Человеческий белок и кодирующий ген
РНК-связывающий белок EWS — это белок , который у людей кодируется геном EWSR1 на 22 -й хромосоме человека , а именно 22q12.2. [5] [6] Это один из 3 белков в семействе белков FET . [7]
Клиническое значение
Область q22.2 хромосомы 22 кодирует N-концевой домен трансактивации белка EWS, и эта область может быть присоединена к одной из нескольких других хромосом, которые кодируют различные факторы транскрипции; см. EWS/FLI и OMIM-133450. [8] Экспрессия химерного белка с доменом трансактивации EWS, слитым с областью связывания ДНК фактора транскрипции, генерирует мощный онкогенный белок, вызывающий саркому Юинга и другие члены семейства опухолей Юинга . Эти транслокации могут происходить из-за хромоплексии , всплеска сложных хромосомных перестроек, наблюдаемых в раковых клетках. [9] Нормальный ген EWS кодирует РНК-связывающий белок, тесно связанный с FUS (ген) и TAF15 , все из которых были связаны с боковым амиотрофическим склерозом . [10]
Взаимодействия
Было показано, что белок EWS взаимодействует с:
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000182944 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000009079 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Delattre O, Zucman J, Plougastel B, Desmaze C, Melot T, Peter M, Kovar H, Joubert I, de Jong P, Rouleau G (октябрь 1992 г.). «Слияние генов с доменом связывания ДНК ETS, вызванное транслокацией хромосом в опухолях человека». Nature . 359 (6391): 162–5. Bibcode :1992Natur.359..162D. doi :10.1038/359162a0. PMID 1522903. S2CID 4331584.
- ^ "Ген Энтреза: EWSR1, область точки разрыва саркомы Юинга 1".
- ^ Flucke U, van Noesel MM, Siozopoulou V, Creytens D, Tops BB, van Gorp JM, Hiemcke-Jiwa LS (июнь 2021 г.). "EWSR1-The Most Common Rearranged Gene in Soft Tissue Lesions, Which Also Occures in Different Bone Lesions: An Updated Review". Diagnostics (Базель, Швейцария) . 11 (6): 1093. doi : 10.3390/diagnostics11061093 . PMC 8232650. PMID 34203801 .
- ^ "Гены слияния семейства EWS - OMIM".
- ^ Андерсон Н.Д., де Борха Р., Янг, МД, Фулиньи Ф, Росич А., Робертс Н.Д., Хаджар С., Лайегифард М., Новокмет А., Ковальски П.Е., Анака М. (август 2018 г.). «Всплески перестройки вызывают канонические слияния генов в опухолях костей и мягких тканей». Наука . 361 (6405): eaam8419. doi : 10.1126/science.aam8419. ПМК 6176908 . ПМИД 30166462.
- ^ Couthouis J, Hart MP, Erion R, King OD, Diaz Z, Nakaya T, Ibrahim F, Kim HJ, Mojsilovic-Petrovic J, Panossian S, Kim CE, Frackelton EC, Solski JA, Williams KL, Clay-Falcone D, Elman L, McCluskey L, Greene R, Hakonarson H, Kalb RG, Lee VM, Trojanowski JQ, Nicholson GA, Blair IP, Bonini NM, Van Deerlin VM, Mourelatos Z, Shorter J, Gitler AD (2012). «Оценка роли гена EWSR1, связанного с FUS/TLS, при боковом амиотрофическом склерозе». Hum. Mol. Genet . 21 (13): 2899–911. doi :10.1093/hmg/dds116. PMC 3373238. PMID 22454397 .
- ^ Fujimura Y, Ohno T, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (январь 1996 г.). «Ген EWS-ATF-1, участвующий в злокачественной меланоме мягких тканей с транслокацией хромосомы t(12;22), кодирует конститутивный транскрипционный активатор». Oncogene . 12 (1): 159–67. PMID 8552387.
- ^ Spahn L, Petermann R, Siligan C, Schmid JA, Aryee DN, Kovar H (август 2002 г.). «Взаимодействие конца NH2 EWS с BARD1 связывает ген саркомы Юинга с общим путем подавления опухолей». Cancer Res . 62 (16): 4583–7. PMID 12183411.
