stringtranslate.com

Кандида аурис

Предлагаемая схема возникновения C. auris . [3]

Candida auris — это вид грибка , который растет как дрожжи . [1] Это один из немногих видов рода Candida , вызывающих кандидоз у человека. Зачастую кандидоз приобретают в больницах пациенты с ослабленным иммунитетом . C.  auris может вызывать инвазивный кандидоз ( фунгемию ), при которомпоражаются кровоток , центральная нервная система и внутренние органы . Он привлек широкое внимание из-за своей множественной лекарственной устойчивости . Лечение также осложняется тем, что его легко ошибочно принять за другие виды Candida .

Candida auris был впервые описан в 2009 году после того, как он был выделен из ушного прохода 70-летней японки в Токийской столичной гериатрической больнице в Японии. В 2011 году в Южной Корее были зарегистрированы первые случаи заболевания C.  auris . Как сообщается, это распространилось по Азии и Европе и впервые появилось в США в 2013 году. [4]

Анализ ДНК четырех различных, но устойчивых к лекарствам штаммов Candida auris указывает на эволюционное расхождение, произошедшее по крайней мере 4000 лет назад, при этом общий скачок среди четырех разновидностей к лекарственной устойчивости, возможно, связан с широким распространением противогрибковых препаратов азолового типа в сельском хозяйстве. [4] Однако объяснения его возникновения остаются спекулятивными.

Идентификация и морфология

Candida auris , впервые выявленный в 2009 году, представляет собой разновидность аскомицетового гриба рода Candida , который растет как дрожжи . [1] Его название происходит от латинского слова «ухо», auris . [5] Образует гладкие, блестящие, беловато-серые, вязкие колонии на питательной среде. Микроскопически клетки имеют эллипсоидную форму. [1]

Клиническое значение

Candida auris привлекает повышенное клиническое внимание из-за своей множественной лекарственной устойчивости . [6] [7] [4]

In vitro более 90% изолятов C.  auris устойчивы к флуконазолу [8] [9] , а диапазон 3–73% изолятов C.  auris устойчив к вориконазолу [9] [10] , в то время как другие триазолы ( позаконазол , итраконазол и изавуконазол ) проявляют лучшую активность. [8] [9] [10]  От 13% до 35% изолятов были устойчивы к амфотерицину B; [8] [10] однако большинство изолятов чувствительны к эхинокандинам . [8] [9] [10]

Лечение осложняется тем, что C.  auris легко ошибочно принять за другие виды Candida . [6] [7] [11] [12] Краткое описание его клинической значимости по состоянию на 2016 год , понятное широкой аудитории, было опубликовано Центром исследований и политики в области инфекционных заболеваний при Университете Миннесоты. [13]

Согласно работам, опубликованным с 2011 по 2016 год, смертность людей с инфекциями кровотока C.  auris (BSI) колебалась от 30 до 60%. [14] Многие из этих людей имели другие серьезные заболевания и состояния (сопутствующие заболевания), которые увеличивали риск смерти. [14] [15]

Разработка вакцины

По состоянию на февраль 2024 г. вакцины против Candida auris для человека не существует . [16] Эксперименты с вакциной NDV-3A успешно иммунизировали мышей против грибка. [17] Вакцина также улучшила защитную эффективность противогрибкового препарата микафунгина против инфекции C. auris в кровотоке мышей. [18]

Геном

Было опубликовано несколько проектов геномов , полученных в результате полногеномного секвенирования . [6] [19] C.  auris имеет размер генома 12,3–12,5 Мб с содержанием GC 44,5–44,8%. [6] [19] Было обнаружено, что геном C.  auris кодирует несколько генов семейства транспортеров ABC , главного суперсемейства посредников , что помогает объяснить его множественную лекарственную устойчивость . [6] Его геном также кодирует семейства генов, связанных с вирулентностью, такие как липазы , транспортеры олигопептидов , маннозилтрансферазы и факторы транскрипции , которые способствуют колонизации, инвазии и приобретению железа. [6] Еще одним фактором, способствующим устойчивости к противогрибковым препаратам , является наличие набора генов, которые, как известно, участвуют в формировании биопленок . [6]

