Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
Гаплогруппа J-M304 , также известная как J , [Филогенетика 1] представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы человека . Считается, что он возник в Западной Азии . [2] Клада распространилась оттуда в эпоху неолита , прежде всего в Северную Африку , на Африканский Рог , на архипелаг Сокотра , на Кавказ , в Европу , Анатолию , Среднюю Азию , Южную Азию и Юго-Восточную Азию .
Гаплогруппа J-M304 делится на два основных субклада (ветви), J-M267 и J-M172 .
Происхождение
Считается, что гаплогруппа J-M304 отделилась от гаплогруппы I-M170 примерно 43 000 лет назад в Западной Азии [1] , поскольку обе линии представляют собой субклады гаплогруппы IJ . Гаплогруппа IJ и гаплогруппа K происходят от гаплогруппы IJK , и только на этом уровне классификации гаплогруппа IJK объединяется с гаплогруппой G-M201 и гаплогруппой H как непосредственные потомки гаплогруппы F-M89 . J-M304 (закавказского происхождения) определяется генетическим маркером M304 или эквивалентным маркером 12f2.1. Считается, что основные нынешние подгруппы J-M267 (происхождение из Армянского нагорья) и J-M172 (происхождение из гор Загроса), которые в настоящее время включают в себя почти все потомки гаплогруппы, возникли очень рано, по крайней мере 10 000 лет назад. Тем не менее, сообщалось, что Y-хромосомы F-M89* и IJ-M429* наблюдались на Иранском плато (Grugni et al. 2012).
С другой стороны, похоже, что различные эпизоды перемещения населения повлияли на юго-восточную Европу, а роль Балкан как давнего коридора в Европу с Ближнего Востока подтверждается филогенетическим объединением Hgs I. и J в результате базальной мутации M429. Это доказательство общего происхождения предполагает, что предок Hgs IJ-M429*, вероятно, проник в Европу через Балканы где-то до LGM . Затем они впоследствии разделились на Hg J и Hg I на Ближнем Востоке и в Европе по типичной дизъюнктивной филогеографической схеме. Такая географическая зона [ необходимы разъяснения ] склонна сталкиваться с дополнительными последовательными потоками генов, включая поселенцев-садоводов. Более того, объединение гаплогрупп IJK создает эволюционную дистанцию от делегатов F – H, а также подтверждает вывод о том, что и IJ-M429, и KT-M9 возникли ближе к Ближнему Востоку, чем к Центральной или Восточной Азии. [ нужна цитата ]
Гаплогруппа J также была обнаружена среди двух древнеегипетских мумий, раскопанных на археологическом участке Абусир-эль-Мелек в Среднем Египте, которые датируются периодом между поздним Новым царством и римской эрой . [3]
Распределение
Гаплогруппа J-M267 в наибольшей концентрации встречается на Аравийском полуострове . За пределами этого региона гаплогруппа J-M304 имеет значительное присутствие в других частях Ближнего Востока , а также в Северной Африке , на Африканском Роге и на Кавказе . Он также умеренно встречается в Южной Европе , особенно в центральной и южной Италии, на Мальте, в Греции и Албании. Субклад J-M410 в основном распространен в Анатолии , Греции и южной Италии. Кроме того, J-M304 наблюдается в Центральной Азии и Южной Азии , особенно в форме субклада J-M172. J-12f2 и J-P19 также встречаются у гереро (8%). [4]
Распределение субкладов
J-M304*
Парагруппа J-M304* [Филогенетика 2] включает все J-M304, за исключением J-M267, J-M172 и их субкладов. J-M304* редко встречается за пределами острова Сокотра, принадлежащего Йемену, где он чрезвычайно часто встречается в 71,4% и j1-267 для остальных без j2 [6] Гаплогруппа J-M304* также была обнаружена с более низкими частота в Омане (Ди Джакомо 2004), евреи-ашкенази , [7] Саудовская Аравия (Абу-Амеро 2009), Греция (Ди Джакомо 2004), Чехия (Ди Джакомо 2004 и Лука 2007), уйгуры [8] и некоторые тюркские народы . [9] (Чинниоглу 2004 и Варзари 2006).
Однако YFull [1] и FTDNA [10] не смогли найти людей J* нигде в мире, хотя есть 2 человека J2-Y130506 и 1 человек J1 из Сокотры. Но исследование Черни 2009 года обнаружило 9 человек J1 на Сокотре / Сокотре и большинство J * и ни одного J2, что предполагает наличие эффекта основателя J1 на Сокотре.
Ниже приводится краткое изложение большинства исследований, в которых специально тестировались J-M267 и J-M172, и показано его распространение в Европе, Северной Африке, на Ближнем Востоке и в Центральной Азии.
