Взаимодействие хозяина и патогена определяется как то, как микробы или вирусы поддерживают себя в организмах-хозяевах на молекулярном, клеточном, организменном или популяционном уровне. Этот термин чаще всего используется для обозначения болезнетворных микроорганизмов , хотя они могут не вызывать заболевания у всех хозяев. [1] Из-за этого определение было расширено до того, как известные патогены выживают в своем хозяине , независимо от того, вызывают ли они заболевание или нет.
На молекулярном и клеточном уровне микробы могут инфицировать хозяина и быстро делиться, вызывая болезнь, находясь там и вызывая гомеостатический дисбаланс в организме, или выделяя токсины, которые вызывают появление симптомов. Вирусы также могут инфицировать хозяина вирулентной ДНК, которая может влиять на нормальные клеточные процессы ( транскрипция , трансляция и т. д.), сворачивание белка или уклонение от иммунного ответа . [2]
Одним из первых патогенов, обнаруженных учеными, был Vibrio cholerae , подробно описанный Филиппо Пачини в 1854 году. Его первоначальные открытия представляли собой лишь рисунки бактерий, но вплоть до 1880 года он опубликовал множество других работ, посвященных этим бактериям. Он описал, как они вызывают диарею, а также разработал эффективные методы лечения против них. Большинство этих открытий оставались незамеченными, пока Роберт Кох не открыл этот организм заново в 1884 году и не связал его с болезнью.
Giardia lamblia была открыта Левенгуком в 1600-х годах[2][3],но не была признана патогенной до 1970-х годов,когда был проведен симпозиум, спонсируемый EPA, после крупной вспышки в Орегоне, связанной с этим паразитом. С тех пор многие другие организмы были идентифицированы как патогены, такие какH. pyloriиE. coli, что позволило ученым разработать антибиотики для борьбы с этими вредными микроорганизмами.
Возбудителями заболеваний являются бактерии , грибки , простейшие , паразитические черви (гельминты) и вирусы .
Каждый из этих различных типов организмов может быть далее классифицирован как патоген на основе его способа передачи. Это включает в себя следующее: пищевой, воздушно-капельный, водный, передающийся через кровь и переносимый через переносчиков. Многие патогенные бактерии, такие как пищевые Staphylococcus aureus и Clostridium botulinum , выделяют токсины в хозяина, вызывая симптомы. ВИЧ и гепатит B являются вирусными инфекциями, вызываемыми патогенами, передающимися через кровь. Aspergillus , наиболее распространенный патогенный гриб, выделяет афлатоксин , который действует как канцероген и загрязняет многие продукты, особенно те, которые выращиваются под землей (орехи, картофель и т. д.). [4]
Внутри хозяина патогены могут выполнять различные действия, вызывая заболевание и запуская иммунный ответ.
Микробы и грибки вызывают симптомы из-за их высокой скорости размножения и проникновения в ткани. Это вызывает иммунный ответ, приводящий к общим симптомам, поскольку фагоциты разрушают бактерии внутри хозяина.
Некоторые бактерии, такие как H. pylori , могут выделять токсины в окружающие ткани, что приводит к гибели клеток или угнетению нормальной функции тканей.
Однако вирусы используют совершенно другой механизм для возникновения заболевания. При попадании в хозяина они могут сделать одно из двух. Во многих случаях вирусные патогены входят в литический цикл; это когда вирус вставляет свою ДНК или РНК в клетку хозяина, реплицируется и в конечном итоге заставляет клетку лизироваться, высвобождая больше вирусов в окружающую среду. Однако лизогенный цикл — это когда вирусная ДНК включается в геном хозяина, что позволяет ей оставаться незамеченной иммунной системой. В конце концов, она реактивируется и входит в литический цикл, давая ей, так сказать, неопределенный «срок годности». [5]
Существует три типа взаимодействия хозяина и патогена, основанных на том, как патоген взаимодействует с хозяином. Комменсализм — это когда патоген получает выгоду, а хозяин ничего не получает от взаимодействия. Примером этого является Bacteroides thetaiotaomicron, который находится в кишечном тракте человека, но не дает никаких известных преимуществ. [6] Мутуализм возникает, когда и патоген, и хозяин получают выгоду от взаимодействия, как это наблюдается в желудке человека. Многие из бактерий помогают расщеплять питательные вещества для хозяина, и взамен наши тела выступают в качестве его экосистемы. [7] Паразитизм возникает, когда патоген получает выгоду от отношений, а хозяину наносится вред. Это можно увидеть на примере одноклеточного паразита Plasmodium falciparum , который вызывает малярию у людей. [8]
Хотя патогены действительно способны вызывать заболевания, они не всегда это делают. Это описывается как патогенность, зависящая от контекста. Ученые полагают, что эта изменчивость обусловлена как генетическими, так и экологическими факторами внутри хозяина. Одним из примеров этого у людей является E. coli . Обычно эта бактерия процветает как часть нормальной, здоровой микробиоты в кишечнике. Однако, если она перемещается в другую область пищеварительного тракта или тела, она может вызвать сильную диарею. Таким образом, хотя E. coli классифицируется как патоген, но она не всегда действует как таковой. [9] Этот пример также можно применить к S. aureus и другой распространенной микробной флоре у людей.
В настоящее время противомикробные препараты являются основным методом лечения патогенов. Эти препараты специально разработаны для уничтожения микробов или подавления дальнейшего роста в среде хозяина. Для описания противомикробных препаратов можно использовать несколько терминов. Антибиотики — это химические вещества, вырабатываемые микробами, которые могут использоваться против других патогенов, например, пенициллин и эритромицин. Полусинтетические — это противомикробные препараты, которые получены из бактерий, но они улучшены для большего эффекта. В отличие от них обоих, синтетические производятся строго в лабораторных условиях для борьбы с патогенностью. Каждый из этих трех типов противомикробных препаратов можно разделить на две последующие группы: бактерицидные и бактериостатические. Бактерицидные вещества убивают микроорганизмы, в то время как бактериостатические вещества подавляют рост микробов. [10]
Основная проблема патогенной лекарственной терапии в современном мире — это лекарственная устойчивость. Многие пациенты не принимают полный курс лечения препаратами, что приводит к естественному отбору резистентных бактерий. Одним из примеров является метициллин-резистентный золотистый стафилококк ( MRSA ). Из-за чрезмерного использования антибиотиков выживают только те бактерии, которые развили генетические мутации для борьбы с препаратом. Это снижает эффективность лекарств и делает многие методы лечения бесполезными. [11]
Благодаря сетевому анализу взаимодействий хозяина и патогена и масштабному анализу данных секвенирования РНК из инфицированных клеток хозяина [12] мы знаем, что белки патогена, вызывающие обширную перестройку интерактома хозяина , оказывают большее влияние на приспособленность патогена во время инфекции. Эти наблюдения предполагают, что хабы в интерактоме хозяина и патогена следует исследовать в качестве перспективных целей для разработки антимикробных препаратов. [13] Двойная протеомика также может быть использована для изучения взаимодействий хозяина и патогена путем одновременной количественной оценки белков, вновь синтезированных хозяином и патогеном. [14] В настоящее время многие ученые стремятся понять генетическую изменчивость и то, как она способствует взаимодействию патогенов и изменчивости внутри хозяина. Они также стремятся ограничить методы передачи для многих патогенов, чтобы предотвратить быстрое распространение среди хозяев. По мере того, как мы узнаем больше о взаимодействии хозяина и патогена и степени изменчивости внутри хозяев, [15] определение взаимодействия должно быть переопределено. Касадеваль предлагает определять патогенность на основе объема ущерба, нанесенного хозяину, классифицируя патогены по различным категориям в зависимости от того, как они функционируют в хозяине. [16] Однако для того, чтобы справиться с изменяющейся патогенной средой, необходимо пересмотреть методы лечения, чтобы иметь дело с микробами, устойчивыми к лекарственным препаратам.