Необходимы дополнительные исследования, чтобы определить, демонстрирует ли филогенетическое расхождение клонов C.  auris специфичные для региона паттерны инвазивности, вирулентности и/или лекарственной устойчивости. [20]

Эпидемиология

Географическая дифференциация

Филогенетика C. auris предполагает, что в разных географических регионах существуют различные генотипы со  значительным геномным разнообразием. [20] Для подтверждения этого вывода использовались различные аналитические методы, основанные на последовательностях. [ нужна цитата ]

Полногеномное секвенирование и анализ изолятов из Пакистана, Индии, Южной Африки, Венесуэлы, Японии и ранее секвенированных геномов C.  auris , хранящихся в архиве считывания последовательностей Национального центра биотехнологической информации [21], выявили четкое географическое распределение генотипов. [8] Были идентифицированы четыре отдельные клады , разделенные десятками тысяч однонуклеотидных полиморфизмов . [8] Распределение этих клад географически разделено на Южную Азию (Индия и Пакистан), Южную Африку, Венесуэлу и Японию с минимальным наблюдаемым внутрирегиональным генетическим разнообразием. [8]

Анализ полиморфизма длины амплифицированных фрагментов изолятов C.  auris из Великобритании, Индии, Японии, Южной Африки, Южной Кореи и Венесуэлы показал, что лондонские изоляты образовали отдельный кластер по сравнению с другими. [22]

Сравнение последовательностей рибосомальной ДНК изолятов C.  auris из Израиля, Азии, Южной Африки и Кувейта показало, что штаммы из Израиля филогенетически отличаются от штаммов из других регионов. [23] Чаттерджи и др. писал в 2015 году: «Его фактическое глобальное распространение остается неясным, поскольку современные коммерческие методы клинической диагностики ошибочно идентифицируют его как C.  haemulonii ». [6]

История

Инфекции Candida auris , мировое распространение по состоянию на 2019 г.
Карта инфекций Candida auris в США по состоянию на 2019 год

Candida auris был впервые описан в 2009 году после того, как он был выделен из ушного прохода 70-летней японки в Токийской столичной гериатрической больнице в Японии. [1] Он был выделен на основе его способности расти в присутствии фунгицида микафунгина , фунгицида класса эхинокандинов . [1] Фенотипический, хемотаксономический и филогенетический анализ установил, что C.  auris является новым штаммом рода Candida . [1] [24]

Первые три случая болезнетворного C.  auris были зарегистрированы в Южной Корее в 2011 году. [25] Два изолята были получены в ходе исследования 2009 года, а третий был обнаружен в хранившемся образце 1996 года. [25] Во всех трех случаях стойкая фунгемия, то есть инфекция кровотока, и двое пациентов впоследствии умерли из-за осложнений. [25] Примечательно, что изоляты изначально были ошибочно идентифицированы как Candida haemulonii и Rhodotorula Glutinis с использованием стандартных методов, пока анализ последовательности не идентифицировал их правильно как C.  auris . [25] Эти первые случаи подчеркивают важность точной идентификации видов и своевременного применения правильных противогрибковых средств для эффективного лечения кандидоза, вызванного C.  auris . [25]

В течение 2009–2011 гг. 12 изолятов C.  auris были получены от пациентов в двух больницах Дели, Индия. [26] Один и тот же генотип был обнаружен в различных учреждениях: отделениях интенсивной терапии, хирургических, медицинских, онкологических, неонатальных и педиатрических отделениях, которые были взаимоисключающими по отношению к медицинскому персоналу. [26] У большинства из них была стойкая кандидемия и наблюдался высокий уровень смертности. [26] Однако все изоляты принадлежали к одному и тому же клональному штамму и были идентифицированы только положительно с помощью анализа последовательности ДНК. [26] Как и ранее, штамм был ошибочно идентифицирован с помощью установленных диагностических лабораторных тестов. [26] В 2013 году индийские исследователи написали, что C.  auris встречается гораздо чаще, чем указано в опубликованных отчетах, поскольку большинство диагностических лабораторий не используют методы, основанные на секвенировании, для идентификации штаммов. [26]

