Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
Гаплогруппа H (Y-ДНК) , также известная как H-L901/M2939 , представляет собой гаплогруппу Y-хромосомы .
Первичная ветвь H1 (H-M69) и ее субклады являются одной из наиболее преобладающих гаплогрупп среди популяций в Южной Азии , особенно ее потомок H1a1 (M52). Первичная ветвь H-M52, H1a1a (H-M82), обычно встречается среди цыган , которые произошли из Южной Азии и мигрировали на Ближний Восток и в Европу примерно в начале 2-го тысячелетия н. э., и кхмеров, которые попали под влияние индийского населения. [4] Гораздо более редкая первичная ветвь H3 (Z5857) также сосредоточена в Южной Азии.
Однако первичная ветвь H2 (P96), по-видимому, была обнаружена в редких слоях, в основном в Европе и Западной Азии с доисторических времен. Она была обнаружена в останках докерамического неолита B ( PPNB ), который является частью докерамического неолита , неолитической культуры, сосредоточенной в верхней Месопотамии и Леванте , датируемой примерно 10 800–8 500 лет назад, а также более поздней культуры линейной керамики и неолитической Иберии . [5] [6] H2, вероятно, проник в Европу во время неолита с распространением сельского хозяйства. [6] [7] Его нынешнее распространение состоит из различных отдельных случаев, распространенных сегодня по всей Европе и Западной Азии. [8]
Структура
H-L901/M2939 является прямым потомком гаплогруппы GHIJK . В свою очередь, есть три прямых потомка H-L901/M2939 – их определяющие SNP следующие:
- Н1 (Л902/М3061)
- H1a ранее гаплогруппа H1 (M69/Page45, M370)
- H1b B108, Z34961, Z34962, Z34963, Z34964
- H2 ранее гаплогруппа F3 , [9] (P96, L279, L281, L284, L285, L286, M282)
- H2a FGC29299/Z19067
- H2b Z41290
- H2c Y21618, Z19080
- Н3 (Z5857)
Древнее распространение
Считается, что H-L901/M2939 отделился от HIJK 48 500 лет назад. [10] Похоже, что он представляет собой основную гаплогруппу Y-хромосомы палеолитических жителей Южной Азии. Возможным местом внедрения может быть Южная Азия, поскольку он там очень сконцентрирован. [11]
Н1а
Сайты Шахри-Сохта и Гонур
Шахре-Сухтех , Иран и Гонур , Туркменистан. H1a1d2 – Бронзовый век, 3200–1900 гг. до н.э. [12] [13]
Места Гогдара и Барикот
С ограниченным древним ДНК-тестированием в Южной Азии , соответственно, существует ограниченное количество древних образцов для H1a, несмотря на то, что это многочисленная и хорошо распространенная гаплогруппа сегодня. Первый набор древней ДНК из Южной Азии был опубликован в марте 2018 года. [14] 65 образцов были собраны в долине Сват на севере Пакистана , 2 из которых принадлежали H1a. [14]
Н2
Самый ранний образец H2 обнаружен в докерамической неолитической культуре B Леванта 10 000 лет назад. [15] Из древних образцов ясно, что H2 также имеет тесную связь с распространением сельского хозяйства из Анатолии в Европу и обычно встречается с гаплогруппой G2a . [16] H2 был обнаружен в неолитической Анатолии, а также в нескольких более поздних неолитических культурах Европы , таких как культура Винча в Сербии, [17] и мегалитическая культура Западной Европы. [17]
Исследование 2021 года «Использование обогащения захвата Y-хромосомы для разрешения гаплогруппы H2 показывает новые доказательства двухпутевой неолитической экспансии в Западную Европу» [7] показало, что, хотя H2 составляет менее 0,2% в современных западноевропейских популяциях, он был более распространен во время неолита, от 1,5 до 9%. Они идентифицировали две основные клады H2m и H2d . Что касается текущей номенклатуры ISOGG, H2m, по-видимому, определяется смесью SNP H2, H2a, H2a1 и H2c1a, в то время как H2d, по-видимому, определяется двумя SNP H2b1 и четырьмя дополнительными SNP, которые ранее не были обнаружены. Они оценили TMRCA для H2d и H2m в ~15,4 тыс. лет назад, а H2m и H2d оценили TMRCA в ~11,8 и ~11,9 тыс. лет назад соответственно. Разнообразие H2, вероятно, существовало у охотников-собирателей и ранних земледельцев Ближнего Востока, а затем распространилось через неолитическую экспансию в Центральную и Западную Европу. H2d был обнаружен вдоль внутреннего/дунайского пути в Центральную Европу, но большинство особей H2m обнаружено вдоль средиземноморского пути в Западную Европу, на Пиренейский полуостров и, в конечном итоге, в Ирландию.
Также было обнаружено два случая присутствия H2a в неолитических захоронениях Линкардстауна на юго-востоке Ирландии. [18] Еще больше образцов неолитического H2 было найдено в Германии и Франции. [19]
Современная дистрибуция
Н1а
Южная Азия
H-M69 распространен среди населения Бангладеш, Индии, Шри-Ланки, Непала и Пакистана, с более низкой частотой в Афганистане. [2] Самая высокая частота Halpoгруппы H обнаружена в таких племенных группах, как 87% среди корага , 70% среди койя и 62% среди гондов . [28] [29] Высокие частоты H-M69 наблюдаются в Индии, как в дравидийских, так и в индоарийских кастах (32,9%). [4] [30] в Дакке, Бангладеш (35,71%), [31] и H-M52 среди калашей (20,5%) в Пакистане. [32] [29]
Гаплогруппа H обычно встречается среди индоарийских , дравидийских и племенных (индийских, а также пакистанских калашей ) популяций на индийском субконтиненте. В Европе она в основном встречается среди цыган , которые принадлежат преимущественно (от 7% до 50%) к субкладу H1a (M82).
