В биологии таксономический ранг — это относительный уровень группы организмов ( таксона ) в предковой или наследственной иерархии . Общая система биологической классификации ( таксономии ) состоит из вида , рода , семейства , порядка , класса , типа , царства и домена . В то время как старые подходы к таксономической классификации были феноменологическими, формируя группы на основе сходства внешнего вида, органической структуры и поведения, методы, основанные на генетическом анализе, открыли дорогу кладистике , методу классификации животных и растений в соответствии с долей измеримых или схожих характеристик, которые у них есть общих. Предполагается, что чем выше доля характеристик, которыми обладают два организма, тем позже они оба произошли от общего предка.
Определенный ранг включает в себя меньше общих категорий, то есть более конкретные описания форм жизни. Выше него каждый ранг классифицируется в пределах более общих категорий организмов и групп организмов, связанных друг с другом через наследование черт или особенностей от общих предков. Ранг любого вида и описание его рода являются базовыми ; это означает, что для идентификации конкретного организма обычно не требуется указывать ранги, отличные от этих первых двух. [1]
Рассмотрим конкретный вид, рыжую лисицу , Vulpes vulpes : видовое название или видовой эпитет vulpes (маленькая v ) идентифицирует конкретный вид в роде Vulpes (большая V ), который включает всех «истинных» лисиц. Все их близкие родственники принадлежат к семейству Canidae , которое включает собак, волков, шакалов и всех лисиц; следующий более высокий основной ранг, отряд Carnivora , включает псовых (медведей, тюленей, ласок, скунсов, енотов и всех упомянутых выше) и кошачьих (кошки, циветты, гиены, мангусты). Хищные — это одна из групп мохнатых, теплокровных, кормящих грудью членов класса Mammalia , которые классифицируются среди животных с хордой в типе Chordata , и вместе с ними среди всех животных в царстве Animalia . Наконец, на самом высоком уровне все они объединены со всеми другими организмами, обладающими клеточными ядрами, в домене Эукариоты .
Международный кодекс зоологической номенклатуры определяет ранг как: «Уровень таксона в таксономической иерархии для номенклатурных целей (например, все семейства для номенклатурных целей находятся в одном и том же ранге, который находится между надсемейством и подсемейством)». [2]
Главные ряды
В своих знаковых работах, таких как Systema Naturae , Карл Линней использовал шкалу ранжирования, ограниченную царством, классом, отрядом, родом, видом и одним рангом ниже вида. Сегодня номенклатура регулируется номенклатурными кодексами . Существует семь основных таксономических рангов: царство, тип или отдел, класс, отряд, семейство, род и вид. Кроме того, домен (предложенный Карлом Вёзе ) теперь широко используется в качестве фундаментального ранга, хотя он не упоминается ни в одном из номенклатурных кодексов и является синонимом доминиона ( лат . dominium ), введенного Муром в 1974 году. [3] [4]
Таксону обычно присваивается ранг, когда ему дается его официальное название. Основные ранги — вид и род. Когда организму дается название вида, он присваивается роду, а название рода является частью названия вида.
Видовое название также называется биномиальным , то есть двучленным названием. Например, зоологическое название человеческого вида — Homo sapiens . Обычно оно выделяется курсивом в печати или подчеркивается, когда курсив недоступен. В этом случае Homo — это родовое название, и оно пишется с заглавной буквы; sapiens указывает на вид, и оно не пишется с заглавной буквы. Хотя это не всегда используется, некоторые виды включают в себя видовой эпитет. Например, современные люди — Homo sapiens sapiens или H. sapiens sapiens .
Международный кодекс зоологической номенклатуры делит названия на «названия групп семейств», «названия групп родов» и «названия групп видов». В Кодексе четко указаны следующие ранги для этих категорий: [5] : §29–31
Правила Кодекса применяются к рангам от надсемейства до подвида, и только в некоторой степени к тем, кто выше ранга надсемейства. Среди «названий родовой группы» и «названий видовой группы» официально не допускаются никакие дальнейшие ранги. Зоологи иногда используют дополнительные термины, такие как видовая группа , видовая подгруппа , видовой комплекс и надвид для удобства в качестве дополнительных, но неофициальных рангов между уровнями подрода и вида в таксонах со многими видами, например, род Drosophila . (Обратите внимание на потенциально запутанное использование «видовой группы» как категории рангов, так и самого неофициального ранга. [ требуется ссылка ] )
На более высоких рангах (семейство и выше) более низкий уровень может быть обозначен добавлением префикса « инфра », означающего «ниже », к рангу. Например, инфраотряд (ниже подотряда) или инфрасемейство (ниже подсемейства).