J-M267
Гаплогруппа J-M267 [Филогенетика 3] , определяемая SNP M267, в настоящее время наиболее часто встречается на Аравийском полуострове: Йемене (до 76%), [11] Саудовской Аравии (до 64%) (Альшамали 2009), Катаре (58). %), [12] и Дагестане (до 56%). [13] J-M267 обычно часто встречается среди арабских бедуинов (62%), [14] евреев-ашкенази (20%) (Semino 2004), Алжира (до 35%) (Semino 2004), Ирака (28%) (Semino 2004), Тунис (до 31%), [15] Сирия (до 30%), Египет (до 20%) (Луис 2004) и Синайский полуостров . В некоторой степени частота гаплогруппы J-M267 коллапсирует на границах арабоязычных / семитскоязычных территорий с преимущественно неарабоязычными/семитскоязычными территориями, такими как Турция (9%), Иран (5%), индийские мусульмане- сунниты ( 2,3%) и шииты Северной Индии (11%) (Eaaswarkhoth 2009). Некоторые приведенные выше цифры, как правило, являются более крупными, полученными в некоторых исследованиях, тогда как меньшие цифры, полученные в других исследованиях, опускаются. Это также очень часто встречается среди евреев , особенно линии Коэним (46%) (Hammer 2009).
ISOGG заявляет, что J-M267 возник на Ближнем Востоке . Он встречается в некоторых частях Ближнего Востока , Анатолии и Северной Африки , с гораздо более редким распространением на южном средиземноморском фланге Европы и в Эфиопии .
Но не все исследования согласны с точкой происхождения. Был предложен Левант , но исследование 2010 года пришло к выводу, что гаплогруппа имела более северное происхождение, возможно, из Анатолии .
Происхождение субклада J-P58, вероятно, происходит от более северных популяций, а затем распространяется на юг, на Аравийский полуостров . Высокая вариативность J-P58 по Y-STR в этнических группах Турции , а также в северных регионах Сирии и Ирака подтверждает вывод о происхождении J-P58 в соседней восточной Анатолии . Более того, сетевой анализ гаплотипов J-P58 показывает, что некоторые популяции с низким разнообразием, такие как бедуины из Израиля , Катара , Судана и Объединенных Арабских Эмиратов , плотно сгруппированы вблизи высокочастотных гаплотипов. Это предполагает, что эффект основателя связан с расширением звездного взрыва в Аравийскую пустыню (Кьярони, 2010).
J-M172
Гаплогруппа J-M172 [Филогенетика 4] встречается в самых высоких концентрациях на Кавказе и в Плодородном полумесяце / Ираке , а также встречается по всему Средиземноморью (включая Итальянский , Балканский , Анатолийский и Пиренейский полуострова и Северную Африку ) (Di Giacomo 2003).
Самая высокая когда-либо зарегистрированная концентрация J-M172 составила 72% в северо-восточной Грузии (Насидзе, 2004). Другие высокие показатели включают ингушей 32% (Насидзе 2004), киприотов 30-37% (Капелли 2005), ливанцев 30% (Уэллс и др. 2001), ассирийцев , мандеев и арабов -иракцев 29,7% (Санчес и др. 2005) [ полный текст ] необходима ссылка ] , сирийцы и сирийцы 22,5%, курды 24%-28%, пуштуны 20-30%, [16] иранцы 23% (Абурто 2006), евреи-ашкенази 24%, палестинские арабы 16,8%-25%, евреи-сефарды 29 % [17] и североиндийские мусульмане-шииты 18%, чеченцы 26%, балкарцы 24%, ягнобцы 32%, армяне 21-24% и азербайджанцы 24-48%.
В Южной Азии уровень J2-M172 оказался значительно выше среди дравидийских каст (19%), чем среди индоевропейских каст (11%). J2-M172 и J-M410 встречаются в 21% дравидийских средних каст, за ними следуют высшие касты (18,6%) и низшие касты (14%). (Sengupta 2006) [18] Субклады M172, такие как M67 и M92, не были обнаружены ни в индийских, ни в пакистанских образцах, что также может указывать на частичное общее происхождение. (Sengupta 2006) [18]
По данным генетического исследования Shou et al., проведенного в Китае, J2-M172 с высокой частотой встречается у уйгуров (17/50 = 34%) и узбеков (7/23 = 30,4%), умеренная частота – у памирцев (5/31 = 16,1%), а также обнаружен J-M172 у ханьцев (10%) [19] и низкую частоту у югуров (2/32 = 6,3%) и монгуров (1/50 = 2,0%). Авторы также обнаружили J-M304(xJ2-M172) с низкой частотой среди русских (1/19 = 5,3%), узбеков (1/23 = 4,3%), сибе (1/32 = 3,1%), дунсянов ( 1/35 = 2,9%) и казахи (1/41 = 2,4%) в Северо-Западном Китае . [20] Только этнические меньшинства крайнего северо-запада имели гаплогруппу J в Синьцзяне, Китай. У узбеков в выборке было 30,4% J2-M172, он также был у таджиков Синьцзяна и уйгуров. [21]
Филогенетика
В филогенетике Y-хромосомы субклады являются ветвями гаплогрупп. Эти субклады также определяются однонуклеотидными полиморфизмами (SNP) или полиморфизмами уникальных событий (UEP).
Филогенетическая история
До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.
Научные публикации
Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены при создании дерева YCC.
- α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
- β Андерхилл 2000
- γ Хаммер 2001
- δ Карафет 2001
- ε Семино 2000
- ζ Вс 1999 г.
- η Капелли 2001 г.
