stringtranslate.com

Гомеобокс

Гомеобокс — это последовательность ДНК длиной около 180 пар оснований , которая регулирует крупномасштабные анатомические особенности на ранних стадиях эмбрионального развития. Мутации в гомеобоксе могут изменить масштабные анатомические особенности взрослого организма.

Гомеобоксы обнаружены в генах , которые участвуют в регуляции анатомического развития ( морфогенеза ) у животных , грибов , растений и многочисленных одноклеточных эукариот . [2] Гены гомеобокса кодируют гомеодоменные белковые продукты, которые являются факторами транскрипции , имеющими характерную структуру складки белка , которая связывает ДНК для регулирования экспрессии генов-мишеней. [3] [4] [2] Гомеодоменные белки регулируют экспрессию генов и дифференцировку клеток на ранних стадиях эмбрионального развития, поэтому мутации в генах гомеобокса могут вызывать нарушения развития. [5]

Гомеозис — это термин, придуманный Уильямом Бейтсоном для описания полной замены отдельной части тела другой частью тела, например антеннопедией — заменой антенны на голове плодовой мухи ногами. [6] Приставка «гомео-» в словах «гомеобокс» и «гомеодомен» происходит от этого мутационного фенотипа , который наблюдается, когда некоторые из этих генов мутируют у животных . Гомеобоксный домен был впервые идентифицирован в ряде гомеотических и сегментационных белков дрозофилы , но теперь известно, что он хорошо консервативен у многих других животных, включая позвоночных . [3] [7] [8]

Открытие

У дрозофилы с мутантным фенотипом антеннепедии наблюдается гомеотическая трансформация усиков в ножкообразные структуры на голове.

Существование генов гомеобокса было впервые обнаружено у дрозофилы путем выделения гена, ответственного за гомеотическую трансформацию, при которой из головы вместо ожидаемых усиков вырастают ноги. Уолтер Геринг идентифицировал ген антеннепедии , который вызвал этот гомеотический фенотип. [9] Анализ антеннопедии показал, что этот ген содержит последовательность из 180 пар оснований, которая кодирует ДНК-связывающий домен, который Уильям МакГиннис назвал «гомеобоксом». [10] О существовании дополнительных генов дрозофилы , содержащих последовательность гомеобокса антеннопедии , независимо сообщили Эрнст Хафен, Майкл Левайн , Уильям Макгиннис и Уолтер Якоб Геринг из Базельского университета в Швейцарии , а также Мэтью П. Скотт и Эми Вайнер из Университета Индианы в Блумингтон в 1984 году. [11] [12] Выделение гомологичных генов Эдвардом де Робертисом и Уильямом Макгиннисом показало, что многочисленные гены различных видов содержат гомеобокс. [13] [14] Последующие филогенетические исследования, детализирующие эволюционные взаимоотношения между генами, содержащими гомеобокс, показали, что эти гены присутствуют у всех двусторонних животных.

Гомеодоменная структура

Характерная складка белка гомеодомена состоит из домена длиной 60 аминокислот , состоящего из трех альфа-спиралей. Ниже показан консенсусный гомеодомен (цепь ~60 аминокислот): [15]

 Спираль 1 Спираль 2 Спираль 3/4 ______________ __________ _________________RRRKRTAYTRYQLLELEKEFHFNRYLTRRRRRIELAHSLNLTERHIKIWFQNRRMKWKKEN....|....|....|....|....|....|....|....|....|....| ....|....| 10 20 30 40 50 60
Комплекс гомеодомен-ДНК vnd/NK-2. Спираль 3 гомеодомена связывается с большой бороздкой ДНК, а N-концевое плечо связывается с малой бороздкой по аналогии с другими комплексами гомеодомен-ДНК.

