stringtranslate.com

Гаплогруппа О-М119

В генетике человека гаплогруппа O-M119 представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы . Гаплогруппа O-M119 является потомком гаплогруппы O-F265, также известной как O1a, одного из двух существующих первичных субкладов гаплогруппы O-M175 . Эта же клада ранее была обозначена как O-MSY2.2. [6]

Происхождение

Считается, что ветвь гаплогруппы O-M119 возникла во время позднего плейстоцена ( верхнего палеолита ) на материковой части Китая. [ нужна цитата ]

Палеолитические миграции

Карафет и др. (2010) предполагают, что гаплогруппа O-M119 была частью четырехфазной модели колонизации, в которой палеолитические миграции охотников-собирателей сформировали первичную структуру нынешнего разнообразия Y-хромосомы Приморской Юго-Восточной Азии . Примерно в 5000 году до нашей эры гаплогруппа O-M119 объединилась в Сундаленде и мигрировала на север до Тайваня, где O-M50 составляет около 90% Y-ДНК аборигенов, будучи основной гаплогруппой, которая может быть напрямую связана с фазовой австронезийской экспансией. 3.

Родина Тайвань

Ли и др. (2008) пришли к выводу, что, в отличие от гипотезы о родине Тайваня, жители островов Юго-Восточной Азии не имеют тайваньского происхождения по отцовской линии. Согласно их результатам, родословные в Приморье Юго-Восточной Азии не произошли от тайваньских аборигенов, как предполагают лингвистические исследования. Аборигены Тайваня и индонезийцы, вероятно, произошли от населения, говорящего на языке тай-кадай , на основе их отцовской линии, и после этого развивались независимо друг от друга.

Самая сильная положительная корреляция между гаплогруппой О-М119 и этнолингвистической принадлежностью наблюдается между этой гаплогруппой и австронезийцами . Пиковая частота гаплогруппы О-М119 встречается у аборигенов Тайваня, именно того региона, из которого лингвисты предположили, что произошла австронезийская языковая семья . Несколько более слабая корреляция наблюдается между гаплогруппой O-M119 и ханьским китайским населением южного Китая, а также между этой гаплогруппой и тай-кадай-говорящим населением южного Китая и Юго-Восточной Азии. Распространение языков тай-кадай в Таиланде и других частях Юго-Восточной Азии за пределами Китая долгое время считалось, по причинам традиционной лингвистической географии, отражением недавнего вторжения в Юго-Восточную Азию говорящего на тай-кадай населения, происходящего из юго-восточного Китая. а несколько повышенная частота гаплогруппы O-M119 среди популяций Тай-Кадай в сочетании с высокой частотой гаплогруппы O-M95, которая является генетической характеристикой австроазиатскоязычных народов Юго -Восточной Азии, позволяет предположить, что генетическая подпись Родство народов Тай-Кадай с населением юго-восточного Китая было ослаблено из-за обширной ассимиляции более ранних австроазиатских жителей земель, в которые вторглись народы Тай-Кадай.

Распределение

Линии гаплогруппы O-M119 встречаются в основном у населения Юго-Восточной Азии в Малайзии , Вьетнаме , Индонезии , Филиппинах , южном Китае и Тайване (ISOGG 2010). Высокие частоты этой гаплогруппы были обнаружены в популяциях, распространившихся по юго-восточному Китаю, Тайваню, Филиппинам и Индонезии. В целом он был обнаружен с меньшей частотой в образцах из Океании, материковой части Юго-Восточной Азии, Юго-Западного Китая, Северо-Западного Китая, Северного Китая, Северо-Восточного Китая, Кореи, Японии, Северной Азии и Центральной Азии.

Исследование Ли, проведенное в 2008 году, показало, что анализ примесей в популяциях, говорящих на языке тай-кадай, показал значительное генетическое влияние у значительной части индонезийцев. Большинство выборок населения содержали высокую частоту гаплогруппы O-M119. [7]

Частоты гаплогруппы O-M119 среди различных восточноазиатских и австронезийских популяций предполагают сложную генетическую историю современных ханьских популяций южного Китая. [ нужна цитата ] Хотя гаплогруппа O-M119 встречается только со средней частотой примерно 4% среди ханьского населения северного Китая и народов юго-западного Китая и Юго-Восточной Азии, говорящих на тибето-бирманских языках , частота этой гаплогруппы среди ханьского населения на юге Китая этот показатель увеличивается почти в четыре раза и составляет примерно 15-23%. [8] Было обнаружено, что частота гаплогруппы O-M119 среди южных ханьцев немного превышает среднее арифметическое частот гаплогруппы O-M119 среди северных ханьцев и объединенной выборки австронезийских популяций. Это говорит о том, что современные популяции Южного Хань могут обладать нетривиальным количеством предков мужского пола, которые изначально были связаны с какой-то австронезийской культурой или, по крайней мере, имели некоторую генетическую близость со многими предками современных австронезийских народов. [9] [10]

Распределение субкладов

О-М119

Эта линия часто встречается у австронезийцев , южных ханьцев и народов кра-дай . [11] Предполагается, что эта линия является маркером доисторической австронезийской экспансии, возможное происхождение которой охватывает регионы вдоль юго-восточного побережья Китая и соседнего Тайваня , и встречается среди современных популяций морской Юго-Восточной Азии и Океании (Karafet 2005).

