stringtranslate.com

Флуоресцентный микроскоп

Вертикальный флуоресцентный микроскоп (Olympus BX61) с флуоресцентным светофильтром, расположенным над объективами, в сочетании с цифровой камерой.
Принцип работы флуоресцентных и конфокальных микроскопов

Флуоресцентный микроскоп — это оптический микроскоп , который использует флуоресценцию вместо или в дополнение к рассеянию , отражению и затуханию или поглощению для изучения свойств органических или неорганических веществ. [1] [2] «Флуоресцентный микроскоп» относится к любому микроскопу, который использует флуоресценцию для создания изображения, будь то простая установка, такая как эпифлуоресцентный микроскоп, или более сложная конструкция, такая как конфокальный микроскоп , который использует оптическое секционирование для получения лучшего разрешения флуоресцентного изображения. [3]

Принцип

Образец освещается светом определенной длины волны (или длин волн), который поглощается флуорофорами , заставляя их излучать свет с большей длиной волны (т. е. другого цвета, чем поглощенный свет). Свет освещения отделяется от гораздо более слабой испускаемой флуоресценции с помощью спектрального фильтра излучения. Типичными компонентами флуоресцентного микроскопа являются источник света ( ксеноновая дуговая лампа или ртутная лампа являются обычными; более продвинутые формы - это мощные светодиоды и лазеры ), фильтр возбуждения , дихроичное зеркало (или дихроичный светоделитель ) и фильтр излучения (см. рисунок ниже). Фильтры и дихроичный светоделитель выбираются так, чтобы соответствовать спектральным характеристикам возбуждения и излучения флуорофора, используемого для маркировки образца. [1] Таким образом, распределение одного флуорофора (цвета) отображается за один раз. Многоцветные изображения нескольких типов флуорофоров должны быть составлены путем объединения нескольких одноцветных изображений. [1]

Большинство используемых флуоресцентных микроскопов являются эпифлуоресцентными микроскопами, в которых возбуждение флуорофора и обнаружение флуоресценции осуществляются через один и тот же световой путь (т. е. через объектив). Эти микроскопы широко используются в биологии и являются основой для более продвинутых конструкций микроскопов, таких как конфокальный микроскоп и флуоресцентный микроскоп полного внутреннего отражения (TIRF).

Эпифлуоресцентная микроскопия

Схема флуоресцентного микроскопа.

Большинство флуоресцентных микроскопов, особенно используемых в биологических науках , имеют эпифлуоресцентную конструкцию, показанную на схеме. Свет возбуждающей длины волны освещает образец через объектив . Флуоресценция , испускаемая образцом, фокусируется на детекторе тем же объективом, который используется для возбуждения, для чего для большего разрешения потребуется объектив с более высокой числовой апертурой . Поскольку большая часть возбуждающего света передается через образец, только отраженный возбуждающий свет достигает объектива вместе с испускаемым светом, и поэтому эпифлуоресцентный метод дает высокое отношение сигнал/шум. Дихроичный светоделитель действует как фильтр определенной длины волны, пропуская флуоресцентный свет через окуляр или детектор, но отражая любой оставшийся возбуждающий свет обратно к источнику. [ необходима цитата ]

Источники света

Флуоресцентная микроскопия требует интенсивного, почти монохроматического освещения, которое некоторые распространенные источники света, такие как галогенные лампы, не могут обеспечить. [4] Используются четыре основных типа источников света, включая ксеноновые дуговые лампы или ртутные лампы с фильтром возбуждения , лазеры , источники суперконтинуума и высокомощные светодиоды . Лазеры наиболее широко используются для более сложных методов флуоресцентной микроскопии, таких как конфокальная микроскопия и флуоресцентная микроскопия полного внутреннего отражения, в то время как ксеноновые лампы, ртутные лампы и светодиоды с дихроичным фильтром возбуждения обычно используются для широкопольных эпифлуоресцентных микроскопов. Размещая две матрицы микролинз в пути освещения широкопольного эпифлуоресцентного микроскопа, [5] можно добиться высокоравномерного освещения с коэффициентом вариации 1-2%.

Подготовка образца

3D-анимация диатомовых водорослей Corethron sp.
Отображает наложения из четырех флуоресцентных каналов
(a) Зеленый: [флуоресценция DiOC6(3)] - окрашивает клеточные мембраны, указывая на основные тела клеток
(b) Голубой: [флуоресценция PLL-A546] - общее контрастное окрашивание для визуализации поверхностей эукариотических клеток
(c) Синий: [флуоресценция Хехста] - окрашивает ДНК, идентифицирует ядра
(d) Красный: [автофлуоресценция хлорофилла] - разделяет хлоропласты  [6]
Анимация начинается с наложения всех доступных флуоресцентных каналов, а затем визуализация становится более понятной путем включения и выключения каналов.
Образец спермы сельди , окрашенный SYBR зеленым в кювете , освещенной синим светом в эпифлуоресцентном микроскопе. SYBR зеленый в образце связывается с ДНК спермы сельди и, после связывания, флуоресцирует, выделяя зеленый свет при освещении синим светом.