Спираль 2 и спираль 3 образуют так называемую структуру «спираль-виток-спираль» (HTH), в которой две альфа-спирали соединены короткой петлевой областью. Две N-концевые спирали гомеодомена антипараллельны , а более длинная С-концевая спираль примерно перпендикулярна осям, установленным первыми двумя. Именно эта третья спираль напрямую взаимодействует с ДНК посредством ряда водородных связей и гидрофобных взаимодействий, а также косвенных взаимодействий через молекулы воды, которые происходят между конкретными боковыми цепями и открытыми основаниями внутри большой бороздки ДНК. [7]

Гомеодоменные белки обнаружены у эукариот . [2] Благодаря мотиву HTH они имеют ограниченное сходство последовательностей и структурное сходство с прокариотическими факторами транскрипции, [16] такими как фаговые белки лямбда , которые изменяют экспрессию генов у прокариот . Мотив HTH демонстрирует некоторое сходство последовательностей, но сходную структуру в широком диапазоне ДНК-связывающих белков (например, белков -кронов и репрессоров , белков гомеодомена и т. д.). Одно из принципиальных различий между мотивами HTH в этих разных белках возникает из-за стереохимической потребности в глицине , который необходим, чтобы избежать стерического взаимодействия бета-углерода с основной цепью: для кро- и репрессорных белков глицин, по-видимому, обязателен. , тогда как для многих гомеотических и других ДНК-связывающих белков требования смягчены.

Специфичность последовательности

Гомеодомены могут связываться как специфично, так и неспецифически с B-ДНК, при этом С-концевая спираль узнавания выравнивается в большой бороздке ДНК, а неструктурированный пептидный «хвост» на N-конце выравнивается в малой бороздке. Спираль узнавания и межспиральные петли богаты остатками аргинина и лизина , которые образуют водородные связи с основной цепью ДНК. Консервативные гидрофобные остатки в центре спирали узнавания помогают стабилизировать упаковку спирали. Гомеодоменные белки отдают предпочтение последовательности ДНК 5'-ТААТ-3'; независимое от последовательности связывание происходит со значительно более низкой аффинностью. Специфичности одного гомеодоменного белка обычно недостаточно для распознавания конкретных промоторов гена-мишени, что делает связывание кофактора важным механизмом контроля специфичности последовательности связывания и экспрессии гена-мишени. Для достижения более высокой целевой специфичности гомеодоменные белки образуют комплексы с другими факторами транскрипции для распознавания промоторной области конкретного гена-мишени.

Биологическая функция

Гомеодоменные белки функционируют как факторы транскрипции благодаря свойствам связывания ДНК консервативного мотива HTH. Гомеодоменные белки считаются главными контролирующими генами, а это означает, что один белок может регулировать экспрессию многих генов-мишеней. Гомеодоменные белки управляют формированием осей и структур тела во время раннего эмбрионального развития . [17] Многие гомеодоменные белки индуцируют клеточную дифференцировку, инициируя каскады корегулируемых генов, необходимых для производства отдельных тканей и органов . Другие белки этого семейства, такие как NANOG, участвуют в поддержании плюрипотентности и предотвращении дифференцировки клеток.

Регулирование

Hox-гены и связанные с ними микроРНК являются высококонсервативными главными регуляторами развития с жестким тканеспецифичным пространственно-временным контролем. Известно, что эти гены не регулируются при некоторых видах рака и часто контролируются метилированием ДНК. [18] [19] Регуляция Hox-генов очень сложна и включает в себя реципрокные взаимодействия, в основном ингибирующие. Известно, что дрозофила использует комплексы полисот и триторакс для поддержания экспрессии Hox-генов после подавления генов парного правила и разрыва, которое происходит во время личиночного развития. Белки группы Polycomb могут заглушать Hox-гены путем модуляции структуры хроматина . [20]

Мутации

Мутации в генах гомеобокса могут вызывать легко видимые фенотипические изменения в идентичности сегментов тела, такие как мутантные фенотипы Antennapedia и Bithorax у дрозофилы . Дупликация генов гомеобокса может производить новые сегменты тела, и такие дупликации, вероятно, сыграли важную роль в эволюции сегментированных животных.

Эволюция

Сам гомеобокс мог возникнуть из несвязывающего ДНК трансмембранного домена на С-конце фермента MraY. Это основано на метагеномных данных, полученных от переходного архея Lokiarchaeum , который считается прокариотом, наиболее близким к предку всех эукариот. [21] [ ненадежный источник? ]

Филогенетический анализ последовательностей генов гомеобокса и структур белков гомеодомена позволяет предположить, что последний общий предок растений, грибов и животных имел по крайней мере два гена гомеобокса. [22] Молекулярные данные показывают, что некоторое ограниченное количество Hox-генов существовало у Cnidaria еще до появления первых настоящих Bilatera , что делает эти гены допалеозойскими . [23] Принято считать, что три основных кластера животных класса ANTP, Hox, ParaHox и NK (MetaHox), являются результатом сегментных дупликаций. В результате первого дублирования были созданы MetaHox и ProtoHox, последний из которых позже дублировался в Hox и ParaHox. Сами кластеры были созданы путем тандемной дупликации одного гомеобоксного гена ANTP-класса. [24] Дупликация генов с последующей неофункционализацией ответственна за многие гомеобоксные гены, обнаруженные у эукариот. [25] [26] Сравнение гомеобоксных генов и кластеров генов использовалось для понимания эволюции структуры генома и морфологии тела у многоклеточных животных. [27]

Типы генов гомеобокса

Hox-гены

Экспрессия гена Hox у Drosophila melanogaster .

