Микробиолог и педагог, родился в 1953 г.
Роберто Колтер — профессор микробиологии , почетный профессор Гарвардской медицинской школы , автор и бывший президент Американского общества микробиологии . [1] [2] Колтер является профессором Гарвардской медицинской школы с 1983 года и был содиректором Гарвардской инициативы по микробиологическим наукам с 2003 по 2018 год. [3] За 35 лет работы лаборатории Колтера с 1983 по 2018 год более 130 аспирантов и постдокторантов исследовали эклектичную смесь тем, связанных с изучением микробов . [4] [5] Колтер является членом Американской ассоциации содействия развитию науки и Американской академии микробиологии . [6]
Будучи почетным профессором, Колтер продолжил свое участие в науке, рассказывая о микробиологии научной и широкой аудитории. [7] [8] С 2016 года Колтер был соблогером (совместно с Моселио Шехтером ) популярного блога по микробиологии Small Things Considered . [9] С 2014 по 2018 год Колтер и Скотт Чимилески разработали две выставки в Гарвардском музее естественной истории : «Мир в капле», открытую в 2017 году, и «Микробная жизнь» , открытую до 2020 года. [10] Параллельно Чимилески и Колтер написали книгу « Жизнь на краю зрения: фотографическое исследование микробного мира» ( Harvard University Press , 2017). [7] [11] [12] Во время интервью 2018 года в университете EAFIT в Колумбии Колтер объяснил, что он «находится в более созерцательной фазе своей карьеры», добавив, что ему нравится «немного больше упражняться в „Ph“ (философии) моей докторской степени». [8]
Ранняя жизнь, образование и академическая карьера
Колтер родился и вырос в Гватемале . [9] Он получил степень бакалавра наук по биологии в Университете Карнеги-Меллона в 1975 году и степень доктора биологии в Калифорнийском университете в Сан-Диего в 1979 году. [7] Затем он был научным сотрудником Хелен Хей Уитни в Стэнфордском университете вместе с Чарльзом Янофски с 1980 по 1983 год. [7] Колтер присоединился к факультету Гарвардской медицинской школы в качестве доцента в 1983 году, был повышен до доцента в 1989 году, профессора в 1994 году и стал почетным профессором после выхода на пенсию из руководства исследовательской лабораторией в 2018 году. [7]
Исследовать
Краткое содержание
Научно-исследовательская деятельность лаборатории Колтера в Гарвардской медицинской школе с 1983 по 2018 год охватывала несколько основных параллельных направлений исследований и охватывала множество взаимосвязанных подотраслей микробиологии. [5] [7] Главной темой лаборатории было использование генетических подходов для изучения физиологических процессов (и связанных с ними возникающих свойств ), которые бактерии развили в ответ на стрессовые условия окружающей среды, такие как голодание или ограниченные питательные вещества, или в результате экологических взаимодействий с другими живыми организмами. [7] [13] Эклектичный характер исследовательской программы Колтера также был результатом его политики поощрения ученых-постдокторантов к исследованию независимых интересов. [5] В интервью журналу Nature в 2015 году Колтер был процитирован относительно этого стиля наставничества: «Я позволяю постдокторантам исследовать то, что они хотят исследовать, до тех пор, пока это находится в сфере моих интересов». [5]
В общей сложности Колтер является соавтором более 250 исследовательских и других научных статей, которые в совокупности были процитированы более 50 000 раз. [7] [14] [15] Исследовательская группа Колтера оказала влияние на изучение бактериальных транспортных систем, известных как ABC-экспортеры , опубликовала некоторые из самых ранних примеров экспериментальной эволюции посредством исследований стационарной фазы роста бактерий , [7] [16] [17] [18] и была основоположницей генетических исследований бактерий, прикрепленных к поверхностям (живущих в сообществах, называемых биопленками ). [19] [20] Лаборатория популяризировала концепцию образования бактериальной биопленки как процесса развития или многоклеточных микробов, [21] [22] [23] и стала пионером в генетических исследованиях клеточной дифференциации , сигнализации, [24] и разделения труда у бактерий. [25] [26] [27] Кроме того , его группа работала над другими аспектами бактериальной физиологии, [28] одомашниванием лабораторных штаммов бактерий, [29] экологией микробиома, [30] [31] [32] [ 33] взаимодействием между растениями и бактериями, [34] [35] [36] процессами бактериального дыхания, [37] и открытием биоактивных соединений. [38] [39] [40] [41]
Некоторые из значительных научных вкладов Кольтера перечислены ниже в хронологическом порядке.
Основные темы расследования
Регуляция репликации ДНК
Будучи аспирантом, Колтер провел исследование, предоставив первые доказательства так называемой « гипотезы репликона », предложенной Якобом, Бреннером и Кузиным в 1962 году. [42] Его работа определила источник репликации ДНК, что привело к разработке множества векторов самоубийственного клонирования, которые используются и по сей день.
- Колтер, Р.; Хелински, Д.Р. (1978). «Конструирование производных плазмиды R6K in vitro: характеристика области репликации R6K». Plasmid . 1 (4): 571–80. doi :10.1016/0147-619X(78)90014-8. PMID 372982.
- Kolter, R; Inuzuka, M; Helinski, DR (декабрь 1978 г.). «Транскомплементационно-зависимая репликация фрагмента происхождения с низкой молекулярной массой из плазмиды R6K». Cell . 15 (4): 1199–208. doi :10.1016/0092-8674(78)90046-6. PMID 728998. S2CID 20082813.
