stringtranslate.com

МТ-АТП6

46-нуклеотидное перекрытие в рамках считывания митохондриальных генов человека MT-ATP6 и MT-ATP8 . Для каждого триплета нуклеотидов (квадратные скобки) указана соответствующая аминокислота (однобуквенный код), либо в рамке +3 для MT-ATP6 (синего цвета), либо в рамке +1 для MT-ATP8 (красного цвета).

MT-ATP6 (или ATP6 ) — это митохондриальный ген с полным названием «митохондриально кодируемая субъединица мембраны АТФ-синтазы 6», который кодирует субъединицу F o 6 (или субъединицу/цепь A) АТФ-синтазы . Эта субъединица принадлежит комплексу F o большой трансмембранной АТФ-синтазы F-типа . [5] Этот фермент, также известный как комплекс V, отвечает за конечный этап окислительного фосфорилирования в цепи переноса электронов . В частности, один сегмент АТФ-синтазы позволяет положительно заряженным ионам , называемым протонами , проходить через специализированную мембрану внутри митохондрий. Другой сегмент фермента использует энергию, создаваемую этим потоком протонов, для преобразования молекулы, называемой аденозиндифосфатом (АДФ), в АТФ . Мутации в гене MT-ATP6 были обнаружены примерно у 10–20 процентов людей с синдромом Лея . [6]

Структура

Расположение гена MT-ATP6 на L-цепи митохондриального генома человека. MT-ATP6 — один из двух митохондриальных генов АТФ-синтазы (красные прямоугольники).

Ген MT-ATP6 предоставляет информацию для создания белка, который необходим для нормальной функции митохондрий. Человеческий ген MT-ATP6 , расположенный в митохондриальной ДНК , имеет длину 681 пары оснований . [7] Необычной особенностью MT-ATP6 является 46- нуклеотидное перекрытие его первых кодонов с концом гена MT-ATP8 . Что касается рамки считывания MT-ATP6 (+3), ген MT-ATP8 заканчивается в рамке считывания +1 стоп-кодоном TAG .

Белок MT-ATP6 весит 24,8 кДа и состоит из 226 аминокислот . [8] [9] Белок является субъединицей F 1 F o АТФазы, также известной как Комплекс V , которая состоит из 14 ядерно- и 2 митохондриально-кодируемых субъединиц. Как субъединица A, MT-ATP6 содержится в некаталитической, трансмембранной части F o комплекса. [7]

Номенклатура фермента имеет долгую историю. Фракция F 1 получила свое название от термина «Фракция 1», а F o (пишется как подстрочная буква «o», а не «ноль») получила свое название от связывающей фракции для олигомицина , типа антибиотика природного происхождения, который способен ингибировать единицу F o АТФ-синтазы. [10] [11] Область F o АТФ-синтазы представляет собой протонную пору, встроенную в митохондриальную мембрану. Она состоит из трех основных субъединиц A, B и C, и (у человека) шести дополнительных субъединиц, d , e , f , g , F6 и 8 (или A6L). Трехмерная структура гомолога этой субъединицы E. coli была смоделирована на основе данных электронной микроскопии (цепь M PDB : 1c17 ​). Образует трансмембранный 4-α-пучок.

Функция

Эта субъединица является ключевым компонентом протонного канала и может играть прямую роль в транслокации протонов через мембрану. Катализ в комплексе F 1 зависит от вращения центрального стебля и F o c-кольца, которое, в свою очередь, управляется потоком протонов через мембрану через интерфейс между F0 c-кольцом и субъединицей A. Периферийный стебель связывает субъединицу A с внешней поверхностью домена F 1 и, как полагают, действует как статор, противодействуя тенденции субъединицы A и каталитической части F 1 alpha 3 beta 3 вращаться с центральным вращающимся элементом. [12]

Клиническое значение

Мутации MT-ATP6 и других генов, влияющих на окислительное фосфорилирование в митохондриях, связаны с различными нейродегенеративными и сердечно-сосудистыми расстройствами, включая дефицит митохондриального комплекса V, наследственную оптическую нейропатию Лебера (LHON), митохондриальную энцефаломиопатию с инсультоподобными эпизодами ( MELAS ), синдром Лея и синдром NARP . Большинство клеток организма содержат тысячи митохондрий, каждая из которых имеет одну или несколько копий митохондриальной ДНК . Тяжесть некоторых митохондриальных расстройств связана с процентом митохондрий в каждой клетке, которая имеет определенное генетическое изменение. Люди с синдромом Лея из-за мутации гена MT-ATP6, как правило, имеют очень высокий процент митохондрий с мутацией (от более 90 процентов до 95 процентов). Менее серьезные признаки NARP являются результатом более низкого процента митохондрий с мутацией, обычно от 70 до 90 процентов. Поскольку эти два состояния являются результатом одних и тех же генетических изменений и могут возникать у разных членов одной семьи, исследователи полагают, что они могут представлять собой спектр перекрывающихся признаков, а не два отдельных синдрома. [6]

Дефицит митохондриального комплекса V

Дефицит митохондриального комплекса V — это недостаток (дефицит) или потеря функции в комплексе V цепи переноса электронов , что может вызывать широкий спектр признаков и симптомов, влияющих на многие органы и системы организма, особенно на нервную систему и сердце . Расстройство может быть опасным для жизни в младенчестве или раннем детстве. У пораженных людей могут быть проблемы с питанием, медленный рост, низкий мышечный тонус ( гипотония ), сильная усталость ( летаргия ) и задержка развития . У них, как правило, повышается уровень молочной кислоты в крови ( лактацидоз ), что может вызывать тошноту, рвоту, слабость и учащенное дыхание. Высокий уровень аммиака в крови ( гипераммониемия ) также может возникать у пораженных людей, и в некоторых случаях приводит к нарушению функции мозга ( энцефалопатия ) и повреждению других органов. [13] У пациентов с мутацией сдвига рамки считывания в MT-ATP6 наблюдались атаксия , микроцефалия , задержка развития и умственная отсталость. Это приводит к вставке C в позиции 8612, что приводит к укорочению белка длиной всего 36 аминокислот, и двум полиморфизмам T > C с одним нуклеотидом в позициях 8610 и 8614, которые приводят к образованию гомополимерного участка цитозина . [14]

Другой распространенной чертой дефицита митохондриального комплекса V является гипертрофическая кардиомиопатия . Это состояние характеризуется утолщением ( гипертрофией ) сердечной мышцы , что может привести к сердечной недостаточности . [13] Мутация m.8528T>C происходит в перекрывающейся области генов MT-ATP6 и MT-ATP8 и была описана у нескольких пациентов с детской кардиомиопатией. Эта мутация изменяет инициирующий кодон в MT-ATP6 на треонин, а также изменяет триптофан на аргинин в позиции 55 MT-ATP8 . [15] [16] Люди с дефицитом митохондриального комплекса V также могут иметь характерный рисунок черт лица, включая высокий лоб, изогнутые брови, внешние уголки глаз, направленные вниз (нисходящие глазные щели ), выступающую переносицу, низко посаженные уши, тонкие губы и маленький подбородок ( микрогнатия ). [13]

синдром Лея

Известно, что патогенные варианты митохондриального гена MT-ATP6 вызывают синдром Лея , связанный с мтДНК , — прогрессирующее заболевание мозга, которое обычно проявляется в младенчестве или раннем детстве. У больных детей может наблюдаться задержка развития , мышечная слабость, проблемы с движением или затрудненное дыхание. [6] Другие варианты, которые, как известно, вызывают синдром Лея, связанный с мтДНК, включают MT-TL1 , MT-TK , MT-TW , MT-TV , MT-ND1 , MT-ND2 , MT-ND3 , MT- ND4 , MT-ND5 , MT-ND6 и MT-CO3 . Нарушения в генерации энергии митохондриями приводят к нейродегенеративным расстройствам, таким как синдром Лея , который характеризуется появлением симптомов в возрасте от 12 месяцев до трех лет. Симптомы часто проявляются после вирусной инфекции и включают двигательные расстройства и периферическую невропатию , а также гипотонию , спастичность и мозжечковую атаксию . Примерно половина пораженных пациентов умирают от дыхательной или сердечной недостаточности к трем годам. Синдром Лея является наследственным по материнской линии заболеванием, и его диагноз устанавливается с помощью генетического тестирования вышеупомянутых митохондриальных генов, включая MT-ATP6. [17] Мутации гена MT-ATP6, связанные с синдромом Лея, изменяют один строительный блок ДНК ( нуклеотид ) в гене MT-ATP6. Наиболее распространенное генетическое изменение заменяет нуклеотид тимин на гуанин в позиции 8993 (пишется как T8993G). Мутации, вызывающие синдром Лея, нарушают функцию или стабильность комплекса АТФ-синтазы , ингибируя выработку АТФ и нарушая окислительное фосфорилирование . Хотя точный механизм неясен, исследователи полагают, что нарушенное окислительное фосфорилирование может привести к гибели клетки из-за снижения доступной в клетке энергии. Некоторые ткани, которым требуется большое количество энергии, такие как мозг, мышцы и сердце, кажутся особенно чувствительными к снижению клеточной энергии. Смерть клеток в мозге, вероятно, вызывает характерные изменения в мозге, наблюдаемые при синдроме Лея, которые способствуют признакам и симптомам этого состояния. Смерть клеток в других чувствительных тканях также может способствовать признакам синдрома Лея. ГетероплазматическийМутация T→C MT-ATP6 в позиции 9185 приводит к замене высококонсервативного лейцина на пролин в кодоне 220, а гетероплазматическая миссенс-мутация T→C в позиции 9191 преобразует высококонсервативный лейцин в пролин в позиции 222 полипептида , что приводит к фенотипу типа Лея . Мутация T9185C привела к легкому и обратимому фенотипу , при этом 97% образцов мышц и крови пациента отражали мутацию. Мутация T9191C представила гораздо более тяжелый фенотип, который привел к смерти пациента в возрасте 2 лет. [18]

синдром НАРП

Некоторые из мутаций гена ATP6, вызывающих синдром Лея, также ответственны за похожее, но менее тяжелое состояние, называемое нейропатией, атаксией и пигментным ретинитом (NARP). [19] Небольшое количество мутаций в гене MT-ATP6 было выявлено у людей с NARP. Каждая из этих мутаций изменяет один нуклеотид в гене MT-ATP6. Как и при синдроме Лея, наиболее распространенное генетическое изменение, связанное с NARP, заменяет нуклеотид тимин на гуанин в позиции 8993 (записывается как T8993G). Мутации, вызывающие NARP, изменяют структуру или функцию АТФ-синтазы , снижая способность митохондрий вырабатывать АТФ. Хотя точные эффекты этих мутаций неясны, исследователи продолжают изучать, как изменения в гене MT-ATP6 мешают выработке АТФ и приводят к мышечной слабости, потере зрения и другим признакам NARP. [6]

Семейный двусторонний некроз полосатого тела

Состояние, называемое семейным двусторонним некрозом полосатого тела, которое похоже на синдром Лея, также может быть результатом изменений в гене MT-ATP6. В нескольких зарегистрированных случаях с этими мутациями у пострадавших детей наблюдались задержка развития, проблемы с движением и координацией, слабый мышечный тонус ( гипотония ) и необычно маленький размер головы ( микроцефалия ). Исследователи не определили, почему мутации MT-ATP6 приводят к такому сочетанию признаков и симптомов у детей с двусторонним некрозом полосатого тела. [6]

Взаимодействия

Было показано, что MT-ATP6 имеет 20 бинарных белок-белковых взаимодействий, включая 17 ко-комплексных взаимодействий. MT-ATP6, по-видимому, взаимодействует с SP1 . [20]

Исследовать

Исследовательский фонд SENS опубликовал статью, в которой подробно описывается успешная аллотопическая экспрессия замещающей ДНК для гена MT-ATP6 в ядерной ДНК клетки. [21]

