stringtranslate.com

Гаплогруппа O-M119

В генетике человека гаплогруппа O-M119 — это гаплогруппа ДНК Y-хромосомы . Гаплогруппа O-M119 — это ветвь потомков гаплогруппы O-F265, также известной как O1a, один из двух сохранившихся первичных субкладов гаплогруппы O-M175 . Ранее этот же клад обозначался как O-MSY2.2. [6]

Происхождение

Считается, что ветвь гаплогруппы O-M119 развилась в период позднего плейстоцена ( верхний палеолит ) на территории материкового Китая. [ необходима цитата ]

Палеолитические миграции

Карафет и др. (2010) предполагают, что гаплогруппа O-M119 была частью модели колонизации из четырех фаз, в которой палеолитические миграции охотников-собирателей сформировали первичную структуру современного разнообразия Y-хромосомы Приморской Юго-Восточной Азии . Примерно в 5000 г. до н. э. гаплогруппа O-M119 объединилась в Сундаланде и мигрировала на север вплоть до Тайваня, где O-M50 составляет около 90% аборигенной Y-ДНК, являясь основной гаплогруппой, которая может быть напрямую связана с австронезийской экспансией в фазе 3.

Считается, что человек Ляндао, скелет которого возрастом 8000 лет и который был найден на острове Лян в Китайской Республике у побережья провинции Фуцзянь, принадлежит к гаплогруппе O-M119, а именно к ветви O-CTS5726. [7] [8]

Тайвань родина

Ли и др. (2008) пришли к выводу, что в отличие от гипотезы о родине на Тайване, островные жители Юго-Восточной Азии не имеют тайваньского происхождения на основе их отцовских линий. Согласно их результатам, линии в пределах Приморской Юго-Восточной Азии не произошли от тайваньских аборигенов, как предполагают лингвистические исследования. Тайваньские аборигены и индонезийцы, вероятно, произошли от популяций, говорящих на языке тай-кадай , на основе их отцовских линий и впоследствии развивались независимо друг от друга.

Самая сильная положительная корреляция между гаплогруппой O-M119 и этнолингвистической принадлежностью наблюдается между этой гаплогруппой и австронезийцами . Пиковая частота гаплогруппы O-M119 обнаружена среди аборигенов Тайваня, именно того региона, из которого, по гипотезе лингвистов, произошла австронезийская языковая семья . Немного более слабая корреляция наблюдается между гаплогруппой O-M119 и ханьскими китайскими популяциями южного Китая, а также между этой гаплогруппой и тай-кадай-говорящими популяциями южного Китая и Юго-Восточной Азии. Распространение языков тай-кадай в Таиланде и других частях Юго-Восточной Азии за пределами Китая долгое время считалось, по причинам традиционной лингвистической географии, отражением недавнего вторжения в Юго-Восточную Азию говорящих на этом языке популяций из юго-восточного Китая, а несколько повышенная частота гаплогруппы O-M119 среди популяций тай-кадай в сочетании с высокой частотой гаплогруппы O-M95, которая является генетической характеристикой австроазиатских говорящих народов Юго-Восточной Азии, позволяет предположить, что генетическая сигнатура родства народов тай-кадай с популяциями юго-восточного Китая была ослаблена из-за обширной ассимиляции более ранних австроазиатских жителей земель, на которые вторглись народы тай-кадай.

Распределение

Линии гаплогруппы O-M119 встречаются в основном в популяциях Юго-Восточной Азии в Малайзии , Вьетнаме , Индонезии , Филиппинах , Южном Китае и Тайване (ISOGG 2010). Высокие частоты этой гаплогруппы были обнаружены в популяциях, распространенных по дуге через Юго-Восточный Китай, Тайвань, Филиппины и Индонезию. Она была обнаружена с более низкой частотой в образцах из Океании, материковой части Юго-Восточной Азии, Юго-Западного Китая, Северо-Западного Китая, Северного Китая, Северо-Восточного Китая, Кореи, Японии, Северной Азии и Центральной Азии.

