stringtranslate.com

Росс Д. Кинг

Росс Дональд Кингпрофессор машинного интеллекта [ 5] в Технологическом университете Чалмерса . [6]

Образование

Кинг получил степень бакалавра наук по микробиологии в Университете Абердина в 1983 году и продолжил обучение для получения степени магистра наук по компьютерным наукам в Университете Ньюкасла в 1985 году. После этого он получил докторскую степень в Институте Тьюринга при Университете Стратклайда в 1989 году [1] за работу по разработке методов машинного обучения для прогнозирования структуры белка . [7]

Исследовать

Научные интересы Кинга лежат в области автоматизации науки , разработки лекарств , искусственного интеллекта , машинного обучения и синтетической биологии . [8] [9] Он, вероятно, наиболее известен по проекту Robot Scientist [2] [10] [11] [12] [13] [14] [15] [16] [17], в рамках которого был создан робот, который может:

Робот-ученый может автономно выполнять высокопроизводительные исследования на основе гипотез. Помимо автоматизации экспериментов роботы-ученые хорошо подходят для записи научных знаний: поскольку эксперименты задумываются и выполняются автоматически компьютером, можно полностью фиксировать и в цифровом виде курировать все аспекты научного процесса. Робот-ученый — первая машина [14] [18] , которая продемонстрировала открытие новых научных знаний. Новый робот-ученый Ева [19] [20] [21] [22] [23] предназначен для автоматизации поиска лекарств. Ева автоматизирует высокопроизводительный скрининг , подтверждение попаданий и генерацию лидов с помощью обучения и тестирования QSAR . Ева применяется для поиска соединений-лидеров для лечения забытых тропических болезней .

Исследования Кинга финансировались EPSRC [ 24] и BBSRC . [18] Европейским союзом , HEFCW , Королевской инженерной академией и JISC . Он проработал в Университете Аберистуита 15 лет, а затем переехал в Манчестер в январе 2012 года. Он покинул Школу компьютерных наук в Университете Манчестера в 2019 году и перешел в Технологический университет Чалмерса.

По данным Google Scholar , его индекс Хирша составляет 54. [25]

Сотрудничества

В 2000 году Кинг стал основателем компании PharmaDM, [26] которая разрабатывала инструменты добычи данных для фармацевтической промышленности . Компания была основана в основном на исследованиях, применяющих добычу данных к биоинформатике и хемоинформатике . Другие научные основатели вышли из Оксфордского и Лёвенского университетов.

Кинг также разработал алгоритм для преобразования последовательностей ДНК , кодирующих белок, в музыку совместно с Колином Ангусом из The Shamen . [27] Песня S2-translation [28], основанная на этом, находится в Rough Guide to Rock [ 29] и вошла в альбом, который был продан тиражом более 100 000 копий.

