stringtranslate.com

Фармакогеномика

Фармакогеномика , часто сокращенно «PGx», — это изучение роли генома в реакции на лекарственные препараты . Ее название ( pharmaco- + genomics ) отражает объединение фармакологии и геномики . Фармакогеномика анализирует, как генетический состав пациента влияет на его реакцию на лекарственные препараты. [1] Она занимается влиянием приобретенных и унаследованных генетических вариаций на реакцию на лекарственные препараты, сопоставляя мутации ДНК (включая точечные мутации , вариации числа копий и структурные вариации ) с фармакокинетическими ( абсорбция , распределение , метаболизм и выведение препарата ), фармакодинамикой (эффекты, опосредованные биологическими мишенями препарата ) и/или иммуногенными конечными точками. [2] [3] [4]

Фармакогеномика направлена ​​на разработку рациональных средств оптимизации лекарственной терапии с учетом генотипа пациентов для достижения максимальной эффективности с минимальными побочными эффектами . [5] Есть надежда, что с помощью фармакогеномики фармацевтическое лечение препаратами может отклониться от того, что называют подходом «одна доза подходит всем». Фармакогеномика также пытается устранить метод проб и ошибок при назначении лекарств, позволяя врачам принимать во внимание гены своих пациентов, функциональность этих генов и то, как это может повлиять на эффективность текущего или будущего лечения пациента (и, где это применимо, дать объяснение неудачам прошлых методов лечения). [6] [7] Такие подходы обещают появление точной медицины и даже персонализированной медицины , в которой препараты и комбинации препаратов оптимизируются для узких подгрупп пациентов или даже для уникальной генетической структуры каждого человека. [8] [9]

Независимо от того, используется ли он для объяснения реакции пациента (или ее отсутствия) на лечение или действует как предсказательный инструмент, он надеется достичь лучших результатов лечения и большей эффективности, а также снизить токсичность лекарств и побочные реакции лекарств (ADR). Для пациентов, которые не реагируют на лечение, могут быть назначены альтернативные методы лечения, которые наилучшим образом соответствуют их требованиям. Для предоставления фармакогеномных рекомендаций для данного препарата могут быть использованы два возможных типа ввода: генотипирование или секвенирование экзома или всего генома . [10] Секвенирование обеспечивает гораздо больше точек данных, включая обнаружение мутаций, которые преждевременно завершают синтезированный белок (ранний стоп-кодон ). [10]

Фармакогенетика против фармакогеномики

Термин фармакогеномика часто используется взаимозаменяемо с фармакогенетикой . Хотя оба термина относятся к реакции на лекарственные препараты, основанной на генетических влияниях, между ними есть различия. Фармакогенетика ограничена моногенными фенотипами (т. е. взаимодействиями одного гена и лекарственного препарата). Фармакогеномика относится к полигенным фенотипам реакции на лекарственные препараты и охватывает транскриптомику , протеомику и метаболомику .

Механизмы фармакогенетических взаимодействий

Фармакокинетика

Фармакокинетика включает в себя абсорбцию, распределение, метаболизм и выведение фармацевтических препаратов. Эти процессы часто облегчаются ферментами, такими как транспортеры лекарств или ферменты, метаболизирующие лекарства (подробно обсуждаемые ниже). Изменения в локусах ДНК, ответственных за выработку этих ферментов, могут изменить их экспрессию или активность, так что их функциональный статус изменится. Увеличение, уменьшение или потеря функции транспортеров или метаболизирующих ферментов может в конечном итоге изменить количество лекарства в организме и в месте действия. Это может привести к отклонению от терапевтического окна лекарства и привести либо к токсичности, либо к потере эффективности.

Ферменты, метаболизирующие лекарства

Большинство клинически действующих фармакогенетических вариаций происходит в генах, которые кодируют ферменты, метаболизирующие лекарственные препараты, включая те, которые участвуют как в метаболизме фазы I , так и фазы II . Семейство ферментов цитохрома P450 отвечает за метаболизм 70-80% всех лекарственных препаратов, используемых в клинической практике. [11] CYP3A4 , CYP2C9 , CYP2C19 и CYP2D6 являются основными ферментами CYP, участвующими в метаболизме лекарственных препаратов, и все они известны своей высокой полиморфностью. [11] Дополнительные ферменты, метаболизирующие лекарственные препараты, которые были вовлечены в фармакогенетические взаимодействия, включают UGT1A1 ( UDP-глюкуронозилтрансфераза ), DPYD и TPMT . [12]

Перевозчики наркотиков

Многие лекарства используют транспортеры для пересечения клеточных мембран для перемещения между жидкостями организма, такими как кровь, просвет кишечника, желчь, моча, мозг и спинномозговая жидкость. [13] Основные транспортеры включают переносчик растворенного вещества , АТФ-связывающую кассету и транспортеры органических анионов . [13] Транспортеры, которые, как было показано, влияют на реакцию на лекарства, включают OATP1B1 ( SLCO1B1 ) и белок резистентности рака молочной железы (BCRP) ( ABCG2 ). [14]

Фармакодинамика

Фармакодинамика относится к влиянию лекарственного средства на организм или механизму его действия.

Цели по наркотикам

Мишени лекарственных средств — это конкретные участки, где лекарство осуществляет свою фармакологическую активность. Взаимодействие между лекарственным средством и этим участком приводит к модификации мишени, которая может включать ингибирование или потенцирование. [15] Большинство фармакогенетических взаимодействий, включающих мишени лекарственных средств, находятся в области онкологии и включают целевые терапевтические средства, предназначенные для устранения соматических мутаций (см. также Фармакогеномика рака ). Например, ингибиторы EGFR, такие как гефитиниб (Иресса) или эрлотиниб (Тарцева), показаны только пациентам, несущим определенные мутации в EGFR . [16] [17]

Мутации зародышевой линии в лекарственных мишенях также могут влиять на реакцию на лекарства, хотя это новая область в фармакогеномике. Одним из хорошо известных взаимодействий гена и препарата, включающих мутацию зародышевой линии в лекарственной мишени, является варфарин (кумадин) и VKORC1 , который кодирует эпоксидредуктазу витамина К (VKOR) . Варфарин связывается с VKOR и ингибирует его, который является важным ферментом в цикле витамина К. [18] Ингибирование VKOR предотвращает снижение витамина К , который является кофактором, необходимым для образования факторов свертывания крови II , VII , IX и X , а также ингибиторов протеина C и S. [18] [19]