Hox-гены представляют собой наиболее широко известное подмножество гомеобоксных генов. Это важные гены многоклеточных животных , которые определяют идентичность эмбриональных областей вдоль передне-задней оси. [28] Первый Hox-ген позвоночных был выделен у Xenopus Эдвардом Де Робертисом и его коллегами в 1984 году. [29] Основной интерес к этому набору генов проистекает из их уникального поведения и расположения в геноме. Hox-гены обычно встречаются в организованном кластере. Линейный порядок Hox-генов внутри кластера напрямую коррелирует с порядком их экспрессии как во времени, так и в пространстве во время развития. Это явление называется коллинеарностью.

Мутации в этих гомеозисных генах вызывают смещение сегментов тела во время эмбрионального развития. Это называется эктопия . Например, когда один ген теряется, сегмент развивается в более передний, а мутация, приводящая к усилению функции, заставляет сегмент развиваться в более задний. Известными примерами являются Antennapedia и bithorax у Drosophila , которые могут вызывать развитие ног вместо усиков и развитие удвоенной грудной клетки соответственно. [30]

У позвоночных четыре кластера паралогов частично дублируют функции, но также приобрели несколько производных функций. Например, HoxA и HoxD определяют идентичность сегмента вдоль оси конечности . [31] [32] Конкретные члены семейства Hox участвуют в ремоделировании сосудов, ангиогенезе и заболеваниях путем организации изменений в деградации матрикса, интегринов и компонентов ECM. [33] HoxA5 участвует в атеросклерозе. [34] [35] HoxD3 и HoxB3 представляют собой проинвазивные ангиогенные гены, которые активируют интегрины b3 и a5 и Efna1 в ЭК соответственно. [36] [37] [38] [39] HoxA3 индуцирует миграцию эндотелиальных клеток (EC) путем активации MMP14 и uPAR. И наоборот, HoxD10 и HoxA5 обладают противоположным эффектом, подавляя миграцию ЭК и ангиогенез, а также стабилизируя слипчивые соединения за счет повышения регуляции TIMP1/понижения uPAR и MMP14, а также за счет повышения регуляции Tsp2/понижения VEGFR2, Efna1, Hif1alpha и COX-2 соответственно. [40] [41] HoxA5 также активирует опухолевый супрессор p53 и Akt1 за счет подавления PTEN. [42] Было показано, что подавление HoxA5 замедляет рост гемангиомы . [43] HoxA5 оказывает далеко идущее влияние на экспрессию генов, вызывая активацию около 300 генов при его индукции в клеточных линиях рака молочной железы. [43] Сверхэкспрессия домена трансдукции белка HoxA5 предотвращает воспаление, проявляющееся ингибированием TNF-индуцируемого связывания моноцитов с HUVEC. [44] [45]

гены ЛИМ

Гены LIM (названные по начальным буквам названий трех белков, в которых характерный домен был впервые идентифицирован) кодируют два цистеиновых и богатых гистидином доменов LIM из 60 аминокислот и гомеодомен. Домены LIM участвуют в белок-белковых взаимодействиях и могут связывать молекулы цинка. Белки домена LIM обнаружены как в цитозоле, так и в ядре. Они участвуют в ремоделировании цитоскелета, в местах фокальной адгезии, в качестве каркасов для белковых комплексов и в качестве факторов транскрипции. [46]

Гены Пакса

Большинство генов Pax содержат гомеобокс и парный домен, который также связывает ДНК для повышения специфичности связывания, хотя некоторые гены Pax полностью или частично потеряли последовательность гомеобокса. [47] Гены Pax участвуют в сегментации эмбрионов , развитии нервной системы , формировании лобных полей глаза , развитии скелета и формировании структур лица. Pax 6 является главным регулятором развития глаз, поэтому этот ген необходим для развития зрительного пузырька и последующих структур глаза. [48]

