stringtranslate.com

Гистидин

Гистидин (символ His или H ) [2] является незаменимой аминокислотой , которая используется в биосинтезе белков . Он содержит α-аминогруппу (которая находится в протонированной форме –NH 3 + в биологических условиях ), группу карбоновой кислоты (которая находится в депротонированной форме –COO в биологических условиях) и имидазольную боковую цепь (которая частично протонирована), что классифицирует его как положительно заряженную аминокислоту при физиологическом pH . Первоначально считавшийся необходимым только для младенцев, теперь в долгосрочных исследованиях было показано, что он необходим и для взрослых. [3] Он кодируется кодонами CAU и CAC.

Гистидин был впервые выделен Альбрехтом Косселем и Свеном Густавом Хедином в 1896 году. [ 4] Название происходит от его открытия в тканях, от ἱστός histós «ткань». [2] Он также является предшественником гистамина , жизненно важного воспалительного агента в иммунных реакциях. Ацильный радикалгистидил .

Свойства боковой цепи имидазола

Сопряженная кислота (протонированная форма) боковой цепи имидазола в гистидине имеет p K a приблизительно 6,0. Таким образом, ниже pH 6 имидазольное кольцо в основном протонировано (как описано уравнением Хендерсона-Хассельбаха ). Полученное имидазолиевое кольцо несет две связи NH и имеет положительный заряд. Положительный заряд равномерно распределен между обоими атомами азота и может быть представлен двумя одинаково важными резонансными структурами . Иногда для этой протонированной формы вместо обычного His используется символ Hip . [5] [6] [7] Выше pH 6 один из двух протонов теряется. Оставшийся протон имидазольного кольца может находиться на любом из атомов азота, что приводит к образованию так называемых таутомеров N3-H или N1- H. Таутомер N3-H показан на рисунке выше. В таутомере N1-H NH находится ближе к основной цепи. Эти нейтральные таутомеры, также называемые Nε и Nδ, иногда обозначаются символами Hie и Hid соответственно. [5] [6] [7] Кольцо имидазола/имидазолия гистидина является ароматическим при всех значениях pH. [8] При определенных условиях все три ионобразующие группы гистидина могут быть заряжены, образуя катион гистидина. [9]

Кислотно-основные свойства боковой цепи имидазола имеют отношение к каталитическому механизму многих ферментов . [10] В каталитических триадах основной азот гистидина отрывает протон от серина , треонина или цистеина , чтобы активировать его как нуклеофил . В гистидиновом протонном челноке гистидин используется для быстрого переноса протонов. Он может делать это, отрывая протон от своего основного азота, чтобы создать положительно заряженный промежуточный продукт, а затем использовать другую молекулу, буфер, для извлечения протона из его кислого азота. В карбоангидразах гистидиновый протонный челнок используется для быстрого переноса протонов от связанной с цинком молекулы воды, чтобы быстро восстановить активную форму фермента. В спиралях E и F гемоглобина гистидин влияет на связывание как дикислорода, так и оксида углерода . Это взаимодействие усиливает сродство Fe(II) к O2, но дестабилизирует связывание CO, который связывается всего в 200 раз прочнее в гемоглобине по сравнению с 20 000 раз прочнее в свободном геме .

Таутомерия и кислотно-основные свойства боковой цепи имидазола были охарактеризованы с помощью спектроскопии ЯМР 15 N. Два химических сдвига 15 N схожи (около 200 ppm относительно азотной кислоты по шкале сигма, на которой повышенное экранирование соответствует повышенному химическому сдвигу ). Спектральные измерения ЯМР показывают, что химический сдвиг N1-H немного падает, тогда как химический сдвиг N3-H падает значительно (около 190 против 145 ppm). Это изменение указывает на то, что таутомер N1-H является предпочтительным, возможно, из-за водородной связи с соседним аммонием . Экранирование в N3 существенно снижается из-за парамагнитного эффекта второго порядка, который включает разрешенное симметрией взаимодействие между неподеленной парой азота и возбужденными π*-состояниями ароматического кольца . При pH > 9 химические сдвиги N1 и N3 составляют приблизительно 185 и 170 ppm. [11]