Для того чтобы образец был пригоден для флуоресцентной микроскопии, он должен быть флуоресцентным. Существует несколько методов создания флуоресцентного образца; основными методами являются маркировка флуоресцентными красителями или, в случае биологических образцов, экспрессия флуоресцентного белка . В качестве альтернативы можно использовать собственную флуоресценцию образца (т. е. автофлуоресценцию ). [1] В науках о жизни флуоресцентная микроскопия является мощным инструментом, который позволяет проводить специфическое и чувствительное окрашивание образца для обнаружения распределения белков или других интересующих молекул. В результате существует широкий спектр методов флуоресцентного окрашивания биологических образцов. [ необходима цитата ]

Биологические флуоресцентные красители

Многие флуоресцентные красители были разработаны для ряда биологических молекул. Некоторые из них представляют собой небольшие молекулы, которые по своей природе флуоресцентны и связывают интересующую биологическую молекулу. Основными примерами являются красители нуклеиновых кислот , такие как DAPI и Hoechst (возбуждаемые ультрафиолетовым светом) и DRAQ5 и DRAQ7 (оптимально возбуждаемые красным светом), которые все связывают малую бороздку ДНК , таким образом маркируя ядра клеток. Другие представляют собой лекарства, токсины или пептиды, которые связывают определенные клеточные структуры и были дериватизированы с помощью флуоресцентного репортера. Основным примером этого класса флуоресцентных красителей является фаллоидин , который используется для окрашивания актиновых волокон в клетках млекопитающих . Новый пептид, известный как коллагеновый гибридизирующий пептид , также может быть конъюгирован с флуорофорами и использован для окрашивания денатурированных коллагеновых волокон. Окрашивание стенок растительных клеток выполняется с использованием красителей или красителей, которые связывают целлюлозу или пектин . Продолжается поиск флуоресцентных зондов с высокой специфичностью, которые также позволяют получать изображения растительных клеток в реальном времени. [7]

Существует множество флуоресцентных молекул, называемых флуорофорами или флуорохромами , например, флуоресцеин , Alexa Fluors или DyLight 488 , которые могут быть химически связаны с другой молекулой, которая связывает интересующую цель в образце.

Иммунофлюоресценция

Иммунофлуоресценция — это метод, который использует высокоспецифичное связывание антитела с его антигеном для маркировки определенных белков или других молекул внутри клетки. Образец обрабатывается первичным антителом, специфичным для интересующей молекулы. Флуорофор может быть напрямую конъюгирован с первичным антителом. В качестве альтернативы можно использовать вторичное антитело , конъюгированное с флуорофором, которое специфически связывается с первым антителом. Например, первичное антитело, выращенное у мыши, которое распознает тубулин , в сочетании со вторичным антимышиным антителом, дериватизированным с флуорофором, может быть использовано для маркировки микротрубочек в клетке. [ необходима цитата ]

Флуоресцентные белки

Современное понимание генетики и доступные методы модификации ДНК позволяют ученым генетически модифицировать белки, чтобы они также несли флуоресцентный репортер белка. В биологических образцах это позволяет ученым напрямую сделать интересующий белок флуоресцентным. Затем можно напрямую отслеживать местоположение белка, в том числе в живых клетках.

Ограничения

Флуорофоры теряют способность флуоресцировать, когда они освещаются в процессе, называемом фотообесцвечиванием . Фотообесцвечивание происходит, когда флуоресцентные молекулы накапливают химические повреждения от электронов, возбужденных во время флуоресценции. Фотообесцвечивание может серьезно ограничить время, в течение которого образец может наблюдаться с помощью флуоресцентной микроскопии. Существует несколько методов уменьшения фотообесцвечивания, таких как использование более надежных флуорофоров, минимизация освещения или использование фотозащитных химикатов- поглотителей . [ необходима цитата ]

Флуоресцентная микроскопия с флуоресцентными репортерными белками позволила проводить анализ живых клеток с помощью флуоресцентной микроскопии, однако клетки подвержены фототоксичности, особенно при коротковолновом свете. Кроме того, флуоресцентные молекулы имеют тенденцию генерировать реактивные химические виды при освещении, что усиливает фототоксичный эффект. [ необходима цитата ]

В отличие от методов микроскопии в проходящем и отраженном свете, флуоресцентная микроскопия позволяет наблюдать только определенные структуры, которые были помечены для флуоресценции. Например, наблюдение образца ткани, подготовленного с флуоресцентным ДНК-красителем, с помощью флуоресцентной микроскопии выявляет только организацию ДНК внутри клеток и не раскрывает ничего больше о морфологии клеток.

