stringtranslate.com

ДНК-лигаза 3

ДНК-лигаза 3 , также ДНК-лигаза III , представляет собой фермент , который у людей кодируется геном LIG3 . [ 5] [6] LIG3 кодирует АТФ -зависимые ДНК-лигазы , которые запечатывают разрывы в фосфодиэфирном остове дуплексной ДНК .

У эукариот есть три семейства АТФ-зависимых ДНК-лигаз . [7] Эти ферменты используют один и тот же трехступенчатый механизм реакции; (i) образование ковалентного промежуточного фермента-аденилата; (ii) перенос аденилатной группы на 5'-фосфатный конец разрыва ДНК; (iii) образование фосфодиэфирной связи. В отличие от членов семейства LIG1 и LIG4 , которые встречаются почти у всех эукариот, члены семейства LIG3 распространены менее широко. [8] LIG3 кодирует несколько различных видов ДНК-лигаз с помощью альтернативной инициации трансляции и альтернативных механизмов сплайсинга , которые описаны ниже.

Структура, связывание ДНК и каталитическая активность

Эукариотические АТФ-зависимые ДНК-лигазы имеют связанную каталитическую область, которая содержит три домена: домен связывания ДНК , домен аденилирования и домен связывания олигонуклеотида / олигосахарида . Когда эти ферменты взаимодействуют с разрывом в дуплексной ДНК, эти домены окружают дуплекс ДНК, и каждый из них контактирует с ДНК. Структура каталитической области ДНК-лигазы III, комплексированной с разорванной ДНК, была определена с помощью рентгеновской кристаллографии и удивительно похожа на ту, которая образована каталитической областью человеческой ДНК-лигазы I, связанной с разорванной ДНК. [9] Уникальной особенностью ДНК-лигаз, кодируемых геном LIG3, является N-концевой цинковый палец , который напоминает два цинковых пальца на N-конце поли (АДФ-рибоза) полимеразы 1 ( PARP1 ). [10] Как и в случае с цинковыми пальцами PARP1, цинковый палец ДНК-лигазы III участвует в связывании с разрывами нитей ДНК. [10] [11] [12] В полипептиде ДНК-лигазы III цинковый палец взаимодействует с доменом связывания ДНК, образуя модуль связывания ДНК. [13] Кроме того, домен аденилирования и домен связывания олигонуклеотида/олигосахарида-складки образуют второй модуль связывания ДНК. [13] В модели складного ножа, предложенной лабораторией Элленбергера, [13] модуль домена связывания цинкового пальца и ДНК служит датчиком разрыва цепи, который связывается с одноцепочечными прерываниями ДНК независимо от природы концов разрыва цепи. Если эти разрывы лигируются, они переносятся в модуль домена связывания аденилирования-олигонуклеотида/олигосахарида-складки, который специфически связывается с лигируемыми надрезами. По сравнению с ДНК-лигазами I и IV, ДНК-лигаза III является наиболее активным ферментом в межмолекулярном соединении дуплексов ДНК. [14] Эта активность в основном зависит от цинкового пальца ДНК-лигазы III, что позволяет предположить, что два модуля связывания ДНК ДНК-лигазы III могут одновременно задействовать концы дуплексной ДНК. [9] [13]

Альтернативный сплайсинг

Альтернативные механизмы инициации трансляции и сплайсинга изменяют амино- и карбоксиконцевые последовательности, которые фланкируют каталитическую область ДНК-лигазы III. [15] [16] В альтернативном механизме сплайсинга экзон , кодирующий C-терминальный домен белка восприимчивости к раку молочной железы 1 ( BRCT ) на C-конце ДНК-лигазы III-альфа, заменяется короткой положительно заряженной последовательностью, которая действует как сигнал ядерной локализации , генерируя ДНК-лигазу III-бета. Этот альтернативно сплайсированный вариант на сегодняшний день был обнаружен только в мужских половых клетках. [16] На основании его паттерна экспрессии во время сперматогенеза, по-видимому, ДНК-лигаза IIIбета участвует в мейотической рекомбинации и/или репарации ДНК в гаплоидных сперматозоидах, но это не было окончательно продемонстрировано. Хотя внутренний ATG является предпочтительным местом для инициации трансляции в открытой рамке считывания ДНК-лигазы III , инициация трансляции также происходит в первом ATG в открытой рамке считывания, что приводит к синтезу полипептида с N-концевой митохондриальной целевой последовательностью . [15] [17] [18]

