Суперсемейство TOG

Суперсемейство рецепторов, сопряженных с транспортером-опсином и G-белком ( TOG ), представляет собой суперсемейство интегральных мембранных белков , обычно из 7 или 8 трансмембранных альфа-спиральных сегментов (TMS). Оно включает (1) ион-транслоцирующие микробные родопсины и (2) рецепторы, сопряженные с G-белком (GPCR), (3) транспортеры сладкого сахара, (4) пермеазы захвата никотинамид рибонуклеозида (PnuC; TC# 4.B.1), (5) пермеазы захвата 4-толуолсульфоната (TSUP) ; TC# 2.A.102), (6) транспортеры Ni ²⁺ –Co ²⁺ (NiCoT) ; TC# 2.A.52), (7) транспортеры органических растворенных веществ (OST) ; TC# 2.A.82), (8) фосфат:Na ⁺ симпортеры (PNaS) ; TC# 2.A.58) и (9) лизосомальные транспортеры цистина (LCT) ; TC# 2.A.43). ^{[1] [2]}

Семьи

В настоящее время признанные семейства в составе суперсемейства TOG (с номерами TC синего цвета) включают: ^[3]

• 1.A.14 - Семейство генов, улучшающих перенос генов через яички (TEGT)
• 1.A.26 - Семейство транспортеров Mg ²⁺ -E (MgtE)
• 1.A.76 - Семейство транспортеров магния 1 (MagT1)
• 2.A.43 - Семейство лизосомальных переносчиков цистеина (LCT)
• 2.A.52 - Семейство переносчиков Ni ²⁺ -Co ²⁺ (NiCoT)
• 2.A.58 - Семейство фосфат:Na ⁺ симпортеров (PNaS)
• 2.A.82 - Семейство переносчиков органических растворенных веществ (OST)
• 2.A.102 - Семейство пермеаз поглощения 4-толуолсульфоната (TSUP)
• 2.A.123 - Сладкий; PQ-петля; Слюна; Семейство MtN3 (сладкий)
• 3.E.1 - Семейство микробных родопсинов (МР), перемещающих ионы
• 4.B.1 - Семейство пермеаз захвата никотинамид рибонуклеозида (NR) (PnuC)
• 9.A.14 - Семейство рецепторов, сопряженных с G-белком (GPCR)

Структуры

Несколько трехмерных структур, доступных для членов следующих семей:

• Семейство SWEET: 4RNG
• Семейство MR: 5AX0 ​, 3T45​ - структуры высокого разрешения
• Семейство PnuC: 4QTN
• Семейство GPCR: 3CAP

Смотрите также

• Семейство переносчиков растворенных веществ
• База данных классификации транспортеров

Ссылки

1. Максим А. Шлыков; Вэй Хао Чжэн; Джонатан С. Чен и Милтон Х. Сайер, младший. (март 2012 г.). «Биоинформатическая характеристика семейства трансмембранных белков пермеазы захвата 4-толуолсульфоната (TSUP)». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биомембраны . 1818 (3): 703–717. doi :10.1016/j.bbamem.2011.12.005. PMC  3917603. PMID  22192777 .
2. Yee DC1, Shlykov MA, Västermark A, Reddy VS, Arora S, Sun EI, Saier MH Jr.. (сентябрь 2013 г.). «Суперсемейство рецепторов, связанных с транспортером-опсином-G-белком (TOG)». Журнал FEBS . 280 (22): 5780–5800. doi :10.1111/febs.12499. PMC 3832197. PMID  23981446 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
3. Saier, Milton. "Transporter-Opsin-G protein-coupled receptor (TOG) Superfamily". tcdb.org . Получено 28 декабря 2015 г. .

Дальнейшее чтение

• Yee DC1, Shlykov MA, Västermark A, Reddy VS, Arora S, Sun EI, Saier MH Jr.. (сентябрь 2013 г.). "Суперсемейство рецепторов, связанных с транспортером-опсином-G-белком (TOG)". The FEBS Journal . 280 (22): 5780–5800. doi :10.1111/febs.12499. PMC  3832197 . PMID  23981446.{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )