База данных классификации транспортеров

Классификация мембранных белков, включая ионные каналы

База данных классификации транспортеров (или TCDB ) — это одобренная Международным союзом биохимии и молекулярной биологии (IUBMB) система классификации мембранных транспортных белков , включая ионные каналы . ^{[1] [2] [3]}

Классификация

Верхний уровень классификации и несколько примеров белков с известной трехмерной структурой:

1.Каналыи поры

1.Каналы α-типа

• 1.A.1 Суперсемейство потенциал-управляемых ионных каналов
• 1.A.2 Семейство каналов K + с внутренним выпрямлением
• 1.A.3 Рианодин-инозитол-1,4,5-трифосфатный рецептор семейства каналов Ca ²⁺
• 1.A.4 Семейство каналов Ca2 + с транзиторным рецепторным потенциалом
• 1.A.5 Семейство катионных каналов полицистина
• 1.A.6 Семейство эпителиальных Na ⁺ каналов
• 1.A.7 Семейство катионных каналов рецепторов P2X, управляемых АТФ
• 1.A.8 Главное суперсемейство внутренних белков
• 1.A.9 Нейротрансмиттерный рецептор, петля Cys, семейство лиганд-управляемых ионных каналов
• 1.A.10 Семейство рецепторов нейротрансмиттеров, содержащих ионные каналы, управляемые глутаматом
• 1.A.11 Семейство транспортеров аммониевых каналов
• 1.A.12 Семейство внутриклеточных хлоридных каналов
• 1.A.13 Семейство эпителиальных хлоридных каналов
• 1.A.14 Семейство генов, переносимых через яички
• 1.A.15 Семейство неселективных катионных каналов 2
• 1.A.16 Семейство переносчиков формиата-нитрита
• 1.A.17 Семейство кальций-зависимых хлоридных каналов
• 1.A.18 Семейство Tic110, образующее анионо-каналы в оболочке хлоропласта
• 1.A.19 Семейство каналов матрицы-2 вируса гриппа типа А
• 1.A.20 Семейство белков 3, взаимодействующих с BCL2/Adenovirus E1B
• 1.A.21 Семейство Bcl-2
• 1.A.22 Механочувствительный ионный канал большой проводимости
• 1.A.23 Механочувствительный ионный канал малой проводимости
• 1.A.24 Семейство коннексинов, образующих щелевые контакты
• 1.A.25 Семейство иннексинов, образующих щелевые контакты
• 1.A.26 Семейство транспортеров Mg ^{2+ -E}
• 1.A.27 Семейство фосфолемманов
• 1.A.28 Семейство переносчиков мочевины
• 1.A.29 Семейство мочевинных/амидных каналов
• 1.A.30 H+- или Na+-транслоцирующий бактериальный жгутиковый мотор MotAB/суперсемейство активаторов наружной мембраны транспорта ExbBD
• 1.A.31 Семейство аннексинов
• 1.A.32 Семейство каналов вируса гриппа типа B NB
• 1.A.33 Семейство белков теплового шока 70, образующих катионные каналы
• 1.A.34 Семейство комплексов, образующих каналы, подобные щелевым контактам Bacillus
• 1.A.35 Семейство переносчиков ионов металлов CorA
• 1.A.36 Семейство внутриклеточных хлоридных каналов
• 1.A.37 Семейство каналов CD20 Ca2+
• 1.A.38 Семейство регуляторов pH Гольджи
• 1.A.39 Семейство каналов CM2 вируса гриппа типа C
• 1.A.40 Вирус иммунодефицита человека типа I, семейство каналов Vpu
• 1.A.41 Птичий реовирус p10 семейства Vvroporin
• 1.A.42 Семейство вирусных белков ВИЧ R
• 1.A.43 Устойчивость к камфоре или семейство экспортеров фторида
• 1.A.44 Порообразующий хвостовой кончик pb2 белок семейства фагов T5
• 1.A.45 Семейство инъектисом фага P22
• 1.A.46 Семейство бестрофинов, образующих анионные каналы
• 1.A.47 Нуклеотид-чувствительный анион-селективный канал, семейство ICln
• 1.A.48 Анионный канал Семья Твити
• 1.A.49 Человеческий коронавирус ns12.9 семейство виропоринов
• 1.A.50 Семейство фосфоламбанов (регулятор Ca ²⁺ -каналов и Ca ²⁺ -АТФазы)
• 1.A.51 Семейство потенциалзависимых протонных каналов (VPC)
• 1.A.52 Семейство каналов Ca ²⁺ , активируемых высвобождением Ca ²⁺ (CRAC) (CRAC-C)
• 1.A.53 Семейство катион-селективных каналов виропорина вируса гепатита С P7 (HCV-P7)
• 1.A.54 Семейство пресенилинов ER Ca ²⁺ Leak Channel (пресенилины)
• 1.A.55 Синаптические везикулы-ассоциированные Ca ²⁺ каналы, семейство Flower (Flower)
• 1.A.56 Семейство транспортеров меди (Ctr)
• 1.A.57 Человеческий коронавирус SARS виропорин (SARS-VP)
• 1.A.58 Семейство белков матрикса вируса гриппа типа B 2 (BM2-C)
• 1.A.59 Порообразующий пептид вируса бурсальной болезни, семейство Pep46 (Pep46)
• 1.A.60 Пептид, формирующий реовирус млекопитающих, семейство Mu-1 (Mu-1)
• 1.A.61 Семейство каналообразующих цепей F (гамма-пептидов) вирусов насекомых
• 1.A.62 Семейство гомотримерных катионных каналов (TRIC)
• 1.A.63 α-спиральный порин наружной мембраны Ignicoccus (семейство I-OMP)
• 1.A.64 Семейство плазмолипинов (Plasmolipin)
• 1.A.65 Семейство белков виропорина E коронавируса (виропорин E)
• 1.A.66 Семья Пардаксин (Пардаксин)
• 1.A.67 Семейство мембранных транспортеров Mg ²⁺ (MMgT)
• 1.A.68 Семейство вирусных малых гидрофобных виропоринов (V-SH)
• 1.A.69 Семейство гетеромерных каналов рецепторов запаха (HORC)
• 1.A.70 Молекула против микробов семейства A (MamA)
• 1.A.71 Семейство мозговых кислоторастворимых белковых каналов (канал BASP1)
• 1.A.72 Суперсемейство Mer
• 1.A.73 Семейство лизирующих белков колицина (CLP)
• 1.A.74 Семья Мицугумин 23 (MG23)
• 1.A.75 Механические ноцицепторы, семейство пьезо (пьезо)
• 1.A.76 Семейство транспортеров магния 1 (MagT1)
• 1.A.77 Семейство унипортеров Mg ²⁺ /Ca ²⁺ (MCU)
• 1.A.78 Семейство K ⁺ -селективных каналов в эндосомах и лизосомах (KEL)
• 1.A.79 Семейство белков, поглощающих холестерин (ChUP) или белков, поглощающих двухцепочечную РНК
• 1.A.80 Семейство виропоринов NS4a (NS4a)
• 1.A.81 Семейство низкоаффинных Ca ²⁺ каналов (LACC)
• 1.A.82 Семейство каналов механотрансдукции волосковых клеток (HCMC)
• 1.A.83 Семейство виропоринов VP2 вируса SV40 (SV40 VP2)
• 1.A.84 Семейство каналов модулятора гомеостаза кальция Ca ²⁺ (CALHM-C)
• 1.A.85 Семейство виропоринов полиовируса 2B (2B Viroporin)
• 1.A.86 Семейство вируса папилломы человека типа 16 (HPV16) L2 виропорин (L2 виропорин)
• 1.A.87 Семейство механочувствительных кальциевых каналов (MCA)
• 1.A.88 Семейство грибковых калиевых каналов (F-Kch)
• 1.A.89 Семейство человеческого коронавируса 229E Viroporin (229E Viroporin)
• 1.A.90 Семейство виропоринов человеческого метапневмовируса (HMPV) (HMPV-Viroporin)
• 1.A.91 Связанный с цитоадгезией бесполый белок 3.2 семейства Plasmodium falciparum (Clag3)
• 1.A.92 Семейство реовирусных виропоринов VP10 (RVP10)
• 1.A.93 Семейство неструктурного белка 3 вируса синего языка Виропорин (NS3)
• 1.A.94 Семейство неструктурного гликопротеина 4 виропорина ротавируса (NSP4)
• 1.A.95 Семейство виропоринов эфемеровирусов (EVVP)
• 1.A.96 Семейство виропоринов вируса полиомы человека (PVVP)
• 1.A.97 Семейство виропоринов вируса папилломы человека типа 16 E5 (HPV-E5)
• 1.A.98 Человеческий Т-лимфотропный вирус 1 белок P13 (HTLV1-P13) Семейство
• 1.A.99 Семейство малых мембранных белков E вируса инфекционного бронхита (IBV-E)
• 1.A.100 Предполагаемый виропорин Rhabdoviridae, семейство U5 (RV-U5)
• 1.A.101 Семейство пероксисомальных порообразующих белков Pex11 (Pex11)
• 1.A.102 Семейство виропоринов гриппа А PB1-F2 (PB1-F2)
• 1.A.103 Семейство вирусов парагриппа 5 (SV5-SH)
• 1.A.104 Предложенный Na ⁺ -канал жгутикового биосинтеза, семейство FlaH (FlaH)
• 1.A.105 Семейство доменов киназ смешанного происхождения (MLKL)
• 1.A.106 Семейство кальциевых каналов, активируемых кальциевой нагрузкой (CLAC)
• 1.A.107 Семейство порообразующих глобинов (глобинов)

1.Б.β-Бочковые пориныи другие белки внешней мембраны

• 1.B.1 Общее семейство бактериальных поринов
• 1.B.2 Семейство хламидийных поринов (CP)
• 1.B.3 Семейство сахарных поринов (СП)
• 1.B.4 Семейство поринов бруцелл и ризобий (BRP)
• 1.B.5 Семейство поринов Pseudomonas OprP (POP)
• 1.B.6 Семейство поринов OmpA-OmpF (OOP)
• 1.B.7 Семейство поринов Rhodobacter PorCa (RPP)
• 1.B.8 Семейство митохондриальных и пластидных поринов (MPP)
• 1.B.9 Семейство белков наружной мембраны FadL (FadL)
• 1.B.10 Семейство нуклеозид-специфических каналообразующих поринов внешней мембраны (Tsx)
• 1.B.11 Семейство поринов фимбриальной наружной мембраны (FUP)
• 1.B.12 Семейство Автотранспортеров-1 (АТ-1)
• 1.B.13 Семейство поринов, экспортирующих альгинат (AEP)
• 1.B.14 Семейство рецепторов наружной мембраны (OMR)
• 1.B.15 Семейство рафинозных поринов (RafY)
• 1.B.16 Семейство короткоцепочечных амидов и мочевинных поринов (SAP)
• 1.B.17 Семейство факторов внешней мембраны (OMF)
• 1.B.18 Семейство белков наружной мембраны (OMA)
• 1.B.19 Семейство глюкозоселективных поринов OprB (OprB)
• 1.B.20 Семейство двухпартнерской секреции (TPS)
• 1.B.21 Семейство поринов OmpG (OmpG)
• 1.B.22 Семейство секретинов внешней бактериальной мембраны (секретинов)
• 1.B.23 Семейство цианобактериальных поринов (CBP)
• 1.B.24 Микобактериальный порин
• 1.B.25 Семейство поринов наружной мембраны (Opr)
• 1.B.26 Семейство циклодекстринпоринов (ЦДП)
• 1.B.31 Семейство поринов наружной мембраны Campylobacter jejuni (MomP)
• 1.B.32 Семейство поринов наружной мембраны фузобактерий (FomP)
• 1.B.33 Семейство поринов, встраиваемых в наружную мембрану (комплекс Bam) (OmpIP)
• 1.B.34 ​​Коринебактериальные порины
• 1.B.35 Семейство олигогалактуронат-специфических поринов (KdgM)
• 1.B.39 Бактериальный порин, семейство OmpW (OmpW)
• 1.B.42 Семейство поринов экспорта липополисахарида наружной мембраны (LPS-EP)
• 1.B.43 Семейство поринов P1 (CPP1) Coxiella
• 1.B.44 Вероятный белок, транслоцирующий семейство поринов porphyromonas gingivalis (PorT)
• 1.B.49 Anaplasma P44 (A-P44) семейство поринов
• 1.B.48 Курлиподобные транспортеры
• 1.B.54 Интимин /Инвазин (Int/Inv) или семейство аутотранспортеров-3
• 1.B.55 Семейство полиацетил-D-глюкозаминпоринов (PgaA)
• 1.B.57 Семейство белков внешней мембраны легионеллы (LM-OMP)
• 1.B.60 Семейство поринов Omp50 (Omp50 Porin)
• 1.B.61 Семейство дельта-протеобактериальных поринов (Дельта-поринов)
• 1.B.62 Предполагаемое семейство бактериальных поринов (PBP)
• 1.B.66 Предполагаемое семейство бета-бочонковых поринов-2 (BBP2)
• 1.B.67 Предполагаемое семейство бета-бочкообразных поринов-4 (BBP4)
• 1.B.68 Предполагаемое суперсемейство бета-бочкообразного порина-5 (BBP5)
• 1.B.70 Семейство каналов наружной мембраны (OMC)
• 1.B.71 Семейство протеобактериальных/веррукомикробных поринов (PVP)
• 1.B.72 Семейство поринов наружной мембраны протохламидий (PomS/T)
• 1.B.73 Семейство биогенеза/сборки капсул (CBA)
• 1.B.78 DUF3374 семейство поринов, ассоциированных с транспортом электронов (ETPorin)