- Kolter, R; Helinski, DR (1982). «Плазмидная репликация ДНК R6K. II. Прямые повторы нуклеотидной последовательности необходимы для активного гамма-происхождения». J Mol Biol . 161 (1): 45–56. doi :10.1016/0022-2836(82)90277-7. PMID 6296394.
Биосинтез пептидных антибиотиков и экспортеры ABC
Будучи новым преподавателем Гарвардской медицинской школы в 1980-х годах, исследовательская группа Колтера использовала Escherichia coli в качестве модельного организма для понимания молекулярной генетики биосинтеза антибиотиков . В ходе этой работы группа была одной из первых, кто охарактеризовал экспортеры ABC , которые сегодня известны как одна из важнейших систем мембранных белков, перемещающих молекулы через клеточную мембрану.
- Gilson, L; Mahanty, HK; Kolter, R (1990). «Генетический анализ экспортной системы, подобной MDR: секреция колицина V». EMBO J . 9 (12): 3875–84. doi :10.1002/j.1460-2075.1990.tb07606.x. PMC 552155 . PMID 2249654.
- Fath, MJ; Kolter, R (1993). «ABC-транспортеры: бактериальные экспортеры». Microbiol. Rev. 57 ( 4): 995–1017. doi :10.1128/mmbr.57.4.995-1017.1993. PMC 372944. PMID 8302219 .
- Yorgey, P; Lee, J; Kördel, J; Vivas, E; Warner, P; Jebaratnam, D; Kolter, R (1994). «Посттрансляционные модификации в микроцине B17 определяют дополнительный класс ингибиторов ДНК-гиразы». Proc Natl Acad Sci USA . 91 (10): 4519–23. Bibcode :1994PNAS...91.4519Y. doi : 10.1073/pnas.91.10.4519 . PMC 43817 . PMID 8183941.
Физиология и эволюция в стационарной фазе
В конце 1980-х годов исследовательская группа Колтера заинтересовалась бактериями, живущими в стационарной фазе цикла роста, состоянии, больше похожем на естественные условия, которые бактерии испытывают в среде за пределами лаборатории. [43] Группа обнаружила регуляторные системы, присущие исключительно клеткам в этом нерастущем состоянии, и обнаружила, что мутанты с большей приспособленностью в стационарной фазе эволюционировали и быстро захватывали культуры. [16] [17] [44] Статья Замбрано и др. 1993 года, в которой было опубликовано это открытие, была одним из самых ранних примеров эволюции, происходящей в лаборатории, или экспериментальной эволюции . [18]
- Альмирон, М; Линк, Эй Джей; Ферлонг, Д; Колтер (1992). «Эшерихия коли». Генс Дев . 6 (12Б): 2646–54. дои : 10.1101/gad.6.12b.2646 . PMID 1340475. S2CID 10308477.
- Siegele, D; Kolter, R (1992). "Жизнь после бревна". J Bacteriol . 174 (2): 345–348. doi :10.1128/jb.174.2.345-348.1992. PMC 205722. PMID 1729229 .
- Zambrano, MM; Siegele, DA; Almirón, M; Tormo, A; Kolter (1993). «Мутанты Escherichia coli, которые захватывают культуры стационарной фазы». Science . 259 (5102): 1757–60. Bibcode :1993Sci...259.1757M. doi :10.1126/science.7681219. PMID 7681219. S2CID 680360.
- Kolter, R; Siegele, DA; Tormo, A (1993). «Стационарная фаза жизненного цикла бактерий». Annu Rev Microbiol . 47 : 855–74. doi :10.1146/annurev.mi.47.100193.004231. PMID 8257118.
- Замбрано, ММ; Колтер, Р. (1996). «GASPing for life in fixed phase». Cell . 86 (2): 181–4. doi : 10.1016/s0092-8674(00)80089-6 . PMID 8706122. S2CID 13569021.
Бактериальные биопленки
В 1990-х годах группа Колтера начала фокусироваться на регуляции и генетических компонентах сообществ бактерий, связанных с поверхностью, называемых биопленками . До этого биопленки были обнаружены и изучались в контексте биообрастания и в инженерных решениях по предотвращению биообрастания, [45] [46] [47], но генетика образования биопленки была неизучена, и большинство микробиологов не рассматривали образование биопленки как физиологический процесс бактериальных клеток. [48] [49] [50] Лаборатория продолжила открывать основные регуляторные системы, лежащие в основе развития биопленки [51] [52] и охарактеризовала ключевые материалы во внеклеточном матриксе биопленок, используя такие модельные виды, как Pseudomonas aeruginosa , [53] [54] [55] Escherichia coli , [56] Vibrio cholerae , [57] [58] и Bacillus subtilis . [59] [60] [61] [62] Микробные биопленки с тех пор стали важной областью микробиологии, признанной преобладающим образом жизни микробов в природе, имеющей отношение к медицине и инфекциям, вызываемым патогенными бактериями . [63] [64]
- O'Toole, GA; Kolter, R (1998). «Инициация образования биопленки в Pseudomonas fluorescens WCS365 происходит через множественные конвергентные сигнальные пути: генетический анализ». Mol Microbiol . 28 (3): 449–61. doi :10.1046/j.1365-2958.1998.00797.x. PMID 9632250. S2CID 43897816.
