Хромосома человека
Хромосома 12 — одна из 23 пар хромосом у людей . Обычно у людей есть две копии этой хромосомы. Хромосома 12 охватывает около 133 миллионов пар оснований (строительный материал ДНК ) и составляет от 4 до 4,5 процентов от общей ДНК в клетках .
Хромосома 12 содержит кластер генов Homeobox C.
Гены
Количество генов
Ниже приведены некоторые оценки количества генов человеческой хромосомы 12. Поскольку исследователи используют разные подходы к аннотации генома, их прогнозы количества генов на каждой хромосоме различаются (технические подробности см. в разделе прогнозирование генов ). Среди различных проектов проект по совместной консенсусной кодирующей последовательности ( CCDS ) придерживается крайне консервативной стратегии. Таким образом, прогноз количества генов CCDS представляет собой нижнюю границу общего количества генов, кодирующих человеческие белки. [4]
Список генов
Ниже приведен частичный список генов на 12-й хромосоме человека. Полный список можно посмотреть по ссылке в информационном поле справа.
- ACAD10 : кодирующий белок семейства ацил-КоА-дегидрогеназ, член 10
- ACRBP : кодирующий белок Белок, связывающий акрозин
- ACSS3 : кодирующий белок ацил-КоА-синтетазы, короткоцепочечный член семейства 3
- ACVRL1 : рецептор активина А типа II, подобный 1f
- ANKRD33 : кодирующий белок Ankyrin повторный домен 33
- APOF : кодирующий белок Аполипопротеин F
- APOLD1 : домен аполипопротеина L, содержащий 1
- ARL6IP4 : кодирующий белок фактор 6, подобный фактору АДФ-рибозилирования, взаимодействующий с белком 4
- ARPC3 : кодирующий белок, комплекс субъединицы 3 белка 2/3, родственного актину
- Асун : кодирующий белок , гомолог белка (Асун).
- ATP2B1-AS1 : кодирующий белок Atp2b1 антисмысловая РНК 1
- ATG101 : белок 101, связанный с аутофагией
- BCAT1 : кодирующий белок трансаминазу аминокислот с разветвленной цепью 1
- BIN2 : кодирующий белок, связывающий интегратор 2
- BRAP : кодирующий белок BRCA1 ассоциированный белок
- C12orf24 : кодирующий белок FAM216A
- C12orf29 : кодирующий белок C12orf29
- C12orf42 : кодирующий белок не охарактеризованная хромосома 12 открытая рамка считывания 42
- C12orf43 : кодирующий белок. Не охарактеризован.
- C12orf60 : кодирующий белок Неохарактеризованный белок C12orf60
- CALCOCO1 : белок 1, связывающий кальций и содержащий домен спиральной спирали
- CBX5 : гомолог хромобокса 5
- CCDC53 : белок 53, содержащий домен спиральной спирали
- CKAP4 : белок 4, ассоциированный с цитоскелетом
- CNOT2 : кодирующий белок CCR4-NOT транскрипционный комплекс субъединица 2
- CNPY2 : кодирующий белок Canopy FGF сигнальный регулятор 2
- CCDC42B : кодирующий белок Coiled Coil Domain, содержащий белок 42B
- COL2A1 : коллаген, тип II, альфа 1 (первичный остеоартрит, спондилоэпифизарная дисплазия, врожденная)
- CRACR2A : кодирующий белок, активирующий регулятор канала высвобождения кальция 2A
- CSRP2 : белок 2, богатый цистеином и глицином
- DDX23 : DEAD-box геликаза 23
- DDX47 : DEAD-box геликаза 47
- DHH : белок пустынного ежа
- DNAI7 : кодирующий белок Динеин аксонемальная промежуточная цепь 7
- DPPA3 : белок 3, ассоциированный с плюрипотентностью развития
- DPY19L2 : кодирующий белок Dpy-19-like 2 (C. elegans)
- DTX3 : кодирующий белок Deltex e3 убиквитинлигаза 3
- E2F7 : фактор транскрипции E2F 7
- EMP1 : белок эпителиальной мембраны 1
- ENDOU : кодирующий белок эндонуклеаза, поли(у)специфичный
- ERGIC2 : кодирующий белок , белок из 377 аминокислотных остатков
- FAM60A: кодирующий белок FAM60A
- FAM186B : кодирующий белок Белок FAM186B
- GABARAPL1 : кодирующий белок ГАМК-рецептор типа А, ассоциированный с белком типа 1
- GPD1 : кодирующий белок глицерол-3-фосфатдегидрогеназа 1
- GOLT1B : Транспорт Гольджи 1B
- GPN3 : кодирующий фермент GPN-петлевая ГТФаза 3
- HNF1A-AS1 : кодирующая белок HNF1A антисмысловая РНК 1
- HPD : 4-гидроксифенилпируватдиоксигеназа
- IFFO1 : кодирующий белок Семейство промежуточных филаментов, сирота 1
- IFNG-AS1 : кодирующая длинная некодирующая РНК IFNG антисмысловая РНК 1
- KANSL2 : кодирующий белок KAT8, регуляторная субъединица 2 комплекса NSL (KANSL2)
- KCNA1 : подсемейство А потенциалзависимых калиевых каналов, член 1 в 12p13.32
- KDM2B : кодирующий белок лизин (K)-специфическую деметилазу 2B
- КЕРА : кератокан
- KRAS : гомолог вирусного онкогена крысиной саркомы V-Ki-ras2 Кирстен.
