stringtranslate.com

Мозаика (генетика)

Цветок тюльпана, у которого одна сторона красная, а другая желтая.
Цветок тюльпана, демонстрирующий мозаичность

Мозаицизм или генетический мозаицизм — это состояние, при котором многоклеточный организм обладает более чем одной генетической линией в результате генетической мутации . [1] [2] Это означает, что различные генетические линии произошли от одной оплодотворенной яйцеклетки . Мозаицизм — одна из нескольких возможных причин химеризма , при котором один организм состоит из клеток с более чем одним различным генотипом .

Генетический мозаицизм может быть результатом многих различных механизмов, включая нерасхождение хромосом , задержку анафазы и эндорепликацию . [3] Задержка анафазы является наиболее распространенным способом возникновения мозаицизма в предимплантационном эмбрионе. [3] Мозаицизм также может быть результатом мутации в одной клетке во время развития , в этом случае мутация будет передана только ее дочерним клеткам (и будет присутствовать только в определенных взрослых клетках). [4] Соматический мозаицизм, как правило, не наследуется, поскольку он, как правило, не влияет на зародышевые клетки. [2]

История

В 1929 году Альфред Стертевант изучал мозаицизм у дрозофилы , рода плодовых мушек. [5] Мюллер в 1930 году продемонстрировал, что мозаицизм у дрозофилы всегда связан с хромосомными перестройками , а Шульц в 1936 году показал, что во всех изученных случаях эти перестройки были связаны с гетерохроматическими инертными областями. Было предложено несколько гипотез о природе такого мозаицизма. Одна из гипотез предполагала, что мозаицизм возникает в результате разрыва и потери сегментов хромосом. Курт Стерн в 1935 году предположил, что структурные изменения в хромосомах произошли в результате соматического скрещивания , в результате которого в соматических клетках возникают мутации или небольшие хромосомные перестройки. Таким образом, инертная область вызывает увеличение частоты мутаций или небольшие хромосомные перестройки в активных сегментах, прилегающих к инертным областям. [6]

В 1930-х годах Стерн продемонстрировал, что генетическая рекомбинация , нормальная для мейоза , может также происходить в митозе . [7] [8] Когда это происходит, это приводит к соматическим (телесным) мозаикам. Эти организмы содержат два или более генетически различных типов тканей. [9] Термин соматический мозаицизм был использован CW Cotterman в 1956 году в его основополагающей статье об антигенной изменчивости . [10]

В 1944 году Бельговский предположил, что мозаицизм не может объяснить некоторые мозаичные проявления, вызванные хромосомными перестройками, включающими гетерохроматиновые инертные области. Связанное с этим ослабление биохимической активности привело к тому, что он назвал генетической химерой . [6]

Типы

Мозаицизм зародышевой линии

Зародышевый или гонадный мозаицизм — это особая форма мозаицизма, при которой некоторые гаметы (то есть сперматозоиды или ооциты) несут мутацию, а остальные являются нормальными. [11] [12] Причиной обычно является мутация, произошедшая в ранней стволовой клетке, которая дала начало всем или части гамет.

Соматический мозаицизм

Соматический мозаицизм (также известный как клональный мозаицизм) возникает, когда соматические клетки организма имеют более одного генотипа. При более распространенных мозаиках разные генотипы возникают из одной оплодотворенной яйцеклетки из-за митотических ошибок при первом или последующих делениях.