- О'Тул, GA; Флагеллар, Колтер Р. (1998). " Развитие биопленки Pseudomonas aeruginosa ". Mol Microbiol . 30 (2): 295–304. doi :10.1046/j.1365-2958.1998.01062.x. PMID 9791175. S2CID 25140899.
- О'Тул, Г.; Каплан, Х.Б.; Колтер, Р. (2000). «Формирование биопленки как микробное развитие». Annu Rev Microbiol . 54 : 49–79. doi :10.1146/annurev.micro.54.1.49. PMID 11018124.
- Branda, SS; González-Pastor, JE; Ben-Yehuda, S; Losick, R; Kolter, R (2001). "Формирование плодовых тел Bacillus subtilis". Proc Natl Acad Sci USA . 98 (20): 11621–6. Bibcode : 2001PNAS...9811621B. doi : 10.1073/pnas.191384198 . PMC 58779. PMID 11572999 .
Микробные внутривидовые взаимодействия, клеточная дифференциация и разделение труда
Другая группа исследований возникла в результате работы над биопленками в группе Колтера в сотрудничестве с лабораторией Ричарда Лосика : открытие того, что субпопуляции различных функциональных типов клеток развиваются в одновидовых биопленках бактерии Bacillus subtilis . Было обнаружено, что некоторые клетки экспрессируют гены подвижности, другие — споруляции , каннибализма, продукции поверхностно-активного вещества или секреции внеклеточного матрикса . [26] Некоторые типы клеток были обнаружены локализованными в кластерах в разных физических местах и временных точках во время развития биопленки. [25] Другое исследование группы в 2015 году показало, что коллективное поведение, такое как групповая миграция по поверхности, может возникать из-за взаимодействия между несколькими типами клеток. [27]
- Вламакис, Х.; Агилар, К.; Лосик, Р.; Колтер, Р. (2008). «Контроль судьбы клетки путем формирования архитектурно сложного бактериального сообщества». Genes Dev . 22 (7): 945–53. doi :10.1101/gad.1645008. PMC 2279205. PMID 18381896 .
- Лопес, Д.; Вламакис, Х.; Лосик, Р.; Колтер, Р. (2009). «Паракринная сигнализация у бактерий». Genes Dev . 23 (14): 1631–1638. doi :10.1101/gad.1813709. PMC 2714712. PMID 19605685 .
- Лопес, Д.; Вламакис, Х.; Лосик, Р.; Колтер, Р. (2009). «Каннибализм усиливает развитие биопленки у Bacillus subtilis». Mol Microbiol . 74 (3): 609–618. doi :10.1111/j.1365-2958.2009.06882.x. PMC 2983100. PMID 19775247 .
- van Gestel, J; Vlamakis, H; Kolter; Collectives, Cell (2015). «Bacillus subtilis использует разделение труда для миграции». PLOS Biol . 13 (4): 4. doi : 10.1371/journal.pbio.1002141 . PMC 4403855. PMID 25894589.
- Лайонс, Северная Каролина; Крайгер, Б; Стефанич, П; Мандич-Мулек, я; Колтер (2016). «Бацилла Субтилис». Курр Биол . 26 (6): 733–42. дои :10.1016/j.cub.2016.01.032. ПМК 4803606 . ПМИД 26923784.
Микробные межвидовые взаимодействия
Большая часть последних работ Колтера была сосредоточена на взаимодействии между несколькими видами в смешанных сообществах, как они обычно существуют в естественных условиях. Эта работа привела к нескольким влиятельным исследованиям эмерджентных свойств и социального поведения микробов при взаимодействии с другими видами.
- Hogan, DA; Kolter, R (2002). " Взаимодействие Pseudomonas - Candida : экологическая роль факторов вирулентности". Science . 296 (5576): 2229–32. Bibcode :2002Sci...296.2229H. doi :10.1126/science.1070784. PMID 12077418. S2CID 23124129.
- Shank, EA; Klepac-Ceraj, V; Collado-Torres, L; Powers, GE; Losick, R; Kolter (2011). «Bacillus subtilis, формирующий биопленки, опосредован в основном представителями своего собственного рода». Proc Natl Acad Sci USA . 108 (48): E1236–43. doi : 10.1073/pnas.1103630108 . PMC 3228442 . PMID 22074846.
- Traxler, MF; Watrous, JD; Alexandrov, T; Dorrestein, PC; Kolter, R (2013). «Межвидовые взаимодействия стимулируют диверсификацию секретируемого метаболома Streptomyces coelicolor». mBio . 4 (4): 4. doi :10.1128/mbio.00459-13. PMC 3747584 . PMID 23963177.
- Segev E, Wyche TP, Kim KH, Petersen J, Ellebrandt C, Vlamakis H, Barteneva N, Paulson JN, Chai L, Clardy J, Kolter R. Динамический метаболический обмен управляет взаимодействием морских водорослей и бактерий. 2017. eLife.
- Lyons NA, Kolter R. Bacillus subtilis защищает общественные блага, распространяя родственную дискриминацию на близкородственные виды. mBio. 2017; 8 № 4e00723-17.