Гриб распространился на другие континенты, и в конечном итоге в начале 2016 года в странах Юго-Восточной Азии был обнаружен штамм с множественной лекарственной устойчивостью. [27]

Первое сообщение о вспышке C.  auris в Европе поступило в октябре 2016 года в Королевской больнице Бромптона , лондонской кардиоторакальной больнице. [22] В апреле 2017 года директор CDC Энн Шучат назвала это «катастрофической угрозой». [28] По состоянию на май 2017 года CDC сообщил о 77 случаях заболевания в США. Из них 69 были взяты из образцов, собранных в Нью-Йорке и Нью-Джерси. [29]

По данным CDC , по состоянию на 31 августа 2019 года число случаев заражения C.  auris в США возросло до 806, из них 388 зарегистрировано в Нью-Йорке, 137 в Нью-Джерси и 227 в Иллинойсе. [4] [30]

С тех пор, как вирус впервые был обнаружен в Соединенном Королевстве, он распространился на более чем 20 больниц NHS Trust и заразил 200 человек. [31]

По состоянию на апрель 2019 года CDC зарегистрировал случаи C.  auris в следующих странах: Австралия, Австрия, Бельгия, Канада, Китай, Колумбия, Франция, Германия, Индия, Иран, Израиль, Япония, Кения, Кувейт, Малайзия, Мексика. , Нидерланды, Норвегия, Оман, Пакистан, Панама, Россия, Саудовская Аравия, Сингапур, Южная Африка, Южная Корея, Испания, Швейцария, Тайвань, Таиланд, Объединенные Арабские Эмираты, Великобритания, США и Венесуэла. [30]

Грибок Candida auris ( C. auris ) — это грибковая инфекция с множественной лекарственной устойчивостью, которая распространяется в больницах и чрезвычайно смертельна: от нее умирает каждый третий заболевший.

—Эбби Хэгладж из Yahoo! Образ жизни , [32] со ссылкой на Центры по контролю и профилактике заболеваний [33]

Артуро Касадевалл, доктор медицинских наук, заведующий кафедрой молекулярной микробиологии и иммунологии в Школе общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, заявил:

Это исследование предполагает, что это начало адаптации грибов к более высоким температурам, и в течение столетия у нас будет все больше и больше проблем. Глобальное потепление приведет к отбору грибковых линий, более устойчивых к термическим воздействиям. [32]

Пандемия COVID-19 отняла ресурсы у борьбы с грибком и его отслеживания, что привело к вспышкам. [34] Нехватка средств индивидуальной защиты вынудила медицинский персонал повторно использовать халаты и маски во время пандемии, что способствовало распространению грибков. [34] В 2021 году CDC выявил штаммы Candida auris , которые были невосприимчивы ко всем существующим лекарствам, используемым для лечения грибковых инфекций. [35] Исследование, опубликованное в журнале Annals of Internal Medicine, отслеживающее распространение Candida auris с 2019 по 2021 год, показало, что грибок присутствовал более чем в половине американских штатов. [36] [37] [38]

Контекст

В целом устойчивость к противомикробным препаратам становится все более распространенным явлением. Сообщалось, что в 2010 году в США два миллиона человек заразились устойчивыми инфекциями, из них 23 000 — со смертельным исходом. [A] «[M]по недавним оценкам исследователей из Медицинской школы Вашингтонского университета , число погибших составляет 162 000. Число смертей во всем мире от резистентных инфекций оценивается в 700 000 в год. [4] [39] C. auris является одним из многие микроорганизмы вносят вклад в эту глобальную оценку УПП [39] .