Соматическая мутация, приводящая к мозаицизму, распространена на начальных и конечных стадиях жизни человека. [10] Соматическая мозаика распространена в эмбриогенезе из-за ретротранспозиции длинных вкрапленных ядерных элементов-1 (LINE-1 или L1) и Alu -транспозируемых элементов . [10] На раннем этапе развития ДНК из недифференцированных типов клеток может быть более восприимчива к вторжению мобильных элементов из-за длинных неметилированных областей в геноме. [10] Кроме того, накопление ошибок копирования ДНК и повреждений в течение жизни приводит к большему количеству случаев мозаичных тканей у стареющих людей. Поскольку продолжительность жизни резко возросла за последнее столетие, человеческий геном, возможно, не успел адаптироваться к кумулятивным эффектам мутагенеза . [10] Таким образом, исследования рака показали, что соматические мутации все чаще присутствуют на протяжении всей жизни и ответственны за большинство лейкемии , лимфом и солидных опухолей. [13]

Наиболее распространенная форма мозаицизма, обнаруженная при пренатальной диагностике, включает трисомии . Хотя большинство форм трисомии обусловлены проблемами мейоза и затрагивают все клетки организма, в некоторых случаях трисомия происходит только в некоторых клетках. Это может быть вызвано событием нерасхождения в раннем митозе, приводящим к потере хромосомы из некоторых трисомных клеток. [14] Как правило, это приводит к более мягкому фенотипу , чем у немозаичных пациентов с тем же расстройством.

В редких случаях интерсексуальные состояния могут быть вызваны мозаицизмом, когда некоторые клетки в организме имеют XX , а другие XY хромосомы ( 46, XX/XY ). [15] [16] У плодовой мушки Drosophila melanogaster , где муха, обладающая двумя X-хромосомами, является самкой, а муха, обладающая одной X-хромосомой, является стерильным самцом, потеря X-хромосомы на ранней стадии эмбрионального развития может привести к половой мозаике или гинандроморфизму . [5] [17] Аналогичным образом, потеря Y-хромосомы может привести к появлению мозаичных самцов XY/X. [18]

Примером этого является одна из более легких форм синдрома Клайнфельтера , называемая мозаикой 46,XY/47,XXY, при которой некоторые клетки пациента содержат хромосомы XY, а некоторые — хромосомы XXY. Аннотация 46/47 указывает на то, что клетки XY имеют нормальное количество хромосом — 46, а клетки XXY имеют в общей сложности 47 хромосом.

Также моносомии могут проявляться некоторой формой мозаицизма. Единственная нелетальная полная моносомия, встречающаяся у людей, — это та, которая вызывает синдром Тернера . Около 30% случаев синдрома Тернера демонстрируют мозаицизм, тогда как полная моносомия (45, X) встречается примерно в 50–60% случаев.

Однако мозаицизм не обязательно должен быть вредным. Ревертантный соматический мозаицизм — это редкое событие рекомбинации со спонтанной коррекцией мутантного патогенного аллеля. [19] При ревертантном мозаицизме здоровая ткань, образованная митотической рекомбинацией, может вытеснять исходные окружающие мутантные клетки в тканях, таких как кровь и эпителий , которые часто регенерируют. [19] При кожном заболевании ихтиоз с конфетти нормальные пятна на коже появляются в раннем возрасте и со временем увеличиваются в количестве и размере. [19]

Другие эндогенные факторы также могут приводить к мозаицизму, включая мобильные элементы , проскальзывание ДНК-полимеразы и несбалансированную сегрегацию хромосом . [10] Экзогенные факторы включают никотин и УФ-излучение . [10] Соматические мозаики были созданы у Drosophila с использованием рентгеновского лечения, а использование облучения для индукции соматической мутации стало полезным методом в изучении генетики. [20]

Истинный мозаицизм не следует путать с явлением X-инактивации , когда все клетки организма имеют один и тот же генотип, но в разных клетках экспрессируется разная копия X-хромосомы. Последнее имеет место у нормальных (XX) самок млекопитающих, хотя это не всегда видно по фенотипу (как у кошек калико ). Однако все многоклеточные организмы, вероятно, в некоторой степени являются соматическими мозаиками. [21]

Гоносомный мозаицизм

Гоносомный мозаицизм — это тип соматического мозаицизма, который возникает на очень ранних стадиях развития организма и, таким образом, присутствует как в зародышевых, так и в соматических клетках. [1] [22] Соматический мозаицизм, как правило, не наследуется, поскольку он обычно не влияет на зародышевые клетки. В случае гоносомного мозаицизма организмы имеют потенциальную возможность передавать генетическое изменение, в том числе потенциальному потомству, поскольку измененный аллель присутствует как в соматических, так и в зародышевых клетках. [22]