гены ПОУ

Белки, содержащие область POU, состоят из гомеодомена и отдельного структурно гомологичного домена POU, который содержит два мотива спираль-поворот-спираль и также связывает ДНК. Два домена связаны гибкой петлей, которая достаточно длинна, чтобы растягиваться вокруг спирали ДНК, позволяя двум доменам связываться на противоположных сторонах целевой ДНК, вместе покрывая сегмент из восьми оснований с консенсусной последовательностью 5'-ATGCAAAT-3. '. Отдельные домены белков POU связываются с ДНК лишь слабо, но при связывании обладают сильным сродством к последовательностям. Домен POU сам по себе имеет значительное структурное сходство с репрессорами, экспрессируемыми в бактериофагах , особенно в фаге лямбда .

Гены гомеобокса растений

Как и у животных, гены гомеобокса растений кодируют типичный ДНК-связывающий гомеодмен длиной 60 аминокислот или, в случае TALE (расширение трех аминокислотных петель), гены гомеобокса - атипичный гомеодомен, состоящий из 63 аминокислот. В соответствии с их консервативной структурой интрон-экзон и уникальной архитектурой кодомена они были сгруппированы в 14 отдельных классов: HD-ZIP I–IV, BEL, KNOX, PLINC, WOX, PHD, DDT, NDX, LD, SAWADEE и PINTOX. [25] Консервативность кодоменов предполагает общее эукариотическое происхождение белков TALE [49] и не-TALE гомеодоменов. [50]

Гены гомеобокса человека

Hox-гены у человека организованы в четыре хромосомных кластера:

Гены ParaHox аналогично обнаруживаются в четырех областях. К ним относятся CDX1 , CDX2 , CDX4 ; ГСХ1, ГСХ2; и PDX1 . Другие гены, считающиеся Hox-подобными, включают EVX1 , EVX2; ГБХ1, ГБХ2 ; МЕОКС1 , МЕОК2 ; и MNX1 . NK-подобные (NKL) гены, некоторые из которых считаются «MetaHox», сгруппированы с Hox-подобными генами в большую ANTP-подобную группу. [51] [52]

У людей есть семейство «гомеобоксов без дистального отдела» : DLX1 , DLX2 , DLX3 , DLX4 , DLX5 и DLX6 . Гены Dlx участвуют в развитии нервной системы и конечностей. [53] Их считают подмножеством NK-подобных генов. [51]

Человеческие гомеобоксные гены TALE (расширение трех аминокислотных петель) для «атипичного» гомеодомена состоят из 63, а не из 60 аминокислот: IRX1 , IRX2 , IRX3 , IRX4 , IRX5 , IRX6 ; МЭИС1 , МЭИС2 , МЭИС3; МКХ ; АТС1 , АТС2 , АТС3 , АТС4; ПКНОКС1 , ПКНОКС2 ; TGIF1 , TGIF2 , TGIF2LX, TGIF2LY. [51]

Кроме того, у человека имеются следующие гомеобоксные гены и белки: [51]

