stringtranslate.com

Молекулярная диагностика

Специалист, использующий QIAsymphony, платформу автоматизации молекулярных диагностических тестов.

Молекулярная диагностика представляет собой набор методов, используемых для анализа биологических маркеров в геноме и протеоме , а также того, как их клетки экспрессируют свои гены в виде белков , применяя молекулярную биологию к медицинским исследованиям . В медицине этот метод используется для диагностики и мониторинга заболеваний, выявления риска и принятия решения о том, какие методы лечения будут лучше всего работать для отдельных пациентов  . и решить, какие карантинные меры необходимо принять. [3]

Анализируя особенности пациента и его заболевания, молекулярная диагностика открывает перспективы персонализированной медицины . [4] Эти тесты полезны в ряде медицинских специальностей , включая инфекционные заболевания , онкологию , типирование лейкоцитарного антигена человека (который исследует и прогнозирует иммунную функцию ), коагуляцию и фармакогеномику — генетическое предсказание того, какие лекарства будут работать лучше всего. [5] : v-vii  Они частично совпадают с клинической химией (медицинскими исследованиями жидкостей организма).

История

Молекулярная диагностика использует такие методы, как масс-спектрометрия и генные чипы, для выявления закономерностей экспрессии генов и белков.

Область молекулярной биологии в конце двадцатого века выросла, как и ее клиническое применение. В 1980 году Юет Вай Кан и др . предложил пренатальный генетический тест на талассемию , который основывался не на секвенировании ДНК (тогда он находился в зачаточном состоянии), а на ферментах рестрикции , которые разрезают ДНК там, где они распознают определенные короткие последовательности, создавая цепи ДНК разной длины в зависимости от того, какой аллель (генетическая вариация) у плода. одержимый. [6] В 1980-х годах эта фраза использовалась в названиях таких компаний, как Molecular Diagnostics Incorporated [7] и Bethseda Research Laboratories Molecular Diagnostics . [8] [9]

В 1990-е годы идентификация недавно открытых генов и новые методы секвенирования ДНК привели к появлению отдельной области молекулярной и геномной лабораторной медицины; в 1995 году была создана Ассоциация молекулярной патологии (AMP), чтобы придать ей структуру. В 1999 году AMP стала соучредителем журнала медицинской диагностики . [10] Informa Healthcare запустила «Экспертные обзоры в области медицинской диагностики» в 2001 году. [1] Начиная с 2002 года, проект HapMap агрегировал информацию об однобуквенных генетических различиях, которые повторяются в человеческой популяции — однонуклеотидных полиморфизмах — и их связи с болезнями. . [2] : ch 37  В 2012 году методы молекулярной диагностики талассемии используют тесты генетической гибридизации для выявления конкретного полиморфизма одного нуклеотида , вызывающего заболевание у человека. [11]

Поскольку коммерческое применение молекулярной диагностики стало более важным, в центре внимания оказались и дебаты о патентовании генетических открытий . В 1998 году Директива Европейского Союза 98 /44/EC разъяснила , что патенты на последовательности ДНК разрешены. [12] В 2010 году в США AMP подала в суд на Myriad Genetics , чтобы оспорить патенты последней на два гена, BRCA1 и BRCA2 , которые связаны с раком молочной железы. В 2013 году Верховный суд США частично согласился , постановив, что встречающаяся в природе последовательность генов не может быть запатентована. [13] [14]

Техники

Affymetrix 5.0, микрочип

Разработка на основе исследовательских инструментов

Индустриализация инструментов молекулярной биологии сделала их практичным использование в клиниках. [2] : предисловие  Миниатюризация в одном портативном устройстве может принести медицинскую диагностику в клинику, офис или дом. [2] : предисловие  Клиническая лаборатория требует высоких стандартов надежности; диагностика может потребовать аккредитации или подпадать под действие правил в отношении медицинского оборудования. [15] По состоянию на 2011 год некоторые клинические лаборатории США, тем не менее, использовали анализы, продаваемые «только для исследовательских целей». [16]

Лабораторные процессы должны соответствовать нормативным актам, таким как Поправки к усовершенствованию клинических лабораторий , Закон о переносимости и подотчетности медицинского страхования , Надлежащая лабораторная практика и спецификации Управления по контролю за продуктами и лекарствами США. Системы управления лабораторной информацией помогают отслеживать эти процессы. [17] Постановление распространяется как на персонал, так и на поставки. По состоянию на 2012 год двенадцать штатов США требуют наличия лицензии у молекулярных патологов; несколько советов, таких как Американский совет медицинской генетики и Американский совет патологии, сертифицируют технологов, руководителей и директоров лабораторий. [18]

Автоматизация и штрих-кодирование образцов максимизируют пропускную способность и снижают вероятность ошибок или загрязнения при ручной обработке и составлении отчетов о результатах. Теперь доступны отдельные устройства для проведения анализа от начала до конца. [15]