Клеточная функция

Как упоминалось выше, ДНК-лигаза III-альфа мРНК кодирует ядерные и митохондриальные версии ДНК-лигазы III-альфа. Ядерная ДНК-лигаза III-альфа существует и функционирует в стабильном комплексе с белком репарации ДНК XRCC1 . [19] [20] Эти белки взаимодействуют через свои С-концевые домены BRCT . [16] [21] XRCC1 не обладает ферментативной активностью, но вместо этого, по-видимому, действует как белок-каркас, взаимодействуя с большим количеством белков, участвующих в вырезании оснований и репарации одноцепочечных разрывов . Участие XRCC1 в этих путях согласуется с фенотипом клеток xrcc1. [19] В отличие от ядерной ДНК-лигазы III-альфа, митохондриальная ДНК- лигаза III-альфа функционирует независимо от XRCC1, который не обнаружен в митохондриях. [22] Похоже, что ядерная ДНК-лигаза III-альфа образует комплекс с XRCC1 в цитоплазме , а последующее ядерное нацеливание полученного комплекса направляется сигналом ядерной локализации XRCC1 . [23] Хотя митохондриальная ДНК-лигаза III-альфа также взаимодействует с XRCC1, вполне вероятно, что активность митохондриальной нацеливающей последовательности ДНК-лигазы III-альфа выше, чем активность сигнала ядерной локализации XRCC1, и что комплекс ДНК-лигазы III-альфа/XRCC1 нарушается, когда митохондриальная ДНК-лигаза III-альфа проходит через митохондриальную мембрану.

Поскольку ген LIG3 кодирует единственную ДНК-лигазу в митохондриях, инактивация гена LIG3 приводит к потере митохондриальной ДНК, что в свою очередь приводит к потере митохондриальной функции. [24] [25] [26] Фибробласты с инактивированным геном Lig3 могут размножаться в среде, дополненной уридином и пируватом. Однако в этих клетках отсутствует мтДНК. [27] Физиологические уровни митохондриальной ДНК-лигазы III кажутся избыточными, а клетки со 100-кратно сниженным содержанием митохондриальной ДНК-лигазы III-альфа поддерживают нормальное количество копий мтДНК. [27] Основная роль ДНК-лигазы III-альфа в метаболизме митохондриальной ДНК может быть выполнена другими ДНК-лигазами, включая НАД-зависимую ДНК-лигазу E. coli , если они нацелены на митохондрии. [24] [26] Таким образом, могут быть получены жизнеспособные клетки, в которых отсутствует ядерная ДНК-лигаза III-альфа. Хотя ДНК-лигаза I является преобладающим ферментом, который присоединяет фрагменты Оказаки во время репликации ДНК, теперь очевидно, что комплекс ДНК-лигазы III-альфа/XRCC1 позволяет клеткам, в которых либо отсутствует, либо снижена активность ДНК-лигазы I, завершить репликацию ДНК. [24] [26] [28] [29] Учитывая биохимические и клеточные биологические исследования, связывающие комплекс ДНК-лигазы III-альфа/XRCC1 с эксцизионной репарацией и репарацией одноцепочечных разрывов ДНК, [30] [31] [32] было удивительно, что клетки, лишенные ядерной ДНК-лигазы III-альфа, не проявляли значительно повышенной чувствительности к повреждающему ДНК агенту. [24] [26] Эти исследования предполагают, что существует значительная функциональная избыточность между ДНК-лигазой I и ДНК-лигазой III-альфа в этих путях репарации ядерной ДНК. В клетках млекопитающих большинство двухцепочечных разрывов ДНК восстанавливаются с помощью негомологичного соединения концов, зависящего от ДНК-лигазы IV ( NHEJ ). [33] ДНК-лигаза III-альфа участвует в небольшом альтернативном пути NHEJ, который генерирует хромосомные транслокации . [34] [35] В отличие от других функций репарации ядерной ДНК, роль ДНК-лигазы III-альфа в альтернативном NHEJ, по-видимому, не зависит от XRCC1. [36]

Клиническое значение

В отличие от генов LIG1 и LIG4, [37] [38] [39] [40] наследственные мутации в гене LIG3 не были выявлены в популяции людей. Однако ДНК-лигаза III-альфа косвенно связана с раком и нейродегенеративными заболеваниями . При раке ДНК-лигаза III-альфа часто сверхэкспрессируется, и это служит биомаркером для идентификации клеток, которые в большей степени зависят от альтернативного пути NHEJ для восстановления двухцепочечных разрывов ДНК. [41] [42] [43] [44] Хотя повышенная активность альтернативного пути NHEJ вызывает геномную нестабильность , которая стимулирует прогрессирование заболевания, она также представляет собой новую цель для разработки терапевтических стратегий, специфичных для раковых клеток. [42] [43] Было выявлено, что несколько генов, кодирующих белки, которые напрямую взаимодействуют с ДНК-лигазой III-альфа или косвенно через взаимодействия с XRCC1, мутируют при наследственных нейродегенеративных заболеваниях. [45] [46] [47] [48] [49] Таким образом, оказывается, что ДНК-транзакции с участием ДНК-лигазы III-альфа играют важную роль в поддержании жизнеспособности нейрональных клеток .

LIG3 играет роль в микрогомологичном опосредованном соединении концов (MMEJ) для восстановления двухцепочечных разрывов. Это один из 6 ферментов, необходимых для этого подверженного ошибкам пути восстановления ДНК. [50] LIG3 повышается при хроническом миелоидном лейкозе, [44] множественной миеломе, [51] и раке молочной железы. [42]

Раковые заболевания очень часто испытывают дефицит экспрессии одного или нескольких генов репарации ДНК, но избыточная экспрессия гена репарации ДНК встречается при раке реже. Например, по крайней мере 36 ферментов репарации ДНК, когда они мутационно дефектны в клетках зародышевой линии, вызывают повышенный риск рака (наследственные раковые синдромы ). [ необходима цитата ] (Также см. Нарушение репарации ДНК с дефицитом .) Аналогичным образом, по крайней мере 12 генов репарации ДНК часто оказываются эпигенетически репрессированными при одном или нескольких видах рака. [ необходима цитата ] (См. также Эпигенетически сниженная репарация ДНК и рак .) Обычно недостаточная экспрессия фермента репарации ДНК приводит к увеличению нерепарированных повреждений ДНК, которые из-за ошибок репликации ( транслезионный синтез ) приводят к мутациям и раку. Однако репарация MMEJ , опосредованная LIG3 , крайне неточна, поэтому в этом случае избыточная экспрессия, а не недостаточная экспрессия, по-видимому, приводит к раку.

