stringtranslate.com

Гаплогруппа E-Z827

E-Z827 , также известная как E1b1b1b , [4] является основной гаплогруппой ДНК Y-хромосомы человека . Она является родительской линией для субкладов E-Z830 и E-V257 и определяет их общую филогению. Первый преимущественно встречается на Ближнем Востоке ; последний чаще всего наблюдается в Северной Африке , а его субклад E-M81 наблюдается среди древних аборигенов гуанчей Канарских островов . [5] E-Z827 также встречается с более низкими частотами в Европе и в изолированных частях Юго-Восточной Африки .

Субклады E-Z827 и распространение

Генеалогическое древо

Следующая филогения основана на дереве YCC 2008 и последующих опубликованных исследованиях, обобщенных ISOGG. [6] [7] [8]

E-V257/L19 (E1b1b1b1)

В пределах E-M35 имеются поразительные параллели между двумя гаплогруппами, E-V68 и E-V257. Обе содержат линию, которая часто наблюдалась в Северной Африке (E-M78 и E-M81 соответственно), и группу недифференцированных хромосом, которые в основном встречаются в Южной Европе. Экспансия носителей E-M35, возможно, с Ближнего Востока, как предполагают другие авторы, и разделение на две ветви, разделенные географическим барьером Средиземного моря, объяснила бы эту географическую картину. Однако отсутствие E-V68* и E-V257* на Ближнем Востоке делает морское распространение между Северной Африкой и Южной Европой более правдоподобной гипотезой.

—  [13]

E-PF2431

PF2431 — родственная ветвь M81, которая была обнаружена в Paolo Francalacci (2011). Ранее она была обозначена как L19*/V257*. Эта мутация была обнаружена в Северной Африке (в Сусе в Марокко, в центральном и восточном Алжире, Западном Ниле в Египте), Сахеле (Чад, Гамбия), Западной Европе (Великобритания (Дербишир), Германия, Швейцария, Испания, Италия) и на Ближнем Востоке (Турция, Карабах и Урмия). Она образовалась 13800 лет назад и, как полагают, происходит из «зеленой» Сахары . Ее TMRCA оценивается в 10600 лет по yfull.

Археология обнаружила останки члена венгерской элиты завоевателей, которые были проанализированы из ветви E-FGC19010, они были обнаружены в Сандорфальве в Венгрии и датируются второй половиной X века. [14] Скелет был обнаружен в монастыре Сан-Пьетро, ​​Вилла Магна в Италии, чья ДНК принадлежит к той же ветви и жила около 1180 года н. э. [15] Ученые исследовали ДНК массового захоронения жертв бубонной чумы в Эльвангене в Германии, это захоронение датируется XVI веком и принадлежит к другой ветви E-FGC18981. [16]

Э-М81

Доминирующий подклад E-M81 подтипа E-V257, как полагают, возник в районе северо-запада Африки 7000 лет назад, [17] но все члены Yfull являются M183 и имеют TMRCA всего 2700 лет назад. [18]

Региональное распределение гаплогруппы E-M81.

E-M81 является наиболее распространенным субкладом гаплогруппы E-L19/V257. Он сосредоточен в Северной Африке и доминирует над своим субкладом E-M183. Считается, что E-M183 возник на северо-западе Африки и имеет предполагаемый возраст 2284-2984 лн. [19]

Субгаплогруппа E-M183 достигает средней частоты 42% в Северной Африке. Она уменьшается по частоте от 100% в некоторых популяциях до приблизительно 28,6% к востоку от этого диапазона в Египте. [3] [20] [21] Субклад E-M81 преобладает среди североафриканских бербероязычных популяций. В Тунисе она достигла 100% частоты среди выборки арабов из Зрибы , [22] 89,5% у андалузцев (Калаат-аль-Андалус) и 100% у берберов из Шенини-Дуирета , Джраду и Такруны. [22] Она обычно встречается с частотой около 45% в прибрежных городах Магриба ( Оран , Тунис , Алжир ). [3] [23]

Диаграмма, отображающая географическую частоту.

Он также распространен среди других берберских популяций и достигает частоты 72,4% у берберов Марракеша [24] , 80% у мозабитов и 71% у берберов Среднего Атласа (Moyen). Он также достигает высоких уровней (77,8%) среди населения туарегов, населяющих Сахару в Буркина-Фасо , около Гора он достигает гораздо более низкой частоты 11,1% в окрестностях Танута в Республике Нигер .

В этой ключевой области от Египта до Атлантического океана [3] сообщается о модели уменьшения вариации гаплотипа STR (подразумевающей уменьшение возраста линии в этих областях) с востока на запад (но [25] сообщается с запада на восток для M183), сопровождающейся существенным увеличением частоты. На восточной окраине этого основного диапазона [21] M81 обнаружен у 28,6% (10 из 35 мужчин) в Эль-Хайезе в Западной пустыне в Египте

Модель распределения и дисперсии согласуется с гипотезой о постпалеолитической « демической диффузии » с Ближнего Востока. [3] Предковое происхождение E-M81 в их гипотезе могло быть связано с распространением неолитических технологий производства продовольствия из Плодородного полумесяца через Нил , хотя это скорее скотоводство, чем земледелие . E-M81 и, возможно, протоафразийский язык могли быть либо принесены из Азии , либо они могут представлять собой «местный вклад в североафриканский неолитический переход».

Субклад E-M81 был обнаружен в ископаемых останках древних гуанчей (бимбапес), найденных в Пунта-Асуль, Эль-Йерро , Канарские острова , которые датируются 10-м веком (~44%). [5] Также был обнаружен в Ифри-наммар , что делает вероятным местом его распространения северо-западную Африку , а не Ближний Восток.

