stringtranslate.com

Проект «Микробиом человека»

Проект «Микробиом человека» ( HMP ) был исследовательской инициативой Национального института здравоохранения США (NIH) по улучшению понимания микробиоты , участвующей в здоровье и болезнях человека. Запущенная в 2007 году, [1] первая фаза (HMP1) была сосредоточена на идентификации и характеристике микробиоты человека. Вторая фаза, известная как Интегративный проект микробиома человека (iHMP), была запущена в 2014 году с целью создания ресурсов для характеристики микробиома и выяснения роли микробов в состоянии здоровья и болезней. Программа получила 170 миллионов долларов США в виде финансирования от Общего фонда NIH с 2007 по 2016 год. [2]

Важными компонентами HMP были культурно-независимые методы характеристики микробного сообщества , такие как метагеномика (которая обеспечивает широкую генетическую перспективу отдельного микробного сообщества), а также обширное секвенирование всего генома (которое обеспечивает «глубокую» генетическую перспективу определенных аспектов данного микробного сообщества, т. е. отдельных видов бактерий). Последние служили в качестве референтных геномных последовательностей — в настоящее время планируется 3000 таких последовательностей отдельных бактериальных изолятов — для целей сравнения во время последующего метагеномного анализа. Проект также финансировал глубокое секвенирование бактериальных последовательностей 16S рРНК , амплифицированных с помощью полимеразной цепной реакции от людей. [3]

Введение

Изображение распространенности различных классов бактерий на выбранных участках кожи человека

До запуска HMP в популярных СМИ и научной литературе часто сообщалось, что в организме человека примерно в 10 раз больше микробных клеток и в 100 раз больше микробных генов, чем человеческих клеток; эта цифра была основана на оценках, что микробиом человека включает около 100 триллионов бактериальных клеток, а у взрослого человека обычно около 10 триллионов человеческих клеток. [4] В 2014 году Американская академия микробиологии опубликовала FAQ, в котором подчеркивалось, что количество микробных клеток и количество человеческих клеток являются оценками, и отмечалось, что недавние исследования пришли к новой оценке количества человеческих клеток — около 37 триллионов клеток, что означает, что соотношение микробных и человеческих клеток, вероятно, составляет около 3:1. [4] [5] В 2016 году другая группа опубликовала новую оценку соотношения, которая составляет примерно 1:1 (1,3:1, с «неопределенностью 25% и вариацией 53% по сравнению с популяцией стандартных мужчин весом 70 кг»). [6] [7]

Несмотря на ошеломляющее количество микробов в организме человека и на нем, мало что было известно об их роли в здоровье и болезнях человека. Многие из организмов, составляющих микробиом, не были успешно культивированы , идентифицированы или иным образом охарактеризованы. Однако организмы, которые, как считается , находятся в микробиоме человека, можно в целом отнести к категориям бактерий , членов домена Archaea , дрожжей и одноклеточных эукариот , а также различных гельминтов и вирусов , причем последние включают вирусы, которые заражают организмы клеточного микробиома (например, бактериофаги ). HMP поставила перед собой задачу обнаружить и охарактеризовать микробиом человека, уделяя особое внимание оральным, кожным, вагинальным, желудочно-кишечным и респираторным участкам.

HMP будет решать некоторые из самых вдохновляющих, раздражающих и фундаментальных научных вопросов сегодня. Важно, что он также имеет потенциал сломать искусственные барьеры между медицинской микробиологией и микробиологией окружающей среды. Есть надежда, что HMP не только определит новые способы определения здоровья и предрасположенности к заболеваниям, но и определит параметры, необходимые для разработки, внедрения и мониторинга стратегий преднамеренного манипулирования микробиотой человека, чтобы оптимизировать ее работу в контексте физиологии человека. [8]