Вычислительные методы, которые предлагают оценивать флуоресцентный сигнал из нефлуоресцентных изображений (например, светлое поле), могут уменьшить эти опасения. [8] В целом, эти подходы включают обучение глубокой сверточной нейронной сети на окрашенных клетках, а затем оценку флуоресценции на неокрашенных образцах. Таким образом, разделяя исследуемые клетки от клеток, используемых для обучения сети, визуализация может выполняться быстрее и с меньшей фототоксичностью.

Методы субдифракции

Волновая природа света ограничивает размер пятна, на котором может быть сфокусирован свет, из-за дифракционного предела . Это ограничение было описано в 19 веке Эрнстом Аббе и «ограничивает разрешение оптического микроскопа приблизительно половиной длины волны используемого света». Флуоресцентная микроскопия является центральной во многих методах, которые стремятся преодолеть этот предел с помощью специализированных оптических конфигураций. [ необходима цитата ]

Несколько усовершенствований в методах микроскопии были изобретены в 20 веке и привели к некоторому повышению разрешения и контрастности. Однако они не преодолели дифракционный предел. В 1978 году были разработаны первые теоретические идеи, чтобы преодолеть этот барьер, используя микроскоп 4Pi в качестве конфокального лазерного сканирующего флуоресцентного микроскопа, где свет идеально фокусируется со всех сторон в общий фокус, который используется для сканирования объекта с помощью возбуждения «по точкам» в сочетании с обнаружением «по точкам». [9] Однако первая экспериментальная демонстрация микроскопа 4pi состоялась в 1994 году. [10] Микроскопия 4Pi максимизирует количество доступных направлений фокусировки, используя две противоположные объективные линзы или микроскопию с двухфотонным возбуждением, использующую смещенный в красную область свет и многофотонное возбуждение. [ необходима цитата ]

Интегрированная корреляционная микроскопия объединяет флуоресцентный микроскоп с электронным микроскопом. Это позволяет визуализировать ультраструктуру и контекстную информацию с помощью электронного микроскопа, используя данные флуоресцентного микроскопа в качестве инструмента маркировки. [11]

Первой техникой, которая действительно достигла субдифракционного разрешения, была STED-микроскопия , предложенная в 1994 году. Этот метод и все техники, следующие концепции RESOLFT, основаны на сильном нелинейном взаимодействии между светом и флуоресцирующими молекулами. Молекулы сильно перемещаются между различимыми молекулярными состояниями в каждом конкретном месте, так что в конечном итоге свет может испускаться только в небольшой части пространства, отсюда и повышенное разрешение.

Также в 1990-х годах был разработан другой метод микроскопии сверхвысокого разрешения, основанный на широкопольной микроскопии. Существенно улучшенное разрешение размеров клеточных наноструктур , окрашенных флуоресцентным маркером, было достигнуто благодаря разработке локализационной микроскопии SPDM и структурированного лазерного освещения (пространственно-модулированное освещение, SMI). [12] Объединение принципа SPDM с SMI привело к разработке микроскопа Vertico SMI . [13] [14] Детектирование отдельных молекул обычных мигающих флуоресцентных красителей, таких как зеленый флуоресцентный белок (GFP), может быть достигнуто с помощью дальнейшего развития SPDM, так называемой технологии SPDMphymod, которая позволяет обнаруживать и подсчитывать два различных типа флуоресцентных молекул на молекулярном уровне (эта технология называется двухцветной локализационной микроскопией или 2CLM). [15]

В качестве альтернативы, появление фотоактивируемой локализационной микроскопии может достичь аналогичных результатов, полагаясь на мерцание или переключение отдельных молекул, где доля флуоресцирующих молекул очень мала в каждый момент времени. Этот стохастический ответ молекул на примененный свет также соответствует высоконелинейному взаимодействию, приводящему к субдифракционному разрешению.