Нецелевые сайты

Лекарства могут иметь нецелевые эффекты (обычно неблагоприятные), которые возникают из-за взаимодействия между лекарством и/или его метаболитами и сайтом, отличным от предполагаемой цели. [20] Генетическая изменчивость в нецелевых сайтах может влиять на это взаимодействие. Основным примером этого типа фармакогеномного взаимодействия является глюкозо-6-фосфатдегидрогеназа (G6PD) . G6PD — это фермент, участвующий в первом этапе пентозофосфатного пути , который генерирует НАДФН (из НАДФ). НАДФН требуется для производства восстановленного глутатиона в эритроцитах и ​​необходим для функции каталазы . [21] Глутатион и каталаза защищают клетки от окислительного стресса, который в противном случае привел бы к лизису клеток . Определенные варианты G6PD приводят к дефициту G6PD , при котором клетки становятся более восприимчивыми к окислительному стрессу. Когда лекарства, оказывающие значительное окислительное действие, назначаются лицам с дефицитом G6PD, у них повышается риск лизиса эритроцитов, который проявляется как гемолитическая анемия . [22]

Иммунологический

Система человеческого лейкоцитарного антигена (HLA), также называемая главным комплексом гистосовместимости (MHC), представляет собой комплекс генов, важных для адаптивной иммунной системы . Мутации в комплексе HLA связаны с повышенным риском развития реакций гиперчувствительности в ответ на определенные лекарства. [23]

Ресурсы по клинической фармакогеномике

Консорциум по внедрению клинической фармакогенетики (CPIC)

Консорциум по внедрению клинической фармакогенетики (CPIC) — это «международный консорциум индивидуальных волонтеров и небольшого числа преданных своему делу сотрудников, заинтересованных в содействии использованию фармакогенетических тестов для лечения пациентов. Цель CPIC — устранить барьеры для клинического внедрения фармакогенетических тестов путем создания, курирования и публикации свободно доступных, рецензируемых, основанных на фактических данных, обновляемых и подробных руководств по клинической практике генов/лекарств. Руководства CPIC следуют стандартизированным форматам, включают систематическую оценку доказательств и клинических рекомендаций, используют стандартизированную терминологию, рецензируются и публикуются в журнале (в партнерстве с Clinical Pharmacology and Therapeutics) с одновременной публикацией на cpicpgx.org, где они регулярно обновляются». [12]

Руководящие принципы CPIC «разработаны для того, чтобы помочь врачам понять, КАК имеющиеся результаты генетических тестов следует использовать для оптимизации лекарственной терапии, а не то, НУЖНО ли заказывать тесты. Ключевое предположение, лежащее в основе руководящих принципов CPIC, заключается в том, что клиническое высокопроизводительное и упреждающее (до назначения) генотипирование станет более распространенным, и что врачи столкнутся с необходимостью иметь генотипы пациентов, даже если они явно не заказывали тест с определенным препаратом. Руководящие принципы, процессы и проекты CPIC были одобрены несколькими профессиональными обществами». [12]

Управление по контролю за продуктами и лекарствами США

Таблица фармакогенетических ассоциаций

В феврале 2020 года FDA опубликовало Таблицу фармакогенетических ассоциаций. [24] Для пар ген-препарат, включенных в таблицу, «FDA провело оценку и считает, что имеются достаточные научные доказательства, позволяющие предположить, что подгруппы пациентов с определенными генетическими вариантами или фенотипами, выведенными из генетических вариантов (например, затронутая подгруппа в таблице ниже), вероятно, будут иметь измененный метаболизм лекарств и, в некоторых случаях, различные терапевтические эффекты, включая различия в рисках нежелательных явлений». [25]

«Информация в этой таблице предназначена в первую очередь для врачей, и пациенты не должны корректировать свои лекарства без консультации с врачом. Эта версия таблицы ограничена фармакогенетическими ассоциациями, которые связаны с вариантами генов ферментов, метаболизирующих лекарственные препараты, вариантами генов транспортеров лекарственных препаратов и вариантами генов, которые связаны с предрасположенностью к определенным нежелательным явлениям. FDA признает, что существуют различные другие фармакогенетические ассоциации, которые здесь не перечислены, и эта таблица будет периодически обновляться дополнительными фармакогенетическими ассоциациями, подкрепленными достаточными научными доказательствами». [25]

Таблица фармакогеномных биомаркеров в маркировке лекарственных средств

Таблица фармакогеномных биомаркеров в маркировке лекарств FDA содержит список одобренных FDA препаратов с фармакогеномной информацией, содержащейся в маркировке лекарств. «Биомаркеры в таблице включают, помимо прочего, варианты генов зародышевой линии или соматические варианты (полиморфизмы, мутации), функциональные дефициты с генетической этиологией, различия в экспрессии генов и хромосомные аномалии; также включены выбранные белковые биомаркеры, которые используются для выбора лечения для пациентов». [26]

ФармГКБ

База знаний по фармакогеномике (PharmGKB) — это « финансируемый NIH ресурс, который предоставляет информацию о том, как генетические вариации человека влияют на реакцию на лекарства. PharmGKB собирает, курирует и распространяет знания о клинически применимых ассоциациях генов и лекарств и связях генотипа и фенотипа». [27]

Коммерческие лаборатории фармакогенетических испытаний

Во всем мире существует множество коммерческих лабораторий, предлагающих фармакогеномное тестирование в качестве лабораторно-разработанного теста (LDT) . Предлагаемые тесты могут значительно различаться в разных лабораториях, включая тестируемые гены и аллели, фенотипическое назначение и любые предоставленные клинические аннотации. За исключением нескольких тестов, проводимых напрямую для потребителя, все фармакогенетическое тестирование требует заказа от уполномоченного медицинского работника. Для того чтобы результаты можно было использовать в клинических условиях в Соединенных Штатах , лаборатория, проводящая тест, должна быть сертифицирована CLIA . Другие правила могут различаться в зависимости от страны и штата.

Окончательные консенсусные условия для функционального статуса аллеля и фенотипа

Фармакогенетическое тестирование напрямую у потребителя

Фармакогенетические тесты для потребителей (DTC) позволяют потребителям получать фармакогенетическое тестирование без заказа от врача. Фармакогенетические тесты DTC обычно проверяются FDA для определения обоснованности заявлений о тесте. [28] FDA ведет список генетических тестов DTC, которые были одобрены.

Общая фармакогеномно-специфическая номенклатура

Генотип

Существует несколько способов представления фармакогеномного генотипа . Обычно используемая система номенклатуры — это представление гаплотипов с использованием звездочки (*) аллеля (например, CYP2C19 *1/*2). Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) могут быть описаны с использованием их идентификатора кластера SNP (rsID) или на основе расположения пары оснований или затронутой аминокислоты . [29]

Фенотип

В 2017 году CPIC опубликовал результаты экспертного опроса с целью стандартизации терминов, связанных с результатами клинических фармакогенетических тестов. [30] Был достигнут консенсус относительно терминов для описания функционального статуса аллеля, фенотипа для ферментов, метаболизирующих лекарственные препараты, фенотипа для транспортеров лекарственных препаратов и фенотипа для статуса генотипа высокого риска.