Филогенетические деревья
Существует несколько подтвержденных и предложенных филогенетических деревьев гаплогруппы J-M304. Научно признанным является вариант Консорциума Y-хромосомы (YCC), опубликованный в Karafet 2008 и впоследствии обновленный. Черновик дерева, показывающего новые научные достижения, предоставлен Томасом Краном из Центра геномных исследований в Хьюстоне, штат Техас . Международное общество генетической генеалогии (ISOGG) также предоставляет любительское дерево.
Черновик дерева Центра геномных исследований
Это Томас Кран из проекта предлагаемого дерева гаплогруппы J-P209 Центра геномных исследований (Krahn & FTDNA 2013). Для краткости показаны только первые три уровня субкладов.
- J-M304 12f2a, 12f2.1, M304, P209, L60, L134
- М267, Л255, Л321, Л765, Л814, Л827, Л1030
- М62
- М365.1
- Л136, Л572, Л620
- М390
- P56
- П58, Л815, Л828
- Л256
- Z1828, Z1829, Z1832, Z1833, Z1834, Z1836, Z1839, Z1840, Z1841, Z1843, Z1844
- М172, Л228
- М410, Л152, Л212, Л505, Л532, Л559
- М12, М102, М221, М314, Л282
Дерево Консорциума Y-хромосомы
Это официальное научное дерево, созданное Консорциумом Y-хромосомы (YCC). Последнее крупное обновление было в 2008 году (Карафет, 2008). Последующие обновления были ежеквартальными и двухгодичными. Текущая версия (2022 г.) представляет собой обновление 2019/2020 г.
Выдающиеся члены J
Смотрите также
Генетика
Субклады Y-ДНК J
Рекомендации
- ^ abcd "J YTree". Архивировано из оригинала 23 мая 2018 года . Проверено 8 апреля 2018 г.
- ^ Гаплогруппа J Y-ДНК. Архивировано 18 августа 2017 г. в Wayback Machine , ISOGG, 2015 г.
- ^ Шунеманн, Верена Дж.; и другие. (2017). «Геномы древнеегипетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримские периоды». Природные коммуникации . 8 : 15694. Бибкод : 2017NatCo...815694S. doi : 10.1038/ncomms15694. ПМЦ 5459999 . ПМИД 28556824.
- ^ Вуд, Элизабет Т.; и другие. (2005). «Контрастные закономерности вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: свидетельства демографических процессов с учетом пола» (PDF) . Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 867–876. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201408 . PMID 15856073. S2CID 20279122. Архивировано (PDF) из оригинала 24 сентября 2016 г. . Проверено 24 сентября 2016 г.
- ^ Эль-Сибай 2009 г. сообщил о результатах нескольких исследований: Ди Джакомо 2003 г., Аль-Захери 2003 г., Флорес 2004 г., Чинниоглу 2004 г., Капелли 2005 г., Гонсалвес 2005 г., Заллуа 2008 г., Каденас 2008 г.
- ^ Черный 2009: J-12f2(xM267, M172)(45/63) Черный, Виктор; и другие. (2009). «За пределами Аравии - поселение на острове Сокотра, что видно по генетическому разнообразию митохондрий и Y-хромосомы» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 138 (4): 439–447. дои : 10.1002/ajpa.20960. PMID 19012329. Архивировано из оригинала (PDF) 6 октября 2016 года . Проверено 12 июня 2016 г.
- ^ Шен 2004: Гаплогруппа J-M304 (xM267, M172) у 1/20 евреев-ашкенази.
- ^ Чжун и др. (2011), Mol Biol Evol, 1 января 2011 г., том. 28 нет. 1 717-727. Архивировано 23 августа 2011 года в Wayback Machine , см. таблицу [ постоянная мертвая ссылка ] .
- ^ Юнусбаев 2006: Статистические данные по объединенным дагестанским этническим группам см. Подробности в статье «Дагестан» . даргинцы (91%), аварцы (67%), чамалины (67%), лезгины (58%), табассаранцы (49%), андисцы (37%), ассирийцы (29%), багвалины (21,4%))
- ^ "FamilyTreeDNA - Проект гаплогруппы Y-ДНК J" . Архивировано из оригинала 12 февраля 2020 года . Проверено 28 сентября 2019 г.
- ^
- Альшамали, 2009 г.: 81% (84/104)
- Каденас 2008: 45/62=72,6% J-M267
- ^ Каденас 2008: 42/72 = 58,3% J-M267
- ^ Юнусбаев 2006: даргвы (91%), аварцы (67%), чамалины (67%), лезгины (58%), табассаранцы (49%), андийцы (37%), ассирийцы (29%), багвалины (21,4%). ))статистику в совокупности дагестанских этносов см. статью о Дагестане
- ^ Небель 2001: 21/32.
- ^ 31% основано на объединенных данных.
- Семино 2004: 30%
- Арреди 2004: 32%
- ^ Хабер, Марк; Платт, Дэниел Э.; Ашрафиан Бонаб, Мазиар; Юханна, Соня С.; Сория-Эрнанц, Дэвид Ф.; Мартинес-Крус, Бегонья; Дуэи, Бушра; Гассибе-Саббах, Мишелла; Рафатпанах, Хошанг; Ганбари, Мохсен; Кит, Джон; Балановский Олег; Уэллс, Р. Спенсер; Комас, Дэвид; Тайлер-Смит, Крис; Заллуа, Пьер А. (2012). «Этнические группы Афганистана разделяют Y-хромосомное наследие, структурированное историческими событиями». ПЛОС ОДИН . 7 (3): e34288. Бибкод : 2012PLoSO...734288H. дои : 10.1371/journal.pone.0034288 . ПМЦ 3314501 . ПМИД 22470552.