Примечания

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000005156 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020697 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ "Entrez Gene: Ligase III, DNA, ATP-dependent" . Получено 2012-03-12 .
  6. ^ Томкинсон AE, Салмир A (декабрь 2013 г.). «Структура и функция ДНК-лигаз, кодируемых геном млекопитающих LIG3». Gene . 531 (2): 150–7. doi :10.1016/j.gene.2013.08.061. PMC 3881560 . PMID  24013086. 
  7. ^ Ellenberger T, Tomkinson AE (2008). «Эукариотические ДНК-лигазы: структурные и функциональные идеи». Annu. Rev. Biochem . 77 : 313–38. doi :10.1146/annurev.biochem.77.061306.123941. PMC 2933818 . PMID  18518823. 
  8. ^ Симсек Д., Ясин М. (ноябрь 2011 г.). «ДНК-лигаза III: незначительное присутствие у эукариот, но важная функция при тестировании». Клеточный цикл . 10 (21): 3636–44. дои : 10.4161/cc.21.10.18094. ПМК 3266004 . ПМИД  22041657. 
  9. ^ ab Cotner-Gohara E, Kim IK, Hammel M, Tainer JA, Tomkinson AE, Ellenberger T (июль 2010 г.). «Человеческая ДНК-лигаза III распознает концы ДНК путем динамического переключения между двумя связанными с ДНК состояниями». Биохимия . 49 (29): 6165–76. doi :10.1021/bi100503w. PMC 2922849 . PMID  20518483. 
  10. ^ ab Mackey ZB, Niedergang C, Murcia JM, Leppard J, Au K, Chen J, de Murcia G, Tomkinson AE (июль 1999 г.). «ДНК-лигаза III привлекается к разрывам нитей ДНК мотивом цинкового пальца, гомологичным мотиву поли(АДФ-рибоза)полимеразы. Идентификация двух функционально различных областей связывания ДНК в ДНК-лигазе III». Журнал биологической химии . 274 (31): 21679–87. doi : 10.1074/jbc.274.31.21679 . PMID  10419478.
  11. ^ Leppard JB, Dong Z, Mackey ZB, Tomkinson AE (август 2003 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между ДНК-лигазой IIIальфа и поли(АДФ-рибоза)полимеразой 1 при репарации одноцепочечных разрывов ДНК». Молекулярная и клеточная биология . 23 (16): 5919–27. doi :10.1128/MCB.23.16.5919-5927.2003. PMC 166336. PMID 12897160  . 
  12. ^ Taylor RM, Whitehouse CJ, Caldecott KW (сентябрь 2000 г.). «Цинковый палец ДНК-лигазы III стимулирует связывание со вторичной структурой ДНК и способствует соединению концов». Nucleic Acids Res . 28 (18): 3558–63. doi :10.1093/nar/28.18.3558. PMC 110727. PMID  10982876 . 
  13. ^ abcd Cotner-Gohara E, Kim IK, Tomkinson AE, Ellenberger T (апрель 2008 г.). «Два модуля связывания ДНК и распознавания разрывов в ДНК-лигазе III человека». Журнал биологической химии . 283 (16): 10764–72. doi : 10.1074/jbc.M708175200 . PMC 2447648. PMID  18238776 . 
  14. ^ Chen L, Trujillo K, Sung P, Tomkinson AE (август 2000 г.). «Взаимодействие комплекса ДНК-лигазы IV-XRCC4 с концами ДНК и ДНК-зависимой протеинкиназой». Журнал биологической химии . 275 (34): 26196–205. doi : 10.1074/jbc.M000491200 . PMID  10854421.
  15. ^ ab Lakshmipathy U, Campbell C (май 1999). «Ген человеческой ДНК-лигазы III кодирует ядерные и митохондриальные белки». Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3869–76. doi :10.1128/MCB.19.5.3869. PMC 84244. PMID  10207110 . 