Приложения

В списке ниже приведены несколько наиболее известных применений фармакогеномики: [31]

Фармакогеномика может применяться в нескольких областях медицины, включая лечение боли , кардиологию , онкологию и психиатрию . Также может существовать место в судебной патологии , где фармакогеномика может использоваться для определения причины смерти в случаях смерти, связанных с наркотиками, когда при вскрытии не выявляются никакие данные . [ требуется ссылка ]

При лечении рака фармакогеномные тесты используются для определения того, какие пациенты с наибольшей вероятностью отреагируют на определенные противораковые препараты . В поведенческом здоровье фармакогеномные тесты предоставляют врачам и лицам, осуществляющим уход, инструменты для лучшего управления выбором лекарств и устранения побочных эффектов. Фармакогеномика также известна как сопутствующая диагностика, то есть тесты, которые идут в комплекте с лекарствами. Примерами служат тест KRAS с цетуксимабом и тест EGFR с гефитинибом . Помимо эффективности, фармакогенетика зародышевой линии может помочь выявить пациентов, которые, вероятно, подвергнутся тяжелой токсичности при приеме цитотоксических препаратов, демонстрирующих нарушение детоксикации в связи с генетическим полиморфизмом, например, канонического 5-FU. [32] В частности, генетические нарушения регуляции, влияющие на гены, кодирующие DPD , UGT1A1 , TPMT , CDA и CYP2D6, в настоящее время считаются критическими проблемами для пациентов, проходящих лечение 5-FU/капецитабином, иринотеканом, меркаптопурином/азатиоприном, гемцитабином/капецитабином/AraC и тамоксифеном соответственно. [33]

При сердечно-сосудистых заболеваниях основной проблемой является реакция на препараты, включая варфарин , клопидогрель , бета-блокаторы и статины . [10] У пациентов с CYP2C19, принимающих клопидогрель, повышен сердечно-сосудистый риск, что приводит к обновлению инструкций по применению лекарств регулирующими органами. [34] У пациентов с диабетом 2 типа генотипирование гаптоглобина (Hp) показывает влияние на сердечно-сосудистые заболевания, при этом Hp2-2 подвержен более высокому риску, а дополнительный витамин E снижает риск, влияя на ЛПВП . [35]

В психиатрии, начиная с 2010 года, исследования были сосредоточены в основном на 5-HTTLPR и DRD2 . [36]

Клиническая реализация

Инициативы по стимулированию внедрения среди врачей включают программу Ubiquitous Pharmacogenomics (U-PGx) в Европе и Консорциум по внедрению клинической фармакогенетики (CPIC) в Соединенных Штатах. [37] В опросе европейских врачей, проведенном в 2017 году, в предыдущем году две трети не заказывали фармакогенетический тест. [38]

В 2010 году Медицинский центр Университета Вандербильта запустил фармакогеномный ресурс для принятия более обоснованных решений в области ухода и лечения (PREDICT); [39] в исследовании 2015 года две трети врачей назначили фармакогенетический тест. [40]

В 2019 году крупнейшая частная медицинская страховая компания UnitedHealthcare объявила, что оплатит генетическое тестирование для прогнозирования реакции на психиатрические препараты. [41]

В 2020 году 4-я по величине медицинская и стоматологическая страховая компания Канады Green Shield Canada объявила, что оплатит фармакогенетическое тестирование и связанное с ним программное обеспечение для поддержки принятия клинических решений с целью оптимизации и персонализации рецептов в области психического здоровья. [42]

Сокращение полипрагмазии

Потенциальная роль фармакогеномики заключается в снижении частоты полипрагмазии : предполагается, что при индивидуальном лечении лекарствами пациентам не нужно будет принимать несколько лекарств для лечения одного и того же состояния. Таким образом, они могли бы потенциально снизить частоту побочных реакций на лекарства , улучшить результаты лечения и сэкономить средства, избегая покупки некоторых лекарств. Например, возможно, из-за неправильного назначения лекарств психиатрические пациенты, как правило, получают больше лекарств, чем непсихиатрические пациенты того же возраста. [43]

Необходимость в фармакогеномически адаптированных лекарственных терапиях может быть наиболее очевидна в исследовании, проведенном Эпидемиологическим центром Слоуна в Бостонском университете с февраля 1998 года по апрель 2007 года. Исследование выявило, что в среднем 82% взрослых в Соединенных Штатах принимают по крайней мере одно лекарство (рецептурное или безрецептурное лекарство, витамин/минерал, травяную/натуральную добавку), а 29% принимают пять или более. Исследование показало, что люди в возрасте 65 лет и старше продолжают оставаться крупнейшими потребителями лекарств, при этом 17-19% в этой возрастной группе принимают по крайней мере десять лекарств в неделю. Также было показано, что полипрагмазия выросла с 2000 года с 23% до 29%. [44]

Примеры тематических исследований

Случай А – Нежелательная реакция на антипсихотические препараты [45]

Пациент А страдает шизофренией. Их лечение включало комбинацию зипрасидона, оланзапина, тразодона и бензтропина . У пациента возникли головокружение и седация, поэтому ему постепенно снизили дозу зипрасидона и оланзапина и перевели на кветиапин. Тразодон был отменен. Затем у пациента появились повышенное потоотделение, тахикардия и боль в шее, он значительно набрал вес и у него появились галлюцинации. Пять месяцев спустя кветиапин был постепенно снижен и отменен, а зипразидон был снова включен в их лечение из-за чрезмерного набора веса. Хотя пациент потерял набранный избыточный вес, у него затем развилась мышечная скованность, зубчатое колесо , тремор и ночная потливость. Когда был добавлен бензтропин, у него возникло нечеткое зрение. Еще через пять месяцев пациента перевели с зипрасидона на арипипразол. В течение 8 месяцев пациент А постепенно испытывал большее увеличение веса и седацию, а также трудности с походкой, скованность, зубчатость и дискинетические движения глаз. Фармакогеномный тест позже показал, что у пациента был CYP2D6 *1/*41, который имеет прогнозируемый фенотип ИМ, и CYP2C19 *1/*2 с прогнозируемым фенотипом ИМ.

