stringtranslate.com

Гаплогруппа E-M2

Гаплогруппа E-M2 , также известная как E1b1a1-M2 , является гаплогруппой ДНК Y-хромосомы человека . E-M2 в основном распространена в Африке, за которой следует Западная Азия. Более конкретно, E-M2 является преобладающим субкладом в Западной Африке, Центральной Африке, Южной Африке и регионе Великих африканских озер; она также встречается с умеренной частотой в Северной Африке и на Ближнем Востоке. E-M2 имеет несколько субкладов, но многие из этих субгаплогрупп включены либо в E-L485, либо в E-U175. E-M2 особенно распространена среди коренных африканцев, говорящих на языках нигеро-конголезской группы , и была распространена в Южной Африке и Восточной Африке через экспансию банту .

Происхождение

Открытие двух SNP (V38 и V100) Тромбеттой и др. (2011) значительно переопределило филогенетическое дерево E-V38. Это привело авторов к предположению, что E-V38 мог возникнуть в Восточной Африке. E-V38 присоединяется к E-M2, связанному с Западной Африкой, и E-M329, связанному с Северо-Восточной Африкой, с более ранним общим предком, который, как и E-P2, также мог возникнуть в Восточной Африке. [5] Нижестоящий SNP E-M180 мог возникнуть во влажной сахарской саванне/пастбищах Северной Африки между 14 000 и 10 000 лет назад. [6] [7] [8] [9] Согласно Вуду и др. (2005) и Розе и др. (2007), такие перемещения населения изменили ранее существовавшее разнообразие хромосом Y населения в Центральной, Южной и Юго-Восточной Африке, заменив предыдущие частоты гаплогрупп в этих областях на ныне доминирующие линии E1b1a1. Однако следы более ранних жителей можно наблюдать сегодня в этих регионах по наличию гаплогрупп Y ДНК A1a , A1b, A2, A3 и B-M60, которые распространены в определенных популяциях, таких как мбути и койсаны . [10] [11] [12] Шрайнер и др. (2018) аналогичным образом предполагают, что гаплогруппа E1b1a-V38 мигрировала через Зеленую Сахару с востока на запад около 19 000 лет назад, где E1b1a1-M2, возможно, впоследствии возникла в Западной Африке или Центральной Африке. Шрайнер и др. (2018) также прослеживает эту миграцию через мутацию серповидноклеточной анемии , которая, вероятно, возникла в период Зеленой Сахары . [4]

Древняя ДНК

В Африке

Ботсвана

В Ксаро, в Ботсване, было два человека, датируемых ранним железным веком (1400 г. до н.э.); один из них имел гаплогруппы E1b1a1a1c1a и L3e1a2 , а другой имел гаплогруппы E1b1b1b2b (E-M293, E-CTS10880) и L0k1a2 . [13] [14]

В Таукоме, в Ботсване, человек, датируемый ранним железным веком (1100 г. до н.э.), был носителем гаплогрупп E1b1a1 (E-M2, E-Z1123) и L0d3b1 . [13] [14]

Демократическая Республика Конго

В Киндоки, в Демократической Республике Конго, было три человека, датируемых доисторическим периодом (230 BP, 150 BP, 230 BP); один из них имел гаплогруппы E1b1a1a1d1a2 (E-CTS99, E-CTS99) и L1c3a1b , другой имел гаплогруппу E (E-M96, E-PF1620) , а последний имел гаплогруппы R1b1 (R-P25 1, R-M415) и L0a1b1a1 . [13] [14]

Египет

Хавасс и др. (2012) определили, что древнеегипетская мумия неизвестного мужчины, похороненного с Рамсесом III, была, из-за доказанной генетической связи и процесса мумификации, который предполагал наказание, хорошим кандидатом на сына фараона, Пентаверета, который был единственным сыном, восставшим против своего отца. [15] Определить причину его смерти было невозможно. [15] Используя предиктор гаплогруппы Уита Атея, основанный на значениях Y- STR , обе мумии были предсказаны совпадающими с хромосомной гаплогруппой Y E1b1a1-M2 и 50% их генетического материала, что указывало на связь отца и сына. [15] Гад и др. (2021) указывают, что Рамсес III и Неизвестный человек E, возможно, Пентаверет , несли гаплогруппу E1b1a . [16]

Кения

На ферме Делорейн в округе Накуру, Кения , металлург железного века был носителем гаплогрупп E1b1a1a1a1a/E-M58 и L5b1 . [17] [18]

В Ламу , на острове Пате , в Фазе , в Кении, человек, датируемый периодом между 1500 и 1700 годами н.э., имел гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a и L3e3a . [19]

В Таита Тавета , Маквасиньи, в Кении, человек, датируемый периодом между 1650 и 1950 годами нашей эры, имел гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a и L4b2a . [19]

В Таита Тавета, Маквасиньи, в Кении, человек, датируемый периодом между 1650 и 1950 годами н.э., имел гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a3b1d1c и L1c3b1a . [19]

В Таита Тавета, Маквасиньи, в Кении, человек, датируемый периодом между 1650 и 1950 годами н. э., был носителем гаплогрупп E1b1a1a1a2a1a и L2a1+143 . [19]

В Таита Тавета, Маквасиньи, в Кении, человек, датируемый периодом между 1667 и 1843 гг. н. э., имел гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a3b1d1c и L2a1+143 . [19]

В Таита Тавета, Маквасиньи, в Кении, человек, датируемый периодом между 1709 и 1927 гг. н. э., имел гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a3a1d~ и L3a2 . [19]

Танзания

В Сонго Мнара , в Танзании, человек, датируемый периодом между 1418 и 1450 гг. н.э., был носителем гаплогрупп E1b1a1~ и L3e2b . [19]

В Линди, в Танзании, человек, датируемый периодом между 1511 и 1664 гг. н.э., имел гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a3a1d~ и L0a1a2 . [19]

За пределами Африки

Франция

В Пон-сюр-Сен , во Франции, мужчина, датируемый средним неолитом , имел гаплогруппы E1b1a1a1a1c2c и U5b1-16189-@16192 . [20]

Мексика

В месте захоронения в Королевском госпитале Сан-Хосе-де-лос-Натуралес в Мехико, Мексика , были обнаружены три раба из Западной Африки западноафриканского и южноафриканского происхождения , датированные периодом между 1453 и 1626 гг. н. э., 1450 и 1620 гг. н. э. и 1436 и 1472 гг. н. э.; один из них имел гаплогруппы E1b1a1a1c1b/E-M263.2 и L1b2a , другой имел гаплогруппы E1b1a1a1d1/E-P278.1/E-M425 и L3d1a1a , а последний имел гаплогруппы E1b1a1a1c1a1c/E-CTS8030 и L3e1a1a . [21] Аллели человеческого лейкоцитарного антигена дополнительно подтверждают, что эти люди были африканского происхождения к югу от Сахары . [22]

Португалия

В Кабесу-да-Аморейра, в Португалии, среди куч ракушек между XVI и XVIII веками нашей эры был похоронен раб из Западной Африки, который, возможно, был родом из прибрежного региона Сенегамбии в Гамбии, Мавритании или Сенегале и являлся носителем гаплогрупп E1b1a и L3b1a . [23]

