stringtranslate.com

Чарльз Дэвид Эллис

Чарльз Дэвид Эллис (22 марта 1951 г. — 8 января 2023 г.) — американский молекулярный биолог , профессор имени Джоя и Джека Фишмана в Рокфеллеровском университете . Он также был руководителем лаборатории биологии хроматина и эпигенетики и профессором трехинституциональной программы MD–PhD (другие два учреждения — Мемориальный онкологический центр имени Слоуна-Кеттеринга и Медицинский центр Вейла Корнелла ). [4]

Ранняя жизнь и образование

Эллис родился и вырос в Цинциннати , штат Огайо . Его отец был городским планировщиком , а мать — учителем начальной школы . [5] Он поступил в Университет Цинциннати в 1969 году, специализируясь на биологии . Он получил свой первый опыт фундаментальных исследований на последнем (или четвертом) курсе бакалавриата наук . Этот опыт привлек его к исследованиям, и он отправился в Индийский университет в Блумингтоне для обучения в аспирантуре. [6] Он получил степень магистра в 1975 году и степень доктора философии три года спустя под руководством Энтони Маховальда . [4] [6]

Карьера

После получения степени доктора философии Эллис прошел постдокторскую стажировку в Университете Рочестера . [6] В 1981 году он присоединился к Медицинскому колледжу Бейлора в качестве доцента на кафедре биохимии и кафедре клеточной биологии , а в 1986 году был повышен до должности доцента , а в 1989 году — до профессора. [4] В 1990 году он присоединился к кафедре биологии в Колледже искусств и наук Сиракузского университета. [7]

Эллис вернулся в Университет Рочестера в 1995 году и два года спустя стал профессором биологии имени Мари Карран Уилсон и Джозефа Чемберлена Уилсона . [8] В 1998 году Эллис перешел на кафедру биохимии и молекулярной генетики в Медицинскую школу Университета Вирджинии . [9] Он присоединился к Университету Рокфеллера в 2003 году в качестве профессора имени Джой и Джека Фишмана и руководителя лаборатории биологии хроматина и эпигенетики . [4]

Эллис лечился от рака. [3] Он умер 8 января 2023 года в больнице в Сиэтле , штат Вашингтон . [3]

Исследовать

В Scholia есть профиль Чарльза Дэвида Эллиса (Q1064064).

Эллис был известен своими исследованиями модификаций гистонов и их связи со структурой хроматина . Он начал работать над Tetrahymena , реснитчатым одноклеточным эукариотом . Tetrahymena является идеальным кандидатом для изучения ацетилирования гистонов из-за своего двойного ядра . У него есть более крупное макронуклеус , которое является транскрипционно активным и соматическим , и меньшее микронуклеус , которое является транскрипционно немым и относится к зародышевой линии . [10] Биология хроматина в то время не была популярной темой; как и использование реснитчатых организмов. [6]

В 1996 году его группа выделила гистонацетилтрансферазу p55 из Tetrahymena , фермент , который ацетилирует гистоны , и обнаружила, что фермент гомологичен Gcn5p, известному транскрипционному коактиватору у дрожжей . [11] [12] Это был первый случай, когда гистонацетилтрансферазы были связаны с активацией транскрипции ДНК , [13] что подтвердило гипотезу Винсента Олфри, высказанную в 1960-х годах, о том, что ацетилирование гистонов регулирует транскрипцию. [14] [15]

После этого основополагающего отчета Эллис продолжил изучать ацетилирование гистонов, открыв больше ацетилтрансфераз гистонов, включая TAF1 (часть фактора транскрипции TF II D, необходимого для инициации транскрипции). [16] Эллис также занялся исследованием фосфорилирования гистонов и метилирования гистонов . Он связал фосфорилирование гистонов с митозом и стимуляцией митогена , [17] [18] и установил синергетическую связь между фосфорилированием гистонов и ацетилированием. [19] Он также определил роль метилирования в лизине 9 гистона H3 , [20] идентифицировал белки, содержащие домен SET , как гистонметилтрансферазу , [21] и обнаружил, что убиквитинирование гистонов регулирует метилирование гистонов. [22]

В 2000 году Эллис и Брайан Страл предложили « гипотезу гистонового кода », которая гласит, что транскрипция ДНК в значительной степени регулируется модификациями гистонов . [23] Позднее Эллис (совместно с Томасом Дженувейном ) явно связал гистоновый код с эпигенетикой , [24] и признал клиническое значение модификаций гистонов, особенно при раке . [25] [26]

В последние годы его внимание переключилось на «онкогистоны», представляющие собой гистоны с мутациями , которые искажают нормальные модификации гистонов, что приводит к раку. [27] [28]

Почести и награды

Эллис был членом общества Phi Beta Kappa , когда окончил Университет Цинциннати . [8]