  16. ^ abc Mackey ZB, Ramos W, Levin DS, Walter CA, McCarrey JR, Tomkinson AE (февраль 1997 г.). «Событие альтернативного сплайсинга, которое происходит в сперматоцитах пахитены мыши, генерирует форму ДНК-лигазы III с различными биохимическими свойствами, которые могут функционировать в мейотической рекомбинации». Молекулярная и клеточная биология . 17 (2): 989–98. doi :10.1128/MCB.17.2.989. PMC 231824. PMID  9001252 . 
  17. ^ Wei YF, Robins P, Carter K, Caldecott K, Pappin DJ, Yu GL, Wang RP, Shell BK, Nash RA, Schär P (июнь 1995 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия человеческих кДНК, кодирующих новую ДНК-лигазу IV и ДНК-лигазу III, фермент, активный в репарации и рекомбинации ДНК». Молекулярная и клеточная биология . 15 (6): 3206–16. doi :10.1128/mcb.15.6.3206. PMC 230553. PMID 7760816  . 
  18. ^ Chen J, Tomkinson AE, Ramos W, Mackey ZB, Danehower S, Walter CA, Schultz RA, Besterman JM, Husain I (октябрь 1995 г.). «ДНК-лигаза III млекопитающих: молекулярное клонирование, хромосомная локализация и экспрессия в сперматоцитах, подвергающихся мейотической рекомбинации». Молекулярная и клеточная биология . 15 (10): 5412–22. doi : 10.1128/MCB.15.10.5412. PMC 230791. PMID  7565692. 
  19. ^ ab Caldecott KW, McKeown CK, Tucker JD, Ljungquist S, Thompson LH (январь 1994). "Взаимодействие между белком репарации ДНК млекопитающих XRCC1 и ДНК-лигазой III". Молекулярная и клеточная биология . 14 (1): 68–76. doi :10.1128/MCB.14.1.68. PMC 358357. PMID  8264637 . 
  20. ^ Caldecott KW, Tucker JD, Stanker LH, Thompson LH (декабрь 1995 г.). «Характеристика комплекса XRCC1-ДНК-лигаза III in vitro и его отсутствие в мутантных клетках хомяка». Nucleic Acids Res . 23 (23): 4836–43. doi :10.1093/nar/23.23.4836. PMC 307472. PMID  8532526 . 
  21. ^ Nash RA, Caldecott KW, Barnes DE, Lindahl T (апрель 1997 г.). «Белок XRCC1 взаимодействует с одной из двух различных форм ДНК-лигазы III». Биохимия . 36 (17): 5207–11. doi :10.1021/bi962281m. PMID  9136882.
  22. ^ Lakshmipathy U, Campbell C (октябрь 2000 г.). «Функция митохондриальной ДНК-лигазы III не зависит от Xrcc1». Nucleic Acids Res . 28 (20): 3880–6. doi : 10.1093/nar/28.20.3880. PMC 110795. PMID  11024166. 
  23. ^ Parsons JL, Dianova II, Finch D, Tait PS, Ström CE, Helleday T, Dianov GL (июль 2010 г.). «Фосфорилирование XRCC1 CK2 необходимо для его стабильности и эффективного восстановления ДНК». DNA Repair (Amst.) . 9 (7): 835–41. doi : 10.1016/j.dnarep.2010.04.008 . PMID  20471329.
  24. ^ abcd Gao Y, Katyal S, Lee Y, Zhao J, Rehg JE, Russell HR, McKinnon PJ (март 2011 г.). «ДНК-лигаза III имеет решающее значение для целостности мтДНК, но не для репарации ядерной ДНК, опосредованной Xrcc1». Nature . 471 (7337): 240–4. Bibcode :2011Natur.471..240G. doi :10.1038/nature09773. PMC 3079429 . PMID  21390131. 
  25. ^ Lakshmipathy U, Campbell C (февраль 2001 г.). «Антисмысловое снижение экспрессии ДНК-лигазы III приводит к снижению целостности митохондриальной ДНК». Nucleic Acids Res . 29 (3): 668–76. doi :10.1093/nar/29.3.668. PMC 30390. PMID  11160888 . 