Мозаицизм клеток мозга

Частым типом нейронного геномного мозаицизма является вариация числа копий . Возможными источниками такой вариации были предложены неправильные исправления повреждений ДНК и соматическая рекомбинация . [23]

Митотическая рекомбинация

Одним из основных механизмов, который может производить мозаичную ткань, является митотическая рекомбинация или соматический кроссинговер . Впервые он был обнаружен Куртом Стерном у Drosophila в 1936 году. Количество ткани, которая является мозаичной, зависит от того, где в дереве деления клеток происходит обмен. Фенотипический признак, называемый «двойное пятно», наблюдаемый у Drosophila, является результатом митотической рекомбинации. Однако он также зависит от аллельного статуса генов, подвергающихся рекомбинации. Двойное пятно возникает только в том случае, если гетерозиготные гены связаны в отталкивании, т. е. в трансфазе. Рекомбинация должна происходить между центромерами соседнего гена. Это дает вид желтых пятен на фоне дикого типа у Drosophila . Другим примером митотической рекомбинации является синдром Блума, который возникает из-за мутации в гене blm . Полученный белок BLM является дефектным. Дефект в RecQ, геликазе, способствует неправильному раскручиванию ДНК во время репликации, поэтому он связан с возникновением этого заболевания. [24] [25]

Использование в экспериментальной биологии

Генетические мозаики являются особенно мощным инструментом при использовании в обычно изучаемой плодовой мушке , где специально отобранные штаммы часто теряют хромосому X [17] или Y [18] в одном из первых делений эмбриональных клеток. Эти мозаики затем могут быть использованы для анализа таких вещей, как поведение ухаживания, [17] и сексуальное влечение самок. [26]

Совсем недавно использование трансгена, встроенного в геном Drosophila, сделало систему гораздо более гибкой. Флип-рекомбиназа (или FLP ) — это ген из широко изучаемых дрожжей Saccharomyces cerevisiae , который распознает сайты «цели флип-рекомбиназы» (FRT), представляющие собой короткие последовательности ДНК, и индуцирует рекомбинацию между ними. Сайты FRT были трансгенно вставлены вблизи центромеры каждого плеча хромосомы D. melanogaster . Затем ген FLP можно индуцировать выборочно, обычно используя либо промотор теплового шока, либо систему GAL4/UAS . Полученные клоны можно идентифицировать либо отрицательно, либо положительно.

В отрицательно маркированных клонах муха является трансгетерозиготной по гену, кодирующему видимый маркер (обычно зеленый флуоресцентный белок ) и аллелю изучаемого гена (оба на хромосомах, несущих сайты FRT). После индукции экспрессии FLP клетки, которые подвергаются рекомбинации, будут иметь потомство, гомозиготное либо по маркеру, либо по изучаемому аллелю. Таким образом, клетки, не несущие маркер (темные), можно идентифицировать как несущие мутацию.

