stringtranslate.com

Гаплогруппа R-M124

Гаплогруппа R2a , или гаплогруппа R-M124 , представляет собой гаплогруппу Y-хромосомы , характеризующуюся генетическими маркерами M124, P249, P267, L266, и в основном встречается в Южной Азии , а также в Центральной Азии , на Кавказе , в Юго-Западной Азии и арабских странах. с низкими частотами.

История термина

Гаплогруппа R2a также известна как гаплогруппа R-M124. [2] Первое упоминание о недавно определенной гаплогруппе «R-M124» было 25 августа 2010 года. [4]

До публикации Филогенетического древа Y-хромосомы 2005 года гаплогруппа R-M124 была известна как гаплогруппа P1 и ранее считалась сестринской кладой гаплогруппы R, а не производной от нее. [5]

Гаплогруппа R2 чаще всего наблюдается в Азии, особенно на Индийском субконтиненте и в Центральной Азии . [5] Об этом также сообщается с заметной частотой на Кавказе .

Происхождение

По данным Сенгупты и др. (2006),

неопределенность нейтрализует предыдущие выводы о том, что вторжение HG R1a1 и R2 [теперь R-M124] с северо-запада в дравидоязычные южные племена связано с одним недавним событием. Скорее, эти HG содержат значительную демографическую сложность, о чем свидетельствует их высокое разнообразие гаплотипов. В частности, они могли прибывать в южную Индию из региона происхождения на юго-западе Азии несколько раз, причем некоторые эпизоды происходили значительно раньше, чем другие.

Субклады

Парагруппа Р-М124*

Парагруппа — это термин, используемый в популяционной генетике для описания линий внутри гаплогруппы , которые не определяются какими-либо дополнительными уникальными маркерами . Обычно они обозначаются звездочкой ( * ) , расположенной после основной гаплогруппы.

Y-хромосомы, положительные по отношению к SNP M124, P249, P267 и L266 и отрицательные по отношению к SNP L295, L263 и L1069, относят к парагруппе R-M124*. На данный момент его находят в Ираке.

Гаплогруппа R-L295

Гаплогруппа R-L295 представляет собой гаплогруппу Y-хромосомы, характеризующуюся генетическим маркером L295. На данный момент он встречается в Южной Азии , Анатолии , на Аравийском полуострове , в Европе и Центральной Азии .

Гаплогруппа R-L263

Гаплогруппа R-L263 представляет собой гаплогруппу Y-хромосомы, характеризующуюся генетическим маркером L263. До сих пор он встречается в греческой Малой Азии и Армении . [6]

Гаплогруппа R-L1069

Гаплогруппа R-L1069 представляет собой гаплогруппу Y-хромосомы, характеризующуюся генетическим маркером L1069. Он до сих пор находится в Кувейте . [6]

Распределение

R-M124 чаще всего наблюдается в Азии, особенно на Индийском субконтиненте и в Центральной Азии [5]. О нем также сообщается с заметной частотой на Кавказе .

Исторический

Древние образцы гаплогруппы R2a наблюдались в останках людей из Ирана и Турана эпохи неолита, энеолита и бронзы ; и железный век Южной Азии . R2a также был обнаружен из раскопанных останков более позднего периода на южноазиатских стоянках Саиду Шариф и Буткара . [7]

Южная Азия

Гаплогруппа R-M124, наряду с гаплогруппами H , L , R1a1 и J2 , составляет большую часть мужского населения Южной Азии. Частота составляет около 10-15% в Индии и Шри-Ланке и 7-8% в Пакистане . Его распространение в Южной Азии очень обширно: от Белуджистана на западе до Бенгалии на востоке; от Хунзы на севере до Шри-Ланки на юге.

Индия

Среди региональных групп он встречается среди жителей Западной Бенгалии (23%), индуистов Нью-Дели (20%), пенджабцев (5%) и гуджаратцев (3%). [8] Среди племенных групп Кармалис из Западной Бенгалии показал самый высокий показатель - 100% (16/16) [9], за ним следовали Лодхи (43%) [10] на востоке, а Бхил из Гуджарата на западе - 18%. [11] Тарус на севере показал его на уровне 17%, [12] Ченчу и Паллан на юге имели 20% и 14% соответственно. [9] [13] Среди кастовых групп высокий процент показывают Джаунпурские кшатрии (87%), Камма Чаудхари (73%), Бихар Ядав (50%), Хандаят (46%) и Каллар (44%). [9]

Он также значительно высок во многих группах брахманов, включая пенджабских брахманов (25%), бенгальских браминов (22%), конканастха- брахманов (20%), чатурведи (32%), бхаргавов (32%), кашмирских пандитов (14%) и Лингаят -брахманы (30%). [11] [14] [12] [9]