Анализы

В молекулярной диагностике используются биологические анализы in vitro , такие как ПЦР- ИФА или флуоресцентная гибридизация in situ . [19] [20] Анализ обнаруживает молекулу, часто в низких концентрациях, которая является маркером заболевания или риска в образце, взятом у пациента. Сохранение образца перед анализом имеет решающее значение. Ручная обработка должна быть сведена к минимуму. [21] Хрупкая молекула РНК создает определенные проблемы. Являясь частью клеточного процесса экспрессии генов в виде белков, он обеспечивает определенную степень экспрессии генов, но уязвим для гидролиза и разрушения постоянно присутствующими ферментами РНКазы . Образцы можно быстро заморозить в жидком азоте или инкубировать в консервантах. [2] : глава 39 

Поскольку методы молекулярной диагностики позволяют обнаружить чувствительные маркеры, эти тесты менее интрузивны, чем традиционная биопсия . Например, поскольку в плазме человека существуют бесклеточные нуклеиновые кислоты , простого образца крови может быть достаточно для получения генетической информации из опухолей, трансплантатов или будущего плода. [2] : ch 45  Многие, но не все, методы молекулярной диагностики, основанные на обнаружении нуклеиновых кислот , используют полимеразную цепную реакцию (ПЦР) для значительного увеличения количества молекул нуклеиновых кислот, тем самым амплифицируя целевую последовательность(и) в образце пациента. [2] : предисловие  ПЦР — это метод, при котором матричная ДНК амплифицируется с использованием синтетических праймеров, ДНК-полимеразы и dNTP. Смесь подвергается циклическому воздействию по меньшей мере двух температур: высокой температуры для денатурации двухцепочечной ДНК в одноцепочечные молекулы и низкой температуры для гибридизации праймера с матрицей и для полимеразы для удлинения праймера. Каждый температурный цикл теоретически удваивает количество целевой последовательности. Обнаружение вариаций последовательностей с помощью ПЦР обычно включает разработку и использование олигонуклеотидных реагентов, которые амплифицируют интересующий вариант более эффективно, чем последовательность дикого типа. ПЦР в настоящее время является наиболее широко используемым методом обнаружения последовательностей ДНК. [22] Для обнаружения маркера можно использовать ПЦР в реальном времени, прямое секвенирование, [2] : чипы микроматрицы ch 17  — готовые чипы, которые проверяют множество маркеров одновременно, [2] : ch 24  или MALDI-TOF [23] То же самое Принцип применим к протеому и геному . Белковые массивы с высокой пропускной способностью могут использовать для связывания комплементарную ДНК или антитела и, следовательно, могут параллельно обнаруживать множество различных белков. [24] Молекулярные диагностические тесты сильно различаются по чувствительности, времени выполнения, стоимости, охвату и одобрению регулирующих органов. Они также различаются по уровню валидации, применяемому в лабораториях, использующих их. Следовательно, требуется надежная местная валидация в соответствии с нормативными требованиями и использование соответствующих средств контроля, особенно там, где результат может быть использован для принятия решения о лечении пациента. [25]

Преимущества

Чип микрочипа содержит ДНК, комплементарную многим интересующим последовательностям. кДНК флуоресцирует при гибридизации с соответствующим фрагментом ДНК в образце.

Пренатальный

Обычные пренатальные тесты на хромосомные аномалии , такие как синдром Дауна, основаны на анализе количества и внешнего вида хромосом – кариотипа . Тесты молекулярной диагностики, такие как сравнительная геномная гибридизация на микрочипах , вместо этого проверяют образец ДНК, а из-за бесклеточной ДНК в плазме могут быть менее инвазивными, но по состоянию на 2013 год они все еще являются дополнением к традиционным тестам. [26]

Уход

Некоторые однонуклеотидные полиморфизмы пациентов — небольшие различия в их ДНК — могут помочь предсказать, насколько быстро они будут метаболизировать определенные лекарства; это называется фармакогеномика . [27] Например, фермент CYP2C19 метаболизирует некоторые лекарства, такие как средство, препятствующее свертыванию крови, клопидогрель , в их активные формы. Некоторые пациенты обладают полиморфизмом в определенных местах гена 2C19, из-за которого эти лекарства плохо метаболизируются ; врачи могут проверить эти полиморфизмы и выяснить, будут ли лекарства полностью эффективны для этого пациента. [28] Достижения в области молекулярной биологии помогли показать, что некоторые синдромы, которые ранее классифицировались как одно заболевание, на самом деле представляют собой несколько подтипов с совершенно разными причинами и методами лечения. Молекулярная диагностика может помочь диагностировать подтип (например, инфекции и рак) или генетический анализ заболевания с наследственным компонентом, такого как синдром Сильвера-Рассела . [1] [29]