Также было обнаружено, что Y-хромосомы гаплогруппы O-M119 встречаются с низкой частотой среди различных популяций Сибири , таких как нивхи (одна из 17 выбранных Y-хромосом), ульчи / нанайцы (2/53), енисейские эвенки (1/ 31), и особенно буряты , проживающие на Саяно - Байкальском нагорье Иркутской области (6/13) (Лелл 2002).

О-П203

O-P203 был обнаружен у 86,7% (52/60) выборки из Ниаса , 70,8% (34/48) тайваньских аборигенов, 28,4% (21/74) жителей Ментавая , 11,4% (73/641) балийцев, 9,8% (6/61) выборки из Явы, 9,1% (36/394) выборки из Флореса , 9,1% (15/165) ханьцев, 8,3% (1/12) выборки из Западного Самоа , 8,2% (4/49) туцзя из Хунани , 6,9% (4/58) мяо из Китая, 5,7% (4/70) вьетнамцев, 3,3% (1/30) выборки с Молуккских островов , 3,1 % (1/32) малазийцев, 3,0% (1/33) выборки из высокогорной Папуа-Новой Гвинеи, 2,6% (1/38) выборки с Суматры, 2,3% (2/86) выборки с Борнео , 2,1% (1/48) филиппинцев, 2,0% (1/51) Ше , 1,7% (1/60) Яо из Гуанси, 1,1% (1/92) выборки из Лембаты и 0,9% ( 3/350) образца из Сумбы . [12]

В исследовании, опубликованном в 2011 году, O-P203 наблюдался у 22,2% (37 из 167) ханьских китайцев-мужчин-добровольцев в Фуданьском университете в Шанхае, чье происхождение можно проследить до Восточного Китая (Цзянсу, Чжэцзян, Шанхай или Аньхой). 12,3% (8/65) ханьских китайцев-добровольцев-мужчин, происхождение которых можно проследить до Южного Китая , и 1,6% (2/129) ханьских китайцев-добровольцев-мужчин, чье происхождение можно проследить до Северного Китая . [13]

О-М101

Эта линия наблюдалась у одного человека из Китая (Underhill 2000) и другого из Кота-Кинабалу (Hurles 2005).

Согласно веб-сайту китайской компании по генетическому тестированию 23mofang, O-M101 является субкладом O-M307/P203 (O-M307 > O-F446 > O-F5498 > O-Z23406 > O-M101). Его TMRCA , по оценкам, возник за 4850 лет до настоящего времени, и, по оценкам, на него приходится Y-ДНК примерно 0,21% всех мужчин в современном Китае, причем его распространение относительно плотное в Хунани , Хубэе , Хайнане и Цзянси . . [14] По оценкам, субклад O-M101 > O-A5863 > O-SK1573 (TMRCA 3400 лет назад), на который приходится Y-ДНК примерно 0,08% всех мужчин в современном Китае, относительно сконцентрирован в Южно-Центральном Китае. Китай и Юго-Западный Китай в настоящее время. [15] Субклад O-M101 > O-A5863 > O-Y163909 (TMRCA 4080 лет назад) наблюдался у 16,7% (3/18) выборки мужчин Фуана из Центрального Таиланда . [16] [17]

О-М50

Эта линия встречается среди австронезийских народов Тайваня, Филиппин, Индонезии, Меланезии, Микронезии и Мадагаскара, а также среди некоторых популяций континентальной Юго-Восточной Азии и среди народов банту на Коморских островах . [18] Он также был найден у гавайца . [19]

Исследование, опубликованное в 2005 году, обнаружило O-M50 у 33,3% (13/39) выборки аборигенов Тайваня, 18,2% (2/11) выборки жителей Маджуро , 17,1% (6/35) выборки. малагасийцев , 9,2% (6/65) выборки жителей Кота-Кинабалу , 9,1% (2/22) выборки жителей Банджармасина , 3,6 % (1/28) выборки жителей Филиппин , и 1,9% (1/52) выборки жителей Вануату . [20]

Кайзер и др. В 2008 году O-M110 был обнаружен у 34,1% (14/41) выборки аборигенов Тайваня, 17,7% (26/147) выборки с островов Адмиралтейства, 17,3% (9/52) выборки с островов Тробриан, 13,5% (5/37) выборки с Филиппин, 9,7% (3/31) выборки с островов Нуса-Тенгара, 3,8% (2/53) выборки с Явы, 3,0% (1/33) образца с Молуккских островов, 2,5% (1/40) образца с Борнео, 1,0% (1/100) образца из Тувалу и 0,95% (1/105) образца из Фиджи. [21]

Исследование, опубликованное в 2010 году, выявило O-M110 у 18,8% (9/48) тайваньских аборигенов, 13,3% (8/60) Ниаса, 8,3% (4/48) Филиппин, 7,4% (4/54) Сулавеси, 6,3% ( 22/350) Сумба, 5,8% (5/86) Борнео, 3,3% (1/30) Молуккские острова, 2,3% (1/44) Маэво, Вануату, 1,6% (1/61) Ява, 1,4% (1/74) ) Ментавай и 0,8% (5/641) Бали. [22]

Исследование, опубликованное в 2012 году, обнаружило O-M110 у 4,6% (33/712) мужчин с Соломоновых Островов . [23]

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены при создании дерева YCC.

Филогенетические деревья

Это филогенетическое древо субкладов гаплогруппы O основано на дереве YCC 2008 (Карафет 2008) и последующих опубликованных исследованиях.

Смотрите также

Генетика

Субклады Y-ДНК О

Доля О-М119 в различных образцах

Основополагающее дерево Y-ДНК

Рекомендации

Сноски

  1. ^ Моника Кармин, Родриго Флорес, Лаури Сааг и др. (2022), «Эпизоды диверсификации и изоляции мужских линий островной Юго-Восточной Азии и Ближнего Океании». Мол. Биол. Эвол. 39(3): msac045 doi:10.1093/molbev/msac045
  2. ^ Позник, Дж. Дэвид; Сюэ, Яли; Мендес, Фернандо Л; Виллемс, Томас Ф; Массайя, Андреа; Уилсон Сейрес, Мелисса А.; Аюб, Касим; Маккарти, Шейн А; и другие. (июнь 2016 г.). «Периодические всплески демографии мужского пола, полученные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру». Природная генетика . 48 (6): 593–599. дои : 10.1038/ng.3559. hdl : 11858/00-001M-0000-002A-F024-C .
  3. ^ Филогенетическое древо гаплогруппы O1-F75 на 23мофанге.
  4. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar as at au av aw ax ay az ba bb bc bd be bf bg bh bi bj bk bl bm bn bo bp bq br bs bt bu bv bw YFull Haplogroup YTree v6.03.19, 24 июля 2018 г.
  5. ^ abcdefghijklmnopqrstu v Филогенетическое древо гаплогруппы O1a-M119 в 23mofang
  6. ^ https://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpO.html: «MSY2.2 был удален из дерева, поскольку не давал надежных результатов».
  7. ^ (Ли и др. 2008)
  8. ^ Ян, Ши (сентябрь 2011 г.). «Обновленное дерево гаплогруппы O Y-хромосомы и пересмотренные филогенетические положения мутаций P164 и PK4». Европейский журнал генетики человека . 19 (9): 1013–5. дои : 10.1038/ejhg.2011.64. ПМК 3179364 . ПМИД  21505448. 
  9. ^ Паназиатский консорциум SNP HUGO, Паназиатский консорциум SNP HUGO (2009). «Картирование генетического разнообразия человека в Азии». Наука . 326 (5959): 1541–1545. Бибкод : 2009Science...326.1541.. doi :10.1126/science.1177074. PMID  20007900. S2CID  34341816.
  10. ^ Паназиатский консорциум SNP HUGO, Паназиатский консорциум SNP HUGO (2009). «Картирование генетического разнообразия человека в Азии». Наука . Научный журнал. 326 (5959): 1541–1545. Бибкод : 2009Science...326.1541.. doi :10.1126/science.1177074. PMID  20007900. S2CID  34341816 . Проверено 11 декабря 2009 г.
  11. ^ «Основное разделение Восток-Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы в Индонезии». Карафет и др. Архивировано из оригинала 8 июня 2014 г. Проверено 15 мая 2010 г.
  12. ^ Карафет, Татьяна (2010). «Основное разделение Восток-Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы в Индонезии». Молекулярная биология и эволюция . 27 (8): 1833–1844. дои : 10.1093/molbev/msq063 . ПМИД  20207712.
  13. ^ Ши Янь, Чуан-Чао Ван, Хуэй Ли, Ши-Лин Ли, Ли Цзинь и Генографический консорциум, «Обновленное дерево гаплогруппы O Y-хромосомы и пересмотренные филогенетические положения мутаций P164 и PK4». Европейский журнал генетики человека (2011) 19, 1013–1015; дои:10.1038/ejhg.2011.64; опубликовано онлайн 20 апреля 2011 г.
  14. ^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/O-M101/detail
  15. ^ https://www.23mofang.com/ancestry/ytree/O-SK1573/detail
  16. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz а.а. Вибху Кутанан, Джатупол Кампуансай, Метави Срикуммул и др. (2019), «Контраст отцовской и материнской генетической истории населения Таиланда и Лаоса». Мол. Биол. Эвол. Публикация в предварительном доступе, 12 апреля 2019 г. doi:10.1093/molbev/msz083
  17. ^ Филогенетическое древо гаплогруппы O-M119 на TheYtree.
  18. ^ Мсаиди, Саид; Дюкурно, Аксель; Боетч, Жиль; Лонгепье, Гай; Папа, Кассим; Аллибер, Клод; Яхая, Али Ахмед; Кьярони, Жак; Митчелл, Майкл Дж. (январь 2011 г.). «Генетическое разнообразие Коморских островов показывает, что раннее мореплавание стало основным фактором, определяющим биокультурную эволюцию человека в западной части Индийского океана». Европейский журнал генетики человека . 19 (1): 89–94. дои : 10.1038/ejhg.2010.128. ПМК 3039498 . ПМИД  20700146. 
  19. ^ Свапан Маллик, Хенг Ли, Марк Липсон и др. , «Проект Саймонса по разнообразию геномов: 300 геномов из 142 различных популяций». Nature 538, 201–206 (13 октября 2016 г.) doi:10.1038/nature18964
  20. ^ аб Херлс, Мэтью Э.; Сайкс, Брайан С.; Джоблинг, Марк А.; Форстер, Питер (2005). «Двойное происхождение малагасийцев на островах Юго-Восточной Азии и Восточной Африки: данные по материнской и отцовской линии». Американский журнал генетики человека . 76 (5): 894–901. дои : 10.1086/430051. ПМЦ 1199379 . ПМИД  15793703. 
  21. ^ Манфред Кайзер, Инь Чой, Маннис ван Овен, Стефано Мона, Силке Брауэр, Рональд Дж. Трент, Дагвин Суаркиа, Вульф Шифенхёвель и Марк Стоункинг (2008), «Влияние австронезийской экспансии: данные мтДНК и разнообразия Y-хромосомы» на Адмиралтейских островах Меланезии». Мол. Биол. Эвол. 25 (7): 1362–1374. doi:10.1093/molbev/msn078
  22. ^ Карафет и др. 2010.
  23. ^ Фредерик Дельфин, Шон Майлз, Инь Чой, Дэвид Хьюз, Роберт Иллек, Маннис ван Овен, Бриджит Пакендорф , Манфред Кайзер и Марк Стоункинг, «Соединяя ближнюю и отдаленную Океанию: вариации мтДНК и NRY на Соломоновых островах». Молекулярная биология и эволюция 29 (2): 545–564. 2012 doi:10.1093/molbev/msr186.
  24. ^ abc Брунелли, Андреа; Кампуансай, Ятуполь; Зейлстад, Марк; Ломтайсонг, Кхимика; Канванпонг, Даорунг; Гиротто, Сильвия; Кутанан, Вибху (24 июля 2017 г.). «Y-хромосомные данные о происхождении жителей северного Таиланда». ПЛОС ОДИН . 12 (7): e0181935. дои : 10.1371/journal.pone.0181935 . ПМК 5524406 . ПМИД  28742125. 
  25. ^ Вибху Кутанан, Расми Шуконгдедж, Метави Шрикуммул и др. (2020), «Культурные различия влияют на отцовские и материнские генетические линии хмонг-миенских и китайско-тибетских групп из Таиланда». Европейский журнал генетики человека https://doi.org/10.1038/s41431-020-0693-x
  26. ^ abcdef O Проект Y-гаплогруппы в ДНК Генеалогического древа
  27. ^ abcde Энрико Махольдт, Леонардо Ариас, Нгуен Туи Дуонг и др. , «Генетическая история вьетнамского населения по отцовской и материнской линии». Европейский журнал генетики человека (2020) 28:636–645. https://doi.org/10.1038/s41431-019-0557-4
  28. ^ abcde Моника Кармин, Лаури Сааг, Марио Висенте и др. , «Недавнее ограничение разнообразия Y-хромосомы совпадает с глобальными изменениями в культуре». Геномные исследования (2015) 25: 459-466. дои: 10.1101/гр.186684.114
  29. ^ Андерхилл, Пенсильвания; Шен, П; Лин, А.А.; Джин, Л; Пассарино, Дж; Ян, WH; Кауфман, Э; Бонне-Тамир, Б; Бертранпети, Дж (2000). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Природная генетика . 26 (3): 358–61. дои : 10.1038/81685. PMID  11062480. S2CID  12893406.
  30. ^ Гаплодерево Y-ДНК на FamilyTreeDNA

Цитируемые работы

Веб-сайты

Источники таблиц преобразования