stringtranslate.com

Гортея вернекская

Hortaea werneckii — вид дрожжей семейства Teratosphaeriaceae . [1] Это черные дрожжи , которые исследуются на предмет их замечательной галотолерантности . [2] [3] Хотя для его культивирования добавление соли в среду не требуется, H. werneckii может расти в растворах, близких к насыщенным NaCl. [4] Чтобы подчеркнуть эту необычно широкую адаптивность и отличить H. werneckii от других галотолерантных грибов, которые имеют более низкие максимальные пределы солености, некоторые авторы описывают  H. werneckii  как «чрезвычайно галотолерантный». [4]

Несколько механизмов солеустойчивости H. werneckii были изучены на молекулярном уровне. [4] Например, известно, что его основными совместимыми растворенными веществами являются глицерин , эритрит , арабитол и маннит ; Накопление меланина в клеточной стенке способствует удержанию по крайней мере глицерина внутри клетки. [3] Некоторые компоненты сигнального пути высокоосмолярного глицерина (HOG) (который контролирует реакцию на осмотический шок ) были подробно изучены, и некоторые из них, по-видимому, отличаются по функциям по сравнению с их аналогами в Saccharomyces cerevisiae . [5] [6] [7] Адаптация к высоким концентрациям соли также сопровождается изменениями липидного состава мембран, преимущественно за счет увеличения ненасыщенности фосфолипидов жирными кислотами. [8] [9]

H. werneckii вызывает редкую поверхностную и неинвазивную инфекцию кожи, опоясывающий лишай . [10] Типичными симптомами являются нечешуйчатые, гладкие, коричнево-черные безболезненные пятна на ладонях рук и подошвах ног.

Рост H. werneckii на жидких средах часто носит дрожжеподобный характер, хотя может переходить на нитевидный рост. Механизм переключения неизвестен. Клетки кажутся коричневыми из-за выработки меланина. [3]

Полногеномное секвенирование H. werneckii [11] [12] выявило недавнюю дупликацию всего генома , которая считается единственной зарегистрированной дупликацией всего генома среди аскомицетовых дрожжей, помимо более известного дублирования в линии Saccharomyces cerevisiae . [13] Судя по секвенированию генома дополнительных штаммов, 10 из 12 штаммов имеют геном, который был продублирован в результате нескольких гибридизаций между гаплоидными штаммами, в результате чего образовались стабильные диплоиды. Помимо этих случаев гибридизации, никаких признаков полового размножения обнаружено не было. [14] Как следствие, геном H. werneckii относительно велик (49,9 Мб) и содержит 15974 предсказанных гена. [12] Гены, кодирующие переносчики катионов металлов, которые, как полагают, играют роль в галотолерантности , претерпели несколько дополнительных дупликаций генов на различных этапах своей эволюции. [11]

Гомоталлический локус спаривания был обнаружен во всех секвенированных геномах, хотя у некоторых штаммов один из генов спаривания мог быть инактивирован. Несмотря на это, филогенетический анализ и анализ неравновесия по сцеплению показывают, что H. werneckii беспола. [14]

Рекомендации

  1. ^ "Hortaea werneckii". Архивировано из оригинала 21 августа 2009 г. Проверено 10 августа 2009 г.
  2. ^ Гунде-Цимерман Н., Рамос Дж., Племенитас А. (ноябрь 2009 г.). «Галотолерантные и галофильные грибы». Микологические исследования . 113 (Часть 11): 1231–41. doi : 10.1016/j.mycres.2009.09.002. ПМИД  19747974.
  3. ^ abc Когей Т., Штейн М., Фолькманн М., Горбушина А.А., Галински Е.А., Гунде-Цимерман Н. (декабрь 2007 г.). «Осмотическая адаптация галофильного гриба Hortaea werneckii: роль осмолитов и меланизации». Микробиология . 153 (Часть 12): 4261–73. дои : 10.1099/mic.0.2007/010751-0. ПМИД  18048939.
  4. ^ abc Гостинчар С, Ленасси М, Гунде-Цимерман Н, Племениташ А (2011). «Адаптация грибков к чрезвычайно высоким концентрациям соли». Достижения прикладной микробиологии . 77 : 71–96. дои : 10.1016/B978-0-12-387044-5.00003-0. ISBN 9780123870445. ПМИД  22050822.
  5. ^ Турк М., Племенитас А (ноябрь 2002 г.). «Путь HOG в галофильных черных дрожжах Hortaea werneckii: выделение гена-гомолога HOG1 и активация HwHog1p». Письма FEMS по микробиологии . 216 (2): 193–9. дои : 10.1111/j.1574-6968.2002.tb11435.x . ПМИД  12435502.
  6. ^ Ленасси М., Вопотик Т., Гунде-Цимерман Н., Племенитас А. (март 2007 г.). «MAP-киназа HwHog1 из галофильных черных дрожжей Hortaea werneckii: борьба со стрессом в солнечных соляных печах». Солевые системы . 3 :3. дои : 10.1186/1746-1448-3-3 . ПМК 1828057 . ПМИД  17349032. 
  7. ^ Феттич М., Ленасси М., Веранич П., Гунде-Цимерман Н., Племениташ А. (май 2011 г.). «Идентификация и характеристика предполагаемых осмосенсоров HwSho1A и HwSho1B из чрезвычайно галотолерантных черных дрожжей Hortaea werneckii». Грибковая генетика и биология . 48 (5): 475–84. дои : 10.1016/j.fgb.2011.01.011. ПМИД  21281727.
  8. ^ Турк М., Межанель Л., Сентьюрк М., Гримальт Дж.О., Гунде-Цимерман Н., Племенитас А. (февраль 2004 г.). «Вызванные солью изменения в липидном составе и текучести мембран галофильных дрожжеподобных меланизированных грибов». Экстремофилы . 8 (1): 53–61. дои : 10.1007/s00792-003-0360-5. PMID  15064990. S2CID  20139110.
  9. ^ Гостинкар С, Тюрк М, Племенитас А, Гунде-Цимерман Н (март 2009 г.). «Экспрессия дельта-9-, дельта-12-десатуразы и элонгазы чрезвычайно галотолерантными черными дрожжами Hortaea werneckii зависит от соли». Исследование дрожжей FEMS . 9 (2): 247–56. дои : 10.1111/j.1567-1364.2009.00481.x . ПМИД  19220869.
  10. ^ Рид Б.Дж. (июль 1998 г.). «Exophiala werneckii, вызывающая черный опоясывающий лишай в Шотландии». Британский журнал дерматологии . 139 (1): 157–8. дои : 10.1046/j.1365-2133.1998.02340.x. PMID  9764175. S2CID  70450832.
  11. ^ ab Ленасси М, Гостинчар С, Джекман С, Терк М, Садовский I, Нислоу С, Джонс С, Бирол I, Цимерман Н.Г., Племениташ А (2013). «Полногеномное дублирование и обогащение переносчиков катионов металлов, выявленное с помощью секвенирования генома de novo чрезвычайно галотолерантных черных дрожжей Hortaea verneckii». ПЛОС ОДИН . 8 (8): е71328. Бибкод : 2013PLoSO...871328L. дои : 10.1371/journal.pone.0071328 . ПМЦ 3744574 . ПМИД  23977017. 
  12. ^ ab Синха С., Флиботт С., Нейра М., Формби С., Племениташ А., Цимерман Н.Г., Ленасси М., Гостинчар С., Стаич Дж.Э., Нислоу С. (июль 2017 г.). «Hortaea werneckii: сочетание улучшенного генома с экспрессией генов и структурой хроматина». Г3 . 7 (7): 2015–2022. дои : 10.1534/g3.117.040691. ПМК 5499112 . ПМИД  28500048. 
  13. ^ Дужон Б (август 2015 г.). «Основные принципы геномики дрожжей, личные воспоминания». Исследование дрожжей FEMS . 15 (5): fov047. дои : 10.1093/femsyr/fov047 . ПМИД  26071597.
  14. ^ аб Гостинчар С, Стаич Дж. Е., Зупанчич Дж., Залар П., Гунде-Цимерман Н. (май 2018 г.). «Геномные доказательства внутривидовой гибридизации клональных и чрезвычайно галотолерантных дрожжей». БМК Геномика . 19 (1): 364. doi : 10.1186/s12864-018-4751-5 . ПМЦ 5952469 . ПМИД  29764372.