Инфекционное заболевание

Молекулярная диагностика используется для выявления инфекционных заболеваний, таких как хламидиоз , [30] вирус гриппа [31] и туберкулез ; [32] или конкретные штаммы, такие как вирус H1N1 [33] или SARS-CoV-2 . [34] Генетическая идентификация может быть быстрой; например, тест с изотермической амплификацией, опосредованный петлей, позволяет диагностировать малярийного паразита и является достаточно надежным для развивающихся стран. [35] Но, несмотря на эти достижения в анализе генома, в 2013 году инфекции по-прежнему чаще выявляются другими способами — по протеомному, бактериофаговому или хроматографическому профилю. [36] Молекулярная диагностика также используется для понимания конкретного штамма возбудителя — например, путем определения того, какими генами лекарственной устойчивости он обладает — и, следовательно, каких методов лечения следует избегать. [36] Кроме того, для беспристрастной идентификации патогенных организмов можно применять анализы, основанные на метагеномном секвенировании следующего поколения. [37]

Управление риском заболеваний

Геном пациента может включать наследственную или случайную мутацию, влияющую на вероятность развития заболевания в будущем. [27] Например, синдром Линча — генетическое заболевание , которое предрасполагает пациентов к колоректальному и другим видам рака; раннее выявление может привести к тщательному мониторингу, который повышает шансы пациента на хороший результат. [38] Сердечно-сосудистый риск определяется биологическими маркерами, и скрининг может измерить риск рождения ребенка с генетическим заболеванием, таким как муковисцидоз . [39] Генетическое тестирование является этически сложным: пациенты могут не хотеть стресса, зная о своем риске. [40] В странах, где нет всеобщего здравоохранения, известный риск может привести к увеличению страховых взносов. [41]

Рак

Рак — это изменение клеточных процессов, которые приводят к бесконтрольному росту опухоли. [27] Раковые клетки иногда имеют мутации в онкогенах , таких как KRAS и CTNNB1 (β-катенин). [42] Анализ молекулярной характеристики раковых клеток — ДНК и уровней ее экспрессии через информационную РНК — позволяет врачам охарактеризовать рак и выбрать лучшую терапию для своих пациентов. [27] По состоянию на 2010 год новой технологией стали анализы, включающие набор антител против конкретных белковых молекул-маркеров; Есть надежда на эти мультиплексные анализы, которые смогут измерять множество маркеров одновременно. [43] Другие потенциальные будущие биомаркеры включают молекулы микроРНК , которые раковые клетки экспрессируют больше, чем здоровые. [44]

Рак – это заболевание с чрезмерными молекулярными причинами и постоянной эволюцией. Существует также гетерогенность заболеваний даже у отдельного человека. Молекулярные исследования рака доказали значимость драйверных мутаций в росте и метастазировании опухолей. [45] Для исследования рака было разработано множество технологий обнаружения вариаций последовательностей. Эти технологии обычно можно сгруппировать в три подхода: полимеразная цепная реакция (ПЦР), гибридизация и секвенирование нового поколения (NGS). [22] В настоящее время многие методы ПЦР и гибридизации одобрены FDA в качестве диагностики in vitro. [46] Однако анализы NGS все еще находятся на ранней стадии клинической диагностики. [47]

Для проведения молекулярного диагностического теста на рак одним из важных вопросов является обнаружение вариаций последовательности ДНК. Образцы биопсии опухоли, используемые для диагностики, всегда содержат всего лишь 5% целевого варианта по сравнению с последовательностью дикого типа. Кроме того, для неинвазивных исследований периферической крови или мочи тест ДНК должен быть достаточно специфичным, чтобы обнаруживать мутации с частотой вариантов аллелей менее 0,1%. [22]

В настоящее время, оптимизируя традиционную ПЦР, появилось новое изобретение — система устойчивых к амплификации мутаций (ARMS) — метод обнаружения вариантов последовательности ДНК при раке. Принцип, лежащий в основе ARMS, заключается в том, что ферментативная активность ДНК-полимераз очень чувствительна к несовпадениям вблизи 3'-конца праймера. [22] Многие компании разработали диагностические тесты на основе праймеров ARMS PCR. Например, Qiagen therascreen, [48] Roche cobas [49] и Biomerieux THxID [50] разработали одобренные FDA ПЦР-тесты для выявления рака легких, толстой кишки и метастатических мутаций меланомы в генах KRAS, EGFR и BRAF. Их наборы для IVD были в основном проверены на геномной ДНК, выделенной из ткани FFPE.