Названия зоологических таксонов
Таксон рангом выше вида имеет научное название, состоящее из одной части (одноименное название).
Подвид имеет название, состоящее из трех частей (триномен или триномен ): родовое название + видовое название + подвидовое название ; например, Canis lupus italicus . Поскольку ниже вида может быть только один возможный ранг, соединительный термин для указания ранга не нужен и не используется.
Звания в ботанике
Ботанические ранги классифицируют организмы на основе их взаимоотношений. Они начинаются с Царства, затем переходят в Отдел (или Тип), [6] Класс, Порядок, Семейство, Род и Вид. Каждый ранг отражает общие характеристики и эволюционную историю. Понимание этих рангов помогает в таксономии и изучении биоразнообразия.
Правила МКБ применяются в первую очередь к рангам семейства и ниже и только в некоторой степени к рангам выше семейства. (См. также описательное ботаническое название .)
Названия ботанических таксонов
Таксоны в ранге рода и выше имеют ботаническое название из одной части (унитарное название); таксоны в ранге вида и выше (но ниже рода) имеют ботаническое название из двух частей ( бинарное название ); все таксоны ниже ранга вида имеют ботаническое название из трех частей ( внутривидовое название ). Для указания ранга внутривидового названия необходим «соединительный термин». Так, Poa secunda subsp. juncifolia , где «subsp.» — сокращение от «subspecies», является названием подвида Poa secunda . [8]
Гибриды могут быть определены либо «гибридной формулой», которая определяет происхождение, либо им может быть дано имя. Для гибридов, получающих гибридное имя , применяются те же ранги, с префиксом notho (греч.: «ублюдок»), с nothogenus в качестве наивысшего разрешенного ранга. [9]
Устаревшие названия ботанических рангов
Если в старой публикации использовался другой термин для обозначения ранга, но намерение ясно, ботаническая номенклатура указывает определенные замены: [ необходима ссылка ]
Если названия «предназначались как названия отрядов, но были опубликованы с обозначением их ранга таким термином, как» «cohors» [лат. «когорта»; [10] см. также когортное исследование для использования термина в экологии], «nixus», «alliance» или «Reihe» вместо «отряда» (статья 17.2), то они рассматриваются как названия отрядов.
«Семья» заменяется на «порядок» (ordo) или «естественный порядок» (ordo naturalis) при определенных условиях, когда современное значение слова «порядок» не подразумевалось. (Статья 18.2)
«Подсемейство» заменяется на «подотряд» (subordo) при определенных условиях, когда современное значение «подотряда» не подразумевалось. (Статья 19.2)
Если в публикации до 1 января 1890 года используется только один внутривидовой ранг, он считается рангом разновидности. (Статья 37.4) Это обычно относится к публикациям, в которых внутривидовые таксоны обозначены греческими буквами α, β, γ, ...
Примеры
Далее следуют классификации пяти видов: плодовая мушка , известная в генетических лабораториях ( Drosophila melanogaster ), человек ( Homo sapiens ), горох , который Грегор Мендель использовал в своем открытии генетики ( Pisum sativum ), гриб-мухомор Amanita muscaria и бактерия Escherichia coli . Восемь основных рангов выделены жирным шрифтом; также приведен выбор второстепенных рангов.
Заметки к таблице
Чтобы сохранить компактность таблицы и избежать спорных технических деталей, некоторые общие и необычные промежуточные ранги опущены. Например, млекопитающие Европы, Африки и верхней части Северной Америки [a] находятся в классе Mammalia , легионе Cladotheria , подлегионе Zatheria , инфралегионе Tribosphenida , подклассе Theria , кладе Eutheria , кладе Placentalia – но в таблице присутствуют только Mammalia и Theria. Законные аргументы могут возникнуть, если бы были включены оба обычно используемых клада Eutheria и Placentalia, над которым стоит ранг «инфракласса» и каким должен быть ранг другого, или являются ли эти два названия синонимами.
