stringtranslate.com

Гаплогруппа J-M172

В генетике человека гаплогруппа J-M172 или J2 [Филогенетика 1] представляет собой гаплогруппу Y-хромосомы , которая является субкладом (ветвью) гаплогруппы J-M304 . [Филогенетика 2] Гаплогруппа J-M172 распространена у современных популяций в Западной Азии , Центральной Азии , Южной Азии , Южной Европе , Северо-Западном Иране и Северной Африке . Считается, что J-M172 мог возникнуть между Кавказом , Анатолией и/или Западным Ираном . [9] [10]

Далее он делится на две взаимодополняющие клады: J-M410 и J-M12 (M12, M102, M221, M314).

Происхождение

Дата происхождения гаплогруппы J-M172 была оценена Батини и др. в 2015 году как от 19 000 до 24 000 лет назад (BP). [11] Самино и др. в 2004 году датировали происхождение родительской гаплогруппы J-P209 периодом от 18 900 до 44 500 лет назад. [12] Древний J-M410 , а именно субклад J-Y12379*, был найден в мезолитическом контексте в зубе из пещеры Котиас Клде в западной Грузии , датируемом 9.529-9.895 кал. БП. [13] Этот образец был отнесен к аутосомному компоненту Кавказских охотников-собирателей (CHG). [14] J-M410, точнее его субклад J-PF5008 , также был обнаружен в мезолитическом образце из пещер Хоту и Камарбанд, расположенных в провинции Мазандаран в Иране , датируемом 9 100–8 600 годами до нашей эры (приблизительно 11 000 лет назад). [15] Оба образца принадлежат триалетской культуре. Вполне вероятно, что люди J2 расселились по большей части Анатолии, Южного Кавказа и гор Загроса к концу Последнего оледенения 12 000 лет назад. [16]

Заллуа и Уэллс 2004 и аль-Захери 2003 утверждали, что обнаружили самую раннюю известную миграцию J2, распространившуюся, возможно, из Анатолии и Кавказа . [9] [10] [17] В 2001 году Небель и др. обнаружили, что «согласно Андерхиллу и др. (2000), Eu 9 (H58) эволюционировал из Eu 10 (H71) посредством трансверсии T→G в M172 ( выделено автором)», и что в сегодняшних популяциях Eu 9 (H71) постмутационная форма М172) наиболее сильна на Кавказе , в Малой Азии и Леванте , в то время как Eu 10 становится сильнее и заменяет частоту Eu 9 по мере продвижения на юг, на Аравийский полуостров , [18] так, что люди с Кавказа встретились с арабами вблизи и между Месопотамией (Шумер/Ассирия) и пустыней Негев , поскольку « арабизация » распространилась из Аравии на Плодородный полумесяц и Турцию.

Согласно исследованию Ди Джакомо, проведенному в 2004 году , гаплогруппа J-M172 распространилась в Южную Европу либо из Леванта , либо из Анатолии , вероятно, параллельно с развитием сельского хозяйства. [19] Что касается времени его распространения в Европе, Ди Джакомо указывает на события, произошедшие после неолита, в частности на демографический расцвет, связанный с возникновением древнегреческого мира. Семино и др. получил более старые оценки возраста для всего J2 (использовав метод Животовского, см. Ди Джакомо), постулируя его первоначальное распространение среди неолитических фермеров с Ближнего Востока. Однако его распространение по субкладам, демонстрирующее локализованные пики на Южных Балканах, в южной Италии, на севере/центральной Италии и на Кавказе, не соответствует единому сценарию «волны наступления», выдавая ряд все еще плохо изученных постнеолитических процессы, которые создали его нынешний образец. Семино в 2004 году предположил, что, как и Ди Джакомо, южные Балканы бронзового века были важным вектором распространения. [12]

Распределение

Гаплогруппа J-M172 встречается в основном на территории Плодородного полумесяца , Кавказа (Насидзе 2003), Анатолии , Италии , средиземноморского побережья и Иранского нагорья (Семино 2004). Y-ДНК: J2 (J-M172): Сирид/Нахрейнид Арабид(ы).

Самая высокая зарегистрированная частота J-M172 за всю историю составила 87,4% среди ингушей в Малгобеке (Балановский, 2011).

