stringtranslate.com

Ацидофильный

Ацидофилы или ацидофильные организмы — это те , которые процветают в условиях высокой кислотности (обычно при pH 5,0 или ниже [1] ). Эти организмы можно найти в различных ветвях древа жизни , включая археи , бактерии [2] и эукариоты .

Примеры

Список этих организмов включает в себя:

Археи

Бактерии

Эукария

Механизмы адаптации к кислой среде

Большинство ацидофильных организмов выработали чрезвычайно эффективные механизмы для откачки протонов из внутриклеточного пространства , чтобы поддерживать цитоплазму на уровне или около нейтрального pH. Поэтому внутриклеточным белкам не нужно развивать кислотную устойчивость в ходе эволюции. Однако другие ацидофилы, такие как Acetobacter aceti , имеют подкисленную цитоплазму, которая заставляет почти все белки в геноме развивать кислотную устойчивость. [8] По этой причине Acetobacter aceti стал ценным ресурсом для понимания механизмов, с помощью которых белки могут достигать кислотной устойчивости.

Исследования белков, адаптированных к низкому pH, выявили несколько общих механизмов, с помощью которых белки могут достигать кислотной стабильности. В большинстве кислотоустойчивых белков (таких как пепсин и белок soxF из Sulfolobus acidocaldarius ) наблюдается избыточное количество кислотных остатков, что минимизирует дестабилизацию при низком pH, вызванную накоплением положительного заряда. Другие механизмы включают минимизацию доступности растворителя для кислотных остатков или связывание металлических кофакторов. В особом случае кислотной стабильности было показано, что белок NAPase из Nocardiopsis alba переместил кислоточувствительные солевые мостики из областей, которые играют важную роль в процессе развертывания. В этом случае кинетической кислотной стабильности долговечность белка достигается в широком диапазоне pH, как кислых, так и основных.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Джин, Кушенг; Кирк, Мэтью Ф. (2018-05-01). "pH как основной контроль в экологической микробиологии: 1. Термодинамическая перспектива". Frontiers in Environmental Science . 6 : 21. doi : 10.3389/fenvs.2018.00021 . ISSN  2296-665X.
  2. ^ Беккер, А., Типы бактерий, живущих в кислой среде. Получено 10 мая 2017 г.
  3. ^ abc Дворкин М., Фальков С. (2006). Прокариоты: Справочник по биологии бактерий.
  4. ^ Сингх OV (2012). Экстремофилы: устойчивые ресурсы и биотехнологические последствия . John Wiley & Sons . стр. 76–79. ISBN 978-1-118-10300-5.
  5. ^ Quaiser, Achim; Ochsenreiter, Torsten; Lanz, Christa; Schuster, Stephan C.; Treusch, Alexander H.; Eck, Jürgen; Schleper, Christa (27 августа 2003 г.). «Ацидобактерии образуют связную, но весьма разнообразную группу в бактериальном домене: данные экологической геномики». Молекулярная микробиология . 50 (2): 563–575. doi :10.1046/j.1365-2958.2003.03707.x. PMID  14617179. S2CID  25162803.
  6. ^ Петтифер GL; Осмундсон ME; Мерфи JM (март 1997 г.). «Методы обнаружения и подсчета Alicyclobacillus acidoterrestris и исследование роста и образования примесей во фруктовом соке и напитках, содержащих фруктовый сок». Письма в прикладную микробиологию . 24 (3): 185–189. doi :10.1046/j.1472-765X.1997.00373.x. PMID  9080697. S2CID  6976998.
  7. ^ abc Rawlings, Douglas; Johnson, D. Barrie. "Eukaryotic Acidophiles". Encyclopedia of Life Support System (EOLSS) . Eolss Publishers. Архивировано из оригинала 2014-10-13 . Получено 3 февраля 2014 .
  8. ^ Менцель, У.; Готтшалк, Г. (1985). «Внутренний pH Acetobacterium wieringae и Acetobacter aceti во время роста и производства уксусной кислоты». Arch Microbiol . 143 (1): 47–51. Bibcode : 1985ArMic.143...47M. doi : 10.1007/BF00414767. S2CID  6477488.

Дальнейшее чтение