  1. ^ Сгруппированы как Lmx 1/5, 2/9, 3/4 и 6/8.
  2. ^ Сгруппированы как шесть 1/2, 3/6 и 4/5.
  3. ^ Сомнительно, согласно [51]
  4. ^ Гены Пакса . Сгруппированы как Pax2/5/8, Pax3/7 и Pax4/6.
  5. ^ Нк4.
  6. ^ Нк5.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ PDB : 1AHD ​; Биллетер М., Цянь Ю.К., Оттинг Г., Мюллер М., Геринг В., Вютрих К. (декабрь 1993 г.). «Определение структуры раствора ядерного магнитного резонанса комплекса гомеодомен-ДНК Antennapedia». Журнал молекулярной биологии . 234 (4): 1084–93. дои : 10.1006/jmbi.1993.1661. ПМИД  7903398.
  2. ^ abc Bürglin TR, Affolter M (июнь 2016 г.). «Гомеодоменные белки: обновление». Хромосома . 125 (3): 497–521. дои : 10.1007/s00412-015-0543-8. ПМЦ 4901127 . ПМИД  26464018. 
  3. ^ аб Геринг WJ (август 1992 г.). «Гомеобокс в перспективе». Тенденции биохимических наук . 17 (8): 277–80. дои : 10.1016/0968-0004(92)90434-B. ПМИД  1357790.
  4. ^ Геринг WJ (декабрь 1993 г.). «Изучение гомеобокса». Джин . 135 (1–2): 215–21. дои : 10.1016/0378-1119(93)90068-E. ПМИД  7903947.
  5. ^ Ссылка GH. «Гомеобоксы». Домашний справочник по генетике . Архивировано из оригинала 21 декабря 2019 г. Проверено 20 ноября 2019 г.
  6. ^ Материалы для изучения изменчивости, рассмотренные с особым вниманием к разрыву в происхождении видов. Уильям Бейтсон 1861–1926. Лондон: Macmillan 1894 xv, 598 стр.
  7. ^ аб Шофилд ПН (1987). «Шаблоны, головоломки и парадигмы - Загадка гомеобокса». Тенденции нейробиологии . 10 : 3–6. дои : 10.1016/0166-2236(87)90113-5. S2CID  53188259.
  8. ^ Скотт MP, Tamkun JW, Hartzell GW (июль 1989 г.). «Структура и функции гомеодомена». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Обзоры о раке . 989 (1): 25–48. дои : 10.1016/0304-419x(89)90033-4. ПМИД  2568852.
  9. ^ Гарбер Р.Л., Куроива А., Геринг В.Дж. (1983). «Геномные и кДНК-клоны гомеотического локуса Antennapedia у дрозофилы». Журнал ЭМБО . 2 (11): 2027–36. doi :10.1002/j.1460-2075.1983.tb01696.x. ПМК 555405 . ПМИД  6416827. 
  10. ^ «Вальтер Якоб Геринг (1939-2014) | Энциклопедия проекта «Эмбрион»» . «эмбрион.asu.edu» . Архивировано из оригинала 09.12.2019 . Проверено 9 декабря 2019 г.
  11. ^ Макгиннис В., Левин М.С., Хафен Э., Куроива А., Геринг В.Дж. (1984). «Консервативная последовательность ДНК в гомеотических генах Drosophila Antennapedia и комплексов биторакса». Природа . 308 (5958): 428–33. Бибкод : 1984Natur.308..428M. дои : 10.1038/308428a0. PMID  6323992. S2CID  4235713.
  12. ^ Скотт член парламента, Вайнер AJ (июль 1984 г.). «Структурные отношения между генами, которые контролируют развитие: гомология последовательностей между локусами Antennapedia, Ultrabithorax и fushi tarazu дрозофилы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 81 (13): 4115–9. Бибкод : 1984PNAS...81.4115S. дои : 10.1073/pnas.81.13.4115 . ПМЦ 345379 . ПМИД  6330741. 
  13. ^ Карраско А.Э., Макгиннис В., Геринг В.Дж., Де Робертис Э.М. (1984). «Клонирование гена X. laevis, экспрессированного во время раннего эмбриогенеза, кодирующего пептидную область, гомологичную гомеотическим генам дрозофилы». Клетка . 37 (2): 409–414. дои : 10.1016/0092-8674(84)90371-4. PMID  6327066. S2CID  30114443.
  14. ^ Макгиннис В., Гарбер Р.Л., Вирц Дж., Куроива А., Геринг В.Дж. (июнь 1984 г.). «Гомологичная белково-кодирующая последовательность в гомеозисных генах дрозофилы и ее сохранение у других многоклеточных животных». Клетка . 37 (2): 403–8. дои : 10.1016/0092-8674(84)90370-2. PMID  6327065. S2CID  40456645. Архивировано из оригинала 04 мая 2021 г. Проверено 9 декабря 2019 г.