В его честь был создан Фонд наставничества имени Дэвида Эллиса для молодых ученых в Университете Рокфеллера . [46] [47]

Ссылки

  1. ^ "Выпускник C. David Allis выигрывает премию Ласкера 2018 года". Кафедра биологии, Университет Индианы в Блумингтоне . 11 сентября 2018 г. Архивировано из оригинала 1 февраля 2023 г. Получено 1 февраля 2023 г.
  2. ^ ab "Charles David Allis ("Dave")". The Cincinnati Enquirer . 14 января 2023 г. Архивировано из оригинала 17 января 2023 г. Получено 30 января 2023 г.
  3. ^ abc Murphy, Brian (21 января 2023 г.). «Дэвид Эллис, исследователь, изучавший механизм включения-выключения генов, умер в возрасте 71 года». The Washington Post . Архивировано из оригинала 23 января 2023 г. . Получено 23 января 2023 г. .
  4. ^ abcd "C. David Allis, Ph.D. (1951-2023)". Rockefeller University . Архивировано из оригинала 30 января 2023 года . Получено 30 января 2023 года .
  5. ^ "C. David Allis". Gruber Foundation . Архивировано из оригинала 7 февраля 2023 г. Получено 7 февраля 2023 г.
  6. ^ abcd Дауни, Филипп (2006). «Профиль К. Дэвида Эллиса». Труды Национальной академии наук . 103 (17): 6425–6427. Bibcode : 2006PNAS..103.6425D. doi : 10.1073/pnas.0602256103 . PMC 1458902. PMID  16618930 . 
  7. ^ Scalese, Sarah (4 февраля 2014 г.). «Бывший профессор SU назван лауреатом премии Японии». Сиракузский университет . Архивировано из оригинала 19 октября 2021 г. Получено 19 октября 2021 г.
  8. ^ ab "C. David Allis Named Wilson Professor of Biology". Университет Рочестера . 25 июля 1997 г. Архивировано из оригинала 16 октября 2019 г. Получено 16 октября 2019 г.
  9. ^ «Дань уважения C. David Allis, доктору философии — профессору кафедры биохимии и молекулярной генетики с 1998 по 2003 год». Медицинская школа Университета Вирджинии . 24 января 2023 г. Архивировано из оригинала 11 февраля 2023 г. Получено 11 февраля 2023 г.
  10. ^ Goldfarb, David S.; Gorovsky, Martin A. (2009). "Nuclear Dimorphism: Two Peas in a Pod" (PDF) . Current Biology . 19 (11): R449–R452. doi :10.1016/j.cub.2009.04.023. PMID  19515351. S2CID  9841779. Архивировано из оригинала (PDF) 14 февраля 2023 г. . Получено 14 февраля 2023 г. .
  11. ^ "2014 Japan Prize Achievement - область "Life Science"" (PDF) . Japan Prize . Архивировано из оригинала (PDF) 15 февраля 2023 г. . Получено 15 февраля 2023 г. .
  12. ^ Brownell, James E.; Zhou, Jianxin; Ranalli, Tamara; Kobayashi, Ryuji; Edmondson, Diane G.; Roth, Sharon Y.; Allis, C. David (1996). "Tetrahymena Histone Acetyltransferase A: A Homolog to Yeast Gcn5p Linking Histone Acetylation to Gene Activation". Cell . 84 (6): 843–851. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81063-6 . PMID  8601308.
  13. ^ Allis, C. David (2015). «Изменение» моей карьеры в сторону биологии хроматина». Журнал биологической химии . 290 (26): 15904–15908. doi : 10.1074/jbc.X115.663229 . PMC 4481195. PMID  25944906 . 
  14. ^ Allfrey, VG; Faulkner, R.; Mirsky, AE (1964). «Ацетилирование и метилирование гистонов и их возможная роль в регуляции синтеза РНК». Труды Национальной академии наук . 51 (5): 786–794. Bibcode : 1964PNAS...51..786A. doi : 10.1073 /pnas.51.5.786 . PMC 300163. PMID  14172992. 
  15. ^ Эллис, К. Дэвид (2018). «В поисках секретов гистоновых белков: удивительное путешествие с замечательным актерским составом». Cell . 175 (1): 18–21. doi : 10.1016/j.cell.2018.08.022 . PMID  30217363.