Галерея флуоресцентных микрофотографий

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abcd Spring KR, Davidson MW. "Введение во флуоресцентную микроскопию". Nikon MicroscopyU . Получено 28 сентября 2008 г.
  2. ^ "Флуоресцентный микроскоп". Микроскопы — помогают ученым исследовать скрытые миры . Нобелевский фонд . Получено 28 сентября 2008 г.
  3. ^ Хуан Карлос Стокерт, Альфонсо Бласкес-Кастро (2017). Флуоресцентная микроскопия в науках о жизни. Bentham Science Publishers. ISBN 978-1-68108-519-7. Архивировано из оригинала 14 мая 2019 . Получено 17 декабря 2017 .
  4. ^ Huang B (март 2010 г.). «Флуоресцентная микроскопия сверхвысокого разрешения». Annual Review of Biochemistry . 78 : 993–1016. doi : 10.1146/annurev.biochem.77.061906.092014. PMC 2835776. PMID 19489737  . 
  5. ^ FAW Coumans; E. van der Pol; LWMM Terstappen (2012). «Профиль освещения с плоской вершиной в эпифлуоресцентном микроскопе с помощью двойных микролинзовых матриц». Цитометрия, часть A. 81 ( 4): 324–331. doi : 10.1002/cyto.a.22029 . PMID  22392641. S2CID  13812696.
  6. ^ Колин, С., Коэльо, Л. П., Сунагава, С., Боулер, К., Карсенти, Э., Борк, П., Пепперкок, Р. и Де Варгас, К. (2017) «Количественная 3D-визуализация для клеточной биологии и экологии микробных эукариот окружающей среды». eLife , 6 : e26066. doi :10.7554/eLife.26066.002.Материал скопирован из этого источника, который доступен по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International.
  7. ^ Bidhendi, AJ; Chebli, Y; Geitmann, A (май 2020 г.). «Флуоресцентная визуализация целлюлозы и пектина в первичной клеточной стенке растений». Журнал микроскопии . 278 (3): 164–181. doi :10.1111/jmi.12895. PMID  32270489. S2CID  215619998.
  8. ^ Кандель, Михаил Э.; Хе, Ючен Р.; Ли, Янг Джэ; Чен, Тейлор Сюань-Ю; Салливан, Кэтрин Мишель; Айдин, Онур; Саиф, М. Тахер А.; Конг, Хёнджун; Собх, Нахил; Попеску, Габриэль (2020). "Фазовая визуализация с вычислительной специфичностью (PICS) для измерения изменений сухой массы в субклеточных компартментах". Nature Communications . 11 (1): 6256. arXiv : 2002.08361 . Bibcode :2020NatCo..11.6256K. doi :10.1038/s41467-020-20062-x. PMC 7721808 . PMID  33288761. S2CID  212725023. 
  9. ^ Cremer, C; Cremer, T (1978). «Соображения относительно лазерного сканирующего микроскопа с высоким разрешением и глубиной резкости» (PDF) . Microscopica Acta . 81 (1): 31–44. PMID  713859. Архивировано из оригинального (PDF) 4 марта 2016 г. . Получено 12 августа 2013 г. .
  10. ^ SW Hell, EHK Stelzer, S. Lindek, C. Cremer; Stelzer; Lindek; Cremer (1994). «Конфокальная микроскопия с увеличенной апертурой обнаружения: конфокальная микроскопия типа B 4Pi». Optics Letters . 19 (3): 222–224. Bibcode : 1994OptL...19..222H. CiteSeerX 10.1.1.501.598 . doi : 10.1364/OL.19.000222. PMID  19829598. {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  11. ^ Baarle, Kaitlin van. "Коррелятивная микроскопия: открытие миров информации с помощью флуоресценции" . Получено 16 февраля 2017 г.
  12. ^ Хаусманн, Михаэль; Шнайдер, Бернхард; Брадл, Иоахим; Кремер, Кристоф Г. (1997), "Высокоточная дистанционная микроскопия 3D-наноструктур с помощью микроскопа с пространственно-модулированным возбуждением" (PDF) , в Bigio, Irving J; Schneckenburger, Herbert; Slavik, Jan; et al. (ред.), Optical Biopsies and Microscopic Techniques II , т. 3197, стр. 217, doi :10.1117/12.297969, S2CID  49339042, архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 г. , извлечено 12 августа 2013 г.
  13. ^ Reymann, J; Baddeley, D; Gunkel, M; Lemmer, P; Stadter, W; Jegou, T; Rippe, K; Cremer, C; Birk, U (2008). "Высокоточный структурный анализ субъядерных комплексов в фиксированных и живых клетках с помощью микроскопии с пространственно-модулированным освещением (SMI)" (PDF) . Chromosome Research . 16 (3): 367–82. doi : 10.1007/s10577-008-1238-2 . PMID  18461478. S2CID  22811346. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 г. . Получено 12 августа 2013 г. .
  14. ^ Baddeley, D; Batram, C; Weiland, Y; Cremer, C; Birk, UJ (2003). "Анализ наноструктур с использованием микроскопии с пространственной модуляцией освещения" (PDF) . Nature Protocols . 2 (10): 2640–6. doi :10.1038/nprot.2007.399. PMID  17948007. S2CID  22042676.[ мертвая ссылка ]
  15. ^ Gunkel, M; Erdel, F; Rippe, K; Lemmer, P; Kaufmann, R; Hörmann, C; Amberger, R; Cremer, C (2009). "Двухцветная локализационная микроскопия клеточных наноструктур" (PDF) . Biotechnology Journal . 4 (6): 927–38. doi :10.1002/biot.200900005. PMID  19548231. S2CID  18162278. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 г. . Получено 12 августа 2013 г. .

Внешние ссылки