В частности, он встречается в Ираке (Аль-Захери 2003), Кувейте , [20] Сирии (Луис 2004), Ливане (Заллуа 2008l), Турции (Чинниоглу 2004), Грузии (Насидзе 2003), Азербайджане (Ди Джакомо 2004), Северный Кавказ (Насидзе 2004 г.), Армения (Уэллс 2001 г.), Иран (Насидзе 2004 г.), Израиль (Семино 2004 г.), Палестина (Семино 2004 г.), Кипр (Капелли 2005 г.), Греция (Мартинес 2007 г.), Албания (Семино 2000 г.), Италия (Капелли 2007), Испании (Ди Джакомо 2003), и чаще у иракцев 24% (Аль-Захери 2011), чеченцев 51,0%-58,0% (Балановский 2011), грузин 21% (Уэллс 2001)-72% (Уэллс 2001) ), ливанцы 30% (Семино 2004), осетины 24% (Насидзе 2004), балкарцы 24% (Батталья 2008), сирийцы 23% (Луис 2004), турки 13% (Чинниоглу 2004)-40% (Семино 2000), киприоты 12,9% (Эль-Сибай 2009)-37% (Капелли 2005), армяне 21% (Уэллс 2001)-24% (Насидзе 2004), черкесы 21,8% (Балановский 2011), иранцы 10% (Насидзе 2004)-25% ( Уэллс 2001), албанцы 16% (Батталья 2008) и (Семино 2000), итальянцы 9%-36% (Капелли 2007), евреи-сефарды 15% (Небель 2001)-29% (Семино 2004), мальтийцы 21% (Капелли 2005) ), палестинцы 17% (Семино 2004), саудовцы 14% (Абу-Амеро 2009), иорданцы 14%, оманцы 10-15% (Ди Джакомо 2004) и (Луис 2004) и мусульмане-шииты Северной Индии 18% (Иасвархант 2009) ).

Северная Африка

Гаплогруппа J2 с низкой частотой встречается в Северной Африке. с горячей точкой в ​​регионе Суса Фадлауи-Зид 2014 г., большинство образцов Суса имеют те же гаплотипы , что и гаплогруппа J-L271, которая была обнаружена в Мсакене .

Центральная Азия

J-M172 встречается с умеренной частотой среди жителей Центральной Азии, таких как уйгуры , узбеки , туркмены , таджики , казахи и ягнобцы . Согласно генетическому исследованию, проведенному Shou et al. в Северо-Западном Китае. (2010), заметная высокая частота J-M172 наблюдается, особенно у уйгуров 34% и узбеков 30,4% в Синьцзяне , Китай . Лю Шуху и др. (2018) обнаружили J2a1 (L26/Page55/PF5110/S57, L27/PF5111/S396) у 43,75% (28/64) и J2a2 (L581/S398) у 14,06% (9/64) выборки лоп-уйгуров из Деревня Карчуга уезда Юли (Лопнур), Синьцзян, J2a1b1 (M92, M260/Page14) в 25,64% (10/39) выборки керийских уйгуров из деревни Дарья Бойи уезда Ютянь (Керия), Синьцзян, и J2a1 (L26) /Page55/PF5110/S57, L27/PF5111/S396) в 3,95% (3/76) и J2a2 (L581/S398) в 3,95% (3/76) выборки долан-уйгуров из поселка Хорикол уезда Ават, Синьцзян . [21] Только этнические меньшинства крайнего северо-запада имели гаплогруппу J в Синьцзяне, Китай. У узбеков в выборке было 30,4% J2-M172, он также был у таджиков Синьцзяна и уйгуров. [22]

Гаплогруппа имеет древнее присутствие в Центральной Азии и, по-видимому, предшествовала распространению ислама (Шоу 2010). Кроме того, непосредственный предок J-M172, а именно J* (J-M304*, он же J-P209*, J-12f2.1*), встречается также у сибо , казахов , дунсянов и узбеков Северо-Западного Китая.

В 2015 году два древних образца, принадлежащих J-M172 или J-M410 (J2a), были найдены на двух разных археологических объектах на Алтае , восточная Россия : Кытманово и курган Сары-бель. Оба древних образца относятся к культурам железного века Алтая. Сары-бел J2/J2a датируется 50 г. до н.э., тогда как Кытмановский образец датируется 721-889 гг. н.э. Анализ генетических примесей этих образцов также предполагает, что эти люди были более тесно связаны с западноевразийцами , чем с другими алтайцами того же периода, хотя они также, по-видимому, связаны с современными тюркскими народами региона. [23] [24] [25]

Европа

В Европе частота гаплогруппы J-M172 падает по мере удаления на север от Средиземноморья . В Италии J-M172 встречается с региональной частотой от 9% до 36% (Capelli 2007). В Греции он встречается с региональной частотой от 10% до 48%. Согласно недавнему исследованию (Cinnioglu 2004), около 24% турецких мужчин имеют J-M172, а региональная частота варьируется от 13% до 40% (Semino 2000). В сочетании с J-M267 до половины населения Турции принадлежит к гаплогруппе J-P209 .

Было высказано предположение, что субклад гаплогруппы J-M410 был связан с населением на древнем Крите путем изучения отношений между анатолийским , критским и греческим населением из мест раннего неолита на Крите. Гаплогруппа J-M172 была связана с неолитической Грецией (ок. 8500–4300 гг. до н. э.) и, как сообщается, была обнаружена на современном Крите (3,1%) и материковой Греции ( Македония 7,0%, Фессалия 8,8%, Арголида 1,8%) (King 2008). .