Исследование Ли 2008 года показало, что анализ примесей в популяциях, говорящих на языке тай-кадай, показал значительное генетическое влияние на большую часть индонезийцев. Большинство образцов популяции содержали высокую частоту гаплогруппы O-M119. [9]

Частоты гаплогруппы O-M119 среди различных восточноазиатских и австронезийских популяций указывают на сложную генетическую историю современных популяций хань южного Китая. [ требуется ссылка ] Хотя гаплогруппа O-M119 встречается только со средней частотой около 4% среди популяций хань северного Китая и народов юго-западного Китая и юго-восточной Азии, говорящих на тибето-бирманских языках , частота этой гаплогруппы среди популяций хань южного Китая почти в четыре раза выше и составляет около 15-23%. [10] Частота гаплогруппы O-M119 среди южных хань оказалась немного выше, чем среднее арифметическое частот гаплогруппы O-M119 среди северных хань и объединенной выборки австронезийских популяций. Это говорит о том, что современные популяции южной Хань могут иметь нетривиальное число предков мужского пола, которые изначально были связаны с какой-либо австронезийской культурой или, по крайней мере, имели некоторое генетическое родство со многими предками современных австронезийских народов. [11] [12]

Распределение субкладов

О-М119

Эта линия часто встречается у австронезийцев , южных китайцев хань и народов Кра-Дай . [13] Предполагается, что эта линия является маркером доисторической австронезийской экспансии, с возможным происхождением, охватывающим регионы вдоль юго-восточного побережья Китая и соседнего Тайваня , и встречается среди современных популяций Приморской Юго-Восточной Азии и Океании (Karafet 2005).

Также было обнаружено, что Y-хромосомы гаплогруппы O-M119 встречаются с низкой частотой среди различных популяций Сибири , таких как нивхи (одна из 17 исследованных Y-хромосом), ульчи / нанайцы (2/53), енисейские эвенки (1/31) и особенно буряты , проживающие в Саяно - Байкальском нагорье Иркутской области (6/13) (Лелл 2002).

О-П203

O-P203 был обнаружен у 86,7% (52/60) образца из Ниаса , 70,8% (34/48) тайваньских аборигенов, 28,4% (21/74) ментавайцев , 11,4% (73/641) балийцев, 9,8% (6/61) образца с Явы, 9,1% (36/394) образца с Флореса , 9,1% (15/165) китайцев хань, 8,3% (1/12) образца из Западного Самоа, 8,2% (4/49) туцзя из Хунани , 6,9% (4/58) мяо из Китая, 5,7% (4/70) вьетнамцев, 3,3% (1/30) образца с Молуккских островов , 3,1% (1/32) малазийцев, 3,0% (1/33) выборки из горной Папуа-Новой Гвинеи, 2,6% (1/38) выборки из Суматры, 2,3% (2/86) выборки из Борнео, 2,1% (1/48) филиппинцев, 2,0% (1/51) Шэ , 1,7% (1/60) Яо из Гуанси, 1,1% (1/92) выборки из Лембаты и 0,9% (3/350) выборки из Сумбы . [14]

В исследовании, опубликованном в 2011 году, O-P203 был обнаружен у 22,2% (37/167) мужчин-добровольцев из числа хань в Университете Фудань в Шанхае, чье происхождение можно проследить до Восточного Китая (Цзянсу, Чжэцзян, Шанхай или Аньхой), у 12,3% (8/65) мужчин-добровольцев из числа хань, чье происхождение можно проследить до Южного Китая , и у 1,6% (2/129) мужчин-добровольцев из числа хань, чье происхождение можно проследить до Северного Китая . [15]

О-М101

Эта линия была обнаружена у одного человека из Китая (Underhill 2000) и другого из Кота-Кинабалу (Hurles 2005).