- LARP4 : кодирующий белок La-связанный белок 4
- LEPREL2 : кодирующий фермент пролил-3-гидроксилазу 3
- LINC00173 : кодирующий белок Длинная межгенная некодирующая белок РНК 173* LMBR1L : кодирующий белок Белок LMBR1L
- LRRC23 : кодирующий белок , содержащий богатый лейцином повтор, белок 23
- LRRIQ1 : кодирующий белок, богатый лейцином, повторы и мотив IQ, содержащий 1
- LRRK2 : лейцин-богатая повторная киназа 2
- MBOAT5 : кодирующий фермент лизофосфолипид ацилтрансферазу 5
- METTL1 : кодирующий фермент тРНК (гуанин-N(7)-)-метилтрансферазу
- MFAP5 : кодирующий белок Микрофибриллярно-ассоциированный белок 5
- MIR196A2 : кодирование микроРНК МикроРНК 196a-2
- MIR200C : кодирование микроРНК 200c
- MMAB : метилмалоновая ацидурия (дефицит кобаламина) тип cblB
- MON2 : кодирующий белок Гомолог белка MON2
- MUCL1 : кодирующий белок Муциноподобный белок 1
- MYO1A : миозин IA
- NANOG : гомеодоменный ген типа NK-2
- NAP1L1 : кодирующий белок , белок сборки нуклеосомы 1-подобный 1
- NLRP9P1 : кодирующий белок семейства NLR пириновый домен, содержащий 9 псевдогенов 1
- NRIP2 : кодирующий белок, взаимодействующий с ядерным рецептором, белок 2
- NUDT4 : кодирующий фермент дифосфоинозитолполифосфатфосфогидролазу 2
- ПАУ : фенилаланингидроксилаза
- PIP4K2C : кодирующий белок фосфатидилинозитол-5-фосфат 4-киназу, тип II, гамма
- PIWIL1 : кодирующий белок Piwi-подобный белок 1
- PLBD1 : кодирующий домен фосфолипазы B белка, содержащий 1 1
- POP5 : кодирующая фермент рибонуклеаза P/MRP белковая субъединица POP5
- PPHLN1 : кодирующий белок перифилин-1
- PPP1R12A : протеинфосфатаза 1, регуляторный (ингибиторный) субъединица 12A
- PRB1 : кодирующий белок Основной слюнной пролин-богатый белок 1
- PRB3 : кодирующий белок Основной слюнной пролин-богатый белок 3
- PRB4 : кодирующий белок Основной слюнной пролин-богатый белок 4
- PRH1 : кодирующий белок слюнной кислой пролин-богатый фосфопротеин 1/2
- PRH2 : кодирующий белок , богатый пролином, подсемейство 2 белка HaeIII
- PRMT8 : кодирующий белок Белок аргининметилтрансфераза 8
- PRR4 : кодирующий белок , богатый пролином белок 4
- ПТМС : кодирующий белок Паратимозин
- PTPN11 : протеинтирозинфосфатаза, нерецепторный тип 11 (синдром Нунан 1)
- PUS1 : кодирующий фермент тРНК псевдоуридинсинтазу А
- PUS7L : кодирующий фермент псевдоуридилатсинтаза 7 гомологичный белок
- PZP : кодирующий белок Белок зоны беременности
- RAB3IP : кодирующий белок, взаимодействующий с RAB3A-белком
- RASSF8 : кодирующий белок , содержащий домен ассоциации Ras 8
- RASSF9 : кодирующий белок , содержащий домен ассоциации Ras 9
- RERG : кодирующий белок RAS-подобный, регулируемый эстрогеном, ингибитор роста
- RIMKLB : кодирующий белок Рибосомальная модификация белка rimk, член семейства b
- RNF34 : кодирующий фермент E3 убиквитин-протеинлигазу RNF34