Мусульмане Северной Индии встречаются с частотой 19% ( сунниты ) и 13% ( шииты ), [14] в то время как мусульмане Давуди Бора в западном штате Гуджарат имеют частоту 16%, а мусульмане Маппила из Южной Индии имеют частоту 5%. . [15]

Пакистан

Гаплогруппа R2 в северных регионах Пакистана встречается у народа бурушо (14%), пуштунов (10%) и хазарейцев (4%). [16] [13]

В южных регионах встречается среди белуджей (12%), брахуи (12%) и синдхов (5%). [13]

Афганистан

Гаплогруппа R2-M124 значительно чаще встречается в северных регионах Афганистана (11,4%). [17] Хотя истинный процент остается спорным, известно, что гаплогруппа находится на повышенном уровне среди населения Памира (число колеблется от 6-17% в зависимости от группы). Одно исследование Нуристанцев показывает частоту R2 20% (1/5), хотя и с небольшим размером выборки. [18]

Шри-Ланка

Согласно исследованию 2003 года, 38% сингальцев Шри -Ланки оказались положительными по R2. [8]

Центральная Азия

В казахских племенах он варьируется от 1% до 12%, однако среди племени Торе / потомков Чингисхана он встречается в более высоком проценте - около 25%. [19]

В Центральной Азии в Таджикистане гаплогруппа R-M124 составляет 6%, в то время как в других странах «-стана» этот показатель варьируется примерно в 2%. Бартангис в Таджикистане имеет высокую частоту R-M124 - около 17%, Ишкашими - 8%, Ходжант - 9% и Душанбе - 6%.

В частности, гаплогруппа R-M124 была обнаружена примерно у 7,5% (4/53) недавних иранских эмигрантов, проживающих в Самарканде , [20] 7,1% (7/99) памирцев , [20] 6,8% (3/44) Каракалпаки , [20] 5,1 % (4/78) таджиков , [20] 5% (2/40) дунган Киргизии , [20] 3,3% (1/30) туркмен , [20] 2,2% (8 /366) узбеков , [20] и 1,9% (1/54) казахов . [20]

Восточная Азия

Генетическое исследование 2011 года обнаружило R-M124 у 6,7% ханьцев из западной провинции Хэнань , у 3,4% ханьцев из Ганьсу и от 2,1% до 4,2% уйгуров из Синьцзяна . [21]

В статье 2014 года R-M124 был обнаружен в 0,9% (1/110) образцов ханьцев из Китая . Образец принадлежал жителю провинции Цзилинь . [22]

Западная Азия

Частота гаплогруппы R-M124 6,1% (6/114) была обнаружена среди курдов в целом [23], в то время как в одном исследовании, которое было проведено с 25 выборками курманджи-курдов из Грузии , R-M124 наблюдалась у 44% (11/ 25) [24]

На Кавказе высокая частота наблюдалась у армян Сасона - 17% (18/104) [25], тогда как у армян Вана она наблюдалась на уровне %1. R2 обнаружен у чеченцев в 16%. [26] R-M124 был обнаружен примерно у 8% (2/24) выборки осетин из Алагира . [27]

На Кавказе около 16% горских евреев , 8% балкарцев , [28] 6% калмыков , [29] 3% азербайджанцев , [26] 2,6% кумыков , [30] 2,4% аварцев , [30] ] 2% армян [26] и от 1% до 6% грузин [26] [28] [31] принадлежат к гаплогруппе R-M124 . К этой гаплогруппе также принадлежат примерно 1% турков [32] и от 1% до 3% иранцев [33] .

В Иране R-M124 имеет такое же распространение, что и R1a1 , с более высоким процентом на юго-востоке Ирана. Он был обнаружен с частотой 9,1% в Исфахане , 6,9% в Хормозгане и 4,2% в Мазендаране. [34]

Арабский мир

В проектах R2-M124-WTY и R-Arabia Y-DNA [6] [42] Гаплогруппа R-M124 появилась в следующих арабских странах : Кувейт (3 кластера), Объединенные Арабские Эмираты (1 кластер), Сирийская Арабская Республика. Республика (1 кластер) и Тунис (1 кластер).

Таким образом, гаплогруппа R-M124 наблюдалась среди арабов на низких частотах в 11 странах/территориях ( Египет , Иордания , Кувейт , Ливан , Палестина , Катар , Сирия , Тунис , Объединенные Арабские Эмираты и Йемен ) из 22 арабских стран /территорий . до сих пор. В Королевстве Саудовская Аравия на данный момент выявлена ​​​​одна семья, у которой гаплогруппа R2A (R-M124) отцовского генома или Y-хромосомы обновлена ​​5 января; 2018.

