stringtranslate.com

Гаплогруппа J (Y-ДНК)

Гаплогруппа J-M304 , также известная как J , [Филогенетика 1] представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы человека . Считается, что он возник в Западной Азии . [2] Клада распространилась оттуда в эпоху неолита , прежде всего в Северную Африку , на Африканский Рог , на архипелаг Сокотра , на Кавказ , в Европу , Анатолию , Среднюю Азию , Южную Азию и Юго-Восточную Азию .

Гаплогруппа J-M304 делится на два основных субклада (ветви), J-M267 и J-M172 .

Происхождение

Считается, что гаплогруппа J-M304 отделилась от гаплогруппы I-M170 примерно 43 000 лет назад в Западной Азии [1] , поскольку обе линии представляют собой субклады гаплогруппы IJ . Гаплогруппа IJ и гаплогруппа K происходят от гаплогруппы IJK , и только на этом уровне классификации гаплогруппа IJK объединяется с гаплогруппой G-M201 и гаплогруппой H как непосредственные потомки гаплогруппы F-M89 . J-M304 (закавказского происхождения) определяется генетическим маркером M304 или эквивалентным маркером 12f2.1. Считается, что основные нынешние подгруппы J-M267 (происхождение из горной местности Армении) и J-M172 (происхождение из гор Загроса), которые в настоящее время включают в себя почти все потомки гаплогруппы, возникли очень рано, по крайней мере, 10 000 лет назад. Тем не менее, сообщалось, что Y-хромосомы F-M89* и IJ-M429* наблюдались на Иранском плато (Grugni et al. 2012).

С другой стороны, похоже, что различные эпизоды перемещения населения повлияли на юго-восточную Европу, а роль Балкан как давнего коридора в Европу с Ближнего Востока подтверждается филогенетическим объединением Hgs I. и J в результате базальной мутации M429. Это доказательство общего происхождения предполагает, что предок Hgs IJ-M429*, вероятно, проник в Европу через Балканы где-то до LGM . Затем они впоследствии разделились на Hg J и Hg I на Ближнем Востоке и в Европе по типичной дизъюнктивной филогеографической схеме. Такая географическая группа [ необходимы разъяснения ] склонна сталкиваться с дополнительными последовательными потоками генов, включая поселенцев-садоводов. Более того, объединение гаплогрупп IJK создает эволюционную дистанцию ​​от делегатов F – H, а также подтверждает вывод о том, что и IJ-M429, и KT-M9 возникли ближе к Ближнему Востоку, чем к Центральной или Восточной Азии. [ нужна цитата ]

Гаплогруппа J также была обнаружена среди двух древнеегипетских мумий, раскопанных на археологическом участке Абусир-эль-Мелек в Среднем Египте, которые датируются периодом между поздним Новым царством и римской эрой . [3]

Распределение

Гаплогруппа J-M267 в наибольшей концентрации встречается на Аравийском полуострове . За пределами этого региона гаплогруппа J-M304 имеет значительное присутствие в других частях Ближнего Востока , а также в Северной Африке , на Африканском Роге и на Кавказе . Он также умеренно встречается в Южной Европе , особенно в центральной и южной Италии, на Мальте, в Греции и Албании. Субклад J-M410 в основном распространен в Анатолии , Греции и южной Италии. Кроме того, J-M304 наблюдается в Центральной Азии и Южной Азии , особенно в форме субклада J-M172. J-12f2 и J-P19 также встречаются у гереро (8%). [4]

Распределение субкладов

J-M304*

Парагруппа J-M304* [Филогенетика 2] включает все J-M304, за исключением J-M267, J-M172 и их субкладов. J-M304* редко встречается за пределами острова Сокотра, принадлежащего Йемену, где он чрезвычайно часто встречается в 71,4% и j1-267 для остальных без j2 [6] Гаплогруппа J-M304* также была обнаружена с более низкими частота в Омане (Ди Джакомо 2004), евреи-ашкенази , [7] Саудовская Аравия (Абу-Амеро 2009), Греция (Ди Джакомо 2004), Чехия (Ди Джакомо 2004 и Лука 2007), уйгуры [8] и некоторые тюркские народы . [9] (Чинниоглу 2004 и Варзари 2006).

Однако YFull [1] и FTDNA [10] не смогли найти людей J* нигде в мире, хотя есть 2 человека J2-Y130506 и 1 человек J1 из Сокотры. Но исследование Черни 2009 года обнаружило 9 человек J1 на Сокотре / Сокотре и большинство J * и ни одного J2, что предполагает наличие эффекта основателя J1 на Сокотре.

Ниже приводится краткое изложение большинства исследований, в которых специально тестировались J-M267 и J-M172, и показано его распространение в Европе, Северной Африке, на Ближнем Востоке и в Центральной Азии.