Европа

В Европе E-M81 имеет широкое распространение с очень низкими частотами, но распространен в основном на Пиренейском полуострове , где в отличие от остальной Европы, [26] показывает среднюю частоту 4,3% (49/1140) на Пиренейском полуострове с частотами, достигающими 4% и 9% в двух отдельных исследованиях Галисии , 10% в Западной Андалусии и Северо-Западной Кастилии . Однако это исследование также включает 153 человека с островов Майорка, Менорка и Ибица, а также 24 человека из Гаскони, которые не находятся на Пиренейском полуострове. Без этих 177 человек реальный средний показатель для Пиренейского полуострова составляет 4,9% (47/963) [26] он более распространен, чем E-M78, со средней частотой около 5%. Его частоты выше в западной половине полуострова с частотами, достигающими 8% в Эстремадуре и Южной Португалии, 4% в одном исследовании и 9% в другом в Галисии , 10% в Западной Андалусии и Северо-Западной Кастилии и от 9% до 17% в Кантабрии . [26] [27] [28] [29] [30] Самые высокие частоты этого клада, обнаруженные до сих пор в Европе, наблюдались в Пасиегос из Кантабрии , в диапазоне от 18% (8/45) [30] до 41% (23/56). [24] Средняя частота 8,28% (54/652) также была зарегистрирована на испанских Канарских островах с частотами более 10% на трех крупнейших островах Тенерифе (10,68%), Гран-Канария (11,54%) и Фуэртевентура (13,33%). [31]

E-M81 также встречается в других частях Европы, таких как Великобритания , особенно Уэльс и Шотландия , и Франция , где его общая частота составляет 2,7% (15/555), с частотой, превышающей 5,0% в Оверни (5/89) и Иль-де-Франс (5/91). [32] [33] [34] E-M81 также наблюдался в Италии с частотой от 0,7% до 5,8% на Сардинии , [35] [36] примерно 2,12% в целом на Сицилии (но до 7,14% на Пьяцца-Армерина ), [37] и с гораздо более низкой частотой вблизи Лучеры (1,7%), в континентальной Италии , [38] возможно, из-за древних миграций во времена Исламской , Римской и Карфагенской империй. В исследовании 2014 года Стефании Сарно и др. с 326 образцами из Козенцы , Реджо-ди-Калабрии , Лечче и пяти сицилийских провинций, E-M81 показывает среднюю частоту 1,53%, но типичный магрибинский основной гаплотип 13-14-30-24-9-11-13 был обнаружен только у двух из пяти индивидуумов E-M81. Эти результаты, наряду с незначительным вкладом североафриканских популяций, выявленным с помощью анализа примесного участка, предполагают лишь незначительное влияние транссредиземноморских потоков генов на текущий генетический пул SSI. [37] [39]

Латинская Америка

В результате испанской и португальской колонизации Америки эта подгруппа встречается по всей Латинской Америке , например, 6,1% на Кубе (8 из 132), [40] 5,4% в Бразилии (Рио-де-Жанейро) (6 из 112), «Наличие хромосом североафриканского происхождения (E3b1b-M81; [24] также можно объяснить притоком, опосредованным португальцами, поскольку эта гаплогруппа достигает частоты 5,6% в Португалии , [28] весьма схожей с частотой, обнаруженной в Рио-де-Жанейро (5,4%) среди европейских участников». [41] и среди испаноязычных мужчин из Калифорнии и Гавайев 2,4% (7 из 295), [42]

Другие

В меньших количествах мужчин E-M81 можно встретить в районах, соприкасающихся с Магрибом, как вокруг Сахары, в таких местах, как Судан , так и вокруг Средиземноморья, в таких местах, как Ливан , Турция , а также среди сефардских евреев .

Распределение

Ниже приводится краткое изложение большинства исследований, в которых специально проверялся E-M81, показывающее, где его распространение превышает 1% в Европе, Северной Африке, на Ближнем Востоке и в Латинской Америке.

E-Z830 (E1b1b1b2)

Недавно подтвержденный подклад E-Z827, Z830, включает подтвержденные подклады E-M123 , E-M293 и E-V42 и является родственным кладом E-L19. В настоящее время проект филогении E-M35 распознает четыре отдельных кластера носителей Z830*, два из которых имеют исключительно еврейское происхождение . Оставшиеся два значительно меньше и включают разбросанных индивидуумов в Германии, Испании, Латинской Америке, Египте и Эфиопии. [70] [71] [72] [73]

Э-М123

E-M123 в основном известен своим основным субкладом E-M34, который доминирует в этом кладе. [74]

Э-В1515

Новая клада (E-V1515) была определена Trombetta et al. 2015, которая возникла около 12 тыс. лет назад (95% ДИ 8,6-16,4) в Восточной Африке, где она в настоящее время в основном распространена. Эта клада включает все гаплогруппы к югу от Сахары (E-V42, E-M293, E-V92, E-V6), которые были описаны как базальные клады E-M35 в предыдущей филогении. [2]

