Гипотеза мира железа и серы представляет собой набор предложений о происхождении жизни и ранней эволюции жизни, выдвинутых в серии статей между 1988 и 1992 годами Гюнтером Вехтерсхойзером , мюнхенским патентным юристом со степенью по химии, которого поощрял и поддерживал философ Карл Р. Поппер , чтобы опубликовать свои идеи. Гипотеза предполагает, что ранняя жизнь могла сформироваться на поверхности минералов сульфида железа , отсюда и название. [1] [2] [3] [4] [5] [ чрезмерное цитирование ] Она была разработана путем ретродикта (составления « предсказания » о прошлом) из существующей биохимии (не вымершей, сохранившейся биохимии) в сочетании с химическими экспериментами.
Вехтерсхойзер предполагает, что самая ранняя форма жизни, называемая «организмом-пионером», возникла в вулканическом гидротермальном потоке при высоком давлении и высокой (100 °C) температуре. Она имела сложную структуру минеральной основы с каталитическими центрами переходных металлов (преимущественно железо и никель , но также, возможно, кобальт , марганец , вольфрам и цинк ). Каталитические центры катализировали автотрофные пути фиксации углерода, генерируя небольшие молекулярные (неполимерные) органические соединения из неорганических газов (например, оксид углерода , диоксид углерода , цианистый водород и сероводород ). Эти органические соединения удерживались на или в минеральной основе в качестве органических лигандов центров переходных металлов со временем удержания потока в соответствии с прочностью их минеральных связей, тем самым определяя автокаталитический «поверхностный метаболизм». Каталитические центры переходных металлов стали автокаталитическими, будучи ускоренными их органическими продуктами, превратившимися в лиганды. Метаболизм фиксации углерода стал автокаталитическим, сформировав метаболический цикл в форме примитивной серозависимой версии восстановительного цикла лимонной кислоты . Ускоренные катализаторы расширили метаболизм, а новые метаболические продукты еще больше ускорили катализаторы. Идея заключается в том, что как только такой примитивный автокаталитический метаболизм был установлен, его внутренне синтетическая химия начала производить все более сложные органические соединения, все более сложные пути и все более сложные каталитические центры.
Реакция конверсии водяного газа (CO + H 2 O → CO 2 + H 2 ) происходит в вулканических флюидах с различными катализаторами или без катализаторов. [6] Сочетание сульфида железа (FeS, троилит ) и сероводорода ( H
2S ) в качестве восстановителей (оба реагента одновременно окисляются в реакции, создавая дисульфидную связь, S–S) в сочетании с пиритом ( FeS
2) формирование:
было продемонстрировано в мягких вулканических условиях. [7] [8] Этот ключевой результат был оспорен. [9] Фиксация азота была продемонстрирована для изотопа 15 N 2 в сочетании с образованием пирита. [10] Аммиак образуется из нитрата с FeS/H 2 S в качестве восстановителя . [11] Метилмеркаптан [CH 3 -SH] и оксисульфид углерода [COS] образуются из CO 2 и FeS/H 2 S, [12] или из CO и H 2 в присутствии NiS . [13]
Реакция оксида углерода (CO), сероводорода (H 2 S) и метантиола CH 3 SH в присутствии сульфида никеля и сульфида железа генерирует метилтиоэфир уксусной кислоты [CH 3 -CO-SCH 3 ] и, предположительно, тиоуксусную кислоту (CH 3 -CO-SH) как простейшие активированные аналоги уксусной кислоты ацетил-КоА . Эти активированные производные уксусной кислоты служат исходными материалами для последующих экзергонических синтетических шагов. [13] Они также служат для энергетического сопряжения с эндергоническими реакциями , в частности, для образования соединений (фосфо)ангидрида . [14] Однако Хубер и Вехтерсхойзер сообщили о низком выходе ацетата 0,5% на основе ввода CH 3 SH ( метантиол ) (8 мМ) в присутствии 350 мМ CO. Это примерно в 500 и 3700 раз [15] превышает самые высокие концентрации CH 3 SH и CO, соответственно, измеренные на сегодняшний день в жидкости естественного гидротермального источника . [16]
Реакция гидроксида никеля с цианистым водородом (HCN) (в присутствии или отсутствии гидроксида железа , сероводорода или метилмеркаптана ) генерирует цианид никеля , который реагирует с оксидом углерода (CO) с образованием пар α-гидрокси и α-аминокислот : например, гликолят / глицин , лактат / аланин , глицерат / серин ; а также пировиноградной кислоты в значительных количествах. [17] Пировиноградная кислота также образуется при высоком давлении и высокой температуре из CO, H2O , FeS в присутствии нонилмеркаптана. [18] Реакция пировиноградной кислоты или других α-кетокислот с аммиаком в присутствии гидроксида железа или в присутствии сульфида железа и сероводорода генерирует аланин или другие α-аминокислоты . [19] Реакция α-аминокислот в водном растворе с COS или с CO и H 2 S генерирует пептидный цикл, в котором дипептиды , трипептиды и т. д. образуются и впоследствии разрушаются через N-концевые гидантоиновые фрагменты и N-концевые мочевинные фрагменты с последующим расщеплением N-концевой аминокислотной единицы. [20] [21] [22]
Предложенный механизм реакции восстановления CO 2 на FeS: Ying et al. (2007) [ требуется ссылка ] показали, что прямое превращение макинавита (FeS) в пирит (FeS 2 ) при реакции с H 2 S до 300 °C невозможно без присутствия критического количества окислителя. В отсутствие какого-либо окислителя FeS реагирует с H 2 S до 300 °C, образуя пирротин. Farid et al. [ требуется ссылка ] экспериментально показали, что макинавит (FeS) обладает способностью восстанавливать CO 2 до CO при температуре выше 300 °C. Они сообщили, что поверхность FeS окисляется, что при реакции с H 2 S дает пирит (FeS 2 ). Ожидается, что CO реагирует с H 2 O в эксперименте Дробнера, образуя H 2 .
Ранняя эволюция определяется как начинающаяся с зарождения жизни и заканчивающаяся последним универсальным общим предком ( LUCA ). Согласно теории мира железа и серы, она охватывает коэволюцию клеточной организации ( клеточность ), генетический аппарат и ферментацию метаболизма .
Клеточная дифференциация происходит в несколько стадий. Она могла начаться с образования примитивных липидов (например, жирных кислот или изопреноидов ) в поверхностном метаболизме . Эти липиды накапливаются на или в минеральной основе. Это липофилизирует внешние или внутренние поверхности минеральной основы, что способствует реакциям конденсации по сравнению с гидролитическими реакциями за счет снижения активности воды и протонов.
На следующем этапе образуются липидные мембраны . Пока они все еще прикреплены к минеральной основе, они образуют полуклетку, частично ограниченную минеральной основой и частично мембраной. Дальнейшая эволюция липидов приводит к самоподдерживающимся липидным мембранам и закрытым клеткам. Самые ранние закрытые клетки являются предклетками (в значении Кандлера), поскольку они допускают частый обмен генетическим материалом (например, путем слияния). По мнению Воеза , этот частый обмен генетическим материалом является причиной существования общего ствола на древе жизни и очень быстрой ранней эволюции. [23] Ник Лейн и соавторы утверждают, что «Также были идентифицированы неферментативные эквиваленты гликолиза, пентозофосфатного пути и глюконеогенеза. Также могут иметь место множественные синтезы аминокислот из α-кетокислот путем прямого восстановительного аминирования и путем реакций трансаминирования. Длинноцепочечные жирные кислоты могут быть образованы путем гидротермального синтеза типа Фишера-Тропша, который химически напоминает процесс удлинения жирных кислот. Недавние исследования показывают, что азотистые основания также могут быть образованы в соответствии с универсально сохраняющимися биосинтетическими путями, используя ионы металлов в качестве катализаторов». [24]