Северный Кавказ

J-M172 встречается с очень высокой частотой у некоторых народов Кавказа : среди ингушей 87,4% (Балановский 2011), чеченцев 55,2% (Балановский 2011), грузин 21% -72 % (Wells 2001), азербайджанцев 24% ( Ди Джакомо 2004) - 48%, (Уэллс 2001) Абхазы 25%, (Насидзе 2004) Балкарцы 24% (Батталья 2008), осетины 24% (Насидзе 2004), армяне 21% (Уэллс 2001) -24% (Насидзе 2004) , адыгейцы 21,8% (Балановский 2011) и другие группы (Насидзе 2004 и Насидзе 2003).

Западная Азия

У евреев-сефардов около 15% (Небель 2001)-29% (Семино 2004) гаплогруппы J-M172, а у евреев-ашкенази - 15% (Шен 2004)-23% (Семино 2004). В раннем исследовании, в котором тестировались только четыре маркера STR (Malaspina 2001), сообщалось, что небольшая выборка итальянских Коэнов принадлежала к Сети 1.2, раннему обозначению всей клады, теперь известной как J-L26, определяемой делецией в DYS413. Однако большое количество всех евреев Коэнов в мире принадлежат к гаплогруппе J-M267 (см. модальный гаплотип Коэна ).

Было показано, что гаплогруппа J-M172 имеет более северное распространение на Ближнем Востоке, хотя она существует в значительных количествах в южных регионах Ближнего Востока, ее меньшее количество было обнаружено по сравнению с ее братской гаплогруппой J-M267. который имеет высокочастотное южное распространение. Считалось, что исходная популяция J-M172 произошла из Леванта/Сирии (Syrid-J-M172), и что ее появление среди современных популяций Европы, Центральной Азии и Южной Азии было признаком неолитических земледельцев. Однако, как уже говорилось, сейчас считается, что оно, скорее всего, распространялось волнообразно в результате постнеолитических процессов.

Южная Азия

Гаплогруппа J2 присутствовала в Южной Азии в основном как J2a-M410 и J2b-M102 со времен неолита (9500 лет назад). [28] [29] Было обнаружено, что J2-M172 значительно выше среди дравидийских каст (19%), чем среди индоарийских каст (11%). J2-M172 и J-M410 встречаются в 21% дравидийских средних каст, за ними следуют высшие касты (18,6%) и низшие касты (14%). [30] Среди кастовых групп самая высокая частота J2-M172 наблюдалась среди тамилов Веллаларов Южной Индии - 38,7%. [30] J2 также присутствует у индийских племен и имеет частоту 11% у австро-азиатских племен. Среди австро-азиатских племен преобладает J2 у племени Асур (77,5%), хотя и с размером выборки 40 человек [28] , и у Лодха (35%) Западной Бенгалии . [30] J2 также присутствует в южноиндийском горном племени Тода - 38,46%, хотя размер выборки составляет всего 26 человек, [31] в племени Анд Телангана - 35,19%, [32] в племени Нарикуравар - 57,9% [ 30 ] 28] и в племени Кол штата Уттар-Прадеш с частотой 33,34%. [33] Гаплогруппа J-P209 оказалась более распространенной среди индийских мусульман-шиитов , из которых 28,7% принадлежат к гаплогруппе J, с 13,7% в J-M410, 10,6% в J-M267 и 4,4% в J2b (Eaaswarkhoth 2009). .

В Пакистане самые высокие частоты J2-M172 наблюдались среди парсов - 38,89%, дравидоязычных брахуи - 28,18% и макранских белуджей - 24%. [34] Это также встречается на уровне 18,18% в Макрани-Сиддис и на 3% в Карнатака-Сиддис . [34] [35]

J2-M172 встречается с общей частотой 16,1% у жителей Шри-Ланки . [36] На Мальдивах 22% населения Мальдив оказались положительными по гаплогруппе J2. [37] Субклады M172, такие как M67 и M92, не были обнаружены ни в индийских, ни в пакистанских образцах, что также может указывать на частичное общее происхождение. [30]

J2-M172 наблюдался в 15,9% (20/164 J2a-M410, 6/164 J2b2-M241) Тару из Уттар -Прадеша , [38] 13,4% (19/202 J2a-M410, 8/202 J2b2-M241) Тхару из Непала , [39] [38] и 8,9% (4/45 J2a-M410) Тхару из Уттаракханда . [38]

Распределение субкладов

Гаплогруппа J-M172 подразделяется на две дополняющие друг друга подгаплогруппы: J-M410 , определяемая генетическим маркером M410 , и J-M12 , определяемая генетическим маркером M12 .