HMP был описан как «логическое концептуальное и экспериментальное расширение проекта генома человека ». [8] В 2007 году HMP был включен в Дорожную карту медицинских исследований NIH [9] как один из новых путей к открытию . Организованная характеристика человеческого микробиома также проводится на международном уровне под эгидой Международного консорциума по микробиому человека. [10] Канадские институты исследований в области здравоохранения через Институт инфекции и иммунитета CIHR возглавляют Канадскую инициативу по микробиому для разработки скоординированных и целенаправленных исследовательских усилий по анализу и характеристике микробов, которые колонизируют организм человека, и их потенциального изменения во время хронических заболеваний. [11]

Учреждения, оказывающие содействие

В HMP приняли участие многие исследовательские институты, включая Стэнфордский университет , Институт Брода , Университет Содружества Вирджинии , Вашингтонский университет , Северо-Восточный университет , Массачусетский технологический институт , Медицинский колледж Бейлора и многие другие. Вклады включали оценку данных, построение наборов данных референтных последовательностей, этические и правовые исследования, разработку технологий и многое другое. [ необходима ссылка ]

Фаза первая (2007-2014)

HMP1 включал в себя исследовательские работы многих учреждений. [12] HMP1 ставил следующие цели: [13]

Второй этап (2014-2016)

В 2014 году NIH запустил вторую фазу проекта, известную как Интегративный проект человеческого микробиома (iHMP). Целью iHMP было создание ресурсов для создания полной характеристики человеческого микробиома с акцентом на понимание присутствия микробиоты в здоровых и болезненных состояниях. [14] Миссия проекта, как заявил NIH, была следующей:

iHMP создаст интегрированные продольные наборы данных биологических свойств как микробиома, так и хозяина на основе трех различных когортных исследований состояний, связанных с микробиомом, с использованием нескольких «омических» технологий. [14]

Проект включал три подпроекта, реализованных в нескольких учреждениях. Методы исследования включали профилирование гена 16S рРНК , секвенирование всего метагенома методом дробовика , секвенирование всего генома , метатранскриптомику , метаболомику / липидомику и иммунопротеомику . Основные выводы iHMP были опубликованы в 2019 году. [15]

Беременность и преждевременные роды

Команда Vaginal Microbiome Consortium в Virginia Commonwealth University провела исследование по проекту Pregnancy & Preterm Birth с целью понять, как микробиом изменяется в течение гестационного периода и влияет на неонатальный микробиом. Проект также был посвящен роли микробиома в возникновении преждевременных родов, которые, по данным CDC , составляют почти 10% всех родов [16] и являются второй по значимости причиной неонатальной смерти. [17] Проект получил 7,44 млн долларов США в виде финансирования от NIH. [18]

Начало воспалительного заболевания кишечника (ВЗК)

Команда Inflammatory Bowel Disease Multi'omics Data (IBDMDB) была многопрофильной группой исследователей, сосредоточенных на понимании того, как микробиом кишечника изменяется в продольном направлении у взрослых и детей, страдающих от ВЗК . ВЗК — это воспалительное аутоиммунное заболевание , которое проявляется либо болезнью Крона , либо язвенным колитом и поражает около миллиона американцев. [19] Участниками исследования были когорты из Массачусетской больницы общего профиля , Университетской больницы Эмори / Детской больницы Цинциннати и Медицинского центра Cedars-Sinai . [20]

Начало сахарного диабета 2 типа (СД2)

Исследователи из Стэнфордского университета и Лаборатории геномной медицины Джексона работали вместе, чтобы провести продольный анализ биологических процессов, которые происходят в микробиоме пациентов с риском развития диабета 2 типа . T2D поражает почти 20 миллионов американцев, из которых не менее 79 миллионов находятся в преддиабетическом состоянии [21] , и частично характеризуется выраженными сдвигами в микробиоме по сравнению со здоровыми людьми. Целью проекта было выявление молекул и сигнальных путей, которые играют роль в этиологии заболевания. [22]

Достижения

Влияние HMP на сегодняшний день может быть частично оценено путем изучения исследований, спонсируемых HMP. Более 650 рецензируемых публикаций были перечислены на веб-сайте HMP с июня 2009 года по конец 2017 года и были процитированы более 70 000 раз. [23] На данный момент веб-сайт был заархивирован и больше не обновляется, хотя наборы данных продолжают быть доступными. [24]

Основные категории работ, финансируемых HMP, включают:

Разработки, финансируемые HMP, включают:

Вехи

Создана справочная база данных

13 июня 2012 года директор NIH Фрэнсис Коллинз объявил о важном событии в рамках HMP . [51] Объявление сопровождалось серией скоординированных статей, опубликованных в Nature [52] [53] и нескольких журналах, включая Public Library of Science (PLoS) в тот же день. [54] [55] [56] Картографируя нормальный микробный состав здоровых людей с использованием методов секвенирования генома, исследователи HMP создали справочную базу данных и границы нормальной микробной изменчивости у людей. [57]

У 242 здоровых добровольцев из США было собрано более 5000 образцов тканей из 15 (мужчин) и 18 (женщин) участков тела, таких как рот, нос, кожа, нижняя часть кишечника (стул) и влагалище. Вся ДНК, человеческая и микробная, была проанализирована с помощью машин для секвенирования ДНК. Данные о микробном геноме были извлечены путем идентификации специфической для бактерий рибосомальной РНК, 16S рРНК . Исследователи подсчитали, что в экосистеме человека обитает более 10 000 видов микробов, и они идентифицировали 81–99% родов . Помимо создания справочной базы данных микробиома человека, проект HMP также обнаружил несколько «сюрпризов», в том числе: [ необходима цитата ]

Клиническое применение

Среди первых клинических приложений, использующих данные HMP, как сообщалось в нескольких статьях PLoS, исследователи обнаружили сдвиг к меньшему видовому разнообразию в вагинальном микробиоме беременных женщин, готовящихся к родам, и высокую вирусную нагрузку ДНК в носовом микробиоме детей с необъяснимой лихорадкой. Другие исследования, использующие данные и методы HMP, включают роль микробиома в различных заболеваниях пищеварительного тракта, кожи, репродуктивных органов и детских расстройствах. [51]