Согласно веб-сайту китайской компании по генетическому тестированию 23mofang, O-M101 является субкладом O-M307/P203 (O-M307 > O-F446 > O-F5498 > O-Z23406 > O-M101). Его TMRCA , по оценкам, существовал 4850 лет назад, и, по оценкам, он составляет Y-ДНК приблизительно 0,21% всех мужчин в современном Китае, при этом его распределение относительно плотное в провинциях Хунань , Хубэй , Хайнань и Цзянси . [16] Субклад O-M101 > O-A5863 > O-SK1573 (TMRCA 3400 лн) по оценкам составляет Y-ДНК приблизительно 0,08% всех мужчин в современном Китае, будучи относительно сконцентрированным в Южно-центральном Китае и Юго-Западном Китае в настоящее время. [17] Субклад O-M101 > O-A5863 > O-Y163909 (TMRCA 4080 лн) наблюдался у 16,7% (3/18) выборки мужчин племени фуан из Центрального Таиланда . [18] [19]

О-М50

Эта линия встречается среди австронезийских народов Тайваня, Филиппин, Индонезии, Меланезии, Микронезии и Мадагаскара, а также среди некоторых популяций континентальной Юго-Восточной Азии и среди народов банту Коморских островов . [20] Она также была обнаружена у гавайцев . [21]

Исследование, опубликованное в 2005 году, обнаружило O-M50 у 33,3% (13/39) выборки аборигенов Тайваня, 18,2% (2/11) выборки людей в Маджуро , 17,1% (6/35) выборки малагасийцев , 9,2% (6/65) выборки людей в Кота-Кинабалу , 9,1% (2/22) выборки людей в Банджармасине , 3,6% (1/28) выборки людей на Филиппинах и 1,9% (1/52) выборки людей в Вануату . [22]

Кайзер и др. 2008 обнаружили O-M110 в 34,1% (14/41) образца тайваньских аборигенов, 17,7% (26/147) образца с островов Адмиралтейства, 17,3% (9/52) образца с островов Тробриан, 13,5% (5/37) образца с Филиппин, 9,7% (3/31) образца с островов Нуса-Тенгара, 3,8% (2/53) образца с Явы, 3,0% (1/33) образца с Молуккских островов, 2,5% (1/40) образца с Борнео, 1,0% (1/100) образца с Тувалу и 0,95% (1/105) образца с Фиджи. [23]

Исследование, опубликованное в 2010 году, выявило O-M110 у 18,8% (9/48) тайваньских аборигенов, 13,3% (8/60) Ниаса, 8,3% (4/48) Филиппин, 7,4% (4/54) Сулавеси, 6,3% ( 22/350) Сумба, 5,8% (5/86) Борнео, 3,3% (1/30) Молуккские острова, 2,3% (1/44) Маэво, Вануату, 1,6% (1/61) Ява, 1,4% (1/74) ) Ментавай и 0,8% (5/641) Бали. [24]

Исследование, опубликованное в 2012 году, обнаружило O-M110 у 4,6% (33/712) мужчин с Соломоновых Островов . [25]

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем наименования для филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместную статью, в которой было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремящегося прежде всего быть своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы в точке знакового дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему более старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

В создании дерева YCC приняли участие следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями.

Филогенетические деревья

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы O основано на дереве YCC 2008 (Karafet 2008) и последующих опубликованных исследованиях.