Позиция в дереве ISOGG и связанных с ним SNP.

Гаплогруппа R-M124 является подгруппой гаплогруппы R-M479 (M479):

Прогнозирование с помощью гаплотипов

Гаплотип можно использовать для предсказания гаплогруппы. Шансы на принадлежность любого человека к этой гаплогруппе самые высокие, если DYS391 =10, DYS392 =10 и DYS426 =12.

Смотрите также

Субклады Y-ДНК R-M207

Основополагающее дерево Y-ДНК

Примечания

  1. ^ ab YFull Haplogroup YTree v5.05, 30 июля 2017 г.
  2. ^ ab ISOGG (2010), «Гаплогруппа R Y-ДНК и ее субклады - 2010».
  3. ^ Проект филогенного дерева FTDNA, «Проект филогенного дерева FTDNA. Архивировано 10 июля 2011 г. в Wayback Machine ».
  4. ^ Майрес и др. (2010), «Эффект основателя основной гаплогруппы Y-хромосомы R1b голоцена в Центральной и Западной Европе - 2010».
  5. ^ abc Манукян, Жан-Грегуар (2006), «Синтез гаплогруппы R2 - 2006».
  6. ^ abc Проект R2-M124-WTY (Прогулка по Y), «Проект R2-M124-WTY (Прогулка по Y)».
  7. ^ Нарасимхан, Вагиш М.; Паттерсон, Ник.; Мурджани, Прия; Лазаридис, Иосиф; Марк, Липсон; Маллик, Свапан; Роланд, Надин; Бернардос, Ребекка; Ким, Александр М. (31 марта 2018 г.). «Геномное формирование Южной и Центральной Азии». bioRxiv : 292581. doi : 10.1101/292581 . hdl : 21.11116/0000-0001-E7B3-0 .
  8. ^ аб Кивисилд, Т .; и другие. (2003), «Генетическое наследие первых поселенцев сохраняется как в индийских племенных, так и в кастовых популяциях», Американский журнал генетики человека , 72 (2): 313–32, doi : 10.1086/346068, PMC 379225 , PMID  12536373 
  9. ^ abcd Саху, С.; и другие. (2006), «Предыстория индийских Y-хромосом: оценка сценариев демической диффузии», Proceedings of the National Academy of Sciences , 103 (4): 843–8, Bibcode : 2006PNAS..103..843S, doi : 10.1073/pnas .0507714103 , PMC 1347984 , PMID  16415161 
  10. ^ Кумар, Викрант; и другие. (2007). «Данные об Y-хромосоме предполагают общее отцовское наследие австро-азиатского населения». Эволюционная биология BMC . 7:47 . дои : 10.1186/1471-2148-7-47 . ПМЦ 1851701 . ПМИД  17389048. 
  11. ^ аб Шарма, Сваркар; и другие. (2009). «Индийское происхождение отцовской гаплогруппы R1a1* обосновывает автохтонное происхождение брахманов и кастовой системы». Журнал генетики человека . 54 (1): 47–55. дои : 10.1038/jhg.2008.2 . ПМИД  19158816.
  12. ^ аб Трипати, Викал; Нирмала, А.; Редди, Б. Мохан (2008), «Тенденции в молекулярных антропологических исследованиях в Индии» (PDF) , Международный журнал генетики человека , 8 (1–2): 1–20, doi : 10.1080/09723757.2008.11886015, S2CID  12763485
  13. ^ abc Сенгупта, Сангамитра; и другие. (2006). «Полярность и временность распределения Y-хромосомы с высоким разрешением в Индии определяют как местное, так и экзогенное распространение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Американский журнал генетики человека . 78 (2): 202–21. дои : 10.1086/499411. ПМЦ 1380230 . ПМИД  16400607. 
  14. ^ Аб Чжао, Чжунмин; и другие. (2009). «Наличие трех разных отцовских линий у жителей Северной Индии: исследование 560 Y-хромосом». Анналы биологии человека . 36 (1): 46–59. дои : 10.1080/03014460802558522. ПМЦ 2755252 . ПМИД  19058044. 
  15. ^ Иасвархант, Мутхукришнан; и другие. (2009). «Следы происхождения к югу от Сахары и Ближнего Востока в мусульманском населении Индии». Европейский журнал генетики человека . 18 (3): 354–63. дои : 10.1038/ejhg.2009.168. ПМЦ 2859343 . ПМИД  19809480. 