  16. ^ Mizzen, Craig A.; Yang, Xiang-Jiao; Kokubo, Tetsuro; Brownell, James E.; Bannister, Andrew J.; Owen-Hughes, Tom; Workman, Jerry; Wang, Lian; Berger, Shelley L.; Kouzarides, Tony; Nakatani, Yoshihiro; Allis, C. David (1996). "The TAFII250 Subunit of TFIID Has Histone Acetyltransferase Activity" (PDF) . Cell . 87 (7): 1261–1270. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81821-8 . PMID  8980232. Архивировано из оригинала (PDF) 15 апреля 2019 г. . Получено 16 февраля 2023 г.
  17. ^ Хендзел, Майкл Дж.; Вэй, Йи; Манчини, Майкл А.; Ван Хузер, Аарон; Раналли, Тамара; Бринкли, БР; Базетт-Джонс, Дэвид П.; Эллис, К. Дэвид (1997). «Специфическое для митоза фосфорилирование гистона H3 инициируется в первую очередь внутри перицентромерного гетерохроматина во время G2 и распространяется упорядоченным образом, совпадающим с митотической конденсацией хромосом». Chromosoma . 106 (6): 348–360. doi :10.1007/s004120050256. PMID  9362543. S2CID  29723188 . Получено 17 февраля 2023 г. .
  18. ^ Hsu, Jer-Yuan; Sun, Zu-Wen; Li, Xiumin; Reuben, Melanie; Tatchell, Kelly; Bishop, Douglas K.; Grushcow, Jeremy M.; Brame, Cynthia J.; Caldwell, Jennifer A.; Hunt, Donald F.; Lin, Rueyling; Smith, M. Mitchell; Allis, C. David (2000). «Митотическое фосфорилирование гистона H3 регулируется киназой Ipl1/aurora и фосфатазой Glc7/PP1 у почкующихся дрожжей и нематод». Cell . 102 (3): 279–291. doi : 10.1016/S0092-8674(00)00034-9 . PMID  10975519.
  19. ^ Cheung, Peter; Tanner, Kirk G.; Cheung, Wang L.; Sassone-Corsi, Paolo; Denu, John M.; Allis, C. David (2000). «Синергическое сопряжение фосфорилирования и ацетилирования гистона H3 в ответ на стимуляцию эпидермального фактора роста». Molecular Cell . 5 (6): 905–915. doi : 10.1016/s1097-2765(00)80256-7 . PMID  10911985.
  20. ^ Райс, Джадд К.; Бриггс, Скотт Д.; Юберхайде, Беатрикс; Барбер, Синтия М.; Шабановиц, Джеффри; Хант, Дональд Ф.; Синкай, Йоичи; Эллис, К. Дэвид (2003). «Гистоновые метилтрансферазы направляют различные степени метилирования для определения различных доменов хроматина». Molecular Cell . 12 (6): 1591–1598. doi : 10.1016/s1097-2765(03)00479-9 . PMID  14690610.
  21. ^ Strahl, Brian D.; Grant, Patrick A.; Briggs, Scott D.; Sun, Zu-Wen; Bone, James R.; Caldwell, Jennifer A.; Mollah, Sahana; Cook, Richard G.; Shabanowitz, Jeffrey; Hunt, Donald F.; Allis, C. David (2002). «Set2 — это нуклеосомная гистоновая H3-селективная метилтрансфераза, которая опосредует транскрипционную репрессию». Молекулярная и клеточная биология . 22 (5): 1298–1306. doi : 10.1128/MCB.22.5.1298-1306.2002 . PMC 134702. PMID  11839797 . 
  22. ^ Сан, Зу-Вен; Эллис, К. Дэвид (2002). «Убиквитинирование гистона H2B регулирует метилирование H3 и подавление генов у дрожжей». Nature . 418 (6893): 104–108. Bibcode :2002Natur.418..104S. doi :10.1038/nature00883. PMID  12077605. S2CID  4338471 . Получено 18 февраля 2023 г. .
  23. ^ Strahl, Brian D.; Allis, C. David (2000). «Язык ковалентных модификаций гистонов». Nature . 403 (6765): 41–45. Bibcode :2000Natur.403...41S. doi :10.1038/47412. PMID  10638745. S2CID  4418993 . Получено 19 февраля 2023 г. .
  24. ^ Jenuwein, Thomas ; Allis, C. David (2001). «Translating the histone code» (Перевод кода гистонов). Science . 293 (5532): 1074–1080. CiteSeerX 10.1.1.453.900 . doi :10.1126/science.1063127. PMID  11498575. S2CID  1883924. Архивировано из оригинала 20 февраля 2023 г. Получено 20 февраля 2023 г. 
  25. ^ Чи, Пинг; Эллис, К. Дэвид; Ванг, Ганг Грег (2010). «Ковалентные модификации гистонов — неправильно написанные, неправильно истолкованные и неправильно стертые при раке человека». Nature Reviews Cancer . 10 (7): 457–469. doi :10.1038/nrc2876. PMC 3262678. PMID  20574448 . 
  26. ^ Дент, Шарон; Гревал, Шив (2023). "C. David Allis (1951–2023)". Nature . 614 (7948): 409. Bibcode :2023Natur.614..409D. doi : 10.1038/d41586-023-00346-0 . PMID  36737544. S2CID  256577181.