Случай B – Лечение боли [46]

Пациентка Б — женщина, родившая с помощью кесарева сечения. Ее врач прописал ей кодеин от боли после кесарева сечения. Она приняла стандартную предписанную дозу, но во время приема кодеина у нее возникли тошнота и головокружение. Она также заметила, что ее грудной ребенок был вялым и плохо ел. Когда пациентка упомянула об этих симптомах своему врачу, он порекомендовал ей прекратить прием кодеина. Через несколько дней симптомы как у пациентки, так и у ее ребенка исчезли. Предполагается, что если бы пациентка прошла фармакогеномный тест, он бы выявил у нее, возможно, дупликацию гена CYP2D6, что отнесло бы ее к категории сверхбыстрых метаболизаторов (UM), что объясняет ее реакцию на прием кодеина.

Случай C – Предупреждение FDA о передозировке кодеина у младенцев [47]

20 февраля 2013 года FDA опубликовало заявление, в котором выражается серьезная обеспокоенность относительно связи между детьми, известными как CYP2D6 UM, и фатальными реакциями на кодеин после тонзиллэктомии и/или аденоидэктомии (операции по удалению миндалин и/или аденоидов). Они выпустили свое самое строгое предупреждение в коробке, чтобы разъяснить опасности употребления кодеина детьми CYP2D6 UM. Кодеин преобразуется в морфин под действием CYP2D6, и те, у кого есть фенотипы UM, подвергаются опасности выработки большого количества морфина из-за повышенной функции гена. Морфин может повышаться до опасных для жизни или смертельных количеств, как стало очевидно после смерти трех детей в августе 2012 года.

Вызовы

Последовательные фазы и связанные с ними проблемы в фармакогеномике. [48]

Хотя, по-видимому, существует общее признание основного принципа фармакогеномики среди врачей и специалистов здравоохранения, [49] существует несколько проблем, которые замедляют усвоение, внедрение и стандартизацию фармакогеномики. Некоторые из опасений, поднятых врачами, включают: [50] [49] [51]

Проблемы, связанные с доступностью теста, включают: [48]

Хотя другие факторы способствуют медленному прогрессу фармакогеномики (например, разработка руководств по клиническому применению), вышеперечисленные факторы, по-видимому, являются наиболее распространенными. Все более существенные доказательства и руководящие принципы отраслевых организаций по клиническому применению фармакогенетики сделали ее подходом к точной медицине для всего населения. Стоимость, возмещение, образование и простота использования в месте оказания помощи остаются значительными препятствиями для широкомасштабного внедрения.

Споры

Расовая медицина

Был призыв отойти от расы и этнической принадлежности в медицине и вместо этого использовать генетическое происхождение как способ категоризации пациентов. [52] Было показано, что некоторые аллели , которые различаются по частоте между определенными популяциями, связаны с различными ответами на определенные препараты . В результате некоторые руководства по конкретным заболеваниям рекомендуют фармакогенетическое тестирование только для популяций, где аллели высокого риска более распространены [53] и, аналогично, некоторые страховые компании будут оплачивать фармакогенетическое тестирование только для бенефициаров групп высокого риска. [54]

Генетическая исключительность

В начале 2000-х годов обращение с генетической информацией как с чем-то исключительным, включая правовую или нормативную защиту, получило мощную поддержку. Утверждалось, что геномная информация может нуждаться в особой политике и практике защиты в контексте электронных медицинских карт (EHR). [55] В 2008 году был принят Закон о недискриминации генетической информации (GINA) для защиты пациентов от медицинских страховых компаний, дискриминирующих человека на основе генетической информации. [56] [57]

Совсем недавно утверждалось, что генетическая исключительность уже не актуальна, поскольку мы вступаем в смешанную эпоху геномики/больших данных в медицине, однако практики исключительности продолжают проникать в клиническое здравоохранение и сегодня. [58] [59] Гаррисон и др. недавно передали призыв к действию, чтобы обновить формулировки с генетической исключительности на геномный контекстуализм, поскольку мы признаем фундаментальную двойственность генетической информации. [60] Это позволяет аргументировать, что различные типы генетической информации должны обрабатываться по-разному, признавая при этом, что геномная информация похожа и в то же время отличается от другой информации, связанной со здоровьем. [60] Геномный контекстуализм позволил бы проводить индивидуальный анализ технологии и контекста ее использования (например, клиническая практика, исследования, вторичные результаты).

Другие утверждают, что генетическая информация действительно отличается от другой информации, связанной со здоровьем, но не в той степени, чтобы требовать правовой/нормативной защиты, подобной другим конфиденциальным данным, связанным со здоровьем, таким как ВИЧ-статус. [61] Кроме того, Эванс и др. утверждают, что EHR имеет достаточные стандарты конфиденциальности для хранения другой конфиденциальной информации, такой как номера социального страхования, и что фундаментальная природа EHR заключается в размещении сугубо личной информации. [58] Аналогичным образом, систематический обзор сообщил, что общественность обеспокоена конфиденциальностью генетической информации, при этом 60% согласились, что сохранение конфиденциальности невозможно; однако 96% согласились, что компания, проводящая тестирование напрямую к потребителю, защитила их конфиденциальность, а 74% заявили, что их информация будет защищена аналогичным образом или лучше в EHR. С ростом технологических возможностей в EHR можно скрыть или скрыть генетические данные от подгрупп поставщиков, и нет единого мнения о том, как, когда или от кого следует скрывать генетическую информацию. [55] [62] Утверждается, что строгая защита и сокрытие генетической информации препятствует дальнейшему научному прогрессу и клиническому переводу в повседневную клиническую практику. [63]

История

Фармакогеномика была впервые признана Пифагором около 510 г. до н. э., когда он установил связь между опасностями употребления конских бобов с гемолитической анемией и окислительным стрессом . В 1950-х годах эта идентификация была подтверждена и приписана дефициту G6PD и называется фавизмом . [64] [65] Хотя первая официальная публикация была только в 1961 году, [66] неофициальное начало этой науки относится к 1950-м годам. Сообщения о длительном параличе и фатальных реакциях, связанных с генетическими вариантами у пациентов, у которых отсутствовала бутирилхолинэстераза («псевдохолинэстераза») после инъекции сукцинилхолина во время анестезии, впервые появились в 1956 году. [2] [67] Термин «фармакогенетика» был впервые введен в употребление в 1959 году Фридрихом Фогелем из Гейдельберга , Германия (хотя некоторые статьи предполагают, что это было в 1957 или 1958 году). [68] В конце 1960-х годов исследования близнецов подтвердили вывод о генетическом участии в метаболизме лекарств, при этом однояйцевые близнецы имели поразительное сходство в реакции на лекарства по сравнению с разнояйцевыми близнецами. [69] Термин «фармакогеномика» впервые начал появляться около 1990-х годов. [64]

Первое одобрение FDA фармакогенетического теста было получено в 2005 году [9] (для аллелей CYP2D6 и CYP2C19 ).