- ^ «Том 69» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 31 января 2017 года . Проверено 11 мая 2020 г.
- ^ аб Сенгупта, С; Животовский, Л.А.; Кинг, Р; и другие. (февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределения Y-хромосомы в Индии с высоким разрешением определяют как местное, так и экзогенное распространение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Являюсь. Дж. Хум. Жене . 78 (2): 202–21. дои : 10.1086/499411. ПМЦ 1380230 . ПМИД 16400607.
- ^ Сюэ, 2006 г.
- ^ Шу и др. (2010), Распределение Y-хромосомы среди популяций Северо-Западного Китая указывает на значительный вклад скотоводов Центральной Азии и меньшее влияние западных евразийцев. Архивировано 2 апреля 2015 г. в Wayback Machine , Journal of Human Genetics (2010) 55, 314–. 322; дои:10.1038/jhg.2010.30; опубликовано онлайн 23 апреля 2010 г., Таблица 2. Распределение гаплогрупп и разнообразие Y-хромосом в 14 популяциях северо-запада. Архивировано 14 января 2015 г. в Wayback Machine.
- ^ Шоу, Вэй-Хуа; Цяо, Внь-Фа; Вэй, Чуан-Юй; Донг, Юн-Ли; Тан, Си-Цзе; Ши, Хун; Тан, Вэнь-Ру; Сяо, Чун-Цзе (2010). «Распределение Y-хромосомы среди популяций Северо-Западного Китая указывает на значительный вклад скотоводов Центральной Азии и меньшее влияние западных евразийцев». Джей Хум Жене . 55 (5): 314–322. дои : 10.1038/jhg.2010.30 . PMID 20414255. S2CID 23002493.
- ^ abcdefgh Масиамо. «Эупедия». Евпедия . Проверено 6 августа 2022 г.
- ^ abcd Масиамо. «Эупедия». Евпедия . Проверено 6 августа 2022 г.
- ^ Шунеманн, виджей; Пельтцер, А.; Вельте, Б.; Ван Пелт, WP; Молак, М.; Ван, CC; Фуртвенглер, А.; Урбан, К.; Рейтер, Э.; Низельт, К.; Тессманн, Б.; Франкен, М.; Харвати, К.; Хаак, В.; Шиффельс, С.; Краузе, Дж. (2017). «Геномы древнеегипетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримские периоды». Природные коммуникации . 8 : 15694. Бибкод : 2017NatCo...815694S. doi : 10.1038/ncomms15694. ПМЦ 5459999 . ПМИД 28556824.
- ^ «Добро пожаловать в FamilyTreeDNA Discover (бета)» . FamilyTreeDNA Discover (бета) . Проверено 6 мая 2023 г.
Цитируемые работы
Журналы
- Консорциум Y-хромосомы «YCC» (2002). «Система номенклатуры дерева бинарных гаплогрупп Y-хромосомы человека». Геномные исследования . 12 (2): 339–48. дои : 10.1101/гр.217602. ПМК 155271 . ПМИД 11827954.
- Абу-Амеро, Халед К.; Хеллани, Али; Гонсалес, Ана М; Ларруга, Хосе М; Кабрера, Висенте М; Андерхилл, Питер А. (2009). «Разнообразие Y-хромосомы Саудовской Аравии и его связь с близлежащими регионами». БМК Генетика . 10:59 . дои : 10.1186/1471-2156-10-59 . ПМК 2759955 . ПМИД 19772609.
- Аль-Захери, Н.; Семино, О.; Бенуцци, Г.; Магри, К.; Пассарино, Г.; Торрони, А.; Сантакьяра-Бенерекетти, AS (сентябрь 2003 г.). «Полиморфизмы Y-хромосомы и мтДНК в Ираке, перекресток раннего расселения человека и постнеолитических миграций». Молекулярная филогенетика и эволюция . 28 (3): 458–472. дои : 10.1016/S1055-7903(03)00039-3. ПМИД 12927131.
- Альшамали, Фарида; Перейра, Луиза; Будоул, Брюс; Полони, Эстелла С.; Куррат, Матиас (2009). «Структура местного населения на Аравийском полуострове, выявленная разнообразием Y-STR». Наследственность человека . 68 (1): 45–54. дои : 10.1159/000210448 . ПМИД 19339785.
- Арреди, Б; Полони, Э; Параккини, С; Зержал, Т; Фаталлах, Д; Макрелуф, М; Паскали, В; Новеллетто, А; Тайлер-Смит, К. (2004). «Преимущественно неолитическое происхождение вариаций Y-хромосомной ДНК в Северной Африке». Американский журнал генетики человека . 75 (2): 338–45. дои : 10.1086/423147. ПМК 1216069 . ПМИД 15202071.