1.СПорообразующие токсины(белки и пептиды)

• 1.C.3 Семейство α- гемолизина (αHL)
• 1.C.4 Семейство аэролизинов
• 1.C.5 Семейство ε-токсинов
• 1.C.11 Суперсемейство RTX-токсинов
• 1.C.12 Комплекс мембранной атаки/суперсемейство перфоринов
• 1.C.13 Семейство лейкоцидинов
• 1.C.14 Семейство цитогемолизинов (CHL)
• 1.C.39 Семейство тиол-активируемых холестеринзависимых цитолизинов
• 1.C.43 Семья Лысениных
• 1.C.56 Pseudomonas syringae Семейство катионных каналов HrpZ
• 1.C.57 Семейство клостридиальных цитотоксинов
• 1.C.58 Семейство микроцинов E492/C24 (микроцин E492)
• 1.C.74 Семейство змеиных цитотоксинов (SCT)
• 1.C.97 Семейство порообразующих плевротолизинов

1.D Каналы, не синтезируемые рибосомами

• 1.D.1 Семейство каналов грамицидина А
• 1.D.2 Семейство сирингомицинов , образующих каналы
• 1.D.3 Семейство сирингопептинов, образующих каналы
• 1.D.4 Каналообразующая семья Толаасин
• 1.D.5 Семейство антибиотиков аламетицина или пептабола , формирующих каналы
• 1.D.6 Семейство комплексных поли-3-гидроксибутиратных Ca ²⁺ каналов (cPHB-CC)
• 1.D.7 Семейство бетиколина
• 1.D.8 Семейство сапонинов
• 1.D.9 Семейство полиглутаминовых ионных каналов (PG-IC)
• 1.D.10 Семейство каналов, образующих церамиды
• 1.D.11 Семейство сурфактинов
• 1.D.12 Семейство Боверицинов (Боверицинов)
• 1.D.13 Антибиотики на основе амфипатических пептидов, доставляющие ДНК (DAPA)
• 1.D.14 Семейство синтетических лей/серных амфипатических каналообразующих пептидов (l/S-SCP)
• 1.D.15 Семейство даптомицинов (даптомицинов)
• 1.D.16 Семейство синтетических амфипатических порообразующих гептапептидов (SAPH)
• 1.D.17 Комбинаторно-спроектированное, порообразующее, семейство β-слоистых пептидов
• 1.D.18 Семейство порообразующих конъюгатов гуанозина и желчной кислоты
• 1.D.19 Препарат, образующий каналы Ca ²⁺ , семейство дигитоксинов
• 1.D.20 Семейство порообразующих полиеновых макролидных антибиотиков/грибковых агентов (ПМАК)
• 1.D.21 Семейство липидных нанопор (LipNP)
• 1.D.22 Протон-транслоцирующий каротиноидный пигмент, семейство зеаксантинов
• 1.D.23 Семейство порообразующих антимикробных препаратов на основе фениленэтинилена (ПЭПА)
• 1.D.24 Семейство морских губок политионамида B (pTB)
• 1.D.25 Семейство ариламиновых фолдамеров (AAF)
• 1.D.26 Семейство 9'-O-β-D-глюкозидов дигидродегидродикониферилового спирта (DDDC9G)
• 1.D.27 Семейство изостеров тиомочевины
• 1.D.28 Семейство липопептаболов
• 1.D.29 Семейство макроциклических олигохолатов
• 1.D.30 Семейство искусственных гидразид-присоединенных столбчатых[5]ареновых каналов (HAPA-C)
• 1.D.31 Семейство амфотерицина B
• 1.D.32 Семейство порообразующих новицидиновых соединений
• 1.D.33 Каналообразующее семейство политионамидов B
• 1.D.34 Каналообразующие олигоэфирные боламфифилы
• 1.D.35 Семейство циклических липодепсипептидов, образующих поры
• 1.D.36 Семейство каналов ионов олигоборнена
• 1.D.37 Семейство Hibicuslide C
• 1.D.38 Семейство циклических пептидных нанотрубок (cPepNT)
• 1.D.39 Семейство амфифильных молекулярных ионных каналов на основе азобензола, управляемых светом (AAM-IC)
• 1.D.40 Семейство липидных тороидальных пор, индуцированных белком
• 1.D.41 Семейство ионофоров спротетонатного типа (спирогексанолиды)
• 1.D.42 Семейство каналов Phe-Arg Tripeptide-Pillar[5]Arene (TPPA-C)
• 1.D.43 Семейство каналов гуанозина динуклеозида триазола (TT-GDN-C)
• 1.D.44 Семейство синтетических ионных каналов с редокс-активным ферроценом (ICRF)
• 1.D.45 Семейство сонопорации и электропорации мембранных пор (SEMP)
• 1.D.46 Семейство ДНК-нанопор (DnaNP)
• 1.D.47 Семейство порообразующих синтетических циклических пептидов (PSCP)
• 1.D.48 Порообразующее семейство сирингомицина E
• 1.D.49 Семейство трансмембранных каротиноидных радикальных каналов (CRC)
• 1.D.50 Семейство амфифильных бис-катехиновых анионных транспортеров (AC-AT)
• 1.D.51 Семейство белковых нанопор (ProNP)
• 1.D.52 Семейство ароматических олигоамидных макроциклических нанопор (OmnNP)
• 1.D.53 Семейство альфа-, гамма-пептидных нанотрубок (a,gPepNT)
• 1.D.54 Семейство калийселективных ионного канала гексил-бензоуреидо-15-краун-5-эфира (HBEC)
• 1.D.55 Семейство нанопор на основе порфирина (PorNP)
• 1.D.56 Семейство олигомерных нанопор альфа-аминоизобутирата (Aib) (AibNP)
• 1.D.57 Семейство липидных электропор (LEP)
• 1.D.58 Семейство продигиозена (продигиозена), транспортирующего анионы
• 1.D.59 Семейство переносящих анионы переносчиков переносин (перенозинов)
• 1.D.60 Семейство альфа-гамма-циклических пептидов (AGCP)
• 1.D.61 Семейство анионофорных 2,6-бис(бензимидазол-2-ил)пиридиновых (ABBP) соединений
• 1.D.62 Семейство производных бис-триазолилдигуанозина, образующих каналы (TDG)
• 1.D.63 Семейство нанопор на основе пептидов (PepNP)
• 1.D.64 Семейство углеродных нанотрубок (CarNT)
• 1.D.65 Семейство порообразующих амфидиноловых соединений (амфидинол)
• 1.D.66 Семейство спиральных макромолекулярных нанопор (HmmNP)
• 1.D.67 Семейство спиральных пептидных ионных каналов, модифицированных краун-эфиром (CEHP)
• 1.D.68 Семейство порообразующих плевронических блок-полимеров (PPBP)
• 1.D.69 Семейство конических нанопор (ConNP)
• 1.D.70 Семейство металлических (Au/Ag/Pt/графен) нанопор (MetNP)
• 1.D.71 Семейство синтетических пептидов TP359 (TP359)
• 1.D.72 Семейство триподальных рецепторов на основе триазина для переноса хлорида (CCTTR)
• 1.D.73 Семейство мезопористых кремниевых нанопор (SilNP)
• 1.D.74 Семейство синтетических жестких пор п-октифенилового стержня (SSROP), чувствительных к стимулам

