Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Обскурин — это белок , который у людей кодируется геном OBSCN . [ 5] [6] [7] Обскурин принадлежит к семейству гигантских саркомерных сигнальных белков, которое включает титин и небулин . Обскурин экспрессируется в сердечной и скелетной мышце и играет роль в организации миофибрилл во время сборки саркомера . Мутация в гене OBSCN связана с гипертрофической кардиомиопатией , а измененные свойства белка обскурина связаны с другими мышечными заболеваниями.
Структура
Человеческий обскурин может существовать в виде множественных вариантов сплайсинга приблизительно 720 кДа , [8] [9] [10] [11] [12] однако на сегодняшний день описана полноразмерная природа только одного из них. [13] Обскурин экспрессируется в сердечной и скелетной мышце. Ген обскурина охватывает более 150 кб, содержит более 80 экзонов . [14] Кодируемый белок содержит 68 доменов Ig , 2 домена фибронектина, 1 мотив связывания кальмодулина IQ , 1 домен RhoGEF с ассоциированным доменом PH и 2 домена серин-треониновой киназы. [13] Доминирующее расположение обскурина в зрелых миофибриллах находится в саркомерной М-полосе . [13] [15] Титин , обскурин, обскурин-подобный-1 и миомезин образуют тройной комплекс в саркомерных М-полосах , который имеет решающее значение для механики саркомера . [16]
Функция
Обскурин принадлежит к семейству гигантских саркомерных сигнальных белков, которое включает титин и небулин , и может играть роль в организации миофибрилл во время сборки и может опосредовать взаимодействия между саркоплазматическим ретикулумом и миофибриллами . Обскурин является основным цитоплазматическим лигандом для малого анкирина 1 (sANK1), саркоплазматического ретикулярного белка, и функция каркаса обскурина, по-видимому, предотвращает деградацию sANK1 . [17] Эти данные указывают на то, что обскурин служит сигнальным звеном между саркомерными и саркоплазматическими ретикулярными доменами, [18] [19] Обскурин играет роль в формировании новых саркомеров во время сборки миофибрилл . [20] в частности, на саркомерной периферии, где находятся участки инициации и прогрессирования миофибрилогенеза. [21] [22] Обскурин, по-видимому, необходим для правильного включения миозиновых нитей в саркомеры и в сборку А-полос . [15] [23] Более того, киназные домены обскурина являются ферментативно активными и, по-видимому, участвуют в регуляции клеточной адгезии. [24]
Клиническое значение
Было показано, что обскурин демонстрирует переключение изоформ, связанное с заболеванием, у пациентов с дилатационной кардиомиопатией . [25] У пациентов с гипертрофической кардиомиопатией была выявлена мутация обскурина Arg 4344 Gln , которая нарушила связывание обскурина с доменами Z9-Z10 тайтина . [26] Однако более позднее исследование не смогло воспроизвести этот эффект. [27] Из-за отсутствия механистических доказательств и высокой распространенности среди афроамериканцев вариант Arg4344Gln в настоящее время не считается патогенным. [28] [29] Мутации, обнаруженные в гене, кодирующем титин , у пациентов с конечностно-поясной мышечной дистрофией 2J или миопатией Салиха снижают способность титина связывать обскурин, что позволяет предположить, что это может быть причиной проявления заболевания. [30]
Взаимодействия
Было показано, что обскурин взаимодействует с титином , [5] [31] в частности, с Novex-3 титина , экзоном размером 6,5 кб , расположенным выше кардиоспецифического экзона N2B . [32] C-концевая область обскурина взаимодействует с цитоплазматическим доменом малого анкирина 1 [33] [34] и с экзоном 43' анкирина B. [35] Ig3 обскурина связывает миомезин в линкере между My4 и My5. [ 30]
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000154358 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000061462 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ ab Young P, Ehler E, Gautel M (июль 2001 г.). «Обскурин, гигантский саркомерный белок фактора обмена нуклеотидов Rho-гуанина, участвующий в сборке саркомера». Журнал клеточной биологии . 154 (1): 123–36. doi :10.1083/jcb.200102110. PMC 2196875. PMID 11448995 .
- ^ Russell MW, Raeker MO, Korytkowski KA, Sonneman KJ (январь 2002 г.). «Идентификация, тканевая экспрессия и хромосомная локализация человеческого Obscurin-MLCK, члена семейств титина и Dbl миозиновых легких цепей киназ». Gene . 282 (1–2): 237–46. doi :10.1016/S0378-1119(01)00795-8. PMID 11814696.
- ^ «Ген Энтреза: обскурин OBSCN, цитоскелетный кальмодулин и взаимодействующий с титином RhoGEF».
- ^ "Q5VST9".
- ^ "Q5VST9-6".
- ^ "Q5VST9-2".
- ^ "Q5VST9-3".
- ^ "Q5VST9-5".
- ^ abc Young P, Ehler E, Gautel M (июль 2001 г.). «Обскурин, гигантский саркомерный белок фактора обмена нуклеотидов Rho-гуанина, участвующий в сборке саркомера». Журнал клеточной биологии . 154 (1): 123–36. doi :10.1083/jcb.200102110. PMC 2196875. PMID 11448995 .
- ^ Фукудзава А., Идову С., Гаутел М. (2005). «Полная структура человеческого гена обскурина: значение для генерации изоформ путем дифференциального сплайсинга». Журнал исследований мышц и подвижности клеток . 26 (6–8): 427–34. doi :10.1007/s10974-005-9025-6. PMID 16625316. S2CID 20522555.
- ^ ab Carlsson L, Yu JG, Thornell LE (июль 2008 г.). «Новые аспекты обскурина в поперечно-полосатых мышцах человека». Histochemistry and Cell Biology . 130 (1): 91–103. doi :10.1007/s00418-008-0413-z. PMID 18350308. S2CID 35469988.
- ^ Pernigo S, Fukuzawa A, Bertz M, Holt M, Rief M, Steiner RA, Gautel M (февраль 2010 г.). «Структурное понимание сборки и механики M-полосы из комплекса титин-обскурин-подобный-1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (7): 2908–13. Bibcode : 2010PNAS..107.2908P. doi : 10.1073/pnas.0913736107 . PMC 2814874. PMID 20133654 .
- ^ Lange S, Perera S, Teh P, Chen J (июль 2012 г.). «Obscurin и KCTD6 регулируют оборот белка cullin-dependent small ankyrin-1 (sAnk1.5)». Молекулярная биология клетки . 23 (13): 2490–504. doi :10.1091/mbc.E12-01-0052. PMC 3386213. PMID 22573887 .
- ^ Bagnato P, Barone V, Giacomello E, Rossi D, Sorrentino V (январь 2003 г.). «Связывание изоформы анкирина-1 с обскурином предполагает молекулярную связь между саркоплазматическим ретикулумом и миофибриллами в поперечно-полосатых мышцах». Журнал клеточной биологии . 160 (2): 245–53. doi :10.1083/jcb.200208109. PMC 2172649. PMID 12527750 .
- ^ Kontrogianni-Konstantopoulos A, Jones EM, Van Rossum DB, Bloch RJ (март 2003 г.). «Обскурин — лиганд для малого анкирина 1 в скелетных мышцах». Молекулярная биология клетки . 14 (3): 1138–48. doi : 10.1091 /mbc.E02-07-0411. PMC 151585. PMID 12631729.
- ^ Борисов AB, Контроджанни-Константопулос A, Блох RJ, Вестфолл MV, Рассел MW (сентябрь 2004 г.). «Динамика локализации обскурина во время дифференциации и ремоделирования сердечных миоцитов: обскурин как интегратор миофибриллярной структуры». Журнал гистохимии и цитохимии . 52 (9): 1117–27. doi : 10.1369/jhc.3A6183.2004 . PMID 15314079.