J-M267

Гаплогруппа J-M267 [Филогенетика 3] , определяемая SNP M267, в настоящее время наиболее часто встречается на Аравийском полуострове: Йемене (до 76%), [11] Саудовской Аравии (до 64%) (Альшамали 2009), Катаре (58) . %), [12] и Дагестане (до 56%). [13] J-M267 обычно часто встречается среди арабских бедуинов (62%), [14] евреев-ашкенази (20%) (Semino 2004), Алжира (до 35%) (Semino 2004), Ирака (28%) (Semino 2004), Тунис (до 31%), [15] Сирия (до 30%), Египет (до 20%) (Луис 2004) и Синайский полуостров . В некоторой степени частота гаплогруппы J-M267 коллапсирует на границах арабоязычных / семитскоязычных территорий с преимущественно неарабоязычными/семитскоязычными территориями, такими как Турция (9%), Иран (5%), индийские мусульмане- сунниты ( 2,3%) и шииты Северной Индии (11%) (Eaaswarkhoth 2009). Некоторые приведенные выше цифры, как правило, являются более крупными, полученными в некоторых исследованиях, тогда как меньшие цифры, полученные в других исследованиях, опускаются. Это также очень часто встречается среди евреев , особенно линии Коэним (46%) (Hammer 2009).

ISOGG заявляет, что J-M267 возник на Ближнем Востоке . Он встречается в некоторых частях Ближнего Востока , Анатолии и Северной Африки , с гораздо более редким распространением на южном средиземноморском фланге Европы и в Эфиопии .

Но не все исследования согласны с точкой происхождения. Был предложен Левант , но исследование 2010 года пришло к выводу, что гаплогруппа имела более северное происхождение, возможно, из Анатолии .

Происхождение субклада J-P58, вероятно, происходит от более северных популяций, а затем распространяется на юг, на Аравийский полуостров . Высокая вариативность J-P58 по Y-STR в этнических группах Турции , а также в северных регионах Сирии и Ирака подтверждает вывод о происхождении J-P58 в соседней восточной Анатолии . Более того, сетевой анализ гаплотипов J-P58 показывает, что некоторые популяции с низким разнообразием, такие как бедуины из Израиля , Катара , Судана и Объединенных Арабских Эмиратов , плотно сгруппированы вблизи высокочастотных гаплотипов. Это предполагает, что эффект основателя связан с расширением звездного взрыва в Аравийскую пустыню (Кьярони, 2010).

J-M172

Гаплогруппа J-M172 [Филогенетика 4] встречается в самых высоких концентрациях на Кавказе и в Плодородном полумесяце / Ираке , а также встречается по всему Средиземноморью (включая Итальянский , Балканский , Анатолийский и Пиренейский полуострова и Северную Африку ) (Di Giacomo 2003).

Самая высокая когда-либо зарегистрированная концентрация J-M172 составила 72% в северо-восточной Грузии (Насидзе, 2004). Другие высокие показатели включают ингушей 32% (Насидзе 2004), киприотов 30-37% (Капелли 2005), ливанцев 30% (Уэллс и др. 2001), ассирийцев , мандеев и арабов -иракцев 29,7% (Санчес и др. 2005) [ полный текст ] необходима ссылка ] , сирийцы и сирийцы 22,5%, курды 24%-28%, пуштуны 20-30%, [16] иранцы 23% (Абурто 2006), евреи-ашкенази 24%, палестинские арабы 16,8%-25%, евреи-сефарды 29 % [17] и североиндийские мусульмане-шииты 18%, чеченцы 26%, балкарцы 24%, ягнобцы 32%, армяне 21-24% и азербайджанцы 24-48%.

В Южной Азии уровень J2-M172 оказался значительно выше среди дравидийских каст (19%), чем среди индоевропейских каст (11%). J2-M172 и J-M410 встречаются в 21% дравидийских средних каст, за ними следуют высшие касты (18,6%) и низшие касты (14%). (Sengupta 2006) [18] Субклады M172, такие как M67 и M92, не были обнаружены ни в индийских, ни в пакистанских образцах, что также может указывать на частичное общее происхождение. (Sengupta 2006) [18]

По данным генетического исследования в Китае, проведенного Shou et al., J2-M172 с высокой частотой встречается у уйгуров (17/50 = 34%) и узбеков (7/23 = 30,4%), умеренная частота – у памирцев (5/31 = 16,1%), а также обнаружен J-M172 у ханьцев (10%) [19] и низкую частоту у югуров (2/32 = 6,3%) и монгуров (1/50 = 2,0%). Авторы также обнаружили J-M304(xJ2-M172) с низкой частотой среди русских (1/19 = 5,3%), узбеков (1/23 = 4,3%), сибе (1/32 = 3,1%), дунсянов ( 1/35 = 2,9%) и казахи (1/41 = 2,4%) в Северо-Западном Китае . [20] Только этнические меньшинства крайнего северо-запада имели гаплогруппу J в Синьцзяне, Китай. У узбеков в выборке было 30,4% J2-M172, он также был у таджиков Синьцзяна и уйгуров. [21]

Филогенетика

В филогенетике Y-хромосомы субклады являются ветвями гаплогрупп. Эти субклады также определяются однонуклеотидными полиморфизмами (SNP) или полиморфизмами уникальных событий (UEP).