1.ЭХолинс

1.ФСлияние везикулпоры

• 1.F.1 Семейство пор слияния синаптосомальных везикул (SVF-поры)
• 1.F.2 Семейство октамерных экзоцист (экзоцист)

1.ГВирусное слияниепоры

• 1.G.1 Семейство вирусных порообразующих мембранных белков слияния-1 (VMFP1)
• 1.G.2 Семейство вирусных белков слияния порообразующих мембран-2 (VMFP2)
• 1.G.3 Семейство вирусных порообразующих мембранных белков слияния-3 (VMFP3)
• 1.G.4 Семейство вирусных белков слияния порообразующих мембран-4 (VMFP4)
• 1.G.5 Семейство вирусных порообразующих мембранных белков слияния-5 (VMFP5)
• 1.G.6 Семейство белков слияния гепаднавируса S (белок HBV-S)
• 1.G.7 Семейство белков слияния реовирусов FAST (R-FAST)
• 1.G.8 Семейство белков слияния аренавирусов (AV-FP)
• 1.G.9 Семейство синцитинов (синцитинов)
• 1.G.10 Семейство комплексов слияния мембран вируса простого герпеса (HSV-MFC)
• 1.G.11 Семейство белкового комплекса проникновения в клетку поксвируса (PEP-C)
• 1.G.12 Семейство белков слияния вируса лейкоза птиц gp95 (ALV-gp95)
• 1.G.13 Семейство малых трансмембранных белков, ассоциированных со слиянием ортореовирусов (FAST)
• 1.G.14 Семейство гемагглютинина вируса гриппа/слияния порообразующих белков (Influenza-H/FPP)
• 1.G.15 Семейство гликопротеинов GP64 (GP64) вируса ядерного полиэдроза Autographa californica
• 1.G.16 Семейство пептидов слияния вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) (ВИЧ-FP)
• 1.G.17 Семейство гликопротеинов оболочки вируса лейкемии крупного рогатого скота (BLV-Env)
• 1.G.18 Пептид слияния SARS-CoV в семействе предшественников гликопротеина-шипа (SARS-FP)
• 1.G.19 Семейство ротавирусного комплекса слияния поровых мембран (ротавирусного MFC)
• 1.G.20 Семейство гликопротеинов слияния оболочки Gc хантавируса (Gc-EFG)
• 1.G.21 Вирус Эпштейна-Барр (вирус герпеса человека 4) семейство Gp42 (Gp42)
• 1.G.22 Семейство гликопротеинов gO (gO) цитомегаловируса (вируса герпеса человека 5 типа)

1.H Параклеточные каналы

• 1.H.1 Семейство плотных контактов Клаудина (Claudin1)
• 1.H.2 Семейство беспозвоночных PMP22-Клаудин (Клаудин2)

1.I Мембранно-связанные каналы

• 1.I.1 Семейство ядерных поровых комплексов , включая кариоферины
• 1.I.2 Растительное семейство плазмодесм

2. Электрохимические потенциал-управляемые транспортеры

2.А Портерс (унипортеры,симпортеры,антипортеры)

• 2.A.1 Суперсемейство основных посредников (MFS), см. также Лактозопермеаза , Фосфатпермеаза и Транспортер глюкозы
• 2.A.2 Семейство гликозид-пентозид-гексуронидов (GPH): катионных симпортеров
• 2.A.3 Семейство аминокислот-полиаминов-органокатионов (APC)
• 2.A.4 Семейство катализаторов диффузии катионов (CDF)
• 2.A.5 Семейство пермеаз цинка (Zn ²⁺ )-железа (Fe ^{2+ )}
• 2.A.6 Суперсемейство резистентности-клубенькования-деления клеток , см. также белок SecDF-экспорт мембранного белка
• 2.A.7 Суперсемейство переносчиков лекарств/метаболитов (DMT)
• 2.A.8 Семейство глюконат:H ⁺ симпортеров (GntP)
• 2.A.9 Семейство инсертаз мембранных белков (YidC/Alb3/Oxa1)
• 2.A.10 Семейство транспортеров 2-кето-3-дезоксиглюконата (KdgT)
• 2.A.11 Семейство симпортеров цитрата-Mg ²⁺ :H ⁺ (CitM) цитрата-Ca ²⁺ :H ⁺ (CitH) (CitMHS)
• 2.A.12 Семейство антипортеров АТФ:АДФ
• 2.A.13 Семейство C4-дикарбоксилатных белков (Dcu)
• 2.A.14 Семейство лактатпермеаз
• 2.A.15 Семейство переносчиков бетаина/карнитина/холина (BCCT)
• 2.A.16 Семейство переносчиков теллурита/дикарбоксилата
• 2.A.17 Семейство протонзависимых олигопептидных транспортеров
• 2.A.18 Семейство пермеаз аминокислот и ауксинов (AAAP)
• 2.A.19 Семейство антипортеров катионов Ca ²⁺ (CaCA)
• 2.A.20 Семейство переносчиков неорганического фосфата (PiT)
• 2.A.21 Растворенное вещество: Семейство симпортеров натрия
• 2.A.22 Нейротрансмиттер: семейство симпортеров натрия
• 2.A.23 Семейство симпортеров дикарбоксилат/аминокислота:катион (Na ⁺ или H ⁺ ) (DAACS)
• 2.A.24 Семейство транспортеров 2-гидроксикарбоксилата (2-HCT)
• 2.A.25 Семейство симпортеров аланина или глицина: катиона (AGCS)
• 2.A.26 Семейство симпортеров аминокислот с разветвленной цепью: катион (LIVCS)
• 2.A.27 Семейство симпортеров глутамата:Na ⁺ (ESS)
• 2.A.28 Желчная кислота: семейство Na ⁺ Symporter
• 2.A.29 Семья митохондриальных переносчиков
• 2.A.30 Семейство катион-хлоридных котранспортеров (CCC)
• 2.A.31 Семейство анионообменников
• 2.A.32 Семейство переносчиков кремния (Sit)
• 2.A.33 Семейство NhaA Na ⁺ :H ⁺ антипортер (NhaA)
• 2.A.34 Семейство антипортеров NhaB Na ⁺ :H ⁺ (NhaB)
• 2.A.35 Семейство антипортеров NhaC Na ⁺ :H ⁺ (NhaC)
• 2.A.36 Семейство моновалентных катионов: протонных антипортеров-1 (CPA1)
• 2.A.37 Семейство моновалентных катионов: протонных антипортеров-2 (CPA2)
• 2.A.38 K ⁺ Транспортер (Trk) Семейство
• 2.A.39 Семейство нуклеиновых оснований: катионный симпортер-1 (NCS1)
• 2.A.40 Семейство нуклеиновых оснований: катионный симпортер-2 (NCS2)
• 2.A.41 Семейство концентрирующих нуклеозидных транспортеров (CNT)
• 2.A.42 Семейство пермеаз гидрокси/ароматических аминокислот (HAAAP)
• 2.A.43 Семейство лизосомальных переносчиков цистеина (LCT)
• 2.A.45 Семейство арсенита-антимонита
• 2.A.46 Семейство бензоат:H ⁺ симпортеров (BenE)
• 2.A.47 Семейство двухвалентных анионов:Na ⁺ симпортер (DASS)
• 2.A.48 Семейство переносчиков восстановленного фолата (RFC)
• 2.A.49 Семейство переносчиков/каналов хлорида (ClC)
• 2.A.50 Семейство глицериновых ингибиторов (GUP)
• 2.A.51 Семейство переносчиков ионов хромата (CHR)
• 2.A.52 Семейство переносчиков Ni ²⁺ -Co ²⁺ (NiCoT)
• 2.A.53 Семейство сульфатпермеаз (SulP)
• 2.A.54 Семейство митохондриальных переносчиков трикарбоксилата (MTC)
• 2.A.55 Семейство переносчиков ионов металлов (Mn2 ⁺ -железо) (Nramp)
• 2.A.56 Семейство трехкомпонентных АТФ-независимых периплазматических транспортеров (TRAP-T)
• 2.A.57 Семейство транспортеров равновесных нуклеозидов (ENT)
• 2.A.58 Семейство фосфат:Na ⁺ симпортеров (PNaS)
• 2.A.59 Семейство резистентности к мышьяку-3 (ACR3)
• 2.A.60 Семейство переносчиков органоанионов (OAT)
• 2.A.61 Семейство C4-дикарбоксилата (DcuC)
• 2.A.62 Семейство NhaD Na ⁺ :H ⁺ антипортер (NhaD)
• 2.A.63 Семейство моновалентных катионов (K ⁺ или Na ⁺ ): протонных антипортеров-3 (CPA3)
• 2.A.64 Семейство двойных аргининовых нацеливающих белков (Tat)
• 2.A.65 Семейство переносчиков билирубина (BRT)
• 2.A.66 Суперсемейство мультилекарственных/олигосахаридил-липид/полисахаридных (MOP) флиппаз
• 2.A.67 Семейство олигопептидных транспортеров (OPT)
• 2.A.68 Семейство переносчиков п-аминобензоил-глутамата (AbgT)
• 2.A.69 Семейство переносчиков ауксина (AEC)
• 2.A.70 Семейство малонат:Na ⁺ симпортеров (MSS)
• 2.A.71 Семейство транспортеров фолиевой кислоты и биоптерина (FBT)
• 2.A.72 Семейство пермеаз поглощения калия ⁽ KUP)
• 2.A.73 Семейство короткоцепочечных жирных кислот (AtoE)
• 2.A.74 Семейство 4 TMS мультилекарственных эндосомальных транспортеров (MET)
• 2.A.75 Семейство экспортеров L-лизина (LysE)
• 2.A.76 Устойчивость к семейству гомосерина/треонина (RhtB)
• 2.A.77 Семейство кадмиестойких (CadD)
• 2.A.78 Семейство экспортеров аминокислот с разветвленной цепью (LIV-E)
• 2.A.79 Семейство экспортеров треонина/серина (ThrE)
• 2.A.80 Семейство трикарбоксилатных транспортеров (ТТТ)
• 2.A.81 Семейство аспартат-аланиновых обменников (AAEx)
• 2.A.82 Семейство переносчиков органических растворенных веществ (OST)
• 2.A.83 Семейство Na ⁺ -зависимых переносчиков бикарбоната (SBT)
• 2.A.84 Семейство экспортеров хлоропластной мальтозы (MEX)
• 2.A.85 Семейство экспортеров ароматических кислот (ArAE)
• 2.A.86 Семейство экспортеров аутоиндуктора-2 (AI-2E) (ранее семейство PerM, TC #9.B.22)
• 2.A.87 Семейство прокариотических транспортеров рибофлавина (P-RFT)
• 2.A.88 Семейство транспортеров поглощения витаминов (VUT или ECF)
• 2.A.89 Семейство вакуолярных транспортеров железа (VIT)
• 2.A.90 Семейство рецепторов/транспортеров витамина А (STRA6)
• 2.A.91 Комплекс импорта митохондриальной тРНК (M-RIC) (ранее 9.C.8)
• 2.A.92 Семейство холинопереносчиков (CTL)
• 2.A.94 Семейство фосфатпермеаз (Pho1)
• 2.A.95 Семейство нейтральных переносчиков аминокислот (NAAT) 6TMS
• 2.A.96 Семейство транспортеров захвата ацетата (AceTr)
• ^{2.A.97 Семейство обменников K +} /H ⁺ и Ca ²⁺ /H ⁺ внутренней мембраны митохондрий (LetM1)
• 2.A.98 Семейство предполагаемых экспортеров сульфата (PSE)
• 2.A.99 Семейство транспортеров поглощения 6TMS Ni ²⁺ (HupE-UreJ)
• 2.A.100 Семейство ферропортинов (Fpn)
• 2.A.101 Семейство малонатных ингибиторов поглощения (MatC) (ранее UIT1)
• 2.A.102 Семейство пермеаз поглощения 4-толуолсульфоната (TSUP)
• 2.A.103 Семейство экспортеров предшественников бактериального муреина (MPE)
• 2.A.104 Семейство экспортеров L-аланина (AlaE)
• 2.A.105 Семейство митохондриальных переносчиков пирувата (MPC)
• 2.A.106 Семейство антипортеров Ca ²⁺ :H ⁺ (CaCA2)
• 2.A.107 Семейство экспортеров MntP Mn ²⁺ (MntP)
• 2.A.108 Семейство транспортеров железа/свинца (ILT)
• 2.A.109 Семейство теллур-ионного сопротивления (TerC)
• 2.A.110 Семейство белков-переносчиков гема (HRG)
• 2.A.111 Семейство Na ⁺ /H ⁺ антипортеров-E (NhaE)
• 2.A.112 Семейство антигенов группы крови KX (KXA)
• 2.A.113 Семейство переносчиков никеля/кобальта (NicO)
• 2.A.114 Предполагаемый пептидный транспортер углеродного голодания CstA (CstA) семейства
• 2.A.115 Семейство экспортеров новобиоцина (NbcE)
• 2.A.116 Семейство пептидогликолипидных адресных белков (GAP)
• 2.A.117 Семейство экспортеров хлоргексидина (CHX)
• 2.A.118 Семейство основных аминокислотных антипортеров (ArcD)
• 2.A.119 Семья экспортеров мышьякоорганических соединений (ArsP)
• 2.A.120 Семейство предполагаемых аминокислотных пермеаз (PAAP)
• 2.A.121 Семейство переносчиков сульфата (CysZ)
• 2.A.122 Семейство вспомогательных холиноподобных белков LrgB/CidB (LrgB/CidB)
• 2.A.123 Сладкий; PQ-петля; Слюна; Семейство MtN3 (сладкий)
• 2.A.124 Семейство экспортеров лизина (LysO)
• 2.A.125 Семейство эукариотических транспортеров рибофлавина (E-RFT)
• 2.A.126 Семейство экспортеров жирных кислот (FAX)
• 2.A.127 Семейство энтеробактериальных переносчиков кардиолипина (CLT)

2.B Портеры, синтезируемые нерибосомально

• 2.B.1 Семейство переносчиков валиномицина
• 2.B.2 Семья Монензинов
• 2.B.3 Семейство нигерицинов
• 2.B.4 Семейство антибиотиков макротетролидов (МА)
• 2.B.5 Семейство макроциклических полиэфиров (МП)
• 2.B.6 Семейство иономицинов
• 2.B.7 Семейство трансмембранной α-спиральной пептидной фосфолипидной транслокации (TMP-PLT)
• 2.B.8 Семейство бафиломицина А1 (бафиломицина)
• 2.B.9 Функциональное семейство пептидов, проникающих в клетки (CPP)
• 2.B.10 Синтетический CPP, семейство транспортанов
• 2.B.11 Семейство ионофоров кальцимицинового или A23187-носителей
• 2.B.12 Семейство салиномицинов
• 2.B.13 Семейство антипортеров тетрапиррольных макроциклических анионов (TPMC-AA)
• 2.B.14 Семейство ионофоров Lasalocid A или X-537A (Lasalocid)
• 2.B.15 Семейство хлоридных носителей на основе тритиомочевины (TTT-CC)
• 2.B.16 Семейство соединений-анионов, содержащих галогеновые связи (HCAC)
• 2.B.17 Семейство котранспортеров (IDC) производных изофталамида H ⁺ :Cl ⁻
• 2.B.18 Производное пиридин-2,6-дикарбоксамина (PDCA) H+:Cl ⁻ семейство котранспортеров
• 2.B.19 Семейство производных каликс(4)пиррола (C4P)
• 2.B.20 Семейство хлорид/бикарбонатных обменников продигиозина (Prodigiosin)
• 2.B.21 Семейство анионных транспортеров производных орто-фенилендиамин-бис-мочевины (oPDA-U)
• 2.B.22 Семейство имидазолиевых функционализированных анионных транспортеров (IAT)
• 2.B.23 Гомотетрамерный трансмембранный Zn2 ⁺ /Co2 ⁺ : протонный синтетический антипортер, семейство Rocker (Рокер)
• 2.B.24 Семейство анионных носителей 2,6-бис(бензимидазол-2-ил)пиридина (BBP-AC)
• 2.B.25 Семейство пептид-опосредованных липидных флип-флопов (PLFF)
• 2.B.26 Семейство бис(имидазолил)-функционализированных бис(холоил) конъюгатов (BIBCC)
• 2.B.27 Семейство переносчиков анионов трис-мочевины
• 2.B.29 Анионофорные морские алкалоиды семейства тамбджаминов

2.C Ионно-градиентные источники энергии

• 2.C.1 Семейство вспомогательных белков TonB-ExbB-ExbD/TolA-TolQ-TolR (TonB) для энергизации активного транспорта, опосредованного рецептором внешней мембраны (OMR)

3.Первичные активные транспортеры

3.A. Транспортеры, управляемые гидролизом PP-связей

• 3.A.1 ABC-транспортеры, включая BtuCD, транспортер поглощения молибдата, регулятор трансмембранной проводимости при муковисцидозе и другие
• 3.A.2 Суперсемейство H ⁺ - или Na ⁺ -транслоцирующих АТФаз F-типа , АТФаз V-типа и АТФаз A-типа
• 3.A.3 Суперсемейство АТФазы P-типа
• 3.A.4 Семейство арсенита-антимонита
• 3.A.5 Общий секреторный путь (Sec) транслокон (препротеин транслоказа SecY)
• 3.A.6 Семейство секреторных путей типа III (связанных с вирулентностью) (IIISP)
• 3.A.7 Семейство секреторного пути типа IV (конъюгационный перенос ДНК-белка или VirB) (IVSP)
• 3.A.8 Семейство митохондриальных протеинтранслоказ (MPT)
• 3.A.9 Семейство транслоказ белка оболочки хлоропласта (CEPT или Tic-Toc)
• 3.A.10 Семейство пирофосфатаз, транслоцирующих H ⁺ , Na ⁺
• 3.A.11 Семейство ДНК-транспортеров трансформации, связанных с бактериальной компетентностью (ДНК-Т)
• 3.A.12 Семейство транслокаторов септальной ДНК (S-DNA-T)
• 3.A.13 Семейство экспортеров нитчатых фагов (FPhE)
• 3.A.14 Семейство экспортеров фимбрилина/белка (FPE)
• 3.A.15 Семейство белков внешней мембраны, секретирующих главную терминальную ветвь (MTB)
• 3.A.16 Семейство ретротранслоконов эндоплазматического ретикулярного белка (ER-RT)
• 3.A.17 Семейство инъектисом фага T7 (T7 Injectisome)
• 3.A.18 Семейство ядерных экспортеров мРНК (мРНК-Е)
• 3.A.19 Семейство комплексов распознавания/вставки TMS (TRC)
• 3.A.20 Семейство импортеров пероксисомальных белков (PPI)
• 3.A.21 Семейство комплекса биогенеза/вставки мембранного белка, закрепленного на С-концевом хвосте (TAMP-B)
• 3.A.22 Семейство комплексов экспорта ядерной мРНК (TREX), связанных с транскрипцией TREX/TAP
• 3.A.23 Семейство путей симбиоза/вирулентности VI типа (VISP)
• 3.A.24 Семейство систем секреции белков типа VII или ESX (T7SS)
• 3.A.25 Семейство симбионт-специфических ERAD-подобных машин (SELMA)
• 3.A.26 Семейство транслоконов экспортируемых белков плазмодия (PTEX)

3.B Транспортеры, управляемые декарбоксилированием

• 3.B.1 Семейство Na ⁺ -транспортирующих декарбоксилаз карбоновых кислот (NaT-DC)

3.C Транспортеры, управляемые метилтрансфером

• 3.C.1 Семейство Na ⁺ -переносящих метилтетрагидрометаноптерин:кофермент М метилтрансфераз (NaT-MMM)

3.D. Окислительно-восстановительные транспортеры

Они включают ряд трансмембранных цитохром b -подобных белков, включая кофермент Q - цитохром c-редуктазу (цитохром bc1); комплекс цитохрома b6f ; формиатдегидрогеназу, респираторную нитратредуктазу ; сукцинат - кофермент Q-редуктазу (фумаратредуктазу); и сукцинатдегидрогеназу . См. цепь переноса электронов .

• 3.D.1 Семейство H ⁺ или Na ⁺ -транслоцирующих НАДН-дегидрогеназ («комплекс I»)
• 3.D.2 Семейство трансгидрогеназ, транслоцирующих протоны (ПТГ)
• 3.D.3 Протон-транслоцирующее хинол:цитохром с-редуктазное суперсемейство
• 3.D.4 Суперсемейство протон-транслоцирующей цитохромоксидазы (COX)
• 3.D.5 Семейство Na ⁺ -транслоцирующих НАДН:хинондегидрогеназ (Na-NDH или NQR)
• 3.D.6 Предполагаемое семейство НАДН:ферредоксин оксидоредуктаз (НФО или РНФ), перемещающее ионы (Н ⁺ или Na ^{+ )}
• 3.D.7 Семейство H2 _: гетеродисульфид оксидоредуктаз (HHO)
• 3.D.8 Семейство Na ⁺ - или H ⁺ -перекачивающих формилметанофурандегидрогеназ (FMF-DH)
• 3.D.9 Семейство дегидрогеназ F420H2 (F420H2DH), транслоцирующих H ⁺
• 3.D.10 Семейство прокариотических сукцинатдегидрогеназ (SDH)

3.E. Транспортеры, управляемые поглощением света

• Бактериородопсин -подобные белки, включая родопсин (см. также опсин )
• Бактериальные фотосинтетические реакционные центры и фотосистемы I и II
• Светосборные комплексы из бактерий и хлоропластов

4. Групповые транслокаторы

4. Групповые транслокаторы, управляемые фосфопереносом

• 4.A.1 Семейство PTS-глюкозо-глюкозидов (Glc)
• 4.A.2 Семейство PTS фруктоза-маннит (Fru)
• 4.A.3 Семейство PTS лактоза-N,N'-диацетилхитобиоза-β-глюкозид (Lac)
• 4.A.4 Семейство PTS Glucitol (Gut)
• 4.A.5 Семейство PTS-галактитола (Gat)
• 4.A.6 Семейство PTS манноза-фруктоза-сорбоза (человек)
• 4.A.7 Семейство PTS L-аскорбата (L-Asc)

4.B Транспортеры захвата никотинамид рибонуклеозида

• 4.B.1 Семейство пермеаз захвата никотинамид рибонуклеозида (NR) (PnuC)

4.C Транспортеры, связанные с ацил-КоА-лигазой

• 4.C.1 Предлагаемое семейство транспортеров жирных кислот (FAT)
• 4.C.2 Семейство карнитин-О-ацилтрансферазы (CrAT)
• 4.C.3 Семейство ацил-КоА-тиоэстераз (AcoT)

4.D Полисахаридсинтаза/Экспортеры

• 4.D.1 Предполагаемое семейство векторной гликозилполимеризации (VGP)
• 4.D.2 Семейство гликозилтрансферазы 2 (GT2)
• 4.D.3 Семейство гликанглюкозилтрансфераз (OpgH)

4.E. Групповые транслокаторы, катализируемые вакуолярной полифосфатполимеразой

• 4.E.1 Семейство вакуолярной (ацидокальцисомной) полифосфатполимеразы (V-PPP)

5. Транспортные переносчики электронов

5.A Трансмембранные переносчики 2-электронов

• 5.A.1 Семейство оксидоредуктаз дисульфидных связей D (DsbD)
• 5.A.2 Семейство оксидоредуктаз дисульфидных связей B (DsbB)
• 5.A.3 Семейство прокариотических молибдоптеринсодержащих оксидоредуктаз (PMO)

5.B Трансмембранные переносчики 1-электрона

• 5.B.1 Семейство НАДФН-оксидазы фагоцитов ( gp91phox )
• 5.B.2 Эукариотическое семейство цитохромов b561 (Cytb561)
• 5.B.3 Семейство Geobacter Nanowire Electron Transfer (G-NET)
• 5.B.4 Семейство суперкомплексов фотосистемы I растений (PSI)
• 5.B.5 Семейство внеклеточных металлооксидоредуктаз (EMOR)
• 5.B.6 Семейство трансмембранного эпителиального антигенного белка-3 железоредуктазы (STEAP)
• 5.B.7 Семья YedZ (YedZ)
• 5.B.8 Семейство транс-наружных мембранных пориновых/цитохромных комплексов переноса электронов (ET-PCC)
• 5.B.9 Семейство поринов-цитохромов c (Cyc2)

8. Вспомогательные факторы, участвующие в транспорте

8.A Вспомогательные транспортные белки

8.B Рибосомально синтезируемые белковые/пептидные токсины, нацеленные на каналы и переносчики

8.C Токсины, синтезируемые не рибосомами, которые нацелены на каналы и переносчики

9. Не полностью охарактеризованные транспортные системы

9.A Признанные транспортеры неизвестного биохимического механизма

9.B Предполагаемые транспортные белки

9.C Функционально охарактеризованные транспортеры, не имеющие идентифицированных последовательностей

Ссылки

1. Saier, Milton H.; Reddy, Vamsee S.; Tamang, Dorjee G.; Västermark, Åke (январь 2014 г.). «База данных классификации транспортеров». Nucleic Acids Research . 42 (D1): D251–D258. doi :10.1093/nar/gkt1097. PMC  3964967. PMID  24225317 .
2. Saier, MH; Yen, MR; Noto, K.; Tamang, DG; Elkan, C. (1 января 2009 г.). «База данных классификации транспортеров: последние достижения». Nucleic Acids Research . 37 (База данных): D274–D278. doi :10.1093/nar/gkn862. PMC 2686586 . PMID  19022853. 
3. Saier, MH; Tran, CV; Barabote, RD (1 января 2006 г.). «TCDB: База данных классификации транспортеров для анализа и информации о мембранных транспортных белках». Nucleic Acids Research . 34 (90001): D181–D186. doi :10.1093/nar/gkj001. PMC 1334385 . PMID  16381841. 

Внешние ссылки

• База данных классификации транспортеров
• Список на qmul.ac.uk
• Saier MH, Tran CV, Barabote RD (январь 2006 г.). "TCDB: База данных классификации транспортеров для анализа и информации о мембранных транспортных белках". Nucleic Acids Res . 34 (выпуск базы данных): D181–6. doi :10.1093/nar/gkj001. PMC  1334385. PMID  16381841 .
• Busch W, Saier MH (2002). «Система классификации транспортеров (TC), 2002». Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol . 37 (5): 287–337. doi :10.1080/10409230290771528. PMID  12449427. S2CID  10558982.
• Классификация переносчиков человека в фармакологии