Распространение знаний о микробиологии среди общественности
Колтер является сторонником и участником коммуникации микробиологической науки с начинающими микробиологами и ненаучной аудиторией. [7] Его работа в этой области началась во время его пребывания на посту содиректора Гарвардской инициативы по микробиологическим наукам с 2003 по 2018 год. В этой роли Колтер организовал ежегодную публичную лекцию в Кембридже, штат Массачусетс, по темам, имеющим общее значение, таким как микробные продукты питания и напитки, такие как сыр, саке и вино. [65] Его работа в области научной коммуникации затем активизировалась в годы, предшествовавшие его выходу на пенсию, и теперь он является почетным профессором посредством приглашенных лекций, написания статей и музейных проектов. [8] [66]
Книги
- «Истории микробов» Артура Корнберга , 2007 (предоставленные фотографии) ISBN 1891389513
- «Марш микробов» Джона Ингрэма (автор предисловия) ISBN 0674064097
- Микробы и эволюция: мир, которого никогда не видел Дарвин , 2012, совместно с Стэнли Малоем, Американское общество микробиологии, ISBN 1891389513
- Жизнь на краю зрения: фотографическое исследование микробного мира , 2017, в соавторстве со Скоттом Чимилески, Издательство Гарвардского университета, ISBN 067497591X
Музейные выставки
С 2014 по 2018 год Колтер и Скотт Чимилески возглавляли две публичные выставки в Гарвардском музее естественной истории . [7] [11] «Мир в капле: фотографические исследования микробной жизни» — художественная выставка, на которой были представлены изображения, созданные в сотрудничестве Чимилески и Колтера, и которая была открыта с августа 2017 года по январь 2018 года. [67] Впоследствии «Микробная жизнь: Вселенная на краю зрения» открылась в феврале 2018 года как крупная специальная выставка, поддержанная Фондом Альфреда П. Слоана . Колтер и Чимилески являются приглашенными кураторами « Микробной жизни» , и выставка будет открыта до марта 2020 года. [10] Эти выставки путешествовали по всему миру в рамках проекта «Эдем» в Великобритании и университета EAFIT в Медельине, Колумбия , а также в других местах. [7] [8] [68] [69] [70]
Чимилески и Колтер также были консультантами и предоставили изображения для Invisible Worlds at the Eden Project , постоянной выставки, спонсируемой Welcome Trust . [71] Их неподвижные и покадровые изображения были представлены на выставке Bacterial World Exhibition в Музее естественной истории Оксфордского университета в 2018 году и на выставке World Unseen: Intersections of Art and Science в Музее CDC Дэвида Дж. Сенсера в Атланте, штат Джорджия, в 2019 году.
Преподавание и редактирование
У Колтера большой опыт преподавания в Гарвардском университете и на международных летних курсах. В Гарварде он преподавал динамику биопленки, а в настоящее время разрабатывает массовый открытый онлайн-курс с HarvardX по ферментации и микробным продуктам питания . [72] Он является постоянным преподавателем курса по микробному разнообразию в Морской биологической лаборатории в Вудс-Хоул, Массачусетс , летнего курса по микробиологии EMBO -FEBES в Спецесе, Греция , и летней школы Джона Иннеса/Руджера Бошковича по прикладной молекулярной микробиологии в Дубровнике, Хорватия . [7] В 2000 году он получил международную премию ASM Professorship Award. [7]
Колтер является редактором обложки журнала Journal of Bacteriology с 1999 года, а ранее входил в состав Совета рецензентов журналов Science , mBio и eLife . [7] [73]
Источники
- ^ "Президенты Общества (1899-настоящее время)". www.asm.org . Получено 24 июля 2017 г.
- ^ "Кафедра микробиологии и иммунобиологии | Преподавательский состав | Роберто Колтер, доктор философии." micro.med.harvard.edu . Получено 21 июля 2017 г.
- ^ "Неоткрытая планета". Harvard Magazine . 2007-11-01 . Получено 2017-07-22 .
- ^ "Kolter Lab | Раскрытие секретов микробного мира | Гарвардская медицинская школа". gasp.med.harvard.edu . Получено 21 июля 2017 г.
- ^ abcd Гулд, Джули (28.05.2015). "Поворотный момент: Роберто Колтер". Nature . 521 (7553): 553. doi : 10.1038/nj7553-553a . ISSN 0028-0836. S2CID 177055203.
- ^ "Члены AAAS избраны в качестве членов". AAAS - Крупнейшее в мире научное общество . 2011-01-11. Архивировано из оригинала 2018-09-13 . Получено 2017-07-21 .
- ^ abcdefghijklmno "Лаборатория Колтера | Роберто". gasp.med.harvard.edu . Получено 2019-07-30 .
- ^ abcd EAFIT, Университет. «Соло mitad humanos». www.eafit.edu.co (на европейском испанском языке) . Проверено 30 июля 2019 г.
- ^ ab "Объявление". Мелочи учтены . Получено 21.07.2017 .
- ^ ab "В Гарварде микробы на милю". Harvard Gazette . 2018-03-26 . Получено 2019-07-30 .
- ^ ab "Scott Chimileski Photography - Into the microbial world". www.scottchimileskiphotography.com . Получено 30 июля 2019 г. .
- ^ Шоу, Джонатан (2017-08-03). «Жизнь за пределами зрения». Harvard Magazine . Получено 2019-07-31 .
- ^ Ренни, Джон. «Прекрасный интеллект бактерий и других микробов». Журнал Quanta . Получено 31 июля 2019 г.
- ^ "Роберто Колтер - Google Scholar Citations". scholar.google.com . Получено 2019-07-31 .