Смотрите также

Генетика

Y-ДНК O субклады

Доля O-M119 в различных образцах

Y-ДНК остовное дерево

Ссылки

Сноски

  1. ^ Моника Кармин, Родриго Флорес, Лаури Сааг и др. (2022), «Эпизоды диверсификации и изоляции в островных юго-восточноазиатских и ближнеокеанских мужских линиях». Mol. Biol. Evol. 39(3): msac045 doi:10.1093/molbev/msac045
  2. ^ Позник, Дж. Дэвид; Сюэ, Яли; Мендес, Фернандо Л; Виллемс, Томас Ф; Массайя, Андреа; Уилсон Сэйрес, Мелисса А; Аюб, Касим; Маккарти, Шейн А; и др. (июнь 2016 г.). «Периодические всплески демографии мужского пола, полученные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру». Природная генетика . 48 (6): 593–599. дои : 10.1038/ng.3559. hdl : 11858/00-001M-0000-002A-F024-C . ПМЦ 4884158 . ПМИД  27111036. 
  3. ^ Филогенетическое древо гаплогруппы O1-F75 на 23mofang
  4. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar as at au av aw ax ay az ba bb bc bd be bf bg bh bi bj bk bl bm bn bo bp bq br bs bt bu bv bw YПолная гаплогруппа YTree v6.03.19 от 24 июля 2018 г.
  5. ^ abcdefghijklmnopqrstu v Филогенетическое древо гаплогруппы O1a-M119 в 23mofang
  6. ^ https://isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpO.html: «MSY2.2 был удален из дерева, поскольку не обеспечивал надежных результатов».
  7. ^ http://www.taipeitimes.com/News/taiwan/archives/2014/12/13/2003606642%7Carchiveurl=https://web.arc hive.org/web/20200811140358/http://www.taipeitimes.com/News/taiwan/archives/2014/12/13/2003606642M
  8. ^ «Добро пожаловать в FamilyTreeDNA Discover».
  9. ^ (Ли и др. 2008)
  10. ^ Ян, Ши (сентябрь 2011 г.). «Обновленное дерево гаплогруппы O Y-хромосомы и пересмотренные филогенетические позиции мутаций P164 и PK4». European Journal of Human Genetics . 19 (9): 1013–5. doi :10.1038/ejhg.2011.64. PMC 3179364. PMID  21505448 . 
  11. ^ HUGO Pan-Asian SNP Consortium, HUGO Pan-Asian SNP Consortium (2009). «Картографирование генетического разнообразия человека в Азии». Science . 326 (5959): 1541–1545. Bibcode :2009Sci...326.1541.. doi :10.1126/science.1177074. PMID  20007900. S2CID  34341816.
  12. ^ HUGO Pan-Asian SNP Consortium, HUGO Pan-Asian SNP Consortium (2009). «Картографирование генетического разнообразия человека в Азии». Science . 326 (5959). Science Magazine: 1541–1545. Bibcode :2009Sci...326.1541.. doi :10.1126/science.1177074. PMID  20007900. S2CID  34341816 . Получено 11 декабря 2009 г. .
  13. ^ "Основное разделение Восток–Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы в Индонезии". Karafet et al. Архивировано из оригинала 2014-06-08 . Получено 15 мая 2010 .
  14. ^ Карафет, Татьяна (2010). «Основное разделение Восток–Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы в Индонезии». Молекулярная биология и эволюция . 27 (8): 1833–1844. doi : 10.1093/molbev/msq063 . PMID  20207712.
  15. ^ Ши Янь, Чуань-Чао Ван, Хуэй Ли, Ши-Линь Ли, Ли Цзинь и Генографический консорциум, «Обновлённое дерево гаплогруппы O Y-хромосомы и пересмотренные филогенетические позиции мутаций P164 и PK4». Европейский журнал генетики человека (2011) 19, 1013–1015; doi:10.1038/ejhg.2011.64; опубликовано онлайн 20 апреля 2011 г.
  16. ^ "O-M101单倍群详情".
  17. ^ "O-Sk1573单倍群详情".
  18. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa Wibhu Kutanan, Jatupol Kampuansai, Metawee Srikummool и др. (2019), "Сопоставление отцовской и материнской генетической истории тайского и лаосского населения". Mol. Biol. Evol. Advance Access, публикация 12 апреля 2019 г. doi:10.1093/molbev/msz083