Святая Елена

На острове Святой Елены 20 освобожденных африканцев, [24] [25], которые датируются 19 веком н. э., [24] также имели западное центральноафриканское [24] [26] [27] происхождение (например, народы банту Габона и Анголы ). [24] Одна женщина была носителем гаплогруппы L1b1a10b . [28 ] Одна женщина была носителем гаплогруппы L2a1f . [28] Одна женщина была носителем гаплогруппы L2a1a3c . [28] Один мужчина был носителем гаплогрупп E1b1a1a1a2a1a3b1d и L1c3a . [28] Один мужчина был носителем гаплогрупп E1b1a1a1a1c1a1a и L0a1b2a . [28] Один мужчина носил гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a3b1a2a2 и L0a1e . [ 28] Один мужчина носил гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a3b1 и L2a1f1 . [28 ] Один мужчина носил гаплогруппы E1b1a1 и L3 . [28] Один мужчина носил гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a3b1d и L3e1e . [28 ] Один мужчина носил гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a3a1d и L3e3b2 . [28] Один мужчина носил гаплогруппы E1b1a1a1a1c1a1a3 и L3e1a3a . [28] Один мужчина носил гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a3b1a2a2 и L2b1a . [ 28] Один мужчина носил гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a3b1 и L3f1b1a . [28 ] Один мужчина носил гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a3b1d1c1a и L3d3a1 . [28] Один мужчина носил гаплогруппы B2a1a1a1 и L3e2b1 . [28] Один мужчина носил гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a3b1d1c1a и L2a1f . [28] Один мужчина носил гаплогруппы E1b1a1a1a1c1a1a3a1c1 и L3e1d1a . [28] Один мужчина был носителем гаплогрупп E1b1a1a1a2a1a3a1d и L1b1a10 . [28] Один мужчина был носителем гаплогрупп E1b1a1a1a1c1a1a3a1c и L2a1f1 . [28] Один мужчина был носителем гаплогрупп E1b1a1a1a1c1a1 и L2b1a . [28] Порабощенный афроамериканец иженщина из захоронения на Энсон-стрит XVIII века н. э. в Чарльстоне, Южная Каролина , которая имела гаплогруппу L3e1e , разделяла эту гаплогруппу с освобожденными африканцами на острове Святой Елены. [29] На основе данных о тех, кто присутствовал среди порабощенных африканцев, соотношение мужчин и женщин подтверждает вывод о наличии сильного смещения отбора в пользу мужчин в последний период трансатлантической работорговли . [24] [30] [31] Следовательно, благодаря этому исследованию освобожденных африканцев на острове Святой Елены, среди других исследований, были получены более глубокие генетические знания о трансатлантической работорговле и ее влиянии на демографию Африки . [32]

Испания

В Гранаде мусульманин ( мавр ) из Кордовского халифата [33] , имевший гаплогруппы E1b1a1 и H1+16189 [ 34] [35] , а также предположительно датируемый периодом между 900 и 1000 гг. н. э., и мориск [33] , имевший гаплогруппу L2e1 [34] [ 35] , а также предположительно датируемый периодом между 1500 и 1600 гг. н. э., оба оказались западноафриканского (т. е. гамбийского ) и иберийского происхождения. [33]

Соединенные Штаты Америки

В Avery's Rest , в Чесапике , штат Делавэр, 3 из 11 человек были афроамериканцами, чей возраст датировался между 1675 и 1725 годами н. э.; один имел западноафриканское происхождение и был носителем гаплогрупп E1b1a-CTS2447 и L3e3b , другой имел западно-центральноафриканское бантуязычное происхождение и был носителем E1b1a-Z5974 и L0a1a2 , а еще один имел западно-африканское и восточно-африканское происхождение и был носителем E1b1a-Z5974 и L3d2 . [36]

На афроамериканском кладбище Катоктин-Фернес в Катоктин-Фернес , штат Мэриленд, были найдены останки 27 афроамериканцев, возраст которых датируется периодом между 1774 и 1850 годами н. э. [37] [38] Один мужчина, на 98,14% имевший африканское происхождение к югу от Сахары, являлся носителем гаплогрупп E1b1a1a1a1c2c и L2a1+143+@16309 . [39] Один мужчина, на 83,73% имевший африканское происхождение к югу от Сахары и на 7,74% европейское происхождение, являлся носителем гаплогрупп E1b1a1a1a1c1b1 и L3e2a1b1 . [ 39 ] Один мужчина, который на 84,94% был африканцем южнее Сахары и на 9,45% европейцем, нес гаплогруппы E1b1a1a1a2a1a и L2a1+143+16189 (16192)+@16309 . [39] Один мужчина, который на 87,83% был африканцем южнее Сахары и на 8,23% европейцем, нес гаплогруппы E1b1a1a1a1c1a1a3a1d1 и L3d1b3 . [39] Один мужчина, который на 98,14% был африканцем южнее Сахары, нес гаплогруппы E1b1a1a1a1a и L3e2a1b1 . [39] Один мужчина, который на 93,87% был выходцем из стран Африки к югу от Сахары и на 2,58% был европейцем, носил гаплогруппы E1b1a1a1 и L3e1 . [39] Один мужчина, который на 98,70% был выходцем из стран Африки к югу от Сахары, носил гаплогруппы E1b1a1a1a1c1b2a и L2a1a1 . [39] Один мужчина, который на 97,01% был выходцем из стран Африки к югу от Сахары, носил гаплогруппы E1b1a1a1a1c1a1 и L3e2a1b1 . [39] Один мужчина, который на 82,31% был выходцем из стран Африки к югу от Сахары и на 10,24% был европейцем, носил гаплогруппы E1b1a1a1a1c1b и L3e2a1b1 . [39] Один мужчина, который на 91,82% был африканцем южнее Сахары и на 5,31% европейцем, нес гаплогруппы E1b1a1a1a1c1a1 и L3e2 . [39] Один мужчина, который на 81,18% был африканцем южнее Сахары и на 14,86% европейцем, нес гаплогруппы E1b1a1~ и L2c . [39]

На месте захоронения на Энсон-стрит в Чарльстоне , Южная Каролина, были найдены 18 афроамериканцев, чьё тело датируется XVIII веком н. э. [40] Банза имел западно-центральноафриканское происхождение и являлся носителем гаплогрупп E1b1a-CTS668 и L3e3b1 . [40] Лима имел западно-африканское происхождение и являлся носителем гаплогрупп E1b1a-M4671 и L3b3 . [40] Куто имел западно-центральноафриканское происхождение и являлся носителем гаплогрупп E1b1a-CTS2198 и L2a1a2 . [40] Аника имела африканское происхождение к югу от Сахары и являлась носителем гаплогрупп E1b1a-CTS6126 и L2b1 . [40] Нана имела западно-африканское происхождение и являлась носителем гаплогруппы L2b3a . [40] Зимбу имел западное центральноафриканское происхождение и являлся носителем гаплогрупп E1b1a-CTS5497 и L3e1e . [40] Вута имел африканское происхождение к югу от Сахары и являлся носителем гаплогрупп E1b1a-CTS7305 и L3e2b+152 . [40] Даба имел западноафриканское происхождение и являлся носителем гаплогрупп E1b1a-M4273 и L2c . [40] Фуму имел африканское происхождение к югу от Сахары и являлся носителем гаплогрупп B2a1a-Y12201 и L3e2b+152 . [40] Лиза имела западноафриканское происхождение и являлась носителем гаплогрупп E1b1a-Z6020 и H100 . [40] Ганда имел западноафриканское происхождение и являлся носителем гаплогрупп E1b1a-CTS5612 и L1c1c . [40] Кусо имел западноафриканское и индейское происхождение и являлся носителем гаплогрупп E2b1a-CTS2400 и A2 . [40] Кидзера имел западноцентральноафриканское происхождение и являлся носителем гаплогруппы L2a1a2c . [40] Пита имел африканское происхождение к югу от Сахары и являлся носителем гаплогрупп E1b1a-M4287 и L3e2b . [40] Тима имел западноцентральноафриканское происхождение и являлся носителем гаплогруппы L3e1e . [40] Джод имел африканское происхождение к югу от Сахары и являлся носителем гаплогрупп E1b1a-CTS4975 и L2a1a2c . [40] Аджана имела западно-центральноафриканское происхождение и была носителем гаплогруппы L2a1I . [40] Иси имела западно-центральноафриканское происхождение и была носителем гаплогруппы L3e2a . [40]