Существуют также микрочипы, которые используют механизм гибридизации для диагностики рака. С помощью технологии Genechip компании Affymetrix можно синтезировать более миллиона различных зондов с пределом обнаружения от одной до десяти копий мРНК на лунку. [22] Обычно считается, что оптимизированные микроматрицы позволяют производить повторяемый относительный количественный анализ различных мишеней. [51] В настоящее время FDA уже одобрило ряд диагностических тестов с использованием микрочипов: анализы MammaPrint от Agendia могут информировать о риске рецидива рака молочной железы, профилируя экспрессию 70 генов, связанных с раком молочной железы; [52] Аутогеномика Анализ INFNITI CYP2C19 может профилировать генетические полиморфизмы, влияние которых на терапевтический ответ на антидепрессанты велико; [53] и CytoScan Dx компании Affymetrix могут оценивать умственную отсталость и врожденные нарушения путем анализа хромосомных мутаций. [54]

В будущем инструменты диагностики рака, скорее всего, будут сосредоточены на секвенировании следующего поколения (NGS). Используя секвенирование ДНК и РНК для диагностики рака, технологии в области инструментов молекулярной диагностики будут развиваться лучше. Хотя за последние 10 лет производительность и цена NGS резко сократились примерно в 100 раз, мы по-прежнему находимся как минимум на 6 порядков от выполнения глубокого секвенирования на уровне всего генома. [22] В настоящее время Ion Torrent разработала несколько панелей NGS на основе трансляционного AmpliSeq, например Oncomine Comprehensive Assay. [55] Они сосредоточены на использовании глубокого секвенирования генов, связанных с раком, для обнаружения редких вариантов последовательностей.

Инструмент молекулярной диагностики можно использовать для оценки риска развития рака. Например, тест BRCA1/2 компании Myriad Genetics оценивает риск развития рака молочной железы у женщин в течение жизни. [22] Кроме того, некоторые виды рака не всегда имеют четкие симптомы. Полезно анализировать людей, когда у них нет явных симптомов и, таким образом, можно обнаружить рак на ранних стадиях. Например, тест ColoGuard можно использовать для скрининга людей старше 55 лет на предмет колоректального рака . [56] Рак является длительным заболеванием с различными стадиями прогрессирования, инструменты молекулярной диагностики могут использоваться для прогноза прогрессирования рака. Например, тест OncoType Dx от компании Genomic Health может оценить риск рака молочной железы. Их технология может информировать пациентов о необходимости пройти химиотерапию, когда это необходимо, путем изучения уровней экспрессии РНК в биопсийной ткани рака молочной железы. [57]