J-M172

J-M172 типичен для популяций Ближнего Востока , Южной Европы , Юго-Западной Азии и Кавказа , с умеренным распространением на большей части территории Центральной Азии , Южной Азии и Северной Африки . [40]

J-M410

J-M410* встречается в Грузии , Северной Осетии. [41]

J-M47

J-M47 встречается с низкой частотой в Грузии (Battaglia 2008), южном Иране (Regueiro 2006), Катаре (Cadenas 2008), Саудовской Аравии (Abu-Amero 2009), Сирии (Di Giacomo 2004), Тунисе (Arredi 2004), Турции . (Ди Джакомо, 2004 г. и Чинниоглу, 2004 г.), ОАЭ (Каденас, 2008 г.) и Центральная Азия / Сибирь (Андерхилл, 2000 г.).

J-M67

J-M67 (в старых статьях называемый J2f) имеет самые высокие частоты, связанные с нахскими народами . Встречается с очень высокой (большинством) частотой среди ингушей в Малгобеке (87,4%), чеченцев в Дагестане (58%), чеченцев в Чечне (56,8%) и чеченцев в Малгобеке, Ингушетия (50,9%) (Балановский 2011). На Кавказе он встречается со значительной частотой среди грузин (13,3%) (Семино 2004), железных осетин (11,3%), южнокавказских балкарцев (6,3%) (Семино 2004), дигорских осетин (5,5%), абхазов (6,9). %) и черкесская (5,6%) (Балановский 2011). Он также встречается с заметной частотой в Средиземноморье и на Ближнем Востоке, включая критян (10,2%), северо-центральных итальянцев (9,6%), южных итальянцев (4,2%; только 0,8% среди северных итальянцев), анатолийских турок (2,7- 5,4%), греки (4-4,3%), албанцы (3,6%), евреи-ашкенази (4,9%), сефарды (2,4%), каталонцы (3,9%), андалузцы (3,2%), калабрийцы (3,3%), албанцы Калабрийцы (8,9%) (см. Di Giacomo 2004 и Semino 2004).

J-M92/M260, субклад J-M67, наблюдался у 25,64% (10/39) выборки керийских уйгуров из деревни Дарья Бойи уезда Ютянь (Керия), Синьцзян. [21] Эта уйгурская деревня расположена в отдаленном оазисе в пустыне Такла-Макан .

J-M319

J-M319 встречается с низкой или умеренной частотой у критских греков (Martinez 2007 и King 2008), иракских евреев (Shen 2004) и марокканских евреев (Shen 2004).

J-M158

J-M158 (расположение под L24 неизвестно) J-M158 встречается с низкой частотой в Турции (Cinnioglu 2004), Южной Азии (Sengupta 2006 и Underhill 2000), Индокитае (Underhill 2000) и на Пиренейском полуострове .

Филогенетика

В филогенетике Y-хромосомы субклады являются ветвями гаплогрупп. Эти субклады также определяются однонуклеотидными полиморфизмами (SNP) или полиморфизмами уникальных событий (UEP).

Филогенетическая история

До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

Филогенетические деревья

Существует несколько подтвержденных и предложенных филогенетических деревьев гаплогруппы J-M172. Научно признанным является вариант Консорциума Y-хромосомы (YCC), опубликованный в Karafet 2008 и впоследствии обновленный. Черновик дерева, показывающего новые научные достижения, предоставлен Томасом Краном из Центра геномных исследований в Хьюстоне, штат Техас . Международное общество генетической генеалогии (ISOGG) также предоставляет любительское дерево. [Филогенетика 3] [42]

Черновик дерева Центра геномных исследований

Это Томас Кран из проекта предлагаемого дерева для гаплогруппы J-M172 Центра геномных исследований (Krahn & FTDNA 2013). Для краткости показаны только первые три уровня субкладов.

Дерево Консорциума Y-хромосомы

Это официальное научное дерево, созданное Консорциумом Y-хромосомы (YCC). Последнее крупное обновление было в 2008 году (Карафет, 2008). Последующие обновления были ежеквартальными и двухгодичными. Текущая версия является версией обновления 2010 года. [43]

Дерево ISOGG

Ниже представлены субклады гаплогруппы J-M172 с определяющей мутацией согласно дереву ISOGG (по состоянию на январь 2020 г.). Обратите внимание, что идентификаторы на основе спуска могут быть изменены по мере обнаружения новых SNP, которые дополняют и уточняют дерево. Для краткости показаны только первые три уровня субкладов.