Лиганд

Связанная с гистидином группа гема сукцинатдегидрогеназы , переносчика электронов в митохондриальной цепи переноса электронов . Большая полупрозрачная сфера указывает на местоположение иона железа . Из PDB : 1YQ3 ​.
Тримедный центр, обнаруженный во многих лакказах , следует отметить, что каждый медный центр связан с имидазольными боковыми цепями гистидина (цветовой код: медь коричневого цвета, азот синего цвета).

Гистидин образует комплексы со многими ионами металлов. Боковая цепь имидазола остатка гистидина обычно служит лигандом в металлопротеинах . Одним из примеров является аксиальное основание, прикрепленное к Fe в миоглобине и гемоглобине. Полигистидиновые метки (шесть или более последовательных остатков H) используются для очистки белка путем связывания с колонками с никелем или кобальтом с микромолярным сродством. [12] Было показано , что природные полигистидиновые пептиды, обнаруженные в яде гадюки Atheris squamigera , связывают Zn(2+), Ni(2+) и Cu(2+) и влияют на функцию металлопротеаз яда. [13]

Метаболизм

Биосинтез

Путь биосинтеза гистидина Восемь различных ферментов могут катализировать десять реакций. На этом изображении His4 катализирует четыре различные реакции в пути.

l -Гистидин — это незаменимая аминокислота, которая не синтезируется de novo у людей. [14] Люди и другие животные должны потреблять гистидин или содержащие гистидин белки. Биосинтез гистидина широко изучался у прокариот, таких как E. coli . Синтез гистидина у E. coli включает восемь генных продуктов (His1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 и 8) и происходит в десять этапов. Это возможно, поскольку один генный продукт способен катализировать более одной реакции. Например, как показано в пути, His4 катализирует 4 различных этапа в пути. [15]

Гистидин синтезируется из фосфорибозилпирофосфата (PRPP), который производится из рибозо-5-фосфата рибозофосфатдифосфокиназой в пентозофосфатном пути. Первой реакцией биосинтеза гистидина является конденсация PRPP и аденозинтрифосфата ( АТФ ) ферментом АТФ - фосфорибозилтрансферазой . АТФ-фосфорибозилтрансфераза обозначена на изображении как His1. [15] Затем продукт гена His4 гидролизует продукт конденсации, фосфорибозил-АТФ, производя фосфорибозил-АМФ (PRAMP), что является необратимым шагом. Затем His4 катализирует образование фосфорибозилформиминоAICAR-фосфата, который затем преобразуется в фосфорибулозилформимино-AICAR-P продуктом гена His6. [16] His7 расщепляет фосфорибулозилформимино-AICAR-P, образуя d -эритро-имидазол-глицерол-фосфат. После этого His3 образует имидазолацетол-фосфат, высвобождая воду. Затем His5 образует l -гистидинол-фосфат, который затем гидролизуется His2, образуя гистидинол. His4 катализирует окисление l -гистидинола, образуя l -гистидиналь, аминоальдегид. На последнем этапе l -гистидиналь превращается в l -гистидин. [16] [17]

Путь биосинтеза гистидина был изучен у грибка Neurospora crassa , и был обнаружен ген ( His-3 ), кодирующий мультиферментный комплекс , который был похож на ген His4 бактерии E. coli . [18] Генетическое исследование мутантов гистидина N. crassa показало, что отдельные виды активности мультиферментного комплекса происходят в дискретных, смежных участках генетической карты His-3 , что позволяет предположить, что различные виды активности мультиферментного комплекса кодируются отдельно друг от друга. [18] Однако были также обнаружены мутанты, у которых отсутствовали все три вида активности одновременно, что позволяет предположить, что некоторые мутации вызывают потерю функции комплекса в целом.