Ожидается, что в связи с растущей государственной поддержкой молекулярной диагностики ДНК в ближайшее время станет доступно все большее количество клинических анализов ДНК для обнаружения рака. В настоящее время исследования в области диагностики рака быстро развиваются с целью снижения затрат, меньших затрат времени и упрощения методов для врачей и пациентов.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ abc Poste G (май 2001 г.). «Молекулярная диагностика: новый мощный компонент цепочки создания стоимости в здравоохранении». Экспертный обзор молекулярной диагностики . 1 (1): 1–5. дои : 10.1586/14737159.1.1.1 . ПМИД  11901792.
  2. ^ abcdefghi Burtis CA, Эшвуд ER, Брунс DE (2012). Учебник Титца по клинической химии и молекулярной диагностике. Эльзевир. ISBN 978-1-4557-5942-2.
  3. ^ «Об ИТП». ИТП . Проверено 23 апреля 2021 г.
  4. ^ Гамбург, Массачусетс, Коллинз FS (июль 2010 г.). «Путь к персонализированной медицине». Медицинский журнал Новой Англии . 363 (4): 301–4. дои : 10.1056/NEJMp1006304 . PMID  20551152. S2CID  205106671.
  5. ^ Гроди В.В., Накамура Р.М., Стром СМ, Кихле, Флорида (2010). Молекулярная диагностика: методы и приложения для клинической лаборатории. Бостон, Массачусетс: ISBN Academic Press Inc. 978-0-12-369428-7.
  6. ^ Кан Ю.В., Ли К.Ю., Фурбетта М., Ангиус А., Цао А. (январь 1980 г.). «Полиморфизм последовательности ДНК в области гена бета-глобина. Применение для пренатальной диагностики бета-0-талассемии на Сардинии». Медицинский журнал Новой Англии . 302 (4): 185–8. дои : 10.1056/NEJM198001243020401. ПМИД  6927915.
  7. ^ Кон Д.В., Элтинг Дж.Дж., Фрик М., Эльд Р. (июнь 1984 г.). «Селективная локализация секреторного белка-I паращитовидной железы / семейства белков хромогранина А мозгового вещества надпочечников в самых разных эндокринных клетках крысы». Эндокринология . 114 (6): 1963–74. дои : 10.1210/endo-114-6-1963. ПМИД  6233131.
  8. ^ Перселин Дж. Э., Стивенс Р. Х. (август 1985 г.). «Анти-Fab-антитела у человека. Преобладание минорных подклассов иммуноглобулинов G при ревматоидном артрите». Журнал клинических исследований . 76 (2): 723–30. дои : 10.1172/JCI112027. ПМК 423887 . ПМИД  3928684. 
  9. ^ Каплан Г., Гаудернак Г. (октябрь 1982 г.). «Дифференцировка моноцитов человека in vitro. Различия в фенотипах моноцитов, индуцированные культивированием на стекле или на коллагене». Журнал экспериментальной медицины . 156 (4): 1101–14. дои : 10.1084/jem.156.4.1101. ПМК 2186821 . ПМИД  6961188. 
  10. ^ Фаусто Н., Каул К.Л. (1999). «Представляем журнал молекулярной диагностики». Журнал молекулярной диагностики . 1 (1): 1. дои :10.1016/S1525-1578(10)60601-0. ЧВК 1906886 . 
  11. ^ Атанасовская Б, Божиновски Г, Чакалова Л, Кочева С, Каранфильски О, Пласеска-Каранфиска Д (декабрь 2012 г.). «Молекулярная диагностика β-талассемии». Балканский журнал медицинской генетики . 15 (Приложение): 61–5. doi : 10.2478/v10034-012-0021-z. ПМЦ 3776673 . ПМИД  24052746. 
  12. ^ Шарплс А (23 марта 2011 г.). «Генные патенты в Европе относительно стабильны, несмотря на неопределенность в США» Новости генной инженерии и биотехнологии . Проверено 13 июня 2013 г.
  13. ↑ Бравин Дж., Кендалл Б. (13 июня 2013 г.). «Судьи отменяют патенты на гены». Журнал "Уолл Стрит . Проверено 15 июня 2013 г.
  14. ↑ Барнс Р., Брэди Д. (13 июня 2013 г.). «Верховный суд постановил, что человеческие гены не могут быть запатентованы». Вашингтон Пост . Проверено 15 июня 2013 г.
  15. ^ Аб Гиббс Дж. Н. (1 августа 2008 г.). «Пути регулирования молекулярной диагностики. Подробное описание различных доступных вариантов и того, что требуется для каждого». 24 (14). Новости генной инженерии и биотехнологии . Проверено 4 сентября 2013 г. {{cite journal}}: Требуется цитировать журнал |journal=( помощь )
  16. ^ Гиббс Дж. Н. (1 апреля 2011 г.). «Неопределенность сохраняется в отношении продуктов RUO. FDA может рассмотреть возможность более ограничительного подхода с использованием анализов только для исследовательских целей». 31 (7). Новости генной инженерии и биотехнологии . Проверено 4 сентября 2013 г. {{cite journal}}: Требуется цитировать журнал |journal=( помощь )