Смотрите также

Генетика

Другие субклады J-ДНК

Основополагающее дерево Y-ДНК

Рекомендации

  1. ^ ab "YFull YTree v7.05.00". yfull.com . Архивировано из оригинала 18 июня 2019 г. Проверено 27 сентября 2019 г.
  2. ^ Степень дифференциации Hg J, наблюдаемая как с биаллельными, так и с микросателлитными маркерами, указывает на Ближний Восток как на его вероятную родину. В этой области J-M172 и J-M267 представлены в равной степени и демонстрируют наибольшую степень внутренней изменчивости, что указывает на то, что, скорее всего, эти субклады возникли также на Ближнем Востоке. (Ди Джакомо, 2004 г.)
  3. ^ Шоу, Вэй-Хуа; Цяо, Эн-Фа; Вэй, Чуан-Юй; Донг, Юн-Ли; Тан, Си-Цзе; Ши, Хун; Тан, Вэнь-Ру; Сяо, Чун-Цзе (2010). «Распределение Y-хромосомы среди популяций Северо-Западного Китая указывает на значительный вклад скотоводов Центральной Азии и меньшее влияние западных евразийцев». Журнал генетики человека . 55 (5): 314–322. дои : 10.1038/jhg.2010.30 . ПМИД  20414255.
  4. ^ Хабер М., Платт Д.Э., Ашрафиан Бонаб М., Юханна С.К., Сориа-Эрнанц Д.Ф., Мартинес-Круз Б. и др. (2012). «Этнические группы Афганистана имеют общее Y-хромосомное наследие, структурированное историческими событиями». ПЛОС ОДИН . 7 (3): e34288. Бибкод : 2012PLoSO...734288H. дои : 10.1371/journal.pone.0034288 . ПМЦ 3314501 . ПМИД  22470552. 
  5. ^ Капелли С., Рыжая Н., Романо В., Кали Ф., Лефранк Г., Делаг В. и др. (2006). «Структура населения в Средиземноморском бассейне: хромосомная перспектива AY». Анналы генетики человека . 70 (2): 207–225. дои : 10.1111/j.1529-8817.2005.00224.x . hdl : 2108/37090 . PMID  16626331. S2CID  25536759.
  6. ^ «Гаплогруппа Y J в Иране, автор Альфред А. Абурто-младший». Архивировано из оригинала 13 октября 2012 г. Проверено 6 апреля 2014 г.
  7. ^ abc "Трофимова Наталья Вадимовна, ИЗМЕНЧИВОСТЬ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК И Y-ХРОМОСОМЫ В ПОПУЛЯЦИЯХ ВОЛГО-УРАЛЬСКОГО РЕГИОНА, 03.02.07" (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 14 января 2015 г. Проверено 7 января 2015 г.
  8. ^ Опубликованное генетическое исследование особей калаша под руководством Фирасата (2007) выявило высокие и разнообразные частоты.
  9. ^ ab Zalloua & Wells: National Geographic Magazine, октябрь 2004 г. [1] Архивировано 7 апреля 2014 г. в Wayback Machine и [2] Архивировано 10 февраля 2012 г. в Wayback Machine .
  10. ^ ab «Н. Аль-Захери и др. «Полиморфизмы Y-хромосомы и мтДНК в Ираке, перекресток раннего расселения человека и постнеолитических миграций» (2003)» (PDF) . ДНК генеалогического древа. Архивировано из оригинала (PDF) 27 декабря 2010 года . Проверено 1 сентября 2013 г.
  11. ^ Батини С., Халласт П., Задик Д., Дельсер П.М., Бенаццо А., Гиротто С. и др. (май 2015 г.). «Крупномасштабное недавнее расширение европейских отцов, продемонстрированное изменением последовательности населения». Природные коммуникации . 6 : 7152. Бибкод : 2015NatCo...6.7152B. doi : 10.1038/ncomms8152. ПМЦ 4441248 . ПМИД  25988751. 
  12. ^ ab Семино О, Магри С, Бенуцци Г, Лин А.А., Аль-Захери Н, Батталья В и др. (май 2004 г.). «Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморье». Американский журнал генетики человека . 74 (5): 1023–34. дои : 10.1086/386295. ПМК 1181965 . ПМИД  15069642. 
  13. ^ "[Домашняя страница]" . YПолный . Архивировано из оригинала 23 апреля 2020 г. Проверено 11 мая 2020 г.
  14. ^ Джонс Э.Р., Гонсалес-Фортес Г., Коннелл С., Сиска В., Эрикссон А., Мартиниано Р. и др. (ноябрь 2015 г.). «Геномы верхнего палеолита раскрывают глубокие корни современных евразийцев». Природные коммуникации . 6 : 8912. Бибкод : 2015NatCo...6.8912J. doi : 10.1038/ncomms9912. ПМК 4660371 . ПМИД  26567969. 
  15. ^ Лазаридис, Иосиф; Надель, Дэни; Роллефсон, Гэри; Мерретт, Дебора К.; Роланд, Надин; Маллик, Свапан; Фернандес, Даниэль; Новак, Марио; Гамарра, Беатрис; Сирак, Кендра; Коннелл, Сара; Стюардсон, Кристин; Харни, Эдаоин; Фу, Цяомэй; Гонсалес-Фортес, Глория; Джонс, Эппи Р.; Руденберг, Сонгюль Алпаслан; Лендьель, Дьёрдь; Бокантен, Фанни; Гаспарян, Борис; Монж, Джанет М.; Грегг, Майкл; Эшед, Веред; Мизрахи, Ахува-Сиван; Мейкледжон, Кристофер; Герритсен, Фокке; Беженару, Луминица; Блюхер, Матиас; Кэмпбелл, Арчи; Каваллери, Джанпьеро; Комас, Дэвид; Фрогель, Филипп; Гилберт, Эдмунд; Керр, Шона М.; Ковач, Питер; Краузе, Йоханнес; МакГеттиган, Даррен; Мерриган, Майкл; Мерриуэзер, Д. Эндрю; О'Рейли, Симус; Ричардс, Мартин Б.; Семино, Орнелла; Шамун-Пур, Мишель; Стефанеску, Георге; Стамволл, Майкл; Тёньес, Анке; Торрони, Антонио; Уилсон, Джеймс Ф.; Йенго, Лоик; Оганесян, Нелли А.; Паттерсон, Ник; Пинхаси, Рон; Райх, Дэвид (август 2016 г.). «Геномное понимание происхождения земледелия на древнем Ближнем Востоке». Природа . 536 (7617): 419–424. Бибкод : 2016Natur.536..419L. дои : 10.1038/nature19310. ПМЦ 5003663 . ПМИД  27459054. 