Смотрите также

Рекомендации

Примечания

  1. ^ По официальным оценкам Центра по контролю заболеваний . [4]

Цитаты

  1. ^ abcdefg Сато К., Макимура К., Хасуми Ю., Нисияма Ю., Учида К., Ямагути Х. (январь 2009 г.). «Candida auris sp. nov., новые аскомицетовые дрожжи, выделенные из наружного слухового прохода стационарного пациента японской больницы». Микробиология и иммунология . 53 (1): 41–4. дои : 10.1111/j.1348-0421.2008.00083.x . ПМИД  19161556.
  2. ^ "Кандида ушной". ДСМЗ – Немецкая коллекция микроорганизмов и клеточных культур . Проверено 1 августа 2017 г.
  3. ^ Casadevall A, Kontoyiannis DP , Роберт V (июль 2019 г.). «О появлении Candida auris: изменение климата, азолы, болота и птицы». мБио . 10 (4): e01397–19. дои : 10.1128/mBio.01397-19 . ПМК 6650554 . ПМИД  31337723. 
  4. ^ abcdef Richtel M , Джейкобс А (6 апреля 2019 г.). «Таинственная инфекция, охватывающая весь земной шар в атмосфере секретности». Нью-Йорк Таймс . ISSN  0362-4331 . Проверено 7 апреля 2019 г. C. auris настолько живуч, отчасти потому, что он невосприимчив к основным противогрибковым препаратам, что делает его новым примером одной из самых трудноразрешимых угроз здоровью в мире: роста инфекций, устойчивых к лекарствам.
  5. ^ «Вопросы и ответы Candida auris» . Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC). 4 ноября 2016 г. Архивировано из оригинала 2 января 2017 г. . Проверено 1 января 2017 г.
  6. ^ abcdefgh Чаттерджи С., Алампалли С.В., Нагешан Р.К., Четтиар С.Т., Джоши С., Тату США (сентябрь 2015 г.). «Проект генома часто неправильно диагностируемого патогена Candida auris с множественной лекарственной устойчивостью». БМК Геномика . 16 (1): 686. doi : 10.1186/s12864-015-1863-z . ПМЦ 4562351 . ПМИД  26346253. 
  7. ^ ab «Идентификация Candida auris». Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC) . Проверено 1 апреля 2017 г.
  8. ^ abcdefg Локхарт С.Р., Этьен К.А., Валлабханени С., Фаруки Дж., Чоудхари А., Говендер Н.П. и др. (январь 2017 г.). «Одновременное появление множественной лекарственной устойчивости Candida auris на трех континентах, подтвержденное полногеномным секвенированием и эпидемиологическим анализом». Клинические инфекционные болезни . 64 (2): 134–140. doi : 10.1093/cid/ciw691. ПМК 5215215 . ПМИД  27988485. 
  9. ^ abcd Чоудхари А., Анил Кумар В., Шарма С., Пракаш А., Агарвал К., Бабу Р. и др. (июнь 2014 г.). «Эндемический клональный штамм Candida auris с множественной лекарственной устойчивостью в Индии». Европейский журнал клинической микробиологии и инфекционных заболеваний . 33 (6): 919–26. дои : 10.1007/s10096-013-2027-1. PMID  24357342. S2CID  14873835.
  10. ^ abcd Рудрамурти С.М., Чакрабарти А., Пол Р.А., Суд П., Каур Х., Капур М.Р. и др. (июнь 2017 г.). «Кандидемия Candida auris в отделениях интенсивной терапии Индии: анализ факторов риска». Журнал антимикробной химиотерапии . 72 (6): 1794–1801. дои : 10.1093/jac/dkx034 . ПМИД  28333181.
  11. ^ «Клиническое предупреждение для медицинских учреждений США - июнь 2016 г.» . Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC). 27 июня 2019 г. Проверено 2 июля 2019 г.