Филогенетическая история

До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены при создании дерева YCC.

Филогенетические деревья

Существует несколько подтвержденных и предложенных филогенетических деревьев гаплогруппы J-M304. Научно признанным является вариант Консорциума Y-хромосомы (YCC), опубликованный в Karafet 2008 и впоследствии обновленный. Черновик дерева, показывающего новые научные достижения, предоставлен Томасом Краном из Центра геномных исследований в Хьюстоне, штат Техас . Международное общество генетической генеалогии (ISOGG) также предоставляет любительское дерево.

Черновик дерева Центра геномных исследований

Это Томас Кран из проекта предлагаемого дерева гаплогруппы J-P209 Центра геномных исследований (Krahn & FTDNA 2013). Для краткости показаны только первые три уровня субкладов.

Дерево Консорциума Y-хромосомы

Это официальное научное дерево, созданное Консорциумом Y-хромосомы (YCC). Последнее крупное обновление было в 2008 году (Карафет, 2008). Последующие обновления были ежеквартальными и двухгодичными. Текущая версия (2022 г.) представляет собой обновление 2019/2020 г.

Выдающиеся члены J

Смотрите также

Генетика

Субклады Y-ДНК J

Рекомендации

  1. ^ abcd "J YTree". Архивировано из оригинала 23 мая 2018 года . Проверено 8 апреля 2018 г.
  2. ^ Гаплогруппа J Y-ДНК. Архивировано 18 августа 2017 г. в Wayback Machine , ISOGG, 2015 г.
  3. ^ Шунеманн, Верена Дж.; и другие. (2017). «Геномы древнеегипетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримские периоды». Природные коммуникации . 8 : 15694. Бибкод : 2017NatCo...815694S. doi : 10.1038/ncomms15694. ПМЦ 5459999 . ПМИД  28556824. 
  4. ^ Вуд, Элизабет Т.; и другие. (2005). «Контрастные закономерности вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: свидетельства демографических процессов с учетом пола» (PDF) . Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 867–876. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201408 . PMID  15856073. S2CID  20279122. Архивировано (PDF) из оригинала 24 сентября 2016 г. . Проверено 24 сентября 2016 г.
  5. ^ Эль-Сибай 2009 г. сообщил о результатах нескольких исследований: Ди Джакомо 2003 г., Аль-Захери 2003 г., Флорес 2004 г., Чинниоглу 2004 г., Капелли 2005 г., Гонсалвес 2005 г., Заллуа 2008 г., Каденас 2008 г.
  6. ^ Черный 2009: J-12f2(xM267, M172)(45/63) Черный, Виктор; и другие. (2009). «За пределами Аравии - поселение на острове Сокотра, что видно по генетическому разнообразию митохондрий и Y-хромосомы» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 138 (4): 439–447. дои : 10.1002/ajpa.20960. PMID  19012329. Архивировано из оригинала (PDF) 6 октября 2016 года . Проверено 12 июня 2016 г.
  7. ^ Шен 2004: Гаплогруппа J-M304 (xM267, M172) у 1/20 евреев-ашкенази.
  8. ^ Чжун и др. (2011), Mol Biol Evol, 1 января 2011 г., том. 28 нет. 1 717-727. Архивировано 23 августа 2011 года в Wayback Machine , см. таблицу [ постоянная мертвая ссылка ] .
  9. ^ Юнусбаев 2006: Статистические данные по объединенным дагестанским этническим группам см. Подробности в статье «Дагестан» . даргинцы (91%), аварцы (67%), чамалины (67%), лезгины (58%), табассаранцы (49%), андисцы (37%), ассирийцы (29%), багвалины (21,4%))
  10. ^ "FamilyTreeDNA - Проект гаплогруппы Y-ДНК J" . Архивировано из оригинала 12 февраля 2020 года . Проверено 28 сентября 2019 г.
  11. ^
    • Альшамали, 2009 г.: 81% (84/104)
    • Каденас 2008: 45/62=72,6% J-M267
  12. ^ Каденас 2008: 42/72 = 58,3% J-M267
  13. ^ Юнусбаев 2006: даргвы (91%), аварцы (67%), чамалины (67%), лезгины (58%), табассаранцы (49%), андийцы (37%), ассирийцы (29%), багвалины (21,4%). ))статистику в совокупности дагестанских этносов см. статью о Дагестане