  15. ^ Бюрглин ТР. «Страница гомеобокса» (gif) . Каролинский институт. Архивировано из оригинала 21 июля 2011 г. Проверено 30 января 2010 г.
  16. ^ "Суперсемейство CATH 1.10.10.60" . www.cathdb.info . Архивировано из оригинала 9 августа 2017 года . Проверено 27 марта 2018 г.
  17. ^ Корсетти М.Т., Бриата П., Сансеверино Л., Дага А., Айролди И., Симеоне А. и др. (сентябрь 1992 г.). «Дифференциальные свойства связывания ДНК трех гомеодоменовых белков человека». Исследования нуклеиновых кислот . 20 (17): 4465–72. дои : 10.1093/нар/20.17.4465. ПМК 334173 . ПМИД  1357628. 
  18. ^ Данн Дж., Табет С., Джо Х. (июль 2015 г.). «Потокозависимое метилирование эпигенетической ДНК при экспрессии эндотелиальных генов и атеросклерозе». Атеросклероз, тромбоз и сосудистая биология . 35 (7): 1562–9. дои : 10.1161/ATVBAHA.115.305042. ПМЦ 4754957 . ПМИД  25953647. 
  19. ^ Бхатлекар С., Филдс Дж.З., Боман Б.М. (август 2014 г.). «НОХ-гены и их роль в развитии рака человека». Журнал молекулярной медицины . 92 (8): 811–23. дои : 10.1007/s00109-014-1181-y. PMID  24996520. S2CID  17159381.
  20. ^ Портозо М, Кавалли Дж (2008). «Роль РНКи и некодирующих РНК в опосредованном Polycomb контроле экспрессии генов и геномном программировании». РНК и регуляция экспрессии генов: скрытый уровень сложности. Кайстер Академик Пресс. ISBN 978-1-904455-25-7. Архивировано из оригинала 2 января 2012 г. Проверено 27 февраля 2008 г.
  21. ^ Бозоргмер Дж.Х. (2018). «Происхождение гомеобокса на C-конце MraY у Lokiarchaea». дои : 10.13140/RG.2.2.35941.65760. Архивировано из оригинала 4 мая 2021 г. Получено 26 октября 2018 г. - через ResearchGate . {{cite journal}}: Требуется цитировать журнал |journal=( помощь )
  22. ^ Бхаратан Г., Янссен Б.Дж., Келлог Э.А., Синха Н. (декабрь 1997 г.). «Дублировались ли гомеодоменные белки до возникновения покрытосеменных, грибов и многоклеточных растений?». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (25): 13749–53. Бибкод : 1997PNAS...9413749B. дои : 10.1073/pnas.94.25.13749 . JSTOR  43805. PMC 28378 . ПМИД  9391098. 
  23. ^ Райан Дж. Ф., Мацца М. Е., Панг К., Матус Д. К., Баксеванис А. Д., Мартиндейл М. К. и др. (январь 2007 г.). «Добилатерийское происхождение кластера Hox и кода Hox: свидетельства актинии Nematostella vectensis». ПЛОС ОДИН . 2 (1): е153. Бибкод : 2007PLoSO...2..153R. дои : 10.1371/journal.pone.0000153 . ПМЦ 1779807 . ПМИД  17252055. 
  24. ^ Гарсия-Фернандес Дж. (декабрь 2005 г.). «Происхождение и эволюция кластеров генов гомеобокса». Обзоры природы Генетика . 6 (12): 881–92. дои : 10.1038/nrg1723. PMID  16341069. S2CID  42823485.
  25. ^ аб Мукерджи К., Броккьери Л., Бурглин Т.Р. (декабрь 2009 г.). «Комплексная классификация и эволюционный анализ генов гомеобокса растений». Молекулярная биология и эволюция . 26 (12): 2775–94. дои : 10.1093/molbev/msp201. ПМК 2775110 . ПМИД  19734295. 
  26. ^ Голландия PW (2013). «Эволюция генов гомеобокса». Междисциплинарные обзоры Wiley: Биология развития . 2 (1): 31–45. дои : 10.1002/wdev.78. PMID  23799629. S2CID  44396110.
  27. ^ Ферье DE (2016). «Эволюция кластеров генов гомеобокса у животных: гига-кластер и первичная и вторичная кластеризация». Границы экологии и эволюции . 4 . дои : 10.3389/fevo.2016.00036 . hdl : 10023/8685 . ISSN  2296-701X.