Будущее

Вычислительные достижения сделали возможным более дешевое и быстрое секвенирование. [70] Исследования были сосредоточены на комбинаторной химии , [71] геномном майнинге, омических технологиях и высокопроизводительном скрининге .

По мере снижения стоимости генетического теста будет расти разработка персонализированной лекарственной терапии. [72] Технологии теперь позволяют проводить генетический анализ сотен целевых генов, участвующих в метаболизме и реакции на лекарства, менее чем за 24 часа и менее чем за 1000 долларов. Это огромный шаг на пути к внедрению фармакогенетической технологии в повседневные медицинские решения. Аналогичным образом, такие компании, как deCODE genetics , MD Labs Pharmacogenetics, Navigenics и 23andMe, предлагают сканирование генома. Компании используют те же чипы генотипирования , которые используются в исследованиях GWAS, и предоставляют клиентам описание индивидуального риска для различных признаков и заболеваний, а также тестирование на 500 000 известных SNP. Цены варьируются от 995 до 2500 долларов и включают обновления с новыми данными исследований по мере их поступления. Более дорогие пакеты даже включали телефонный сеанс с генетическим консультантом для обсуждения результатов. [73]

Этика

Фармакогенетика стала спорным вопросом в области биоэтики . Конфиденциальность и конфиденциальность являются основными проблемами. [74] Доказательства пользы или риска генетического теста могут быть только предположительными, что может вызвать дилеммы для поставщиков. [74] : 145  Разработка лекарств может быть затронута, при этом редкие генетические варианты, возможно, получат меньше исследований. [74] Доступ и автономия пациента также открыты для обсуждения. [75] : 680 