Фармацевтическое применение

Фармацевтические микробиологи рассмотрели значение данных HMP в отношении наличия/отсутствия «нежелательных» микроорганизмов в нестерильных фармацевтических продуктах и ​​в отношении мониторинга микроорганизмов в контролируемых средах, в которых производятся продукты. Последнее также имеет значение для выбора среды и исследований эффективности дезинфицирующих средств. [58]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ «Проект микробиома человека: разнообразие микробов человека больше, чем предполагалось ранее». ScienceDaily . Получено 8 марта 2012 г.
  2. ^ "Проект микробиома человека - Главная | Общий фонд NIH". commonfund.nih.gov . 28 июня 2013 г. Получено 15 апреля 2018 г.
  3. ^ "Проект микробиома человека". NIH Common Fund . Получено 8 марта 2012 г.
  4. ^ ab Американская академия микробиологии FAQ: Микробиом человека Архивировано 31 декабря 2016 г. на Wayback Machine Январь 2014 г.
  5. ↑ Джуда Л. Роснер для журнала Microbe Magazine, февраль 2014 г. В десять раз больше микробных клеток, чем клеток тела у людей?
  6. ^ Элисон Эбботт для Nature News. 8 января 2016 г. Ученые развенчивают миф о том, что в наших телах больше бактерий, чем человеческих клеток.
  7. ^ Sender R, Fuchs S, Milo R (январь 2016 г.). «Действительно ли мы значительно уступаем по численности? Пересматривая соотношение бактериальных и хозяйских клеток у людей». Cell . 164 (3): 337–40. doi : 10.1016/j.cell.2016.01.013 . PMID  26824647.
  8. ^ ab Turnbaugh PJ, Ley RE, Hamady M, Fraser-Liggett CM, Knight R, Gordon JI (октябрь 2007 г.). «Проект человеческого микробиома». Nature . 449 (7164): 804–10. Bibcode :2007Natur.449..804T. doi :10.1038/nature06244. PMC 3709439 . PMID  17943116. 
  9. ^ "О дорожной карте NIH". Общий фонд NIH. Архивировано из оригинала 17 февраля 2013 года . Получено 8 марта 2012 года .
  10. ^ "Международный консорциум по микробиому человека" . Получено 8 марта 2012 г.
  11. ^ "Канадская инициатива микробиома". Канадские институты исследований в области здравоохранения. 13 августа 2009 г. Получено 8 марта 2012 г.
  12. ^ "Проект микробиома человека / Финансируемые исследования". Общий фонд NIH . Получено 8 марта 2012 г.
  13. ^ "Human Microbiome Project / Program Initiatives". The NIH Common Fund. Архивировано из оригинала 16 ноября 2013 года . Получено 8 марта 2012 года .
  14. ^ ab "Проект NIH Human Microbiome - О человеческом микробиоме". hmpdacc.org . Получено 2018-03-30 .
  15. ^ Группа анализа портфолио микробиома человека NIH (2019). «Обзор 10 лет исследований микробиома человека в Национальных институтах здравоохранения США, финансовые годы 2007-2016». Микробиом . 7 (1): 31. doi : 10.1186/s40168-019-0620-y . ISSN  2049-2618. PMC 6391833. PMID  30808411 . 
  16. ^ Ferré C, Callaghan W, Olson C, Sharma A, Barfield W (ноябрь 2016 г.). «Влияние возраста матери и показателей преждевременных родов в зависимости от возраста на общие показатели преждевременных родов — США, 2007 и 2014 гг.». MMWR. Еженедельный отчет о заболеваемости и смертности . 65 (43): 1181–1184. doi : 10.15585/mmwr.mm6543a1 . PMID  27811841.
  17. ^ "Детская смертность | Здоровье матери и ребенка | Репродуктивное здоровье | CDC". www.cdc.gov . 2018-01-02 . Получено 2018-04-03 .
  18. ^ Консорциум, VCU, Вагинальный микробиом. "Вагинальный микробиом Консорциум". vmc.vcu.edu . Получено 2018-04-05 .{{cite web}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  19. ^ "CDC - Эпидемиология ВЗК - Воспалительное заболевание кишечника". www.cdc.gov . Архивировано из оригинала 2017-02-23 . Получено 2018-04-15 .
  20. ^ "Команда". ibdmdb.org . Получено 2018-04-05 .
  21. ^ "Национальный статистический отчет по диабету | Данные и статистика | Диабет | CDC". www.cdc.gov . 2018-03-09 . Получено 2018-04-15 .
  22. ^ "Интегрированное персональное омическое профилирование | Интегрированное персональное омическое профилирование | Стэнфордская медицина". med.stanford.edu . Получено 05.04.2018 .
  23. ^ "Проект микробиома человека - Главная | Общий фонд NIH". commonfund.nih.gov . 28 июня 2013 г. Получено 18 апреля 2019 г.
  24. ^ "Портал данных проекта микробиома человека". portal.hmpdacc.org . Получено 18.04.2019 .
  25. ^ Markowitz VM, Chen IM, Palaniappan K, Chu K, Szeto E, Grechkin Y, Ratner A, Jacob B, Huang J, Williams P, Huntemann M, Anderson I, Mavromatis K, Ivanova NN, Kyrpides NC (январь 2012 г.). "IMG: интегрированная база данных микробных геномов и система сравнительного анализа". Nucleic Acids Research . 40 (выпуск базы данных): D115–22. doi :10.1093/nar/gkr1044. PMC 3245086. PMID  22194640 . 
  26. ^ Markowitz VM, Chen IM, Chu K, Szeto E, Palaniappan K, Grechkin Y, Ratner A, Jacob B, Pati A, Huntemann M, Liolios K, Pagani I, Anderson I, Mavromatis K, Ivanova NN, Kyrpides NC (январь 2012 г.). "IMG/M: интегрированная система управления метагеномными данными и сравнительного анализа". Nucleic Acids Research . 40 (выпуск базы данных): D123–9. doi :10.1093/nar/gkr975. PMC 3245048. PMID  22086953 . 
  27. ^ Madupu R, Richter A, Dodson RJ, Brinkac L, Harkins D, Durkin S, Shrivastava S, Sutton G, Haft D (январь 2012 г.). "CharProtDB: база данных экспериментально охарактеризованных аннотаций белков". Nucleic Acids Research . 40 (выпуск базы данных): D237–41. doi :10.1093/nar/gkr1133. PMC 3245046. PMID  22140108 . 
  28. ^ Pagani I, Liolios K, Jansson J, Chen IM, Smirnova T, Nosrat B, Markowitz VM, Kyrpides NC (январь 2012 г.). «База данных Genomes OnLine (GOLD) v.4: статус геномных и метагеномных проектов и связанных с ними метаданных». Nucleic Acids Research . 40 (выпуск базы данных): D571–9. doi :10.1093/nar/gkr1100. PMC 3245063. PMID 22135293  . 
  29. ^ Zhao Y, Tang H, Ye Y (январь 2012 г.). «RAPSearch2: быстрый и экономящий память инструмент поиска сходства белков для данных секвенирования следующего поколения». Биоинформатика . 28 (1): 125–6. doi :10.1093/bioinformatics/btr595. PMC 3244761. PMID  22039206 . 
  30. ^ Stombaugh J, Widmann J, McDonald D, Knight R (июнь 2011 г.). «Boulder ALignment Editor (ALE): веб-инструмент для выравнивания РНК». Bioinformatics . 27 (12): 1706–7. doi :10.1093/bioinformatics/btr258. PMC 3106197 . PMID  21546392. 
  31. ^ Wu S, Zhu Z, Fu L, Niu B, Li W (сентябрь 2011 г.). "WebMGA: настраиваемый веб-сервер для быстрого анализа метагеномной последовательности". BMC Genomics . 12 : 444. doi : 10.1186/1471-2164-12-444 . PMC 3180703 . PMID  21899761. 
  32. ^ Ghodsi M, Liu B, Pop M (июнь 2011 г.). «DNACLUST: точная и эффективная кластеризация генов филогенетических маркеров». BMC Bioinformatics . 12 : 271. doi : 10.1186/1471-2105-12-271 . PMC 3213679. PMID  21718538 . 
  33. ^ Yao G, Ye L, Gao H, Minx P, Warren WC, Weinstock GM (январь 2012 г.). «Соответствие графов последовательностей следующего поколения». Биоинформатика . 28 (1): 13–6. doi :10.1093/bioinformatics/btr588. PMC 3244760. PMID  22025481 . 