Мы наблюдали самую высокую частоту и разнообразие этой гаплогруппы в северной части Африканского Рога (современная Эритрея и северная Эфиопия ), где было обнаружено большинство самых глубоких подгаплогрупп и парагрупп E-V1515. В южной части Рога (южная Эфиопия, Сомали и северная Кения) гаплогруппа E-V1515 представлена ​​почти исключительно недавней (3,5 тыс. лет; 95% ДИ: 1,7–5,9 тыс. лет) подгаплогруппой E-V1486. ​​Дальше на юг, в южной Кении и южной Африке, была обнаружена единственная терминальная клада E-V1486, известная как E-M293 (Henn et al. 2008) (рис. 3). Эта филогеографическая картина убедительно свидетельствует о перемещениях людей из северной части Африканского Рога к границам Эфиопии и Кении между 12 тыс. лет назад (слияние E-V1515) и 3,5 тыс. лет назад (слияние E-V1486), а отсюда в сторону Южной Африки через экваториальный пояс в более позднее время. [2]

Множество случаев коммерческого наблюдения E-V1515 также были обнаружены в Аравии. [75]

Э-М293

E-M293 является субкладом E-V1515. Он был идентифицирован ISOGG как второй клад в пределах E-Z830. Он был обнаружен до E-Z830 и связан с распространением скотоводства из Восточной Африки южными кушитами в Южную Африку . [76] До сих пор высокие уровни были обнаружены в определенных этнических группах в Танзании и Южной Африке. Самые высокие были у датогов (43%), кхве (кхоэ) (31%), бурунге (28%) и сандаве (24%). Были обнаружены два бантуязычных кенийских мужчины с мутацией M293. [76] Другие субклады E-M215 редки в Южной Африке. Авторы заявляют...

Без информации о M293 у масаев, хема и других популяций в Кении, Судане и Эфиопии мы не можем с большей уверенностью определить точный географический источник M293. Однако имеющиеся доказательства указывают на современную Танзанию как на раннее и важное географическое место эволюции M293.

Они также говорят, что «M293 встречается только в странах Африки к югу от Сахары, что указывает на отдельную филогенетическую историю для образцов M35.1 * (бывших) дальше на север». E-P72 . [7] Это субклад E-M293. [13]

Э-V42

E-V42 был обнаружен у двух эфиопских евреев . [13] Было высказано предположение, что он может быть ограничен регионом вокруг Эфиопии. Однако дальнейшее тестирование коммерческими компаниями по тестированию ДНК подтвердило положительные результаты для этого субклада и в Аравии. [77]

E-V6

Субклад E-V6 E-V1515 определяется V6, и было выявлено значительное присутствие этих линий в Эфиопии , а также некоторых из соседней популяции Сомали . [24] Среди выборок эфиопов и сомалийцев самые высокие показатели были 14,7% среди эфиопских амхара и 16,7% среди эфиопских волайта .

Э-В92

E-V92 был обнаружен в двух эфиопских амхара . [13] Как и E-V6 и E-V42, он, возможно, существует только на территории Эфиопии.

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем наименования для филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместную статью, в которой было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремящегося прежде всего быть своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы в точке знакового дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему более старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Оригинальные исследовательские публикации

В создании YCC Tree приняли участие следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями.