  16. ^ «Распространение быка». Колыбель цивилизации . 15 июля 2018 г. Проверено 21 октября 2023 г.
  17. ^ Аль-Захери, Н. (2003). «Полиморфизмы Y-хромосомы и мтДНК в Ираке, перекресток раннего расселения человека и постнеолитических миграций». Молекулярная филогенетика и эволюция . 28 (3): 458–72. дои : 10.1016/s1055-7903(03)00039-3. ПМИД  12927131.
  18. ^ Небель А, Филон Д, Бринкманн Б, Маджумдер П.П., Фаерман М, Оппенгейм А (ноябрь 2001 г.). «Пул Y-хромосомы евреев как часть генетического ландшафта Ближнего Востока». Американский журнал генетики человека . 69 (5): 1095–1112. дои : 10.1086/324070. ПМЦ 1274378 . ПМИД  11573163.  См. особенно рисунок шесть. Semino 2000 — это источник, который также утверждает, что Eu 9 происходит от Eu 10 (Eu 10 — это другой субклад гаплогруппы J (мтДНК) ).
  19. ^ Ди Джакомо Ф., Лука Ф., Попа Л.О., Акар Н., Ананьу Н., Банико Дж. и др. (2004). «Y-хромосомная гаплогруппа J как признак постнеолитической колонизации Европы». Генетика человека . 115 (5): 357–71. дои : 10.1007/s00439-004-1168-9. PMID  15322918. S2CID  18482536.
  20. ^ Аль-Захери, Н.; Семино, О.; Бенуцци, Г.; Магри, К.; Пассарино, Г.; Торрони, А.; Сантакьяра-Бенерекетти, AS (1 сентября 2003 г.). «Полиморфизмы Y-хромосомы и мтДНК в Ираке, перекресток раннего расселения человека и постнеолитических миграций». Молекулярная филогенетика и эволюция . Специальный выпуск: доклады, представленные на симпозиуме по филогении млекопитающих во время ежегодного собрания Общества молекулярной биологии и эволюции 2002 г., Сорренто, Италия, 13–16 июня 2002 г. 28 (3): 458–472. дои : 10.1016/S1055-7903(03)00039-3. ISSN  1055-7903.
  21. ^ аб Лю Шуху; Низам Илихаму; Рабияму Баке; Абдукерам Бупатима; Долкун Матюсуп (2018). «Инъён и жунсету СНП дуй Синьцзян сан гэ гэли ренкун ичуан дуоян синь де яньцзю» 应用 Y 染色体 СНП 对新疆三个隔离人群遗传多样性的研究 [Исследование генетического разнообразия трёх изолированных популяций в Синьцзяне с использованием Y-SNP]. Rénleixué xuébào / Acta Anthropologica Sinica (на китайском языке). 37 (1): 146–156. doi : 10.16359/j.cnki.cn11-1963/q.2017.0067.
  22. ^ Шоу, Вэй-Хуа; Цяо, Внь-Фа; Вэй, Чуан-Юй; Донг, Юн-Ли; Тан, Си-Цзе; Ши, Хун; Тан, Вэнь-Ру; Сяо, Чун-Цзе (2010). «Распределение Y-хромосомы среди популяций Северо-Западного Китая указывает на значительный вклад скотоводов Центральной Азии и меньшее влияние западных евразийцев». Джей Хум Жене . 55 (5): 314–322. дои : 10.1038/jhg.2010.30 . PMID  20414255. S2CID  23002493.
  23. ^ Аллентофт; и другие. (2015). «Популяционная геномика Евразии бронзового века». Природа . 522 (7555): 167–172. Бибкод : 2015Natur.522..167A. дои : 10.1038/nature14507. PMID  26062507. S2CID  4399103. Архивировано из оригинала 04 февраля 2020 г. Проверено 21 января 2020 г.
  24. ^ C. Rоttensteiner, J2a2-PH3085, SK1403: Древний Алтай, современный уйгурский и турецкий язык. Архивировано 26 июня 2015 г. в Wayback Machine , Исследование гаплогрупп J2-M172.
  25. ^ Ф. Иммануэль, Коды для результатов Gedmatch, страница древней ДНК. Архивировано 5 сентября 2015 г. в Wayback Machine , F999962 для RISE504, образец Кытманово и F999965 для RISE602, образец Сары-Бел.
  26. ^ Аль-Захери и др., 2011, Дополнительный файл 3. Абсолютные частоты гаплогрупп и субгаплогрупп Y-хромосомы в 48 популяциях, включенных в PCA. Архивировано 6 ноября 2015 г. в Wayback Machine. Примечание. Только 37 из 154 образцов (24%) относятся к J2 в Ираке согласно списку Аль-Захери за 2011 г. 43,6% - это частота J2 среди всех иракцев J-гаплогруппы, а не у всех. гаплогруппы.
  27. ^ Абу-Амеро (2009), Разнообразие Y-хромосомы Саудовской Аравии и его связь с близлежащими регионами. Архивировано 3 апреля 2017 г. в Wayback Machine , Цитата: Самые распространенные гаплогруппы в Саудовской Аравии, J1-M267 (42%), J2. -М172 (14%), Е1-М2 (8%), R1-M17 (5%) и К2-М184 (5%) также хорошо представлены в других арабских популяциях (Таблица (Табл.1).1).