Так же, как животные и микроорганизмы, растения нуждаются в гистидине для своего роста и развития. [10] Микроорганизмы и растения похожи тем, что они могут синтезировать гистидин. [19] Оба синтезируют гистидин из биохимического промежуточного фосфорибозилпирофосфата. В целом, биосинтез гистидина очень похож у растений и микроорганизмов. [20]

Регуляция биосинтеза

Для осуществления этого пути требуется энергия, поэтому присутствие АТФ активирует первый фермент пути, АТФ-фосфорибозилтрансферазу (показана как His1 на изображении справа). АТФ-фосфорибозилтрансфераза является ферментом, определяющим скорость, который регулируется посредством ингибирования по принципу обратной связи, что означает, что он ингибируется в присутствии продукта, гистидина. [21]

Деградация

Гистидин является одной из аминокислот, которые могут быть преобразованы в промежуточные продукты цикла трикарбоновых кислот (TCA) (также известного как цикл лимонной кислоты). [22] Гистидин, наряду с другими аминокислотами, такими как пролин и аргинин, принимает участие в дезаминировании, процессе, в котором его аминогруппа удаляется. У прокариот гистидин сначала преобразуется в уроканат гистидазой. Затем уроканаза преобразует уроканат в 4-имидазолон-5-пропионат. Имидазолонпропионаза катализирует реакцию с образованием формиминоглутамата (FIGLU) из 4-имидазолон-5-пропионата. [23] Формиминогруппа переносится на тетрагидрофолат , а оставшиеся пять атомов углерода образуют глутамат. [22] В целом, эти реакции приводят к образованию глутамата и аммиака. [24] Глутамат затем может быть дезаминирован глутаматдегидрогеназой или трансаминирован с образованием α-кетоглутарата. [22]