Метаболические промежуточные продукты в гликолизе и пентозофосфатном пути, такие как глюкоза, пируват, рибозо-5-фосфат и эритрозо-4-фосфат , спонтанно генерируются в присутствии Fe(II). [25] Было показано, что фруктозо-1,6-бифосфат , метаболический промежуточный продукт в глюконеогенезе , непрерывно накапливается, но только в замороженном растворе. Образование фруктозо-1,6-бифосфата ускорялось лизином и глицином , что подразумевает, что самые ранние анаболические ферменты были аминокислотами. [26] Сообщалось, что 4Fe-4S, 2Fe-2S и моноядерные кластеры железа спонтанно образуются при низких концентрациях цистеина и щелочном pH. [27] Метилтиоацетат, предшественник ацетил-КоА , может быть синтезирован в условиях, соответствующих гидротермальным источникам. Фосфорилирование метилтиоацетата приводит к синтезу тиоацетата, более простого предшественника ацетил-КоА. Тиоацетат в более прохладных и нейтральных условиях способствует синтезу ацетилфосфата, который является предшественником аденозинтрифосфата и способен фосфорилировать рибозу и нуклеозиды . Это говорит о том, что ацетилфосфат, вероятно, синтезировался в термофорезе и смешивании кислой морской воды и щелочной гидротермальной жидкости в взаимосвязанных микропорах. Возможно, что он может способствовать полимеризации нуклеотидов на минеральных поверхностях или при низкой активности воды. [28] Термофорез в порах гидротермальных источников может концентрировать полирибонуклеотиды, [29] но остается неизвестным, как он может способствовать кодированию и метаболическим реакциям. [30]
В математическом моделировании предполагается, что автокаталитический синтез нуклеотидов способствует росту протоклетки, поскольку нуклеотиды также катализируют фиксацию CO2 . Сильный нуклеотидный катализ жирных кислот и аминокислот замедляет рост протоклетки, и если бы произошла конкуренция между каталитическими функциями, это нарушило бы протоклетку. Слабый или умеренный нуклеотидный катализ аминокислот посредством фиксации CO2 способствовал бы делению и росту протоклетки. [31] В 2017 году компьютерное моделирование протоклетки в щелочной гидротермальной среде показало, что «некоторые гидрофобные аминокислоты хелатируют нанокристаллы FeS, создавая три положительные обратные связи: (i) увеличение каталитической площади поверхности; (ii) разделение нанокристаллов FeS на мембрану; и (iii) протон-движущий активный центр для фиксации углерода, который имитирует фермент Ech». [32] Максимальный синтез АТФ происходил бы при высокой активности воды в пресной воде, а высокие концентрации Mg 2+ и Ca 2+ предотвращали бы синтез АТФ, однако концентрации двухвалентных катионов в гадейских океанах были намного ниже, чем в современных океанах, а концентрации Mg 2+ и Ca 2+ в щелочных гидротермальных источниках обычно ниже, чем в океане. Такие среды генерировали бы Fe 3+ , что способствовало бы фосфорилированию АДФ. Смесь морской воды и щелочной гидротермальной жидкости может способствовать циклу между Fe 3+ и Fe 2+ . [33] Экспериментальные исследования биомиметических пребиотических реакций, таких как восстановление НАД + [34] и перенос фосфорила [35], также подтверждают происхождение жизни, происходящее в щелочном гидротермальном источнике.
Уильям Мартин и Майкл Рассел предполагают, что первые клеточные формы жизни могли развиться внутри щелочных гидротермальных источников в зонах распространения морского дна в глубоком море . [36] [37] Эти структуры состоят из микромасштабных пещер, покрытых тонкими мембранными стенками из сульфида металла . Таким образом, эти структуры сразу решат несколько критических моментов, соответствующих предложениям Вехтерсхойзера:
Эта модель помещает «последнего универсального общего предка» ( LUCA ) в неорганически сформированные физические границы щелочного гидротермального источника, а не предполагает существование свободноживущей формы LUCA. Последним эволюционным шагом на пути к настоящим свободноживущим клеткам был бы синтез липидной мембраны, которая в конечном итоге позволяет организмам покинуть систему микрокаверн источника. Это постулируемое позднее приобретение биосинтеза липидов , направленное генетически кодируемыми пептидами, согласуется с наличием совершенно разных типов мембранных липидов у архей и бактерий (плюс эукариот ). Тип источника, находящийся на переднем плане их предположения, химически больше похож на теплые (около 100 °C) кратеры у хребта , такие как Лост-Сити, чем на более знакомые источники типа «черный курильщик» (около 350 °C).
В абиотическом мире термоклин температур и хемоклин концентраций связаны с пребиотическим синтезом органических молекул, более горячих вблизи химически богатого источника, более холодных, но и менее химически богатых на больших расстояниях. Миграция синтезированных соединений из областей высокой концентрации в области низкой концентрации дает направленность, которая обеспечивает как источник, так и сток самоорганизующимся образом, обеспечивая протометаболический процесс, посредством которого производство уксусной кислоты и ее возможное окисление могут быть пространственно организованы.
Таким образом, многие из индивидуальных реакций, которые сегодня обнаруживаются в центральном метаболизме, могли изначально происходить независимо от какой-либо развивающейся клеточной мембраны . Каждый микрокомпартмент вентиляционного отверстия функционально эквивалентен одной клетке. Затем отбираются химические сообщества, обладающие большей структурной целостностью и устойчивостью к сильно меняющимся условиям; их успех привел бы к локальным зонам истощения важных прекурсорных химических веществ. Прогрессивное включение этих прекурсорных компонентов в клеточную мембрану постепенно увеличило бы метаболическую сложность внутри клеточной мембраны, одновременно приводя к большей экологической простоте во внешней среде. В принципе, это могло бы привести к развитию сложных каталитических наборов, способных к самоподдержанию .
Рассел добавляет существенный фактор к этим идеям, указывая на то, что полупроницаемые макинавитовые (минерал сульфида железа) и силикатные мембраны могли бы естественным образом образовываться в этих условиях и электрохимически связывать реакции, разделенные в пространстве, если не во времени [ необходимо разъяснение ] . [38] [39]
6 из 11 метаболических промежуточных продуктов в обратном цикле Кребса, стимулируемых Fe, Zn 2+ и Cr 3+ в кислых условиях, подразумевают, что протоклетки, возможно, возникли в локально богатых металлами и кислых наземных гидротермальных полях. Кислые условия, по-видимому, согласуются со стабилизацией РНК. [40] Эти гидротермальные поля демонстрировали бы цикличность замерзания и оттаивания и различные температурные градиенты, которые способствовали бы неферментативным реакциям глюконеогенеза, синтезу азотистых оснований, неферментативной полимеризации и репликации РНК. [26] Синтез АТФ и окисление двухвалентного железа посредством фотохимических реакций или окислителей, таких как оксид азота, полученный в результате ударов молний, ударов метеоритов или вулканических выбросов, также могли происходить в гидротермальных полях. [41]
Циклы «влажность-сухость» гидротермальных полей полимеризуют РНК и пептиды, агрегация протоклеток во влажной гелевой фазе во время циклов «влажность-сухость» допускает диффузию продуктов метаболизма через соседние протоклетки. Агрегацию протоклеток можно описать как примитивную версию горизонтального переноса генов. Везикулы жирных кислот стабилизируются полимерами в присутствии Mg2 +, необходимого для активности рибозима. [42] Эти пребиотические процессы могли происходить в затененных областях, которые защищают возникновение ранней клеточной жизни под воздействием ультрафиолетового излучения. [43] Длинноцепочечные спирты и монокарбоновые кислоты также могли синтезироваться посредством синтеза Фишера-Тропша . [44] Гидротермальные поля также могут иметь осадки переходных металлов [4] и концентрировать множество элементов, включая CHNOPS . [45] Геотермальная конвекция также может быть источником энергии для возникновения движущей силы протонов, переноса фосфорильной группы, связи между окислением-восстановлением и активным транспортом. [4] Дэвид Димер и Брюс Дамер отметили , что эти среды, по-видимому, напоминают идею Чарльза Дарвина о «маленьком теплом пруду». [42]
Проблемы с гипотезой субаэрального гидротермального поля абиогенеза заключаются в том, что предлагаемая химия не похожа на известные биохимические реакции. [46] Обилие субаэральных гидротермальных полей было бы редким и не обеспечивало бы никакой защиты ни от метеоритов, ни от ультрафиолетового излучения. Глинистые минералы в субаэральных гидротермальных полях поглощали бы органические реагенты. Пирофосфат имеет низкую растворимость в воде и не может фосфорилироваться без фосфорилирующего агента. [44] Она не предлагает объяснений происхождения хемиосмоса и различий между археями и бактериями. [47]