stringtranslate.com

Альфакоронавирус

Альфакоронавирусы (Альфа-КоВ) относятся к первому из четырех родов ( Альфа- , Бета- , Гамма- и Дельта- ) коронавирусов . Это одноцепочечные РНК-вирусы с положительным смыслом , которые заражают млекопитающих , включая человека . Они имеют сферические вирионы с булавовидными выступами на поверхности , образованными тримерами белка-шипа , и вирусную оболочку .

Альфакоронавирусы относятся к подсемейству Orthocoronavirinae семейства Coronaviridae . Обе линии альфа- и бетакоронавируса происходят от генофонда вируса летучих мышей . [1] [2] Альфакоронавирусы ранее были известны как « коронавирусы филогруппы 1».

Род Alphacoronavirus очень разнообразен, особенно у летучих мышей. Большинство штаммов, происходящих от летучих мышей, не были успешно изолированы и культивированы в лаборатории. Альфакоронавирусы, заражающие другие виды млекопитающих, изучены гораздо лучше, см. Список живых изолятов коронавируса .

Этимология

Название альфакоронавирус происходит от древнегреческого ἄλφα ( álpha , «первая буква греческого алфавита ») и κορώνη (korṓnē, «гирлянда, венок»), что означает корону, что описывает внешний вид поверхностных выступов, видимых под электронной микроскопией. напоминающие солнечную корону . [3]

Состав

Вирион имеет оболочку и сферическую форму, его диаметр составляет 120–160 нм, а диаметр ядра составляет около 65 нм. Гликопротеины и тримеры образуют большие выступы на поверхности, которые создают видимость солнечной короны. Этот род, как и другие коронавирусы, имеет шиповый белок со слитой машиной типа I (S2) и рецептор-связывающим доменом (S1). Собирается в тример. В отличие от бета- и гаммакоронавирусов, этот белок не расщепляется на две половины. [4]

Геном

Генетические взаимоотношения между различными генотипами коронавирусов кошек (FCov) и коронавирусов собак (CCoV). Рекомбинация по стрелкам. [5]

Геном представляет собой одноцепочечную РНК с положительным смыслом длиной от 27 до 29 тыс. оснований и 3'- полиА- хвостом. Две большие перекрывающиеся ORF на 5'-конце генома кодируют основные неструктурные белки, экспрессируемые в виде слитого белка за счет сдвига рамки рибосомы . К ним относятся области с протеазными , геликазными и РНК-полимеразными мотивами. Ниже расположены семь других генов, которые кодируют структурные белки. Они экспрессируются из 3'-котерминального вложенного набора субгеномных мРНК .

Рекомбинация

Известно , что оба типа альфакоронавируса 1 — коронавирус кошек (FCoV) и коронавирус собак (CCoV) — существуют в двух серотипах. Серотип II нацелен на аминопептидазу N , тогда как рецептор серотипа I неизвестен. Разница связана с другим белком-шипом. [6] У FCoV и CCoV есть общий предок. Этот предок постепенно превратился в FCoV I и CCoV I. Белок S неизвестного вируса был рекомбинирован в предка и дал начало CCoV II. CCoV II снова объединился с FCoV, чтобы создать FCoV II. CCoV II постепенно превратился в TGEV. Удаление шипа в TGEV создает PRCV. Все эти вирусы отнесены к подроду Tegacovirus . [6]

Классификация

Филогенетическое древо рода Alphacoronaviruses с животными-хозяевами указано справа.

Признаны следующие подроды и виды: [7]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Ву, ПК; Ван, М.; Лау, СК; Сюй, Х.; Пун, RW; Го, Р.; Вонг, Б.Х.; Гао, К.; Цой, Х.В.; Хуанг, Ю.; Ли, К.С.; Лам, CS; Чан, К.Х.; Чжэн, Би Джей; Юэнь, Кентукки (2007). «Сравнительный анализ двенадцати геномов трех новых коронавирусов группы 2c и группы 2d выявляет уникальные особенности групп и подгрупп». Журнал вирусологии . 81 (4): 1574–85. дои : 10.1128/JVI.02182-06. ПМЦ  1797546 . ПМИД  17121802.
  2. ^ Лау, СК; Ву, ПК; Ага, CC; Фан, Р.Ю.; Хуанг, Ю.; Ван, М.; Го, Р.; Лам, CS; Цанг, АК; Лай, КК; Чан, К.Х.; Че, XY; Чжэн, Би Джей; Юэнь, Кентукки (2012). «Выделение и характеристика нового коронавируса бетакоронавируса подгруппы А, кроличьего коронавируса HKU14, от домашних кроликов». Журнал вирусологии . 86 (10): 5481–96. дои : 10.1128/JVI.06927-11. ПМЦ 3347282 . ПМИД  22398294. 
  3. ^ Декаро, Никола (2011). «Альфакоронавирус». Индекс вирусов Спрингера . стр. 371–383. дои : 10.1007/978-0-387-95919-1_56. ISBN 978-0-387-95918-4. S2CID  216061230.
  4. ^ Рэпп, Дэниел; Маклеллан, Джейсон С.; Галлахер, Том (13 ноября 2019 г.). «Структура криоэлектронной микроскопии 3,1 ангстрема шипового белка вируса эпидемической диареи свиней в префузионной конформации». Журнал вирусологии . 93 (23): e00923-19. дои : 10.1128/JVI.00923-19. ПМК 6854500 . ПМИД  31534041. 
  5. ^ Ле Подер, Софи (31 июля 2011 г.). «Коронавирусы кошек и собак: общие генетические и патобиологические особенности». Достижения вирусологии . 2011 : 609465. doi : 10.1155/2011/609465 . ПМЦ 3265309 . ПМИД  22312347. 
  6. ^ Аб Хаймес, Хавьер А.; Милле, Жан К.; Стаут, Элисон Э.; Андре, Николь М.; Уиттакер, Гэри Р. (10 января 2020 г.). «Повесть о двух вирусах: особые шиповые гликопротеины кошачьих коронавирусов». Вирусы . 12 (1): 83. дои : 10.3390/v12010083 . ПМК 7019228 . ПМИД  31936749. 
  7. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.» . talk.ictvonline.org . Международный комитет по таксономии вирусов . Проверено 20 июня 2020 г.

Внешние ссылки