- ^ pubmeddev. "Kolter R - PubMed - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 21 июля 2017 г.
- ^ ab Zambrano, MM; Siegele, DA; Almirón, M.; Tormo, A.; Kolter, R. (1993-03-19). "Микробная конкуренция: мутанты Escherichia coli, которые захватывают культуры стационарной фазы". Science . 259 (5102): 1757–1760. Bibcode :1993Sci...259.1757M. doi :10.1126/science.7681219. ISSN 0036-8075. PMID 7681219. S2CID 680360.
- ^ ab Kolter, Roberto; Finkel, Steven E. (1999-03-30). "Эволюция микробного разнообразия во время длительного голодания". Труды Национальной академии наук . 96 (7): 4023–4027. Bibcode : 1999PNAS...96.4023F. doi : 10.1073 /pnas.96.7.4023 . ISSN 0027-8424. PMC 22413. PMID 10097156.
- ^ ab Lenski, Richard E (октябрь 2017 г.). «Экспериментальная эволюция и динамика адаптации и эволюции генома в микробных популяциях». Журнал ISME . 11 (10): 2181–2194. Bibcode : 2017ISMEJ..11.2181L. doi : 10.1038/ismej.2017.69. ISSN 1751-7362. PMC 5607360. PMID 28509909 .
- ^ «Сигнализация и определение кворума». www.cs.montana.edu .
- ^ О'Тул, Джордж А.; Пратт, Лесли А.; Уотник, Паула И.; Ньюман, Дайан К.; Уивер, Валери Б.; Колтер, Роберто (1999-01-01). "[6] Генетические подходы к изучению биопленок". Биопленки . Методы в энзимологии. Т. 310. Academic Press. С. 91–109. doi :10.1016/S0076-6879(99)10008-9. ISBN 9780121822118. PMID 10547784.
- ^ Агилар, Клаудио; Вламакис, Гера; Лосик, Ричард; Колтер, Роберто (декабрь 2007 г.). «Размышления о Bacillus subtilis как о многоклеточном организме». Current Opinion in Microbiology . 10 (6): 638–643. doi :10.1016/j.mib.2007.09.006. ISSN 1369-5274. PMC 2174258. PMID 17977783 .
- ^ О'Тул, Г.; Каплан, Х.Б.; Колтер, Р. (2000). «Формирование биопленки как микробное развитие». Annual Review of Microbiology . 54 : 49–79. doi :10.1146/annurev.micro.54.1.49. ISSN 0066-4227. PMID 11018124.
- ^ Уотник, Паула; Колтер, Роберто (2000-05-15). «Биопленка, город микробов». Журнал бактериологии . 182 (10): 2675–2679. doi :10.1128/JB.182.10.2675-2679.2000. ISSN 0021-9193. PMC 101960. PMID 10781532 .
- ^ Ромеро, Диего; Тракслер, Мэтью Ф.; Лопес, Даниэль; Колтер, Роберто (14.09.2011). «Антибиотики как сигнальные молекулы». Chemical Reviews . 111 (9): 5492–5505. doi :10.1021/cr2000509. ISSN 1520-6890. PMC 3173521. PMID 21786783 .
- ^ ab Vlamakis, Hera; Aguilar, Claudio; Losick, Richard; Kolter, Roberto (2008-04-01). «Контроль судьбы клетки путем формирования архитектурно сложного бактериального сообщества». Genes & Development . 22 (7): 945–953. doi :10.1101/gad.1645008. ISSN 0890-9369. PMC 2279205. PMID 18381896 .
- ^ ab Лопес, Даниэль; Вламакис, Гера; Колтер, Роберто (январь 2009 г.). «Генерация множественных типов клеток в Bacillus subtilis». FEMS Microbiology Reviews . 33 (1): 152–163. doi : 10.1111/j.1574-6976.2008.00148.x . ISSN 0168-6445. PMID 19054118.
- ^ ab van Gestel, Jordi; Vlamakis, Hera; Kolter, Roberto (2015-04-20). «От клеточной дифференциации к клеточным коллективам: Bacillus subtilis использует разделение труда для миграции». PLOS Biology . 13 (4): e1002141. doi : 10.1371/journal.pbio.1002141 . ISSN 1544-9173. PMC 4403855. PMID 25894589 .
- ^ Финкель, С. Э.; Колтер, Р. (ноябрь 2001 г.). «ДНК как питательное вещество: новая роль гомологов генов бактериальной компетентности». Журнал бактериологии . 183 (21): 6288–6293. doi :10.1128/JB.183.21.6288-6293.2001. ISSN 0021-9193. PMC 100116. PMID 11591672 .
- ^ МакЛун, Анна Л.; Гуттенплан, Сара Б.; Кернс, Дэниел Б.; Колтер, Роберто; Лосик, Ричард (апрель 2011 г.). «Отслеживание одомашнивания бактерии, образующей биопленку». Журнал бактериологии . 193 (8): 2027–2034. doi :10.1128/JB.01542-10. ISSN 1098-5530. PMC 3133032. PMID 21278284 .
- ^ Лемон, Кэтрин П.; Клепач-Черай, Ваня; Шиффер, Хилари К.; Броди, Эоин Л.; Линч, Сьюзен В.; Колтер, Роберто (22 июня 2010 г.). «Сравнительный анализ бактериальной микробиоты ноздри и ротоглотки человека». мБио . 1 (3). дои : 10.1128/mBio.00129-10. ISSN 2150-7511. ПМК 2925076 . ПМИД 20802827.