Ранги более высоких таксонов, особенно промежуточных, склонны к пересмотру по мере обнаружения новой информации о взаимоотношениях. Например, цветковые растения были понижены с отдела (Magnoliophyta) до подкласса (Magnoliidae), а надотряд стал рангом, который отличает основные группы цветковых растений. [12] Традиционная классификация приматов (класс Mammalia, подкласс Theria, инфракласс Eutheria, отряд Primates) была изменена новыми классификациями, такими как Маккенна и Белл (класс Mammalia, подкласс Theriformes, инфракласс Holotheria), при этом Theria и Eutheria были назначены более низкие ранги между инфраклассом и отрядом Primates. ( Подробнее см. в классификации млекопитающих .) Эти различия возникают из-за того, что в ископаемой летописи мало доступных рангов и много точек ветвления.
Внутри вида могут быть распознаны дополнительные единицы. Животные могут быть классифицированы на подвиды (например, Homo sapiens sapiens , современные люди) или морфы (например, Corvus corax varius morpha leucophaeus , пегий ворон). Растения могут быть классифицированы на подвиды (например, Pisum sativum subsp. sativum , садовый горошек) или разновидности (например, Pisum sativum var. macrocarpon , снежный горошек), при этом культурные растения получают название сорта (например, Pisum sativum var. macrocarpon 'Snowbird'). Бактерии могут быть классифицированы по штаммам (например, Escherichia coli O157:H7 , штамм, который может вызвать пищевое отравление ).
Окончания имен
Таксоны выше уровня рода часто получают названия, основанные на типовом роде , со стандартным окончанием. Окончания, используемые при формировании этих названий, зависят от царства (а иногда и от типа и класса), как указано в таблице ниже.
Приведенные произношения являются наиболее англицированными . Также распространены более латинские произношения, в частности / ɑː / вместо / eɪ / для ударного a .
Заметки к таблице
В ботанике и микологии названия в ранге семейства и ниже основаны на названии рода, иногда называемого типовым родом этого таксона, со стандартным окончанием. Например, семейство розовых, Rosaceae , названо в честь рода Rosa , со стандартным окончанием "-aceae" для семейства. Названия выше ранга семейства также образованы от родового названия или являются описательными (например, Gymnospermae или Fungi ).
Для животных существуют стандартные суффиксы для таксонов только до ранга надсемейства. [19] Единый суффикс был предложен (но не рекомендован) в AAAS [20] как -ida / ɪ d ə / для отрядов, например; протозоологи, похоже, принимают эту систему. Многие отряды метазоа (высшие животные) также имеют такой суффикс, например Hyolithida и Nectaspida (Naraoiida).
Образование имени на основе родового имени может быть непростым. Например, у homo родительный падеж hominis , поэтому род Homo (человек) находится в Hominidae , а не "Homidae".
Ранги эписемейства, инфрасемейства и инфратрибы (у животных) используются там, где сложность филетического ветвления требует более тонких, чем обычно, различий. Хотя они и находятся ниже ранга надсемейства, они не регулируются Международным кодексом зоологической номенклатуры и, следовательно, не имеют формальных стандартных окончаний. Перечисленные здесь суффиксы являются регулярными, но неформальными. [21]
В вирусологии формальные окончания для таксонов вироидов , сателлитных нуклеиновых кислот и вириформов похожи на вирусы, только -vir- заменяется на -viroid- , -satellit- и -viriform- . [14] Дополнительные уровни области и подобласти заканчиваются на -viria и -vira соответственно. [14]
Все ранги
Существует неопределенное количество рангов, так как таксономист может придумать новый ранг по своему желанию, в любое время, если он сочтет это необходимым. При этом существуют некоторые ограничения, которые будут различаться в зависимости от применяемого номенклатурного кода . [ необходима цитата ]
Ниже приведен искусственный синтез, исключительно в целях демонстрации относительного ранга (но см. примечания), от наиболее общего к наиболее частному: [22]
Ранги присваиваются на основе субъективного различия и не полностью отражают градационный характер изменений в природе. В большинстве случаев более высокие таксономические группировки возникают позже во времени: не потому, что скорость диверсификации была выше в прошлом, а потому, что каждое последующее событие диверсификации приводит к увеличению разнообразия и, таким образом, увеличивает таксономический ранг, присваиваемый современными таксономистами. [27] Более того, некоторые группы имеют много описанных видов не потому, что они более разнообразны, чем другие виды, а потому, что их легче отбирать и изучать, чем другие группы. [ необходима цитата ]
Из этих многочисленных рангов наиболее базовым является вид. Однако это не означает, что таксон любого другого ранга не может быть четко определен или что любой вид гарантированно будет четко определен. Это варьируется от случая к случаю. В идеале таксон должен представлять кладу , то есть филогению обсуждаемых организмов, но это не является обязательным требованием. [ необходима цитата ]
Классификация, в которой все таксоны имеют формальные ранги, не может адекватно отражать знания о филогении. Поскольку названия таксонов зависят от рангов в традиционных системах классификации Линнея, таксонам без рангов нельзя давать названия. Альтернативные подходы, такие как использование объемных названий , позволяют избежать этой проблемы. [28] [29] Теоретическая трудность с наложением таксономических рангов на эволюционные деревья проявляется как парадокс границ , который можно проиллюстрировать с помощью эволюционных моделей Дарвина.
Нет никаких правил относительно того, сколько видов должно составлять род, семейство или любой другой более высокий таксон (то есть таксон в категории выше уровня вида). [30] [31] Это должна быть естественная группа (то есть неискусственная, неполифилетическая ) , как ее оценивает биолог, используя всю доступную ему информацию. Равноранговые более высокие таксоны в разных типах не обязательно эквивалентны (например, неверно предполагать, что семейства насекомых каким-то образом эволюционно сопоставимы с семействами моллюсков). [31] Для животных, по крайней мере, ранг типа обычно связан с определенным планом тела , что также является произвольным критерием. [ требуется ссылка ]
Загадочные таксоны
Загадочные таксоны — это таксономические группы, более широкие связи которых неизвестны или не определены. [32] (См. Incertae sedis .)
Мнемонический
Существует несколько аббревиатур, призванных помочь запомнить таксономическую иерархию, например, «Король Филипп приехал за отличными спагетти». [33] (См. Мнемонику таксономии .)
^ «Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений – Мельбурнский кодекс». IAPT-Taxon.org . 2012. Статьи 2 и 3. Архивировано из оригинала 10 июня 2019 г. Получено 28 апреля 2013 г.
^ Международная комиссия по зоологической номенклатуре (1999), Международный кодекс зоологической номенклатуры. Четвертое издание, International Trust for Zoological Nomenclature, архивировано из оригинала 21 мая 2019 г. , извлечено 12 апреля 2015 г.
^ Мур, РТ (1974). «Предложение о признании суперрангов» (PDF) . Таксон . 23 (4): 650–652. doi :10.2307/1218807. JSTOR 1218807. Архивировано (PDF) из оригинала 6 октября 2016 г. . Получено 5 октября 2016 г. .
^ Лукета, С. (2012). «Новые взгляды на мегаклассификацию жизни» (PDF) . Протистология . 7 (4): 218–237. Архивировано из оригинала (PDF) 2 апреля 2015 г.
^ ab Международная комиссия по зоологической номенклатуре (1999). "Глоссарий". Международный кодекс зоологической номенклатуры. Лондон: Международный траст зоологической номенклатуры. ISBN0-85301-006-4. Архивировано из оригинала 3 сентября 2021 г. . Получено 10 ноября 2023 г. .
^ jibran, jibran. "Войти ‹ Информация metBotanical Ranks: Understanding Taxonomic Classification" Мета-описание: Изучите иерархическую структуру ботанической классификации, от царства до вида, необходимую для понимания разнообразия и эволюции растений. описание — WordPress". dev-information-meta-descrition.pantheonsite.io . Получено 7 мая 2024 г.
^ «Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений – Мельбурнский кодекс». IAPT-Taxon.org . 2012. Архивировано из оригинала 10 октября 2020 г. Получено 28 апреля 2013 г.
^ "Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений – Мельбурнский кодекс". IAPT-Taxon.org . 2012. Статьи 4.2 и 24.1. Архивировано из оригинала 3 августа 2018 г. Получено 3 августа 2018 г.
^ "Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений – Мельбурнский кодекс". IAPT-Taxon.org . 2012. Статья 3.2 и Приложение 1, статьи H.1–3. Архивировано из оригинала 10 октября 2020 г. Получено 28 апреля 2013 г.
^ Stearn, WT 1992. Ботаническая латынь: история, грамматика, синтаксис, терминология и словарь, четвертое издание . Дэвид и Чарльз.
^ Göker, Markus; Oren, Aharon (22 января 2024 г.). «Действительная публикация названий двух доменов и семи царств прокариот». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 74 (1). Society for General Microbiology. doi : 10.1099/ijsem.0.006242. ISSN 1466-5034. PMID 38252124. Получено 7 июня 2024 г.
^ Чейз, М. В.; Ривил, Дж. Л. (2009), «Филогенетическая классификация наземных растений, сопровождающая APG III», Ботанический журнал Линнеевского общества , 161 (2): 122–127, doi : 10.1111/j.1095-8339.2009.01002.x
^ abcde "ICTV Code. Раздел 3.IV, § 3.23; раздел 3.V, §§ 3.27-3.28." Международный комитет по таксономии вирусов . Октябрь 2018 г. Архивировано из оригинала 6 июля 2022 г. Получено 28 ноября 2018 г.
^ Орен, Аарон (1 ноября 2023 г.). «Поправка к Принципу 8, Правилам 5b, 8, 15, 33a и Приложению 7 Международного кодекса номенклатуры прокариот с целью включения категорий царства и домена». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 73 (11). doi :10.1099/ijsem.0.006123. PMID 37909283.
^ Уитмен, Уильям Б.; Орен, Аарон; Чувочина, Мария; да Коста, Милтон С.; Гаррити, Джордж М.; Рейни, Фред А.; Росселло-Мора, Рамон; Шинк, Бернхард; Сатклифф, Иэн; Трухильо, Марта Э.; Вентура, Стефано (1 марта 2018 г.). «Предложение о суффиксе –ota для обозначения фил. Приложение к «Предложению о включении ранга филума в Международный кодекс номенклатуры прокариот». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 68 (3): 967–969. doi : 10.1099/ijsem.0.002593 . ISSN 1466-5034. PMID 29458499.
^ ab "Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений (Шэньчжэньский кодекс)". IAPT-Taxon.org . 2018. Статья 16. Архивировано из оригинала 19 декабря 2018 г. Получено 19 декабря 2018 г.
^ Например, черепаховые инфрасемейства Chelodd (Gaffney & Meylan 1988: 169) и Baenodd ( там же , 176).
^ МКЗН статья 29.2
^ Pearse, AS (1936) Зоологические названия. Список типов, классов и отрядов, подготовленный для раздела F, Американская ассоциация содействия развитию науки. Архивировано 15 ноября 2021 г. в Wayback Machine Американская ассоциация содействия развитию науки, стр. 4
↑ По материалам Gaffney & Meylan (1988).
^ Для общего использования зоологических рангов между уровнями типа и семейства, включая множество интеркалярных рангов, см. Carroll (1988). Для дополнительных интеркалярных рангов в зоологии см., в частности, Gaffney & Meylan (1988); McKenna & Bell (1997); Milner (1988); Novacek (1986, цит. в Carroll 1988: 499, 629); и классификацию птицетазовых динозавров Пола Серено 1986 года , как описано в Lambert (1990: 149, 159). Для ботанических рангов, включая множество интеркалярных рангов, см. Willis & McElwain (2002).
^ abcd Это подвижные ранги, чаще всего вставляемые между классом и легионом или когортой. Тем не менее, их расположение в зоологической иерархии может быть предметом широких вариаций. Для примеров см. классификацию позвоночных Бентона, архивированная 16 января 2019 года в Wayback Machine (2005).
