stringtranslate.com

Ядерный антиген пролиферирующих клеток

Крио-ЭМ структура ДНК-связанного процессивного комплекса PolD–PCNA

Ядерный антиген пролиферирующих клеток ( PCNA ) представляет собой зажим ДНК , который действует как фактор процессивности ДНК-полимеразы δ в эукариотических клетках и необходим для репликации. PCNA является гомотримером и достигает своей процессивности, окружая ДНК, где он действует как каркас для рекрутирования белков, участвующих в репликации ДНК, репарации ДНК, ремоделировании хроматина и эпигенетике . [5]

Многие белки взаимодействуют с PCNA посредством двух известных PCNA-взаимодействующих мотивов PCNA-взаимодействующего пептида (PIP) [6] и гомолога AlkB 2 PCNA-взаимодействующего мотива (APIM). [7] Белки, связывающиеся с PCNA через PIP-бокс, в основном участвуют в репликации ДНК, тогда как белки, связывающиеся с PCNA через APIM, в основном важны в контексте генотоксического стресса. [8]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, находится в ядре и является кофактором ДНК-полимеразы дельта. Кодируемый белок действует как гомотример и помогает увеличить процессивность синтеза ведущей цепи во время репликации ДНК. В ответ на повреждение ДНК этот белок убиквитинируется и участвует в RAD6-зависимом пути репарации ДНК. Для этого гена обнаружено два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок. Псевдогены этого гена описаны на 4-й и Х-хромосоме. [9]

PCNA также обнаружен у архей как фактор процессивности polD , единственной многофункциональной ДНК-полимеразы в этой области жизни. [10]

Экспрессия в ядре во время синтеза ДНК

PCNA первоначально был идентифицирован как антиген , который экспрессируется в ядрах клеток во время фазы синтеза ДНК клеточного цикла . [11] Часть белка была секвенирована, и эта последовательность была использована для выделения клона кДНК . [12] PCNA помогает удерживать ДНК-полимеразу дельта ( Pol δ ) на ДНК. PCNA прикрепляется [13] к ДНК посредством действия фактора репликации C (RFC), [14] который является гетеропентамерным членом класса ААА+ АТФаз. Экспрессия PCNA находится под контролем комплексов, содержащих транскрипционный фактор E2F . [15] [16]

Роль в восстановлении ДНК

Поскольку ДНК-полимераза эпсилон участвует в ресинтезе вырезанных поврежденных цепей ДНК во время репарации ДНК , PCNA важен как для синтеза ДНК, так и для репарации ДНК. [17] [18]

PCNA также участвует в пути толерантности к повреждению ДНК, известном как пострепликационная репарация (PRR). [19] При PRR существует два подпути: (1) путь синтеза транслейкоза , который осуществляется специализированными ДНК-полимеразами, которые способны включать поврежденные основания ДНК в свои активные центры (в отличие от нормальной репликативной полимеразы, которая останавливает ), и, следовательно, обойти повреждение, и (2) предложенный путь «переключения шаблона», который, как полагают, включает обход повреждения путем задействования механизма гомологичной рекомбинации. PCNA имеет решающее значение для активации этих путей и выбора того, какой путь будет использоваться клеткой. PCNA посттрансляционно модифицируется убиквитином . [20] Моноубиквитин лизина номер 164 на PCNA активирует путь синтеза транслейкоза. Считается , что удлинение этого моноубиквитина за счет неканонической полиубиквитиновой цепи, связанной с лизин-63, на PCNA [20] активирует путь переключения матрицы. Кроме того, сумойлирование (с помощью небольшого убиквитиноподобного модификатора , SUMO) PCNA лизина-164 (и, в меньшей степени, лизина-127) ингибирует путь переключения матрицы. [20] Этот антагонистический эффект возникает потому, что сумойилированная PCNA рекрутирует ДНК-хеликазу под названием Srs2, [21] которая играет роль в разрушении нитей нуклеопротеина Rad51, фундаментальных для инициации гомологичной рекомбинации.

PCNA-связывающие белки

PCNA взаимодействует со многими белками. [22]

Взаимодействия

Было показано, что PCNA взаимодействует с:

Белки, взаимодействующие с PCNA через APIM, включают человеческий гомолог AlkB 2, TFIIS-L, TFII-I, Rad51B, [7] XPA, [88] ZRANB3, [89] и FBH1. [90]

Использование

Антитела против ядерного антигена пролиферирующих клеток (PCNA) или моноклональные антитела Ki-67 могут использоваться для классификации различных новообразований , например астроцитомы . Они могут иметь диагностическое и прогностическое значение. Визуализация ядерного распределения PCNA (с помощью мечения антител) может использоваться для различения ранней, средней и поздней S-фазы клеточного цикла. [91] Однако важным ограничением антител является то, что клетки необходимо фиксировать, что приводит к потенциальным артефактам.