Гаплогруппа H-M69 была обнаружена в:
- Бангладеш - 35,71% (15/42) в выборках из Дакки [31] и 17,72% (115/649) среди бенгальских выборок из различных районов страны [33] .
- Индия - разделена на зоны ниже:
- Южная Индия – 27,2% (110/405) выборки неуказанного этнического состава. [34] [35] Народ корага имеет 87%, а племя коя имеет 70% галпогруппы H. [28] [29] Народ гонди имеет около 62% галпогруппы H. [36] Другое исследование обнаружило гаплогруппу H-M69 у 26,4% (192/728) этнически разнообразной группы образцов из различных регионов Индии. [4]
- Западная Индия - В Махараштре - 33,3% выборки (68/204) [37] и в Гуджарате , 20,69% (12/58) среди гуджаратцев в США. [31] 13,8% (4/29) среди неуказанных гуджаратцев в Индии, [38] 26% (13/50) среди Давуди Бохра, [39] 27,27 (6/22) среди Бхилов, [40] 1,56% среди гуджаратских брахманов [40]
- Северная Индия . Согласно исследованию (Trivedi2007), этот показатель составляет 24,5% (44/180) как среди кастового, так и среди племенного населения Северной Индии. Наиболее часто встречаются: 44,4% (8/18) среди чамаров Уттар-Прадеш (UP) [4] 20,7% (6/29) среди раджпутов UP [4] 18,3% (9/49) среди индуистов Нью-Дели [41] 16,13% (5/31) среди брахманов UP [40] 11,11% (6/54) среди колов UP [40] 10,53% (2/19) среди химачал-брахманов [40] 10,2% (5/49) среди гуджаров из Джамму и Кашмира [40] 9,8% (5/51) среди пандитов из Джамму и Кашмира [40]
- Восточная Индия 14,81% (4/27) среди Бихар Пасван, [40] 9,7% (3/31) среди бенгальцев Западной Бенгалии (WB), [29] 5,56% (1/18) среди брахманов Западной Бенгалии . [4]
- Шри-Ланка – в 25,3% (23/91) выборки неуказанного этнического состава [34] [35] и в 10,3% (4/39) выборки сингалов . [29]
- Непал – одно исследование обнаружило гаплогруппу H-M69 примерно у 12% выборки мужчин из общей популяции Катманду (включая 4/77 H-M82, 4/77 H-M52(xM82) и 1/77 H-M69(xM52, APT)) и 6% выборки неваров (4/66 H-M82). [42] В другом исследовании Y-ДНК, которая принадлежит гаплогруппе H-M69, была обнаружена у 25,7% (5/37 = 13,5% H-M69 из деревни в округе Моранг , 9/57 = 15,8% H-M69 из деревни в округе Читван и 30/77 = 39,0% H-M69 из другой деревни в округе Читван) тхару в Непале. [43]
- Пакистан – у 4,1% бурушо , 20,5% калашей , 4,2% пуштунов и 6,3% у других пакистанцев . [4] [32] Другое исследование обнаружило гаплогруппу H-M69 примерно у 8% (3/38) выборки бурушо (также известной как хунза ), включая 5% (2/38) H-M82(xM36, M97, M39/M138) и 3% (1/38) H-M36. [44]
- Афганистан – в 6,1% пуштуны , [2] в 7,1% таджики . [2]
Народ рома
Гаплогруппа H-M82 является основным кластером линий у цыган, особенно у балканских цыган , среди которых она составляет примерно 60% мужчин. [45] Делеция 2 пар оснований в локусе M82, определяющем эту гаплогруппу, также была зарегистрирована у трети мужчин из традиционных популяций цыган, проживающих в Болгарии , Испании и Литве . [46] Высокая распространенность специфической для Азии Y-хромосомной гаплогруппы H-M82 подтверждает их индийское происхождение и гипотезу о небольшом числе основателей, расходящихся от одной этнической группы в Индии (Gresham et al. 2001).
В гаплогруппе H-M82 идентичный 8-микросателлитный гаплотип Y-хромосомы встречается почти у 30% цыганских мужчин, что является поразительной степенью сохранения высокодифференцированной родословной, ранее описанной только у еврейских священников. (Недавно обнаруженная популяция-основатель: рома/цыгане - Stanford Medicine 2005) [47]
Важные исследования показывают ограниченную интрогрессию типичной цыганской гаплогруппы Y-хромосомы H1 в нескольких европейских группах, включая приблизительно 0,61% у албанцев-гегов и 2,48% у албанцев-тосков. [48]
Европа, Кавказ, Центральная Азия и Ближний Восток
Гаплогруппа H1a встречается в гораздо меньших количествах за пределами индийского субконтинента и цыганского населения, но все еще присутствует в других популяциях:
- Европа - 0,9% (1/113) H-M82 в выборке сербов , [45] 2% (1/57) H-M82 в выборке македонских греков, [ 41] 1% (1/92 H-M82) [41] до 2% (1/50 H-M69) [52] украинцев , H1a2a в 1,3% (1/77) выборки греков . [32]
- Кавказ - 2,6% (1/38) H-M82 в выборке балкарцев , [41]
- Центральная Азия - 12,5% (2/16) H-M52 в выборке таджиков из Душанбе [53] , 5,19% (7/135) H-M69 в выборке саларов из Цинхая [54] , 5,13% (2/39) H (включая 1/39 H(xH1,H2) и 1/39 H1) в выборке уйгуров из деревни Дарья Бойи, уезда Юйтянь (Керия), Синьцзян [55] , 4,65% (6/129) H-M69 в выборке монголов из Цинхая [54] , 4,44% (2/45) H-M52 в выборке узбеков из Самарканда [53] , 3,56% (17/478) H-M69 и 0,84% (4/478) F-M89(xG-M201, H-M69, I-M258, J-M304, L-M20, N-M231, O-M175, P-M45, T-M272) в выборке уйгуров из района Хотан, Синьцзян, [54] 2,86% (2/70) H-M52 в выборке узбеков из Хорезма , [53] 2,44% (1/41) H-M52 в выборке уйгуров из Казахстана , [53] 1,79% (1/56) H-M52 в выборке узбеков из Бухары , [53] 1,71% (3/175) H-M69 в выборке хуэй из района Чанцзи, Синьцзян, [54] 1,59% (1/63) H-M52 в выборке узбеков из Ферганской долины , [53] 1,56% (1/64) H1 в выборке уйгуров из деревни Карчуга, уезд Юли (Лопнур), Синьцзян, [55] 1,32% (1/76) H2 в выборке уйгуров из поселка Хорикол, уезд Ават, Синьцзян, [55] 0,99% (1/101) H-M69 в выборке казахов из района Хами, Синьцзян. [54]
- Западная Азия - 6% (1/17) H-M52 в выборке турок , [52] [53] 5% (1/20) H-M69 в выборке сирийцев , [52] 4% (2/53) H-M52 в выборке иранцев из Самарканда , [53] 2,6% (3/117) H-M82 в выборке из южного Ирана , [56] 4,3% (7/164) мужчин из Объединенных Арабских Эмиратов , [57] 2% мужчин из Омана , [58] 1,9% (3/157) мужчин из Саудовской Аравии , [59] 1,4% (1/72 H-M82) мужчин из Катара , [57] и 0,6% (3/523) H-M370 в другой выборке турок . [60]
Восточная и Юго-Восточная Азия
На самом востоке своего распространения гаплогруппа H-M69 была обнаружена у тайцев из Таиланда (1/17 = 5,9% H-M69 Северный Таиланд ; [61] 2/290 = 0,7% H-M52 Северный Таиланд ; [62] 2/75 = 2,7% H-M69(xM52) и 1/75 = 1,3% H-M52(xM82) общей популяции Таиланда [63] ), балийцев (19/551 = 3,45% H-M69), [35] тибетцев (3/156 = 1,9% H-M69(xM52, APT)), [42] филиппинцев с южного Лусона (1/55 = 1,8% H-M69(xM52) [63] ), бамарцев из Мьянмы (1/59 = 1,7% H-M82, при этом соответствующий индивид был отобран в регионе Баго ), [64] Чамы из Бинь Туан, Вьетнам (1/59 = 1,7% H-M69), [61] и монголы (1/149 = 0,7% H-M69). [34] Субклад H-M39/M138 был обнаружен в окрестностях Камбоджи , включая один случай в выборке из шести камбоджийцев [4] и один случай в выборке из 18 человек из Камбоджи и Лаоса. [44] Исследование генома кхмеров показало, что в среднем 16,5% кхмеров принадлежат к y-ДНК H. [4]
H1b
H1b определяется SNP - B108, Z34961, Z34962, Z34963 и Z34964. [65] H1b, обнаруженный только в 2015 году, был обнаружен в единственном образце от человека в Мьянме. [66] Поскольку он был классифицирован лишь недавно, в настоящее время нет исследований, регистрирующих H1b в современных популяциях.
Н2
H2 (H-P96), который определяется семью однонуклеотидными полиморфизмами (SNP) – P96, M282, L279, L281, L284, L285 и L286 – является единственной первичной ветвью, обнаруженной в основном за пределами Южной Азии. [65] Ранее называвшаяся F3, H2 была переклассифицирована как принадлежащая к гаплогруппе H из-за общего маркера M3035 с H1. [67] Хотя H2 был обнаружен во многих древних образцах, он был обнаружен лишь скудно в современных популяциях по всей Западной Евразии. [5]
Н3
H3 (Z5857), как и H1, также в основном сосредоточен в Южной Азии, хотя и с гораздо более низкими частотами. [66]
Как и другие ветви H, из-за того, что он был недавно классифицирован, он явно не обнаружен в современных исследованиях населения. Образцы, принадлежащие H3, вероятно, были помечены как F*. [66] В потребительском тестировании он был обнаружен в основном среди южных индийцев и шри-ланкийцев, а также других регионов Азии, таких как Аравия. [10]
Ниже приводится краткое изложение большинства исследований, в которых специально проверялись субклады H1a1a (H-M82) и H2 (H-P96), ранее F3, показывающее их распространение в разных частях мира. [74]
Смотрите также
Ссылки
- ^ Махал, Дэвид Г.; Мацукас, Янис Г. (2018). «Географическое происхождение этнических групп на Индийском субконтиненте: исследование древних следов с помощью гаплогрупп Y-ДНК». Frontiers in Genetics . 9 : 4. doi : 10.3389/fgene.2018.00004 . PMC 5787057. PMID 29410676 .
- ^ abcd Хабер М., Платт Д.Е., Ашрафиан Бонаб М., Юханна С.С., Сория-Эрнанц Д.Ф., Мартинес-Крус Б. и др. (2012). «Этнические группы Афганистана имеют общее наследие Y-хромосомы, структурированное историческими событиями». PLOS ONE . 7 (3): e34288. Bibcode :2012PLoSO...734288H. doi : 10.1371/journal.pone.0034288 . PMC 3314501 . PMID 22470552.
- ^ Тарик, Мухаммад; Ахмад, Хабиб; Хемфилл, Брайан Э.; Фарук, Умар; Шурр, Теодор Г. (2022). «Сопоставление материнских и отцовских генетических историй среди пяти этнических групп из Хайбер-Пахтунхвы, Пакистан». Scientific Reports . 12 (1): 1027. Bibcode :2022NatSR..12.1027T. doi :10.1038/s41598-022-05076-3. PMC 8770644 . PMID 35046511.
- ^ abcdefghi Sengupta S, Zhivotovsky LA, King R, Mehdi SQ, Edmonds CA, Chow CE и др. (февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии выявляют как местные, так и экзогенные расширения и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». American Journal of Human Genetics . 78 (2): 202–221. doi :10.1086/499411. PMC 1380230 . PMID 16400607.
- ^ abc Günther T, Valdiosera C, Malmström H, Ureña I, Rodriguez-Varela R, Sverrisdóttir ÓO и др. (сентябрь 2015 г.). «Древние геномы связывают ранних земледельцев из Атапуэрки в Испании с современными басками». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (38): 11917–11922. Bibcode : 2015PNAS..11211917G. doi : 10.1073 /pnas.1509851112 . PMC 4586848. PMID 26351665.
- ^ ab Haak W, Balanovsky O, Sanchez JJ, Koshel S, Zaporozhchenko V, Adler CJ, et al. (Ноябрь 2010 г.). «Древняя ДНК европейских фермеров раннего неолита раскрывает их ближневосточные связи». PLOS Biology . 8 (11): e1000536. doi : 10.1371/journal.pbio.1000536 . PMC 2976717 . PMID 21085689.
- ^ ab Rohrlach, Adam B.; Papac, Luka; Childebayeva, Ainash; Rivollat, Maïté; Villalba-Mouco, Vanessa; Neumann, Gunnar U.; Penske, Sandra; Skourtanioti, Eirini; et al. (22 июля 2021 г.). «Использование обогащения захвата Y-хромосомы для определения гаплогруппы H2 показывает новые доказательства двухпутевой неолитической экспансии в Западную Европу». Scientific Reports . 11 (1): 15005. doi :10.1038/s41598-021-94491-z. eISSN 2045-2322. PMC 8298398 . PMID 34294811.
- ^ St Clairl M (март 2018 г.). "Haplogroup H-M2713" (PDF) . База данных St. Clair . Архивировано из оригинала (PDF) 26 июня 2018 г. . Получено 25 июня 2018 г. .
- ^ Magoon GR, Banks RH, Rottensteiner C, Schrack BE, Tilroe VO, Robb T, Grierson AJ (2013). «Создание филогений Y-хромосомы с высоким разрешением априори с использованием данных секвенирования следующего поколения». bioRxiv 10.1101/000802 .
- ^ ab "H YTree". YFull .
- ^ Тарик, Мухаммад; Ахмад, Хабиб; Хемфилл, Брайан Э.; Фарук, Умар; Шурр, Теодор Г. (19 января 2022 г.). «Сопоставление материнских и отцовских генетических историй среди пяти этнических групп из Хайбер-Пахтунхвы, Пакистан». Scientific Reports . 12 (1): 1027. Bibcode :2022NatSR..12.1027T. doi :10.1038/s41598-022-05076-3. ISSN 2045-2322. PMC 8770644 . PMID 35046511.
- ^ Нарасимхан, Вагиш М.; и др. (2019). «Формирование человеческих популяций в Южной и Центральной Азии». Science . 365 (6457). doi :10.1126/science.aat7487. PMC 6822619 . PMID 31488661.
- ^ "ДНК долины Инда". 2 мая 2022 г.
- ^ abcd Narasimhan VM, Patterson NJ, Moorjani P, Lazaridis I, Mark L, Mallick S, Rohland N, Bernardos R, Kim AM, Nakatsuka N, Olalde I (31 марта 2018 г.). «Геномная формация Южной и Центральной Азии». bioRxiv 10.1101/292581 .
- ^ ab Lazaridis I, Nadel D, Rollefson G, Merrett DC, Rohland N, Mallick S и др. (август 2016 г.). «Геномные идеи происхождения земледелия на древнем Ближнем Востоке». Nature . 536 (7617): 419–424. Bibcode :2016Natur.536..419L. doi :10.1038/nature19310. PMC 5003663 . PMID 27459054.
- ^ Hofmanová Z, Kreutzer S, Hellenthal G, Sell C, Diekmann Y, Díez-Del-Molino D и др. (июнь 2016 г.). «Ранние земледельцы со всей Европы напрямую произошли от неолитических эгейцев». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (25): 6886–6891. Bibcode : 2016PNAS..113.6886H. doi : 10.1073/pnas.1523951113 . PMC 4922144. PMID 27274049 .
- ^ abcdef Липсон М., Сеченьи-Надь А., Маллик С., Поса А., Стегмар Б., Кирл В. и др. (ноябрь 2017 г.). «Параллельные палеогеномные разрезы раскрывают сложную генетическую историю ранних европейских земледельцев». Природа . 551 (7680): 368–372. Бибкод : 2017Natur.551..368L. дои : 10.1038/nature24476. ПМК 5973800 . ПМИД 29144465.
- ^ Кэссиди, Лара М.; Маолдуин, Рос О; Кадор, Томас; Линч, Энн; Джонс, Карлтон; Вудман, Питер К.; Мерфи, Эйлин; Рэмси, Грир; и др. (17 июня 2020 г.). «Династическая элита в монументальном неолитическом обществе». Nature . 582 (7812): 384–388. Bibcode :2020Natur.582..384C. doi :10.1038/s41586-020-2378-6. eISSN 1476-4687. ISSN 0028-0836. PMC 7116870 . PMID 32555485.
- ^ Риволла, Майте; Чонг, Чунгвон; Шиффелс, Стефан; Кючюккалипчи, Ишил; Пемонж, Мари-Элен; Рорлах, Адам Бенджамин; Альт, Курт В.; Биндер, Дидье; и др. (29 мая 2020 г.). «Древняя полногеномная ДНК из Франции подчеркивает сложность взаимодействий между охотниками-собирателями мезолита и неолитическими земледельцами». Science Advances . 6 (22): eaaz5344. Bibcode :2020SciA....6.5344R. doi :10.1126/sciadv.aaz5344. eISSN 2375-2548. PMC 7259947 . PMID 32523989.
- ^ ab Mathieson I, Lazaridis I, Rohland N, Mallick S, Patterson N, Roodenberg SA, Harney E, Stewardson K, Fernandes D, Novak M, Sirak K (10 октября 2015 г.). «Восемь тысяч лет естественного отбора в Европе». bioRxiv 10.1101/016477 .
- ^ abc Скуртаниоти, Эйрини; Эрдал, Йылмаз С.; Франжипан, Марселла; Балосси Рестелли, Франческа; Йенер, К. Аслихан; Пиннок, Фрэнсис; Маттиа, Паоло; Озбал, Рана; и др. (2020). «Геномная история Анатолии от неолита до бронзового века, Северного Леванта и Южного Кавказа». Клетка . 181 (5): 1158–1175.e28. дои : 10.1016/j.cell.2020.04.044 . hdl : 20.500.12154/1254 . PMID 32470401. S2CID 219105572.
- ^ Арзелье, Ана. «Древняя ДНК проливает свет на погребальные практики коллективного захоронения позднего неолита на юге Франции». Труды Королевского общества Б.
- ^ Антонио, Маргарет Л.; Гао, Цзыюэ; М. Мутс, Ханна (2019). «Древний Рим: генетический перекресток Европы и Средиземноморья». Science . 366 (6466). Вашингтон, округ Колумбия: Американская ассоциация содействия развитию науки (опубликовано 8 ноября 2019 г.): 708–714. Bibcode :2019Sci...366..708A. doi :10.1126/science.aay6826. hdl : 2318/1715466 . PMC 7093155 . PMID 31699931.
- ^ Мэтисон I, Альпаслан-Руденберг С., Пост С., Сечени-Надь А., Роланд Н., Маллик С., Олальд И., Брумандхошбахт Н., Кандилио Ф., Черонет О., Фернандес Д. (9 мая 2017 г.). «Геномная история Юго-Восточной Европы». bioRxiv 10.1101/135616 .
- ^ Olalde Í (2016). От мезолита до бронзового века: раскрытие 5000 лет истории европейского населения с помощью палеогеномики (PDF) (диссертация на соискание ученой степени доктора философии). Барселона, Испания: Институт эволюционной биологии (CSIC-Universitat Pompeu Fabra). hdl :10803/403608.
- ^ Скуртаниоти, Эйрини; Эрдал, Йилмаз; Франджипане, Марселла; Балосси Рестелли, Франческа; Йенер, К (2020). «Геномная история Анатолии от неолита до бронзового века, Северного Леванта и Южного Кавказа». Cell . 181 (5): 1158–1175.e28. doi : 10.1016/j.cell.2020.04.044 . hdl : 20.500.12154/1254 . PMID 32470401. S2CID 219105572.
- ^ Хабер, Марк. «Генетическая история Ближнего Востока по данным анализа временного хода ДНК, проведенного в восьми точках за последние 4000 лет». Cell .
- ^ ab Cordaux R, Aunger R, Bentley G, Nasidze I, Sirajuddin SM, Stoneking M (февраль 2004 г.). «Независимые истоки индийских кастовых и племенных отцовских линий». Current Biology . 14 (3): 231–235. doi : 10.1016/j.cub.2004.01.024 . PMID 14761656.
- ^ abcde Kivisild T, Rootsi S, Metspalu M, Mastana S, Kaldma K, Parik J, et al. (февраль 2003 г.). «Генетическое наследие самых ранних поселенцев сохраняется как в индийских племенных, так и в кастовых популяциях». American Journal of Human Genetics . 72 (2): 313–332. doi :10.1086/346068. PMC 379225 . PMID 12536373.
- ^ Sahoo S, Singh A, Himabindu G, Banerjee J, Sitalaximi T, Gaikwad S и др. (январь 2006 г.). «Предыстория индийских Y-хромосом: оценка сценариев демической диффузии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (4): 843–848. Bibcode : 2006PNAS..103..843S. doi : 10.1073/pnas.0507714103 . PMC 1347984. PMID 16415161 .
- ^ abc Позник, Г. Дэвид; Сюэ, Яли; Мендес, Фернандо Л.; Виллемс, Томас Ф.; Массайя, Андреа; Уилсон Сейрес, Мелисса А.; Аюб, Касим; Маккарти, Шейн А.; Наречанья, Апурва; Кашин, Сева; Чен, Юань (июнь 2016 г.). «Периодические всплески демографии мужского пола, полученные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру». Природная генетика . 48 (6): 593–599. дои : 10.1038/ng.3559. ISSN 1061-4036. ПМЦ 4884158 . ПМИД 27111036.
- ^ abc Firasat S, Khaliq S, Mohyuddin A, Papaioannou M, Tyler-Smith C, Underhill PA и др. (январь 2007 г.). «Y-хромосомные доказательства ограниченного греческого вклада в патанскую популяцию Пакистана». European Journal of Human Genetics . 15 (1): 121–126. doi :10.1038/sj.ejhg.5201726. PMC 2588664 . PMID 17047675.
- ^ Махмуд Х (ноябрь 2019 г.). ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ СРЕДИ БАНГАЛЬЦЕВ И СЕМИ ЭТНИЧЕСКИХ ГРУПП БАНГЛАДЕШ НА ОСНОВЕ Y-ХРОМОСОМЫ (PDF) (диссертация на соискание ученой степени доктора философии). Дакка, Бангладеш: Университет Дакки. С. 100–05.
- ^ abc Hammer MF, Karafet TM, Park H, Omoto K, Harihara S, Stoneking M, Horai S (2006). «Двойное происхождение японцев: общая почва для Y-хромосом охотников-собирателей и фермеров». Журнал генетики человека . 51 (1): 47–58. doi : 10.1007/s10038-005-0322-0 . PMID 16328082.
- ^ abc Karafet TM, Lansing JS, Redd AJ, Reznikova S, Watkins JC, Surata SP и др. (февраль 2005 г.). «Взгляд балийской Y-хромосомы на заселение Индонезии: генетический вклад донеолитических охотников-собирателей, австронезийских фермеров и индийских торговцев». Human Biology . 77 (1): 93–114. doi :10.1353/hub.2005.0030. hdl : 1808/13586 . PMID 16114819. S2CID 7953854.
- ^ Sharma S, Rai E, Sharma P, Jena M, Singh S, Darvishi K, Bhat AK, Bhanwer AJ, Tiwari PK, Bamezai RN (январь 2009 г.). «Индийское происхождение отцовской гаплогруппы R1a1* подтверждает автохтонное происхождение брахманов и кастовой системы». Journal of Human Genetics . 54 (1): 47–55. doi : 10.1038/jhg.2008.2 . PMID 19158816.
- ^ Саху, Сангамитра; Сингх, Анамика; Химабинду, Г.; Банерджи, Джилам; Ситалакшими, Т.; Гайквад, Сонали; Триведи, Р.; Эндикотт, Филипп; Кивисилд, Тоомас; Мецпалу, Мейт; Виллемс, Ричард (24 января 2006 г.). «Предыстория индийских Y-хромосом: оценка сценариев демического распространения». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (4): 843–848. Бибкод : 2006PNAS..103..843S. дои : 10.1073/pnas.0507714103 . ISSN 0027-8424. ПМК 1347984 . PMID 16415161.
- ^ Кивисилд, Т.; Рутси, С.; Метспалу, М.; Мастана, С.; Калдма, К.; Парик, Дж.; Метспалу, Э.; Адоджан, М.; Толк, Х.-В.; Степанов, В.; Гёльге, М. (февраль 2003 г.). «Генетическое наследие самых ранних поселенцев сохраняется как в индийских племенах, так и в кастовых популяциях». Американский журнал генетики человека . 72 (2): 313–332. doi :10.1086/346068. ISSN 0002-9297. PMC 379225. PMID 12536373 .
- ^ Иасвархант, Мутхукришнан; Хак, Икрамул; Равеш, Зейнаб; Ромеро, Ирен Гальего; Меганатан, Пурлин Рамакоди; Дубей, Бхавна; Хан, Файзан Ахмед; Чаубей, Гьянешвер; Кивисилд, Тоомас; Тайлер-Смит, Крис; Сингх, Лалджи (март 2010 г.). «Следы происхождения к югу от Сахары и Ближнего Востока в мусульманском населении Индии». Европейский журнал генетики человека . 18 (3): 354–363. дои : 10.1038/ejhg.2009.168. ISSN 1018-4813. ПМЦ 2859343 . ПМИД 19809480.
- ^ abcdefgh Шарма, Сваркар; Рай, Экта; Шарма, Притхвирадж; Джена, Мамата; Сингх, Швета; Дарвиши, Катаюн; Бхат, Аудеш К.; Бханвер, А. Дж. С.; Тивари, Прамод Кумар; Бамезай, Рамешвар НК (январь 2009 г.). «Индийское происхождение отцовской гаплогруппы R1a1 * подтверждает автохтонное происхождение брахманов и кастовой системы». Журнал генетики человека . 54 (1): 47–55. doi : 10.1038/jhg.2008.2 . ISSN 1435-232X. PMID 19158816. S2CID 22162114.
- ^ abcd Battaglia V, Fornarino S, Al-Zahery N, Olivieri A, Pala M, Myres NM и др. (июнь 2009 г.). «Y-хромосомные доказательства культурной диффузии сельского хозяйства в Юго-Восточной Европе». European Journal of Human Genetics . 17 (6): 820–830. doi :10.1038/ejhg.2008.249. PMC 2947100. PMID 19107149 .
- ^ ab Gayden T, Cadenas AM, Regueiro M, Singh NB, Zhivotovsky LA, Underhill PA, et al. (Май 2007). «Гималаи как направленный барьер для потока генов». American Journal of Human Genetics . 80 (5): 884–894. doi :10.1086/516757. PMC 1852741. PMID 17436243 .
- ^ Форнарино С., Пала М., Батталья В., Маранта Р., Ахилли А., Модиано Г. и др. (июль 2009 г.). «Митохондриальное и Y-хромосомное разнообразие Таруса (Непал): резервуар генетических вариаций». Эволюционная биология BMC . 9 (1): 154. Бибкод : 2009BMCEE...9..154F. дои : 10.1186/1471-2148-9-154 . ПМК 2720951 . ПМИД 19573232.
- ^ ab Underhill PA, Shen P, Lin AA, Jin L, Passarino G, Yang WH и др. (ноябрь 2000 г.). «Изменение последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Nature Genetics . 26 (3): 358–361. doi :10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.
- ^ abc Pericić M, Lauc LB, Klarić IM, Rootsi S, Janićijevic B, Rudan I, et al. (октябрь 2005 г.). «Высокоточный филогенетический анализ юго-восточной Европы прослеживает основные эпизоды отцовского потока генов среди славянских популяций». Молекулярная биология и эволюция . 22 (10): 1964–1975. doi : 10.1093/molbev/msi185 . PMID 15944443.
- ^ abcd Грешам Д., Морар Б., Андерхилл П.А., Пассарино Г., Лин А.А., Уайз С., Ангеличева Д., Калафель Ф., Офнер П.Дж., Шен П., Турнев И., де Пабло Р., Кучинскас В., Перес-Лезаун А., Марушякова Е., Попов В., Калайджиева Л. (декабрь 2001 г.). «Происхождение и расхождение цыган (цыган)». Американский журнал генетики человека . 69 (6): 1314–1331. дои : 10.1086/324681. ПМЦ 1235543 . ПМИД 11704928.
- ^ В гаплогруппе H-M82 идентичный 8-микросателлитный гаплотип хромосомы Y разделяют почти 30% цыганских мужчин, что является поразительной степенью сохранения высокодифференцированной линии, ранее описанной только у еврейских священников.
https://med.stanford.edu Недавно обнаруженная популяция-основатель: рома/цыгане - Stanford Medicine
https://med.stanford.edu/content/dam/sm/tanglab/documents/ANewlyDiscoveredFounderPopulation-TheRomaGypsies.pdf
- ^ Ferri G, Tofanelli S, Alù M, Taglioli L, Radheshi E, Corradini B и др. (сентябрь 2010 г.). «Изменение Y-STR в албанских популяциях: влияние на вероятности совпадения и генетическое наследие меньшинства, претендующего на египетское происхождение». Международный журнал юридической медицины . 124 (5): 363–370. doi :10.1007/s00414-010-0432-x. PMID 20238122. S2CID 1433895.
- ^ ab Pamjav H, Zalán A, Béres J, Nagy M, Chang YM (май 2011 г.). «Генетическая структура отцовской линии цыган». Американский журнал физической антропологии . 145 (1): 21–29. doi :10.1002/ajpa.21454. PMID 21484758.
- ^ ab Regueiro M, Stanojevic A, Chennakrishnaiah S, Rivera L, Varljen T, Alempijevic D, Stojkovic O, Simms T, Gayden T, Herrera RJ (январь 2011 г.). «Расходящиеся патрилинейные сигналы в трех популяциях рома». American Journal of Physical Anthropology . 144 (1): 80–91. doi :10.1002/ajpa.21372. PMID 20878647.
- ↑ Гужман А, Гужман Л, Гомеш В, Алвес С, Калафель Ф, Аморим А, Прата MJ (март 2008 г.). «Взгляд на историю иберийских цыган, представленный филогеографическим анализом линий Y-хромосомы». Анналы генетики человека . 72 (Часть 2): 215–227. дои : 10.1111/j.1469-1809.2007.00421.x. PMID 18205888. S2CID 6365458.
- ^ abc Семино О, Пассарино Г, Офнер П.Дж., Лин А.А., Арбузова С., Бекман Л.Е. и др. (ноябрь 2000 г.). «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: взгляд на Y-хромосому». Наука . 290 (5494): 1155–1159. Бибкод : 2000Sci...290.1155S. дои : 10.1126/science.290.5494.1155. ПМИД 11073453.
- ^ abcdefgh Уэллс RS, Юлдашева N, Рузибакиев R, Андерхилл PA, Евсеева I, Блю-Смит J и др. (август 2001 г.). «Евразийское сердце: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (18): 10244–10249. Bibcode : 2001PNAS...9810244W. doi : 10.1073/pnas.171305098 . PMC 56946. PMID 11526236 .
- ^ abcde Лу Ян (2011), «Генетическая смесь популяций в Западном Китае». Шанхай: Университет Фудань, 2011: 1-84. (Докторская диссертация на китайском языке: 陆艳, «中国西部人群的遗传混合», 上海:复旦大学,2011: 1-84.)
- ^ abc ЛЮ Шуху, НИЗАМ Йилихаму, РАБИЯМУ Баке, АБДУКЕРАМ Бупатима и ДОЛКУН Матюсуп, «Исследование генетического разнообразия трех изолированных популяций в Синьцзяне с использованием Y-SNP». Acta Anthropologica Sinica , 2018, 37(1): 146-156.
- ^ Regueiro M, Cadenas AM, Gayden T, Underhill PA, Herrera RJ (2006). «Иран: трехконтинентальный узел миграции, вызванной Y-хромосомой». Human Heredity . 61 (3): 132–143. doi :10.1159/000093774. PMID 16770078. S2CID 7017701.
- ^ ab Cadenas AM, Zhivotovsky LA, Cavalli-Sforza LL, Underhill PA, Herrera RJ (март 2008 г.). «Разнообразие Y-хромосомы характеризует Оманский залив». European Journal of Human Genetics . 16 (3): 374–386. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201934 . PMID 17928816.
- ^ Luis JR, Rowold DJ, Regueiro M, Caeiro B, Cinnioğlu C, Roseman C и др. (март 2004 г.). «Левант против Африканского Рога: доказательства двунаправленных коридоров человеческих миграций». American Journal of Human Genetics . 74 (3): 532–544. doi :10.1086/382286. PMC 1182266 . PMID 14973781.
- ^ Абу-Амеро КК, Хеллани А, Гонсалес АМ, Ларруга ДжМ, Кабрера ВМ, Андерхилл ПА (сентябрь 2009 г.). «Разнообразие Y-хромосомы Саудовской Аравии и его связь с близлежащими регионами». BMC Genetics . 10 : 59. doi : 10.1186/1471-2156-10-59 . PMC 2759955. PMID 19772609 .
- ^ Cinnioğlu C, King R, Kivisild T, Kalfoğlu E, Atasoy S, Cavalleri GL и др. (январь 2004 г.). «Раскопки слоев гаплотипа Y-хромосомы в Анатолии». Генетика человека . 114 (2): 127–148. doi :10.1007/s00439-003-1031-4. PMID 14586639. S2CID 10763736.
- ^ ab He JD, Peng MS, Quang HH, Dang KP, Trieu AV, Wu SF и др. (2012). «Патрилинейный взгляд на австронезийскую диффузию в материковой части Юго-Восточной Азии». PLOS ONE . 7 (5): e36437. Bibcode : 2012PLoSO...736437H. doi : 10.1371/journal.pone.0036437 . PMC 3346718. PMID 22586471 .
- ^ Брунелли А., Кампуансай Дж., Сейелстад М., Ломтайсонг К., Кангванпонг Д., Гиротто С., Кутанан В. (2017). «Доказательства происхождения северных тайцев по хромосоме Y». PLOS ONE . 12 (7): e0181935. Bibcode : 2017PLoSO..1281935B. doi : 10.1371/journal.pone.0181935 . PMC 5524406. PMID 28742125 .
- ^ ab Trejaut JA, Poloni ES, Yen JC, Lai YH, Loo JH, Lee CL, He CL, Lin M (июнь 2014 г.). "Вариация ДНК Y-хромосомы Тайваня и ее связь с островной Юго-Восточной Азией". BMC Genetics . 15 : 77. doi : 10.1186/1471-2156-15-77 . PMC 4083334 . PMID 24965575.
- ^ Peng MS, He JD, Fan L, Liu J, Adeola AC, Wu SF и др. (август 2014 г.). «Получение деревьев гаплогрупп Y-хромосомы с использованием данных GWAS». European Journal of Human Genetics . 22 (8): 1046–1050. doi :10.1038/ejhg.2013.272. PMC 4350590. PMID 24281365 .
- ^ ab Международное общество генетической генеалогии (25 мая 2016 г.). "Y-ДНК Гаплогруппа Древо 2016 Версия: 11.144".
- ^ abc Karmin M, Saag L, Vicente M, Wilson Sayres MA, Järve M, Talas UG и др. (апрель 2015 г.). «Недавнее узкое место разнообразия Y-хромосомы совпадает с глобальным изменением в культуре». Genome Research . 25 (4): 459–466. doi :10.1101/gr.186684.114. PMC 4381518 . PMID 25770088. «Дополнительная информация» (PDF) .
- ^ van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau MH (февраль 2014 г.). «Видеть лес за деревьями: минимальная справочная филогения для человеческой Y-хромосомы». Human Mutation . 35 (2): 187–191. doi :10.1002/humu.22468. PMID 24166809. S2CID 23291764.
- ^ Лю С., Низам И., Рабияму Б., Абдукерам Б., Долкун М. (2018). «Исследование генетического разнообразия трех изолированных популяций в Синьцзяне с использованием Y-SNP». Acta Anthropologica Sinica . Архивировано из оригинала 14 января 2019 г. Получено 13 января 2019 г.
- ^ Каденас А. (8 ноября 2006 г.). Полиморфизмы Y-хромосомы в Южной Аравии (диссертация на степень магистра наук). Международный университет Флориды. doi : 10.25148/etd.FI14052526 .
- ^ Regueiro M, Cadenas AM, Gayden T, Underhill PA, Herrera RJ (2006). «Иран: трехконтинентальный узел миграции, вызванной Y-хромосомой». Human Heredity . 61 (3): 132–143. doi :10.1159/000093774. PMID 16770078. S2CID 7017701.
- ^ "Ассирийский". FamilyTreeDNA . Gene by Gene, Ltd.
- ^ "Армянский ДНК-проект". FamilyTreeDNA . Gene by Gene, Ltd.
- ^ Francalacci P, Morelli L, Angius A, Berutti R, Reinier F, Atzeni R и др. (август 2013 г.). «Низкочастотное секвенирование ДНК 1200 сардинцев реконструирует европейскую филогению Y-хромосомы». Science . 341 (6145): 565–569. Bibcode :2013Sci...341..565F. doi :10.1126/science.1237947. PMC 5500864 . PMID 23908240.
- ^ Rai N, Chaubey G, Tamang R, Pathak AK, Singh VK, Karmin M и др. (2012). «Филогеография гаплогруппы Y-хромосомы h1a1a-m82 раскрывает вероятное индийское происхождение европейских цыганских популяций». PLOS ONE . 7 (11): e48477. Bibcode :2012PLoSO...748477R. doi : 10.1371/journal.pone.0048477 . PMC 3509117 . PMID 23209554.
Внешние ссылки
На Викискладе есть медиафайлы по теме Гаплогруппа H Y-ДНК .
- Индийский генеалогический проект