Использование отрицательно маркированных клонов иногда неудобно, особенно при создании очень маленьких участков клеток, где увидеть темное пятно на ярком фоне сложнее, чем светлое пятно на темном фоне. Создание положительно маркированных клонов возможно с использованием так называемой системы MARCM («мозаичный анализ с репрессируемым клеточным маркером»), разработанной Лицюнем Ло , профессором Стэнфордского университета , и его аспирантом Цумином Ли, который сейчас возглавляет группу в исследовательском кампусе Janelia Farm . Эта система основана на системе GAL4/UAS, которая используется для экспрессии GFP в определенных клетках. Однако глобально экспрессируемый ген GAL80 используется для подавления действия GAL4, предотвращая экспрессию GFP. Вместо использования GFP для маркировки хромосомы дикого типа, как указано выше, этой цели служит GAL80, так что когда он удаляется путем митотической рекомбинации , GAL4 разрешается функционировать, а GFP включается. Это приводит к тому, что интересующие клетки ярко помечаются на темном фоне. [27]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab Кэмпбелл, Ян М.; Шоу, Чад А.; Станкевич, Павел; Лупски, Джеймс Р. (2015-07-01). «Соматический мозаицизм: последствия для генетики болезней и передачи». Trends in Genetics . 31 (7): 382–392. doi :10.1016/j.tig.2015.03.013. ISSN  0168-9525. PMC 4490042.  PMID 25910407  .
  2. ^ ab Forsberg, Lars A.; Gisselsson, David; Dumanski, Jan P. (февраль 2017 г.). «Мозаицизм в здоровье и болезни — клоны набирают скорость». Nature Reviews Genetics . 18 (2): 128–142. doi :10.1038/nrg.2016.145. ISSN  1471-0064. PMID  27941868. S2CID  44092954.
  3. ^ ab Taylor, TH; Gitlin, SA; Patrick, JL; Crain, JL; Wilson, JM; Griffin, DK (2014). «Происхождение, механизмы, частота и клинические последствия хромосомного мозаицизма у людей». Human Reproduction Update . 20 (4): 571–581. doi : 10.1093/humupd/dmu016 . ISSN  1355-4786. PMID  24667481.
  4. ^ Strachan, Tom; Read, Andrew P. (1999). "Глоссарий". Молекулярная генетика человека (2-е изд.). Нью-Йорк: Wiley–Liss. ISBN 978-1-85996-202-2. PMID  21089233.[ нужна страница ]
  5. ^ аб Стертевант, AH (1929). «Бордовый мутантный тип Drosophila simulans: исследование элиминации хромосом и клеточного происхождения». Zeitschrift für Wissenschaftliche Zoologie . 135 : 323–356.
  6. ^ аб Бельговский, М.Л. (1962) [1944]. «К вопросу о механизме осуществления мозаики, связанной с гетерохроматическими районами хромосом». Журнал «Общая биология» . В (6). Министерство торговли США – Управление технических служб: 325–356. ОЦ 61-11476.
  7. ^ Стерн, К. и К. Секигути, 1931. Анализ eines Mosaikindividuums bei Drosophila melanogaster . Био. Центр. 51 , 194–199.
  8. ^ Stern C. 1936. «Соматический кроссинговер и сегрегация у Drosophila melanogaster ». Генетика 21 , 625–730.
  9. ^ Стерн, Курт 1968. «Генетические мозаики у животных и человека». стр. 27–129, в Stern, C. Genetic Mosaics and Other Essays . Harvard University Press, Кембридж, Массачусетс.
  10. ^ abcdefg De, S. (2011). «Соматический мозаицизм в здоровых тканях человека». Trends in Genetics . 27 (6): 217–223. doi :10.1016/j.tig.2011.03.002. PMID  21496937.
  11. ^ "Google Здоровье – Google". health.google.com .
  12. ^ Шваб, Анджела Л.; и др. (2007). «Гонадный мозаицизм и семейный аденоматозный полипоз». Семейный рак . 7 (2): 173–7. doi :10.1007/s10689-007-9169-1. PMID  18026870. S2CID  20956228.