  16. ^ Фирасат, Садаф; и другие. (2006). «Y-хромосомные доказательства ограниченного вклада греков в патанское население Пакистана». Европейский журнал генетики человека . 15 (1): 121–6. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201726. ПМЦ 2588664 . ПМИД  17047675. 
  17. ↑ Лако, Харлетт (18 апреля 2012 г.). «Афганистан с точки зрения Y-хромосомы». Европейский журнал генетики человека . 20 (10): 1063–1070. дои : 10.1038/ejhg.2012.59. ПМК 3449065 . ПМИД  22510847. 
  18. ↑ Хабер, Марк (28 марта 2012 г.). «Этнические группы Афганистана разделяют Y-хромосомное наследие, структурированное историческими событиями». ПЛОС ОДИН . 7 (3): e34288. Бибкод : 2012PLoSO...734288H. дои : 10.1371/journal.pone.0034288 . ПМЦ 3314501 . ПМИД  22470552. 
  19. ^ Джабагин Максат Кизатович. ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ОБЩЕЙ ГЕНЕТИКИ им. Н.И. ВАВИЛОВА РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК (PDF) (PhD). Российская академия наук.
  20. ^ abcdefgh Уэллс, Р. Спенсер; Юлдашева, Надира; Рузибакиев Руслан; Андерхилл, Питер А.; Евсеева Ирина; Блю-Смит, Джейсон; Джин, Ли; Су, Бинг; Питчаппан, Рамасами; Шанмугалакшми, Садагопал; Балакришнан, Каруппиа; Читай, Марк; Пирсон, Натаниэль М.; Зержал, Татьяна; Вебстер, Мэтью Т.; Жолошвили, Ираклий; Джамарджашвили, Елена; Гамбаров, «Спартак»; Никбин, Бехруз; Достиев, Ашур; Акназаров, Огоназар; Заллуа, Пьер; Цой, Игорь; Китаев Михаил; Миррахимов, Мирсаид; Чариев, Ашир; Бодмер, Уолтер Ф. (28 августа 2001 г.). «Евразийский Хартленд: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы». Труды Национальной академии наук . 98 (18): 10244–10249. Бибкод : 2001PNAS...9810244W. дои : 10.1073/pnas.171305098 . ПМК 56946 . ПМИД  11526236. 
  21. ^ Чжун Х, Ши Х, Ци XB и др. (январь 2011 г.). «Расширенное исследование Y-хромосомы предполагает послеледниковую миграцию современных людей в Восточную Азию северным путем». Молекулярная биология и эволюция . 28 (1): 717–27. дои : 10.1093/molbev/msq247 . ПМИД  20837606.
  22. ^ Ян, Ши; Ван, Чуан-Чао; Чжэн, Хун-Сян; Ван, Вэй; Цинь, Чжэнь-Дун; Вэй, Лан-Хай; Ван, Йи; Пан, Сюэ-Донг; Фу, Вэнь-Цин; Он, Юн-Ганг; Сюн, Ли-Цзюнь; Цзинь, Вэнь-Фей; Ли, Ши-Лин; Ан, Ю; Ли, Хуэй; Джин, Ли; Су, Бинг (29 августа 2014 г.). «Y-хромосомы 40% китайцев происходят от трех неолитических супердедушек». ПЛОС ОДИН . 9 (8): e105691. arXiv : 1310.3897 . Бибкод : 2014PLoSO...9j5691Y. дои : 10.1371/journal.pone.0105691 . ПМЦ 4149484 . ПМИД  25170956. 
  23. ^ «Курдская генетика - ДНК курдов Курдистана (Ирак-Иран-Турция)» . www.khazaria.com . Проверено 20 декабря 2019 г.
  24. ^ "[1]".
  25. ^ "[2]".
  26. ^ abcd Насидзе I, Саркисян Т, Керимов А, Стоункинг М (март 2003 г.). «Проверка гипотезы замены языка на Кавказе: данные Y-хромосомы». Генетика человека . 112 (3): 255–61. дои : 10.1007/s00439-002-0874-4. PMID  12596050. S2CID  13232436.[3] Архивировано 10 ноября 2007 г. в Wayback Machine
    Manoukian (2006).
  27. ^ И. Насидзе, Д. Куинке, И. Дюпанлуп и др. , «Генетические данные о происхождении южных и северных осетин», Анналы генетики человека (2004) 68, 588–599.
  28. ^ аб Винченца Батталья, Симона Форнарино, Надя Аль-Захери и др. , «Y-хромосомные свидетельства культурного распространения сельского хозяйства в юго-восточной Европе», Европейский журнал генетики человека (2008), 1–11.