  28. ^ abc Сингх С., Сингх А., Раджкумар Р., Сампат Кумар К., Кадаркарай Сами С., Низамуддин С. и др. (январь 2016 г.). «Анализ влияния неолитической демической диффузии на индийский пул Y-хромосом через гаплогруппу J2-M172». Научные отчеты . 6 : 19157. Бибкод : 2016NatSR...619157S. дои : 10.1038/srep19157. ПМК 4709632 . ПМИД  26754573. 
  29. ^ Эррера, Рене Дж.; Гарсиа-Бертран, Ральф (2018). ДНК предков, происхождение человека и миграции. Академическая пресса. п. 250. ИСБН 978-0-12-804128-4.
  30. ^ abcd Сенгупта С., Животовский Л.А., Кинг Р., Мехди С.К., Эдмондс Калифорния, Чоу CE и др. (февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределения Y-хромосомы в Индии с высоким разрешением определяют как местное, так и экзогенное распространение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Американский журнал генетики человека . 78 (2): 202–21. дои : 10.1086/499411. ПМЦ 1380230 . ПМИД  16400607. 
  31. ^ Арункумар Г., Сориа-Эрнанц Д.Ф., Кавита В.Дж., Арун В.С., Шьяма А., Ашокан К.С. и др. (2012). «Дифференциация населения мужских линий Южной Индии коррелирует с расширением сельского хозяйства, предшествовавшим возникновению кастовой системы». ПЛОС ОДИН . 7 (11): е50269. Бибкод : 2012PLoSO...750269A. дои : 10.1371/journal.pone.0050269 . ПМК 3508930 . ПМИД  23209694. 
  32. ^ Тансим И., Тангарадж К., Чаубей Г., Сингх В.К., Бхаскар Л.В., Редди Б.М. и др. (август 2006 г.). «Генетическое сходство между низшими кастами и племенными группами Индии: вывод на основе Y-хромосомы и митохондриальной ДНК». БМК Генетика . 7:42 . дои : 10.1186/1471-2156-7-42 . ПМЦ 1569435 . ПМИД  16893451. 
  33. ^ Шарма С., Рай Э., Шарма П., Джена М., Сингх С., Дарвиши К. и др. (январь 2009 г.). «Индийское происхождение отцовской гаплогруппы R1a1* обосновывает автохтонное происхождение брахманов и кастовой системы». Журнал генетики человека . 54 (1): 47–55. дои : 10.1038/jhg.2008.2 . ПМИД  19158816.
  34. ^ Аб Камар Р., Аюб К., Мохьюддин А. и др. (май 2002 г.). «Вариант Y-хромосомной ДНК в Пакистане». Являюсь. Дж. Хум. Жене . 70 (5): 1107–24. дои : 10.1086/339929. ПМЦ 447589 . ПМИД  11898125. 
  35. ^ Шах А.М., Таманг Р., Мурджани П., Рани Д.С., Говиндарадж П., Кулкарни Г., Бхаттачарья Т., Мустак М.С., Бхаскар Л.В., Редди А.Г., Гадхви Д., Гай П.Б., Чаубей Г., Паттерсон Н., Райх Д., Тайлер-Смит С. , Сингх Л., Тангарадж К. (2011). «Индийские Сидди: африканские потомки с индийской примесью». Являюсь. Дж. Хум. Жене . 89 (1): 154–61. дои : 10.1016/j.ajhg.2011.05.030. ПМК 3135801 . ПМИД  21741027. 
  36. ^ Тоомас Кивисилд; Сиири Роотси; Мейт Метспалу; Эне Мецпалу; Юри Парик; Катрин Калдма; Эсиен Усанга; Сарабджит Мастана; Суриндер С. Папиха; Ричард Виллемс (2002). «Генетика языка и распространения сельского хозяйства в Индии» (PDF) . В Питере Беллвуде; Колин Ренфрю (ред.). Исследование гипотезы расселения сельского хозяйства/языка. Монографии Института Макдональда. Институт археологических исследований Макдональда. ISBN 9781902937205.
  37. ^ «Происхождение жителей Мальдивских островов в свете популяционной генетики: Мальдивское происхождение в свете генетики» . 24 мая 2013. Архивировано из оригинала 29 октября 2013 года . Проверено 6 августа 2016 г.
  38. ^ abc Гьянешвер Чаубей, Манвендра Сингх, Федерика Кривелларо и др. , «Раскрытие различных линий происхождения Тару». Европейский журнал генетики человека (2014), 1–9. doi:10.1038/ejhg.2014.36
  39. ^ Симона Форнарино, Мария Пала, Винченца Батталья и др. , «Митохондриальное и Y-хромосомное разнообразие народа Тарус (Непал): резервуар генетических вариаций». Эволюционная биология BMC 2009, 9:154. дои: 10.1186/1471-2148-9-154
  40. ^ Сингх, Сакши; Сингх, Ашиш; Раджкумар, Раджа; Сампат Кумар, Катакам; Кадаркарай Сами, Суббурадж; Низамуддин, шейх; Сингх, Амита; Ахмед Шейх, Шахнаваз; Педдада, Видья; Ханна, Вини; Вирайя, Пандичелвам; Пандит, Аридаман; Чаубей, Гьянешвер; Сингх, Лалджи; Тангарадж, Кумарасами (12 января 2016 г.). «Анализ влияния неолитической демической диффузии на индийский пул Y-хромосом через гаплогруппу J2-M172». Научные отчеты . 6 (1): 19157. doi : 10.1038/srep19157 . ISSN  2045-2322. ПМК 4709632 . 
  41. ^ «Осетинский проект ДНК - Классическая диаграмма Y-ДНК» . семьятридна.
  42. ^ «Гаплогруппа J2 (Y-ДНК)» . Генетический атлас . Архивировано из оригинала 24 сентября 2010 г. Проверено 27 декабря 2010 г.
  43. ^ "Гаплодерево Y-ДНК" . Архивировано из оригинала 27 января 2013 г. Проверено 5 января 2013 г. ДНК генеалогического древа использует дерево Консорциума Y-хромосомы и публикует его на своем веб-сайте.

