stringtranslate.com

НАХТ-домен

Домен NACHT представляет собой эволюционно консервативный белковый домен . Этот домен NTPase обнаружен в белках апоптоза , а также в белках, участвующих в транскрипции MHC . [1] Его название отражает некоторые белки, которые его содержат: NAIP ( белок-ингибитор апоптоза семейства NLP ), CIITA (то есть активатор транскрипции C2TA или MHC класса II ), HET-E (белок локуса несовместимости из Podospora anserina ) и TEP1. (то есть TP1 или белок, связанный с теломеразой).

Домен NACHT содержит от 300 до 400 аминокислот . Это предполагаемый домен нуклеозидтрифосфатазы (НТФазы), который содержится в белках животных , грибов и бактерий . Он обнаружен в ассоциации с другими доменами, такими как домен рекрутирования каспазы ( InterProIPR001315 ), пириновый домен ( InterProIPR004020 ), домен повтора HEAT ( InterProIPR004155 ), повтор WD40 ( InterProIPR001680 ), богатый лейцином повтор (LRR) или повтор BIR ( InterProIPR001370 ). [1]

Домен NACHT состоит из семи различных консервативных мотивов, включая специфичную для АТФ/ГТФазы P-петлю, сайт связывания Mg 2+ ( мотивы Уокера A и B соответственно) и пять более специфических мотивов. Уникальные особенности домена NACHT включают преобладание «крошечных» остатков (глицин, аланин или серин) непосредственно на С-конце Mg2 + -координирующего аспартата в мотиве Уокера B вместо второго кислого остатка, преобладающего в других НТФазы. Второй кислотный остаток обычно обнаруживается в белках, содержащих NACHT, на два положения ниже. Более того, дистальный мотив VII содержит консервативный набор полярных, ароматических и гидрофобных остатков, который не наблюдается ни в одном другом семействе NTPase. [1]

Примеры

Белки человека, содержащие этот домен, включают:

Рекомендации

  1. ^ abc Кунин Е.В., Аравинд Л. (май 2000 г.). «Семейство NACHT - новая группа предсказанных НТФаз, участвующих в апоптозе и активации транскрипции MHC». Тенденции биохимических наук . 25 (5): 223–4. дои : 10.1016/S0968-0004(00)01577-2. ПМИД  10782090.
В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR007111.