stringtranslate.com

HNRNPK

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин K (также белок K ) — это белок , который у людей кодируется геном HNRNPK . [ 5] Он находится в ядре клетки , где связывается с пре- мессенджерной РНК (мРНК) как компонент гетерогенных рибонуклеопротеиновых частиц . Обезьяний гомолог известен как белок H16 . Оба белка связываются с одноцепочечной ДНК , а также с РНК и могут стимулировать активность РНК-полимеразы II , белка, ответственного за большую часть транскрипции генов . Относительное сродство белков к ДНК и РНК меняется в зависимости от условий раствора и обратно коррелирует, так что условия, способствующие сильному связыванию ДНК, приводят к слабому связыванию РНК. [6]

Домены РНК-связывающего белка в других белках, которые похожи на домен РНК-связывающего белка K, называются доменами K-гомологии или KH- доменами.

Белок К был предметом исследования, связанного с колоректальным раком , в котором было обнаружено, что событие редактирования РНК , вызывающее экспрессию изоформы, содержащей точечную мутацию, специфично для раковых клеток. [7]

Функция

Этот ген принадлежит к подсемейству повсеместно экспрессируемых гетерогенных ядерных рибонуклеопротеинов (hnRNP). hnRNP являются РНК-связывающими белками и образуют комплекс с гетерогенной ядерной РНК (hnRNA). Эти белки связаны с пре-мРНК в ядре и, по-видимому, влияют на процессинг пре-мРНК и другие аспекты метаболизма и транспорта мРНК . Хотя все hnRNP присутствуют в ядре, некоторые, по-видимому, перемещаются между ядром и цитоплазмой.

Белки hnRNP обладают особыми свойствами связывания нуклеиновых кислот. Белок, кодируемый этим геном, находится в нуклеоплазме и имеет три повтора доменов KH , которые связываются с РНК. Он отличается от других белков hnRNP своим предпочтением связывания; он прочно связывается с поли(C). Считается, что этот белок также играет роль в ходе клеточного цикла. Для этого гена было описано несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, но только три варианта были полностью описаны. [8]

Мутации в обеих копиях HNRNPK являются эмбрионально летальными у мышей. Мыши с обеими копиями гена, выведенными из строя, умирают до 14-го дня эмбрионального развития . [9]

Клиническое значение

синдром Окамото

Мутации в HNRNPK вызывают синдром Окамото , также известный как синдром Ау-Клайна. [10]

Рак крови

Делеции в области, охватывающей HNRNPK , были обнаружены в клетках острого миелоидного лейкоза примерно в 2% случаев. Кроме того, у большинства мышей, у которых один из генов HNRNPK был искусственно нокаутирован, развился миелоидный рак , у трети развился лимфоидный рак , а у 4% развилась гепатоцеллюлярная карцинома . Мыши также были меньше, имели менее развитые органы и имели более высокую постнатальную смертность (30%). Медианная продолжительность жизни выживших мышей составила менее 50% от таковой у мышей дикого типа. Дефицит HNRNPK, по-видимому, специфически снижает уровни изоформы p42 CEBPA , которая является фактором транскрипции , участвующим в дифференциации определенных клеток крови , а также p21 (ингибитор циклинзависимой киназы 1), который участвует в остановке развития клеток для восстановления ДНК . [11]

Повышенная экспрессия HNRNPK также, по-видимому, способствует возникновению рака посредством другого механизма, включающего трансляцию, а не транскрипцию . [11]

Взаимодействия

Было показано, что HNRPK взаимодействует с:

Белки человека, содержащие домен KH

АКАП1 ; АНКХД1 ; АНКРД17 ; АССС1 ; БИКК1; ДДХ43 ; ДДХ53 ; ДППА5; ФМР1 ; ФУБП1 ; ФУБП3; FXR1 ; FXR2 ; ЛПВП ; ХНРПК ; ИФР2ВР1 ; ИФР2ВР2 ; ИФР2ВР3 ; ХДРБС1 ; ХДРБС2; ХДРБС3 ; КХСРП ; КРР1 ; МЕХ3А; МЕХ3Б ; МЕХ3С; МЕКС3Д ; НОВА1 ; НОВА2 ; ПКБП1 ; ПКБП2 ; ПКБП3 ; ПКБП4 ; ПНО1 ; ПНПТ1; БКИ ; СФ1 ; ТДРХ ;

