НЛРП2

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Белок 2, содержащий домены NACHT, LRR и PYD, представляет собой белок , который у людей кодируется геном NLRP2 . [ ^{5] [6] [7]}

Белки NALP, такие как NALP2, характеризуются N-концевым доменом пирина (PYD) и участвуют в активации каспазы-1 (CASP1; MIM 147678) с помощью Toll-подобных рецепторов (см. TLR4). Они также могут участвовать в белковых комплексах, которые активируют провоспалительные каспазы (Tschopp et al., 2003). [предоставлено OMIM] ^{[7] [8]}

Функция

Ген NLRP2 является одним из членов семейства рецепторов нуклеотид-связывающих и лейцин -богатых повторов (NLR). Информация из многих литературных источников указывает на то, что N-концевой эффекторный домен пирина (PYD) является одним из компонентов гена NLRP2. Другие компоненты включают центрально расположенный домен нуклеотид -связывающих и олигомеризационных (NACHT) и C-концевые лейцин-богатые повторы (LRR). ^[9] Известно, что продукты гена NLRP2 взаимодействуют с компонентами комплекса киназы IkB (IKK). Он также может регулировать активность как каспазы-1, так и ядерного фактора каппа-легкой цепи-энхансера активированных В-клеток (NF-kB). Пириновый домен необходим и достаточен для подавления активности NF-kB (Minkiewicz, de Rivero Vaccari и Keane 1113). Известно, что аллельный вариант (rs147585490) блокирует транскрипционную активность NF-kB. Ген NLRP2 является одним из генов семейства NLR; считается, что он участвует в регуляции иммунных реакций (Minkiewicz, de Rivero Vaccari и Keane 1121). Хотя это не совсем понятно, ген NLRP2 отвечает за поддержание фертильности у женщин и способствует нормальным родам. Ген NPRP2 кодирует человеческий белок, известный как «белок 2, содержащий домены NACHT, LRR и PYD». ^[10] NALP2, который является одним из белков NALP, имеет N-концевую пириновую характеристику, также кодируемую как MIM 608107 и домен PYD. ^[11] Белок NALP2 играет роль в процессе активации каспазы-1, которая кодируется как CASP1; MIM 147678. Процесс активации происходит через Toll-подобные рецепторы. NALP2 также может принимать участие в белковых комплексах, которые инициируют активацию провоспалительных каспаз. ^[12] Семейство NLR регулирует работу иммунной системы , что технически ставит под угрозу нормальные функции организма, включая репродукцию.

Открытие

Семейство генов NLR, к которому принадлежит ген NLRP2, было впервые извлечено из данио-рерио, который является обычным образцом для изучения иммунных систем. Считается, что ген NLRP2 произошел от семейства генов NLR в результате мутации . ^[13] Мутация была инициирована необходимостью организмов приспосабливаться к динамической среде и диверсификации на этапах эволюции. ^[14] Кроме того, мутация белков семейства генов NLR также была вызвана способностью патогенов подрывать защитный механизм хозяина. ^[15] Поэтому организмы были вынуждены изобретать новые способы обнаружения и противодействия эффектам резистентных патогенов . ^[16] Эволюция белков NLR определяет происхождение гена NLRP2. Ген NLRP2 в настоящее время является врожденным иммунным сенсором для патогенов и сигнала стерильного стресса (SSS) в многоклеточных организмах.

Мутация и бесплодие

Дефицит гена NLRP2 приводит к подавлению активации ооцитов. ^[17] Ген NLRP2 экспрессируется исключительно в ооцитах. Таким образом, он регулирует качество ооцитов, что объясняет его связь с бесплодием у женщин. ^[18]