- Балановский О.; Дибирова, К.; Дыбо, А.; Мудрак, О.; Фролова С.; Почешхова Е.; Хабер, М.; Платт, Д.; и другие. (2011). «Параллельная эволюция генов и языков в Кавказском регионе». Молекулярная биология и эволюция . 28 (10): 2905–20. doi : 10.1093/molbev/msr126. ПМЦ 3355373 . ПМИД 21571925.
- Батталья, Винченца; Форнарино, Симона; Аль-Захери, Надя; Оливьери, Анна; Пала, Мария; Майрес, Натали М; Кинг, Рой Дж; Роотси, Сиири; и другие. (2009). «Y-хромосомные свидетельства культурного распространения сельского хозяйства в Юго-Восточной Европе». Европейский журнал генетики человека . 17 (6): 820–30. дои : 10.1038/ejhg.2008.249. ПМК 2947100 . ПМИД 19107149.
- Бош, Э.; Калафель, Ф.; Гонсалес-Нейра, А.; Флейз, К.; Матеу, Э.; Шейль, Х.-Г.; Хакенбек, В.; Ефремовская, Л.; Микерези, И.; Ксиротирис, Н.; Граса, К.; Шмидт, Х.; Комас, Д. (июль 2006 г.). «Отцовская и материнская линии на Балканах демонстрируют однородный ландшафт, несмотря на языковые барьеры, за исключением изолированных аромунов». Анналы генетики человека . 70 (4): 459–487. дои : 10.1111/j.1469-1809.2005.00251.x. PMID 16759179. S2CID 23156886.
- Каденас, Алисия М; Животовский Лев А; Кавалли-Сфорца, Лука Л; Андерхилл, Питер А; Эррера, Рене Дж (2008). «Разнообразие Y-хромосом характеризует Оманский залив». Европейский журнал генетики человека . 16 (3): 374–86. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201934 . ПМИД 17928816.
- Капелли, К.; Рыжая, Н.; Романо, В.; Кали, Ф.; Лефранк, Г.; Делаг, В.; Мегарбейн, А.; Феличе, А.Е.; Паскали, В.Л.; Неофиту, ИП; Пулли, З.; Новеллетто, А.; Маласпина, П.; Терренато, Л.; Беребби, А.; Феллоус, М.; Томас, Миннесота; Гольдштейн, Д.Б. (март 2006 г.). «Структура населения в Средиземноморском бассейне: хромосомная перспектива AY». Анналы генетики человека . 70 (2): 207–225. дои : 10.1111/j.1529-8817.2005.00224.x. hdl : 2108/37090 . PMID 16626331. S2CID 25536759.
- Капелли, Кристиан; Бризигелли, Франческа; Скарниччи, Франческа; Арреди, Барбара; Калья, Алессандра; Ветруньо, Джузеппе; Тофанелли, Серджио; Онофри, Валерио; Тальябраччи, Адриано; Паоли, Джорджио; Паскали, Винченцо Л. (июль 2007 г.). «Генетическая вариация Y-хромосомы на итальянском полуострове является клинальной и подтверждает модель примеси для встречи мезолита и неолита». Молекулярная филогенетика и эволюция . 44 (1): 228–239. doi :10.1016/j.ympev.2006.11.030. ПМИД 17275346.
- Кьярони, Жак; Кинг, Рой Дж; Майрес, Натали М; Хенн, Бренна М; Дюкурно, Аксель; Митчелл, Майкл Дж; Боетч, Жиль; Шейха, Исса; и другие. (2009). «Появление гаплогруппы J1e Y-хромосомы среди арабоязычного населения». Европейский журнал генетики человека . 18 (3): 348–53. дои : 10.1038/ejhg.2009.166. ПМЦ 2987219 . ПМИД 19826455.
- Кьярони, Жак; Кинг, Рой Дж; Майрес, Натали М; Хенн, Бренна М; Дюкурно, Аксель; Митчелл, Майкл Дж; Боетч, Жиль; Шейха, Исса; и другие. (2010). «Появление гаплогруппы J1e Y-хромосомы среди арабоязычного населения». Европейский журнал генетики человека . 18 (3): 348–53. дои : 10.1038/ejhg.2009.166. ПМЦ 2987219 . ПМИД 19826455.
- Чинниоглу, Дженгиз; Кинг, Рой; Кивисилд, Тоомас; Калфоглу, Эрси; Атасой, Севиль; Каваллери, Джанпьеро Л.; Лилли, Анита С.; Роузман, Чарльз К.; и другие. (2004). «Раскопки слоев гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии». Генетика человека . 114 (2): 127–48. дои : 10.1007/s00439-003-1031-4. PMID 14586639. S2CID 10763736.
- Ди Джакомо, Ф.; Лука, Ф.; Ананью, Н.; Чаварелла, Г.; Корбо, РМ; Креста, М.; Куччи, Ф.; Ди Стази, Л.; и другие. (2003). «Клинические закономерности разнообразия Y-хромосомы человека в континентальной Италии и Греции определяются эффектами дрейфа и основателя». Молекулярная филогенетика и эволюция . 28 (3): 387–95. дои : 10.1016/S1055-7903(03)00016-2. ПМИД 12927125.
- Ди Джакомо, Ф.; Лука, Ф.; Попа, Ло; Акар, Н.; Ананью, Н.; Банико Дж.; Брдичка, Р.; Барбуджани, Г.; и другие. (2004). «Y-хромосомная гаплогруппа J как признак постнеолитической колонизации Европы». Генетика человека . 115 (5): 357–71. дои : 10.1007/s00439-004-1168-9. PMID 15322918. S2CID 18482536.
- Иасвархант, Мутхукришнан; Хак, Икрамул; Равеш, Зейнаб; Ромеро, Ирен Гальего; Меганатан, Пурлин Рамакоди; Дубей, Бхавна; Хан, Файзан Ахмед; Чаубей, Гьянешвер; Кивисилд, Тоомас; Тайлер-Смит, Крис; Сингх, Лалджи; Тангарадж, Кумарасами (март 2010 г.). «Следы происхождения к югу от Сахары и Ближнего Востока в мусульманском населении Индии». Европейский журнал генетики человека . 18 (3): 354–363. дои : 10.1038/ejhg.2009.168. ПМЦ 2859343 . ПМИД 19809480.
- Эль-Сибай, М.; Платт, Делавэр; Хабер, М.; Сюэ, Ю.; Юханна, Южная Каролина; Уэллс, РС; Изаабель, Х.; Санюра, МФ; Харманани, Х.; Бонаб, Массачусетс; Бехбехани, Дж.; Хашва, Ф.; Тайлер-Смит, К.; Заллуа, Пенсильвания; Генографический, Консорциум (2009). «Географическая структура Y-хромосомного генетического ландшафта Леванта: контраст между побережьем и сушей». Анналы генетики человека . 73 (6): 568–81. дои : 10.1111/j.1469-1809.2009.00538.x. ПМЦ 3312577 . ПМИД 19686289.
- Фадлауи-Зид, Карима (2014). «Сус: крайняя генетическая гетерогенность в Северной Африке». Журнал генетики человека . 60 (1): 41–49. дои : 10.1038/jhg.2014.99 . PMID 25471516. S2CID 25186140.
- Флорес, Карлос; Мака-Мейер, Николь; Гонсалес, Ана М; Офнер, Питер Дж; Шен, Пейдун; Перес, Хосе А; Рохас, Антонио; Ларруга, Хосе М; Андерхилл, Питер А. (октябрь 2004 г.). «Редуцированная генетическая структура Пиренейского полуострова, выявленная с помощью анализа Y-хромосомы: последствия для демографии населения». Европейский журнал генетики человека . 12 (10): 855–863. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201225 . PMID 15280900. S2CID 16765118.
- Гонсалвес, Рита; Фрейтас, Ана; Бранко, Марта; Роза, Александра; Фернандес, Ана Т.; Животовский Лев А.; Андерхилл, Питер А.; Кивисилд, Тоомас; Брем, Антонио (2005). «Линии Y-хромосомы из Португалии, Мадейры и Асорских островов фиксируют элементы сефардского и берберского происхождения». Анналы генетики человека . 69 (Часть 4): 443–454. дои : 10.1111/j.1529-8817.2005.00161.x. hdl : 10400.13/3018 . PMID 15996172. S2CID 3229760.
- Хаммер, Майкл Ф.; Бехар, Дорон М.; Карафет Татьяна М.; Мендес, Фернандо Л.; Холлмарк, Брайан; Эрез, Тамар; Животовский Лев А.; Россе, Сахарон; Скорецкий, Карл (2009). «Расширенные гаплотипы Y-хромосомы определяют многочисленные и уникальные линии еврейского духовенства». Генетика человека . 126 (5): 707–17. дои : 10.1007/s00439-009-0727-5. ПМЦ 2771134 . ПМИД 19669163.
- Джоблинг, Марк А.; Тайлер-Смит, Крис (2000). «Новое использование новых гаплотипов». Тенденции в генетике . 16 (8): 356–62. дои : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6. ПМИД 10904265.
- Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, СЛ; Хаммер, МФ (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогруппы Y-хромосомы человека». Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои :10.1101/гр.7172008. ПМК 2336805 . ПМИД 18385274.
- Лука, Ф.; Ди Джакомо, Ф.; Бенинкаса, Т.; Попа, Ло; Банико Дж.; Крацмарова А.; Маласпина, П.; Новеллетто, А.; Брдичка, Р. (2007). «Y-хромосомная вариация в Чехии». Американский журнал физической антропологии . 132 (1): 132–9. дои : 10.1002/ajpa.20500. hdl : 2108/35058 . ПМИД 17078035.
- Луис, Дж; Роуолд, Д; Регейро, М; Каейро, Б; Чинниоглу, К; Роузман, К; Андерхилл, П; Каваллисфорса, Л; Эррера, Р. (2004). «Левант против Африканского Рога: свидетельства двунаправленных коридоров миграции людей». Американский журнал генетики человека . 74 (3): 532–44. дои : 10.1086/382286. ПМЦ 1182266 . ПМИД 14973781.
- Мартинес, Лэйзель; Андерхилл, Питер А; Животовский Лев А; Гайден, Тензин; Мошонас, Николас К; Чоу, Шерил-Эмилиан Т; Конти, Саймон; Мамолини, Элизабетта; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Эррера, Рене Дж (апрель 2007 г.). «На Критском высокогорном плато преобладает палеолитическое наследие Y-гаплогруппы». Европейский журнал генетики человека . 15 (4): 485–493. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201769 . PMID 17264870. S2CID 9847088.