Внешние ссылки

Ссылки

  1. ^ ab King, Ross (1989). Подход машинного обучения к проблеме предсказания вторичной структуры белка по его первичной структуре (PROMIS) (диссертация на соискание степени доктора философии). Университет Стратклайда.
  2. ^ ab King, Ross D.; Muggleton, Stephen H .; Srinivasan, A.; Sternberg, MJ (1996). «Структурно-активностные связи, полученные с помощью машинного обучения: использование атомов и их связей для прогнозирования мутагенности с помощью индуктивного логического программирования». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (1): 438–442. Bibcode : 1996PNAS...93..438K. doi : 10.1073 /pnas.93.1.438 . PMC 40253. PMID  8552655. 
  3. ^ Sparkes, A.; Aubrey, W.; Byrne, E.; Clare, A.; Khan, MN; Liakata, M.; Markham, M.; Rowland, J.; Soldatova, LN; Whelan, KE; Young, M.; King, RD (2010). «На пути к ученым-роботам для автономных научных открытий». Автоматизированное экспериментирование . 2 : 1. doi : 10.1186/1759-4499-2-1 . PMC 2813846. PMID  20119518 . 
  4. ^ Кинг, П.; Роуленд, Дж.; Обри, В.; Лиаката, М.; Маркхэм, М.; Солдатова, Л. Н.; Уилан, К. Э.; Клэр, А.; Янг, М.; Спаркс, А.; Оливер, С. Г.; Пир, П. (2009). «Робот-ученый Адам» . Компьютер . 42 (7): 46–54. doi :10.1109/MC.2009.270. S2CID  13920692.
  5. ^ "Росс Кинг". Чалмерс . 12 декабря 2017 г. Получено 6 ноября 2019 г.
  6. ^ Шринивасан, А.; Магглтон, Ш. Х .; Стернберг, М. Дж. Э .; Кинг, Р. Д. (1996). «Теории мутагенности: исследование индукции первого порядка и признаков». Искусственный интеллект . 85 (1–2): 277–299. doi : 10.1016/0004-3702(95)00122-0 .
  7. ^ King, RD; Sternberg, MJE (1990). «Подход машинного обучения к прогнозированию вторичной структуры белка». Журнал молекулярной биологии . 216 (2): 441–457. doi :10.1016/S0022-2836(05)80333-X. PMID  2254939.
  8. ^ King, RD; Sternberg, MJE (1996). «Идентификация и применение концепций, важных для точного и надежного предсказания вторичной структуры белка». Protein Science . 5 (11): 2298–2310. doi :10.1002/pro.5560051116. PMC 2143286 . PMID  8931148. 
  9. ^ King, RD; Muggleton, S .; Lewis, RA; Sternberg, MJ (1992). «Разработка лекарств с помощью машинного обучения: использование индуктивного логического программирования для моделирования взаимосвязей структуры и активности аналогов триметоприма, связывающихся с дигидрофолатредуктазой». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (23): 11322–11326. Bibcode : 1992PNAS ...8911322K. doi : 10.1073/pnas.89.23.11322 . PMC 50542. PMID  1454814. 
  10. ^ King, RD; Liakata, M.; Lu, C.; Oliver, SG; Soldatova, LN (2011). «О формализации и повторном использовании научных исследований». Journal of the Royal Society Interface . 8 (63): 1440–1448. doi :10.1098/rsif.2011.0029. PMC 3163424. PMID  21490004 . 
  11. ^ Андерсон, Филип В .; Абрахамс, Элиу (2009). «Машины не соответствуют революционной науке». Science . 324 (5934): 1515–1516. Bibcode : 2009Sci...324.1515A. doi : 10.1126/science.324_1515c. PMID  19541975.
  12. ^ Уолц, Дэвид ; Бьюкенен, Брюс Г. (2009). «Автоматизация науки: компьютеры с интеллектом могут разрабатывать и проводить эксперименты, но обучение на основе результатов для создания последующих экспериментов требует еще большего интеллекта». Science . 324 (5923): 43–44. doi :10.1126/science.1172781. PMID  19342574. S2CID  36543867.
  13. ^ Стивенсон, Р. В.; Мерфи, Дж. Ф.; Клэр, Т. Дж. (2009). «Изобретатели роботов: патентованно невозможны?». Science . 324 (5930): 1014. doi :10.1126/science.324_1014a. PMID  19460985.
  14. ^ ab King, RD; Rowland, J.; Oliver, SG ; Young, M.; Aubrey, W.; Byrne, E.; Liakata, M.; Markham, M.; Pir, P.; Soldatova, LN; Sparkes, A.; Whelan, KE; Clare, A. (2009). «Make Way for Robot Scientists» . Science . 325 (5943): 945. Bibcode :2009Sci...325R.945K. doi :10.1126/science.325_945a. PMID  19696334.