- ^ Niu, Ben; Paulson, Joseph Nathaniel; Zheng, Xiaoqi; Kolter, Roberto (2017-03-21). «Упрощенное и репрезентативное бактериальное сообщество корней кукурузы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 114 (12): E2450–E2459. Bibcode : 2017PNAS..114E2450N. doi : 10.1073/pnas.1616148114 . ISSN 1091-6490. PMC 5373366. PMID 28275097 .
- ^ Петерсон, Селеста Н.; Дэй, Стефани; Вольф, Бенджамин Э.; Эллисон, Аарон М.; Колтер, Роберто; Прингл, Энн (сентябрь 2008 г.). «Ключевой хищник контролирует бактериальное разнообразие в микроэкосистеме кувшинчатого растения (Sarracenia purpurea)». Environmental Microbiology . 10 (9): 2257–2266. Bibcode : 2008EnvMi..10.2257P. doi : 10.1111/j.1462-2920.2008.01648.x. ISSN 1462-2920. PMID 18479443. S2CID 24215810.
- ^ Гонтанг, Эрин А.; Эйлуорд, Фрэнк О.; Карлос, Камила; Главина-дель-Рио, Тихана; Човация, манси; Ферн, Элисон; Ло, Чиен-Чи; Малфатти, Стефани А.; Тринге, Сюзанна Г. (18 мая 2017 г.). «Основные изменения в микробном разнообразии и составе сообщества в отделах кишечника молодого таракана Panchroma». ПЛОС ОДИН . 12 (5): e0177189. Бибкод : 2017PLoSO..1277189G. дои : 10.1371/journal.pone.0177189 . ISSN 1932-6203. ПМЦ 5436645 . ПМИД 28545131.
- ^ Чэнь, Юнь; Цао, Шугенг; Чай, Юньронг; Кларди, Джон; Колтер, Роберто; Го, Цзянь-хуа; Лосик, Ричард (август 2012 г.). «Сенсорная киназа Bacillus subtilis, участвующая в формировании биопленки на корнях томатных растений». Молекулярная микробиология . 85 (3): 418–430. doi :10.1111/j.1365-2958.2012.08109.x. ISSN 0950-382X. PMC 3518419. PMID 22716461 .
- ^ Эспиноза-Урхель, Мануэль; Колтер, Роберто; Рамос, Хуан-Луис (февраль 2002 г.). «Корневая колонизация Pseudomonas putida: любовь с первого взгляда». Микробиология . 148 (ч. 2): 341–343. doi : 10.1099/00221287-148-2-341 . ISSN 1350-0872. PMID 11832496. S2CID 42681037.
- ^ Шапиро, Лори Р.; Полсон, Джозеф Н.; Арнольд, Брайан Дж.; Скалли, Эрин Д.; Жахыбаева Ольга; Пирс, Наоми Э.; Роча, Хорхе; Клепач-Черай, Ваня; Холтон, Кристина (2 октября 2018 г.). «Интродуцированное сельскохозяйственное растение способствует диверсификации вирулентного бактериального возбудителя Erwinia tracheiphila». мБио . 9 (5). doi : 10.1128/mBio.01307-18. ISSN 2150-7511. ПМК 6168856 . ПМИД 30279283.
- ^ Newman, DK; Kolter, R. (2000-05-04). "Роль выделяемых хинонов во внеклеточном переносе электронов". Nature . 405 (6782): 94–97. Bibcode :2000Natur.405...94N. doi :10.1038/35011098. ISSN 0028-0836. PMID 10811225. S2CID 4432099.
- ^ "Лаборатория Колтера | Роберто Колтер". gasp.med.harvard.edu . Получено 22 июля 2017 г.
- ^ Kolter, Roberto; Clardy, Jon; Skaar, Eric P.; Koren, Sergey; Silva-Junior, Eduardo A.; Paludo, Camila R.; Horvath, Dennis J.; Ndousse-Fetter, Sula; Mevers, Emily (2018-10-02). «Амикомицин — это мощный и специфический антибиотик, обнаруженный с помощью целевого скрининга взаимодействия». Труды Национальной академии наук . 115 (40): 10124–10129. Bibcode : 2018PNAS..11510124P. doi : 10.1073/pnas.1807613115 . ISSN 0027-8424. PMC 6176635. PMID 30228116 .
- ^ Колтер, Роберто; ван Везель, Жиль П. (27 января 2016 г.). «Прощай, грубая сила в открытии антибиотиков?». Nature Microbiology . 1 (2): 15020. doi : 10.1038/nmicrobiol.2015.20. hdl : 1887/3191938 . ISSN 2058-5276. PMID 27571977. S2CID 35052005.
- ^ Сейедсайамдост, Мохаммад Р.; Трэкслер, Мэтью Ф.; Кларди, Джон; Колтер, Роберто (2012). «Старое встречает новое: использование межвидовых взаимодействий для обнаружения продукции вторичных метаболитов у актиномицетов». Биосинтез натуральных продуктов микроорганизмами и растениями, часть C. Методы в энзимологии. Том 517. стр. 89–109. doi :10.1016/B978-0-12-404634-4.00005-X. ISBN 9780124046344. ISSN 1557-7988. PMC 4004031. PMID 23084935 .