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000165119 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000021546 – ​​Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Dejgaard K, Leffers H, Rasmussen HH, Madsen P, Kruse TA, Gesser B, et al. (Февраль 1994). «Идентификация, молекулярное клонирование, экспрессия и хромосомное картирование семейства белков hnRNP-K с повышенной регуляцией трансформации, полученных путем альтернативного сплайсинга». Журнал молекулярной биологии . 236 (1): 33–48. doi :10.1006/jmbi.1994.1116. PMID  8107114.
  6. ^ Gaillard C, Cabannes E, Strauss F (октябрь 1994 г.). «Идентичность РНК-связывающего белка K частиц hnRNP с белком H16, специфичным для последовательности одноцепочечным ДНК-связывающим белком». Nucleic Acids Research . 22 (20): 4183–6. doi :10.1093/nar/22.20.4183. PMC 331915. PMID  7524036 . 
  7. ^ Климек-Томчак К., Микула М., Дзвонек А., Пазиевска А., Карчмарски Дж., Хенниг Э. и др. (февраль 2006 г.). «Редактирование мРНК белка hnRNP K в колоректальной аденокарциноме и окружающей слизистой оболочке». Британский журнал рака . 94 (4): 586–92. дои : 10.1038/sj.bjc.6602938. ПМК 2361188 . ПМИД  16404425. 
  8. ^ "Ген Энтреза: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин К HNRPK".
  9. ^ Галлардо М., Ли Х.Дж., Чжан Х., Буэсо-Рамос К., Пейджон Л.Р., МакАртур М. и др. (октябрь 2015 г.). «hnRNP K — это гаплонедостаточный супрессор опухолей, который регулирует программы пролиферации и дифференциации при гематологических злокачественных новообразованиях». Cancer Cell . 28 (4): 486–499. doi :10.1016/j.ccell.2015.09.001. PMC 4652598 . PMID  26412324. 
  10. ^ Ссылка GH. "Синдром Ау-Клайна". Genetics Home Reference . Получено 2019-11-30 .
  11. ^ ab Gallardo M, Lee HJ, Zhang X, Bueso-Ramos C, Pageon LR, McArthur M и др. (октябрь 2015 г.). «hnRNP K — это гаплонедостаточный супрессор опухолей, который регулирует программы пролиферации и дифференциации при гематологических злокачественных новообразованиях». Cancer Cell . 28 (4): 486–499. doi :10.1016/j.ccell.2015.09.001. PMC 4652598 . PMID  26412324. 
  12. ^ Ostareck-Lederer A, Ostareck DH, Cans C, Neubauer G, Bomsztyk K, Superti-Furga G, Hentze MW (июль 2002 г.). "c-Src-опосредованное фосфорилирование hnRNP K управляет трансляционной активацией специфически подавленных мРНК". Molecular and Cellular Biology . 22 (13): 4535–43. doi :10.1128/mcb.22.13.4535-4543.2002. PMC 133888 . PMID  12052863. 
  13. ^ Chen HC, Lin WC, Tsay YG, Lee SC, Chang CJ (октябрь 2002 г.). «РНК-хеликаза DDX1, взаимодействующая с поли(А) РНК и гетерогенным ядерным рибонуклеопротеином K». Журнал биологической химии . 277 (43): 40403–9. doi : 10.1074/jbc.M206981200 . PMID  12183465.
  14. ^ abc Kim JH, Hahm B, Kim YK, Choi M, Jang SK (май 2000 г.). «Взаимодействие белок-белок среди hnRNP, перемещающихся между ядром и цитоплазмой». Журнал молекулярной биологии . 298 (3): 395–405. doi :10.1006/jmbi.2000.3687. PMID  10772858.
  15. ^ Yang JP, Reddy TR, Truong KT, Suhasini M, Wong-Staal F (октябрь 2002 г.). «Функциональное взаимодействие Sam68 и гетерогенного ядерного рибонуклеопротеина K». Oncogene . 21 (47): 7187–94. doi :10.1038/sj.onc.1205759. PMID  12370808. S2CID  26091319.
  16. ^ Côté J, Boisvert FM, Boulanger MC, Bedford MT, Richard S (январь 2003 г.). «Sam68 РНК-связывающий белок является субстратом in vivo для белка аргинин N-метилтрансферазы 1». Молекулярная биология клетки . 14 (1): 274–87. doi :10.1091/mbc.E02-08-0484. PMC 140244. PMID  12529443 . 
  17. ^ Wada K, Inoue K, Hagiwara M (август 2002 г.). «Идентификация метилированных белков с помощью белка аргинин N-метилтрансферазы 1, PRMT1, с новой стратегией клонирования экспрессии». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research . 1591 (1–3): 1–10. doi :10.1016/s0167-4889(02)00202-1. PMID  12183049.

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки