Домен KilA-N

В молекулярной биологии домен KilA-N является консервативным ДНК -связывающим доменом, обнаруженным на N-конце белков D6R/NIR поксвируса . Он также обнаружен в широком спектре белков крупных бактериальных и эукариотических ДНК - вирусов . ^[1] Предполагаемые белки с гомологией с доменом KilA-N также были идентифицированы в мобильных элементах Maverick парабазальных простейших Trichomonas vaginalis . ^[2] Было высказано предположение, что домен KilA-N гомологичен домену APSES, связывающему ДНК грибов . Во всех белках , которые, как было показано, содержат домен KilA-N, он находится на крайнем аминоконце в сопровождении широкого спектра различных карбоксиконцевых доменов . Эти карбокси-концевые модули могут быть ферментами , такими как домены нуклеазы , или могут опосредовать дополнительные специфические взаимодействия с нуклеиновыми кислотами или белками, такими как пальцы RING или CCCH в поксвирусах . ^[1] Предполагается, что домен KilA-N примет альфа-бета- складку с четырьмя консервативными цепями и по крайней мере двумя консервативными спиралями . ^[1] Некоторые белки, которые, как известно, содержат домен KilA-N, перечислены ниже:

• Белок бактериофага P1 kilA
• Белок вируса оспы кур (FPV) FPV236.
• Trichomonas vaginalis G3 Предполагаемый неохарактеризованный белок
• Гипотетический белок HindIII-C вируса осповакцины массой 21,7 кДа

Ссылки

1. Iyer LM, Koonin EV, Aravind L (2002). "Обширная перетасовка доменов в регуляторах транскрипции ДНК-вирусов и ее значение для происхождения факторов транскрипции грибковых APSES". Genome Biol . 3 (3): RESEARCH0012. doi : 10.1186 /gb-2002-3-3-research0012 . PMC  88810. PMID  11897024.
2. Pritham EJ, Putliwala T, Feschotte C (апрель 2007 г.). «Mavericks, новый класс гигантских мобильных элементов, широко распространенных у эукариот и связанных с ДНК-вирусами». Gene . 390 (1–2): 3–17. doi :10.1016/j.gene.2006.08.008. PMID  17034960.

В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR018004