- ^ Jacob, François; Brenner, Sydney; Cuzin, François (1963-01-01). «О регуляции репликации ДНК у бактерий». Симпозиумы по количественной биологии в Колд-Спринг-Харбор . 28 : 329–348. doi :10.1101/SQB.1963.028.01.048. ISSN 0091-7451.
- ^ Коннелл, Н.; Хан, З.; Морено, Ф.; Колтер, Р. (сентябрь 1987 г.). «Промотор E. coli, индуцированный прекращением роста». Молекулярная микробиология . 1 (2): 195–201. doi :10.1111/j.1365-2958.1987.tb00512.x. ISSN 0950-382X. PMID 2835580. S2CID 41850797.
- ^ Zinser, ER; Kolter, R. (сентябрь 1999 г.). «Мутации, усиливающие катаболизм аминокислот, дают преимущество роста в стационарной фазе». Journal of Bacteriology . 181 (18): 5800–5807. doi :10.1128/jb.181.18.5800-5807.1999. ISSN 0021-9193. PMC 94102 . PMID 10482523.
- ^ Хенрици, Артур Т. (1933-03-01). «Исследования пресноводных бактерий I. Прямой микроскопический метод». Журнал бактериологии . 25 (3): 277–287. doi :10.1128/JB.25.3.277-287.1933. ISSN 0021-9193. PMC 533461. PMID 16559616 .
- ^ Zobell, Claude E. (1943). «Влияние твердых поверхностей на бактериальную активность1». Журнал бактериологии . 46 (1): 39–56. doi :10.1128/JB.46.1.39-56.1943. ISSN 0021-9193. PMC 373789. PMID 16560677 .
- ^ Geesey, GG; Richardson, WT; Yeomans, HG; Irvin, RT; Costerton, JW (декабрь 1977 г.). «Микроскопическое исследование природных популяций сидячих бактерий из альпийского ручья». Canadian Journal of Microbiology . 23 (12): 1733–1736. doi :10.1139/m77-249. ISSN 0008-4166. PMID 340020.
- ^ Колтер, Роберто (март 2010 г.). «Биопленки в лаборатории и природе: путешествие молекулярного генетика в микробную экологию». Международная микробиология . 13 (1): 1–7. doi :10.2436/20.1501.01.105. ISSN 1618-1905. PMID 20890834.
- ^ Колтер, Роберто (28.05.2007). «Биология микробных сообществ — интервью». Журнал визуализированных экспериментов (4): 205. doi :10.3791/205. ISSN 1940-087X. PMC 2556159. PMID 18979009 .
- ^ О'Тул, Джордж А. (2016-01-01). "Классический центр внимания: до того, как они стали биопленками". Журнал бактериологии . 198 (1): 5. doi :10.1128/JB.00593-15. ISSN 0021-9193. PMC 4686204. PMID 26668270 .
- ^ Кернс, Дэниел Б.; Чу, Фрэнсис; Брэнда, Стивен С.; Колтер, Роберто; Лосик, Ричард (февраль 2005 г.). «Главный регулятор формирования биопленки Bacillus subtilis». Молекулярная микробиология . 55 (3): 739–749. doi : 10.1111/j.1365-2958.2004.04440.x . ISSN 0950-382X. PMID 15661000. S2CID 34300602.
- ^ Брэнда, Стивен С.; Вик, Шилд; Фридман, Лиза; Колтер, Роберто (январь 2005 г.). «Биопленки: пересмотр матрицы». Тенденции в микробиологии . 13 (1): 20–26. doi :10.1016/j.tim.2004.11.006. ISSN 0966-842X. PMID 15639628.
- ^ O'Toole, GA; Kolter, R. (октябрь 1998 г.). «Жгутиковая и подергивающаяся подвижность необходимы для развития биопленки Pseudomonas aeruginosa». Молекулярная микробиология . 30 (2): 295–304. doi :10.1046/j.1365-2958.1998.01062.x. ISSN 0950-382X. PMID 9791175. S2CID 25140899.
- ^ Сакураги, Юмико; Колтер, Роберто (июль 2007 г.). «Регулирование кворум-чувствования генов матрикса биопленки (pel) Pseudomonas aeruginosa». Журнал бактериологии . 189 (14): 5383–5386. doi :10.1128/JB.00137-07. ISSN 0021-9193. PMC 1951888. PMID 17496081 .
- ^ Фридман, Лиза; Колтер, Роберто (2004). «Гены, участвующие в формировании матрицы в биопленках Pseudomonas aeruginosa PA14». Молекулярная микробиология . 51 (3): 675–690. doi :10.1046/j.1365-2958.2003.03877.x. ISSN 1365-2958. PMID 14731271. S2CID 20612916.
- ^ Pratt, LA; Kolter, R. (октябрь 1998 г.). «Генетический анализ образования биопленки Escherichia coli: роль жгутиков, подвижности, хемотаксиса и пилей I типа». Молекулярная микробиология . 30 (2): 285–293. doi :10.1046/j.1365-2958.1998.01061.x. ISSN 0950-382X. PMID 9791174. S2CID 26631504.
- ^ Watnick, PI; Kolter, R. (ноябрь 1999 г.). «Шаги в развитии биопленки Vibrio cholerae El Tor». Молекулярная микробиология . 34 (3): 586–595. doi :10.1046/j.1365-2958.1999.01624.x. ISSN 0950-382X. PMC 2860543. PMID 10564499 .