  17. ^ Томиелло К. (21 февраля 2007 г.). «Соблюдение нормативных требований стимулирует LIMS». Мир дизайна . Проверено 7 ноября 2012 г.
  18. ^ Маккиннон AC, Ван YL, Сахота А, Юнг CC, Век К.Э. (ноябрь 2012 г.). «Сертификация в области молекулярной патологии в Соединенных Штатах: обновленная информация Комитета по обучению и образованию Ассоциации молекулярной патологии». Журнал молекулярной диагностики . 14 (6): 541–9. дои : 10.1016/j.jmoldx.2012.05.004 . ПМИД  22925695.
  19. ↑ Рао-младший, Флеминг CC, Мур Дж.Э. (7 июля 2006 г.). Молекулярная диагностика: современные технологии и приложения (Horizon Bioscience) . Горизонт Бионауки. п. 97. ИСБН 978-1-904933-19-9.
  20. ^ ван Оммен Г.Дж., Бройнинг М.Х., Раап АК (июнь 1995 г.). «РЫБА в исследованиях генома и молекулярной диагностике». Текущее мнение в области генетики и развития . 5 (3): 304–8. дои : 10.1016/0959-437X(95)80043-3. ПМИД  7549423.
  21. ^ Хаммерлинг Дж. А. (2012). «Обзор медицинских ошибок в лабораторной диагностике и где мы находимся сегодня». Лабораторная медицина . 43 (2): 41–44. дои : 10.1309/LM6ER9WJR1IHQAUY .
  22. ^ abcdefg Ходаков Д., Ван С., Чжан Д.Ю. (октябрь 2016 г.). «Диагностика, основанная на профилировании вариантов последовательностей нуклеиновых кислот: подходы ПЦР, гибридизации и NGS». Обзоры расширенной доставки лекарств . 105 (Часть А): 3–19. дои : 10.1016/j.addr.2016.04.005 . ПМИД  27089811.
  23. ^ Шервуд, Джеймс Л.; Мюллер, Сюзанна; Орр, Мария СМ; Рэтклифф, Марианна Дж.; Уокер, Джилл (2014). «Панельное профилирование опухоли MALDI-TOF — чувствительный метод обнаружения мутаций в клинической немелкоклеточной опухоли рака легких». ПЛОС ОДИН . 9 (6): e100566. Бибкод : 2014PLoSO...9j0566S. дои : 10.1371/journal.pone.0100566 . ПМК 4067351 . ПМИД  24956168. 
  24. ^ Вальтер Г., Бюссов К., Люкинг А., Глёклер Дж. (июнь 2002 г.). «Высокопроизводительные белковые массивы: перспективы молекулярной диагностики». Тенденции молекулярной медицины . 8 (6): 250–3. дои : 10.1016/S1471-4914(02)02352-3. ПМИД  12067604.
  25. ^ Шервуд Дж.Л., Браун Х., Реттино А., Шрайек А., Кларк Г., Клаас Б., Агравал Б., Частон Р., Конг Б.С., Чоппа П., Нигрен А.О., Дерас И.Л., Кольманн А. (1 сентября 2017 г.). «Ключевые различия между 13 технологиями обнаружения мутаций KRAS и их актуальность для клинической практики». ЭСМО Открытый . 2 (4): e000235. doi : 10.1136/esmoopen-2017-000235. ПМЦ 5623342 . ПМИД  29018576. 
  26. ^ «Достижения в области пренатальной молекулярной диагностики (Введение)» . ЗдоровьеТех. 2013 . Проверено 28 сентября 2013 г.
  27. ^ abcd «Молекулярная диагностика - Национальный институт рака». Cancer.gov. 28 января 2005 г. Проверено 26 сентября 2013 г.
  28. ^ Деста З, Чжао X, Шин Дж.Г., Флокхарт Д.А. (2002). «Клиническое значение генетического полиморфизма цитохрома P450 2C19». Клиническая фармакокинетика . 41 (12): 913–58. дои : 10.2165/00003088-200241120-00002. PMID  12222994. S2CID  27616494.
  29. ^ Эггерманн Т., Шпенглер С., Гогель М., Бегеманн М., Эльбрахт М. (июнь 2012 г.). «Эпигенетическая и генетическая диагностика синдрома Сильвера-Рассела». Экспертный обзор молекулярной диагностики . 12 (5): 459–71. дои : 10.1586/эр.12.43. PMID  22702363. S2CID  3427029.
  30. ^ Тонг CY, Мэллинсон Х (май 2002 г.). «Переход к обнаружению генитальной Chlamydia trachomatis на основе нуклеиновых кислот». Экспертный обзор молекулярной диагностики . 2 (3): 257–66. дои : 10.1586/14737159.2.3.257. PMID  12050864. S2CID  26518693.
  31. ^ Дейде В.М., Сампат Р., Губарева Л.В. (январь 2011 г.). «Подход RT-PCR/масс-спектрометрии с ионизацией электрораспылением в обнаружении и характеристике вирусов гриппа». Экспертный обзор молекулярной диагностики . 11 (1): 41–52. дои : 10.1586/эээ.10.107. PMID  21171920. S2CID  207219269.
