stringtranslate.com

WD40 повторить

Повтор WD40 (также известный как повтор WD или бета-трансдуцина ) представляет собой короткий структурный мотив , состоящий приблизительно из 40 аминокислот , часто заканчивающийся дипептидом триптофана - аспарагиновой кислоты (WD). [2] Тандемные копии этих повторов обычно складываются вместе, образуя тип кольцевого соленоидного домена белка, называемого доменом WD40 .

Структура

Белки, содержащие домен WD40, имеют от 4 до 16 повторяющихся единиц, все из которых, как полагают, образуют кольцевую структуру бета-пропеллера (см. рисунок справа). [3] [4] Домен WD40 состоит из нескольких повторов, вариабельной области из примерно 20 остатков в начале, за которой следует более распространенный повторяющийся набор остатков. Эти повторы обычно образуют четырехцепочечный антипараллельный бета-слой или лопасть. Эти лопасти объединяются, образуя пропеллер, причем наиболее распространенным является бета-пропеллер с 7 лопастями. Лопасти сцепляются таким образом, что последняя бета-нить одного повтора формируется с первыми тремя следующего повтора, образуя трехмерную структуру лопасти.

Функция

Белки с повторами WD40 представляют собой большое семейство, обнаруженное у всех эукариот , и участвуют в различных функциях, начиная от передачи сигнала и регуляции транскрипции до контроля клеточного цикла , аутофагии и апоптоза . [5] Основная общая функция всех белков с повторами WD40 заключается в координации многобелковых комплексных сборок, где повторяющиеся единицы служат жестким каркасом для взаимодействия белков. Специфичность белков определяется последовательностями вне самих повторов. Примерами таких комплексов являются белки G (бета-субъединица является бета-пропеллером), фактор транскрипции TAFII и убиквитинлигаза E3 . [3] [4]

Примеры

Согласно первоначальному анализу генома человека повторы WD40 являются восьмым по величине семейством белков. Всего было идентифицировано 277 белков, содержащих их. [6] Гены человека, кодирующие белки, содержащие этот домен, включают:

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ PDB : 1erj ​; Sprague ER, Redd MJ, Johnson AD, Wolberger C (июнь 2000 г.). «Структура C-концевого домена Tup1, корепрессора транскрипции у дрожжей». EMBO J . 19 (12): 3016–27. doi :10.1093/emboj/19.12.3016. PMC  203344 . PMID  10856245.
  2. ^ Neer EJ, Schmidt CJ, Nambudripad R, Smith TF (сентябрь 1994 г.). «Древнее семейство регуляторных белков WD-повторов». Nature . 371 (6495): 297–300. Bibcode :1994Natur.371..297N. doi :10.1038/371297a0. PMID  8090199. S2CID  600856.
  3. ^ ab Smith TF, Gaitatzes C, Saxena K, Neer EJ (май 1999). «Повтор WD40: общая архитектура для разнообразных функций». Trends Biochem. Sci . 24 (5): 181–5. doi : 10.1016/S0968-0004(99)01384-5 . PMID  10322433.
  4. ^ ab Li D, Roberts R (декабрь 2001 г.). «WD-повторяющиеся белки: структурные характеристики, биологическая функция и их участие в заболеваниях человека». Cell. Mol. Life Sci . 58 (14): 2085–97. doi :10.1007/PL00000838. PMC 11337334. PMID 11814058.  S2CID 20646422  . 
  5. ^ Stirnimann CU, Petsalaki E, Russell RB, Müller CW (май 2010 г.). «Белки WD40 способствуют развитию клеточных сетей». Trends Biochem. Sci . 35 (10): 565–74. doi :10.1016/j.tibs.2010.04.003. PMID  20451393.
  6. ^ Lander ES, Linton LM, Birren B, et al. (Февраль 2001). «Первоначальное секвенирование и анализ генома человека» (PDF) . Nature . 409 (6822): 860–921. doi : 10.1038/35057062 . PMID  11237011.

Внешние ссылки

В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR001680