  12. ^ «Клинические новости Candida auris - сентябрь 2017 г.» . Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC). 27 июня 2019 г. Проверено 2 июля 2019 г.
  13. ↑ Далл С. (29 июня 2016 г.). «CDC выпускает предупреждение о дрожжевой инфекции с множественной лекарственной устойчивостью». Новости CIDRAP.
  14. ^ аб Спивак Э.С., Хансон К.Э. (февраль 2018 г.). Крафт CS (ред.). «Candida auris: новый грибковый патоген». Журнал клинической микробиологии . 56 (2): e01588–17. дои : 10.1128/JCM.01588-17. ПМК 5786713 . ПМИД  29167291. 
  15. ^ Чакрабарти А., Суд П., Рудрамурти С.М., Чен С., Каур Х., Капур М. и др. (февраль 2015 г.). «Заболеваемость, характеристики и исход кандидемии, приобретенной в отделении интенсивной терапии, в Индии». Интенсивная медицина . 41 (2): 285–95. дои : 10.1007/s00134-014-3603-2. PMID  25510301. S2CID  10471076.
  16. ^ "Кандида Аурис". Департамент общественного здравоохранения Филадельфии. 8 августа 2022 г. Проверено 21 марта 2023 г.
  17. ↑ Харпер, Рэйчел (7 августа 2019 г.). «Важный шаг на пути к разработке вакцины Candida auris». (Европейский фармацевтический обзор) . Архивировано из оригинала 7 августа 2019 года . Проверено 1 февраля 2021 г.
  18. ^ Сингх, Шакти; Уппулури, Прия; Мамуэй, Зейнаб; Алькарихи, Абдулла; Эльхассан, Хана; Френч, Сэмюэл; Локхарт, Шон Р.; Чиллер, Том; Эдвардс, Джон Э.; Ибрагим, Ашраф С. (август 2019 г.). «Вакцина NDV-3A защищает мышей от инфекции Candida auris с множественной лекарственной устойчивостью». ПЛОС Патогены . 15 (8): e1007460. дои : 10.1371/journal.ppat.1007460 . ISSN  1553-7374. ПМК 6695204 . ПМИД  31381597. 
  19. ^ Аб Шарма С., Кумар Н., Мейс Дж. Ф., Панди Р., Чоудхари А. (июль 2015 г.). «Проект геномной последовательности устойчивого к флуконазолу штамма Candida auris от пациента с кандидемией в Индии». Геномные объявления . 3 (4): e00722–15. doi :10.1128/геномA.00722-15. ПМК 4505117 . ПМИД  26184929. 
  20. ^ аб Бен-Ами Р., Берман Дж., Новиков А., Баш Э., Шачор-Мейухас Ю., Закин С. и др. (февраль 2017 г.). «Множественная лекарственная устойчивость Candida haemulonii и C. auris, Тель-Авив, Израиль». Новые инфекционные заболевания . 23 (1): 195–203. дои : 10.3201/eid2302.161486. ПМК 5324804 . ПМИД  28098529. 
  21. ↑ Архив чтения последовательностей Национального центра биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США , получено 31 мая 2017 г.
  22. ^ Аб Шеленц С., Хаген Ф., Роудс Дж.Л., Абдолрасули А., Чоудхари А., Холл А. и др. (19 октября 2016 г.). «Candida auris в европейской больнице». Устойчивость к противомикробным препаратам и инфекционный контроль . 5:35 . дои : 10.1186/s13756-016-0132-5 . ПМК 5069812 . ПМИД  27777756. 
  23. ^ Миллер Р. (апрель 1966 г.). «Дизайн больницы». Больницы . 40 (7): 91–4. ПМИД  5324804.
  24. ^ "Кандида ушной". МикоБанк . Проверено 2 апреля 2017 г.
  25. ^ abcde Lee WG, Shin JH, Uh Y, Kang MG, Kim SH, Park KH, Jang HC (сентябрь 2011 г.). «Первые три зарегистрированных случая нозокомиальной фунгемии, вызванной Candida auris». Журнал клинической микробиологии . 49 (9): 3139–42. дои : 10.1128/JCM.00319-11. ПМК 3165631 . ПМИД  21715586. 