  28. ^ Алонсо CR (ноябрь 2002 г.). «Hox-белки: формирование частей тела путем активации локализованной гибели клеток». Современная биология . 12 (22): Р776-8. Бибкод : 2002CBio...12.R776A. дои : 10.1016/S0960-9822(02)01291-5 . PMID  12445403. S2CID  17558233.
  29. ^ Карраско А.Э., Макгиннис В., Геринг В.Дж., Де Робертис Э.М. (июнь 1984 г.). «Клонирование гена X. laevis, экспрессируемого во время раннего эмбриогенеза, кодирующего пептидную область, гомологичную гомеотическим генам дрозофилы». Клетка . 37 (2): 409–14. дои : 10.1016/0092-8674(84)90371-4. PMID  6327066. S2CID  30114443.
  30. ^ Шнойвли С., Клеменц Р., Геринг В.Дж. (1987). «Изменение плана тела дрозофилы путем эктопической экспрессии гомеотического гена Antennapedia». Природа . 325 (6107): 816–8. Бибкод : 1987Natur.325..816S. дои : 10.1038/325816a0. PMID  3821869. S2CID  4320668.
  31. ^ Фроменталь-Рамен С., Варот X, Мессадек Н., ЛеМёр М., Долле П., Шамбон П. (октябрь 1996 г.). «Hoxa-13 и Hoxd-13 играют решающую роль в формировании паттерна автопода конечностей». Разработка . 122 (10): 2997–3011. дои : 10.1242/dev.122.10.2997. ПМИД  8898214.
  32. ^ Закани Дж., Дюбул Д. (апрель 1999 г.). «Hox-гены в развитии и эволюции пальцев». Исследования клеток и тканей . 296 (1): 19–25. дои : 10.1007/s004410051262. PMID  10199961. S2CID  3192774.
  33. ^ Горски Д.Х., Уолш К. (ноябрь 2000 г.). «Роль генов гомеобокса в ремоделировании сосудов и ангиогенезе». Исследование кровообращения . 87 (10): 865–72. дои : 10.1161/01.res.87.10.865 . ПМИД  11073881.
  34. ^ Данн Дж., Табет С., Джо Х. (июль 2015 г.). «Потокозависимое метилирование эпигенетической ДНК при экспрессии эндотелиальных генов и атеросклерозе». Атеросклероз, тромбоз и сосудистая биология . 35 (7): 1562–9. дои : 10.1161/ATVBAHA.115.305042. ПМЦ 4754957 . ПМИД  25953647. 
  35. ^ Данн Дж., Симмонс Р., Табет С., Джо Х. (октябрь 2015 г.). «Роль эпигенетики в реакции эндотелиальных клеток на стресс сдвига и атеросклерозе». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 67 : 167–76. doi :10.1016/j.biocel.2015.05.001. ПМЦ 4592147 . ПМИД  25979369. 
  36. ^ Будро Н., Эндрюс С., Среброу А., Раванпей А., Череш Д.А. (октябрь 1997 г.). «Индукция ангиогенного фенотипа Hox D3». Журнал клеточной биологии . 139 (1): 257–64. дои : 10.1083/jcb.139.1.257. ПМК 2139816 . ПМИД  9314544. 
  37. ^ Будро, штат Нью-Джерси, Варнер Дж. А. (февраль 2004 г.). «Гомеобоксный фактор транскрипции Hox D3 способствует экспрессии и функции интегрина альфа5бета1 во время ангиогенеза». Журнал биологической химии . 279 (6): 4862–8. дои : 10.1074/jbc.M305190200 . ПМИД  14610084.
  38. ^ Майерс С., Шарбоно А., Будро Н. (январь 2000 г.). «Гомеобокс B3 способствует капиллярному морфогенезу и ангиогенезу». Журнал клеточной биологии . 148 (2): 343–51. дои : 10.1083/jcb.148.2.343. ПМК 2174277 . ПМИД  10648567. 
  39. ^ Чен Ю, Сюй Б, Ардериу Г, Хашимото Т, Янг ВЛ, Будро Н и др. (ноябрь 2004 г.). «Ретровирусная доставка гена гомеобокса D3 индуцирует церебральный ангиогенез у мышей». Журнал церебрального кровотока и метаболизма . 24 (11): 1280–7. дои : 10.1097/01.WCB.0000141770.09022.AB . ПМИД  15545924.
  40. ^ Майерс С., Шарбоно А., Чунг И., Хэнкс Д., Будро Н. (декабрь 2002 г.). «Устойчивая экспрессия гомеобокса D10 ингибирует ангиогенез». Американский журнал патологии . 161 (6): 2099–109. дои : 10.1016/S0002-9440(10)64488-4. ПМК 1850921 . ПМИД  12466126. 