Веб-ресурсы

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Ермак Г (2015). Новые медицинские технологии . World Scientific. ISBN 978-981-4675-80-2.
  2. ^ ab Johnson JA (ноябрь 2003 г.). «Фармакогенетика: потенциал для индивидуализированной лекарственной терапии с помощью генетики». Trends in Genetics . 19 (11): 660–666. doi :10.1016/j.tig.2003.09.008. PMID  14585618. S2CID  15195039.
  3. ^ "Центр фармакогеномики и индивидуальной терапии". Unc Eshelman School of Pharmacy . Получено 25.06.2014 .
  4. ^ "Обзор фармакогеномики". Обновлено. 16 мая 2014 г. Получено 25 июня 2014 г.
  5. ^ Becquemont L (июнь 2009). «Фармакогеномика побочных реакций на лекарства: практическое применение и перспективы». Фармакогеномика . 10 (6): 961–969. doi :10.2217/pgs.09.37. PMID  19530963.
  6. ^ Sheffield LJ, Phillimore HE (май 2009). «Клиническое использование фармакогеномных тестов в 2009 году». The Clinical Biochemist. Обзоры . 30 (2): 55–65. PMC 2702214. PMID  19565025 . 
  7. ^ Хаузер А.С., Чавали С., Масухо И., Ян Л.Дж., Мартемьянов К.А., Глориам Д.Э., Бабу М.М. (январь 2018 г.). «Фармакогеномика лекарственных средств-мишеней GPCR». Клетка . 172 (1–2): 41–54.e19. дои : 10.1016/j.cell.2017.11.033. ПМК 5766829 . ПМИД  29249361. 
  8. ^ "Руководство по подаче фармакогеномных данных в промышленность" (PDF) . Управление по контролю за продуктами питания и лекарственными средствами США . Март 2005 г. Получено 27 августа 2008 г.
  9. ^ ab Squassina A, Manchia M, Manolopoulos VG, Artac M, Lappa-Manakou C, Karkabouna S и др. (август 2010 г.). «Реальности и ожидания фармакогеномики и персонализированной медицины: влияние перевода генетических знаний в клиническую практику». Pharmacogenomics . 11 (8): 1149–1167. doi :10.2217/pgs.10.97. PMID  20712531.
  10. ^ abc Huser V, Cimino JJ (2013). «Предоставление поддержки клинических решений в области фармакогеномики с использованием данных секвенирования всего генома в качестве входных данных». Труды совместных саммитов AMIA по трансляционной науке. AMIA Joint Summits on Translational Science . 2013 : 81. PMID  24303303.
  11. ^ ab Zanger, Ulrich M.; Schwab, Matthias (2013-04-01). «Ферменты цитохрома P450 в метаболизме лекарств: регуляция экспрессии генов, активности ферментов и влияние генетической изменчивости». Pharmacology & Therapeutics . 138 (1): 103–141. doi : 10.1016/j.pharmthera.2012.12.007 . ISSN  0163-7258. PMID  23333322.
  12. ^ abc "Консорциум по внедрению клинической фармакогенетики". cpicpgx.org . Получено 2022-12-13 .
  13. ^ ab Nigam SK (январь 2015 г.). «Что на самом деле делают перевозчики наркотиков?». Nature Reviews. Drug Discovery . 14 (1): 29–44. doi :10.1038/nrd4461. PMC 4750486. PMID 25475361  . 
  14. ^ Купер-ДеХофф, Ронда М.; Ниеми, Микко; Рэмси, Лора Б.; Лузум, Жасмин А.; Таркиайнен, Э. Катриина; Страка, Роберт Дж.; Гонг, Ли; Тутея, Сони; Вилке, Рассел А.; Ваделиус, Миа; Ларсон, Эрик А.; Роден, Дэн М.; Кляйн, Тери Э.; Йи, Сук Вах; Краусс, Рональд М. (май 2022 г.). «Руководство Консорциума по внедрению клинической фармакогенетики для генотипов SLCO1B1, ABCG2 и CYP2C9 и симптомов опорно-двигательного аппарата, связанных со статинами». Клиническая фармакология и терапия . 111 (5): 1007–1021. doi :10.1002/cpt.2557. ISSN  1532-6535. PMC 9035072. PMID  35152405 . 
  15. ^ Зандерс, Эдвард Д. (2011-03-21). «Введение в наркотики и цели наркотиков». Наука и бизнес открытия лекарств . стр. 11–27. doi :10.1007/978-1-4419-9902-3_2. ISBN 978-1-4419-9901-6. ЧМЦ  7120710 .
  16. ^ Иресса [вкладыш в упаковку]. Уилмингтон, Делавэр: Астра Зенека; 2021.
  17. ^ Тарцева [вкладыш в упаковку]. Нортбрук, Иллинойс: OSI Pharmaceuticals, LLC; 2016. https://www.accessdata.fda.gov/drugsatfda_docs/label/2016/021743s025lbl.pdf.
  18. ^ ab Oldenburg, Johannes; Marinova, Milka; Müller-Reible, Clemens; Watzka, Matthias (2008). "Цикл витамина К". Витамины и гормоны . 78 : 35–62. doi :10.1016/S0083-6729(07)00003-9. ISBN 9780123741134. ISSN  0083-6729. PMID  18374189.
  19. ^ Михарес, Мэн; Надь, Э.; Герреро, Б.; Ароча-Пиньянго, CL (сентябрь 1998 г.). «[Витамин К: биохимия, функция и дефицит. Обзор]». Исследовательская клиника . 39 (3): 213–229. ISSN  0535-5133. ПМИД  9780555.
  20. ^ Рудманн, Дэниел Г. (февраль 2013 г.). «Целевые и нецелевые токсикологические эффекты». Toxicologic Pathology . 41 (2): 310–314. doi :10.1177/0192623312464311. ISSN  1533-1601. PMID  23085982. S2CID  11858945.
  21. ^ Рехт, Джудит; Чансамут, Вилада; Уайт, Николас Дж.; Эшли, Элизабет А. (2022-05-03). «Нитрофурантоин и дефицит глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы: обзор безопасности». JAC-Antimicrobial Resistance . 4 (3): dlac045. doi :10.1093/jacamr/dlac045. ISSN  2632-1823. PMC 9070801. PMID 35529053  . 
  22. ^ Гаммал, Розанн С.; Пирмохамед, Мунир; Сомоджи, Эндрю А.; Моррис, Сара А.; Формеа, Кристин М.; Элчински, Аманда Л.; Ошикойя, Казим А.; Маклеод, Ховард Л.; Хайдар, Сирин Э.; Вирл-Каррильо, Мишель; Кляйн, Тери Э.; Кодл, Келли Э.; Реллинг, Мэри В. (май 2023 г.). «Расширенное руководство Консорциума по внедрению клинической фармакогенетики для использования лекарств в контексте генотипа G6PD». Клиническая фармакология и терапия . 113 (5): 973–985. doi :10.1002/cpt.2735. ISSN  0009-9236. PMC 10281211 . PMID  36049896. 
  23. ^ Павлос Р., Маллал С., Филлипс Э. (август 2012 г.). «HLA и фармакогенетика лекарственной гиперчувствительности». Фармакогеномика . 13 (11): 1285–1306. doi :10.2217/pgs.12.108. PMID  22920398.
  24. ^ Офис комиссара (24.03.2020). «FDA объявляет о совместном обзоре научных доказательств в поддержку связей между генетической информацией и конкретными лекарствами». FDA . Получено 13.12.2022 .
  25. ^ ab Center for Devices and Radiological Health (2022-10-26). "Таблица фармакогенетических ассоциаций". FDA .
  26. ^ Центр оценки и исследования лекарственных средств (2022-08-11). "Таблица фармакогеномных биомаркеров в маркировке лекарственных средств". FDA .
  27. ^ "PharmGKB". PharmGKB . Получено 2022-12-13 .
  28. ^ Центр оценки и исследования лекарственных средств (2021-06-25). "Тесты, проводимые непосредственно потребителем". FDA .
  29. ^ Poo DC, Cai S, Mah JT (ноябрь 2011 г.). "UASIS: Универсальная автоматическая система идентификации SNP". BMC Genomics . 12 (Suppl 3): S9. doi : 10.1186/1471-2164-12-S3-S9 . PMC 3333510. PMID  22369494 . 
  30. ^ Кодл KE, Данненбергер HM, Фреймут RR, Петерсон JF, Берлисон JD, Вирл-Каррильо M и др. (февраль 2017 г.). «Стандартизация терминов для результатов клинических фармакогенетических тестов: консенсусные термины от Консорциума по внедрению клинической фармакогенетики (CPIC)». Генетика в медицине . 19 (2): 215–223. doi :10.1038/gim.2016.87. PMC 5253119. PMID 27441996  . 