  14. ^ Небель 2001: 21/32.
  15. ^ 31% основано на объединенных данных.
    • Семино 2004: 30%
    • Арреди 2004: 32%
  16. ^ Хабер, Марк; Платт, Дэниел Э.; Ашрафиан Бонаб, Мазиар; Юханна, Соня С.; Сория-Эрнанц, Дэвид Ф.; Мартинес-Крус, Бегонья; Дуэи, Бушра; Гассибе-Саббах, Мишелла; Рафатпанах, Хошанг; Ганбари, Мохсен; Кит, Джон; Балановский Олег; Уэллс, Р. Спенсер; Комас, Дэвид; Тайлер-Смит, Крис; Заллуа, Пьер А. (2012). «Этнические группы Афганистана разделяют Y-хромосомное наследие, структурированное историческими событиями». ПЛОС ОДИН . 7 (3): e34288. Бибкод : 2012PLoSO...734288H. дои : 10.1371/journal.pone.0034288 . ПМЦ 3314501 . ПМИД  22470552. 
  17. ^ «Том 69» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 31 января 2017 года . Проверено 11 мая 2020 г.
  18. ^ аб Сенгупта, С; Животовский, Л.А.; Кинг, Р; и другие. (февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределения Y-хромосомы с высоким разрешением в Индии определяют как местное, так и экзогенное распространение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Являюсь. Дж. Хум. Жене . 78 (2): 202–21. дои : 10.1086/499411. ПМЦ 1380230 . ПМИД  16400607. 
  19. ^ Сюэ, 2006 г.
  20. ^ Шу и др. (2010), Распределение Y-хромосомы среди популяций на Северо-Западном Китае указывает на значительный вклад скотоводов Центральной Азии и меньшее влияние жителей Западной Евразии. Архивировано 2 апреля 2015 г. в Wayback Machine, Journal of Human Genetics (2010) 55, 314–. 322; дои:10.1038/jhg.2010.30; опубликовано онлайн 23 апреля 2010 г., Таблица 2. Распределение гаплогрупп и разнообразие Y-хромосом в 14 популяциях северо-запада. Архивировано 14 января 2015 г. в Wayback Machine.
  21. ^ Шоу, Вэй-Хуа; Цяо, Внь-Фа; Вэй, Чуан-Юй; Донг, Юн-Ли; Тан, Си-Цзе; Ши, Хун; Тан, Вэнь-Ру; Сяо, Чун-Цзе (2010). «Распределение Y-хромосомы среди популяций Северо-Западного Китая указывает на значительный вклад скотоводов Центральной Азии и меньшее влияние западных евразийцев». Джей Хум Жене . 55 (5): 314–322. дои : 10.1038/jhg.2010.30 . PMID  20414255. S2CID  23002493.
  22. ^ abcdefgh Масиамо. «Эупедия». Евпедия . Проверено 6 августа 2022 г.
  23. ^ abcd Масиамо. «Эупедия». Евпедия . Проверено 6 августа 2022 г.
  24. ^ Шунеманн, виджей; Пельтцер, А.; Вельте, Б.; Ван Пелт, WP; Молак, М.; Ван, CC; Фуртвенглер, А.; Урбан, К.; Рейтер, Э.; Низельт, К.; Тессманн, Б.; Франкен, М.; Харвати, К.; Хаак, В.; Шиффельс, С.; Краузе, Дж. (2017). «Геномы древнеегипетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримские периоды». Природные коммуникации . 8 : 15694. Бибкод : 2017NatCo...815694S. doi : 10.1038/ncomms15694. ПМЦ 5459999 . ПМИД  28556824. 
  25. ^ «Добро пожаловать в FamilyTreeDNA Discover (бета)» . FamilyTreeDNA Discover (бета) . Проверено 6 мая 2023 г.

Цитируемые работы

Журналы

Диссертации и диссертации

Блоги

Списки рассылки

Веб-сайты

Источники таблиц преобразования

дальнейшее чтение

Филогенетические заметки

  1. ^ ISOGG Y-ДНК Гаплогруппа J и ее субклады - 2016. Архивировано 18 августа 2017 года в Wayback Machine (2 февраля 2016 года).
  2. ^ В этой таблице показаны исторические названия J-M304 (также известные как J-P209 и J-12f2.1) в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 является субкладом 23 .
  3. ^ В этой таблице показаны исторические названия J-M267 и его ранее открытого и названного субклада J-M62 в опубликованной рецензируемой литературе.
  4. ^ В этой таблице показаны исторические названия J-M172 в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 является субкладом 23 .

Внешние ссылки

Викискладе есть медиафайлы, связанные с гаплогруппой J Y-ДНК .

Филогенетическое древо и карты распространения гаплогруппы J Y-ДНК

Другие