  13. ^ Jacobs, K. B.; et al. (2012). «Обнаруживаемый клональный мозаицизм и его связь со старением и раком». Nature Genetics . 44 (6): 651–U668. doi :10.1038/ng.2270. PMC 3372921 . PMID  22561519. 
  14. ^ Strachan, Tom; Read, Andrew P. (1999). «Хромосомные аномалии». Human Molecular Genetics (2-е изд.). Нью-Йорк: Wiley–Liss. ISBN 978-1-85996-202-2. PMID  21089233.[ нужна страница ]
  15. ^ Marchi, M. De; et al. (2008). «Истинный гермафродитизм с мозаицизмом половых хромосом XX/XY: Отчет о случае». Clinical Genetics . 10 (5): 265–72. doi :10.1111/j.1399-0004.1976.tb00047.x. PMID  991437. S2CID  6074108.
  16. ^ Фицджеральд, П. Х.; Дональд, Р. А.; Кирк, Р. Л. (1979). «Истинная гермафродитная диспермическая химера с кариотипами 46,XX и 46,XY». Клиническая генетика . 15 (1): 89–96. doi :10.1111/j.1399-0004.1979.tb02032.x. PMID  759058. S2CID  39280592.
  17. ^ abc Хотта, Йошики; Бензер, Сеймур (1972). «Картирование поведения в мозаиках дрозофилы». Nature . 240 (5383): 527–535. Bibcode :1972Natur.240..527H. doi :10.1038/240527a0. PMID  4568399. S2CID  4181921.
  18. ^ ab Nissani, Moti (1978). «Место функции хромосомы Y у самцов Drosophila melanogaster». Молекулярная и общая генетика . 165 (2): 221–224. doi :10.1007/BF00269910. S2CID  39242830.
  19. ^ abc Jongmans, M. C. J.; et al. (2012). «Ревертантный соматический мозаицизм с помощью митотической рекомбинации при врожденном дискератозе». American Journal of Human Genetics . 90 (3): 426–433. doi :10.1016/j.ajhg.2012.01.004. PMC 3309184 . PMID  22341970. 
  20. ^ Блэр, С. С. (2003). «Генетические мозаичные методы изучения развития дрозофилы». Развитие . 130 (21): 5065–5072. doi : 10.1242/dev.00774 . PMID  12975340.
  21. ^ Холл, Дж. Г. (1988). «Обзор и гипотезы: соматический мозаицизм, наблюдения, связанные с клинической генетикой». Американский журнал генетики человека . 43 (4): 355–363. PMC 1715487. PMID  3052049 . 
  22. ^ ab Mensa-Vilaró, Anna; et al. (2019-01-01). «Неожиданная важная роль мозаицизма генов у пациентов с первичными иммунодефицитными заболеваниями». Журнал аллергии и клинической иммунологии . 143 (1): 359–368. doi : 10.1016/j.jaci.2018.09.009 . ISSN  0091-6749. PMID  30273710.
  23. ^ Lee MH, Siddoway B, Kaeser GE, Segota I, Rivera R, Romanow WJ, Liu CS, Park C, Kennedy G, Long T, Chun J (ноябрь 2018 г.). «Рекомбинация соматического гена APP при болезни Альцгеймера и нормальных нейронах». Nature . 563 (7733): 639–645. Bibcode :2018Natur.563..639L. doi :10.1038/s41586-018-0718-6. PMC 6391999 . PMID  30464338. 
  24. ^ Кинг Р. К.; Стэнсфилд В. Д. и Маллиган П. К. 2006. Генетический словарь . 7-е изд., Oxford University Press. стр. 282
  25. ^ Sanz, Maureen M.; German, James; Cunniff, Christopher (11 марта 1993 г.). «Синдром Блума». В Adam, Margaret P.; Ardinger, Holly H.; Pagon, Roberta A.; Wallace, Stephanie E.; Bean, Lora JH; Stephens, Karen; Amemiya, Anne (ред.). GeneReviews . Университет Вашингтона, Сиэтл. PMID  20301572 – через PubMed.
  26. ^ Ниссани, М (1975). «Новый поведенческий биоанализ для анализа сексуального влечения и феромонов у насекомых». Журнал экспериментальной зоологии . 192 (2): 271–5. Bibcode : 1975JEZ...192..271N. doi : 10.1002/jez.1401920217. PMID  805823.
  27. ^ Ли, Цумин; Луо, Лицюнь (1999). «Мозаичный анализ с репрессируемым клеточным маркером для изучения функции гена в нейрональном морфогенезе». Neuron . 22 (3): 451–61. doi : 10.1016/S0896-6273(00)80701-1 . PMID  10197526.

Дальнейшее чтение