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000198899 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000064357 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Anderson S, Bankier AT, Barrell BG, de Bruijn MH, Coulson AR, Drouin J, Eperon IC, Nierlich DP, Roe BA, Sanger F, Schreier PH, Smith AJ, Staden R, Young IG (апрель 1981 г.). «Последовательность и организация митохондриального генома человека». Nature . 290 (5806): 457–65. Bibcode :1981Natur.290..457A. doi :10.1038/290457a0. PMID  7219534. S2CID  4355527.
  6. ^ abcde "MT-ATP6". Генетика Главная Справочник . NCBI.
  7. ^ ab "Ген Энтреза: митохондриально кодируемая АТФ-синтаза 6 MT-ATP6".
  8. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний». Circulation Research . 113 (9): 1043–53. doi :10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID  23965338 . 
  9. ^ "Субъединица A АТФ-синтазы, митохондриальная". База знаний по атласу белков сердечной органеллы (COPaKB) .
  10. ^ Kagawa Y, Racker E (май 1966). «Частичное разрешение ферментов, катализирующих окислительное фосфорилирование. 8. Свойства фактора, придающего митохондриальной аденозинтрифосфатазе чувствительность к олигомицину». Журнал биологической химии . 241 (10): 2461–6. doi : 10.1016/S0021-9258(18)96640-8 . PMID  4223640.
  11. ^ Маккарти RE (ноябрь 1992 г.). «ВЗГЛЯД БИОХИМИКА РАСТЕНИЙ НА H+-АТФазы и АТФ-СИНТАЗЫ». Журнал экспериментальной биологии . 172 (ч. 1): 431–441. doi :10.1242/jeb.172.1.431. PMID  9874753.
  12. ^ Carbajo RJ, Kellas FA, Runswick MJ, Montgomery MG, Walker JE, Neuhaus D (август 2005 г.). «Структура домена связывания F1 статора бычьей F1Fo-АТФазы и как она связывает альфа-субъединицу». Журнал молекулярной биологии . 351 (4): 824–38. doi :10.1016/j.jmb.2005.06.012. PMID  16045926.
  13. ^ abc "Дефицит митохондриального комплекса V". Genetics Home Reference . NCBI . Получено 3 августа 2018 г. . Общественное достояниеВ данной статье использован текст из этого источника, находящегося в общественном достоянии .
  14. ^ Jackson CB, Hahn D, Schröter B, Richter U, Battersby BJ, Schmitt-Mechelke T, Marttinen P, Nuoffer JM, Schaller A (июнь 2017 г.). «Новая мутация сдвига рамки считывания митохондриального гена ATP6, вызывающая дефицит изолированного комплекса V, атаксию и энцефаломиопатию». European Journal of Medical Genetics . 60 (6): 345–351. doi :10.1016/j.ejmg.2017.04.006. hdl : 10138/237062 . PMID  28412374.
  15. ^ Имаи А., Фудзита С., Кишита И., Кода М., Токузава И., Хирата Т., Мизуно И., Харашима Х., Накая А., Саката И., Такеда А., Мори М., Мураяма К., Отаке А., Оказаки И. (март 2016 г.). «Быстро прогрессирующая детская кардиомиопатия с дефицитом комплекса V митохондриальной дыхательной цепи из-за потери белка АТФазы 6 и 8». Международный журнал кардиологии . 207 : 203–5. doi : 10.1016/j.ijcard.2016.01.026. PMID  26803244.
  16. ^ Ware SM, El-Hassan N, Kahler SG, Zhang Q, Ma YW, Miller E, Wong B, Spicer RL, Craigen WJ, Kozel BA, Grange DK, Wong LJ (май 2009 г.). «Детская кардиомиопатия, вызванная мутацией в перекрывающейся области генов митохондриальной АТФазы 6 и 8». Журнал медицинской генетики . 46 (5): 308–14. doi :10.1136/jmg.2008.063149. PMID  19188198. S2CID  25354118.
  17. ^ Thorburn DR, Rahman S (1993–2015). «Синдром Ли, связанный с митохондриальной ДНК, и NARP». В Pagon RA, Adam MP, Ardinger HH, Wallace SE, Amemiya A, Bean LJ, Bird TD, Dolan CR, Fong CT, Smith RJ, Stephens K (ред.). GeneReviews [Интернет] . Сиэтл (WA): Университет Вашингтона, Сиэтл.
  18. ^ Moslemi AR, Darin N, Tulinius M, Oldfors A, Holme E (октябрь 2005 г.). «Две новые мутации в гене MTATP6, связанные с синдромом Лея». Neuropediatrics . 36 (5): 314–8. doi :10.1055/s-2005-872845. PMID  16217706.
  19. ^ Баракка А., Сгарби Г., Маттиацци М., Казалена Г., Паньотта Е., Валентино М.Л., Моджио М., Леназ Г., Карелли В., Солайни Г. (июль 2007 г.). «Биохимические фенотипы, связанные с мутациями митохондриального гена ATP6 в nt8993». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Биоэнергетика . 1767 (7): 913–9. дои : 10.1016/j.bbabio.2007.05.005 . ПМИД  17568559.
  20. ^ "Найдено 20 бинарных взаимодействий для поискового термина MT-ATP6". База данных молекулярных взаимодействий IntAct . EMBL-EBI . Получено 24.08.2018 .
  21. ^ Boominathan A, Vanhoozer S, Basisty N, Powers K, Crampton AL, Wang X, Friedricks N, Schilling B, Brand MD, O'Connor MS (ноябрь 2016 г.). «Стабильная ядерная экспрессия генов ATP8 и ATP6 спасает нулевой мутант комплекса V мтДНК». Nucleic Acids Research . 44 (19): 9342–9357. doi :10.1093/nar/gkw756. PMC 5100594. PMID  27596602 . 

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки

В данной статье использован текст из Национальной медицинской библиотеки США , являющийся общественным достоянием .