stringtranslate.com

Андерс Крог

Андерс Крог — биоинформатик из Копенгагенского университета , [1] где он возглавляет университетский центр биоинформатики . Он известен своей новаторской работой по использованию скрытых марковских моделей в биоинформатике (совместно с Дэвидом Хаусслером ), [2] [3] [4] и является соавтором широко используемого учебника по биоинформатике. [5] Кроме того, он также был соавтором одного из первых учебников по нейронным сетям . [6] Его текущие исследовательские интересы включают анализ промоторов , [7] [8] [9] некодирующую РНК , [10] [11] [12] предсказание генов [13] [14] [15] и предсказание структуры белка . [16] [17] [18] [19] [20]

В 2017 году Крог был избран членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB). [21]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ «Пользователь: Крог - БИНФ - Центр биоинформатики» . Архивировано из оригинала 02 сентября 2011 г. Проверено 14 апреля 2011 г.Профессор Андерс Крог, Центр биоинформатики, кафедра молекулярной биологии, Копенгагенский университет
  2. ^ Крог А., Браун М., Миан И.С., Шёландер К., Хаусслер Д. (1994). «Скрытые марковские модели в вычислительной биологии. Приложения к моделированию белков». Дж. Мол. Биол . 235 (5): 1501–31. дои : 10.1006/jmbi.1994.1104. ПМИД  8107089.
  3. ^ Крог А., Миан И.С., Хаусслер Д. (1994). «Скрытая модель Маркова, которая находит гены в ДНК E. coli». Нуклеиновые кислоты Рез . 22 (22): 4768–78. дои : 10.1093/нар/22.22.4768. ПМЦ 308529 . ПМИД  7984429. 
  4. ^ Шёландер К., Карплюс К., Браун М. и др. (1996). «Смеси Дирихле: метод улучшенного обнаружения слабой, но значительной гомологии белковых последовательностей». Вычислить. Прил. Биосци . 12 (4): 327–45. дои : 10.1093/биоинформатика/12.4.327 . ПМИД  8902360.
  5. ^ Дурбин, Ричард М .; Эдди, Шон Р .; Крог, Андерс; Митчисон, Грэм (1998), Анализ биологических последовательностей: вероятностные модели белков и нуклеиновых кислот (1-е изд.), Кембридж, Нью-Йорк: Cambridge University Press , ISBN 0-521-62971-3, OCLC  593254083
  6. ^ Введение в теорию нейронных вычислений (Исследования Института Санта-Фе в области наук о сложности). (1991) Джон А. Герц, Ричард Г. Палмер, Андерс Крог, Westview Press
  7. ^ Марстранд Т.Т., Фреллсен Дж., Мольтке И. и др. (2008). Копли Р. (ред.). «Как можно скорее: основа статистики чрезмерного представительства сайтов связывания факторов транскрипции». ПЛОС ОДИН . 3 (2): e1623. Бибкод : 2008PLoSO...3.1623M. дои : 10.1371/journal.pone.0001623 . ПМК 2229843 . ПМИД  18286180.  Значок открытого доступа
  8. ^ Фрит MC, Вален Э, Крог А, Хаяшизаки Ю, Карнинчи П, Санделин А (2008). «Код инициации транскрипции в геномах млекопитающих». Геном Рез . 18 (1): 1–12. дои : 10.1101/гр.6831208. ПМК 2134772 . ПМИД  18032727. 
  9. ^ Брин Дж.К., Вален Э., Тан М.Х. и др. (2008). «JASPAR, база данных открытого доступа с профилями связывания факторов транскрипции: новый контент и инструменты в обновлении 2008 года». Нуклеиновые кислоты Рез . 36 (Проблема с базой данных): D102–6. дои : 10.1093/nar/gkm955. ПМК 2238834 . ПМИД  18006571. 
  10. ^ Линдоу М., Якобсен А., Найгаард С., Манг Ю., Крог А. (2007). «Внутригеномное сопоставление раскрывает огромный потенциал для регуляции, опосредованной микроРНК, у растений». ПЛОС Компьютер. Биол . 3 (11): е238. Бибкод : 2007PLSCB...3..238L. дои : 10.1371/journal.pcbi.0030238 . ПМК 2098865 . ПМИД  18052543.  Значок открытого доступа
  11. ^ Линдгрин С., Гарднер П.П., Крог А. (2007). «MASTR: множественное выравнивание и предсказание структуры некодирующих РНК с использованием моделирования отжига». Биоинформатика . 23 (24): 3304–11. CiteSeerX 10.1.1.563.7072 . doi : 10.1093/биоинформатика/btm525. ПМИД  18006551. 
  12. ^ Линдгрин С., Гарднер П.П., Крог А. (2006). «Измерение ковариации в выравнивании РНК: физический реализм улучшает информационные показатели». Биоинформатика . 22 (24): 2988–95. doi : 10.1093/биоинформатика/btl514. ПМИД  17038338.
  13. ^ Мунк К., Крог А. (2006). «Автоматическое создание средств поиска генов эукариотических видов». БМК Биоинформатика . 7 : 263. дои : 10.1186/1471-2105-7-263 . ПМК 1522026 . ПМИД  16712739.  Значок открытого доступа
  14. ^ Мунк К., Гарднер П.П., Арктандер П., Крог А. (2006). «Подход скрытой марковской модели для определения экспрессии на микрочипах геномных плиток». БМК Биоинформатика . 7 : 239. дои : 10.1186/1471-2105-7-239 . ПМЦ 1481622 . ПМИД  16672042.  Значок открытого доступа
  15. ^ Нильсен П., Крог А. (2005). «Крупномасштабное предсказание генов прокариот и сравнение с аннотацией генома». Биоинформатика . 21 (24): 4322–9. doi : 10.1093/биоинформатика/bti701 . ПМИД  16249266.
  16. ^ Крог А, Ларссон Б, фон Хейне Г, Зоннхаммер Э.Л. (2001). «Прогнозирование топологии трансмембранных белков с помощью скрытой модели Маркова: применение для полных геномов». Дж Мол Биол . 305 (3): 567–580. дои : 10.1006/jmbi.2000.4315. ПМИД  11152613.
  17. ^ Винтер О, Крог А (2004). «Обучение компьютеров сворачиванию белков». Физ. Преподобный Е. 70 (3): 030903. arXiv : cond-mat/0309497 . Бибкод : 2004PhRvE..70c0903W. doi : 10.1103/PhysRevE.70.030903. PMID  15524499. S2CID  103560.
  18. ^ Выиграл KJ, Хамелрик Т, Прюгель-Беннетт А, Крог А (2007). «Эволюционный метод изучения структуры HMM: предсказание вторичной структуры белка». БМК Биоинформатика . 8 : 357. дои : 10.1186/1471-2105-8-357 . ПМК 2072961 . ПМИД  17888163.  Значок открытого доступа
  19. ^ Хамелрик Т., Кент Дж.Т., Крог А. (2006). «Отбор реалистичных конформаций белка с использованием локального структурного смещения». ПЛОС Компьютер. Биол . 2 (9): е131. Бибкод : 2006PLSCB...2..131H. дои : 10.1371/journal.pcbi.0020131 . ПМК 1570370 . ПМИД  17002495.  Значок открытого доступа
  20. ^ Бумсма В., Мардия К.В., Тейлор CC, Феркингхофф-Борг Дж., Крог А., Хамелрик Т. (2008). «Генеративная вероятностная модель локальной структуры белка». ПНАС . 105 (26): 8932–8937. Бибкод : 2008PNAS..105.8932B. дои : 10.1073/pnas.0801715105 . ПМК 2440424 . ПМИД  18579771. 
  21. ^ «13 февраля 2017 г.: Международное общество вычислительной биологии назвало семь членов классом стипендиатов ISCB 2017 г.» . www.iscb.org . Проверено 13 февраля 2017 г.

Внешние ссылки

У Схолии есть профиль Андерса Крога (Q4753847).