- ^ Ohno T, Ouchida M, Lee L, Gatalica Z, Rao VN, Reddy ES (октябрь 1994 г.). «Ген EWS, вовлеченный в семейство опухолей Юинга, злокачественную меланому мягких тканей и десмопластические мелкокруглоклеточные опухоли, кодирует РНК-связывающий белок с новыми регуляторными доменами». Oncogene . 9 (10): 3087–97. PMID 8084618.
- ^ Thomas GR, Latchman DS (2002). «Проонкопротеин EWS (белок саркомы Юинга) взаимодействует с фактором транскрипции Brn-3a POU и подавляет его способность активировать транскрипцию». Cancer Biol. Ther . 1 (4): 428–32. doi : 10.4161/cbt.1.4.23 . PMID 12432261.
- ^ Felsch JS, Lane WS, Peralta EG (май 1999). "Тирозинкиназа Pyk2 опосредует регуляцию рецептора, связанного с G-белком, РНК-связывающего белка саркомы Юинга EWS". Curr. Biol . 9 (9): 485–8. Bibcode : 1999CBio....9..485F. doi : 10.1016/s0960-9822(99)80214-0 . PMID 10322114.
- ^ Zhang D, Paley AJ, Childs G (июль 1998). «Транскрипционный репрессор ZFM1 взаимодействует с EWS и модулирует его способность активировать транскрипцию». J. Biol. Chem . 273 (29): 18086–91. doi : 10.1074/jbc.273.29.18086 . PMID 9660765.
- ^ Knoop LL, Baker SJ (август 2000 г.). «Фактор сплайсинга U1C подавляет трансактивацию, опосредованную EWS/FLI». J. Biol. Chem . 275 (32): 24865–71. doi : 10.1074/jbc.M001661200 . PMID 10827180.
- ^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С., Лламосас Е., Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.И., Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М (октябрь 2005 г.). «К карте белково-белкового взаимодействия человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R. doi : 10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Дальнейшее чтение
- Ohno T, Rao VN, Reddy ES (декабрь 1993 г.). «Химерный белок EWS/Fli-1 является активатором транскрипции». Cancer Res . 53 (24): 5859–63. PMID 7503813.
- Ouchida M, Ohno T, Fujimura Y, Rao VN, Reddy ES (сентябрь 1995 г.). «Потеря опухолеобразующей способности клеток саркомы Юинга, экспрессирующих антисмысловую РНК к транскриптам слияния EWS». Онкоген . 11 (6): 1049–54. PMID 7566963.
- Ban J, Siligan C, Kreppel M, Aryee D, Kovar H (2006). "Ews-Fli1 в саркоме Юинга: реальные цели и сопутствующий ущерб". Новые тенденции в онкологии в 21 веке . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том 587. С. 41–52. doi :10.1007/978-1-4020-5133-3_4. ISBN 978-1-4020-4966-8. PMID 17163154.
- Мейстер Х.П. (1976). «[Морфологические данные о хроническом запоре в детстве]». Monatsschrift für Kinderheilkunde . 124 (5): 354–6. ПМИД 934118.
- Guthrie GM, Verstraete A, Deines MM, Stern RM (1975). «Симптомы стресса в четырех обществах». Журнал социальной психологии . 95 (Вторая половина): 165–72. doi :10.1080/00224545.1975.9918699. PMID 1127890.
- Bhagirath T, Abe S, Nojima T, Yoshida MC (1995). «Молекулярный анализ соединения транслокации at(11;22) в случае саркомы Юинга». Гены Хромосомы Рак . 13 (2): 126–32. doi :10.1002/gcc.2870130209. PMID 7542907. S2CID 36929552.
- Ohno T, Ouchida M, Lee L, Gatalica Z, Rao VN, Reddy ES (1994). «Ген EWS, вовлеченный в семейство опухолей Юинга, злокачественную меланому мягких тканей и десмопластические мелкокруглоклеточные опухоли, кодирует РНК-связывающий белок с новыми регуляторными доменами». Oncogene . 9 (10): 3087–97. PMID 8084618.