Преобразование в другие биологически активные амины

Превращение гистидина в гистамин с помощью гистидиндекарбоксилазы

Требования

Совет по пищевым продуктам и питанию (FNB) Института медицины США установил рекомендуемые нормы потребления (RDA) незаменимых аминокислот в 2002 году. Для гистидина, для взрослых в возрасте 19 лет и старше, 14 мг/кг массы тела/день. [29] Дополнительный гистидин исследуется для использования при различных состояниях, включая неврологические расстройства, атопический дерматит, метаболический синдром, диабет, уремическую анемию, язвы, воспалительные заболевания кишечника, злокачественные новообразования и мышечную производительность во время интенсивных упражнений. [30]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ http://prowl.rockefeller.edu/aainfo/solub.htm [ требуется полная ссылка ]
  2. ^ ab "Номенклатура и символика аминокислот и пептидов". Совместная комиссия ИЮПАК-МСБ по биохимической номенклатуре. 1983. Архивировано из оригинала 9 октября 2008 г. Получено 5 марта 2018 г.
  3. ^ Коппл, Дж. Д.; Свендсейд, М. Э. (1975). «Доказательства того, что гистидин является незаменимой аминокислотой у нормального и хронически уремического человека». Журнал клинических исследований . 55 (5): 881–91. doi :10.1172/JCI108016. PMC 301830. PMID  1123426 . 
  4. ^ Викери, Хьюберт Брэдфорд; Ливенворт, Чарльз С. (1928-08-01). «О разделении гистидина и аргинина» (PDF) . Журнал биологической химии . 78 (3): 627–635. doi : 10.1016/S0021-9258(18)83967-9 . ISSN  0021-9258.
  5. ^ ab Kim, Meekyum Olivia; Nichols, Sara E.; Wang, Yi; McCammon, J. Andrew (март 2013 г.). «Влияние протонирования гистидина и ротамерных состояний на виртуальный скрининг M. tuberculosis RmlC». Journal of Computer-Aided Molecular Design . 27 (3): 235–246. Bibcode :2013JCAMD..27..235K. doi :10.1007/s10822-013-9643-9. ISSN  0920-654X. PMC 3639364 . PMID  23579613. 
  6. ^ ab "ГИСТИДИН". ambermd.org . Получено 2022-05-12 .
  7. ^ ab Dokainish, Hisham M.; Kitao, Akio (2016-08-05). "Вычислительное назначение состояния протонирования гистидина в ферменте фотолиазы (6-4) и его влияние на стадию протонирования". ACS Catalysis . 6 (8): 5500–5507. doi : 10.1021/acscatal.6b01094 . ISSN  2155-5435. S2CID  88813605.
  8. ^ Мрозек, Агнешка; Каролак-Войцеховска, Янина; Кич-Кононович, Катажина (2003). «Пятичленные гетероциклы. Часть III. Ароматичность 1,3-имидазола в 5+n гетеробициклических молекулах». Журнал молекулярной структуры . 655 (3): 397–403. Бибкод : 2003JMoSt.655..397M. дои : 10.1016/S0022-2860(03)00282-5.
  9. ^ Новиков, Антон П.; Сафонов, Алексей В.; Герман, Константин Е.; Григорьев, Михаил С. (2023-12-01). «Какие взаимодействия мы можем получить, переходя от цвиттер-ионов к «дриттерным» ионам: взаимодействия анионов C–O⋯Re(O4) и Re–O⋯Re(O4) создают структурные различия между перренатом и пертехнетатом L-гистидина». CrystEngComm . 26 : 61–69. doi :10.1039/D3CE01164J. ISSN  1466-8033. S2CID  265572280.
  10. ^ ab Ingle, Robert A. (2011). "Биосинтез гистидина". The Arabidopsis Book . 9 : e0141. doi :10.1199/tab.0141. PMC 3266711 . PMID  22303266. 
  11. ^ Робертс, Джон Д. (2000). ABCs of FT-NMR . Sausalito, CA: University Science Books. стр. 258–9. ISBN 978-1-891389-18-4.
  12. ^ Bornhorst, JA; Falke, JJ (2000). "Очистка белков с использованием полигистидиновых аффинных меток". Applications of Chimeric Genes and Hybrid Proteins Part A: Gene Expression and Protein Purification . Methods in Enzymology. Vol. 326. pp. 245–254. doi :10.1016/s0076-6879(00)26058-8. ISBN 978-0-12-182227-9. ISSN  0076-6879. PMC  2909483 . PMID  11036646.
  13. ^ Watly, Joanna; Simonovsky, Eyal; Barbosa, Nuno; Spodzieja, Marta; Wieczorek, Robert; Rodziewicz-Motowidlo, Sylwia; Miller, Yifat; Kozlowski, Henryk (2015-08-17). "African Viper Poly-His Tag Peptide Fragment Efficiently Binds Metal Ions and Is Folded into an α-Helical Structure". Inorganic Chemistry . 54 (16): 7692–7702. doi :10.1021/acs.inorgchem.5b01029. ISSN  1520-510X. PMID  26214303.
  14. ^ Карта биохимических путей Roche Карта биохимических путей Roche
  15. ^ ab Alifano, P; Fani, R; Liò, P; Lazcano, A; Bazzicalupo, M; Carlomagno, MS; Bruni, CB (1996-03-01). "Путь биосинтеза гистидина и гены: структура, регуляция и эволюция". Microbiological Reviews . 60 (1): 44–69. doi :10.1128/MMBR.60.1.44-69.1996. ISSN  0146-0749. PMC 239417 . PMID  8852895. 
  16. ^ ab Кулис-Хорн, Роберт К; Персике, Маркус; Калиновски, Йорн (2014-01-01). «Биосинтез гистидина, его регуляция и биотехнологическое применение в Corynebacterium glutamicum». Микробная биотехнология . 7 (1): 5–25. doi :10.1111/1751-7915.12055. ISSN  1751-7915. PMC 3896937. PMID 23617600  . 
  17. ^ Адамс, Э. (1955-11-01). "L-Гистидинал, биосинтетический предшественник гистидина". Журнал биологической химии . 217 (1): 325–344. doi : 10.1016/S0021-9258(19)57184-8 . ISSN  0021-9258. PMID  13271397.
  18. ^ ab Ahmed A. Организация региона гистидина-3 у Neurospora. Mol Gen Genet. 1968;103(2):185-93. doi: 10.1007/BF00427145. PMID 4306011
  19. ^ ДеНофрио, Ян (2011-02-08). «Почему растения могут производить незаменимые аминокислоты, а люди — нет?». The Tech Interactive . Спросите генетика . Получено 2024-08-04 .
  20. ^ Степанский, А.; Леустек, Т. (2006-03-01). «Биосинтез гистидина в растениях». Аминокислоты . 30 (2): 127–142. doi :10.1007/s00726-005-0247-0. ISSN  0939-4451. PMID  16547652. S2CID  23733445.
  21. ^ Чэн, Юнсонг; Чжоу, Юньцзяо; Ян, Лэй; Чжан, Чэнлинь; Сюй, Цинъян; Се, Сисянь; Чэнь, Нин (2013-05-01). «Модификация генов пути биосинтеза гистидина и влияние на производство L-гистидина в Corynebacterium glutamicum». Biotechnology Letters . 35 (5): 735–741. doi :10.1007/s10529-013-1138-1. ISSN  1573-6776. PMID  23355034. S2CID  18380727.
  22. ^ Серия обзоров Совета (BRS) abc — Биохимия, молекулярная биология и генетика (пятое издание): Свенсон, Ким, Глюксман
  23. ^ Coote, JG; Hassall, H. (1973-03-01). «Деградация l-гистидина, имидазолил-l-лактата и имидазолилпропионата Pseudomonas testosteroni». Biochemical Journal . 132 (3): 409–422. doi :10.1042/bj1320409. ISSN  0264-6021. PMC 1177604. PMID 4146796  . 
  24. ^ Mehler, AH; Tabor, H. (1953-04-01). «Дезаминирование гистидина с образованием уроканиновой кислоты в печени». Журнал биологической химии . 201 (2): 775–784. doi : 10.1016/S0021-9258(18)66234-9 . ISSN  0021-9258. PMID  13061415.
  25. ^ Андерсен, Хьялте Х.; Эльберлинг, Йеспер; Арендт-Нильсен, Ларс (1 сентября 2015 г.). «Человеческие суррогатные модели гистаминергического и негистаминэргического зуда» (PDF) . Acta Dermato-Venereologica . 95 (7): 771–777. дои : 10.2340/00015555-2146 . ISSN  1651-2057. ПМИД  26015312.
  26. ^ "3-Метилгистидин". HMDB Version 4.0 . База данных метаболома человека. 20 декабря 2017 г. Получено 25 декабря 2017 г.
  27. ^ Дераве, Вим; Эверарт, Инге; Бекман, Сэм; Багет, Одри (01.03.2010). «Обмен карнозина в мышцах и добавление бета-аланина в связи с упражнениями и тренировками». Спортивная медицина . 40 (3): 247–263. doi :10.2165/11530310-000000000-00000. hdl : 1854/LU-897781 . ISSN  1179-2035. PMID  20199122. S2CID  7661250.
  28. ^ Фэйи, Роберт С. (2001). «Новые тиолы прокариот». Ежегодный обзор микробиологии . 55 : 333–56. doi :10.1146/annurev.micro.55.1.333. PMID  11544359.
  29. ^ Институт медицины (2002). "Белки и аминокислоты". Диетические рекомендации по потреблению энергии, углеводов, клетчатки, жиров, жирных кислот, холестерина, белков и аминокислот . Вашингтон, округ Колумбия: The National Academies Press. стр. 589–768. doi :10.17226/10490. ISBN 978-0-309-08525-0.
  30. ^ Холечек, Милан (2020-03-22). «Гистидин в здоровье и болезнях: метаболизм, физиологическое значение и использование в качестве добавки». Питательные вещества . 12 (3): 848. doi : 10.3390/nu12030848 . ISSN  2072-6643. PMC 7146355. PMID 32235743  . 

Внешние ссылки