  41. ^ Мейс К.А., Хансен С.Л., Майерс С., Янг Д.М., Будро Н. (июнь 2005 г.). «HOXA3 индуцирует миграцию клеток в эндотелиальных и эпителиальных клетках, способствуя ангиогенезу и заживлению ран». Журнал клеточной науки . 118 (Часть 12): 2567–77. дои : 10.1242/jcs.02399 . ПМИД  15914537.
  42. ^ Роудс К., Ардериу Г., Шарбоно А., Хансен С.Л., Хоффман В., Будро Н. (2005). «Роль Hox A5 в регуляции ангиогенеза и формирования сосудистого рисунка». Лимфатические исследования и биология . 3 (4): 240–52. дои : 10.1089/lrb.2005.3.240. ПМИД  16379594.
  43. ^ ab Arderiu G, Cuevas I, Chen A, Carrio M, East L, Boudreau NJ (2007). «HoxA5 стабилизирует слипчивые соединения за счет увеличения Akt1». Адгезия и миграция клеток . 1 (4): 185–95. дои : 10.4161/cam.1.4.5448. ПМК 2634105 . ПМИД  19262140. 
  44. ^ Чжу Ю., Куэвас И.К., Габриэль Р.А., Су Х., Нишимура С., Гао П. и др. (июнь 2009 г.). «Восстановление экспрессии транскрипционного фактора HoxA5 подавляет рост экспериментальных гемангиом головного мозга». Журнал невропатологии и экспериментальной неврологии . 68 (6): 626–32. doi : 10.1097/NEN.0b013e3181a491ce. ПМЦ 2728585 . ПМИД  19458547. 
  45. ^ Чен Х., Рубин Э., Чжан Х., Чунг С., Цзе CC, Гарретт Э. и др. (май 2005 г.). «Идентификация транскрипционных мишеней HOXA5». Журнал биологической химии . 280 (19): 19373–80. дои : 10.1074/jbc.M413528200 . ПМИД  15757903.
  46. ^ Кадрмас Дж.Л., Бекерле MC (ноябрь 2004 г.). «Домен LIM: от цитоскелета к ядру». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 5 (11): 920–31. дои : 10.1038/nrm1499. PMID  15520811. S2CID  6030950.
  47. ^ Грусс П., Вальтер С. (май 1992 г.). «Пакс в разработке». Клетка . 69 (5): 719–22. дои : 10.1016/0092-8674(92)90281-G. PMID  1591773. S2CID  44613005. Архивировано из оригинала 2 мая 2021 г. Проверено 11 декабря 2019 г.
  48. ^ Вальтер С., Грусс П. (декабрь 1991 г.). «Pax-6, парный ген мышиной коробки, экспрессируется в развивающейся ЦНС». Разработка . 113 (4): 1435–49. дои : 10.1242/dev.113.4.1435. ПМИД  1687460.
  49. ^ Бюрглин Т.Р. (ноябрь 1997 г.). «Анализ генов гомеобокса суперкласса TALE (MEIS, PBC, KNOX, Iroquois, TGIF) выявил новый домен, консервативный между растениями и животными». Исследования нуклеиновых кислот . 25 (21): 4173–80. дои : 10.1093/нар/25.21.4173. ПМК 147054 . ПМИД  9336443. 
  50. ^ Дерелле Р., Лопес П., Ле Гаядер Х., Мануэль М. (2007). «Гомеодоменные белки принадлежат к древнему молекулярному набору эукариот». Эволюция и развитие . 9 (3): 212–9. дои : 10.1111/j.1525-142X.2007.00153.x. PMID  17501745. S2CID  9530210.
  51. ^ abcde Holland PW, Бут HA, Бруфорд EA (октябрь 2007 г.). «Классификация и номенклатура всех гомеобоксных генов человека». БМК Биология . 5 (1): 47. дои : 10.1186/1741-7007-5-47 . ПМК 2211742 . ПМИД  17963489. 
  52. ↑ Кулиер Ф, Попович С, Вилле Р, Бирнбаум Д (15 декабря 2000 г.). «Кластеры генов MetaHox». Журнал экспериментальной зоологии . 288 (4): 345–351. doi :10.1002/1097-010X(20001215)288:4<345::AID-JEZ7>3.0.CO;2-Y. ПМИД  11144283.
  53. ^ Краус П., Луфкин Т. (июль 2006 г.). «Гомеобоксный ген Dlx, контролирующий конечности и черепно-лицевое развитие млекопитающих». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 140 (13): 1366–74. doi : 10.1002/ajmg.a.31252. PMID  16688724. S2CID  32619323.

дальнейшее чтение

Внешние ссылки

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR001356.