Источники таблиц преобразования

Примечания

  1. ^ Ренфрю AC (1998). Археология и язык: загадка индоевропейского происхождения (изд. Пимлико). Лондон: Пимлико. ISBN 978-0-7126-6612-1.
  2. ^ Небель А, Филон Д, Бринкманн Б, Маджумдер П.П., Фаерман М, Оппенгейм А (2001). «Пул Y-хромосомы евреев как часть генетического ландшафта Ближнего Востока». Являюсь. Дж. Хум. Жене . 69 (5): 1095–112. дои : 10.1086/324070. ПМЦ 1274378 . ПМИД  11573163. 
  3. ^ Маласпина П., Цопаномихалу М., Думан Т., Стефан М., Сильвестри А., Ринальди Б. и др. (2001). «Многоэтапный процесс распространения Y-хромосомной линии в Средиземноморье» (PDF) . Анна. Хм. Жене . 65 (Часть 4): 339–49. дои : 10.1046/j.1469-1809.2001.6540339.x . hdl : 2108/44448. PMID  11592923. S2CID  221448190.

Библиография

Внешние ссылки

Филогенетические заметки

  1. ^ В этой таблице показаны исторические названия J-M172 в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 является субкладом 23 .
  2. ^ В этой таблице показаны исторические названия J-P209 (AKA J-12f2.1 или J-M304) в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 является субкладом 23 .
  3. ^ "ISOGG 2018 Гаплогруппа Y-ДНК J" . www.isogg.org . Архивировано из оригинала 18 августа 2017 г. Проверено 11 апреля 2010 г.