^ abcd В зоологической классификации когорта и связанная с ней группа рангов вставляются между группой класса и порядковой группой. Когорта также использовалась между инфраотрядом и семейством у ящеротазовых динозавров (Benton Архивировано 16 января 2019 г. в Wayback Machine 2005). В ботанической классификации группа когорт иногда вставлялась между группой подразделения (филума) и группой класса: см. Willis & McElwain (2002: 100–101), или иногда использовалась в ранге отряда и теперь считается устаревшим названием для отряда: см. Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений, Мельбурнский кодекс 2012 г., статья 17.2.
^ abcde Надпорядковая последовательность гигаотряд–мегаотряд–капаксатряд–гиперотряд (и микроотряд, примерно в той позиции, которую чаще всего относят к парвотряду) использовалась по крайней мере у черепах (Gaffney & Meylan 1988), в то время как параллельная последовательность магноотряд–грандотряд–зеркотряд фигурирует в недавних влиятельных классификациях млекопитающих. Из источников неясно, как эти две последовательности должны быть скоординированы (или переплетены) в единой зоологической иерархии рангов. Ранее Новачек (1986) и Маккенна-Белл (1997) вставляли зеркалотряды и грандотряды между отрядом и надотрядом, но Бентон (2005) теперь помещает оба этих ранга выше надотряда.
^ Кроме того, термины биовар , морфовар , фаговар и серовар обозначают штаммы бактерий (генетические варианты), которые физиологически или биохимически отличаются. Это не таксономические ранги, а группировки различных видов, которые могут определять подвид бактерий.
^ Джинджерич, PD (1987). «Эволюция и палеонтологическая летопись: закономерности, темпы и процессы». Канадский журнал зоологии . 65 (5): 1053–1060. doi :10.1139/z87-169.
^ Клюге, Н. Дж. (1999). «Система альтернативных номенклатур надвидовых таксонов. Линнеевские и постлиннеевские принципы систематики». Entomological Review . 79 (2): 133–147.
^ Клюге, Нью-Джерси (2010). «Окружные названия высших таксонов Hexapoda». Bionomina . 1 (1): 15–55. doi : 10.11646/bionomina.1.1.3 .
^ Stuessy, TF (2009). Таксономия растений: систематическая оценка сравнительных данных. 2-е изд. Columbia University Press, стр. 175.
^ Эванс, Род Л. (2007). Каждый хороший мальчик заслуживает подделки: Книга мнемонических приемов. Penguin. ISBN978-1-4406-2207-6. Архивировано из оригинала 23 ноября 2023 г. . Получено 23 ноября 2023 г. .
Гаффни, Юджин С .; Мейлан, Питер А. (1988). «Филогения черепах». В Бентоне, М. Дж. (ред.). Филогения и классификация четвероногих . Том 1: Амфибии, рептилии, птицы. Оксфорд: Clarendon Press. С. 157–219.
Ламберт, Дэвид (1990). Книга данных о динозаврах . Оксфорд: Факты в деле / Британский музей (Естественная история. ISBN 0816024316.
Маккенна, Малкольм С.; Белл, Сьюзен К., ред. (1997). Классификация млекопитающих выше уровня вида . Нью-Йорк: Columbia University Press. ISBN 0231110138.
Милнер, Эндрю (1988). «Взаимоотношения и происхождение ныне живущих амфибий». В Бентоне, М. Дж. (ред.). Филогения и классификация четвероногих . Т. 1: Амфибии, рептилии, птицы. Оксфорд: Clarendon Press. С. 59–102.
Новачек, Майкл Дж. (1986). «Череп лептиктидных насекомоядных и классификация плацентарных млекопитающих более высокого уровня». Бюллетень Американского музея естественной истории (183): 1–112.
Серено, Пол К. (1986). «Филогения птицетазовых динозавров (отряд Ornithischia)». National Geographic Research . 2 : 234–256.
Уиллис, К. Дж.; МакЭлвейн, Дж. К. (2002). Эволюция растений . Oxford University Press. ISBN 0198500653.