- ^ Watnick, PI; Fullner, KJ; Kolter, R. (июнь 1999 г.). «Роль чувствительного к маннозе гемагглютинина в образовании биопленки Vibrio cholerae El Tor». Journal of Bacteriology . 181 (11): 3606–3609. doi :10.1128/jb.181.11.3606-3609.1999. ISSN 0021-9193. PMC 93833 . PMID 10348878.
- ^ Бранда, Стивен С.; Гонсалес-Пастор, Хосе Эдуардо; Дервин, Этьен; Эрлих, С. Душко; Лосик, Ричард; Колтер, Роберто (июнь 2004 г.). «Гены, участвующие в формировании структурированных многоклеточных сообществ Bacillus subtilis». Журнал бактериологии . 186 (12): 3970–3979. doi :10.1128/JB.186.12.3970-3979.2004. ISSN 0021-9193. PMC 419949. PMID 15175311 .
- ^ Брэнда, Стивен С.; Чу, Фрэнсис; Кернс, Дэниел Б.; Лосик, Ричард; Колтер, Роберто (февраль 2006 г.). «Основной белковый компонент матрицы биопленки Bacillus subtilis». Молекулярная микробиология . 59 (4): 1229–1238. doi : 10.1111/j.1365-2958.2005.05020.x . ISSN 0950-382X. PMID 16430696. S2CID 3041295.
- ^ Ромеро, Диего; Агилар, Клаудио; Лосик, Ричард; Колтер, Роберто (2010-02-02). «Амилоидные волокна обеспечивают структурную целостность биопленок Bacillus subtilis». Труды Национальной академии наук . 107 (5): 2230–2234. Bibcode : 2010PNAS..107.2230R. doi : 10.1073/pnas.0910560107 . ISSN 0027-8424. PMC 2836674. PMID 20080671 .
- ↑ Science News, 22 декабря 2008 г.
- ^ Холл-Студли, Луанн; Костертон, Дж. Уильям; Студли, Пол (февраль 2004 г.). «Бактериальные биопленки: от естественной среды до инфекционных заболеваний». Nature Reviews. Микробиология . 2 (2): 95–108. doi :10.1038/nrmicro821. ISSN 1740-1526. PMID 15040259. S2CID 9107205.
- ^ Лопес, Даниэль; Вламакис, Гера; Колтер, Роберто (2010). «Биопленки». Cold Spring Harbor Perspectives in Biology . 2 (7): a000398. doi :10.1101/cshperspect.a000398. ISSN 1943-0264. PMC 2890205. PMID 20519345 .
- ^ «Оценка вина и микробов, которые его производят. Гарвардская инициатива по микробиологическим наукам» (PDF) .
- ^ Чимилески, Скотт; Котер, Роберто (21.12.2017). «Микробы дали нам жизнь». STAT . Получено 31.07.2019 .
- ^ «Ученые Гарварда превращают красоту микробов в музейный материал». Harvard Gazette . 2017-10-27 . Получено 2019-07-31 .
- ^ miloperrin (2018-11-03). "Мир в капле – Потрясающая выставка фотографий микробов |". Weekend Stuff . Получено 2019-07-30 .
- ^ EAFIT, Университет. «Увеличить фотографию микробов мира». www.eafit.edu.co (на европейском испанском языке) . Проверено 31 июля 2019 г.
- ^ «Загляните в Эдем на потрясающую новую микробную фотовыставку». Проект Эдем . 2018-11-02 . Получено 2019-07-31 .
- ^ "Невидимые миры: увеличиваем масштаб для более детального просмотра". Проект Эдем . 2018-11-05 . Получено 2019-07-31 .
- ^ «Людям нужны микробы для выживания — и приличный обед». Harvard Gazette . 2017-11-08 . Получено 2019-07-31 .
- ^ "Журнал бактериологии, редакционная коллегия". jb.asm.org . Получено 22 июля 2017 г.
Внешние ссылки
- Колтер, Роберто (8 октября 2021 г.). «История микробиологии — личная интерпретация». Annual Review of Microbiology . 75 (1): 1–17. doi : 10.1146/annurev-micro-033020-020648 . ISSN 0066-4227. PMID 33974804. S2CID 234471146.
- Наука имеет значение с Роберто Кольтером: очарованный невидимым миром, Гарвардская медицинская школа
- Вступительная лекция к выставке «Микробная жизнь» в 2018 году на канале YouTube Гарвардского музея истории
- Микробные джунгли повсюду (и вы), анимация TED-ED о биопленках
- Биопленка крупным планом, фотография, удостоенная премии FASEB Bioart Award в журнале The Scientist в 2016 году
- Поворотный момент: Роберто Колтер, интервью журналу Nature Jobs в 2015 году о взглядах на подготовку постдокторантов
- «О дивный новый мир: недавняя эволюция патогена, передаваемого насекомыми», семинар, проведенный доктором Колтером в 2017 году в Национальном институте здравоохранения США
- Зачем писать? Сообщение ваших результатов для дальнейшего научного знания, семинар по письму, проведенный в штаб-квартире ASM в 2010 году
- Биология микробных сообществ, интервью в 2007 году с JoVE
- «Неоткрытая планета», статья об инициативе по микробной науке в журнале Harvard Magazine в 2007 году
- Ссылка на все публикации Колтера на PubMed и Google Scholar