Вирусная нагрузка , также известная как вирусная нагрузка , представляет собой числовое выражение количества вируса в данном объеме жидкости, включая биологические образцы и образцы из окружающей среды. Его не следует путать с титром вируса или титром вируса , который зависит от анализа. Когда проводится анализ для измерения количества инфекционных вирусных частиц (анализ бляшек, анализ фокуса), титр вируса часто относится к концентрации инфекционных вирусных частиц, которая отличается от общего количества вирусных частиц. Вирусную нагрузку измеряют с использованием биологических жидкостей мокроты [1] и плазмы крови . [2] В качестве примера образцов из окружающей среды: вирусную нагрузку норовируса можно определить по стокам воды с садовых продуктов. [3] Норовирус не только продлевает выделение вируса и обладает способностью выживать в окружающей среде, но для возникновения инфекции у человека требуется незначительная инфекционная доза : менее 100 вирусных частиц. [4]
Вирусная нагрузка часто выражается в виде вирусных частиц (вирионов) или инфекционных частиц на мл в зависимости от типа анализа. Более высокая вирусная нагрузка, титр или вирусная нагрузка часто коррелируют с тяжестью активной вирусной инфекции. Количество вируса на мл можно рассчитать, оценив живое количество вируса в вовлеченной жидкости. Например, его можно давать в копиях РНК на миллилитр плазмы крови.
Отслеживание вирусной нагрузки используется для мониторинга терапии во время хронических вирусных инфекций, а также у пациентов с ослабленным иммунитетом, например, у пациентов, выздоравливающих после трансплантации костного мозга или твердых органов . В настоящее время доступно рутинное тестирование на ВИЧ -1, цитомегаловирус , вирус гепатита В и вирус гепатита С. Мониторинг вирусной нагрузки при ВИЧ представляет особый интерес при лечении людей с ВИЧ , поскольку этот вопрос постоянно обсуждается в контексте лечения ВИЧ/СПИДа . Неопределяемая вирусная нагрузка не означает отсутствия инфекции. ВИЧ-положительные пациенты, получающие длительную комбинированную антиретровирусную терапию, могут иметь неопределяемую вирусную нагрузку при большинстве клинических анализов, поскольку концентрация вирусных частиц ниже предела обнаружения (LOD).
Обзорное исследование 2010 года, проведенное Puren et al. [2] разделяет тестирование на вирусную нагрузку на три типа: (1) тесты на основе амплификации нуклеиновых кислот ( NAT или NAAT), коммерчески доступные в США с одобрением Управления по контролю за продуктами и лекарствами (FDA) или на рынке Европейской экономической зоны ( ЕЭЗ) с маркировкой CE ; (2) «Самодельные» или собственные NAT; (3) тест, не основанный на нуклеиновой кислоте. [ нужна цитата ]
Существует множество различных молекулярных методов тестирования для количественной оценки вирусной нагрузки с использованием NAT. По исходному материалу для амплификации эти молекулярные методы можно разделить на три группы: [5]
Плазма с ЭДТА и образец крови с ЭДТА являются хорошим источником бесклеточной вирусной РНК для тестирования вирусной нагрузки на основе РНК. Для экстракции РНК из плазмы требуется специальное оборудование, реагенты и обучение, что может быть недоступно для средних и небольших лабораторий. Необходим большой образец (> 1 мл плазмы), требующий венепункции .
Кровь с ЭДТА можно хранить при комнатной температуре в течение 30 часов, а отделенную плазму - в течение длительных периодов времени при -70 °C без значительного снижения вирусной нагрузки.
Вирусная нагрузка определяется как количество копий РНК ВИЧ в миллилитре (мл) крови. Об изменениях вирусной нагрузки обычно сообщают в виде логарифмического изменения (в степени 10). Например, увеличение вирусной нагрузки на три логарифма (3 log10) представляет собой увеличение в 10 3 или 1000 раз по сравнению с ранее сообщенным уровнем, тогда как падение с 500 000 до 500 копий будет падением на три логарифма (также 3 log10). [ нужна цитата ]
Различные методы тестирования часто дают разные результаты для одного и того же образца пациента. Для обеспечения сопоставимости каждый раз при анализе образца пациента следует использовать один и тот же метод тестирования (целевая амплификация, специфическая амплификация зонда или усиление сигнала). В идеале тестирование пациентов должно проводиться в одной медицинской лаборатории с использованием одного и того же теста на вирусную нагрузку и одного анализатора.