Смотрите также

Генетика

Y-ДНК E субклады

Y-ДНК Основа Древа

Ссылки

  1. ^ ab "YFull YTree v6.02". YFull: Служба интерпретации последовательности Y-Chr .
  2. ^ abc Trombetta B, D'Atanasio E, Massaia A, Ippoliti M, Coppa A, Candilio F и др. (июнь 2015 г.). «Phylogeographic Refinement and Large Scale Genotyping of Human Y Chromosome Haplogroup E Provide New Insights into the Dispersal of Early Pastoralists in the African Continent». Genome Biology and Evolution . 7 (7): 1940–50. doi :10.1093/gbe/evv118. PMC 4524485. PMID  26108492 . 
  3. ^ abcdefgh Arredi B, Poloni ES, Paracchini S, Zerjal T, Fathallah DM, Makrelouf M, Pascali VL, Novelletto A, Tyler-Smith C (август 2004 г.). «Преимущественно неолитическое происхождение вариации Y-хромосомной ДНК в Северной Африке». American Journal of Human Genetics . 75 (2): 338–45. doi :10.1086/423147. PMC 1216069 . PMID  15202071. 
  4. ^ ISOGG (2015), Y-ДНК гаплогруппа E и ее субклады - 2015
  5. ^ ab Ордоньес AC, Фрегель Р., Трухильо-Медерос А, Эрвелла М, де-ла-Руа С, Арне-де-ла-Роса М (2017). «Генетические исследования доиспанского населения, захороненного в пещере Пунта-Асуль (Эль-Йерро, Канарские острова)». Журнал археологической науки . 78 : 20–28. Бибкод : 2017JArSc..78...20O. дои : 10.1016/j.jas.2016.11.004.
  6. ^ ISOGG (2008). "Y-ДНК гаплогруппа E и ее субклады - 2008". Международное общество генетических генеалогов "ISOGG".
  7. ^ abc Karafet TM, Mendez FL, Meilerman MB, Underhill PA, Zegura SL, Hammer MF (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и повышают разрешение древа гаплогруппы Y-хромосомы человека». Genome Research . 18 (5): 830–8. doi :10.1101/gr.7172008. PMC 2336805 . PMID  18385274. 
  8. ^ Консорциум Y-хромосомы "YCC" (февраль 2002 г.). "Система номенклатуры для древа бинарных гаплогрупп Y-хромосомы человека". Genome Research . 12 (2): 339–48. doi :10.1101/gr.217602. PMC 155271. PMID  11827954 . 
  9. ^ abc ISOGG 2015
  10. ^ "E-PF2431 YTree".
  11. ^ "E-M81 YTree". www.yfull.com . Получено 2016-07-09 .
  12. ^ "E-L19 YTree". www.yfull.com . Получено 2023-07-24 .
  13. ^ abcd Trombetta B, Cruciani F, Sellitto D, Scozzari R (январь 2011 г.). MacAulay V (ред.). "Новая топология человеческой Y-хромосомной гаплогруппы E1b1 (E-P2), выявленная с помощью недавно охарактеризованных бинарных полиморфизмов". PLOS ONE . ​​6 (1): e16073. Bibcode :2011PLoSO...616073T. doi : 10.1371/journal.pone.0016073 . PMC 3017091 . PMID  21253605. 
  14. ^ Мароти и др. 2022, Анализ всего генома проливает свет на генетическое происхождение гуннов, аваров и завоевателей-венгров https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.01.19.476915v1
  15. ^ Антонио и др. 2019, Древний Рим: генетический перекресток Европы и Средиземноморья
  16. ^ Иммель и др. 2021, Анализ геномной ДНК жертв средневековой чумы предполагает долгосрочное воздействие Yersinia pestis на гены иммунитета человека.
  17. ^ Арреди, Барбара; Полони, Эстелла С.; Параккини, Сильвия; Зержал, Татьяна; Фаталлах, Дахмани М.; Макрелуф, Мохамед; Паскали, Винченцо Л.; Новеллетто, Андреа; Тайлер-Смит, Крис (август 2004 г.). «Преимущественно неолитическое происхождение вариаций Y-хромосомной ДНК в Северной Африке». Американский журнал генетики человека . 75 (2): 338–345. дои : 10.1086/423147. ISSN  0002-9297. ПМК 1216069 . ПМИД  15202071. 
  18. ^ "E-M81 YTree". www.yfull.com . Получено 2016-07-10 .
  19. Соле-Мората Н, Гарсия-Фернандес С, Урасин В, Бекада А, Фадлауи-Зид К, Заллуа П, Комас Д, Калафель Ф (ноябрь 2017 г.). «Полные последовательности Y-хромосомы свидетельствуют о чрезвычайно недавнем происхождении наиболее распространенной в Северной Африке отцовской линии E-M183 (M81)». Научные отчеты . 7 (1): 15941. Бибкод : 2017NatSR...715941S. doi : 10.1038/s41598-017-16271-y. ПМК 5698413 . ПМИД  29162904. 
  20. ^ abcd Альварес Л., Сантос С., Монтьель Р., Каейро Б., Баали А., Дугухона Х.М., Дюгухон Х.М., Алуха М.П. (2009). «Вариации Y-хромосомы в Южной Иберии: понимание вклада Северной Африки». Американский журнал биологии человека . 21 (3): 407–9. дои : 10.1002/ajhb.20888 . PMID  19213004. S2CID  7041905.
  21. ^ abc Kujanová M, Pereira L, Fernandes V, Pereira JB, Cerný V (октябрь 2009 г.). «Ближневосточный неолитический генетический вклад в небольшой оазис египетской Западной пустыни». American Journal of Physical Anthropology . 140 (2): 336–46. doi :10.1002/ajpa.21078. PMID  19425100.
  22. ^ аб Элькамель, Сарра; Маркес, София Л.; Альварес, Луис; Гомес, Вероника; Буссетта, Сами; Мурали-Чебиль, Суфия; Ходжет-эль-Хиль, Хусейн; Черни, Лотфи; Бенаммар-Эльгаайед, Амель; Прата, Мария Дж. (3 августа 2021 г.). «Взгляд на ближневосточный отцовский генетический фонд в Тунисе: высокая распространенность гаплогруппы Т-М70 в арабском населении». Научные отчеты . 11 (1): 15728. Бибкод : 2021NatSR..1115728E. doi : 10.1038/s41598-021-95144-x. ISSN  2045-2322. ПМЦ 8333252 . PMID  34344940. 
  23. ^ ab Robino C, Crobu F, Di Gaetano C, Bekada A, Benhamamouch S, Cerutti N, Piazza A, Inturri S, Torre C (май 2008 г.). «Анализ гаплогрупп SNP Y-хромосомы и гаплотипов STR в выборке алжирской популяции». International Journal of Legal Medicine . 122 (3): 251–5. doi :10.1007/s00414-007-0203-5. PMID  17909833. S2CID  11556974.
  24. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa Круциани Ф, Ла Фратта Р, Сантоламазца П, Селлитто Д, Пасконе Р, Морал П, Уотсон Э, Гуида В, Коломб ЭБ, Захарова Б, Лавинья Дж, Вона Г, Аман Р, Кали Ф, Акар Н, Ричардс М., Торрони А., Новеллетто А., Скоццари Р. (май 2004 г.). «Филогеографический анализ y-хромосом гаплогруппы E3b (E-M215) выявляет множественные миграционные события внутри Африки и из нее». Американский журнал генетики человека . 74 (5): 1014–22. дои : 10.1086/386294. ПМК 1181964 . ПМИД  15042509. 
  25. ^ Соле-Мората Н., Гарсия-Фернандес С., Урасин В., Бекада А., Фадлауи-Зид К., Заллуа П. и др. (ноябрь 2017 г.). «Полные последовательности Y-хромосомы показывают чрезвычайно недавнее происхождение наиболее распространенной в Северной Африке отцовской линии E-M183 (M81)». Научные отчеты . 7 (1): 15941. Бибкод : 2017NatSR...715941S. doi : 10.1038/s41598-017-16271-y. ПМК 5698413 . ПМИД  29162904. 
  26. ^ abcdefghijklmnopqr Адамс С.М., Бош Э., Балареск П.Л., Баллеро С.Дж., Ли AC, Арройо Э., Лопес-Парра AM, Алер ​​М., Грифо М.С., Брайон М., Карраседо А., Лавинья Дж., Мартинес-Харрета Б., Кинтана-Мурси Л., Пикорнелл А., Рамон М., Скорецки К., Бехар Д.М., Калафель Ф., Джоблинг М.А. (декабрь 2008 г.). «Генетическое наследие религиозного разнообразия и нетерпимости: отцовские линии христиан, евреев и мусульман на Пиренейском полуострове». Американский журнал генетики человека . 83 (6): 725–36. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.11.007. ПМК 2668061 . PMID  19061982. 
  27. ^ abcde Flores C, Maca-Meyer N, Larruga JM, Cabrera VM, Karadsheh N, Gonzalez AM (2005). «Изоляты в коридоре миграций: высокоразрешающий анализ вариации Y-хромосомы в Иордании». Журнал генетики человека . 50 (9): 435–41. doi : 10.1007/s10038-005-0274-4 . PMID  16142507.
  28. ^ abcdefghij Белеза С., Гужман Л., Лопес А., Алвес С., Гомеш И., Гиузели М., Калафель Ф., Карраседо А., Аморим А. (март 2006 г.). «Микрофилогеографическая и демографическая история португальских мужских линий». Анналы генетики человека . 70 (Часть 2): 181–94. дои : 10.1111/j.1529-8817.2005.00221.x. PMID  16626329. S2CID  4652154.
  29. ^ abcde Capelli C, Онофри V, Бризигелли F, Боски I, Скарниччи F, Масулло М и др. (июнь 2009 г.). «Мавры и сарацины в Европе: оценка средневекового мужского наследия Северной Африки в южной Европе». Европейский журнал генетики человека . 17 (6): 848–52. дои : 10.1038/ejhg.2008.258. ПМК 2947089 . ПМИД  19156170. 
  30. ^ abc Мака-Мейер Н., Санчес-Веласко П., Флорес С., Ларруга Х.М., Гонсалес А.М., Отерино А., Лейва-Кобиан Ф (июль 2003 г.). «Характеристика Y-хромосомы и митохондриальной ДНК Pasiegos, человеческого изолята из Кантабрии (Испания)». Анналы генетики человека . 67 (Часть 4): 329–39. CiteSeerX 10.1.1.584.4253 . дои : 10.1046/j.1469-1809.2003.00045.x. PMID  12914567. S2CID  40355653. 
  31. ^ abcdefghijkl Фрегель Р., Гомеш В., Гусмао Л., Гонсалес А.М., Кабрера В.М., Аморим А., Ларруга Х.М. (август 2009 г.). «Демографическая история мужского генофонда Канарских островов: замена местных линий европейскими». Эволюционная биология BMC . 9 : 181. дои : 10.1186/1471-2148-9-181 . ПМЦ 2728732 . ПМИД  19650893. 
  32. ^ abcdef Рамос-Луис Э, Бланко-Вереа А, Брион М, Ван Хаффель В, Карраседо А, Санчес-Дис П (декабрь 2009 г.). «Филогеография французских мужских линий». Forensic Science International: Серия дополнений по генетике . 2 (1): 439–441. дои : 10.1016/j.fsigss.2009.09.026 .
  33. ^ abc Мартинес-Круз Б, Хармант С, Платт Д.Э., Хаак В., Мэнри Дж., Рамос-Луис Э., Сориа-Эрнанц Д.Ф., Бодуэр Ф., Салаберрия Дж., Ойхарсабал Б. (март 2012 г.). «Свидетельства доримской племенной генетической структуры басков на основе маркеров, унаследованных от одного родителя». Молекулярная биология и эволюция . 29 (9): 2211–2222. дои : 10.1093/molbev/mss091 . hdl : 10261/112478 . ПМИД  22411853.
  34. ^ Анализировались только мужчины с французской фамилией, чтобы исключить более поздних иммигрантов.
  35. ^ Grugni V, Raveane A, Colombo G, Nici C, Crobu F, Ongaro L и др. (ноябрь 2019 г.). «Анализ Y-хромосомы и фамилии для реконструкции прошлых популяционных структур: популяция Сардинии как тестовый случай». International Journal of Molecular Sciences . 20 (22): 5763. doi : 10.3390/ijms20225763 . PMC 6888588 . PMID  31744094. 
  36. ^ ab Francalacci et al. (2013), Низкочастотное секвенирование ДНК 1200 сардинцев реконструирует европейскую филогению Y-хромосомы
  37. ^ ab Ди Гаэтано и др. (2009)
  38. ^ Капелли и др. (2009)
  39. ^ Sarno S, Boattini A, Carta M, Ferri G, Alù M, Yao DY и др. (2014). «Древний средиземноморский плавильный котел: исследование однородительской генетической структуры и истории населения Сицилии и южной Италии». PLOS ONE . 9 (4): e96074. Bibcode : 2014PLoSO...996074S. doi : 10.1371/journal.pone.0096074 . PMC 4005757. PMID  24788788 .  В статье использованы цитаты из этого источника, доступного по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International (CC BY 4.0).
  40. ^ ab Mendizabal I, Sandoval K, Berniell-Lee G, Calafell F, Salas A, Martínez-Fuentes A, Comas D (июль 2008 г.). "Генетическое происхождение, смешение и асимметрия в материнских и отцовских человеческих линиях на Кубе". BMC Evolutionary Biology . 8 : 213. doi : 10.1186/1471-2148-8-213 . PMC 2492877 . PMID  18644108. 
  41. ^ аб Силва Д.А., Карвалью Э, Коста Г, Таварес Л, Аморим А, Гужман Л (2006). «Генетическая вариация Y-хромосомы в популяции Рио-де-Жанейро». Американский журнал биологии человека . 18 (6): 829–37. дои : 10.1002/ajhb.20567. PMID  17039481. S2CID  23778828.
  42. ^ Paracchini S, Pearce CL, Kolonel LN, Altshuler D, Henderson BE, Tyler-Smith C (ноябрь 2003 г.). «Влияние хромосомы AY на риск рака простаты: многоэтническое когортное исследование». Журнал медицинской генетики . 40 (11): 815–9. doi :10.1136/jmg.40.11.815. PMC 1735314. PMID  14627670. 
  43. ^ "E-M81 YTree". www.yfull.com . Получено 2023-07-16 .
  44. ^ Бекада А., Арауна Л.Р., Деба Т., Калафель Ф., Бенхамамуш С., Комас Д. (24 сентября 2015 г.). «Генетическая гетерогенность в алжирских человеческих популяциях». ПЛОС ОДИН . 10 (9): e0138453. Бибкод : 2015PLoSO..1038453B. дои : 10.1371/journal.pone.0138453 . ПМЦ 4581715 . ПМИД  26402429. 
  45. ^ Cherni L, Pereira L, Goios A, Loueslati BY, Khodjet el Khil H, Gomes I и др. (август 2005 г.). «Y-хромосомные STR-гаплотипы в трех этнических группах и одной космополитической популяции из Туниса». Forensic Science International . 152 (1): 95–99. doi :10.1016/j.forsciint.2005.02.007. PMID  15939181.
  46. ^ Манни Ф., Леонарди П., Патин Э, Берреби А., Ходжет эль-Хил Х., Скорецки К. и др. (июнь 2005 г.). «Y-хромосомный портрет населения Джербы (Тунис) для выяснения его сложной демографической истории». Бюллетени и мемуары Парижского общества антропологии . 17 (1–2): 103–114. дои : 10.4000/bmsap.956. ISSN  0037-8984.
  47. ^ abc Dugoujon JM, Philippson G (2005). "Берберы: языковое и генетическое разнообразие" (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 2012-03-25.
  48. ^ abcdef Bekada A, Fregel R, Cabrera VM, Larruga JM, Pestano J, Benhamamouch S, González AM (февраль 2013 г.). «Введение алжирской митохондриальной ДНК и профилей Y-хромосомы в североафриканский ландшафт». PLOS ONE . ​​8 (2): e56775. Bibcode :2013PLoSO...856775B. doi : 10.1371/journal.pone.0056775 . PMC 3576335 . PMID  23431392. 
  49. ^ Бекада, Асмахан; Арауна, Лара Р.; Деба, Тахрия; Калафель, Франческ; Бенхамамуш, Сорая; Комас, Дэвид (24 сентября 2015 г.). «Генетическая гетерогенность в алжирских человеческих популяциях». ПЛОС ОДИН . 10 (9): e0138453. дои : 10.1371/journal.pone.0138453 . ISSN  1932-6203. ПМК 4581715 . ПМИД  26402429. 
  50. ^ abcde Pereira L, Cerný V, Cerezo M, Silva NM, Hájek M, Vasíková A, Kujanová M, Brdicka R, Salas A (август 2010 г.). «Связывание генофондов к югу от Сахары и Западной Евразии: материнское и отцовское наследие кочевников-туарегов из африканского Сахеля». European Journal of Human Genetics . 18 (8): 915–23. doi :10.1038/ejhg.2010.21. PMC 2987384. PMID  20234393 . 
  51. ^ Di Gaetano C, Cerutti N, Crobu F, Robino C, Inturri S, Gino S и др. (январь 2009 г.). «Различные греческие и североафриканские миграции на Сицилию подтверждаются генетическими доказательствами из Y-хромосомы». European Journal of Human Genetics . 17 (1): 91–9. doi :10.1038/ejhg.2008.120. PMC 2985948 . PMID  18685561. 
  52. ^ Genographic Consortium, Zalloua PA, Platt DE, El Sibai M, Khalife J, Makhoul N и др. (ноябрь 2008 г.). «Определение генетических следов исторических экспансий: финикийские следы в Средиземноморье». American Journal of Human Genetics . 83 (5): 633–42. doi :10.1016/j.ajhg.2008.10.012. PMC 2668035 . PMID  18976729. 
  53. ^ Оттони С., Лармюсо М.Х., Вандерхейден Н., Мартинес-Лабарга С., Примативо Г., Бионди Г., Декорте Р., Рикардс О. (май 2011 г.). «Вглубь корней ливийских туарегов: генетический обзор их отцовского наследия». Американский журнал физической антропологии . 145 (1): 118–24. дои : 10.1002/ajpa.21473. ПМИД  21312181.
  54. ^ Fadhlaoui-Zid K, Haber M, Martínez-Cruz B, Zalloua P, Benammar Elgaaied A, Comas D (2013). «Геномное и отцовское разнообразие раскрывают недавнее происхождение человеческих популяций в Северной Африке». PLOS ONE . 8 (11): e80293. Bibcode : 2013PLoSO...880293F. doi : 10.1371/journal.pone.0080293 . PMC 3842387. PMID  24312208 . 
  55. ^ Reguig A, Harich N, Barakat A, Rouba H (2014). «Филогеография гаплогруппы E1b1b1b-M81 и анализ ее субкладов в Марокко». Биология человека . 86 (2): 105–12. doi :10.3378/027.086.0204. PMID  25397701. S2CID  11334895.
  56. ^ ab Onofri V, Alessandrini F, Turchi C, Pesaresi M, Tagliabracci A (август 2008 г.). «Распределение маркеров Y-хромосомы в Северной Африке: анализ SNP и STR высокого разрешения в популяциях Туниса и Марокко». Forensic Science International: Genetics Supplement Series . 1 (1): 235–236. doi :10.1016/j.fsigss.2007.10.173.
  57. ^ Bosch, Елена; Calafell, Francesc; Comas, Дэвид; Oefner, Питер Дж.; Underhill, Питер А.; Bertranpetit, Жауме (апрель 2001 г.). «Анализ высокого разрешения вариаций Y-хромосомы человека показывает резкий разрыв и ограниченный поток генов между северо-западной Африкой и Пиренейским полуостровом». American Journal of Human Genetics . 68 (4): 1019–1029. doi :10.1086/319521. ISSN  0002-9297. PMC 1275654 . PMID  11254456. 
  58. ^ abcdefghijk Флорес С., Мака-Мейер Н., Гонсалес А.М., Офнер П.Дж., Шен П., Перес Х.А., Рохас А., Ларруга Дж.М., Андерхилл, Пенсильвания (октябрь 2004 г.). «Редуцированная генетическая структура Пиренейского полуострова, выявленная с помощью анализа Y-хромосомы: последствия для демографии населения». Европейский журнал генетики человека . 12 (10): 855–63. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201225 . ПМИД  15280900.
  59. ^ abcdef Гонсалвес Р., Фрейтас А., Бранко М., Роза А., Фернандес А.Т., Животовский Л.А., Андерхилл П.А., Кивисилд Т., Брем А. (июль 2005 г.). «Линии Y-хромосомы из Португалии, Мадейры и Асорских островов фиксируют элементы сефардского и берберского происхождения». Анналы генетики человека . 69 (Часть 4): 443–54. дои : 10.1111/j.1529-8817.2005.00161.x. hdl : 10400.13/3018 . PMID  15996172. S2CID  3229760.
  60. ^ аб Ногейру I, Манко Л., Гомеш В., Аморим А., Гужман Л. (март 2010 г.). «Филогеографический анализ отцовских линий в еврейских общинах северо-восточной Португалии». Американский журнал физической антропологии . 141 (3): 373–81. дои : 10.1002/ajpa.21154 . ПМИД  19918998.
  61. ^ Скозцари Р., Кручиани Ф., Панграцио А., Сантоламазца П., Вона Г., Мораль П., Латини В., Варези Л., Мемми М.М., Романо В., Де Лео Г., Дженнарелли М., Ярузельска Дж., Виллемс Р., Парик Дж., Маколей В., Торрони А. (сентябрь 2001 г.). «Изменения Y-хромосомы человека в западном Средиземноморье: последствия для заселения региона» (PDF) . Иммунология человека . 62 (9): 871–84. CiteSeerX 10.1.1.408.4857 . дои : 10.1016/S0198-8859(01)00286-5. PMID  11543889. Архивировано из оригинала (PDF) 2012-12-17 . Получено 2011-06-17 . 
  62. ^ Брайон М., Квинтанс Б., Заррабейтия М., Гонсалес-Нейра А., Салас А., Лареу В., Тайлер-Смит С., Карраседо А. (март 2004 г.). «Микрогеографическая дифференциация Северной Иберии, выявленная с помощью анализа Y-хромосомной ДНК». Джин . 329 : 17–25. дои : 10.1016/j.gene.2003.12.035. ПМИД  15033525.
  63. ^ abcd Сантос С., Фрегель Р., Кабрера В.М., Альварес Л., Ларруга Х.М., Рамос А., Лопес М.А., Пилар Алуха М., Гонсалес AM (2014). «Митохондриальная ДНК и структура Y-хромосомы на средиземноморском и атлантическом фасадах Пиренейского полуострова». Американский журнал биологии человека . 26 (2): 130–41. дои : 10.1002/ajhb.22497. PMID  24375863. S2CID  205303141.
  64. ^ Регейро М., Гарсия-Бертран Р., Фадлауи-Зид К., Альварес Дж., Эррера Р.Дж. (июнь 2015 г.). «От Аравии до Иберии: перспектива хромосомы AY». Джин . 564 (2): 141–52. дои : 10.1016/j.gene.2015.02.042. ПМИД  25701402.
  65. ^ аб Амбросио Б, Дюгухон Х.М., Эрнандес С., Де Ла Фуэнте Д., Гонсалес-Мартин А., Фортес-Лима К.А., Новеллетто А., Родригес Х.Н., Кальдерон Р. (2010). «Андалузское население Уэльвы демонстрирует высокую диверсификацию отцовских линий Y-ДНК от гаплогруппы E: выявление человеческих мужских движений в средиземноморском пространстве». Анналы биологии человека . 37 (1): 86–107. дои : 10.3109/03014460903229155. PMID  19939195. S2CID  1667431.
  66. ^ Альварес Л., Сирия Э., Маркес С.Л., Сантос К., Алуха МП (2014). «Анализ Y-хромосомы в популяции северо-западной Иберии: раскрытие влияния североафриканских линий». Американский журнал биологии человека . 26 (6): 740–6. doi :10.1002/ajhb.22602. PMID  25123837. S2CID  205303372.