- RNU4-1 : кодирующая белок РНК, U4 малый ядерный 1
- SARNP : рибонуклеопротеин, содержащий домен SAP
- Serpina3f : кодирующий белок ингибитор сериновой (или цистеиновой) пептидазы, клад A, член 3F
- SHMT2 : кодирующий белок серингидроксиметилтрансфераза 2
- SLC8B1 : семейство переносчиков растворенных веществ 8-й член B1
- TBC1D15 : кодирующий белок TBC1, член семейства доменов 15
- TBX3 : кодирующий белок фактор транскрипции T-box 3
- TCHP : кодирующий белок трихоплейн кератиновый филамент-связывающий белок
- TESPA1 : кодирующий белок, экспрессируемый тимоцитами, ассоциированный с положительным отбором 1
- THAP2 : кодирующий белок THAP-домен, содержащий белок 2
- TMTC1 : кодирующий белок Трансмембранный и тетратрикопептидный повтор, содержащий 1
- TMEM117 : кодирующий белок Трансмембранный белок 117
- TRAFD1 : кодирующий белок TRAF-типа, содержащий домен цинкового пальца 1
- TSFM : кодирующий белок фактор элонгации Ts, митохондриальный
- TWF1 : твинфилин-1
- UNQ1887 :
- USP52 : кодирующая фермент PAB-зависимая поли(A)-специфическая рибонуклеаза субъединица 2
- UTP20 : кодирующий белок Малая субъединица процессомного компонента 20 гомолог
- VEZT : кодирующий белок Везатин.
- VPS37B : кодирующий белок Vps37b, субъединица escrt-i
- YAF2 : кодирующий белок YY1-ассоциированный фактор 2
- ZCCHC8 : кодирующий белок , содержащий домен цинкового пальца CCHC 8
- ZFC3H1 : кодирующий белок цинковый палец типа C3H1, содержащий
- ZNF26 : кодирующий белок Цинковый палец белка 26
- ZNF84 : кодирующий белок Цинковый палец белка 84
- ZNF268 : кодирующий белок Цинковый палец белка 268
- ZNF664 : кодирующий белок Цинковый палец белка 664
Заболевания и расстройства
Следующие заболевания связаны с генами на хромосоме 12:
Цитогенетическая полоса
Ссылки
- ^ ab "Результаты поиска - 12[CHR] И "Homo sapiens"[Организм] И ("has ccds"[Свойства] И alive[prop]) - Ген". NCBI . Выпуск 20 CCDS для Homo sapiens . 2016-09-08 . Получено 2017-05-28 .
- ^ Том Страхан; Эндрю Рид (2 апреля 2010 г.). Молекулярная генетика человека. Garland Science. стр. 45. ISBN 978-1-136-84407-2.
- ^ Страница оформления генома abc , NCBI. Данные идеограммы для Homo sapience (850 bphs, Assembly GRCh38.p3). Последнее обновление 2014-06-03. Получено 2017-04-26.
- ^ Pertea M, Salzberg SL (2010). «Между курицей и виноградом: оценка количества человеческих генов». Genome Biol . 11 (5): 206. doi : 10.1186/gb-2010-11-5-206 . PMC 2898077. PMID 20441615 .
- ^ "Статистика и загрузки для хромосомы 12". Комитет по номенклатуре генов HUGO . 2017-05-12 . Получено 2017-05-19 .
- ^ "Хромосома 12: Сводка хромосом - Homo sapiens". Ensembl Release 88. 2017-03-29 . Получено 2017-05-19 .
- ^ "Человеческая хромосома 12: записи, названия генов и перекрестные ссылки на MIM". UniProt . 2018-02-28 . Получено 2018-03-16 .