  32. ^ Пай М., Калантри С., Деда К. (май 2006 г.). «Новые инструменты и новые технологии диагностики туберкулеза: часть I. Латентный туберкулез» (PDF) . Экспертный обзор молекулярной диагностики . 6 (3): 413–22. дои : 10.1586/14737159.6.3.413 . ПМИД  16706743.
  33. ^ Буркардт HJ (январь 2011 г.). «Пандемия H1N1 2009 («свиной грипп»): диагностика и другие проблемы». Экспертный обзор молекулярной диагностики . 11 (1): 35–40. дои : 10.1586/эр.10.102. PMID  21171919. S2CID  894775.
  34. ^ Хабибзаде П., Мофаттех М., Силави М., Гавами С., Фагихи М.А. (февраль 2021 г.). «Молекулярные диагностические тесты на COVID-19: обзор». Критические обзоры клинических лабораторных наук . 58 (6): 385–398. дои : 10.1080/10408363.2021.1884640. ПМЦ 7898297 . ПМИД  33595397. 
  35. ^ Хан ET (март 2013 г.). «Тест петлевой изотермической амплификации для молекулярной диагностики малярии». Экспертный обзор молекулярной диагностики . 13 (2): 205–18. дои : 10.1586/эр.12.144. PMID  23477559. S2CID  24649273.
  36. ^ аб Тан Ю.В., Прокоп Г.В., Персинг Д.Х. (ноябрь 1997 г.). «Молекулярная диагностика инфекционных заболеваний». Клиническая химия . 43 (11): 2021–38. doi : 10.1093/clinchem/43.11.2021 . ПМИД  9365385.
  37. ^ Чиу С.А., Миллер С.А. (июнь 2019 г.). «Клиническая метагеномика». Обзоры природы. Генетика . 20 (6): 341–355. дои : 10.1038/s41576-019-0113-7. ПМК 6858796 . ПМИД  30918369. 
  38. ^ ван Лиер М.Г., Вагнер А., ван Леердам М.Э., Бирманн К., Кейперс Э.Дж., Штайерберг Э.В., Дуббинк Х.Дж., Диньенс В.Н. (январь 2010 г.). «Обзор молекулярной диагностики синдрома Линча: центральная роль патологоанатомической лаборатории». Журнал клеточной и молекулярной медицины . 14 (1–2): 181–97. дои : 10.1111/j.1582-4934.2009.00977.x. ПМЦ 3837620 . ПМИД  19929944. 
  39. ^ Шримптон AE (май 2002 г.). «Молекулярная диагностика муковисцидоза». Экспертный обзор молекулярной диагностики . 2 (3): 240–56. дои : 10.1586/14737159.2.3.240. PMID  12050863. S2CID  27351636.
  40. ^ Андорно Р. (октябрь 2004 г.). «Право не знать: подход, основанный на автономии». Журнал медицинской этики . 30 (5): 435–9, обсуждение 439–40. дои : 10.1136/jme.2002.001578. ПМЦ 1733927 . ПМИД  15467071. 
  41. ↑ Хармон, Эми (24 февраля 2008 г.) Страховые страхи заставляют многих избегать тестов ДНК. Газета "Нью-Йорк Таймс
  42. ^ Минамото Т., Угольков А.В., Май М. (ноябрь 2002 г.). «Обнаружение онкогенов в диагностике рака с активной онкогенной передачей сигналов». Экспертный обзор молекулярной диагностики . 2 (6): 565–75. дои : 10.1586/14737159.2.6.565. PMID  12465453. S2CID  26732113.
  43. ^ Бреннан DJ, О'Коннор DP, Реджепай Э, Понтен Ф, Галлахер WM (сентябрь 2010 г.). «Протеомика на основе антител: ускоренная молекулярная диагностика в онкологии». Обзоры природы. Рак . 10 (9): 605–17. дои : 10.1038/nrc2902. PMID  20720569. S2CID  23540973.
  44. ^ Феррацин М., Веронезе А., Негрини М. (апрель 2010 г.). «Микромаркеры: микроРНК в диагностике и прогнозе рака». Экспертный обзор молекулярной диагностики . 10 (3): 297–308. дои : 10.1586/эм.10.11. PMID  20370587. S2CID  45371217.
  45. ^ Мисале С, Ягер Р, Хобор С, Скала Е, Джанакираман М, Лиска Д, Валторта Е, Скьяво Р, Бускарино М, Сиравенья Г, Бенкардино К, Серчек А, Чен CT, Веронезе С, Занон С, Сарторе-Бьянки А , Гамбакорта М, Галликкио М, Вакиани Е, Боскаро В, Медико Е, Вайзер М, Сиена С, Ди Николантонио Ф, Солит Д, Барделли А (июнь 2012 г.). «Появление мутаций KRAS и приобретенной устойчивости к терапии анти-EGFR при колоректальном раке». Природа . 486 (7404): 532–6. Бибкод : 2012Natur.486..532M. дои : 10.1038/nature11156. ПМЦ 3927413 . ПМИД  22722830. 
  46. ^ Эммади Р., Буньяратанакорнкит Дж.Б., Сельваранган Р., Шьямала В., Циммер Б.Л., Уильямс Л., Брайант Б., Шуцбанк Т., Скунмейкер М.М., Амос Уилсон Дж.А., Холл Л., Панчоли П., Бернард К. (ноябрь 2011 г.). «Молекулярные методы и платформы для тестирования инфекционных заболеваний: обзор одобренных и одобренных FDA анализов». Журнал молекулярной диагностики . 13 (6): 583–604. дои : 10.1016/j.jmoldx.2011.05.011. ПМК 3194051 . ПМИД  21871973. 