С другой стороны, изучение динамики репликации и репарации в живых клетках можно провести путем введения трансляционных слияний PCNA. Чтобы исключить необходимость трансфекции и обойти проблему трудно трансфицируемых и/или короткоживущих клеток, можно использовать проницаемые для клеток маркеры репликации и/или репарации. Эти пептиды обладают тем явным преимуществом, что их можно использовать in situ в живых тканях и даже отличать клетки, подвергающиеся репликации, от клеток, подвергающихся восстановлению. [92]

caPCNA, посттрансляционно модифицированная изоформа PCNA, распространенная в раковых клетках, является потенциальной терапевтической мишенью при терапии рака. [93] [94] В 2023 году Национальный медицинский центр «Город надежды» опубликовал доклинические исследования таргетной химиотерапии с использованием AOH1996 , которая, по-видимому, подавляет рост опухоли, не вызывая заметных побочных эффектов. [95]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ abc GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000132646 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027342 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Ссылка на Human PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Молдавский Г.Л., Пфандер Б., Йенч С. (май 2007 г.). «PCNA, маэстро репликационной вилки». Клетка . 129 (4): 665–679. дои : 10.1016/j.cell.2007.05.003 . PMID  17512402. S2CID  3547069.
  6. ^ Warbrick E (март 1998 г.). «Связывание PCNA через консервативный мотив». Биоэссе . 20 (3): 195–199. doi :10.1002/(sici)1521-1878(199803)20:3<195::aid-bies2>3.0.co;2-r. ПМИД  9631646.
  7. ^ аб Гилльям К.М., Фейзи Э., Аас П.А., Соуза М.М., Мюллер Р., Вогбё CB и др. (сентябрь 2009 г.). «Идентификация нового, широко распространенного и функционально важного мотива связывания PCNA». Журнал клеточной биологии . 186 (5): 645–654. дои : 10.1083/jcb.200903138. ПМК 2742182 . ПМИД  19736315. 
  8. ^ Мейланд Н., Гиббс-Сеймур I, Беккер-Дженсен С. (май 2013 г.). «Регуляция взаимодействий PCNA-белков для стабильности генома». Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 14 (5): 269–282. дои : 10.1038/nrm3562. PMID  23594953. S2CID  25952152.
  9. ^ «Ген Энтрез: ядерный антиген пролиферирующих клеток PCNA» .
  10. ^ Мадру С., Хеннеке Г., Райя П., Югонно-Бофе I, Пехау-Арноде Г., Англия П. и др. (март 2020 г.). «Структурная основа повышенной процессивности ДНК-полимераз D-семейства в комплексе с PCNA». Природные коммуникации . 11 (1): 1591. Бибкод : 2020NatCo..11.1591M. дои : 10.1038/s41467-020-15392-9. ПМК 7101311 . ПМИД  32221299. 
  11. ^ Леонарди Э., Гирландо С., Серио Дж., Маури Ф.А., Перроне Дж., Скампини С. и др. (май 1992 г.). «Экспрессия PCNA и Ki67 при карциноме молочной железы: корреляция с клиническими и биологическими переменными». Журнал клинической патологии . 45 (5): 416–419. дои :10.1136/jcp.45.5.416. ПМК 495304 . ПМИД  1350788. 
  12. ^ Мацумото К., Мориучи Т., Кодзи Т., Накане ПК (март 1987 г.). «Молекулярное клонирование кДНК, кодирующей ядерный антиген пролиферирующих клеток крысы (PCNA)/циклин». Журнал ЭМБО . 6 (3): 637–642. doi :10.1002/j.1460-2075.1987.tb04802.x. ПМЦ 553445 . ПМИД  2884104. 
  13. ^ Боуман Г.Д., О'Доннелл М., Куриян Дж. (июнь 2004 г.). «Структурный анализ эукариотического комплекса скользящей ДНК-зажим-зажим». Природа . 429 (6993): 724–730. Бибкод : 2004Natur.429..724B. дои : 10.1038/nature02585. PMID  15201901. S2CID  4346799.
  14. ^ Чжан Г., Гиббс Э., Кельман З., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (март 1999 г.). «Исследования взаимодействия между фактором репликации человека C и ядерным антигеном пролиферирующих клеток человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (5): 1869–1874. Бибкод : 1999PNAS...96.1869Z. дои : 10.1073/pnas.96.5.1869 . ПМЦ 26703 . ПМИД  10051561. 
  15. ^ Эгелькроут Э.М., Мариконти Л., Сеттлейдж С.Б., Селла Р., Робертсон Д., Хэнли-Боудойн Л. (декабрь 2002 г.). «Два элемента E2F по-разному регулируют промотор ядерного антигена пролиферирующих клеток во время развития листьев». Растительная клетка . 14 (12): 3225–3236. дои : 10.1105/tpc.006403. ПМЦ 151214 . ПМИД  12468739. 
  16. ^ Николай BC, Ланц РБ, Йорк Б, Дасгупта С, Мициадес Н, Крейтон CJ и др. (март 2016 г.). «Передача сигналов HER2 стимулирует анаболизм и пролиферацию ДНК посредством фосфорилирования SRC-3 и генов, регулируемых E2F1». Исследования рака . 76 (6): 1463–1475. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-15-2383. ПМЦ 4794399 . ПМИД  26833126. 
  17. ^ Шивджи К.К., Кенни МК, Вуд Р.Д. (апрель 1992 г.). «Ядерный антиген пролиферирующих клеток необходим для эксцизионной репарации ДНК». Клетка . 69 (2): 367–374. дои : 10.1016/0092-8674(92)90416-А. PMID  1348971. S2CID  12260457.
  18. ^ Эссерс Дж., Тейл А.Ф., Балдейрон С., ван Каппеллен В.А., Хаутсмюллер А.Б., Канаар Р., Вермюлен В. (ноябрь 2005 г.). «Ядерная динамика PCNA в репликации и репарации ДНК». Молекулярная и клеточная биология . 25 (21): 9350–9359. дои : 10.1128/MCB.25.21.9350-9359.2005. ПМЦ 1265825 . ПМИД  16227586. 
  19. ^ Леманн А.Р., Фукс Р.П. (декабрь 2006 г.). «Пробелы и развилки в репликации ДНК: заново открывая старые модели» (PDF) . Восстановление ДНК . 5 (12): 1495–1498. doi :10.1016/j.dnarep.2006.07.002. ПМИД  16956796.
  20. ^ abc Hoege C, Pfander B, Молдован Г.Л., Пироволакис Г., Йенч С. (сентябрь 2002 г.). «RAD6-зависимая репарация ДНК связана с модификацией PCNA убиквитином и SUMO». Природа . 419 (6903): 135–141. Бибкод : 2002Natur.419..135H. дои : 10.1038/nature00991. PMID  12226657. S2CID  205209495.
  21. ^ Пфандер Б., Молдаванин Г.Л., Захер М., Хёге С., Йентч С. (июль 2005 г.). «SUMO-модифицированная PCNA привлекает Srs2 для предотвращения рекомбинации во время S-фазы». Природа . 436 (7049): 428–433. Бибкод : 2005Natur.436..428P. дои : 10.1038/nature03665. PMID  15931174. S2CID  4316517.
  22. ^ Молдавский Г.Л., Пфандер Б., Йенч С. (май 2007 г.). «PCNA, маэстро репликационной вилки». Клетка . 129 (4): 665–679. дои : 10.1016/j.cell.2007.05.003 . PMID  17512402. S2CID  3547069.
  23. ^ Витко-Сарсат В., Мочек Дж., Буаяд Д., Тамассиа Н., Рибейл Дж.А., Кандал С. и др. (ноябрь 2010 г.). «Ядерный антиген пролиферирующих клеток действует как цитоплазматическая платформа, контролирующая выживание нейтрофилов человека». Журнал экспериментальной медицины . 207 (12): 2631–2645. дои : 10.1084/jem.20092241. ПМЦ 2989777 . ПМИД  20975039. 
  24. ^ abcdefghijklm Ота С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомный подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация комплекса CHL12/RFCs2-5 человека как нового PCNA-связывающего белка». Ж. Биол. Хим . 277 (43): 40362–7. дои : 10.1074/jbc.M206194200 . ПМИД  12171929.
  25. ^ Чжан К., Гао Ю, Ли Дж., Берджесс Р., Хань Дж., Лян Х. и др. (июнь 2016 г.). «ДНК-связывающий домен крылатой спирали в CAF-1 функционирует вместе с PCNA, стабилизируя CAF-1 на вилках репликации». Исследования нуклеиновых кислот . 44 (11): 5083–5094. дои : 10.1093/nar/gkw106. ПМЦ 4914081 . ПМИД  26908650. 
  26. ^ Моггс Дж.Г., Гранди П., Киви Дж.П., Йонссон З.О., Хюбшер Ю., Беккер П.Б., Альмузни Дж. (февраль 2000 г.). «Путь сборки хроматина, опосредованный CAF-1-PCNA, запускаемый путем обнаружения повреждения ДНК». Молекулярная и клеточная биология . 20 (4): 1206–1218. дои : 10.1128/mcb.20.4.1206-1218.2000. ПМЦ 85246 . ПМИД  10648606. 
  27. ^ Ролеф Бен-Шахар Т., Кастильо А.Г., Осборн М.Дж., Борден К.Л., Корнблатт Дж., Верро А. (декабрь 2009 г.). «Два принципиально различных пептида взаимодействия PCNA способствуют функции фактора сборки хроматина 1». Молекулярная и клеточная биология . 29 (24): 6353–6365. дои : 10.1128/MCB.01051-09. ПМЦ 2786881 . ПМИД  19822659. 
  28. ^ Кавабе Т., Суганума М., Андо Т., Кимура М., Хори Х., Окамото Т. (март 2002 г.). «Cdc25C взаимодействует с PCNA при переходе G2/M». Онкоген . 21 (11): 1717–1726. дои : 10.1038/sj.onc.1205229 . ПМИД  11896603.
  29. ^ Мацуока С., Ямагути М., Мацукаге А. (апрель 1994 г.). «Циклин-связывающие области D-типа ядерного антигена пролиферирующих клеток». Журнал биологической химии . 269 ​​(15): 11030–11036. дои : 10.1016/S0021-9258(19)78087-9 . ПМИД  7908906.
  30. ^ Аб Сюн И, Чжан Х, Бич Д (август 1993 г.). «Перестройка субъединиц циклин-зависимых киназ связана с клеточной трансформацией». Гены и развитие . 7 (8): 1572–1583. дои : 10.1101/gad.7.8.1572 . ПМИД  8101826.
  31. ^ Оттерлей М., Уорбрик Э., Нагельхус Т.А., Хауг Т., Слупфауг Г., Акбари М. и др. (июль 1999 г.). «Пострепликативная базовая эксцизионная репарация в очагах репликации». Журнал ЭМБО . 18 (13): 3834–3844. дои : 10.1093/emboj/18.13.3834. ПМЦ 1171460 . ПМИД  10393198. 
  32. ^ Серрано М., Хэннон Г.Дж., Бич Д. (декабрь 1993 г.). «Новый регуляторный мотив в контроле клеточного цикла, вызывающий специфическое ингибирование циклина D/CDK4». Природа . 366 (6456): 704–707. Бибкод : 1993Natur.366..704S. дои : 10.1038/366704a0. PMID  8259215. S2CID  4368128.
  33. ^ аб Ватанабэ Х., Пан ЗК, Шрайбер-Агус Н., ДеПиньо Р.А., Гурвиц Дж., Сюн Ю. (февраль 1998 г.). «Подавление клеточной трансформации ингибитором циклин-зависимой киназы p57KIP2 требует связывания с ядерным антигеном пролиферирующей клетки». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (4): 1392–1397. Бибкод : 1998PNAS...95.1392W. дои : 10.1073/pnas.95.4.1392 . ЧВК 19016 . ПМИД  9465025. 
  34. ^ Раунтри М.Р., Бахман К.Э., Бэйлин С.Б. (июль 2000 г.). «DNMT1 связывает HDAC2 и новый ко-репрессор DMAP1, образуя комплекс в фокусах репликации». Природная генетика . 25 (3): 269–277. дои : 10.1038/77023. PMID  10888872. S2CID  26149386.
  35. ^ Иида Т, Суэтаке И, Тадзима С, Мориока Х, Охта С, Обусе С, Цуримото Т (октябрь 2002 г.). «Зажим PCNA облегчает действие ДНК-цитозинметилтрансферазы 1 на полуметилированную ДНК». Гены в клетки . 7 (10): 997–1007. дои : 10.1046/j.1365-2443.2002.00584.x . PMID  12354094. S2CID  25310911.
  36. ^ Чуанг Л.С., Ян Х.И., Ко Т.В., Нг Х.Х., Сюй Г., Ли Б.Ф. (сентябрь 1997 г.). «Комплекс ДНК человека-(цитозин-5) метилтрансфераза-PCNA как мишень для p21WAF1». Наука . 277 (5334): 1996–2000. doi : 10.1126/science.277.5334.1996. ПМИД  9302295.
  37. ^ Хасан С., Хасса П.О., Имхоф Р., Хоттигер М.О. (март 2001 г.). «Коактиватор транскрипции p300 связывает PCNA и может играть роль в синтезе репарации ДНК». Природа . 410 (6826): 387–391. Бибкод : 2001Natur.410..387H. дои : 10.1038/35066610. PMID  11268218. S2CID  2129847.
  38. ↑ Бендер Д., Де Сильва Э., Чен Дж., Посс А., Гави Л., Рулон З., Рэнкин, С. (декабрь 2019 г.). «Многовалентное взаимодействие ESCO2 с механизмом репликации необходимо для слипания сестринских хроматид у позвоночных». Учеб. Натл. акад. наук. США . 117 (2): 1081–1089. дои : 10.1073/pnas.1911936117 . ПМК 6969535 . ПМИД  31879348. 
  39. ^ Хеннеке Г., Кундриукофф С., Хюбшер У (июль 2003 г.). «Фосфорилирование человеческого Fen1 циклин-зависимой киназой модулирует его роль в регуляции репликационной вилки». Онкоген . 22 (28): 4301–13. дои : 10.1038/sj.onc.1206606 . ПМИД  12853968.
  40. ^ Хасан С., Стуки М., Хасса П.О., Имхоф Р., Гериг П., Хунцикер П., Хюбшер У., Хоттигер М.О. (июнь 2001 г.). «Регуляция активности эндонуклеазы-1 лоскута человека путем ацетилирования через коактиватор транскрипции p300». Мол. Клетка . 7 (6): 1221–31. дои : 10.1016/s1097-2765(01)00272-6 . ПМИД  11430825.
  41. ^ аб Йонссон З.О., Хинджес Р., Хюбшер У. (апрель 1998 г.). «Регуляция репликации ДНК и репарации белков посредством взаимодействия с передней стороной ядерного антигена пролиферирующей клетки». ЭМБО Дж . 17 (8): 2412–25. дои : 10.1093/emboj/17.8.2412. ПМК 1170584 . ПМИД  9545252. 
  42. ^ Гэри Р., Людвиг Д.Л., Корнелиус Х.Л., Макиннес М.А., Парк М.С. (сентябрь 1997 г.). «Эндонуклеаза репарации ДНК XPG связывается с ядерным антигеном пролиферирующих клеток (PCNA) и разделяет элементы последовательности с PCNA-связывающими областями FEN-1 и ингибитором циклин-зависимой киназы p21». Ж. Биол. Хим . 272 (39): 24522–9. дои : 10.1074/jbc.272.39.24522 . ПМИД  9305916.
  43. ^ Чен У, Чен С, Саха П, Дутта А (октябрь 1996 г.). «p21Cip1/Waf1 нарушает рекрутирование человеческого Fen1 посредством ядерного антигена пролиферирующих клеток в комплекс репликации ДНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (21): 11597–11602. Бибкод : 1996PNAS...9311597C. дои : 10.1073/pnas.93.21.11597 . ПМЦ 38103 . ПМИД  8876181. 
  44. ^ Дианова И.И., Бор В.А., Дианов Г.Л. (октябрь 2001 г.). «Взаимодействие эндонуклеазы 1 AP человека с эндонуклеазой 1 лоскута и ядерным антигеном пролиферирующих клеток, участвующим в репарации иссеченного основания с длинными заплатками». Биохимия . 40 (42): 12639–12644. дои : 10.1021/bi011117i. ПМИД  11601988.
  45. ^ abc Ю П, Хуан Б, Шен М, Лау С, Чан Э, Мишель Дж и др. (январь 2001 г.). «p15 (PAF), новый фактор, связанный с PCNA, с повышенной экспрессией в опухолевых тканях». Онкоген . 20 (4): 484–489. дои : 10.1038/sj.onc.1204113 . ПМИД  11313979.
  46. ^ Смит М.Л., Чен И.Т., Чжан Кью, Бэ И, Чен С.И., Гилмер Т.М., Кастан М.Б., О'Коннор П.М., Форнас А.Дж. (ноябрь 1994 г.). «Взаимодействие белка Gadd45, регулируемого р53, с ядерным антигеном пролиферирующей клетки». Наука (Представлена ​​рукопись). 266 (5189): 1376–80. Бибкод : 1994Sci...266.1376S. дои : 10.1126/science.7973727. ПМИД  7973727.
  47. ^ Чен IT, Смит ML, О'Коннор PM, Fornace AJ (ноябрь 1995 г.). «Прямое взаимодействие Gadd45 с PCNA и доказательства конкурентного взаимодействия Gadd45 и p21Waf1/Cip1 с PCNA». Онкоген . 11 (10): 1931–7. ПМИД  7478510.
  48. ^ Вайрапанди М., Азам Н., Баллиет А.Г., Хоффман Б., Либерманн Д.А. (июнь 2000 г.). «Характеристика MyD118, Gadd45 и доменов, взаимодействующих с ядерным антигеном пролиферирующих клеток (PCNA). PCNA препятствует MyD118 И Gadd45-опосредованному отрицательному контролю роста». Ж. Биол. Хим . 275 (22): 16810–9. дои : 10.1074/jbc.275.22.16810 . ПМИД  10828065.
  49. ^ Холл Пенсильвания, Кирси Дж. М., Коутс П. Дж., Норман Д. Г., Уорбрик Э., Кокс Л. С. (июнь 1995 г.). «Характеристика взаимодействия между PCNA и Gadd45». Онкоген . 10 (12): 2427–33. ПМИД  7784094.
  50. ^ Ян К., Маникон А., Курсен Дж.Д., Линке С.П., Нагасима М., Форг М., Ван XW (ноябрь 2000 г.). «Идентификация функционального домена в контрольной точке G2 / M, опосредованной GADD45». Ж. Биол. Хим . 275 (47): 36892–8. дои : 10.1074/jbc.M005319200 . ПМИД  10973963.
  51. ^ Азам Н., Вайрапанди М., Чжан В., Хоффман Б., Либерманн Д.А. (январь 2001 г.). «Взаимодействие CR6 (GADD45gamma) с ядерным антигеном пролиферирующих клеток препятствует отрицательному контролю роста». Ж. Биол. Хим . 276 (4): 2766–74. дои : 10.1074/jbc.M005626200 . ПМИД  11022036.
  52. ^ Накаяма К., Хара Т., Хиби М., Хирано Т., Миядзима А. (август 1999 г.). «Новый ген OIG37, индуцируемый онкостатином М, образует семейство генов с MyD118 и GADD45 и отрицательно регулирует рост клеток». Ж. Биол. Хим . 274 (35): 24766–72. дои : 10.1074/jbc.274.35.24766 . ПМИД  10455148.
  53. ^ Милутинович С., Чжуан Ц., Шиф М. (июнь 2002 г.). «Ядерный антиген пролиферирующих клеток связан с активностью деацетилазы гистонов, интегрируя репликацию ДНК и модификацию хроматина». Ж. Биол. Хим . 277 (23): 20974–8. дои : 10.1074/jbc.M202504200 . ПМИД  11929879.
  54. ^ Комацу К., Уортон В., Ханг Х., Ву С., Сингх С., Либерман Х.Б., Залогодатель В.Дж., Ван Х.Г. (ноябрь 2000 г.). «PCNA взаимодействует с hHus1/hRad9 в ответ на повреждение ДНК и ингибирование репликации». Онкоген . 19 (46): 5291–7. дои : 10.1038/sj.onc.1203901 . ПМИД  11077446.
  55. ^ Скотт М., Боннефин П., Виейра Д., Буасверт Ф.М., Янг Д., Базетт-Джонс Д.П., Риабовол К. (октябрь 2001 г.). «УФ-индуцированное связывание ING1 с PCNA регулирует индукцию апоптоза». Дж. Клеточная наука . 114 (Часть 19): 3455–62. дои : 10.1242/jcs.114.19.3455. ПМИД  11682605.
  56. ^ Хе Х, Тан С.К., Дауни К.М., Со А.Г. (октябрь 2001 г.). «Белок, индуцируемый фактором некроза опухоли альфа и интерлейкином 6, который взаимодействует с небольшой субъединицей ДНК-полимеразы дельта и ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (21): 11979–84. Бибкод : 2001PNAS...9811979H. дои : 10.1073/pnas.221452098 . ПМК 59753 . ПМИД  11593007. 
  57. ^ аб Баладжи А.С., Гирд CR (март 2001 г.). «Образование комплекса PCNA, связанного с хроматином, вызванное повреждением ДНК, происходит независимо от продукта гена ATM в клетках человека». Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (6): 1341–51. дои : 10.1093/нар/29.6.1341. ПМК 29758 . ПМИД  11239001. 
  58. ^ Матеос Д., Руис М.Т., Прайс ГБ, Заннис-Хаджопулос М. (октябрь 2002 г.). «Ku-антиген, специфичный для происхождения связывающий белок, который связывается с белками репликации, необходим для репликации ДНК млекопитающих». Биохим. Биофиз. Акта . 1578 (1–3): 59–72. дои : 10.1016/s0167-4781(02)00497-9. ПМИД  12393188.
  59. ^ Фудзисе К., Чжан Д., Лю Дж., Йе ET (декабрь 2000 г.). «Регуляция апоптоза и прогрессирования клеточного цикла с помощью MCL1. Дифференциальная роль ядерного антигена пролиферирующих клеток». Ж. Биол. Хим . 275 (50): 39458–65. дои : 10.1074/jbc.M006626200 . ПМИД  10978339.
  60. ^ ab Клечковска HE, Марра Г, Леттьери Т, Йирични Дж (март 2001 г.). «hMSH3 и hMSH6 взаимодействуют с PCNA и колокализуются с ним в фокусах репликации». Генс Дев . 15 (6): 724–36. дои : 10.1101/gad.191201. ПМК 312660 . ПМИД  11274057. 
  61. ^ ab Кларк AB, Валле Ф, Дрочманн К, Гэри РК, Кункель Т.А. (ноябрь 2000 г.). «Функциональное взаимодействие ядерного антигена пролиферирующих клеток с комплексами MSH2-MSH6 и MSH2-MSH3». Ж. Биол. Хим . 275 (47): 36498–501. дои : 10.1074/jbc.C000513200 . ПМИД  11005803.
  62. ^ Паркер А., Гу Ю., Махони В., Ли Ш., Сингх К.К., Лу А.Л. (февраль 2001 г.). «Человеческий гомолог белка репарации MutY (hMYH) физически взаимодействует с белками, участвующими в эксцизионном восстановлении оснований ДНК с длинными участками». Ж. Биол. Хим . 276 (8): 5547–55. дои : 10.1074/jbc.M008463200 . ПМИД  11092888.
  63. ^ ab Фотедар Р., Мосси Р., Фицджеральд П., Руссель Т., Мага Г., Брикнер Х., Мессье Х., Касибхатла С., Хюбшер Ю., Фотедар А. (август 1996 г.). «Консервативный домен большой субъединицы фактора репликации C связывает PCNA и действует как доминантный негативный ингибитор репликации ДНК в клетках млекопитающих». ЭМБО Дж . 15 (16): 4423–33. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00815.x. ПМК 452166 . ПМИД  8861969. 
  64. ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхауте Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С. , Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети межбелковых взаимодействий человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R. дои : 10.1038/nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
  65. ^ Фруэн И, Мага Г, Денегри М, Рива Ф, Савио М, Спадари С, Проспери Э, Сковасси А.И. (октябрь 2003 г.). «Ядерный антиген пролиферирующих клеток человека, поли(АДФ-рибоза) полимераза-1 и p21waf1/cip1. Динамический обмен партнерами». Ж. Биол. Хим . 278 (41): 39265–8. дои : 10.1074/jbc.C300098200 . ПМИД  12930846.
  66. ^ Гулбис Дж. М., Кельман З., Гурвиц Дж., О'Доннелл М., Куриян Дж. (октябрь 1996 г.). «Структура С-концевой области p21 (WAF1/CIP1) в комплексе с PCNA человека». Клетка . 87 (2): 297–306. дои : 10.1016/s0092-8674(00)81347-1 . PMID  8861913. S2CID  17461501.
  67. ^ Туиту Р., Ричардсон Дж., Бозе С., Наканиши М., Риветт Дж., Эллдей М.Дж. (май 2001 г.). «Сигнал деградации, расположенный на С-конце p21WAF1/CIP1, представляет собой сайт связывания альфа-субъединицы C8 протеасомы 20S». ЭМБО Дж . 20 (10): 2367–75. дои : 10.1093/emboj/20.10.2367. ПМК 125454 . ПМИД  11350925. 
  68. ^ Лу X, Тан С.К., Чжоу JQ, Ю М, Карастро Л.М., Дауни К.М., Со А.Г. (июль 2002 г.). «Прямое взаимодействие ядерного антигена пролиферирующей клетки с небольшой субъединицей ДНК-полимеразы дельта». Ж. Биол. Хим . 277 (27): 24340–5. дои : 10.1074/jbc.M200065200 . ПМИД  11986310.
  69. ^ Дюку М., Урбах С., Балдаччи Г., Хюбшер Ю., Кундриукофф С., Кристенсен Дж., Хьюз П. (декабрь 2001 г.). «Опосредование репликации ДНК, зависимой от ядерного антигена пролиферирующей клетки (PCNA), через консервативный p21 (Cip1)-подобный PCNA-связывающий мотив, присутствующий в третьей субъединице ДНК-полимеразы дельта человека». Ж. Биол. Хим . 276 (52): 49258–66. дои : 10.1074/jbc.M106990200 . ПМИД  11595739.
  70. ^ Лю Л., Родригес-Бельмонте Э.М., Мазлум Н., Се Б, Ли М.Ю. (март 2003 г.). «Идентификация нового белка, PDIP38, который взаимодействует с субъединицей p50 ДНК-полимеразы дельта и ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Ж. Биол. Хим . 278 (12): 10041–7. дои : 10.1074/jbc.M208694200 . ПМИД  12522211.
  71. ^ Харачка Л., Джонсон Р.Э., Унк И., Филлипс Б., Гурвиц Дж., Пракаш Л., Пракаш С. (ноябрь 2001 г.). «Физические и функциональные взаимодействия ДНК-полимеразы эта человека с PCNA». Мол. Клетка. Биол . 21 (21): 7199–206. дои : 10.1128/MCB.21.21.7199-7206.2001. ПМК 99895 . ПМИД  11585903. 
  72. ^ Харачка Л., Унк И., Джонсон Р.Э., Филлипс Б.Б., Гурвиц Дж., Пракаш Л., Пракаш С. (февраль 2002 г.). «Стимуляция активности синтеза ДНК каппа ДНК-полимеразы человека с помощью PCNA». Мол. Клетка. Биол . 22 (3): 784–91. дои : 10.1128/mcb.22.3.784-791.2002. ПМЦ 133560 . ПМИД  11784855. 
  73. ^ Мага Г, Виллани Г, Рамадан К, Шевелев И, Танги Ле Гак Н, Бланко Л, Бланка Г, Спадари С, Хюбшер У (декабрь 2002 г.). «ДНК-полимераза человека лямбда функционально и физически взаимодействует с ядерным антигеном пролиферирующей клетки при нормальном синтезе ДНК и при транспорозе». Ж. Биол. Хим . 277 (50): 48434–40. дои : 10.1074/jbc.M206889200 . ПМИД  12368291.
  74. ^ Симадзаки Н., Ёсида К., Кобаяши Т., Тодзи С., Тамаи К., Койвай О. (июль 2002 г.). «Сверхэкспрессия лямбда ДНК-полимеразы человека в E. coli и характеристика рекомбинантного фермента». Генные клетки . 7 (7): 639–51. дои : 10.1046/j.1365-2443.2002.00547.x. PMID  12081642. S2CID  29714829.
  75. ^ Маруяма Т., Фарина А., Дей А., Чеонг Дж., Бермудес В.П., Тамура Т., Скиортино С., Шуман Дж., Гурвиц Дж., Озато К. (сентябрь 2002 г.). «Бромодоменовый белок млекопитающих, brd4, взаимодействует с фактором репликации C и ингибирует переход к S-фазе». Мол. Клетка. Биол . 22 (18): 6509–20. дои : 10.1128/mcb.22.18.6509-6520.2002. ПМК 135621 . ПМИД  12192049. 
  76. ^ аб Мосси Р., Йонссон З.О., Аллен Б.Л., Хардин Ш., Хюбшер Ю. (январь 1997 г.). «Фактор репликации C взаимодействует с C-концевой стороной ядерного антигена пролиферирующей клетки». Ж. Биол. Хим . 272 (3): 1769–76. дои : 10.1074/jbc.272.3.1769 . ПМИД  8999859.
  77. ^ ван дер Куип Х., Кариус Б., Хак С.Дж., Уильямс Б.Р., Хубер С., Фишер Т. (апрель 1999 г.). «ДНК-связывающая субъединица p140 фактора репликации C активируется в циклических клетках и ассоциируется с белками, регулирующими клеточный цикл фазы G1». Дж. Мол. Мед . 77 (4): 386–92. дои : 10.1007/s001090050365. PMID  10353443. S2CID  22183443.
  78. ^ abc Кай Дж., Гиббс Э., Ульманн Ф., Филлипс Б., Яо Н., О'Доннелл М., Гурвиц Дж. (июль 1997 г.). «Комплекс, состоящий из субъединиц человеческого фактора репликации C p40, p37 и p36, представляет собой ДНК-зависимую АТФазу и промежуточный продукт в сборке холофермента». Журнал биологической химии . 272 (30): 18974–18981. дои : 10.1074/jbc.272.30.18974 . ПМИД  9228079.
  79. ^ Пан ZQ, Чен М, Гурвиц Дж (январь 1993 г.). «Субъединицы активатора 1 (фактор репликации C) выполняют множество функций, необходимых для синтеза ДНК, зависимого от ядерного антигена пролиферирующих клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (1): 6–10. Бибкод : 1993PNAS...90....6P. дои : 10.1073/pnas.90.1.6 . ПМК 45588 . ПМИД  8093561. 
  80. ^ Меркл CJ, Карниц Л.М., Генри-Санчес Дж.Т., Чен Дж. (август 2003 г.). «Клонирование и характеристика hCTF18, hCTF8 и hDCC1. Человеческие гомологи комплекса Saccharomyces cerevisiae, участвующие в установлении слипания сестринских хроматид». Журнал биологической химии . 278 (32): 30051–30056. дои : 10.1074/jbc.M211591200 . ПМИД  12766176.
  81. ^ Мотеги А., Лио Х.Дж., Ли К.Ю., Роест Х.П., Маас А., Ву X и др. (август 2008 г.). «Полюбиквитинирование ядерного антигена пролиферирующих клеток с помощью HLTF и SHPRH предотвращает нестабильность генома из-за остановки вилок репликации». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (34): 12411–12416. Бибкод : 2008PNAS..10512411M. дои : 10.1073/pnas.0805685105 . ПМЦ 2518831 . ПМИД  18719106. 
  82. ^ Унк I, Хайду I, Фатиол К., Гурвиц Дж., Юн Дж.Х., Пракаш Л. и др. (март 2008 г.). «Человеческий HLTF функционирует как убиквитинлигаза для полиубиквитинирования ядерного антигена пролиферирующих клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (10): 3768–3773. Бибкод : 2008PNAS..105.3768U. дои : 10.1073/pnas.0800563105 . ПМК 2268824 . ПМИД  18316726. 
  83. ^ Брун Дж., Чиу Р., Локхарт К., Сяо В., Воутерс Б.Г., Грей Д.А. (февраль 2008 г.). «hMMS2 играет избыточную роль в полиубиквитинировании PCNA человека». BMC Молекулярная биология . 9:24 . дои : 10.1186/1471-2199-9-24 . ПМК 2263069 . ПМИД  18284681. 
  84. ^ Родригес-Лопес AM, Джексон Д.А., Нелин Д.О., Иборра Ф., Уоррен А.В., Кокс Л.С. (февраль 2003 г.). «Характеристика взаимодействия между WRN, дефектом геликазы/экзонуклеазы при синдроме прогероида Вернера и важным фактором репликации PCNA». Механизмы старения и развития . 124 (2): 167–174. дои : 10.1016/s0047-6374(02)00131-8. PMID  12633936. S2CID  37287691.
  85. ^ Хуан С., Берестен С., Ли Б., Осима Дж., Эллис Н.А., Камписи Дж. (июнь 2000 г.). «Характеристика экзонуклеазы WRN 3'→5' человека и мыши». Исследования нуклеиновых кислот . 28 (12): 2396–2405. дои : 10.1093/нар/28.12.2396. ПМЦ 102739 . ПМИД  10871373. 
  86. ^ Фан Дж, Оттерлей М, Вонг ХК, Томкинсон А.Э., Уилсон Д.М. (2004). «XRCC1 локализуется и физически взаимодействует с PCNA». Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (7): 2193–201. дои : 10.1093/nar/gkh556. ПМК 407833 . ПМИД  15107487. 
  87. ^ Исэ Т., Нагатани Г., Имамура Т., Като К., Такано Х., Номото М. и др. (январь 1999 г.). «Белок 1, связывающий фактор транскрипции Y-box, преимущественно связывается с модифицированной цисплатином ДНК и взаимодействует с ядерным антигеном пролиферирующих клеток». Исследования рака . 59 (2): 342–346. ПМИД  9927044.
  88. ^ Гилльям К.М., Мюллер Р., Лиабакк Н.Б., Оттерлей М. (2012). «Эксцизионная репарация нуклеотидов связана с реплисомой, и ее эффективность зависит от прямого взаимодействия между XPA и PCNA». ПЛОС ОДИН . 7 (11): e49199. Бибкод : 2012PLoSO...749199G. дои : 10.1371/journal.pone.0049199 . ПМЦ 3496702 . ПМИД  23152873. 
  89. ^ Чичча А., Нимонкар А.В., Ху Ю., Хайду И., Ачар Ю.Дж., Ижар Л. и др. (август 2012 г.). «Полюбиквитинированный PCNA рекрутирует транслоказу ZRANB3 для поддержания целостности генома после репликационного стресса». Молекулярная клетка . 47 (3): 396–409. doi :10.1016/j.molcel.2012.05.024. ПМЦ 3613862 . ПМИД  22704558. 
  90. ^ Баккен А., Пувель С., Сио Н., Пердеризе М., Саломе-Деснулез С., Телье-Лебег С. и др. (Июль 2013). «Хеликаза FBH1 жестко регулируется PCNA посредством CRL4(Cdt2)-опосредованного протеолиза в клетках человека». Исследования нуклеиновых кислот . 41 (13): 6501–6513. дои : 10.1093/nar/gkt397. ПМЦ 3711418 . ПМИД  23677613. 
  91. ↑ Шёненбергер Ф, Дойцманн А, Феррандо-Мэй Э, Мерхоф Д (29 мая 2015 г.). «Дискриминация фаз клеточного цикла в клетках, меченных PCNA». БМЦ Биоинформ. 16 (180): 180. дои : 10.1186/s12859-015-0618-9 . ПМЦ 4448323 . ПМИД  26022740.  
  92. ↑ Герце Х.Д., Раджан М., Леттиг-Тюннеманн Г., Филлис М., Кардосо MC (3 сентября 2014 г.). «Новый маркер репликации и репарации ДНК, проницаемый для клеток». Нуклеус (Остин, Техас) . 5 (6): 590–600. дои : 10.4161/nucl.36290. ПМК 4615156 . ПМИД  25484186. 
  93. ^ Ван СК (апрель 2014 г.). «PCNA: тихая домработница или потенциальная терапевтическая мишень?». Тенденции в фармакологических науках . 35 (4): 178–186. doi :10.1016/j.tips.2014.02.004. ПМИД  24655521.
  94. ^ Гу Л., Лингеман Р., Якусиджин Ф., Сунь Э., Цуй Q, Чао Дж. и др. (декабрь 2018 г.). «Противораковая активность первой в своем классе низкомолекулярной молекулы, нацеленной на PCNA». Клинические исследования рака . 24 (23): 6053–6065. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-18-0592. ПМК 6279569 . ПМИД  29967249. 
  95. ^ Гу Л, Ли М, Ли СМ, ​​Харатипур П., Лингеман Р., Джоссарт Дж. и др. (июль 2023 г.). «Маленькие молекулы, направленные на конфликт транскрипции-репликации для селективной химиотерапии». Клеточная химическая биология . 30 (10): 1235–1247.e6. doi : 10.1016/j.chembiol.2023.07.001 . ПМЦ 10592352 . ПМИД  37531956. 

дальнейшее чтение

Внешние ссылки