  31. ^ Коэн Н. (ноябрь 2008 г.). Фармакогеномика и персонализированная медицина (методы в фармакологии и токсикологии) . Тотова, Нью-Джерси: Humana Press. стр. 6. ISBN 978-1934115046.
  32. ^ Ciccolini J, Gross E, Dahan L, Lacarelle B, Mercier C (октябрь 2010 г.). «Рутинное тестирование дигидропиримидиндегидрогеназы для прогнозирования тяжелой токсичности, связанной с 5-фторурацилом: шумиха или надежда?». Clinical Colorectal Cancer . 9 (4): 224–228. doi :10.3816/CCC.2010.n.033. PMID  20920994.
  33. ^ Yang CG, Ciccolini J, Blesius A, Dahan L, Bagarry-Liegey D, Brunet C и др. (январь 2011 г.). «Адаптивное дозирование 5-FU на основе DPD у пациентов с раком головы и шеи: влияние на эффективность и токсичность лечения». Cancer Chemotherapy and Pharmacology . 67 (1): 49–56. doi :10.1007/s00280-010-1282-4. PMID  20204365. S2CID  25362813.
  34. ^ Дин Л. (2012). «Терапия клопидогрелем и генотип CYP2C19». В Pratt VM, McLeod HL, Rubinstein WS и др. (ред.). Medical Genetics Summaries. Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). PMID  28520346. Идентификатор книжной полки: NBK84114.
  35. ^ Bale BF, Doneen AL, Vigerust DJ (2018). «Точная медицинская помощь пациентам с диабетом 2 типа посредством внедрения генотипирования гаптоглобина». Frontiers in Cardiovascular Medicine . 5 : 141. doi : 10.3389/fcvm.2018.00141 . PMC 6198642. PMID  30386783 . 
  36. ^ Малхотра АК (2010). «Состояние фармакогенетики». Psychiatr Times . 27 (4): 38–41, 62.
  37. ^ Williams MS (август 2019 г.). «Ранние уроки внедрения программ геномной медицины». Annual Review of Genomics and Human Genetics . 20 (1): 389–411. doi : 10.1146/annurev-genom-083118-014924 . PMID  30811224. S2CID  73460688.
  38. ^ Just KS, Steffens M, Swen JJ, Patrinos GP, Guchelaar HJ, Stingl JC (октябрь 2017 г.). «Медицинское образование в области фармакогеномики — результаты опроса по фармакогенетическим знаниям у специалистов здравоохранения в рамках европейского проекта клинического внедрения фармакогеномики Ubiquitous Pharmacogenomics (U-PGx)». European Journal of Clinical Pharmacology . 73 (10): 1247–1252. doi :10.1007/s00228-017-2292-5. PMC 5599468 . PMID  28669097. 
  39. ^ Карлсон Б. (2012). «Вандербильт — пионеры генетики у постели больного». Биотехнология Здравоохранение . 9 (2): 31–32. PMC 3411230. PMID 22876213  . 
  40. ^ Peterson JF, Field JR, Shi Y, Schildcrout JS, Denny JC, McGregor TL и др. (август 2016 г.). «Отношение врачей к крупномасштабному внедрению фармакогеномики». The Pharmacogenomics Journal . 16 (4): 393–398. doi : 10.1038/tpj.2015.57. PMC 4751074. PMID  26261062. 
  41. ^ "Производители фармакогенетических тестов приветствуют покрытие UnitedHealth. Другие плательщики пока не готовы". MedTech Dive . Получено 29.12.2019 .
  42. ^ «Персонализированное лекарственное лечение с помощью фармакогенетики».
  43. ^ Рицнер М (2013). Полипрагмазия в психиатрической практике, том I. Стратегии множественного приема лекарств . Дордрехт: Springer Science and Business Media. ISBN 978-94-007-5804-9.
  44. ^ «Модели использования лекарств в Соединенных Штатах». Бостонский университет, Эпидемиологический центр Слоуна. 2006.
  45. ^ Foster A, Wang Z, Usman M, Stirewalt E, Buckley P (декабрь 2007 г.). «Фармакогенетика побочных эффектов антипсихотических препаратов: исследования случаев и обзор литературы для врачей». Neuropsychiatric Disease and Treatment . 3 (6): 965–973. doi : 10.2147/ndt.s1752 . PMC 2656342. PMID  19300635 . 
  46. ^ "Фармакогенетика: повышение безопасности и эффективности лекарственной терапии [Брошюра]" (PDF) . Американская медицинская ассоциация. 2011.
  47. ^ «Сообщение FDA о безопасности лекарств: обновление обзора безопасности использования кодеина у детей; новое предупреждение и противопоказание по применению после тонзиллэктомии и/или аденоидэктомии». Управление по контролю за продуктами и лекарствами США. 2013-02-20.
  48. ^ ab Свен Дж.Дж., Хейзинга Т.В., Гелдерблом Х., де Врис Э.Г., Ассендельфт В.Дж., Кирххайнер Дж., Гучелаар Х.Дж. (август 2007 г.). «Перевод фармакогеномики: проблемы на пути к клинике». ПЛОС Медицина . 4 (8): е209. дои : 10.1371/journal.pmed.0040209 . ПМК 1945038 . ПМИД  17696640. 
  49. ^ ab Stanek EJ, Sanders CL, Taber KA, Khalid M, Patel A, Verbrugge RR и др. (март 2012 г.). «Принятие фармакогеномного тестирования врачами США: результаты общенационального опроса». Клиническая фармакология и терапия . 91 (3): 450–458. doi :10.1038/clpt.2011.306. PMID  22278335. S2CID  21366195.
  50. ^ «Центр генетического образования».[ постоянная мертвая ссылка ]
  51. ^ Ma JD, Lee KC, Kuo GM (август 2012 г.). «Клиническое применение фармакогеномики». Журнал фармацевтической практики . 25 (4): 417–427. doi :10.1177/0897190012448309. PMID  22689709. S2CID  1212666.
  52. ^ Borrell LN, Elhawary JR, Fuentes-Afflick E, Witonsky J, Bhakta N, Wu AH и др. (февраль 2021 г.). «Раса и генетическая родословная в медицине — время расплаты с расизмом». The New England Journal of Medicine . 384 (5): 474–480. doi :10.1056/NEJMms2029562. PMC 8979367. PMID  33406325 . 
  53. ^ Фитцджеральд Дж.Д., Далбет Н., Микулс Т., Бриньярделло-Петерсен Р., Гайятт Г., Абелес AM и др. (июнь 2020 г.). «Руководство Американского колледжа ревматологии по лечению подагры, 2020 г.». Уход и исследование артрита . 72 (6): 744–760. дои : 10.1002/акр.24180. hdl : 2027.42/155497 . ПМЦ 10563586 . PMID  32391934. S2CID  218583019. 
  54. ^ "LCD - Процедуры молекулярной патологии (L35000)". www.cms.gov . Получено 2022-12-13 .
  55. ^ ab McGuire AL, Fisher R, Cusenza P, Hudson K, Rothstein MA, McGraw D и др. (июль 2008 г.). «Конфиденциальность, приватность и безопасность информации о генетических и геномных тестах в электронных медицинских картах: моменты для рассмотрения». Genetics in Medicine . 10 (7): 495–499. doi : 10.1097/gim.0b013e31817a8aaa . PMID  18580687. S2CID  29833634.
  56. ^ "Закон о недискриминации в отношении генетической информации 2008 года". EEOC США . Получено 13 декабря 2022 г.
  57. ^ Dressler LG, Terry SF (ноябрь 2009 г.). «Как GINA повлияет на участие в фармакогеномных исследованиях и клинических испытаниях?». Клиническая фармакология и терапия . 86 (5): 472–475. doi :10.1038/clpt.2009.146. PMID  19844223. S2CID  205121202.
  58. ^ ab Evans JP, Burke W (июль 2008 г.). «Генетическая исключительность. Слишком много хорошего?». Genetics in Medicine . 10 (7): 500–501. doi : 10.1097/GIM.0b013e31817f280a . PMID  18580684. S2CID  32998031.