  47. ^ Одобренная FDA система секвенирования следующего поколения может расширить клиническое геномное тестирование: эксперты прогнозируют, что платформа MiSeqDx сделает генетическое тестирование более доступным для небольших лабораторий. ЯВЛЯЮСЬ. Дж. Мед. Жене. А 164, X-XI.
  48. ↑ Ангуло Б, Конде Э, Суарес-Готье А, Плаза С, Мартинес Р, Редондо П, Искьердо Э, Рубио-Викейра Б, Пас-Арес Л, Идальго М, Лопес-Риос Ф (27 августа 2012 г.). «Сравнение методов тестирования мутаций EGFR при карциноме легких: прямое секвенирование, ПЦР в реальном времени и иммуногистохимия». ПЛОС ОДИН . 7 (8): е43842. Бибкод : 2012PLoSO...743842A. дои : 10.1371/journal.pone.0043842 . ПМЦ 3428292 . ПМИД  22952784. 
  49. ^ Гонсалес де Кастро Д, Ангуло Б, Гомес Б, Майр Д, Мартинес Р, Суарес-Готье А, Шие Ф, Велес М, Брофи В.Х., Лоуренс Х.Дж., Лопес-Риос Ф (июль 2012 г.). «Сравнение трех методов обнаружения мутаций KRAS в фиксированных формалином образцах колоректального рака». Британский журнал рака . 107 (2): 345–51. дои : 10.1038/bjc.2012.259. ПМК 3394984 . ПМИД  22713664. 
  50. ^ Маршан Дж., Манж А., Ларри М., Костес В., Солассол Дж. (июль 2014 г.). «Сравнительная оценка нового одобренного FDA теста THxID™-BRAF с плавлением высокого разрешения и секвенированием по Сэнгеру». БМК Рак . 14 :519. дои : 10.1186/1471-2407-14-519 . ПМЦ 4223712 . ПМИД  25037456. 
  51. ^ Салазар Р, Ропман П, Капелла Г, Морено В, Саймон I, Дризен С, Лопес-Дорига А, Сантос С, Марийнен С, Вестерга Дж, Брюин С, Керр Д, Куппен П, ван де Вельде С, Морро Х, Ван Велтуйсен Л., Глас А.М., Вант Вир Л.Дж., Толленаар Р. (январь 2011 г.). «Сигнатура экспрессии генов для улучшения прогнозирования прогноза колоректального рака II и III стадий». Журнал клинической онкологии . 29 (1): 17–24. дои : 10.1200/JCO.2010.30.1077 . hdl : 2445/198405 . ПМИД  21098318.
  52. ^ Уиттнер Б.С., Сгрой, округ Колумбия, Райан П.Д., Бруинсма Т.Дж., Глас А.М., Мале А, Дахия С., Хабин К., Бернардс Р., Хабер Д.А., Вант Вир Л.Дж., Рамасвами С. (май 2008 г.). «Анализ анализа рака молочной железы MammaPrint в когорте преимущественно в постменопаузе». Клинические исследования рака . 14 (10): 2988–93. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-07-4723. ПМК 3089800 . ПМИД  18483364. 
  53. ^ Ли CC, Макмиллин Г.А., Бабич Н., Мелис Р., Йео КТ (май 2011 г.). «Оценка панели генотипа CYP2C19 на платформе GenMark eSensor® и сравнение с панелями Autogenomics Infiniti™ и Luminex CYP2C19». Клиника Химика Акта; Международный журнал клинической химии . 412 (11–12): 1133–7. doi : 10.1016/j.cca.2011.03.001. ПМИД  21385571.
  54. ^ Пфундт Р., Квятковски К., Ротер А., Шукла А., Торланд Э., Хокетт Р., Дюпон Б., Фунг Э.Т., Чаубей А. (февраль 2016 г.). «Клинические характеристики анализа CytoScan Dx при диагностике задержки развития / умственной отсталости». Генетика в медицине . 18 (2): 168–73. дои : 10.1038/gim.2015.51 . hdl : 2066/167658 . ПМИД  25880438.
  55. ^ Ховелсон Д.Х., МакДэниел А.С., Кани А.К., Джонсон Б., Роудс К., Уильямс П.Д. и др. (апрель 2015 г.). «Разработка и проверка масштабируемой системы секвенирования нового поколения для оценки соответствующих соматических вариантов солидных опухолей». Неоплазия . 17 (4): 385–99. дои : 10.1016/j.neo.2015.03.004. ПМЦ 4415141 . ПМИД  25925381. 
  56. ^ Imperiale TF, Рансохофф Д.Ф., Ицковиц С.Х. (июль 2014 г.). «Многоцелевое ДНК-тестирование стула для скрининга колоректального рака». Медицинский журнал Новой Англии . 371 (2): 187–8. дои : 10.1056/NEJMc1405215. ПМИД  25006736.
  57. ^ Ракович Э., Нофех-Мозес С., Ханна В., Бэнер Ф.Л., Саскин Р., Батлер С.М., Так А., Сенгупта С., Элаватил Л., Яни П.А., Бонин М., Чанг MC, Робертсон С.Дж., Слодковска Е., Фонг С., Андерсон Дж.М. , Джамшидян Ф., Миллер Д.П., Чербаваз Д.Б., Шак С., Пасат Л. (июль 2015 г.). «Популяционное исследование оценки DCIS Score, прогнозирующее риск рецидива у людей, пролеченных только с помощью органосохраняющей операции». Исследование и лечение рака молочной железы . 152 (2): 389–98. дои : 10.1007/s10549-015-3464-6. ПМЦ 4491104 . ПМИД  26119102.