  27. ^ Нацев, Бенджамин А.; Фэн, Лицзюань; Багерт, Джон Д.; Лемеш, Агата Э.; Гао, Цзянь Цзюн; Сошнев Алексей А.; Кундра, Ритика; Шульц, Николаус; Мьюир, Том В.; Эллис, К. Дэвид (2019). «Расширяющийся ландшафт мутаций онкогистона при раке человека». Природа . 567 (7749): 473–478. Бибкод : 2019Natur.567..473N. дои : 10.1038/s41586-019-1038-1. ПМК 6512987 . ПМИД  30894748. 
  28. ^ Бергер, Шелли Л. (2023). "C. David Allis (1951–2023)". Science . 379 (6633): 645. Bibcode :2023Sci...379..645B. doi : 10.1126/science.adg7738 . PMID  36795814. S2CID  256901502.
  29. ^ "C. David Allis". Американская академия искусств и наук . Архивировано из оригинала 3 февраля 2023 г. Получено 3 февраля 2023 г.
  30. ^ "Лауреат премии Диксона 2002 года". Премия Диксона . Архивировано из оригинала 25 декабря 2022 г. Получено 3 февраля 2023 г.
  31. ^ "Massry Prize Winners (1996 – настоящее время)". University of Southern California Keck School of Medicine . Архивировано из оригинала 5 декабря 2022 г. Получено 5 декабря 2022 г.
  32. ^ "C. David Allis to Receive the Third Annual Wiley Prize in the Biomedical Sciences". Wiley Foundation. 27 января 2004 г. Архивировано из оригинала 5 февраля 2023 г. Получено 5 февраля 2023 г.
  33. ^ "C. David Allis". Национальная академия наук . Архивировано из оригинала 5 февраля 2023 г. Получено 5 февраля 2023 г.
  34. ^ "Past A&S Alumni Award Winners (2002-2019)". Колледж искусств и наук Университета Цинциннати . Архивировано из оригинала 4 декабря 2022 г. Получено 6 февраля 2023 г.
  35. ^ "C. David Allis". Gairdner Foundation . Архивировано из оригинала 6 декабря 2021 г. Получено 6 февраля 2023 г.
  36. ^ "ASBMB–Merck Award". Американское общество биохимии и молекулярной биологии . Архивировано из оригинала 6 февраля 2023 г. Получено 6 февраля 2023 г.
  37. ^ "Past Winners". Brandeis University . Архивировано из оригинала 6 февраля 2023 г. Получено 6 февраля 2023 г.
  38. ^ "The 2014 Japan Prize". Japan Prize . Архивировано из оригинала 2 февраля 2023 г. Получено 6 февраля 2023 г.
  39. ^ "Lauréat 2014 du prix Charles-Léopold Mayer : C. David Allis" (на французском). Французская академия наук . Архивировано из оригинала 7 февраля 2023 г. . Получено 7 февраля 2023 г. .
  40. ^ "C. David Allis". Breakthrough Prize Board . Архивировано из оригинала 16 января 2023 г. Получено 16 января 2023 г.
  41. ^ "C. David Allis". Gruber Foundation. Архивировано из оригинала 1 февраля 2023 г. Получено 1 февраля 2022 г.
  42. ^ "Премия March of Dimes 2017 года присуждена доктору С. Дэвиду Эллису за новаторские исследования". March of Dimes . 8 мая 2017 г. Архивировано из оригинала 8 февраля 2023 г. Получено 8 февраля 2022 г.
  43. ^ "Премия Альберта Ласкера за фундаментальные медицинские исследования 2018 года". Фонд Ласкера . Архивировано из оригинала 8 февраля 2023 г. Получено 8 февраля 2022 г.
  44. ^ "C. David Allis, Ph.D." Национальная медицинская академия . Архивировано из оригинала 8 февраля 2023 г. Получено 8 февраля 2023 г.
  45. ^ "Премия Олбани 2022 года присуждена за важнейшие открытия в области регуляции генов" (пресс-релиз). Медицинский колледж Олбани . 13 октября 2022 г. Архивировано из оригинала 14 октября 2022 г. Получено 14 октября 2022 г.
  46. ^ «Вспоминая пионера биологии хроматина». Рокфеллеровский университет. 14 января 2023 г. Архивировано из оригинала 16 февраля 2023 г. Получено 16 февраля 2023 г.
  47. ^ "C. David Allis Mentorship Fund for Young Scientists". Rockefeller University. Архивировано из оригинала 16 февраля 2023 г. Получено 16 февраля 2023 г.