stringtranslate.com

домен NACHT

Домен NACHT является эволюционно консервативным белковым доменом . Этот домен NTPase обнаружен в белках апоптоза , а также в белках, участвующих в транскрипции MHC . [1] Его название отражает некоторые из белков, которые его содержат: NAIP ( белок-ингибитор апоптоза семейства NLP ), CIITA (то есть C2TA или активатор транскрипции MHC класса II ), HET-E (белок локуса несовместимости из Podospora anserina ) и TEP1 (то есть TP1 или белок, ассоциированный с теломеразой).

Домен NACHT содержит от 300 до 400 аминокислот . Это предсказанный домен нуклеозидтрифосфатазы (NTPase), который встречается в белках животных , грибов и бактерий . Он встречается в ассоциации с другими доменами, такими как домен рекрутирования каспазы ( InterProIPR001315 ), домен пирина ( InterProIPR004020 ), домен повтора HEAT ( InterProIPR004155 ), повтор WD40 ( InterProIPR001680 ), повтор, богатый лейцином (LRR) или повтор BIR ( InterProIPR001370 ). [1]

Домен NACHT состоит из семи отдельных консервативных мотивов, включая специфичную для АТФ/ГТФазы P-петлю, сайт связывания Mg 2+ ( мотивы Walker A и B соответственно) и пять более специфических мотивов. Уникальные особенности домена NACHT включают преобладание «крошечных» остатков (глицин, аланин или серин) непосредственно на С-конце Mg 2+ -координирующего аспартата в мотиве Walker B, вместо второго кислотного остатка, распространенного в других NTPases. Второй кислотный остаток обычно находится в белках, содержащих NACHT, на две позиции ниже. Кроме того, дистальный мотив VII содержит консервативный рисунок полярных, ароматических и гидрофобных остатков, который не наблюдается ни в одном другом семействе NTPase. [1]

Примеры

Человеческие белки, содержащие этот домен, включают:

Ссылки

  1. ^ abc Koonin EV, Aravind L (май 2000). "Семейство NACHT - новая группа предсказанных NTPases, вовлеченных в апоптоз и активацию транскрипции MHC". Trends in Biochemical Sciences . 25 (5): 223–4. doi :10.1016/S0968-0004(00)01577-2. PMID  10782090.
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR007111