  34. ^ Treangen TJ, Sommer DD, Angly FE, Koren S, Pop M (март 2011). Сборка последовательности следующего поколения с AMOS . Том. Глава 11. стр. Раздел 11.8. doi :10.1002/0471250953.bi1108s33. ISBN 978-0471250951. PMC  3072823 . PMID  21400694. {{cite book}}: |journal=проигнорировано ( помощь )
  35. ^ Koren S, Miller JR, Walenz BP, Sutton G (сентябрь 2010 г.). «Алгоритм автоматического закрытия во время сборки». BMC Bioinformatics . 11 : 457. doi : 10.1186/1471-2105-11-457 . PMC 2945939. PMID  20831800 . 
  36. ^ "Проект микробиома человека / Данные эталонных геномов". Центр анализа и координации данных (DACC) для Национальных институтов здравоохранения (NIH) . Получено 8 марта 2012 г.
  37. ^ "Data Analysis and Coordination Center (DACC)". National Institutes of Health (NIH) Common Fund . Получено 11 марта 2012 г.
  38. ^ Schwab AP, Frank L, Gligorov N (ноябрь 2011 г.). «Говоря о приватности, подразумевая конфиденциальность». Американский журнал биоэтики . 11 (11): 44–5. doi :10.1080/15265161.2011.608243. PMID  22047127. S2CID  34313782.
  39. ^ Rhodes R, Azzouni J, Baumrin SB, Benkov K, Blaser MJ, Brenner B, Dauben JW, Earle WJ, Frank L, Gligorov N, Goldfarb J, Hirschhorn K, Hirschhorn R, Holzman I, Indyk D, Jabs EW, Lackey DP, Moros DA, Philpott S, Rhodes ME, Richardson LD, Sacks HS, Schwab A, Sperling R, Trusko B, Zweig A (ноябрь 2011 г.). «De minimis risk: a proposal for a new category of research risk». Американский журнал биоэтики . 11 (11): 1–7. doi :10.1080/15265161.2011.615588. PMID  22047112. S2CID  205859554.
  40. ^ McGuire AL, Lupski JR (май 2010 г.). «Исследование персонального генома: что следует сказать участнику?». Trends in Genetics . 26 (5): 199–201. doi :10.1016/j.tig.2009.12.007. PMC 2868334. PMID 20381895  . 
  41. ^ Sharp RR, Achkar JP, Brinich MA, Farrell RM (апрель 2009 г.). «Помощь пациентам в осознанном выборе пробиотиков: необходимость в исследовании». Американский журнал гастроэнтерологии . 104 (4): 809–13. doi :10.1038/ajg.2008.68. PMC 2746707. PMID  19343022 . 
  42. ^ Cuellar-Partida G, Buske FA, McLeay RC, Whitington T, Noble WS, Bailey TL (январь 2012 г.). «Эпигенетические априорные данные для определения активных сайтов связывания факторов транскрипции». Биоинформатика . 28 (1): 56–62. doi :10.1093/bioinformatics/btr614. PMC 3244768. PMID  22072382 . 
  43. ^ Хафт ДХ (январь 2011 г.). «Биоинформатические доказательства широко распространенного, рибосомально продуцируемого предшественника переносчика электронов, его белков созревания и его никотинопротеиновых окислительно-восстановительных партнеров». BMC Genomics . 12 : 21. doi : 10.1186/1471-2164-12-21 . PMC 3023750. PMID  21223593 . 
  44. ^ Caporaso JG, Lauber CL, Costello EK, Berg-Lyons D, Gonzalez A, Stombaugh J, Knights D, Gajer P, Ravel J, Fierer N, Gordon JI, Knight R (2011). «Движущиеся изображения человеческого микробиома». Genome Biology . 12 (5): R50. doi : 10.1186/gb-2011-12-5-r50 . PMC 3271711. PMID  21624126 . 
  45. ^ Sczesnak A, Segata N, Qin X, Gevers D, Petrosino JF, Huttenhower C, Littman DR, Ivanov II (сентябрь 2011 г.). «Геном индуцирующих клетки th17 сегментированных нитчатых бактерий обнаруживает обширную ауксотрофию и адаптации к кишечной среде». Cell Host & Microbe . 10 (3): 260–72. doi :10.1016/j.chom.2011.08.005. PMC 3209701 . PMID  21925113. 