- ^ "Результаты поиска - 12[CHR] И "Homo sapiens"[Организм] И ("генотип кодирование белка"[Свойства] И живой[свойство]) - Ген". NCBI . 2017-05-19 . Получено 2017-05-20 .
- ^ "Результаты поиска - 12[CHR] И "Homo sapiens"[Организм] И ( ("genetype miscrna"[Свойства] ИЛИ "genetype ncrna"[Свойства] ИЛИ "genetype rrna"[Свойства] ИЛИ "genetype trna"[Свойства] ИЛИ "genetype scrna"[Свойства] ИЛИ "genetype snrna"[Свойства] ИЛИ "genetype snorna"[Свойства]) НЕ "genetype protein coding"[Свойства] И alive[prop]) - Ген". NCBI . 2017-05-19 . Получено 2017-05-20 .
- ^ "Результаты поиска - 12[CHR] И "Homo sapiens"[Организм] И ("genetype pseudo"[Свойства] И alive[prop]) - Ген". NCBI . 2017-05-19 . Получено 2017-05-20 .
- ^ Риаз Н.; Стейнберг С.; Ахмад Дж.; и др. (апрель 2005 г.). «Значительная связь генома с заиканием на хромосоме 12». Am. J. Hum. Genet . 76 (4): 647–51. doi :10.1086/429226. PMC 1199301 . PMID 15714404.
- ^ Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы для Homo sapience (400 bphs, Assembly GRCh38.p3). Последнее обновление 2014-03-04. Получено 2017-04-26.
- ^ Страница оформления генома, NCBI. Данные идеограммы для Homo sapience (550 bphs, Assembly GRCh38.p3). Последнее обновление 2015-08-11. Получено 2017-04-26.
- ^ Международный постоянный комитет по цитогенетической номенклатуре человека (2013). ISCN 2013: Международная система цитогенетической номенклатуры человека (2013). Karger Medical and Scientific Publishers. ISBN 978-3-318-02253-7.
- ^ Sethakulvichai, W.; Manitpornsut, S.; Wiboonrat, M.; Lilakiatsakun, W.; Assawamakin, A.; Tongsima, S. (2012). «Оценка разрешений на уровне полос изображений хромосом человека». 2012 Девятая международная конференция по компьютерным наукам и программной инженерии (JCSSE) . стр. 276–282. doi :10.1109/JCSSE.2012.6261965. ISBN 978-1-4673-1921-8. S2CID 16666470.
- ^ " p ": Короткое плечо; " q ": Длинное плечо.
- ^ Для номенклатуры цитогенетического распределения см. статью locus .
- ^ ab Эти значения (старт/стоп ISCN) основаны на длине полос/идеограмм из книги ISCN «Международная система цитогенетической номенклатуры человека» (2013). Произвольная единица .
- ^ gpos : Область, которая положительно окрашивается G-бэндингом , как правило, богата AT и бедна генами; gneg : Область, которая отрицательно окрашивается G-бэндингом, как правило, богата CG и богата генами; acen Центромера . var : Вариабельная область; stem : Стебель.
- Гилберт Ф., Кауфф Н. (2000). «Гены и хромосомы болезней: карты болезней генома человека. Хромосома 12». Genet Test . 4 (3): 319–33. doi :10.1089/10906570050501588. PMID 11142767.
- Montgomery KT, Lee E, Miller A, Lau S, Shim C, Decker J, Chiu D, Emerling S, Sekhon M, Kim R, Lenz J, Han J, Ioshikhes I, Renault B, Marondel I, Yoon SJ, Song K, Murty VV, Scherer S, Yonescu R, Kirsch IR, Ried T, McPherson J, Gibbs R, Kucherlapati R (2001). "Высокоразрешающая карта человеческой хромосомы 12". Nature . 409 (6822): 945–6. Bibcode :2001Natur.409..945M. doi : 10.1038/35057174 . PMID 11237017.
Внешние ссылки
На Викискладе есть медиафайлы по теме « Человеческая хромосома 12» .
- Национальные институты здравоохранения. "Хромосома 12". Genetics Home Reference . Архивировано из оригинала 2007-06-12 . Получено 2017-05-06 .
- «Хромосома 12». Архив информации о проекте «Геном человека» 1990–2003 гг . Получено 06.05.2017 г.