Медицинская ДНК

Серповидная клетка

Среди Зеленой Сахары мутация серповидноклеточной анемии возникла в Сахаре [41] или в северо-западном лесном регионе западной Центральной Африки (например, Камерун) [41] [42] по крайней мере 7300 лет назад, [41] [42] хотя, возможно, уже 22 000 лет назад. [43] [42] Предковый гаплотип серповидной анемии для современных гаплотипов (например, гаплотипы Камеруна / Центральноафриканской Республики и Бенина / Сенегала ) мог впервые возникнуть у предков современных западноафриканцев, носителей гаплогрупп E1b1a1-L485 и E1b1a1-U175 или их предковой гаплогруппы E1b1a1-M4732. [41] Западноафриканцы (например, йоруба и эсан из Нигерии), носители бенинского гаплотипа серповидной анемии, могли мигрировать через Северо-Восточную Африку в Западную Аравию . [41] Западноафриканцы (например, менде из Сьерра-Леоне), несущие гаплотип серповидноклеточной анемии Сенегала, [44] [41] могли мигрировать в Мавританию (77% современной частоты встречаемости) и Сенегал (100%); они также могли мигрировать через Сахару в Северную Африку и из Северной Африки в Южную Европу, Турцию и регион около северного Ирака и южной Турции. [44] Некоторые могли мигрировать и привнести гаплотипы серповидноклеточной анемии Сенегала и Бенина в Басру , Ирак, где оба встречаются в равной степени. [44] Западноафриканцы, несущие гаплотип серповидноклеточной анемии Бенина , могли мигрировать в северный регион Ирака (69,5%), Иорданию (80%), Ливан (73%), Оман (52,1%) и Египет (80,8%). [44]

Распределение

Частота и разнообразие E-M2 наиболее высоки в Западной Африке. В пределах Африки E-M2 демонстрирует клинальное распределение с запада на восток, а также с юга на север. Другими словами, частота гаплогруппы уменьшается по мере продвижения от западной и южной Африки к восточной и северной частям Африки. [45]

Население Северо-Западной Африки, Центральной Восточной Африки и Мадагаскара тестировалось с более умеренной частотой.

E-M2 встречается с низкой или средней частотой в Северной Африке и Северо-Восточной Африке. Некоторые из линий, обнаруженных в этих областях, возможно, связаны с экспансией банту или другими миграциями. [45] [53] Однако открытие в 2011 году маркера E-M2, который предшествует E-M2, привело Тромбетту и др. к предположению, что E-M2 мог возникнуть в Восточной Африке. [5] В Эритрее и большей части Эфиопии (за исключением ануаков ) E-V38 обычно встречается в форме E-M329, которая является автохтонной, в то время как E-M2 обычно указывает на миграционное происхождение банту. [54] [55] [56]

За пределами Африки E-M2 был обнаружен с низкими частотами. Клада была обнаружена с низкими частотами в Западной Азии. Несколько изолированных случаев E-M2 также наблюдались среди популяций в Южной Европе, таких как Хорватия , Мальта , Испания и Португалия. [64] [65] [66] [67]

Трансатлантическая работорговля привела людей в Северную Америку, Центральную Америку и Южную Америку, включая Карибский бассейн. Следовательно, гаплогруппа часто наблюдается в популяциях Соединенных Штатов у мужчин, которые идентифицируют себя как афроамериканцы. [75] Она также наблюдалась в ряде популяций в Мексике, Карибском бассейне, Центральной Америке и Южной Америке среди людей африканского происхождения.

Субклады

Е1б1а1

Африканское пространственное распределение гаплогруппы E3a-M2. Роза и др. (2007)

E1b1a1 определяется маркерами DYS271/M2/SY81, M291, P1/PN1, P189, P293, V43 и V95. В то время как E1b1a достигает своей самой высокой частоты в 81% в Сенегале, только 1 из 139 протестированных сенегальцев показал M191/P86. [48] Другими словами, по мере продвижения в Западную Африку из западной части Центральной Африки, обнаруживается меньше субкладов E1b1a1f. Cruciani et al. (2002) утверждает: «Возможным объяснением может быть то, что хромосомы гаплотипа 24 [E-M2*] уже присутствовали в Суданском поясе, когда мутация M191, которая определяет гаплотип 22, возникла в центральной части Западной Африки. Только тогда более поздняя демическая экспансия могла принести хромосомы гаплотипа 22 из центральной части Западной Африки в Западную, что привело к противоположным клинальным распределениям гаплотипов 22 и 24». [46]

Е1б1а1а1

E1b1a1a1 обычно определяется как M180/P88. Базальный субклад довольно регулярно наблюдается в образцах M2+.

Е1б1а1а1а

E1b1a1a1a определяется маркером M58. 5% (2/37) жителей города Синга-Римайбе , Буркина-Фасо, дали положительный результат на E-M58. [46] 15% (10/69) хуту в Руанде дали положительный результат на M58. [45] Три южноафриканца дали положительный результат на этот маркер. [12] Один кариока из Рио-де-Жанейро , Бразилия, дал положительный результат на SNP M58. [83] Место происхождения и возраст не сообщаются.

Е1б1а1а1б

E1b1a1a1b определяется M116.2, частным маркером. Один носитель был найден в Мали. [12] [d]

Е1б1а1а1с

E1b1a1a1c определяется частным маркером M149. Этот маркер был обнаружен у одного южноафриканца. [12]

Е1б1а1а1д

E1b1a1a1d определяется частным маркером M155. Он известен по одному носителю в Мали. [12]

Е1б1а1а1е

E1b1a1a1e определяется маркерами M10, M66, M156 и M195. У людей племени Вайрак в Танзании 4,6% (2/43) дали положительный результат на E-M10. [45] E-M10 был обнаружен у одного человека из группы Лиссонго в Центральноафриканской Республике и у двух членов «смешанной» популяции из региона Адамава . [12]

Е1б1а1а1ф

E1b1a1a1f определяется L485. Базальный узел E-L485*, по-видимому, встречается несколько редко, но не был достаточно протестирован в больших популяциях. Предковый SNP L485 (вместе с несколькими его субкладами) был обнаружен совсем недавно. Некоторые из этих SNP имеют мало или вообще не имеют опубликованных популяционных данных и/или еще не получили номенклатурного признания YCC .

Исследования Veeramah et al. (2010) рекомбинирующих частей положительных Y-хромосом M191 предполагают, что эта линия «диффузно распространена с несколькими высокочастотными гаплотипами, что подразумевает более длительный эволюционный период с момента возникновения этой гаплогруппы». [85] Субклад E1b1a1a1f1a, по-видимому, выражает противоположные клинальные распределения по сравнению с E1b1a1* в регионе саванны Западной Африки. Гаплогруппа E1b1a1a1f1a (E-M191) имеет частоту 23% в Камеруне (где она представляет 42% гаплотипов, несущих мутацию DYS271 или E-M2), 13% в Буркина-Фасо (16% гаплотипов, несущих мутацию M2/DYS271) и только 1% в Сенегале . [48] ​​Аналогично, в то время как E1b1a достигает своей самой высокой частоты в 81% в Сенегале, только 1 из 139 протестированных сенегальцев показал M191/P86. [48] Другими словами, по мере продвижения в Западную Африку из западной части Центральной Африки обнаруживается меньше субкладов E1b1a1f. «Возможным объяснением может быть то, что хромосомы гаплотипа 24 [E-M2*] уже присутствовали в суданском поясе, когда мутация M191, которая определяет гаплотип 22, возникла в центральной части Западной Африки. Только тогда более поздняя демическая экспансия могла принести хромосомы гаплотипа 22 из центральной части Западной в Западную Африку, что привело к противоположным клинальным распределениям гаплотипов 22 и 24». [46]

Е1б1а1а1г

E1b1a1a1g (YCC E1b1a8) определяется маркером U175. Базальный E-U175* встречается крайне редко. Montano et al. (2011) обнаружили только одного из 505 протестированных африканских субъектов, который был положительным по U175, но отрицательным по U209. [9] Brucato et al. обнаружили такие же низкие частоты базального E-U175* у субъектов в Кот-д'Ивуаре и Бенине. Veeramah et al. (2010) обнаружили U175 у протестированных Annang (45,3%), Ibibio (37%), Efik (33,3%) и Igbo (25,3%), но не тестировали на U209. [85]

Предполагаемый «гаплотип банту», обнаруженный у носителей E-U175, «присутствует с заметной частотой у других народов, говорящих на языках Нигера и Конго, вплоть до Гвинеи-Бисау на западе ». [85] Это модальный гаплотип маркеров STR, который распространен у носителей E-U175. [e]

E1b1a1a1g имеет несколько субкладов.

Е1б1а1а1х

E1b1a1a1h определяется маркерами P268 и P269. Впервые он был зарегистрирован у человека из Гамбии . [92]

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем наименования для филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместную статью, в которой было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремящегося прежде всего быть своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы в точке знакового дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему более старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

В создании дерева YCC приняли участие следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями.

Филогенетические деревья

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано на дереве Консорциума Y-хромосомы (YCC) 2008 года [92] , дереве гаплогруппы E Y-ДНК ISOGG [7] и последующих опубликованных исследованиях.

Смотрите также

В Викицитатнике есть цитаты, связанные с гаплогруппой E-M2 .

Генетика

Y-ДНК E субклады

Y-ДНК остовное дерево

Примечания

  1. ^ Все результаты тестов на U175 оказались положительными.
  2. ^ В публикации E-V38 обозначен как H22.
  3. ^ E-M2 составляет примерно 7,7–7,9% от общей численности мужского населения США.
  4. ^ В публикации M116.2 заменено на M116.1 в Таблице 1.
  5. ^ Значение маркера YCAII STR 19–19 также обычно указывает на U175.
  6. ^ DYS271/M2/SY81, P1/PN1, P189, P293 и M291, по-видимому, образуют E1b1a1*. L576 образует субклад сразу после ранее упомянутых SNP. L576 дал начало более глубокому субкладу M180/P88, P182, L88.3, ​​L86 и PAGES0006. Из этого субклада произошли все основные субклады (т. е. E-U175 и E-L485) E1b1a. Точное положение V43 и V95 внутри этих трех субкладов и E1b1a1a1b (M116.2), E1b1a1a1c (M149) и E1b1a1a1d (M155) остается неопределенным.