- Маруяма К, Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Plougastel B, Zucman J, Peter M, Thomas G, Delattre O (1994). «Геномная структура гена EWS и ее связь с EWSR1, сайтом транслокации хромосом, ассоциированной с опухолью». Genomics . 18 (3): 609–15. doi :10.1016/S0888-7543(05)80363-5. PMID 8307570.
- Zucman J, Delattre O, Desmaze C, Epstein AL, Stenman G, Speleman F, Fletchers CD, Aurias A, Thomas G (1993). "Слияние генов EWS и ATF-1, вызванное транслокацией t(12;22) при злокачественной меланоме мягких тканей". Nat. Genet . 4 (4): 341–5. doi :10.1038/ng0893-341. PMID 8401579. S2CID 10944105.
- Brodie SG, Stocker SJ, Wardlaw JC, Duncan MH, McConnell TS, Feddersen RM, Williams TM (1996). «Слияние генов EWS и WT-1 при десмопластической мелкокруглоклеточной опухоли живота». Hum. Pathol . 26 (12): 1370–4. doi :10.1016/0046-8177(95)90303-8. PMID 8522311.
- Fujimura Y, Ohno T, Siddique H, Lee L, Rao VN, Reddy ES (1996). «Ген EWS-ATF-1, участвующий в злокачественной меланоме мягких тканей с транслокацией хромосомы t(12;22), кодирует конститутивный транскрипционный активатор». Oncogene . 12 (1): 159–67. PMID 8552387.
- Clark J, Benjamin H, Gill S, Sidhar S, Goodwin G, Crew J, Gusterson BA, Shipley J, Cooper CS (1996). «Слияние гена EWS с CHN, членом суперсемейства генов стероидных/тиреоидных рецепторов, в миксоидной хондросаркоме человека». Oncogene . 12 (2): 229–35. PMID 8570200.
- Magnaghi-Jaulin L, Masutani H, Robin P, Lipinski M, Harel-Bellan A (1996). "Элементы SRE являются сайтами связывания для белка слияния EWS-FLI-1". Nucleic Acids Res . 24 (6): 1052–8. doi :10.1093/nar/24.6.1052. PMC 145748. PMID 8604338 .
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
- Aman P, Panagopoulos I, Lassen C, Fioretos T, Mencinger M, Toresson H, Höglund M, Forster A, Rabbitts TH, Ron D, Mandahl N, Mitelman F (1997). "Шаблоны экспрессии генов FUS и EWS, ассоциированных с саркомой человека, и геномная структура FUS". Genomics . 37 (1): 1–8. doi : 10.1006/geno.1996.0513 . PMID 8921363.
- Morohoshi F, Arai K, Takahashi EI, Tanigami A, Ohki M (1997). «Клонирование и картирование гена RBP56 человека, кодирующего предполагаемый связывающий РНК белок, аналогичный белкам FUS/TLS и EWS». Genomics . 38 (1): 51–7. doi :10.1006/geno.1996.0591. PMID 8954779.
- Zucman-Rossi J, Legoix P, Thomas G (1997). «Идентификация новых членов семейств Gas2 и Ras в области хромосомы 22q12». Genomics . 38 (3): 247–54. doi :10.1006/geno.1996.0625. PMID 8975699.
- Guinamard R, Fougereau M, Seckinger P (1997). «Домен SH3 тирозинкиназы Брутона взаимодействует с Vav, Sam68 и EWS». Scand. J. Immunol . 45 (6): 587–95. doi :10.1046/j.1365-3083.1997.d01-447.x. PMID 9201297. S2CID 23303841.
- Deloulme JC, Prichard L, Delattre O, Storm DR (1997). «Проонкопротеин EWS связывает кальмодулин и фосфорилируется протеинкиназой C через домен IQ». J. Biol. Chem . 272 (43): 27369–77. doi : 10.1074/jbc.272.43.27369 . PMID 9341188.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Конструирование и характеристика библиотеки кДНК с полной длиной и обогащенной 5'-концом». Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Внешние ссылки