Термин вирусный белок относится как к продуктам генома вируса , так и к любым белкам хозяина, включенным в вирусную частицу. Вирусные белки сгруппированы в соответствии с их функциями, и группы вирусных белков включают структурные белки , неструктурные белки , регуляторные белки и вспомогательные белки. [1] Вирусы неживые и не имеют средств для самостоятельного размножения, вместо этого они зависят от механизмов клетки-хозяина, которые делают это. Таким образом, вирусы не кодируют большинство белков, необходимых для их репликации и трансляции их мРНК в вирусные белки, а используют для этой цели белки, кодируемые клеткой-хозяином. [2]
Большинство вирусных структурных белков являются компонентами капсида и оболочки вируса.
Генетический материал вируса хранится в структуре вирусного белка, называемой капсидом. Капсид представляет собой «щит», который защищает нуклеиновые кислоты вируса от разрушения ферментами хозяина или другими типами пестицидов или эпидемий. Он также выполняет функцию прикрепления вириона к хозяину и позволяет вириону проникать через мембрану клетки-хозяина. Капсид состоит из множества копий одного вирусного белка или ряда различных вирусных белков, и каждый из этих вирусных белков кодируется одним геном вирусного генома . Структура капсида позволяет вирусу использовать небольшое количество вирусных генов для создания большого капсида. [3]
Несколько протомеров , олигомерных (вирусных) белковых субъединиц, объединяются, образуя капсомеры , а капсомеры объединяются, образуя капсид. [1] Капсомеры могут образовывать икосаэдрический , спиральный или сложный капсид, но у многих вирусов, таких как вирус простого герпеса, собирается икосаэдрический капсид. [2] Три асимметричные и неидентичные единицы вирусного белка составляют каждую из двадцати идентичных треугольных граней икосаэдрического капсида. [2]
Капсид некоторых вирусов заключен в мембрану, называемую вирусной оболочкой . В большинстве случаев вирусная оболочка образуется из капсида плазматической мембраны клетки-хозяина, когда вирус покидает клетку-хозяина посредством процесса, называемого почкованием. [4] Вирусная оболочка состоит из липидного бислоя , в который встроены вирусные белки, включая вирусные гликопротеины . [1] Эти вирусные гликопротеины связываются со специфическими рецепторами и корецепторами на мембране клеток-хозяев и позволяют вирусам прикрепляться к клеткам-мишеням. [1] Некоторые из этих гликопротеинов включают:
Вирусные гликопротеины играют решающую роль в слиянии вируса с клеткой. Слияние вируса с клеткой начинается, когда вирусные гликопротеины связываются с клеточными рецепторами. [5]
Для слияния вирусной оболочки с клеточной мембраной требуется высокая энергия. Белки, слитые с вирусной мембраной, действуют как катализаторы, преодолевая этот высокий энергетический барьер . [6] После связывания вирусного гликопротеина с клеточными рецепторами слитые с мембраной вируса белки претерпевают изменения в конформации структуры. [6] Это изменение конформации затем способствует дестабилизации и слиянию вирусной оболочки с клеточной мембраной, позволяя петлям слияния (FL) или гидрофобным слитым пептидам (FP) на вирусной оболочке взаимодействовать с клеточной мембраной. [6] Большинство слитых с мембраной вирусов белков после слияния оказываются в конформации, напоминающей шпильку, в которой FL/FP и трансмембранный домен находятся на одной стороне белка. [6]
Вирусные гликопротеины и их трехмерные структуры до и после слияния позволили обнаружить широкий спектр структурных конформаций. [6] Белки, слитые с вирусными мембранами, были сгруппированы в четыре различных класса, и каждый класс идентифицируется по характерным структурным конформациям:
Вирусные неструктурные белки — это белки, кодируемые геномом вируса и экспрессируемые в инфицированных клетках. [1] Однако эти белки не собираются в вирионе. [1] Во время репликации вирусов некоторые вирусные неструктурные белки выполняют важные функции, влияющие на сам процесс репликации. [1] Аналогичным образом, во время сборки вирусов некоторые из этих белков также выполняют важные функции, влияющие на процесс сборки. [1] Некоторые из этих функций вирусных неструктурных белков включают образование репликона, иммуномодуляцию и трансактивацию генов, кодирующих вирусные структурные белки. [1]
Вирусные неструктурные белки взаимодействуют с белками клетки-хозяина с образованием репликона, иначе известного как репликационный комплекс. [1] В вирусе гепатита С вирусные неструктурные белки взаимодействуют с транспортным белком мембраны клеточных везикул , hVAP-33, для сборки репликона. [1] Вирусный неструктурный белок 4b ( NS4B ) изменяет мембрану клетки-хозяина и запускает процесс формирования репликационного комплекса. [1] [7] Другие вирусные неструктурные белки, такие как NS5A , NS5B и NS3 , также рекрутируются в комплекс, а NS4B взаимодействует с ними и связывается с вирусной РНК . [1] [7]
Иммунный ответ хозяина на инфицированную клетку можно регулировать за счет иммуномодулирующих свойств вирусных неструктурных белков. [1] Многие виды крупных ДНК-вирусов кодируют белки, которые подрывают иммунный ответ хозяина, обеспечивая пролиферацию вируса. [8] Такие белки обладают потенциалом в разработке новых биофармацевтических методов лечения воспалительных заболеваний у людей, поскольку доказано, что они разрушают воспалительные иммунные медиаторы. [9] Вирусный неструктурный белок NS1 вируса Западного Нила предотвращает активацию комплемента посредством его связывания с белком, контролирующим комплемент, фактором H. [1] В результате распознавание комплемента инфицированными клетками снижается, и инфицированные клетки остаются невредимыми для хозяина. иммунная система. [1] [10]
Вирусные регуляторные и вспомогательные белки выполняют множество функций. Эти вирусные белки контролируют и влияют на экспрессию вирусных генов в вирусном геноме, включая скорость транскрипции вирусных структурных генов. [1] Вирусные регуляторные и вспомогательные белки также влияют и регулируют клеточные функции клетки-хозяина, такие как регуляция генов и апоптоз. [1]
В ДНК-вирусах и ретровирусах вирусные регуляторные белки могут усиливать транскрипцию вирусных генов, аналогично эти белки также могут усиливать транскрипцию клеточных генов хозяина. [11]
Вирусные вспомогательные белки, также известные как вспомогательные белки, кодируются геномом ретровирусов. [12] Большинство вирусных вспомогательных белков выполняют свои функции только в определенных типах клеток. [12] Кроме того, они не оказывают большого влияния на репликацию вируса. [12] Однако в некоторых случаях поддержание репликации вирусов потребует помощи (и функционирования) вирусных вспомогательных белков. [12]
Синцитин представляет собой эндогенный белок ретровируса , который был захвачен в геноме млекопитающих, чтобы обеспечить слияние мембран в морфогенезе плаценты. [13]