  26. ^ abcd Симсек Д., Фурда А., Гао Ю., Артус Дж., Брюне Э., Хаджантонакис А.К., Ван Хаутен Б., Шуман С., Маккиннон П.Дж., Джасин М. (март 2011 г.). «Решающая роль ДНК-лигазы III в митохондриях, но не в Xrcc1-зависимой репарации». Природа . 471 (7337): 245–8. Бибкод : 2011Natur.471..245S. дои : 10.1038/nature09794. ПМК 3261757 . ПМИД  21390132. 
  27. ^ ab Шоколенко ИН, Файзулин РЗ, Катял С, МакКиннон ПДЖ, Алексеев МФ (13 сентября 2013 г.). «Митохондриальная ДНК-лигаза необязательна для жизнеспособности культивируемых клеток, но необходима для поддержания мтДНК». Журнал биологической химии . 288 (37): 26594–605. doi : 10.1074/jbc.M113.472977 . PMC 3772206. PMID  23884459 . 
  28. ^ Аракава Х, Беднар Т, Ван М, Пол К, Младенов Э, Бенчик-Тейлен АА, Илиакис Г (март 2012). «Функциональная избыточность между ДНК-лигазами I и III при репликации ДНК в клетках позвоночных». Nucleic Acids Research . 40 (6): 2599–610. doi :10.1093/nar/gkr1024. PMC 3315315. PMID  22127868 . 
  29. ^ Le Chalony C, Hoffschir F, Gauthier LR, Gross J, Biard DS, Boussin FD, Pennaneach V (сентябрь 2012 г.). «Частичная комплементация дефицита ДНК-лигазы I ДНК-лигазой III и ее влияние на выживаемость клеток и стабильность теломер в клетках млекопитающих». Cellular and Molecular Life Sciences . 69 (17): 2933–49. doi :10.1007/s00018-012-0975-8. PMC 3417097 . PMID  22460582. 
  30. ^ Каппелли Э., Тейлор Р., Кеваско М., Аббондандоло А., Калдекотт К., Фросина Г. (сентябрь 1997 г.). «Участие продуктов генов XRCC1 и ДНК-лигазы III в эксцизионной репарации оснований ДНК». Журнал биологической химии . 272 (38): 23970–5. дои : 10.1074/jbc.272.38.23970 . ПМИД  9295348.
  31. ^ Okano S, Lan L, Tomkinson AE, Yasui A (2005). «Транслокация XRCC1 и ДНК-лигазы III-альфа из центросом в хромосомы в ответ на повреждение ДНК в митотических клетках человека». Nucleic Acids Res . 33 (1): 422–9. doi :10.1093/nar/gki190. PMC 546168. PMID  15653642 . 
  32. ^ Kubota Y, Nash RA, Klungland A, Schär P, Barnes DE, Lindahl T (декабрь 1996 г.). «Восстановление эксцизионной репарации оснований ДНК с помощью очищенных белков человека: взаимодействие между ДНК-полимеразой бета и белком XRCC1». EMBO Journal . 15 (23): 6662–70. doi :10.1002/j.1460-2075.1996.tb01056.x. PMC 452490. PMID  8978692 . 
  33. ^ Lieber MR (2010). «Механизм восстановления двухцепочечных разрывов ДНК путем негомологичного соединения концов ДНК». Annu. Rev. Biochem . 79 : 181–211. doi :10.1146/annurev.biochem.052308.093131. PMC 3079308. PMID  20192759 . 
  34. ^ Wang H, Rosidi B, Perrault R, Wang M, Zhang L, Windhofer F, Iliakis G (май 2005 г.). «ДНК-лигаза III как кандидат на компонент резервных путей негомологичного соединения концов». Cancer Res . 65 (10): 4020–30. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-04-3055 . PMID  15899791.
  35. ^ Simsek D, Brunet E, Wong SY, Katyal S, Gao Y, McKinnon PJ, Lou J, Zhang L, Li J, Rebar EJ, Gregory PD, Holmes MC, Jasin M (июнь 2011 г.). Haber JE (ред.). «ДНК-лигаза III способствует альтернативному негомологичному соединению концов во время формирования хромосомной транслокации». PLOS Genet . 7 (6): e1002080. doi : 10.1371/journal.pgen.1002080 . PMC 3107202. PMID  21655080 . 
  36. ^ Бобойла C, Оксених V, Гостисса M, Ван JH, Чжа S, Чжан Y, Чай H, Ли CS, Янкович M, Саез LM, Нуссенцвейг MC, МакКиннон PJ, Альт FW, Швер B (февраль 2012 г.). "Надежная репарация хромосомной ДНК с помощью альтернативного соединения концов в отсутствие перекрестно-комплементирующего белка 1 репарации рентгеновских лучей (XRCC1)". Труды Национальной академии наук США . 109 (7): 2473–8. Bibcode : 2012PNAS..109.2473B. doi : 10.1073/pnas.1121470109 . PMC 3289296. PMID  22308491 . 
  37. ^ Girard PM, Kysela B, Härer CJ, Doherty AJ, Jeggo PA (октябрь 2004 г.). «Анализ мутаций ДНК-лигазы IV, обнаруженных у пациентов с синдромом LIG4: влияние двух связанных полиморфизмов». Human Molecular Genetics . 13 (20): 2369–76. doi : 10.1093/hmg/ddh274 . PMID  15333585.
  38. ^ О'Дрисколл М., Черосалетти К.М., Жирар П.М., Дай Ю., Штумм М., Кисела Б., Хирш Б., Дженнери А., Палмер С.Е., Зайдель Дж., Гатти Р.А., Варон Р., Эттингер М.А., Нейтцель Х., Джегго П.А., Конканнон П. (декабрь 2001 г.). «Мутации ДНК-лигазы IV, выявленные у пациентов с задержкой развития и иммунодефицитом». Молекулярная клетка . 8 (6): 1175–85. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00408-7 . ПМИД  11779494.
  39. ^ Riballo E, Critchlow SE, Teo SH, Doherty AJ, Priestley A, Broughton B, Kysela B, Beamish H, Plowman N, Arlett CF, Lehmann AR, Jackson SP, Jeggo PA (июль 1999 г.). «Идентификация дефекта ДНК-лигазы IV у радиочувствительного пациента с лейкемией». Curr. Biol . 9 (13): 699–702. Bibcode : 1999CBio....9..699R. doi : 10.1016/S0960-9822(99)80311-X . PMID  10395545. S2CID  17103936.
  40. ^ Barnes DE, Tomkinson AE, Lehmann AR, Webster AD, Lindahl T (май 1992). «Мутации в гене ДНК-лигазы I у человека с иммунодефицитами и клеточной гиперчувствительностью к агентам, повреждающим ДНК». Cell . 69 (3): 495–503. doi :10.1016/0092-8674(92)90450-Q. PMID  1581963. S2CID  11736507.
  41. ^ Chen X, Zhong S, Zhu X, Dziegielewska B, Ellenberger T, Wilson GM, MacKerell AD, Tomkinson AE (май 2008 г.). «Рациональный дизайн ингибиторов человеческой ДНК-лигазы, нацеленных на репликацию и восстановление клеточной ДНК». Cancer Res . 68 (9): 3169–77. doi :10.1158/0008-5472.CAN-07-6636. PMC 2734474. PMID  18451142 . 
  42. ^ abc Tobin LA, Robert C, Nagaria P, Chumsri S, Twaddell W, Ioffe OB, Greco GE, Brodie AH, Tomkinson AE, Rassool FV (2012). «Нацеливание на аномальное восстановление ДНК при резистентном к терапии раке груди». Molecular Cancer Research . 10 (1): 96–107. doi :10.1158/1541-7786.MCR-11-0255. PMC 3319138. PMID  22112941 . 