Ссылки

  1. ^ Д'Атанасио Э, Тромбетта Б, Бонито М, Финоккио А, Ди Вито Дж, Сегиззи М; и др. (2018). «Население последней Зеленой Сахары, выявленное путем широкомасштабного повторения последовательности транссахарских отцов». Геном Биол . 19 (1): 20. дои : 10.1186/s13059-018-1393-5 . ПМК 5809971 . ПМИД  29433568. {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  2. ^ ab "E-M2 YTree".
  3. ^ ab Trombetta, Beniamino; et al. (2015). «Филогеографическое уточнение и крупномасштабное генотипирование гаплогруппы E человеческой Y-хромосомы предоставляют новые сведения о расселении ранних скотоводов на африканском континенте». Genome Biology and Evolution . 7 (7). Genome Biol Evol: 1940–1950. doi :10.1093/gbe/evv118. PMC 4524485. PMID  26108492 . 
  4. ^ abc Шрайнер, Дэниел; Ротими, Чарльз (2018). «Гаплотипы, основанные на последовательности всего генома, выявляют единое происхождение аллеля серпа во время влажной фазы голоцена». Американский журнал генетики человека . 102 (4). Am J Hum Genet : 547–556. doi : 10.1016/j.ajhg.2018.02.003. PMC 5985360. PMID  29526279. 
  5. ^ abc Trombetta B, Cruciani F, Sellitto D, Scozzari R (январь 2011 г.). MacAulay V (ред.). "Новая топология человеческой Y-хромосомной гаплогруппы E1b1 (E-P2), выявленная с помощью недавно охарактеризованных бинарных полиморфизмов". PLOS ONE . ​​6 (1): e16073. Bibcode :2011PLoSO...616073T. doi : 10.1371/journal.pone.0016073 . PMC 3017091 . PMID  21253605. 
  6. ^ "E-V43 YTree".
  7. ^ ab Международное общество генетической генеалогии (3 февраля 2010 г.). "Y-ДНК гаплогруппа E и ее субклады – 2010" . Получено 17 декабря 2010 г.
  8. ^ Адамс, Джонатан. «Африка за последние 150 000 лет». Архивировано из оригинала 1 мая 2006 года . Получено 26 января 2011 года .
  9. ^ abcdefgh Монтано В, Ферри Г, Маркари В, Батини К, Аняэле О, Дестро-Бисол Г, Комас Д (июль 2011 г.). «Повторное рассмотрение расширения банту: новый анализ вариации Y-хромосомы в Центральной Западной Африке». Молекулярная экология . 20 (13): 2693–708. doi :10.1111/j.1365-294X.2011.05130.x. PMID  21627702. S2CID  9951365.
  10. ^ abcdef Rosa A, Ornelas C, Jobling MA, Brehm A, Villems R (июль 2007 г.). "Разнообразие Y-хромосомы в популяции Гвинеи-Бисау: многоэтническая перспектива". BMC Evolutionary Biology . 7 : 124. doi : 10.1186/1471-2148-7-124 . PMC 1976131 . PMID  17662131. 
  11. ^ abcdefghijkl Wood ET, Stover DA, Ehret C, Destro-Bisol G, Spedini G, McLeod H, Louie L, Bamshad M, Strassmann BI, Soodyall H, Hammer MF (июль 2005 г.). «Контрастные паттерны вариации Y-хромосомы и мтДНК в Африке: доказательства демографических процессов, обусловленных полом». European Journal of Human Genetics . 13 (7): 867–76. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201408 . PMID  15856073.
  12. ^ abcdef Андерхилл П.А., Пассарино Г., Лин А.А., Шен П., Мирасон Лар М., Фоли Р.А., Офнер П.Дж., Кавалли-Сфорца Л.Л. (январь 2001 г.). «Филогеография бинарных гаплотипов Y-хромосомы и происхождение современных человеческих популяций». Анналы генетики человека . 65 (Часть 1): 43–62. дои : 10.1046/j.1469-1809.2001.6510043.x . PMID  11415522. S2CID  9441236.
  13. ^ abc Wang, Ke; et al. (2020). «Древние геномы раскрывают сложные закономерности перемещения, взаимодействия и замещения населения в странах Африки к югу от Сахары». Science Advances . 6 (24): eaaz0183. Bibcode :2020SciA....6..183W. doi :10.1126/sciadv.aaz0183. ISSN  2375-2548. OCLC  8616876709. PMC 7292641 . PMID  32582847. S2CID  219604401. 
  14. ^ abc Wang, Ke; et al. (2020). «Дополнительные материалы по древним геномам раскрывают сложные закономерности перемещения, взаимодействия и замещения населения в странах Африки к югу от Сахары» (PDF) . Science Advances . 6 (24): eaaz0183. Bibcode :2020SciA....6..183W. doi :10.1126/sciadv.aaz0183. ISSN  2375-2548. OCLC  8616876709. PMC 7292641 . PMID  32582847. S2CID  219604401. 
  15. ^ abc Хавасс, Захи и др. (2012). «Возвращаясь к заговору гарема и смерти Рамсеса III: антропологическое, судебно-медицинское, радиологическое и генетическое исследование». British Medical Journal . 345 : e8268. doi :10.1136/bmj.e8268. hdl : 10072/62081 . ISSN  0959-8138. OCLC  825973553. PMID  23247979. S2CID  206896841.
  16. ^ Гад, Йехия З. и др. (2021). «Выводы из анализа древней ДНК египетских человеческих мумий: ключи к болезням и родству». Молекулярная генетика человека . 30 (R1): R24–R28. doi : 10.1093/hmg/ddaa223 . ISSN  0964-6906. OCLC  8681412353. PMID  33059357. S2CID  222824170.
  17. ^ Прендергаст, Мэри Э. и др. (30 мая 2019 г.). «Древняя ДНК раскрывает многоэтапное распространение первых скотоводов в странах Африки к югу от Сахары». Science . 365 (6448): 6275. Bibcode :2019Sci...365.6275P. doi :10.1126/science.aaw6275. ISSN  0036-8075. OCLC  8176642048. PMC 6827346 . PMID  31147405. S2CID  171092468. 
  18. ^ Прендергаст, Мэри Э. и др. (30 мая 2019 г.). «Дополнительные материалы по древней ДНК раскрывают многоэтапное распространение первых скотоводов в странах Африки к югу от Сахары» (PDF) . Science . 365 (6448). Bibcode :2019Sci...365.6275P. doi :10.1126/science.aaw6275. ISSN  0036-8075. OCLC  8176642048. PMC 6827346 . PMID  31147405. S2CID  171092468. 
  19. ^ abcdefgh Brielle, Esther S.; et al. (29 марта 2023 г.). «Дополнительные файлы данных для переплетенных африканских и азиатских генетических корней средневековых народов побережья Суахили». Nature . 615 (7954): 866–873. Bibcode :2023Natur.615..866B. doi :10.1038/s41586-023-05754-w. ISSN  0028-0836. OCLC  9819552636. PMC 10060156 . PMID  36991187. S2CID  250534036. 
  20. ^ Брунель, Саманта и др. (9 июня 2020 г.). «Древние геномы современной Франции открывают 7000 лет ее демографической истории». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (23): 12791–12798. Bibcode : 2020PNAS..11712791B. doi : 10.1073/pnas.1918034117 . ISSN  0027-8424. JSTOR  26968323. OCLC  8600693713. PMC 7293694. PMID  32457149. S2CID  218910530. 
  21. ^ Баркера, Родриго и др. (8 июня 2020 г.). «Происхождение и состояние здоровья африканцев первого поколения из ранней колониальной Мексики». Current Biology . 30 (11): 2078–2091. doi : 10.1016/j.cub.2020.04.002 . hdl : 21.11116/0000-0007-30FE-5 . ISSN  0960-9822. OCLC  8586564917. PMID  32359431. S2CID  216662049.
  22. ^ Fortes-Lima, Cesar A. (22 ноября 2021 г.). «Распутывание влияния трансатлантической работорговли на население африканской диаспоры с точки зрения геномики». Африка, колыбель человеческого разнообразия Культурные и биологические подходы к раскрытию африканского разнообразия . Brill. стр. 305, 308–321. doi :10.1163/9789004500228_012. ISBN 978-90-04-50022-8. OCLC  1284920909. S2CID  244549408.
  23. ^ Пейротео-Стьерна, Рита; и др. (21 февраля 2022 г.). «Мультидисциплинарное расследование выявило человека западноафриканского происхождения, похороненного в португальской мезолитической куче раковины четыре столетия назад». Журнал археологической науки: отчеты . 42 : 103370. doi : 10.1016/j.jasrep.2022.103370 . OCLC  1337974923. S2CID  247045502.
  24. ^ abcde Сандовал-Веласко, Марсела; и др. (7 сентября 2023 г.). «Происхождение и географическое происхождение освобожденных африканцев острова Святой Елены» (PDF) . American Journal of Human Genetics . 110 (9): 1590–1599. bioRxiv 10.1101/787515 . doi :10.1016/j.ajhg.2023.08.001. ISSN  0002-9297. OCLC  9998699240. PMC 10502851 . PMID  37683613. S2CID  261620937.  
  25. ^ Isable, Kendra Briana (август 2021 г.). «Вклад в обсуждение: здоровье рабов-африканцев сквозь призму биоархеологии». Калифорнийский государственный университет, Нортридж. стр. 34.
  26. ^ Fortes-Lima, Cesar; Verdu, Paul (17 декабря 2020 г.). «Взгляды антропологической генетики на трансатлантическую работорговлю». Human Molecular Genetics . 30 (R1): R79–R87. doi :10.1093/hmg/ddaa271. PMID  33331897. S2CID  229301497.
  27. ^ Callaway, Ewen (7 декабря 2016 г.). «Что ДНК раскрывает об освобожденных рабах Святой Елены». Nature . 540 (7632): 184–187. doi : 10.1038/540184a . S2CID  89162808.
  28. ^ abcdefghijklmnopqrst Сандовал-Веласко, Марсела; и др. (7 сентября 2023 г.). «Данные S1. Таблицы S1–S13: Родословная и географическое происхождение освобожденных африканцев острова Святой Елены». Американский журнал генетики человека . 110 (9): 1590–1599. bioRxiv 10.1101/787515 . doi :10.1016/j.ajhg.2023.08.001. hdl : 11250/3105696 . ISSN 0002-9297  . OCLC  9998699240. PMC 10502851. PMID  37683613. S2CID  261620937.  
  29. ^ Fleskes, Raquel E.; et al. (2019). «Древняя ДНК и биоархеологические перспективы европейского и африканского разнообразия и отношений на колониальной границе Делавэра». Американский журнал физической антропологии . 170 (2): 232–245. doi :10.1002/ajpa.23887. PMID  31270812. S2CID  195796747.
  30. ^ Расимо, Фернандо и др. (2020). «За пределами общих черт: социокультурные идеи из изучения древних геномов» (PDF) . Nature Reviews Genetics . 21 (6): 355–366. doi :10.1038/s41576-020-0218-z. ISSN  1471-0056. PMID  32127690. S2CID  207780165.
  31. ^ Callaway, Ewen (5 ноября 2019 г.). «Геномы прослеживают происхождение рабов, умерших на отдаленном острове». Nature . 575 (18): 18. Bibcode :2019Natur.575...18C. doi :10.1038/d41586-019-03152-9. PMID  31690869. S2CID  207896705.
  32. ^ Абель, Сара; Шредер, Ханнес (октябрь 2020 г.). «От меток стран к ДНК-маркерам: геномный поворот в реконструкции африканских идентичностей». Current Anthropology . 61 : S206. doi :10.1086/709550. S2CID  224962523.
  33. ^ abc Olalde, Iñigo; et al. (2019). «Дополнительные материалы к геномной истории Пиренейского полуострова за последние 8000 лет» (PDF) . Science . 363 (6432): 1230–1234. Bibcode :2019Sci...363.1230O. doi :10.1126/science.aav4040. hdl :10261/207967. ISSN  0036-8075. OCLC  8024095449. PMC 6436108 . PMID  30872528. S2CID  78094214. 
  34. ^ ab Olalde, Iñigo (2019). «Геномная история Пиренейского полуострова за последние 8000 лет, таблицы S1–S5». Science . 363 (6432): 1230–1234. Bibcode :2019Sci...363.1230O. doi :10.1126/science.aav4040. hdl :10261/207967. ISSN  0036-8075. OCLC  8024095449. PMC 6436108 . PMID  30872528. S2CID  78094214. 
  35. ^ ab Olalde, Iñigo (2019). «Материалы/методы, дополнительный текст, таблицы, рисунки и/или ссылки». Science . 363 (6432): 1230–1234. Bibcode :2019Sci...363.1230O. doi :10.1126/science.aav4040. ISSN  0036-8075. OCLC  8024095449. PMC 6436108 . PMID  30872528. S2CID  78094214. 
  36. ^ Fleskes, Raquel E.; et al. (5 июня 2023 г.). «Исторические геномы объясняют европейское поселение и африканскую диаспору в Делавэре». Current Biology . 33 (11): 2350–2358.e7. doi :10.1016/j.cub.2023.04.069. ISSN  0960-9822. OCLC  9874997102. PMID  37207647. S2CID  258767664.
  37. ^ Харни, Эдаойн и др. (2023). «Генетическое наследие афроамериканцев из Катоктиновой печи» (PDF) . Наука . 381 (500): eade4995. doi :10.1126/science.ade4995. PMC 10958645 . PMID  37535739. S2CID  260440898. 
  38. ^ Харни, Эдаойн и др. (2023). «Дополнительные материалы к генетическому наследию афроамериканцев из Катоктиновой печи» (PDF) . Наука . 381 (500): eade4995. doi :10.1126/science.ade4995. PMC 10958645 . PMID  37535739. S2CID  260440898. 
  39. ^ abcdefghijk Harney, Éadaoin; et al. (2023). "Таблицы S1 - S24, S1.1, S3.2 - S3.7 и S4.1 для генетического наследия афроамериканцев из Катоктиновой печи". Science . 381 (500): eade4995. doi :10.1126/science.ade4995. PMC 10958645 . PMID  37535739. S2CID  260440898. 
  40. ^ abcdefghijklmnopqrs Fleskes, Raquel E.; et al. (2023). «Проект по изучению древней ДНК с участием сообщества раскрывает разнообразное происхождение потомков африканцев XVIII века в Чарльстоне, Южная Каролина». Антропология . 120 (3): e2201620120. doi :10.1073/pnas.2201620120. PMC 9934026. PMID 36623185.  S2CID 255568252  . 
  41. ^ abcdef Шрайнер, Дэниел; Ротими, Чарльз Н. (2018). «Гаплотипы, основанные на последовательности всего генома, выявляют единое происхождение аллеля серпа во время влажной фазы голоцена». Американский журнал генетики человека . 102 (4): 547–556. doi : 10.1016/j.ajhg.2018.02.003. ISSN  0002-9297. OCLC  7352712531. PMC 5985360. PMID  29526279. S2CID  4636822. 
  42. ^ abc Esoh, Kevin; Wonkam, Ambroise (2021). «Эволюционная история мутации серповидноклеточной анемии: последствия для глобальной генетической медицины». Human Molecular Genetics . 30 (R1): R119–R128. doi :10.1093/hmg/ddab004. ISSN  0964-6906. OCLC  8885008275. PMC 8117455. PMID  33461216. S2CID  231640941 . 
  43. ^ Лаваль, Гийом и др. (2019). «Недавнее адаптивное приобретение охотниками-собирателями африканских тропических лесов мутации серповидноклеточной анемии позднего плейстоцена указывает на прошлые различия в воздействии малярии». Американский журнал генетики человека . 104 (3): 553–561. doi : 10.1016/j.ajhg.2019.02.007. ISSN  0002-9297. OCLC  8015758034. PMC 6407493. PMID  30827499. S2CID  73503158. 
  44. ^ abcd Ясин, Нур Таха; и др. (2020). «Серповидные гаплотипы β-глобина у пациентов с серповидноклеточной анемией в Басре, Ирак: поперечное исследование». Иракский журнал гематологии . 9 (1): 23–29. дои : 10.4103/ijh.ijh_20_19 . ISSN  2072-8069. OCLC  8663256900. S2CID  216082225. Архивировано из оригинала 3 июня 2023 года.
  45. ^ abcdefghi Luis JR, Rowold DJ, Regueiro M, Caeiro B, Cinnioğlu C, Roseman C, Underhill PA, Cavalli-Sforza LL, Herrera RJ (март 2004 г.). «Левант против Африканского Рога: доказательства двунаправленных коридоров человеческих миграций». American Journal of Human Genetics . 74 (3): 532–44. doi :10.1086/382286. PMC 1182266 . PMID  14973781. 
  46. ^ abcde Круциани Ф, Сантоламазца П, Шен П, Маколей В, Морал П, Олкерс А, Модиано Д, Холмс С, Дестро-Бисол Г, Койа В, Уоллес округ Колумбия, Офнер П.Дж., Торрони А, Кавалли-Сфорца ЛЛ, Скоццари Р. , Андерхилл, Пенсильвания (май 2002 г.). «Обратная миграция из Азии в страны Африки к югу от Сахары подтверждается анализом гаплотипов Y-хромосомы человека с высоким разрешением». Американский журнал генетики человека . 70 (5): 1197–214. дои : 10.1086/340257. ПМЦ 447595 . ПМИД  11910562. 
  47. ^ Международный консорциум HapMap (октябрь 2005 г.). «Карта гаплотипа генома человека». Nature . 437 (7063): 1299–320. Bibcode :2005Natur.437.1299T. doi :10.1038/nature04226. PMC 1880871 . PMID  16255080. 
  48. ^ abcd Семино О, Сантакьяра-Бенересетти А.С., Фаласки Ф, Кавалли-Сфорца ЛЛ, Андерхилл, Пенсильвания (январь 2002 г.). «Эфиопы и койсанцы разделяют самые глубокие клады филогении Y-хромосомы человека». Американский журнал генетики человека . 70 (1): 265–8. дои : 10.1086/338306. ПМЦ 384897 . ПМИД  11719903. 
  49. ^ abc Pereira L, Cerný V, Cerezo M, Silva NM, Hájek M, Vasíková A, Kujanová M, Brdicka R, Salas A (август 2010 г.). «Связывание генофондов к югу от Сахары и Западной Евразии: материнское и отцовское наследие кочевников-туарегов из африканского Сахеля». European Journal of Human Genetics . 18 (8): 915–23. doi :10.1038/ejhg.2010.21. PMC 2987384. PMID  20234393 . 
  50. ^ ab Msaidie S, Ducourneau A, Boetsch G, Longepied G, Papa K, Allibert C, Yahaya AA, Chiaroni J, Mitchell MJ (январь 2011 г.). «Генетическое разнообразие на Коморских островах показывает, что раннее мореплавание было основным фактором биокультурной эволюции человека в западной части Индийского океана». European Journal of Human Genetics . 19 (1): 89–94. doi :10.1038/ejhg.2010.128. PMC 3039498 . PMID  20700146. 
  51. ^ Gonçalves R, Rosa A, Freitas A, Fernandes A, Kivisild T, Villems R, Brehm A (ноябрь 2003 г.). «Линии Y-хромосомы на островах Кабо-Верде свидетельствуют о разнообразном географическом происхождении первых поселенцев мужского пола». Human Genetics . 113 (6): 467–72. doi :10.1007/s00439-003-1007-4. hdl : 10400.13/3047 . PMID  12942365. S2CID  63381583.
  52. ^ abcd Tofanelli S, Bertoncini S, Castrì L, Luiselli D, Calafell F, Donati G, Paoli G (сентябрь 2009 г.). «О происхождении и смешении малагасийцев: новые доказательства, полученные в результате высокоразрешающего анализа отцовских и материнских линий». Молекулярная биология и эволюция . 26 (9): 2109–24. doi : 10.1093/molbev/msp120 . PMID  19535740.
  53. ^ ab Sanchez JJ, Hallenberg C, Børsting C, Hernandez A, Morling N (июль 2005 г.). «Высокие частоты линий Y-хромосомы, характеризующихся E3b1, DYS19-11, DYS392-12 у сомалийских мужчин». European Journal of Human Genetics . 13 (7): 856–66. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201390 . PMID  15756297.
  54. ^ Iacovacci G, D'Atanasio E, Marini O, Coppa A, Sellitto D, Trombetta B, Berti A, Cruciani F (март 2017 г.). «Данные судебной экспертизы и характеристика микровариантной последовательности 27 локусов Y-STR, проанализированных в четырех странах Восточной Африки». Forensic Science International. Genetics . 27 : 123–131. doi :10.1016/j.fsigen.2016.12.015. PMID  28068531.
  55. ^ Пластер и др. Y-ДНК E субклады
  56. ^ Plaster CA (28.09.2011). Изменчивость Y-хромосомы, митохондриальной ДНК и метки идентичности в Эфиопии. discovery.ucl.ac.uk (Doctoral) . Получено 27.06.2018 .
  57. ^ Оттони С., Лармюсо М.Х., Вандерхейден Н., Мартинес-Лабарга С., Примативо Г., Бионди Г., Декорте Р., Рикардс О. (май 2011 г.). «Вглубь корней ливийских туарегов: генетический обзор их отцовского наследия». Американский журнал физической антропологии . 145 (1): 118–24. дои : 10.1002/ajpa.21473. ПМИД  21312181.
  58. ^ Robino C, Crobu F, Di Gaetano C, Bekada A, Benhamamouch S, Cerutti N, Piazza A, Inturri S, Torre C (май 2008 г.). «Анализ гаплогрупп SNP Y-хромосомы и гаплотипов STR в выборке алжирской популяции». International Journal of Legal Medicine . 122 (3): 251–5. doi :10.1007/s00414-007-0203-5. PMID  17909833. S2CID  11556974.
  59. ^ abc Bosch E, Calafell F, Comas D, Oefner PJ, Underhill PA, Bertranpetit J (апрель 2001 г.). «Анализ с высоким разрешением вариаций Y-хромосомы человека показывает резкий разрыв и ограниченный поток генов между северо-западной Африкой и Пиренейским полуостровом». American Journal of Human Genetics . 68 (4): 1019–29. doi :10.1086/319521. PMC 1275654 . PMID  11254456. 
  60. ^ ab Круциани Ф, Ла Фратта Р, Сантоламазца П, Селлитто Д, Пасконе Р, Морал П, Уотсон Э, Гуида В, Коломб ЭБ, Захарова Б, Лавинья Дж, Вона Г, Аман Р, Кали Ф, Акар Н, Ричардс М , Торрони А., Новеллетто А., Скоццари Р. (май 2004 г.). «Филогеографический анализ y-хромосом гаплогруппы E3b (E-M215) выявляет множественные миграционные события внутри Африки и из нее». Американский журнал генетики человека . 74 (5): 1014–22. дои : 10.1086/386294. ПМК 1181964 . ПМИД  15042509. 
  61. ^ Karafet TM, Zegura SL, Posukh O, Osipova L, Bergen A, Long J, Goldman D, Klitz W, Harihara S, de Knijff P, Wiebe V, Griffiths RC, Templeton AR, Hammer MF (март 1999). "Предковые азиатские источники гаплотипов основателей Y-хромосомы нового мира". American Journal of Human Genetics . 64 (3): 817–31. doi :10.1086/302282. PMC 1377800 . PMID  10053017. 
  62. ^ ab Arredi B, Poloni ES, Paracchini S, Zerjal T, Fathallah DM, Makrelouf M, Pascali VL, Novelletto A, Tyler-Smith C (август 2004 г.). «Преимущественно неолитическое происхождение вариации Y-хромосомной ДНК в Северной Африке». American Journal of Human Genetics . 75 (2): 338–45. doi :10.1086/423147. PMC 1216069 . PMID  15202071. 
  63. ^ Хассан HY, Андерхилл PA, Кавалли-Сфорца LL, Ибрагим ME (ноябрь 2008 г.). «Изменчивость Y-хромосомы среди суданцев: ограниченный поток генов, соответствие языку, географии и истории». Американский журнал физической антропологии . 137 (3): 316–23. doi :10.1002/ajpa.20876. PMID  18618658.
  64. ^ Мршич Г, Гршкович Б, Врдоляк А, Попович М, Валпотич I, Анжелинович Ш, Стензл В, Элер Э, Урбан Л, Лакович Г, Андерхилл П, Приморак Д (июль 2012 г.). «Хорватская национальная справочная база данных гаплотипов Y-STR». Отчеты по молекулярной биологии . 39 (7). Бранка Грскович, Андро Врдоляк, Майя Попович, Ивица Вальпотик, Симун Анделинович, Властимил Стенцль, Эдвард Элер, Людвик Урбан, Гордана Лацкович, Питер Андерхилл, Драган Приморац: 7727–41. дои : 10.1007/s11033-012-1610-3. PMID  22391654. S2CID  18011987.
  65. ^ Capelli C, Redhead N, Romano V, Calì F, Lefranc G, Delague V и др. (март 2006 г.). «Структура населения в Средиземноморском бассейне: перспектива Y-хромосомы». Annals of Human Genetics . 70 (Pt 2): 207–25. doi :10.1111/j.1529-8817.2005.00224.x. hdl : 2108/37090 . PMID  16626331. S2CID  25536759.
  66. ^ Flores C, Maca-Meyer N, González AM, Oefner PJ, Shen P, Pérez JA, Rojas A, Larruga JM, Underhill PA (октябрь 2004 г.). «Редуцированная генетическая структура Пиренейского полуострова, выявленная с помощью анализа Y-хромосомы: последствия для демографии населения». European Journal of Human Genetics . 12 (10): 855–63. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201225 . PMID  15280900.
  67. ^ ab Адамс С.М., Бош Э., Балареск П.Л., Баллеро С.Дж., Ли AC, Арройо Э., Лопес-Парра AM, Алер ​​М., Грифо М.С., Брион М., Карраседо А., Лавинья Дж., Мартинес-Харрета Б., Кинтана-Мурси Л., Пикорнелл А., Рамон М., Скорецки К., Бехар Д.М., Калафелл Ф., Джоблинг М.А. (декабрь 2008 г.). «Генетическое наследие религиозного разнообразия и нетерпимости: отцовские линии христиан, евреев и мусульман на Пиренейском полуострове». Американский журнал генетики человека . 83 (6): 725–36. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.11.007. ПМК 2668061 . ПМИД  19061982. 
  68. ^ Нура Р. Аль-Снан1; Сафия А. Мессауди; Яхья М. Хубрани; Джон Х. Веттон; Марк А. Джоблинг; Мойз Бахиет (2020). «Географическая структуризация и низкое разнообразие отцовских линий в Бахрейне, продемонстрированное анализом 27 Y-STR». Молекулярная генетика и геномика . 295 (6): 1315–1324. дои : 10.1007/s00438-020-01696-4. ПМЦ 7524810 . ПМИД  32588126. {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
  69. ^ Абу-Амеро КК, Хеллани А, Гонсалес АМ, Ларруга ДжМ, Кабрера ВМ, Андерхилл ПА (сентябрь 2009 г.). «Разнообразие Y-хромосомы Саудовской Аравии и его связь с близлежащими регионами». BMC Genetics . 10 : 59. doi : 10.1186/1471-2156-10-59 . PMC 2759955. PMID  19772609 . 
  70. ^ ab Cadenas AM, Zhivotovsky LA, Cavalli-Sforza LL, Underhill PA, Herrera RJ (март 2008 г.). «Разнообразие Y-хромосомы характеризует Оманский залив». European Journal of Human Genetics . 16 (3): 374–86. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201934 . PMID  17928816.
  71. ^ Regueiro M, Cadenas AM, Gayden T, Underhill PA, Herrera RJ (2006). «Иран: трехконтинентальный узел миграции, вызванной Y-хромосомой». Human Heredity . 61 (3): 132–43. doi :10.1159/000093774. PMID  16770078. S2CID  7017701.
  72. ^ Al-Zahery N, Semino O, Benuzzi G, Magri C, Passarino G, Torroni A, Santachiara-Benerecetti AS (сентябрь 2003 г.). «Полиморфизмы Y-хромосомы и мтДНК в Ираке, перекресток раннего расселения людей и постнеолитических миграций». Молекулярная филогенетика и эволюция . 28 (3): 458–72. doi :10.1016/S1055-7903(03)00039-3. PMID  12927131.
  73. ^ Firasat S, Khaliq S, Mohyuddin A, Papaioannou M, Tyler-Smith C, Underhill PA, Ayub Q (январь 2007 г.). «Y-хромосомные доказательства ограниченного греческого вклада в патанскую популяцию Пакистана». European Journal of Human Genetics . 15 (1): 121–6. doi :10.1038/sj.ejhg.5201726. PMC 2588664. PMID  17047675 . 
  74. ^ Cinnioğlu C, King R, Kivisild T, Kalfoğlu E, Atasoy S, Cavalleri GL, Lillie AS, Roseman CC, Lin AA, Prince K, Oefner PJ, Shen P, Semino O, Cavalli-Sforza LL, Underhill PA (январь 2004 г.). «Раскопки слоев гаплотипа Y-хромосомы в Анатолии». Генетика человека . 114 (2): 127–48. doi :10.1007/s00439-003-1031-4. PMID  14586639. S2CID  10763736.
  75. ^ abcd Sims LM, Garvey D, Ballantyne J (январь 2007 г.). «Субпопуляции в пределах основных европейских и африканских производных гаплогрупп R1b3 и E3a различаются по ранее филогенетически неопределенным Y-SNP». Human Mutation . 28 (1): 97. doi : 10.1002/humu.9469 . PMID  17154278. S2CID  34556775.
  76. ^ Мендисабаль И, Сандовал К, Берниелл-Ли Г, Калафель Ф, Салас А, Мартинес-Фуэнтес А, Комас Д (июль 2008 г.). «Генетическое происхождение, смешение и асимметрия в материнских и отцовских человеческих линиях на Кубе». BMC Evolutionary Biology . 8 : 213. doi : 10.1186/1471-2148-8-213 . PMC 2492877 . PMID  18644108. 
  77. ^ ab Bryc K, Velez C, Karafet T, Moreno-Estrada A, Reynolds A, Auton A, Hammer M, Bustamante CD, Ostrer H (май 2010 г.). «Доклад на коллоквиуме: общегеномные закономерности структуры популяции и смешения среди испаноязычных/латиноамериканских популяций». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 Suppl 2 (Дополнение 2): 8954–61. Bibcode : 2010PNAS..107.8954B. doi : 10.1073/pnas.0914618107 . PMC 3024022. PMID  20445096 . 
  78. ^ Нуньес С., Баэта М., Соса С., Касалод Ю., Ге Дж., Будовле Б., Мартинес-Харрета Б. (декабрь 2010 г.). «Реконструкция истории населения Никарагуа с помощью мтДНК, STR Y-хромосомы и аутосомных STR-маркеров». Американский журнал физической антропологии . 143 (4): 591–600. дои : 10.1002/ajpa.21355. ПМИД  20721944.
  79. ^ Рохас В, Парра М.В., Кампо О, Каро М.А., Лопера Х.Г., Ариас В., Дуке С, Наранхо А., Гарсиа Х., Вергара С., Лопера Х., Эрнандес Э., Валенсия А., Кайседо Ю., Куартас М., Гутьеррес Дж., Лопес. С., Руис-Линарес А., Бедойя Г. (сентябрь 2010 г.). «Генетический состав и структура колумбийского населения с помощью маркеров однородительской и двуродительской ДНК». Американский журнал физической антропологии . 143 (1): 13–20. дои : 10.1002/ajpa.21270. ПМИД  20734436.
  80. ^ де Азеведо Д.А., да Силва Л.А., Гужман Л., де Карвальо Э.Ф. (декабрь 2009 г.). «Анализ SNP Y-хромосомы в Алагоасе, северо-восток Бразилии». Forensic Science International: Серия дополнений по генетике . 2 (1): 421–422. doi :10.1016/j.fsigss.2009.08.166.
  81. ^ Насименту Э, Серкейра Э, Азеведо Э, Фрейтас В, Азеведо Д (декабрь 2009 г.). «Африканские мужские линии народа Баии — Северо-восток Бразилии: предварительное исследование SNP». Forensic Science International: Серия дополнений по генетике . 2 (1): 349–350. doi :10.1016/j.fsigss.2009.07.010.
  82. ^ Таня М. Симмс 2011, Заселение Багамских островов: филогеографическая перспектива, стр. 194
  83. ^ ab Hünemeier T, Carvalho C, Marrero AR, Salzano FM, Pena SD, Bortolini MC (июнь 2007 г.). «Нигеро-конголезское говорящее население и формирование бразильского генофонда: данные мтДНК и Y-хромосомы». American Journal of Physical Anthropology . 133 (2): 854–67. doi :10.1002/ajpa.20604. PMID  17427922.
  84. ^ Аб де Филиппо С, Барбьери С, Уиттен М, Мполока С.В., Гуннарсдоттир ЭД, Бостоен К, Ньямбе Т, Бейер К, Шрайбер Х, де Книфф П, Луизелли Д, Стоункинг М, Пакендорф Б (март 2011 г.). «Y-хромосомная вариация в Африке к югу от Сахары: взгляд на историю групп Нигера и Конго». Молекулярная биология и эволюция . 28 (3): 1255–69. doi : 10.1093/molbev/msq312. ПМЦ 3561512 . ПМИД  21109585. 
  85. ^ abcd Veeramah KR, Connell BA, Ansari Pour N, Powell A, Plaster CA, Zeitlyn D, Mendell NR, Weale ME, Bradman N, Thomas MG (март 2010 г.). "Незначительная генетическая дифференциация, оцененная по однородительским маркерам при наличии существенной языковой вариации у народов региона Кросс-Ривер в Нигерии". BMC Evolutionary Biology . 10 : 92. doi : 10.1186/1471-2148-10-92 . PMC 2867817 . PMID  20356404. 
  86. ^ ab Naidoo T, Schlebusch CM, Makkan H, Patel P, Mahabeer R, Erasmus JC, Soodyall H (сентябрь 2010 г.). «Разработка метода расширения одной базы для определения гаплогрупп Y-хромосомы в популяциях Африки к югу от Сахары». Investigative Genetics . 1 (1): 6. doi : 10.1186/2041-2223-1-6 . PMC 2988483 . PMID  21092339. 
  87. ^ ab Abecasis GR, Altshuler D, Auton A, Brooks LD, Durbin RM, Gibbs RA, Hurles ME, McVean GA (октябрь 2010 г.). «Карта вариаций генома человека, полученная с помощью секвенирования в масштабе популяции». Nature . 467 (7319): 1061–73. Bibcode :2010Natur.467.1061T. doi :10.1038/nature09534. PMC 3042601 . PMID  20981092. 
  88. ^ Reynolds D, Squecco A. "Y-Chromosome Genome Comparison". Архивировано из оригинала 26 декабря 2022 года . Получено 1 августа 2011 года .
  89. ^ Brucato N, Cassar O, Tonasso L, Tortevoye P, Migot-Nabias F, Plancoulaine S, Guitard E, Larrouy G, Gessain A, Dugoujon JM (октябрь 2010 г.). «Отпечаток работорговли в популяции афроамериканцев: митохондриальная ДНК, Y-хромосома и анализ HTLV-1 в черном мароне Французской Гвианы». BMC Evolutionary Biology . 10 : 314. doi : 10.1186/1471-2148-10-314 . PMC 2973943. PMID  20958967 . 
  90. ^ Брито П., Карвалью М., Гомеш В., Мело М.М., Богас В., Бальса Ф. и др. (декабрь 2011 г.). «Анализ Y-SNP в популяции Анголы». Forensic Science International: Серия дополнений по генетике . 3 (1): е369–е370. doi :10.1016/j.fsigss.2011.09.046.
  91. ^ Андерхилл П.А., Шен П., Лин А.А., Джин Л., Пассарино Г., Ян В.Х., Кауфман Э., Бонне-Тамир Б., Бертранпетит Дж., Франкалаччи П., Ибрагим М., Дженкинс Т., Кидд Дж.Р., Мехди С.К., Зейлстад М.Т., Уэллс Р.С. , Площадь А, Дэвис Р.В., Фельдман М.В., Кавалли-Сфорца Л.Л., Офнер П.Дж. (ноябрь 2000 г.). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Природная генетика . 26 (3): 358–61. дои : 10.1038/81685. PMID  11062480. S2CID  12893406.
  92. ^ ab Karafet TM, Mendez FL, Meilerman MB, Underhill PA, Zegura SL, Hammer MF (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и повышают разрешение древа гаплогруппы Y-хромосомы человека». Genome Research . 18 (5): 830–8. doi :10.1101/gr.7172008. PMC 2336805 . PMID  18385274. 

Источники таблиц преобразования

Внешние ссылки