  15. ^ King, RD; Rowland, J.; Oliver, SG ; Young, M.; Aubrey, W.; Byrne, E.; Liakata, M.; Markham, M.; Pir, P.; Soldatova, LN; Sparkes, A.; Whelan, KE; Clare, A. (2009). «Автоматизация науки». Science . 324 (5923): 85–89. Bibcode :2009Sci...324...85K. doi :10.1126/science.1165620. PMID  19342587. S2CID  14948753.
  16. ^ King, RD; Whelan, KE; Jones, FM; Reiser, PGK; Bryant, CH; Muggleton, SH ; Kell, DB ; Oliver, SG (2004). «Генерация функциональных геномных гипотез и эксперименты с роботом-ученым» . Nature . 427 (6971): 247–252. Bibcode : 2004Natur.427..247K. doi : 10.1038/nature02236. PMID  14724639. S2CID  4428725.
  17. ^ Кинг, RD (2011). «Восход роботов-ученых». Scientific American . 304 (1): 72–76. Bibcode : 2011SciAm.304a..72K. doi : 10.1038/scientificamerican0111-72. PMID  21265330.
  18. ^ ab "2 апреля 2009 г. - Робот-ученый становится первой машиной, открывшей новые научные знания - Пресс-релиз - BBSRC". Архивировано из оригинала 14 мая 2013 г.
  19. ^ Уилсон, Н. (2004). «Технология: робот-ученый». Nature Reviews Genetics . 5 (3): 164. doi : 10.1038/nrg1300 . S2CID  5633301.
  20. ^ Билсленд, Элизабет; Спаркс, Эндрю; Уильямс, Кевин; Мосс, Гарри Дж.; де Клер, Микаэла; Пир, Пынар; Роуленд, Джем; Обри, Уэйн; Пейтман, Рон; Янг, Майк; Кэррингтон, Марк; Кинг, Росс Д.; Оливер, Стивен Г. (2013). «Автоматизированные высокопроизводительные скрининги на основе дрожжей для определения антипаразитарных свинцовых соединений». Open Biology . 3 (2). Королевское общество: 120158. doi :10.1098/rsob.120158. ISSN  2046-2441. PMC 3603448. PMID 23446112  . 
  21. ^ Уильямс, Кевин; Билсленд, Элизабет; Спаркс, Эндрю; Обри, Уэйн; Янг, Майкл; Солдатова, Лариса Н.; Де Граве, Курт; Рамон, Ян; де Клер, Микаэла; Сираварапорн, Ворахарт; Оливер, Стивен Г.; Кинг, Росс Д. (6 марта 2015 г.). «Более дешевая и быстрая разработка лекарств подтверждена перепозиционированием лекарств против забытых тропических болезней». Журнал интерфейса Королевского общества . 12 (104). Королевское общество: 20141289. doi :10.1098/rsif.2014.1289. ISSN  1742-5689. PMC 4345494. PMID  25652463 . 
  22. ^ Билсленд, Элизабет; ван Влит, Лииса; Уильямс, Кевин; Фелтхэм, Джек; Карраско, Марта П.; Фоторан, Уэсли Л.; Кубильос, Элиана Ф.Г.; Вундерлих, Герхард; Грётли, Мортен; Холлфельдер, Флориан; Джексон, Виктория; Кинг, Росс Д.; Оливер, Стивен Г. (18 января 2018 г.). "Дигидрофолатредуктаза плазмодия является второй мишенью фермента для противомалярийного действия триклозана". Scientific Reports . 8 (1). Springer Nature: 1038. Bibcode :2018NatSR...8.1038B. doi :10.1038/s41598-018-19549-x. ISSN  2045-2322. PMC 5773535 . PMID  29348637. 
  23. ^ Кутан, Энтони; Ропер, Кэтрин; Трехо-Баньос, Даниэль; Бутинон, Доминик; Карпентер, Мартин; Гжебита, Яцек; Сантини, Гийом; Солдано, Генри; Элати, Мохамед; Рамон, Ян; Рувейроль, Селин; Солдатова, Лариса Н.; Кинг, Росс Д. (16 августа 2019 г.). «Замкнутые циклы проектирования, выполнения и обучения эксперимента ускоряют разработку моделей системной биологии на дрожжах». Труды Национальной академии наук . 116 (36): 18142–18147. doi : 10.1073/pnas.1900548116 . ISSN  0027-8424. PMC 6731661. PMID  31420515 . 
  24. ^ «Гранты, предоставленные Россу Кингу Советом по исследованиям в области инженерии и физических наук (EPSRC)».
  25. ^ "Росс Д. Кинг". Google Scholar . Получено 30 апреля 2022 г.
  26. ^ "Pharmadm.com".
  27. ^ «Музыка моей структуры ДНК». Times Higher Education 2001-05-25 . 25 мая 2001 г.
  28. ^ "The Shamen - S2 Translation (S2 Protein)" на YouTube
  29. ^ Бакли, Питер Дж. (2003). The Rough Guide to Rock (Rough Guides) . Rough Guides Limited. ISBN 978-1-84353-105-0.