Ссылки

1. ENSG00000275796, ENSG00000277060, ENSG00000275843, ENSG00000275399, ENSG00000022556, ENSG00000275082, ENSG00000278682, ENSG00000274638, ENSG00000273992 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000278789, ENSG00000275796, ENSG00000277060, ENSG00000275843, ENSG00000275399, ENSG00000022556, ENSG00000275082, ENSG00000278682, ENSG00000274638, ENSG00000273992 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000035177 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Tschopp J, Martinon F, Burns K (февраль 2003 г.). «NALP: новое семейство белков, участвующих в воспалении». Nature Reviews. Molecular Cell Biology . 4 (2): 95–104. doi :10.1038/nrm1019. PMID  12563287. S2CID  31417018.
6. Bertin J, DiStefano PS (декабрь 2000 г.). «Домен PYRIN: новый мотив, обнаруженный в белках апоптоза и воспаления». Cell Death and Differentiation . 7 (12): 1273–4. doi : 10.1038/sj.cdd.4400774 . PMID  11270363.
7. "Ген Entrez: семейство NLRP2 NLR, домен пирина, содержащий 2".
8. "Семейство NLRP2 NLR, домен пирина, содержащий 2 [ Homo sapiens (человек) ]". NCBI .
9. Minkiewicz J, de Rivero Vaccari JP, Keane RW (июль 2013 г.). «Человеческие астроциты экспрессируют новую инфламмасому NLRP2». Glia . 61 (7): 1113–21. doi :10.1002/glia.22499. PMID  23625868. S2CID  24606692.
10. Ачарья С., Саха С., Прадхан П. (декабрь 2018 г.). «Новые основанные на симметрии меры различия генов с использованием онтологии генов: применение в кластеризации генов». Gene . 679 : 341–351. doi :10.1016/j.gene.2018.08.062. PMID  30184472. S2CID  52163882.
11. Peng H, Liu H, Liu F и др. (сентябрь 2017 г.). «Дефицит NLRP2 и FAF1 блокирует ранний эмбриогенез у мышей». Reproduction . 154 (3): 245–251. doi :10.1530/REP-16-0629. PMID  28630100.
12. Vizlin-Hodzic D, Zhai Q, Illes S и др. (январь 2017 г.). «Раннее начало воспаления во время онтогенеза биполярного расстройства: ген инфламмасомы NLRP2 отчетливо различается между пациентами и здоровыми людьми при переходе между стадиями iPS-клеток и нейральных стволовых клеток». Трансляционная психиатрия . 7 (1): e1010. doi :10.1038/tp.2016.284. PMC 5545741 . PMID  28117838. 
13. Ачарья С., Саха С., Прадхан П. (декабрь 2018 г.). «Новые основанные на симметрии меры различия генов с использованием онтологии генов: применение в кластеризации генов». Gene . 679 : 341–351. doi :10.1016/j.gene.2018.08.062. PMID  30184472. S2CID  52163882.
14. Yang Y, Lang X, Sun S и др. (ноябрь 2018 г.). «NLRP2 отрицательно регулирует противовирусный иммунитет, взаимодействуя с TBK1». European Journal of Immunology . 48 (11): 1817–1825. doi : 10.1002/eji.201847589 . PMID  30183071.
15. Minkiewicz J, de Rivero Vaccari JP, Keane RW (июль 2013 г.). «Человеческие астроциты экспрессируют новую инфламмасому NLRP2». Glia . 61 (7): 1113–21. doi :10.1002/glia.22499. PMID  23625868. S2CID  24606692.
16. Махадеван С., Сатхаппан В., Утама Б. и др. (апрель 2017 г.). «Опечатка: Матерински экспрессируемый NLRP2 связывает подкорковый материнский комплекс (SCMC) с фертильностью, эмбриогенезом и эпигенетическим перепрограммированием». Scientific Reports . 7 : 46434. Bibcode :2017NatSR...746434M. doi :10.1038/srep46434. PMC 5395947 . PMID  28422141. 
17. Minkiewicz J, de Rivero Vaccari JP, Keane RW (июль 2013 г.). «Человеческие астроциты экспрессируют новую инфламмасому NLRP2». Glia . 61 (7): 1113–21. doi :10.1002/glia.22499. PMID  23625868. S2CID  24606692.
18. Ачарья С., Саха С., Прадхан П. (декабрь 2018 г.). «Новые основанные на симметрии меры различия генов с использованием онтологии генов: применение в кластеризации генов». Gene . 679 : 341–351. doi :10.1016/j.gene.2018.08.062. PMID  30184472. S2CID  52163882.

Дальнейшее чтение

• Teng SC, Wu KJ, Tseng SF и др. (сентябрь 2006 г.). «Импорт KPNA2, NBS1, восстановление ДНК и опухолеобразование». Журнал молекулярной гистологии . 37 (5–7): 293–9. doi :10.1007/s10735-006-9032-y. PMID  16752129. S2CID  7281949.
• Маруяма К, Сугано С (январь 1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K и др. (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
• Martinon F, Hofmann K, Tschopp J (февраль 2001 г.). "Домен пирина: возможный член семейства доменов смерти-фолда, вовлеченный в апоптоз и воспаление". Current Biology . 11 (4): R118-20. Bibcode :2001CBio...11.R118M. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00056-2 . PMID  11250163. S2CID  18564343.
• Wang L, Manji GA, Grenier JM и др. (август 2002 г.). «PYPAF7, новый белок, содержащий PYRIN и подобный Apaf1, который регулирует активацию NF-kappa B и зависимую от каспазы-1 обработку цитокинов». Журнал биологической химии . 277 (33): 29874–80. doi : 10.1074/jbc.M203915200 . PMID  12019269.
• Grenier JM, Wang L, Manji GA и др. (октябрь 2002 г.). «Функциональный скрининг пяти членов семейства PYPAF идентифицирует PYPAF5 как новый регулятор NF-kappaB и каспазы-1». FEBS Letters . 530 (1–3): 73–8. doi :10.1016/S0014-5793(02)03416-6. PMID  12387869. S2CID  25023390.
• Agostini L, Martinon F, Burns K и др. (март 2004 г.). "NALP3 формирует инфламмасому, обрабатывающую IL-1beta, с повышенной активностью при аутовоспалительном расстройстве Макла-Уэллса". Immunity . 20 (3): 319–25. doi : 10.1016/S1074-7613(04)00046-9 . PMID  15030775.
• Bruey JM, Bruey-Sedano N, Newman R и др. (декабрь 2004 г.). "PAN1/NALP2/PYPAF2, индуцируемый воспалительный медиатор, регулирующий активацию NF-kappaB и каспазы-1 в макрофагах". Журнал биологической химии . 279 (50): 51897–907. doi : 10.1074/jbc.M406741200 . PMID  15456791.
• Киносита Т., Ван И., Хасегава М. и др. (июнь 2005 г.). «PYPAF3, белок, подобный APAF-1, содержащий PYRIN, является регулятором обратной связи секреции интерлейкина-1бета, зависящей от каспазы-1». Журнал биологической химии . 280 (23): 21720–5. doi : 10.1074/jbc.M410057200 . hdl : 2297/2649 . PMID  15817483.
• Rink L, Slupianek A, Stoklosa T и др. (июль 2007 г.). «Усиленное фосфорилирование Nbs1, члена комплекса репарации/контрольной точки ДНК Mre11-RAD50-Nbs1, может быть направлено на повышение эффективности мезилата иматиниба против BCR/ABL-положительных лейкозных клеток». Blood . 110 (2): 651–60. doi :10.1182/blood-2006-08-042630. PMC  1924483 . PMID  17431132.