  46. ^ Ballal SA, Gallini CA, Segata N, Huttenhower C, Garrett WS (апрель 2011 г.). «Симбиотические факторы хозяина и микробиоты кишечника: уроки воспалительных заболеваний кишечника и успешных симбионтов». Cellular Microbiology . 13 (4): 508–17. doi :10.1111/j.1462-5822.2011.01572.x. PMID  21314883. S2CID  205529660.
  47. ^ Bergmann GT, Bates ST, Eilers KG, Lauber CL, Caporaso JG, Walters WA, Knight R, Fierer N (июль 2011 г.). «Недооцененное доминирование Verrucomicrobia в почвенных бактериальных сообществах». Soil Biology & Biochemistry . 43 (7): 1450–1455. doi :10.1016/j.soilbio.2011.03.012. PMC 3260529. PMID  22267877 . 
  48. ^ Yeoman CJ, Yildirim S, Thomas SM, Durkin AS, Torralba M, Sutton G, Buhay CJ, Ding Y, Dugan-Rocha SP, Muzny DM, Qin X, Gibbs RA, Leigh SR, Stumpf R, White BA, Highlander SK, Nelson KE, Wilson BA (август 2010 г.). Li W (ред.). "Сравнительная геномика штаммов Gardnerella vaginalis выявляет существенные различия в метаболическом и вирулентном потенциале". PLOS ONE . ​​5 (8): e12411. Bibcode :2010PLoSO...512411Y. doi : 10.1371/journal.pone.0012411 . PMC 2928729 . PMID  20865041. 
  49. ^ Koren O, Spor A, Felin J, Fåk F, Stombaugh J, Tremaroli V, Behre CJ, Knight R, Fagerberg B, Ley RE, Bäckhed F (март 2011 г.). «Микробиота полости рта, кишечника и бляшек у пациентов с атеросклерозом». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 Suppl 1 (Supplement_1): 4592–8. Bibcode : 2011PNAS..108.4592K. doi : 10.1073/pnas.1011383107 . PMC 3063583. PMID  20937873 . 
  50. ^ Marri PR, Paniscus M, Weyand NJ, Rendón MA, Calton CM, Hernández DR, Higashi DL, Sodergren E, Weinstock GM, Rounsley SD, So M (июль 2010 г.). Ahmed N (ред.). «Секвенирование генома выявляет широко распространенный обмен генами вирулентности среди видов Neisseria у человека». PLOS ONE . 5 (7): e11835. Bibcode : 2010PLoSO...511835M. doi : 10.1371/journal.pone.0011835 . PMC 2911385. PMID  20676376 . 
  51. ^ ab "Проект NIH Human Microbiome определяет нормальный состав бактерий в организме". NIH News. 13 июня 2012 г.
  52. ^ Human Microbiome Project Consortium (июнь 2012 г.). «Структура для исследования человеческого микробиома». Nature . 486 (7402): 215–21. Bibcode :2012Natur.486..215T. doi :10.1038/nature11209. PMC 3377744 . PMID  22699610. 
  53. ^ Human Microbiome Project Consortium (июнь 2012 г.). «Структура, функция и разнообразие здорового человеческого микробиома». Nature . 486 (7402): 207–14. Bibcode :2012Natur.486..207T. doi :10.1038/nature11234. PMC 3564958 . PMID  22699609. 
  54. ^ Cantarel BL, Lombard V, Henrissat B (2012). «Утилизация сложных углеводов здоровым микробиомом человека». PLOS ONE . 7 (6): e28742. Bibcode : 2012PLoSO...728742C. doi : 10.1371/journal.pone.0028742 . PMC 3374616. PMID  22719820 . 
  55. ^ Wu YW, Rho M, Doak TG, Ye Y (август 2012 г.). «Оральные спирохеты, вызывающие стоматологические заболевания, широко распространены у здоровых людей и несут чрезвычайно разнообразные кассеты генов интегронов». Applied and Environmental Microbiology . 78 (15): 5288–96. Bibcode :2012ApEnM..78.5288W. doi :10.1128/AEM.00564-12. PMC 3416431 . PMID  22635997. 
  56. ^ "PLOS Collections: Сборники статей, опубликованные Публичной научной библиотекой". collections.plos.org . Получено 15.04.2018 .
  57. ^ "Manuscript Summarys" (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 2014-03-04 . Получено 2012-11-06 .
  58. ^ Уайлдер, К., Сэндл Т., Саттон С. (июнь 2013 г.). «Влияние микробиома человека на фармацевтическую микробиологию». American Pharmaceutical Review .

Внешние ссылки