  67. ^ abcd Эннафаа Х., Фрегель Р., Ходжет-Эль-Хил Х., Гонсалес А.М., Махмуди Х.А., Кабрера В.М., Ларруга Дж.М., Бенаммар-Эльгаайед А. (октябрь 2011 г.). «Митохондриальная ДНК и микроструктура Y-хромосомы в Тунисе». Журнал генетики человека . 56 (10): 734–41. дои : 10.1038/jhg.2011.92 . ПМИД  21833004.
  68. ^ abcde Фадлауи-Зид К., Мартинес-Круз Б., Ходжет-эль-Хил Х., Мендисабаль И., Бенаммар-Эльгаайед А., Комас Д. (октябрь 2011 г.). «Генетическая структура тунисских этнических групп, выявленная по отцовской линии». Американский журнал физической антропологии . 146 (2): 271–80. дои : 10.1002/ajpa.21581. ПМИД  21915847.
  69. ^ Дюгужон, Жан-Мишель; Кудрэ, Клотильда; Торрони, Антонио; Кручиани, Фульвио; Скоццари, Розария; Мораль, Педро; Луали, Найма; Коссманн, Мартен (17 декабря 2009 г.), д'Эррико, Франческо; Омбер, Жан-Мари (ред.), «Генетическое и лингвистическое разнообразие: бербер и берберы», Становление красноречивым: достижения в развитии языка, человеческого познания и современных культур , Издательство John Benjamins Publishing Company, стр. 123–146. , ISBN 978-90-272-3269-4, получено 2023-07-24
  70. ^ "Данные проекта E-M35". haplozone.net . Архивировано из оригинала 2015-09-24 . Получено 2012-05-22 .
  71. ^ "Данные проекта E-M35". haplozone.net . Архивировано из оригинала 2015-09-24 . Получено 2012-05-22 .
  72. ^ "Данные проекта E-M35". haplozone.net . Архивировано из оригинала 2015-09-24 . Получено 2012-05-22 .
  73. ^ "Данные проекта E-M35". haplozone.net . Архивировано из оригинала 2015-09-24 . Получено 2012-05-22 .
  74. ^ "Проект филогении E-M35". Например, по состоянию на 11 ноября 2008 года проект филогении E-M35 имел записи о четырех тестах E-M123* по сравнению с 93 результатами тестов E-M34.[ постоянная мертвая ссылка ]
  75. ^ "E-CTS10880 YTree".
  76. ^ ab Henn BM, Gignoux C, Lin AA, Oefner PJ, Shen P, Scozzari R, Cruciani F, Tishkoff SA, Mountain JL, Underhill PA (август 2008 г.). «Y-хромосомные доказательства миграции скотоводов через Танзанию в южную Африку». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (31): 10693–8. Bibcode : 2008PNAS..10510693H. doi : 10.1073/pnas.0801184105 . PMC 2504844. PMID  18678889 . 
  77. ^ "Данные проекта E-M35". haplozone.net . Архивировано из оригинала 2015-09-24 . Получено 2013-01-16 .
  78. ^ Джоблинг MA, Тайлер-Смит C (август 2000). «Новые применения новых гаплотипов человеческой Y-хромосомы, болезни и отбор». Тенденции в генетике . 16 (8): 356–62. doi :10.1016/S0168-9525(00)02057-6. PMID  10904265.
  79. ^ Калайджиева Л., Калафель Ф., Джоблинг М.А., Ангеличева Д., де Книфф П., Россер З.Х., Херлс М.Е., Андерхилл П., Турнев И., Марушякова Е., Попов В. (февраль 2001 г.). «Закономерности меж- и внутригруппового генетического разнообразия у Vlax Roma, выявленные с помощью Y-хромосомы и линий митохондриальной ДНК». Европейский журнал генетики человека . 9 (2): 97–104. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . ПМИД  11313742.
  80. ^ Андерхилл П.А., Шен П., Линь А.А., Джин Л., Пассарино Г., Ян WH и др. (ноябрь 2000 г.). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Природная генетика . 26 (3): 358–61. дои : 10.1038/81685. PMID  11062480. S2CID  12893406.
  81. ^ Хаммер М.Ф., Карафет Т.М., Редд А.Дж., Джаржанази Х., Сантакьяра-Бенерекетти С., Судьялл Х., Зегура С.Л. (июль 2001 г.). «Иерархические закономерности глобального разнообразия Y-хромосомы человека». Молекулярная биология и эволюция . 18 (7): 1189–203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . ПМИД  11420360.
  82. ^ Семино О, Пассарино Г, Офнер П.Дж., Лин А.А., Арбузова С., Бекман Л.Е. и др. (ноябрь 2000 г.). «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: взгляд на Y-хромосому». Наука . 290 (5494): 1155–9. Бибкод : 2000Sci...290.1155S. дои : 10.1126/science.290.5494.1155. ПМИД  11073453.
  83. ^ Su B, Xiao J, Underhill P, Deka R, Zhang W, Akey J, Huang W, Shen D, Lu D, Luo J, Chu J, Tan J, Shen P, Davis R, Cavalli-Sforza L, Chakraborty R, Xiong M, Du R, Oefner P, Chen Z, Jin L (декабрь 1999 г.). «Y-хромосомные доказательства миграции современных людей на север в Восточную Азию во время последнего ледникового периода». American Journal of Human Genetics . 65 (6): 1718–24. doi :10.1086/302680. PMC 1288383 . PMID  10577926. 
  84. ^ Capelli C, Wilson JF, Richards M, Stumpf MP, Gratrix F, Oppenheimer S, Underhill P, Pascali VL, Ko TM, Goldstein DB (февраль 2001 г.). «Преимущественно коренное отцовское наследие для австронезийскоязычных народов островной Юго-Восточной Азии и Океании». American Journal of Human Genetics . 68 (2): 432–43. doi :10.1086/318205. PMC 1235276 . PMID  11170891. 

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки