stringtranslate.com

Западная когтистая лягушка

Западная шпорцевая лягушка ( Xenopus тропическая ) — вид лягушек семейства Pipidae , также известный как тропическая шпорцевая лягушка . [2] Это единственный вид рода Xenopus , имеющий диплоидный геном . [3] [4] Его геном был секвенирован, [5] [6] что делает его важным модельным организмом для генетики , дополняющим родственный вид Xenopus laevis ( африканская шпорцевая лягушка ), [7] широко используемой моделью позвоночных для изучения развития. биология . X. тропический также имеет ряд преимуществ перед X. laevis в исследованиях, таких как гораздо более короткое время генерации (<5 месяцев), меньший размер (длина тела 4–6 см (1,6–2,4 дюйма)) и большее количество яиц за нерест . [8]

Встречается в Бенине , Буркина-Фасо , Камеруне , Кот-д'Ивуаре , Экваториальной Гвинее , Гамбии , Гане , Гвинее , Гвинее-Бисау , Либерии , Нигерии , Сенегале , Сьерра-Леоне , Того и, возможно, Мали . Его естественными местами обитания являются субтропические или тропические влажные равнинные леса , влажные саванны , реки , пересыхающие реки , болота , пресноводные озера, перемежающиеся пресноводные озера, пресноводные болота , перемежающиеся пресноводные болота, сельские сады, сильно деградировавшие бывшие леса, водохранилища, пруды , аквакультура. пруды, каналы и канавы.

Описание

Западная шпорцевая лягушка - это вид среднего размера с несколько уплощенным телом и длиной отверстия морды от 28 до 55 мм (от 1,1 до 2,2 дюйма), причем самки крупнее самцов. Глаза навыкате, расположены высоко на голове, под каждым глазом имеется короткое щупальце . Ряд непигментированных дермальных бугорков проходит вдоль бока сразу за глазом и, как полагают, представляет собой орган боковой линии . Конечности короткие и пухлые, а полностью перепончатые ступни имеют роговые когти. Кожа мелкозернистая. Спинная поверхность варьируется от бледно- до темно-коричневого цвета и имеет мелкие серые и черные пятна. Брюшная поверхность тускло-белая или желтоватая с темными крапинками. [9]

Распространение и среда обитания

Западная когтистая лягушка — водный вид, обитающий в поясе тропических лесов Западной Африки, ареал которого простирается от Сенегала до Камеруна и восточного Заира. Обычно считается лесным видом и населяет медленно текущие ручьи, но также встречается в заводях и временных прудах в саваннах северной Гвинеи и Судана . [9]

Биология

В засушливый сезон эта лягушка обитает в мелких ручьях и прячется под корнями деревьев, под плоскими камнями или в ямах на берегу реки. Питается в основном дождевыми червями, личинками насекомых и головастиками. Когда начинается сезон дождей, он ночью мигрирует по лесной подстилке в поисках временных луж. Нерест может происходить в больших водоемах с большим количеством растительности, но головастики иногда встречаются и в мутных водоемах без растительности. Одиночные яйца могут прикрепляться к растениям или плавать. У головастиков широкий рот и отсутствие челюстей, но на верхних губах имеются длинные щупальца. Брюшные плавники их хвостов шире спинных. Цвет их тела обычно оранжевый, а хвост прозрачный, но в более темных местах хвост может быть черноватым. Головастики питаются, фильтруя зоопланктон из воды. В крупных водоемах они могут образовывать плотные стаи. Метаморфоза происходит, когда головастики достигают длины около 5 см (2 дюйма). [9]

Определение пола

Определение пола у подавляющего большинства земноводных контролируется гомоморфными (морфологически неразличимыми) половыми хромосомами . [10] В результате этой трудности в идентификации половых хромосом, только у относительно небольшой части видов бесхвостых животных, которые были кариотипированы , также были идентифицированы половые хромосомы. [11] Все виды рода Xenopus имеют гомоморфные половые хромосомы. [11] Кроме того, ген DM-W на W-хромосоме у некоторых видов Xenopus является единственным геном, определяющим пол, который был идентифицирован у амфибий. [11] Этот ген DM-W был впервые идентифицирован у X. laevis , однако он не обнаружен у X. тропического . [11] Эксперименты с участием особей с измененным полом, гиногенезом , триплоидами и обычными скрещиваниями показали, что X. тропический имеет три половые хромосомы: Y, W и Z. [11] Эти три половые хромосомы производят три разных мужских генотипа, YW. , YZ и ZZ (все фенотипически идентичны) и два разных женских генотипа, ZW и WW (все фенотипически идентичны). [11] В результате потомство X. тропического может иметь соотношение полов, которое отличается от широко известного 1:1, обычно встречающегося у видов только с двумя разными половыми хромосомами. Например, потомство, полученное от самки ZW и самца YZ, будет иметь соотношение полов самок и самцов 1:3, а потомство, полученное от самки WW и самца ZZ, будет полностью женским. [11] В результате такой системы определения пола как самцы, так и самки X. тропических могут быть как гетерогаметными, так и гомогаметными , что крайне редко встречается в природе. [11] Точный генетический механизм и точные аллели, лежащие в основе этой системы, пока не известны. [12] Одно из возможных объяснений состоит в том, что W-хромосома содержит аллель, определяющую самку, функция которой не обнаружена в Z-хромосоме, в то время как Y-хромосома содержит аллель, действующую как негативный регулятор, который доминирует над аллелем, определяющим самку на хромосоме. W-хромосома. [12]

Хотя у X. тропических есть эти три половые хромосомы, частота этих трех половых хромосом неравномерно распределена среди популяций этого вида на всем его естественном ареале. Y-хромосома была идентифицирована в двух местах в Гане и в лабораторном штамме, происходящем из Нигерии, а наличие Z-хромосомы было подтверждено у людей из западной и восточной Ганы. [12] Кроме того, было обнаружено, что все три половые хромосомы существуют вместе в популяциях X. тропических в Гане и, возможно, в других местах ее ареала. [12] Кроме того, нерегулярное соотношение полов у потомства обычно считается невыгодным, поэтому независимо от того, является ли наличие трех половых хромосом у X. тропических эволюционно стабильным или признаком того, что этот вид переживает переход половых хромосом (обмен половых хромосом) или нет. , это еще вопрос. [12] Кажется вероятным, что появление Y-хромосомы является самым последним событием в эволюции половых хромосом этого вида. [12] Вполне возможно, что в будущем вымирание Z-хромосомы приведет к тому, что W-хромосома превратится в X-хромосому, что приведет к созданию этого вида, пол которого будет определяться системой XY . [12] Также возможно, что если бы Y-хромосома вымерла, этот вид вернулся бы к использованию наследственной системы ZW . [12]

Положение дел

МСОП относит западную шпорцевую лягушку к категории « вызывающих наименьшие опасения », поскольку она имеет широкое распространение и является адаптируемым видом , обитающим в различных средах обитания, а тенденция численности популяции кажется устойчивой. [1]

Использование в качестве генетической модельной системы.

См. также Xenopus # Модельный организм для биологических исследований.

Эмбрионы и яйца Xenopus являются популярной модельной системой для широкого спектра биомедицинских исследований. [3] [13] Это животное широко используется из-за мощного сочетания экспериментальной послушности и тесной эволюционной связи с человеком, по крайней мере, по сравнению со многими модельными организмами. [13]

В отличие от родственного вида X. laevis , X. тропический диплоиден и имеет короткое время генерации , что облегчает генетические исследования. [3] Полный геном X. тропического секвенирован. [5] Этот вид имеет n=10 хромосом. [14]

X. тропический имеет три гена трансферрина , каждый из которых является близким ортологом других позвоночных. Они относительно далеки от хордовых беспозвоночных и сильно отличаются от ортологов протостом . [15]

Онлайн-база данных модельных организмов

Xenbase [16] представляет собой базу данных модельных организмов (MOD) как для Xenopus laevis , так и для Xenopus тропического . [17]

Рекомендации

  1. ^ ab Группа специалистов МСОП SSC по амфибиям (2019). «Ксенопус тропический». Красный список исчезающих видов МСОП . 2019 : e.T89256756A107607050. doi : 10.2305/IUCN.UK.2019-2.RLTS.T89256756A107607050.en . Проверено 11 ноября 2021 г.
  2. ^ Фрост, Даррел Р. (2014). «Xenopus тропический (Серый, 1864 г.)». Виды амфибий мира: онлайн-справочник. Версия 6.0 . Американский музей естественной истории . Проверено 3 марта 2015 г.
  3. ^ abc Харланд РМ, Грейнджер РМ (декабрь 2011 г.). «Исследования Xenopus: метаморфизованные генетикой и геномикой». Тенденции в генетике . 27 (12): 507–15. дои :10.1016/j.tig.2011.08.003. ПМК 3601910 . ПМИД  21963197. 
  4. ^ Амайя Э, Оффилд М.Ф., Грейнджер Р.М. (июль 1998 г.). «Генетика лягушек: Xenopus тропический прыгает в будущее». Тенденции в генетике . 14 (7): 253–5. дои : 10.1016/s0168-9525(98)01506-6. ПМИД  9676522.
  5. ^ ab Хеллстен Ю, Харланд Р.М., Гилкрист М.Дж., Хендрикс Д., Юрка Дж., Капитонов В. и др. (30 апреля 2010 г.). «Геном западной шпорцевой лягушки Xenopustropicis». Наука . 328 (5978): 633–636. Бибкод : 2010Sci...328..633H. дои : 10.1126/science.1183670. ПМЦ 2994648 . ПМИД  20431018. 
  6. ^ JGI X. тропический v4.1
  7. ^ Боуз Дж.Б., Снайдер К.А., Сегерделл Э., Гибб Р., Джарабек С., Ноумен Э. и др. (январь 2008 г.). «Xenbase: ресурс по биологии и геномике Xenopus». Исследования нуклеиновых кислот . 36 (Проблема с базой данных): D761-7. дои : 10.1093/нар/gkm826 . ПМК 2238855 . ПМИД  17984085. 
  8. ^ «Привнесение генетики в Xenopus: половина генома, в два раза быстрее» . Университет Вирджинии . Проверено 24 октября 2009 г.
  9. ^ abc МО Редель; Вэнс Вреденбург; Эм Джей Махони; Тейт Танстолл; Келли Уиттакер (01 мая 2010 г.). «Ксенопус тропический». АмфибияВеб . Проверено 6 декабря 2013 г.
  10. ^ Бахтрог, Дорис; Мэнк, Джудит Э .; Пайхель, Кэтрин Л.; Киркпатрик, Марк; Отто, Сара П.; Эшман, Тиа-Линн; Хан, Мэтью В.; Китано, Джун; Мэйроуз, Италия; Мин, Рэй; Перрен, Николя (июль 2014 г.). «Определение пола: почему так много способов сделать это?». ПЛОС Биология . 12 (7): e1001899. дои : 10.1371/journal.pbio.1001899 . ISSN  1545-7885. ПМК 4077654 . ПМИД  24983465. 
  11. ^ abcdefgh Роко, Альваро С.; Олмстед, Аллен В.; Дегиц, Зигмунд Дж.; Амано, Тосиказу; Циммерман, Лайл Б.; Бульехос, Моника (август 2015 г.). «Сосуществование половых хромосом Y, W и Z у Xenopus тропического». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (34): Е4752-61. Бибкод : 2015PNAS..112E4752R. дои : 10.1073/pnas.1505291112 . ISSN  0027-8424. ПМЦ 4553762 . ПМИД  26216983. 
  12. ^ abcdefgh Фурман, Бенджамин Л.С.; Коре, Кэролайн М.С.; Найтл, Мартин; Сун, Сюэ-Ин; Премачандра, Таринду; Офори-Боатенг, Калеб; Джордан, Даниэль С.; Хорб, Марко Э.; Эванс, Бен Дж. (9 ноября 2020 г.). Пайхель, Кэтрин Л. (ред.). «Лягушка с тремя половыми хромосомами, которые в природе смешиваются вместе: Xenopus тропический имеет вырожденную W и Y, которые произошли из Z-хромосомы». ПЛОС Генетика . 16 (11): e1009121. дои : 10.1371/journal.pgen.1009121 . ISSN  1553-7404. ПМЦ 7652241 . ПМИД  33166278. 
  13. ^ Аб Уоллингфорд Дж., Лю К. и Чжэн Ю. 2010. Current Biology vol. 20, с. Р263–4
  14. ^ "Xenopus тропический (ID 80) - Геном - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 1 декабря 2020 г.
  15. ^ Габальдон, Тони; Кунин, Евгений В. (04 апреля 2013 г.). «Функциональные и эволюционные последствия ортологии генов». Обзоры природы Генетика . Природное портфолио . 14 (5): 360–366. дои : 10.1038/nrg3456. ISSN  1471-0056. ПМЦ 5877793 . ПМИД  23552219. 
  16. ^ Карими К., Фортрид Дж. Д., Лотай В. С., Бернс К. А., Ван Д. З., Фишер М. Е. и др. (январь 2018 г.). «Xenbase: база данных геномных, эпигеномных и транскриптомных модельных организмов». Исследования нуклеиновых кислот . 46 (Д1): Д861–Д868. дои : 10.1093/nar/gkx936. ПМЦ 5753396 . ПМИД  29059324. 
  17. ^ "База данных модельного организма Xenopus" . Xenbase.org .

Внешние ссылки