- Мирабал С., Варльен Т., Гайден Т. и др. (июль 2010 г.). «Короткие тандемные повторы Y-хромосомы человека: история аккультурации и миграций как механизмов распространения сельского хозяйства на Балканском полуострове». Американский журнал физической антропологии . 142 (3): 380–390. дои : 10.1002/ajpa.21235. ПМИД 20091845.
- Насидзе И.; Линг, EYS; Куинке, Д.; Дюпанлуп, И.; Кордо, Р.; Рычков С.; Наумова О.; Жукова О.; и другие. (2004). «Митохондриальная ДНК и вариации Y-хромосомы на Кавказе». Анналы генетики человека . 68 (3): 205–21. дои : 10.1046/j.1529-8817.2004.00092.x . PMID 15180701. S2CID 27204150.
- Небель, Альмут; Филон, Двора; Бринкманн, Бернд; Маджумдер, Парта П.; Фаерман, Марина; Оппенгейм, Ариэлла (ноябрь 2001 г.). «Пул Y-хромосомы евреев как часть генетического ландшафта Ближнего Востока». Американский журнал генетики человека . 69 (5): 1095–1112. дои : 10.1086/324070. ПМЦ 1274378 . ПМИД 11573163.
- Онофри, Валерио; Алессандрини, Федерика; Турки, Кьяра; Песарези, Мауро; Тальябраччи, Адриано (2008). «Распределение маркеров Y-хромосомы в Северной Африке: анализ SNP и STR высокого разрешения в популяциях Туниса и Марокко». Forensic Science International: Серия дополнений по генетике . 1 : 235–236. дои : 10.1016/j.fsigss.2007.10.173.
- Перичич М., Лаук Л.Б., Кларич И.М. и др. (октябрь 2005 г.). «Филогенетический анализ юго-восточной Европы с высоким разрешением прослеживает основные эпизоды потока отцовских генов среди славянского населения». Мол. Биол. Эвол . 22 (10): 1964–75. дои : 10.1093/molbev/msi185 . ПМИД 15944443.
- Робино, К.; Кробу, Ф.; Ди Гаэтано, К.; Бекада, А.; Бенхамамуш, С.; Черутти, Н.; Пьяцца, А.; Интурри, С.; Торре, К. (2008). «Анализ гаплогрупп SNP Y-хромосомы и гаплотипов STR в выборке населения Алжира». Международный журнал юридической медицины . 122 (3): 251–255. дои : 10.1007/s00414-007-0203-5. PMID 17909833. S2CID 11556974.
- Семино, Орнелла; Магри, Кьяра; Бенуцци, Джорджия; Лин, Алиса А.; Аль-Захери, Надя; Батталья, Винченца; Маччиони, Лилиана; Триантафиллидис, Костас; и другие. (2004). «Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморье». Американский журнал генетики человека . 74 (5): 1023–1034. дои : 10.1086/386295. ПМК 1181965 . ПМИД 15069642.
- Шен, Пейдун; Лави, Таль; Кивисилд, Тоомас; Чоу, Вивиан; Сенгун, Дениз; Гефель, Дов; Шпирер, Иссак; Вульф, Эйлон; и другие. (2004). «Реконструкция отцовских и матрилиний самаритян и других израильских популяций на основе вариаций Y-хромосомы и последовательности митохондриальной ДНК». Человеческая мутация . 24 (3): 248–60. дои :10.1002/humu.20077. PMID 15300852. S2CID 1571356.
- Сюэ, Яли; Зержал, Татьяна; Бао, Вэйдун; Чжу, Сулин; Шу, Цюньфан; Сюй, Цзюджин; Ду, Руофу; Фу, Сонбин; Ли, Пу; Херлс, Мэтью Э; Ян, Хуаньмин; Тайлер-Смит, Крис (1 апреля 2006 г.). «Мужская демография в Восточной Азии: контраст между Севером и Югом во времена роста численности населения». Генетика . 172 (4): 2431–2439. дои : 10.1534/генетика.105.054270. ПМЦ 1456369 . ПМИД 16489223.
- Заллуа, Пьер А.; Платт, Дэниел Э.; Эль Сибай, Мирват; Халифе, Джейд; Махул, Надин; Хабер, Марк; Сюэ, Яли; Изаабель, Хасан; и другие. (2008). «Выявление генетических следов исторической экспансии: финикийские следы в Средиземноморье». Американский журнал генетики человека . 83 (5): 633–642. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.10.012. ПМК 2668035 . ПМИД 18976729.
Диссертации и диссертации
- Варзари, Александр (2006). Популяционная история Днестровско-Карпат: данные по вставке Alu и полиморфизму Y-хромосомы (PDF) (Диссертация). Мюнхен, Университет. ОСЛК 180859661.
- Юнусбаев, Баязит Булатович (2006). ПОПУЛЯЦИОННО -ГЕНЕТИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ НАРОДОВ ДАГЕСТАНА ПО ДАННЫМ О ПОЛИМОРФИЗМЕ У-ХРОМОСОМЫ И АТД-ИНСЕРЦИЙ ( PDF) (доктор философии). Москва: Российская академия наук. Архивировано из оригинала (PDF) 5 февраля 2007 года.
Блоги
- Диенекес (2009). «Ближневосточные и субсахарские линии в мусульманском населении Индии».
Списки рассылки
- Абурто, Альфред А. (2006). «Гаплогруппа Y J в Иране» (список рассылки). Архивировано из оригинала 13 октября 2012 года . Проверено 3 января 2013 г.
Веб-сайты
- Кран; ФТДНА (2003). «Черновик дерева Центра геномных исследований (AKA Y-TRee)» . Архивировано из оригинала 15 августа 2015 года.
Источники таблиц преобразования
- Капелли, Кристиан; Уилсон, Джеймс Ф.; Ричардс, Мартин; Штумпф, Майкл П.Х.; и другие. (февраль 2001 г.). «Отцовское наследие преимущественно коренных народов австронезийскоязычных народов островной Юго-Восточной Азии и Океании». Американский журнал генетики человека . 68 (2): 432–443. дои : 10.1086/318205 . ПМЦ 1235276 . ПМИД 11170891.
- Хаммер, Майкл Ф.; Карафет Татьяна М.; Редд, Алан Дж.; Джарджанази, Хамди; и другие. (1 июля 2001 г.). «Иерархические закономерности глобального разнообразия Y-хромосомы человека». Молекулярная биология и эволюция . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . ПМИД 11420360.
- Джоблинг, Марк А.; Тайлер-Смит, Крис (2000), «Новое использование новых гаплотипов», Trends in Genetics , 16 (8): 356–62, doi : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6, PMID 10904265
- Каладжиева, Люба; Калафель, Франческ; Джоблинг, Марк А; Ангеличева, Дора; и другие. (февраль 2001 г.). «Закономерности меж- и внутригруппового генетического разнообразия у Vlax Roma, выявленные с помощью Y-хромосомы и линий митохондриальной ДНК». Европейский журнал генетики человека . 9 (2): 97–104. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . PMID 11313742. S2CID 21432405.
- Карафет, Татьяна; Сюй, Липин; Ду, Руофу; Ван, Уильям; и другие. (сентябрь 2001 г.). «История отцовского населения Восточной Азии: источники, закономерности и микроэволюционные процессы». Американский журнал генетики человека . 69 (3): 615–628. дои : 10.1086/323299. ПМЦ 1235490 . ПМИД 11481588.
- Семино, О.; Пассарино, Дж; Оефнер, П.Дж.; Лин, А.А.; и другие. (2000), «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: хромосомная перспектива AY», Science , 290 (5494): 1155–9, Бибкод : 2000Sci...290.1155S, doi : 10.1126/science.290.5494. 1155, ПМИД 11073453
- Су, Бинг; Сяо, Цзюньхуа; Андерхилл, Питер; Дека, Ранджан; и другие. (декабрь 1999 г.). «Свидетельства Y-хромосомы миграции современных людей на север в Восточную Азию во время последнего ледникового периода». Американский журнал генетики человека . 65 (6): 1718–1724. дои : 10.1086/302680 . ПМЦ 1288383 . ПМИД 10577926.
- Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А.; Джин, Ли; и другие. (ноябрь 2000 г.). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Природная генетика . 26 (3): 358–361. дои : 10.1038/81685. PMID 11062480. S2CID 12893406.
дальнейшее чтение
- yJdb: гаплотипы гаплотипов гаплогруппы J в базе данных Y-гаплогруппы J.
- [1]
- Субклады гаплогруппы J в Международном обществе генетической генеалогии
- Санчес, Хуан Дж; Халленберг, Шарлотта; Бёрстинг, Клаус; Эрнандес, Алексис; Горлин, Р.Дж. (2005). «Высокая частота линий Y-хромосомы, характеризующихся E3b1, DYS19-11, DYS392-12 у сомалийских мужчин». Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 856–66. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201390 . ПМИД 15756297.
- Сенгупта С., Животовский Л.А., Кинг Р. и др. (февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределения Y-хромосомы в Индии с высоким разрешением определяют как местное, так и экзогенное распространение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Являюсь. Дж. Хум. Жене . 78 (2): 202–21. дои : 10.1086/499411. ПМЦ 1380230 . ПМИД 16400607.
Филогенетические заметки
- ^ ISOGG Y-ДНК Гаплогруппа J и ее субклады - 2016. Архивировано 18 августа 2017 года в Wayback Machine (2 февраля 2016 года).
- ^ В этой таблице показаны исторические названия J-M304 (также известные как J-P209 и J-12f2.1) в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 является субкладом 23 .
- ^ В этой таблице показаны исторические названия J-M267 и его ранее открытого и названного субклада J-M62 в опубликованной рецензируемой литературе.
- ^ В этой таблице показаны исторические названия J-M172 в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 является субкладом 23 .
Внешние ссылки
Викискладе есть медиафайлы, связанные с гаплогруппой J Y-ДНК .
Филогенетическое древо и карты распространения гаплогруппы J Y-ДНК
- Гаплогруппа J Y-ДНК и ее субклады по данным ISOGG 2009.
Другие
- Канал гаплогруппы J2 на YouTube
- Распространение гаплогруппы J по данным National Geographic.
- Проект ДНК Британских островов