  26. ^ abcdef Чоудхари А., Шарма С., Дуггал С., Агарвал К., Пракаш А., Сингх ПК и др. (Октябрь 2013). «Новый клональный штамм Candida auris, Дели, Индия». Новые инфекционные заболевания . 19 (10): 1670–3. дои : 10.3201/eid1910.130393. ПМЦ 3810747 . ПМИД  24048006. 
  27. ↑ Мэрин МакКенна (7 ноября 2016 г.). «Смертельный грибок связан с четырьмя новыми смертями – что вам нужно знать». Национальная география . Национальное географическое общество . Архивировано из оригинала 2 января 2017 года . Проверено 1 января 2017 г.
  28. ↑ Блау М (21 апреля 2017 г.). «Катастрофическая угроза»: руководитель CDC опасается распространения смертельной супербактерии». Стат Новости . Проверено 23 апреля 2017 г.
  29. ^ Цай С., Уэлш Р.М., Адамс Э.Х., Чоу Н.А., Гейд Л., Берков Э.Л. и др. (май 2017 г.). «Заметки с мест: продолжающаяся передача Candida auris в медицинских учреждениях – США, июнь 2016 г. – май 2017 г.». ММВР. Еженедельный отчет о заболеваемости и смертности . 66 (19): 514–515. дои : 10.15585/mmwr.mm6619a7. ПМЦ 5657645 . ПМИД  28520710. 
  30. ^ ab «Отслеживание Candida auris». Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC). 31 августа 2019 года . Проверено 26 ноября 2019 г. .
  31. ↑ Хенк Д. (21 августа 2017 г.). «Гриб-убийца распространяется по больницам Великобритании – вот что вам нужно знать о Candida auris». Независимый . Проверено 27 августа 2017 г.
  32. ^ ab Haglage A (24 июля 2019 г.). «Новый смертоносный грибковый супербактерий беспокоит врачей — вот что вам нужно знать». Yahoo! Образ жизни . Проверено 13 ноября 2019 г. .
  33. ^ «Candida auris: устойчивый к лекарствам микроб, распространяющийся в медицинских учреждениях». Центры по контролю и профилактике заболеваний . 21 декабря 2018 года . Проверено 13 ноября 2019 г. .
  34. ^ аб Рихтель, Мэтт (27 января 2021 г.). «Все внимание сосредоточено на Covid-19, и вкрались устойчивые к лекарствам инфекции». Нью-Йорк Таймс . Проверено 28 января 2021 г.
  35. ↑ Джейкобс, Эндрю (23 июля 2021 г.). «Вспышки неизлечимых, устойчивых к лекарствам грибков распространились в 2 городах». Нью-Йорк Таймс . Проверено 24 июля 2021 г.
  36. ↑ Рихтель, Мэтт (20 марта 2023 г.). «Смертельный грибок быстро распространился во время пандемии, говорят в Центре по контролю и профилактике заболеваний» (CDC). Нью-Йорк Таймс . Проверено 21 марта 2023 г.
  37. ↑ Робосон, Дэвид (21 марта 2023 г.). «Укрепление иммунитета и улучшение благополучия в условиях противогрибковой резистентности». Улу Йога . Проверено 22 марта 2023 г.
  38. ^ Лайман, Меган; Форсберг, Кейтлин; Секстон, Д. Джозеф; Чоу, Нэнси А.; Локхарт, Шон Р.; Джексон, Брендан Р.; Чиллер, Том (21 марта 2023 г.). «Ухудшение распространения Candida auris в США, 2019–2021 годы». Анналы внутренней медицины . 176 (4): М22–3469. дои : 10.7326/M22-3469. PMID  36940442. S2CID  257632701.
  39. ^ Аб О'Нил Дж (2016). Борьба с лекарственно-устойчивыми инфекциями во всем мире: окончательный отчет и рекомендации . ОКЛК  979367942.

Внешние ссылки

Викискладе есть медиафайлы, связанные с Candida auris.