- ^ Борисов AB, Рэкер MO, Контроджанни-Константопулос A, Янг K, Курнит DM, Блох RJ, Рассел MW (октябрь 2003 г.). «Быстрая реакция кластера генов сердечного обскурина на аортальный стеноз: дифференциальная активация Rho-GEF и MLCK и участие в гипертрофическом росте». Biochemical and Biophysical Research Communications . 310 (3): 910–8. doi :10.1016/j.bbrc.2003.09.035. PMID 14550291.
- ^ Борисов AB, Мартынова MG, Рассел MW (апрель 2008). «Раннее включение обскурина в зарождающиеся саркомеры: значение для сборки миофибрилл во время сердечного миогенеза». Гистохимия и клеточная биология . 129 (4): 463–78. doi :10.1007/s00418-008-0378-y. PMC 2761667. PMID 18219491 .
- ^ Борисов AB, Саттер SB, Контроджанни-Константопулос A, Блох RJ, Вестфолл MV, Рассел MW (март 2006). "Важная роль обскурина в сердечном миофибриллогенезе и гипертрофическом ответе: доказательства подавления генов, опосредованного малыми интерферирующими РНК" (PDF) . Гистохимия и клеточная биология . 125 (3): 227–38. doi :10.1007/s00418-005-0069-x. hdl : 2027.42/47398 . PMID 16205939. S2CID 13623244.
- ^ Hu LY, Kontrogianni-Konstantopoulos A (май 2013 г.). «Киназные домены обскурина взаимодействуют с белками межклеточной адгезии». FASEB Journal . 27 (5): 2001–12. doi : 10.1096/fj.12-221317 . PMC 3633816. PMID 23392350.
- ^ Makarenko I, Opitz CA, Leake MC, Neagoe C, Kulke M , Gwathmey JK и др. (октябрь 2004 г.). «Изменения пассивной жесткости, вызванные повышением регуляции соответствующих изоформ тайтина в человеческих сердцах с дилатационной кардиомиопатией». Circulation Research . 95 (7): 708–16. doi : 10.1161/01.RES.0000143901.37063.2f . PMID 15345656.
- ^ Аримура Т., Мацумото Ю., Окадзаки О., Хаяси Т., Такахаши М., Инагаки Н. и др. (октябрь 2007 г.). «Структурный анализ гена обскурина при гипертрофической кардиомиопатии». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 362 (2): 281–7. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.07.183. ПМИД 17716621.
- ^ Фукудзава А., Кох Д., Гровер С., Риз М., Гаутель М. (июнь 2021 г.). «Когда вариант обскурина является патогенным? Влияние вариантов Arg4344Gln и Arg4444Trp на белок-белковые взаимодействия и стабильность белка». Молекулярная генетика человека . 30 (12): 1131–1141. doi : 10.1093/hmg/ddab010. PMC 8188405. PMID 33438037.
- ^ Фукудзава А., Кох Д., Гровер С., Риз М., Гаутель М. (июнь 2021 г.). «Когда вариант обскурина является патогенным? Влияние вариантов Arg4344Gln и Arg4444Trp на белок-белковые взаимодействия и стабильность белка». Молекулярная генетика человека . 30 (12): 1131–1141. doi : 10.1093/hmg/ddab010. PMC 8188405. PMID 33438037.
- ^ Manrai AK, Funke BH, Rehm HL, Olesen MS, Maron BA, Szolovits P, et al. (Август 2016). «Генетические ошибочные диагнозы и потенциальные различия в состоянии здоровья». The New England Journal of Medicine . 375 (7): 655–65. doi :10.1056/NEJMsa1507092. PMC 5292722. PMID 27532831 .
- ^ аб Фукузава А., Ланге С., Холт М., Вихола А., Карминьяк В., Феррейро А. и др. (июнь 2008 г.). «Взаимодействие с тайтином и миомезином нацелено на обскурин и обскурин-подобный 1 в M-диапазоне: последствия для наследственных миопатий». Журнал клеточной науки . 121 (11): 1841–51. дои : 10.1242/jcs.028019 . ПМИД 18477606.
- ^ Pernigo S, Fukuzawa A, Pandini A, Holt M, Kleinjung J, Gautel M, Steiner RA (февраль 2015 г.). «Кристаллическая структура комплекса человеческого тайтина: обскурина выявляет консервативный, но специфический модуль молнии мышечной полосы М». Журнал молекулярной биологии . 427 (4): 718–36. doi : 10.1016/j.jmb.2014.11.019 . PMID 25490259.
- ^ Bang ML, Centner T, Fornoff F, Geach AJ, Gotthardt M, McNabb M, Witt CC, Labeit D, Gregorio CC, Granzier H, Labeit S (ноябрь 2001 г.). «Полная последовательность гена тайтина, экспрессия необычной изоформы тайтина массой около 700 кДа и ее взаимодействие с обскурином выявляют новую систему связывания Z-линии с I-полосой». Circulation Research . 89 (11): 1065–72. doi : 10.1161/hh2301.100981 . PMID 11717165.
- ^ Kontrogianni-Konstantopoulos A, Jones EM, Van Rossum DB, Bloch RJ (март 2003 г.). «Обскурин — лиганд для малого анкирина 1 в скелетных мышцах». Молекулярная биология клетки . 14 (3): 1138–48. doi : 10.1091 /mbc.E02-07-0411. PMC 151585. PMID 12631729.
- ^ Busby B, Oashi T, Willis CD, Ackermann MA, Kontrogianni-Konstantopoulos A, Mackerell AD, Bloch RJ (апрель 2011 г.). «Электростатические взаимодействия опосредуют связывание обскурина с малым анкирином 1: биохимические и молекулярные модельные исследования». Журнал молекулярной биологии . 408 (2): 321–34. doi :10.1016/j.jmb.2011.01.053. PMC 3367564. PMID 21333652 .
- ^ Cunha SR, Mohler PJ (ноябрь 2008 г.). «Обскурин нацеливает анкирин-B и протеинфосфатазу 2A на сердечную М-линию». Журнал биологической химии . 283 (46): 31968–80. doi : 10.1074/jbc.M806050200 . PMC 2581558. PMID 18782775 .
Дальнейшее чтение
- Nagase T, Kikuno R, Nakayama M, Hirosawa M, Ohara O (август 2000 г.). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». DNA Research . 7 (4): 273–81. doi : 10.1093/dnares/7.4.271 . PMID 10997877.
- Bang ML, Centner T, Fornoff F, Geach AJ, Gotthardt M, McNabb M, Witt CC, Labeit D, Gregorio CC, Granzier H, Labeit S (ноябрь 2001 г.). «Полная последовательность гена тайтина, экспрессия необычной изоформы тайтина массой около 700 кДа и ее взаимодействие с обскурином идентифицируют новую систему связывания Z-линии с I-полосой». Circulation Research . 89 (11): 1065–72. doi : 10.1161/hh2301.100981 . PMID 11717165.
- Bagnato P, Barone V, Giacomello E, Rossi D, Sorrentino V (январь 2003 г.). «Связывание изоформы анкирина-1 с обскурином предполагает молекулярную связь между саркоплазматическим ретикулумом и миофибриллами в поперечно-полосатых мышцах». The Journal of Cell Biology . 160 (2): 245–53. doi :10.1083/jcb.200208109. PMC 2172649 . PMID 12527750.
- Kontrogianni-Konstantopoulos A, Jones EM, Van Rossum DB, Bloch RJ (март 2003 г.). «Обскурин — лиганд для малого анкирина 1 в скелетных мышцах». Молекулярная биология клетки . 14 (3): 1138–48. doi : 10.1091 /mbc.E02-07-0411. PMC 151585. PMID 12631729.
- Контроджианни-Константопулос А., Катино Д.Х., Стронг Дж.К., Рэндалл В.Р., Блох Р.Дж. (июль 2004 г.). «Обскурин регулирует организацию миозина в полосы А». Американский журнал физиологии. Клеточная физиология . 287 (1): C209-17. doi : 10.1152/ajpcell.00497.2003. ПМИД 15013951.
- Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома проливает свет на сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку эмбриональных стволовых клеток человека». Nature Biotechnology . 22 (6): 707–16. doi :10.1038/nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
- Sutter SB, Raeker MO, Борисов AB, Russell MW (июль 2004 г.). "Ортологичные отношения обскурина и Unc-89: филогения нового семейства тандемных миозиновых легких цепей киназ" (PDF) . Development Genes and Evolution . 214 (7): 352–9. doi :10.1007/s00427-004-0413-5. hdl : 2027.42/47514 . PMID 15185077. S2CID 7676954.
- Борисов AB, Саттер SB, Контроджанни-Константопулос A, Блох RJ, Вестфолл MV, Рассел MW (март 2006 г.). "Важная роль обскурина в сердечном миофибриллогенезе и гипертрофическом ответе: доказательства подавления генов, опосредованного малыми интерферирующими РНК" (PDF) . Гистохимия и клеточная биология . 125 (3): 227–38. doi :10.1007/s00418-005-0069-x. hdl : 2027.42/47398 . PMID 16205939. S2CID 13623244.
- Кимура К, Вакамацу А, Сузуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секинэ М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р., Канда К., Ёкои Т., Кондо Х., Вагацума М., Муракава К., Исида С., Исибаши Т., Такахаси-Фудзи А., Танасе Т., Нагай К., Кикучи Х., Накаи К., Исогай Т., Сугано С. (январь 2006 г.). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 .
- Фукудзава А., Идову С., Гаутел М. (2007). «Полная структура человеческого гена обскурина: значение для генерации изоформ путем дифференциального сплайсинга». Журнал исследований мышц и подвижности клеток . 26 (6–8): 427–34. doi :10.1007/s10974-005-9025-6. PMID 16625316. S2CID 20522555.
- Price ND, Trent J, El-Naggar AK, Cogdell D, Taylor E, Hunt KK, Pollock RE, Hood L, Shmulevich I, Zhang W (февраль 2007 г.). «Высокоточный двухгенный классификатор для дифференциации гастроинтестинальных стромальных опухолей и лейомиосарком». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (9): 3414–9. Bibcode : 2007PNAS..104.3414P. doi : 10.1073/pnas.0611373104 . PMC 1805517. PMID 17360660.
- Боуман А.Л., Контроджианни-Константопулос А., Хирш С.С., Гейслер С.Б., Гонсалес-Серратос Х., Рассел М.В., Блох Р.Дж. (апрель 2007 г.). «Различные изоформы обскурина локализуются в разных участках саркомеров». Письма ФЭБС . 581 (8): 1549–54. doi :10.1016/j.febslet.2007.03.011. ЧВК 1899168 . ПМИД 17382936.
- Аримура Т., Мацумото Ю., Окадзаки О., Хаяси Т., Такахаши М., Инагаки Н., Хинохара К., Асидзава Н., Яно К., Кимура А. (октябрь 2007 г.). «Структурный анализ гена обскурина при гипертрофической кардиомиопатии». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 362 (2): 281–7. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.07.183. ПМИД 17716621.
- Borzok MA, Catino DH, Nicholson JD, Kontrogianni-Konstantopoulos A, Bloch RJ (ноябрь 2007 г.). «Картирование сайта связывания на малом анкирине 1 для обскурина». Журнал биологической химии . 282 (44): 32384–96. doi : 10.1074/jbc.M704089200 . PMID 17720975.