  43. ^ ab Tobin LA, Robert C, Rapoport AP, Gojo I, Baer MR, Tomkinson AE, Rassool FV (апрель 2013 г.). «Нацеливание на аномальное восстановление двухцепочечных разрывов ДНК при хронических миелоидных лейкозах, устойчивых к ингибиторам тирозинкиназы». Oncogene . 32 (14): 1784–93. doi :10.1038/onc.2012.203. PMC 3752989 . PMID  22641215. 
  44. ^ ab Sallmyr A, Tomkinson AE, Rassool FV (август 2008 г.). «Повышенная регуляция WRN и ДНК-лигазы III-альфа при хроническом миелоидном лейкозе: последствия для восстановления двухцепочечных разрывов ДНК». Blood . 112 (4): 1413–23. doi :10.1182/blood-2007-07-104257. PMC 2967309 . PMID  18524993. 
  45. ^ Ahel I, Rass U, El-Khamisy SF, Katyal S, Clements PM, McKinnon PJ, Caldecott KW, West SC (октябрь 2006 г.). «Белок нейродегенеративных заболеваний апратаксин устраняет промежуточные продукты абортивной лигации ДНК». Nature . 443 (7112): 713–6. Bibcode :2006Natur.443..713A. doi :10.1038/nature05164. PMID  16964241. S2CID  4431045.
  46. ^ Дата Ч, Онодера О, Танака Х, Ивабути К, Уэкава К, Игараси С, Койке Р, Хирои Т, Юаса Т, Авайя Ю, Сакаи Т, Такахаши Т, Нагатомо Х, Секидзима Ю, Кавачи I, Такаяма Ю, Нисидзава М., Фукухара Н., Сайто К., Сугано С., Цудзи С. (октябрь 2001 г.). «Ранняя атаксия с глазной моторной апраксией и гипоальбуминемией вызвана мутациями в новом гене суперсемейства HIT». Природная генетика . 29 (2): 184–8. дои : 10.1038/ng1001-184. PMID  11586299. S2CID  25665707.
  47. ^ Морейра MC, Барбот С, Тати Н, Кодзука Н, Учида Э, Гибсон Т, Мендонса П, Коста М, Баррос Дж, Янагисава Т, Ватанабэ М, Икеда Ю, Аоки М, Нагата Т, Коутиньо П, Секейрос Дж, Кениг М (октябрь 2001 г.). «Ген, мутировавший при атаксии-глазной апраксии 1, кодирует новый белок HIT/Zn-пальцевый апратаксин». Природная генетика . 29 (2): 189–93. дои : 10.1038/ng1001-189. PMID  11586300. S2CID  23001321.
  48. ^ El-Khamisy SF, Saifi GM, Weinfeld M, Johansson F, Helleday T, Lupski JR, Caldecott KW (март 2005 г.). «Дефектное восстановление одноцепочечных разрывов ДНК при спиноцеребеллярной атаксии с аксональной нейропатией-1». Nature . 434 (7029): 108–13. Bibcode :2005Natur.434..108E. doi :10.1038/nature03314. PMID  15744309. S2CID  4423748.
  49. ^ Shen J, Gilmore EC, Marshall CA, Haddadin M, Reynolds JJ, Eyaid W, Bodell A, Barry B, Gleason D, Allen K, Ganesh VS, Chang BS, Grix A, Hill RS, Topcu M, Caldecott KW, Barkovich AJ, Walsh CA (март 2010 г.). «Мутации в PNKP вызывают микроцефалию, судороги и дефекты репарации ДНК». Nature Genetics . 42 (3): 245–9. doi :10.1038/ng.526. PMC 2835984 . PMID  20118933. 
  50. ^ Sharma S, Javadekar SM, Pandey M, Srivastava M, Kumari R, Raghavan SC (2015). "Гомология и ферментативные требования к альтернативному соединению концов, зависящему от микрогомологии". Cell Death Dis . 6 (3): e1697. doi :10.1038/cddis.2015.58. PMC 4385936. PMID  25789972 . 
  51. ^ Herrero AB, San Miguel J, Gutierrez NC (2015). «Дерегуляция репарации двухцепочечных разрывов ДНК при множественной миеломе: последствия для стабильности генома». PLOS ONE . 10 (3): e0121581. Bibcode : 2015PLoSO..1021581H. doi : 10.1371/journal.pone.0121581 . PMC 4366222. PMID  25790254 . 

Внешние ссылки