  29. ^ Иван Насидзе, Доминик Кинк, Изабель Дюпанлуп, Ришар Кордо, Людмила Кокшунова и Марк Стоункинг, «Генетические доказательства монгольского происхождения калмыков», Американский журнал физической антропологии 126: 000–000 (2005).
  30. ^ Аб Юнусбаев и др. (2006): 2/76 = 2,6% R-M124 кумыки, 1/42 = 2,4% R-M124 аварцы
  31. ^ Семино О, Пассарино Г, Офнер П.Дж., Лин А.А., Арбузова С., Бекман Л.Е., Де Бенедиктис Г., Франкалаччи П., Куваци А., Лимборска С., Марсикиа М., Мика А., Мика Б., Приморак Д., Сантакьяра-Бенерекетти А.С., Кавалли -Сфорца Л.Л., Андерхилл, Пенсильвания (ноябрь 2000 г.). «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: взгляд на Y-хромосому» (PDF) . Наука . 290 (5494): 1155–9. Бибкод : 2000Sci...290.1155S. дои : 10.1126/science.290.5494.1155. PMID  11073453. Архивировано из оригинала (PDF) 25 ноября 2003 г.
  32. ^ Чинниоглу и др. (2003), «Раскопки слоев гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии. Архивировано 19 июня 2006 г. в Wayback Machine ».
  33. ^ Регейро М., Каденас А.М., Гайден Т., Андерхилл П.А., Эррера Р.Дж. (2006). «Иран: трехконтинентальная связь для миграции, вызванной Y-хромосомой». Наследственность человека . 61 (3): 132–43. дои : 10.1159/000093774. PMID  16770078. S2CID  7017701.
  34. ^ "[4]".
  35. ^ Альшамали, Фарида; Перейра, Луиза; Будоул, Брюс; Полони, Эстелла С.; Куррат, Матиас (2009). «Структура местного населения на Аравийском полуострове, выявленная разнообразием Y-STR». Наследственность человека . 68 (1): 45–54. дои : 10.1159/000210448 . ISSN  0001-5652. PMID  19339785. S2CID  2751928.
  36. ^ аб Каденас, Алисия М.; Животовский Лев А.; Кавалли-Сфорца, Лука Л.; Андерхилл, Питер А.; Эррера, Рене Дж. (март 2008 г.). «Разнообразие Y-хромосом характеризует Оманский залив». Европейский журнал генетики человека . 16 (3): 374–386. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201934 . ISSN  1476-5438. PMID  17928816. S2CID  32386262.
  37. ^ Мохаммед, Т.; Сюэ, Ю.; Эвисон, М.; Тайлер-Смит, К. (ноябрь 2009 г.). «Генетическая структура кочевых бедуинов из Кувейта». Наследственность . 103 (5): 425–433. дои : 10.1038/hdy.2009.72. ISSN  1365-2540. ПМК 2869035 . ПМИД  19639002. 
  38. ^ Флорес, Карлос; Мака-Мейер, Николь; Ларруга, Хосе М.; Кабрера, Висенте М.; Карадшех, Наиф; Гонсалес, Ана М. (сентябрь 2005 г.). «Изоляты в коридоре миграций: анализ вариаций Y-хромосомы с высоким разрешением в Иордании». Журнал генетики человека . 50 (9): 435–441. дои : 10.1007/s10038-005-0274-4 . ISSN  1435-232Х. PMID  16142507. S2CID  6490283.
  39. ^ Заллуа, Пьер А.; Сюэ, Яли; Халифе, Джейд; Махул, Надин; Дебиан, Лабиб; Платт, Дэниел Э.; Ройюру, Аджай К.; Эррера, Рене Дж.; Эрнанц, Дэвид Ф. Сориа; Блю-Смит, Джейсон; Уэллс, Р. Спенсер; Комас, Дэвид; Бертранпети, Жауме; Тайлер-Смит, Крис (11 апреля 2008 г.). «Y-хромосомное разнообразие в Ливане структурировано недавними историческими событиями». Американский журнал генетики человека . 82 (4): 873–882. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.01.020. ISSN  0002-9297. ПМЦ 2427286 . ПМИД  18374297. 
  40. ^ Майрес и др. (2010), «Эффект основателя основной гаплогруппы Y-хромосомы R1b голоцена в Центральной и Западной Европе».
  41. ^ Луис и др. (2004), «Левант против Африканского Рога: доказательства двунаправленных коридоров миграции людей. Архивировано 16 февраля 2012 г. в Wayback Machine ».
  42. ^ Проект Y-ДНК Р-Аравии, «Проект Y-ДНК Р-Аравии».

Рекомендации

Внешние ссылки