  19. ^ Филогенетическое дерево гаплогруппы O-M119 на TheYtree
  20. ^ Msaidie, Said; Ducourneau, Axel; Boetsch, Gilles; Longepied, Guy; Papa, Kassim; Allibert, Claude; Yahaya, Ali Ahmed; Chiaroni, Jacques; Mitchell, Michael J (январь 2011 г.). «Генетическое разнообразие на Коморских островах показывает, что раннее мореплавание является основным фактором биокультурной эволюции человека в западной части Индийского океана». European Journal of Human Genetics . 19 (1): 89–94. doi :10.1038/ejhg.2010.128. PMC 3039498. PMID  20700146 . 
  21. ^ Свапан Маллик, Хэн Ли, Марк Липсон и др. , «Проект по изучению разнообразия геномов Саймонса: 300 геномов из 142 различных популяций». Nature 538, 201–206 (13 октября 2016 г.) doi:10.1038/nature18964
  22. ^ ab Hurles, Matthew E.; Sykes, Bryan C.; Jobling, Mark A.; Forster, Peter (2005). «Двойное происхождение малагасийцев на островах Юго-Восточной Азии и в Восточной Африке: доказательства по материнской и отцовской линиям». American Journal of Human Genetics . 76 (5): 894–901. doi :10.1086/430051. PMC 1199379 . PMID  15793703. 
  23. ^ Манфред Кайзер, Ин Чой, Маннис ван Овен, Стефано Мона, Силке Брауэр, Рональд Дж. Трент, Дагвин Суаркиа, Вульф Шифенхёвел и Марк Стоункинг (2008), «Влияние австронезийской экспансии: доказательства из мтДНК и разнообразия хромосом Y на островах Адмиралтейства в Меланезии». Mol. Biol. Evol. 25(7):1362–1374. doi:10.1093/molbev/msn078
  24. ^ Карафет и др. 2010.
  25. ^ Фредерик Делфин, Шон Майлз, Ин Чой, Дэвид Хьюз, Роберт Иллек, Маннис ван Овен, Бригитта Пакендорф , Манфред Кайзер и Марк Стоункинг, «Соединяя близкую и отдаленную Океанию: мтДНК и вариации NRY на Соломоновых островах». Молекулярная биология и эволюция 29(2):545–564. 2012 doi:10.1093/molbev/msr186.
  26. ^ abc Брунелли, Андреа; Кампуансай, Джатупол; Сейелстад, Марк; Ломтайсонг, Кхемика; Кангванпонг, Даорунг; Гиротто, Сильвия; Кутанан, Вибху (24 июля 2017 г.). "Y-хромосомные доказательства происхождения северных тайцев". PLOS ONE . 12 (7): e0181935. Bibcode : 2017PLoSO..1281935B. doi : 10.1371/journal.pone.0181935 . PMC 5524406. PMID  28742125 . 
  27. ^ Вибху Кутанан, Расми Шуконгдей, Метави Шрикуммул и др. (2020), «Культурные различия влияют на отцовские и материнские генетические линии групп хмонг-мьен и сино-тибетцев из Таиланда». Европейский журнал генетики человека https://doi.org/10.1038/s41431-020-0693-x
  28. ^ abcdef O Проект Y-гаплогруппы в Family Tree DNA
  29. ^ abcde Энрико Махольдт, Леонардо Ариас, Нгуен Туи Дуонг и др. , «Генетическая история вьетнамского населения по отцовской и материнской линии». Европейский журнал генетики человека (2020) 28:636–645. https://doi.org/10.1038/s41431-019-0557-4
  30. ^ abcde Моника Кармин, Лаури Сааг, Марио Висенте и др. , «Недавнее узкое место в разнообразии Y-хромосомы совпадает с глобальными изменениями в культуре». Геномные исследования (2015) 25: 459-466. дои: 10.1101/гр.186684.114
  31. ^ Андерхилл, PA; Шен, P; Линь, AA; Джин, L; Пассарино, G; Янг, WH; Кауфман, E; Бонне-Тамир, B; Бертранпети, J (2000). «Изменение последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Nature Genetics . 26 (3): 358–61. doi :10.1038/81685. PMID  11062480. S2CID  12893406.
  32. ^ Y-ДНК Гаплодерево в FamilyTreeDNA
  33. ^ «Добро пожаловать в FamilyTreeDNA Discover».

Цитируемые работы

Веб-сайты

Источники таблиц преобразования