  59. ^ Мюррей TH (январь 2019 г.). «Истек ли срок годности генетической исключительности? О геномных дневниках, контексте и содержании». Американский журнал биоэтики . 19 (1): 13–15. doi : 10.1080/15265161.2018.1552038 . PMID  30676900. S2CID  59250873.
  60. ^ ab Garrison NA, Brothers KB, Goldenberg AJ, Lynch JA (январь 2019 г.). «Геномный контекстуализм: смещение риторики генетической исключительности». Американский журнал биоэтики . 19 (1): 51–63. doi : 10.1080 /15265161.2018.1544304. PMC 6397766. PMID  30676903. 
  61. ^ Sulmasy DP (май 2015). «Голые тела, голые геномы: особая (но не исключительная) природа геномной информации». Генетика в медицине . 17 (5): 331–336. doi : 10.1038/gim.2014.111 . PMID  25232853. S2CID  34092673.
  62. ^ Карабальо П.Дж., Саттон Дж.А., Гири Дж., Райт Дж.А., Николсон В.Т., Кулло И.Дж. и др. (январь 2020 г.). «Интеграция фармакогеномики в электронную медицинскую карту путем внедрения геномных индикаторов». Журнал Американской ассоциации медицинской информатики . 27 (1): 154–158. дои : 10.1093/jamia/ocz177. ПМК 6913212 . ПМИД  31591640. 
  63. ^ Мартани А., Женевьева Л. Д., Паули-Магнус К., Макленнан С., Элгер Б. С. (2019-12-20). «Регулирование вторичного использования данных для исследований: аргументы против генетической исключительности». Frontiers in Genetics . 10 : 1254. doi : 10.3389/fgene.2019.01254 . PMC 6951399. PMID  31956328 . 
  64. ^ ab Pirmohamed M (октябрь 2001 г.). «Фармакогенетика и фармакогеномика». British Journal of Clinical Pharmacology . 52 (4): 345–347. doi :10.1046/j.0306-5251.2001.01498.x. PMC 2014592. PMID  11678777 . 
  65. ^ Прасад К (январь 2009). «Роль регулирующих органов в переводе фармакогенетики в клинику». Клинические случаи в области минерального и костного метаболизма . 6 (1): 29–34. PMC 2781218. PMID  22461095 . 
  66. ^ Evans DA, Clarke CA (сентябрь 1961 г.). «Фармакогенетика». British Medical Bulletin . 17 (3): 234–240. doi :10.1093/oxfordjournals.bmb.a069915. PMID  13697554.
  67. ^ Kalow W (2006). «Фармакогенетика и фармакогеномика: происхождение, статус и надежда на персонализированную медицину». Журнал фармакогеномики . 6 (3): 162–165. doi :10.1038/sj.tpj.6500361. PMID  16415920. S2CID  21761285.
  68. ^ Фогель Ф (1959). «Современные проблемы генетики человека». Ergebnisse der Inneren Medizin und Kinderheilkunde [ Результаты внутренней медицины и педиатрии ] (на немецком языке). Берлин, Гейдельберг: Springer: 52–125.
  69. ^ Motulsky AG, Qi M (февраль 2006 г.). «Фармакогенетика, фармакогеномика и экогенетика». Журнал Чжэцзянского университета. Наука. B . 7 (2): 169–170. doi :10.1631/jzus.2006.B0169. PMC 1363768 . PMID  16421980. 
  70. ^ Kalow W (2005). Фармакогеномика . Нью-Йорк: Taylor & Francis. С. 552–553. ISBN 978-1-57444-878-8.
  71. ^ Thorpe DS (2001). «Комбинаторная химия: начало второго десятилетия». The Pharmacogenomics Journal . 1 (4): 229–232. doi :10.1038/sj.tpj.6500045. PMID  11908762. S2CID  1740692.
  72. ^ Paul NW, Fangerau H (декабрь 2006 г.). «Зачем нам беспокоиться? Этические и социальные вопросы в индивидуализированной медицине». Current Drug Targets . 7 (12): 1721–1727. doi :10.2174/138945006779025428. PMID  17168846.
  73. ^ Тополь Э. (2012). Творческое разрушение медицины: как цифровая революция создаст лучшее здравоохранение . Нью-Йорк: Basic Books. ISBN 978-0-465-02550-3.
  74. ^ abc Corrigan OP (март 2005 г.). «Фармакогенетика, этические вопросы: обзор отчета Совета Наффилда по биоэтике». Журнал медицинской этики . 31 (3): 144–148. doi :10.1136/jme.2004.007229. PMC 1734105. PMID 15738433  . 
  75. ^ Breckenridge A, Lindpaintner K, Lipton P, McLeod H, Rothstein M, Wallace H (сентябрь 2004 г.). «Фармакогенетика: этические проблемы и решения». Nature Reviews. Genetics . 5 (9): 676–680. doi :10.1038/nrg1431. PMID  15372090. S2CID  6149591.
  76. ^ Барх Д., Дхаван Д., Гангули Н.К. (2013). Барх Д., Дхаван Д., Гангули Н.К. (ред.). Омикс для персонализированной медицины. Индия: Springer Media. дои : 10.1007/978-81-322-1184-6. ISBN 978-81-322-1183-9. S2CID  46120003.
  77. ^ Stram D (2014). "Post-GWAS Analyses". Design, Analysis, and Interpretation of Genome-Wide Association Scans . Statistics for Biology and Health. Los Angeles: Springer Science and Business Media. pp. 285–327. doi :10.1007/978-1-4614-9443-0_8. ISBN 978-1-4614-9442-3.
  78. ^ Gaedigk A, Ingelman-Sundberg M, Miller NA, Leeder JS, Whirl-Carrillo M, Klein TE (март 2018 г.). «Консорциум вариаций фармакогенов (PharmVar): включение базы данных номенклатуры аллелей человеческого цитохрома P450 (CYP)». Клиническая фармакология и терапия . 103 (3): 399–401. doi :10.1002/cpt.910. PMC 5836850. PMID  29134625 . 
  79. ^ Preissner S, Kroll K, Dunkel M, Senger C, Goldsobel G, Kuzman D и др. (январь 2010 г.). «SuperCYP: комплексная база данных по ферментам цитохрома P450, включая инструмент для анализа взаимодействий CYP-лекарства». Nucleic Acids Research . 38 (выпуск базы данных): D237–D243. doi :10.1093/nar/gkp970. PMC 2808967 . PMID  19934256. 
  80. ^ Thorn CF, Klein TE, Altman RB (2013). "PharmGKB: The Pharmacogenomics Knowledge Base". Фармакогеномика . Методы в молекулярной биологии. Т. 1015. Клифтон, Нью-Джерси, стр. 311–20. doi :10.1007/978-1-62703-435-7_20. ISBN 978-1-62703-434-0. PMC  4084821 . PMID  23824865.{{cite book}}: CS1 maint: location missing publisher (link)
  81. ^ "DBSNP Home Page". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  82. ^ Smigielski EM, Sirotkin K, Ward M, Sherry ST (январь 2000 г.). "dbSNP: база данных полиморфизмов отдельных нуклеотидов". Nucleic Acids Research . 28 (1): 352–355. doi :10.1093/nar/28.1.352. PMC 102496. PMID  10592272 . 
  83. ^ Papadopoulos P, Viennas E, Gkantouna V, Pavlidis C, Bartsakoulia M, Ioannou ZM и др. (январь 2014 г.). «Разработки всемирной базы данных FINDbase для клинически значимых геномных вариаций аллельных частот». Nucleic Acids Research . 42 (выпуск базы данных): D1020–D1026. doi :10.1093/nar/gkt1125. PMC 3964978 . PMID  24234438. 
  84. ^ «Таблица фармакогеномных биомаркеров в маркировке лекарств». FDA . 18 августа 2021 г.
  85. ^ "SNPedia".
  86. ^ Cariaso M, Lennon G (январь 2012 г.). «SNPedia: вики, поддерживающая аннотацию, интерпретацию и анализ персонального генома». Nucleic Acids Research . 40 (выпуск базы данных): D1308–D1312. doi :10.1093/nar/gkr798. PMC 3245045. PMID 22140107  . 
  87. ^ «Сеть исследований фармакогеномики PGRN».

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки

Журналы: