Алкогольдегидрогеназы ( АДГ ) ( КФ 1.1.1.1) представляют собой группу ферментов дегидрогеназ , которые встречаются во многих организмах и способствуют взаимопревращениям между спиртами и альдегидами или кетонами с восстановлением никотинамидадениндинуклеотида (НАД + ) до НАДН. У людей и многих других животных они служат для расщепления спиртов, которые в противном случае были бы токсичны, а также участвуют в образовании полезных альдегидных, кетонных или спиртовых групп в ходе биосинтеза различных метаболитов . У дрожжей , растений и многих бактерий некоторые алкогольдегидрогеназы катализируют противоположную реакцию как часть ферментации , чтобы обеспечить постоянное поступление НАД + .
Генетические доказательства, полученные в результате сравнения нескольких организмов, показали, что глутатион -зависимая формальдегиддегидрогеназа , идентичная алкогольдегидрогеназе класса III (ADH-3/ADH5), предположительно является предковым ферментом для всего семейства ADH. [2] [3] [4] На ранних этапах эволюции был важен эффективный метод устранения как эндогенного, так и экзогенного формальдегида, и эта способность сохранила предковую ADH-3 с течением времени. Дупликация гена ADH-3, за которой последовала серия мутаций, привела к эволюции других ADH. [3] [4]
Считается, что способность производить этанол из сахара (что является основой того, как производятся алкогольные напитки) изначально развилась у дрожжей . Хотя эта особенность не является адаптивной с точки зрения энергии, производя спирт в таких высоких концентрациях, что он был бы токсичным для других организмов, дрожжевые клетки могли эффективно устранять своих конкурентов. Поскольку гниющие фрукты могут содержать более 4% этанола, животным, поедающим фрукты, требовалась система для метаболизма экзогенного этанола. Считалось, что это объясняет сохранение этанол-активного АДГ у видов, отличных от дрожжей, хотя теперь известно, что АДГ-3 также играет важную роль в сигнализации оксида азота . [5] [6]
У людей секвенирование гена ADH1B (отвечающего за выработку полипептида алкогольдегидрогеназы ) показывает несколько функциональных вариантов. В одном из них есть SNP (полиморфизм одного нуклеотида), который приводит к остатку гистидина или аргинина в позиции 47 в зрелом полипептиде. В варианте гистидина фермент гораздо более эффективен в вышеупомянутом преобразовании. [7] Однако фермент, ответственный за преобразование ацетальдегида в ацетат, остается незатронутым, что приводит к различным скоростям катализа субстрата и вызывает накопление токсичного ацетальдегида, вызывая повреждение клеток. [7] Это обеспечивает некоторую защиту от чрезмерного потребления алкоголя и алкогольной зависимости (алкоголизма). [8] [9] [10] [11] Различные гаплотипы, возникающие в результате этой мутации, более сконцентрированы в регионах вблизи Восточного Китая, региона, также известного своей низкой толерантностью к алкоголю и зависимостью от него.
Было проведено исследование с целью найти корреляцию между аллельным распределением и алкоголизмом, и результаты показывают, что аллельное распределение возникло вместе с выращиванием риса в регионе между 12 000 и 6 000 лет назад. [12] В регионах, где выращивался рис, рис также ферментировался в этанол. [12] Это привело к предположению, что возросшая доступность алкоголя привела к алкоголизму и злоупотреблению, что привело к снижению репродуктивной приспособленности. [12] Те, у кого есть вариантный аллель, плохо переносят алкоголь, что снижает вероятность зависимости и злоупотребления. [7] [12] Гипотеза предполагает, что те люди, у которых был вариант фермента гистидина, были достаточно чувствительны к воздействию алкоголя, что привело к дифференциальному репродуктивному успеху, и соответствующие аллели передавались из поколения в поколение. Классическая дарвиновская эволюция действовала бы, чтобы отбирать вредную форму фермента (вариант Arg) из-за сниженного репродуктивного успеха людей, несущих аллель. Результатом будет более высокая частота аллеля, ответственного за фермент His-варианта в регионах, которые находились под селективным давлением дольше всего. Распространение и частота His-варианта следуют за распространением выращивания риса во внутренние регионы Азии, с более высокими частотами His-варианта в регионах, которые выращивали рис дольше всего. [7] Таким образом, географическое распределение аллелей, по-видимому, является результатом естественного отбора против людей с более низким репродуктивным успехом, а именно тех, кто носит аллель варианта Arg и более подвержен алкоголизму. [13] Однако сохранение варианта Arg в других популяциях свидетельствует о том, что эффект не может быть сильным. [ необходима цитата ]
Первая в истории изолированная алкогольдегидрогеназа (АДГ) была очищена в 1937 году из Saccharomyces cerevisiae (пивные дрожжи). [14] Многие аспекты каталитического механизма фермента АДГ из печени лошади были исследованы Хьюго Теорелем и его коллегами. [15] АДГ также был одним из первых олигомерных ферментов, у которого была определена аминокислотная последовательность и трехмерная структура. [16] [17] [18]
В начале 1960-х годов у плодовых мушек рода Drosophila melanogaster был обнаружен ген алкогольдегидрогеназы ( АДГ ) . [19] Мухи, мутировавшие по АДГ, не могут расщеплять спирты на альдегиды и кетоны. [20] В то время как этанол, вырабатываемый гниющими фруктами, является естественным источником пищи и местом откладки яиц для дрозофилы при низких концентрациях (<4%), высокие концентрации этанола могут вызывать окислительный стресс и алкогольную интоксикацию . [21] Физическая форма дрозофилы повышается при потреблении низкой концентрации этанола. Первоначальное воздействие этанола вызывает гиперактивность, за которой следует нарушение координации и седация. [22] Дальнейшие исследования показали, что антиоксидант альфа-кетоглутарат может быть полезен для снижения окислительного стресса, вызванного потреблением алкоголя. Исследование 2016 года пришло к выводу, что добавление в пищу 10 мМ альфа-кетоглутарата со временем снижает чувствительность дрозофилы к алкоголю. [23] Для гена, который кодирует ADH, известно 194 классических и вставочных аллеля. [24] Два аллеля, которые обычно используются для экспериментов, связанных с токсичностью этанола и реакцией на него, — это ADH s (медленный) и ADH F (быстрый). Многочисленные эксперименты пришли к выводу, что эти два аллеля объясняют различия в ферментативной активности для каждого из них. При сравнении гомозигот Adh-F (дикий тип) и Adh-nulls (гомозиготный null) исследования показали, что Adh-nulls имеют более низкий уровень толерантности к этанолу, начиная процесс интоксикации раньше, чем его контрпартнер. [22] Другие эксперименты также пришли к выводу, что аллель Adh является гаплодостаточным. Гаплодостаточность означает, что наличие одного функционирующего аллеля будет достаточным для создания необходимых фенотипов для выживания. Это означает, что мухи, гетерозиготные по аллелю Adh (одна копия нулевого аллеля Adh и одна копия аллеля Adh дикого типа), давали очень похожую фенотипическую толерантность к алкоголю, как и гомозиготные доминантные мухи (две копии аллеля Adh дикого типа). [21] Независимо от генотипа, дрозофилы демонстрируют отрицательную реакцию на воздействие образцов с содержанием этанола выше 5%, что делает любую толерантность неадекватной, что приводит к летальной дозировке и уровню смертности около 70%. [25] Дрозофилы демонстрируют многие из тех же реакций на этанол, что и люди. Низкие дозы этанола вызывают гиперактивность, умеренные дозы — нарушение координации, а высокие дозы — седацию . [26]
Алкогольдегидрогеназы включают группу из нескольких изоферментов , которые катализируют окисление первичных и вторичных спиртов до альдегидов и кетонов соответственно, а также могут катализировать обратную реакцию. [19] У млекопитающих это окислительно-восстановительная (восстановительная/окислительная) реакция с участием кофермента никотинамидадениндинуклеотида (НАД + ). [ необходима цитата ]
Механизм в дрожжах и бактериях является обратным этой реакции. Эти шаги подтверждаются кинетическими исследованиями. [27]
Субстрат координируется с цинком, и этот фермент имеет два атома цинка на субъединицу. Один из них является активным центром, который участвует в катализе. В активном центре лигандами являются Cys-46, Cys-174, His-67 и одна молекула воды. Другая субъединица участвует в структуре. В этом механизме гидрид из спирта переходит в NAD + . Кристаллические структуры указывают на то, что His-51 депротонирует никотинамидрибозу, которая депротонирует Ser-48. Наконец, Ser-48 депротонирует спирт, превращая его в альдегид. [27] С механистической точки зрения, если фермент добавляет гидрид к поверхности re NAD + , полученный водород включается в положение pro-R. Ферменты, которые добавляют гидрид к поверхности re, считаются дегидрогеназами класса A. [ необходима цитата ]
Активный центр человеческого ADH1 (PDB:1HSO) состоит из атома цинка, His-67, Cys-174, Cys-46, Thr-48, His-51, Ile-269, Val-292, Ala-317 и Phe-319. В обычно изучаемой изоформе печени лошади Thr-48 представляет собой Ser, а Leu-319 представляет собой Phe. Цинк координирует субстрат (спирт). Цинк координируется Cys-46, Cys-174 и His-67. Leu-319, Ala-317, His-51, Ile-269 и Val-292 стабилизируют NAD + , образуя водородные связи . His-51 и Ile-269 образуют водородные связи со спиртами на никотинамидрибозе. Phe-319, Ala-317 и Val-292 образуют водородные связи с амидом на NAD + . [27]
Алкогольдегидрогеназы млекопитающих также имеют структурный цинковый сайт. Этот ион Zn играет структурную роль и имеет решающее значение для стабильности белка. Структуры каталитических и структурных цинковых сайтов в алкогольдегидрогеназе печени лошади (HLADH), как показано в кристаллографических структурах, которые были изучены вычислительно с помощью квантовой химии, а также с помощью методов классической молекулярной динамики. Структурный цинковый сайт состоит из четырех близко расположенных цистеиновых лигандов (Cys97, Cys100, Cys103 и Cys111 в аминокислотной последовательности), расположенных в почти симметричном тетраэдре вокруг иона Zn. Недавнее исследование показало, что взаимодействие между цинком и цистеином регулируется в первую очередь электростатическим вкладом с дополнительным ковалентным вкладом в связывание. [28]
У людей АДГ существует в нескольких формах в виде димера и кодируется по крайней мере семью генами. Среди пяти классов (IV) алкогольдегидрогеназы печеночные формы, которые в основном используются у людей, относятся к классу 1. Класс 1 состоит из субъединиц α, β и γ, которые кодируются генами ADH1A , ADH1B и ADH1C . [29] [30] Фермент присутствует в больших количествах в печени и слизистой оболочке желудка . [ 31] Он катализирует окисление этанола до ацетальдегида (этаналь):
Это позволяет употреблять алкогольные напитки , но его эволюционное предназначение, вероятно, заключается в расщеплении спиртов, которые естественным образом содержатся в пище или вырабатываются бактериями в пищеварительном тракте . [32]
Еще одной эволюционной целью является обратимый метаболизм ретинола ( витамина А ), спирта, в ретинальдегид , также известный как ретиналь, который затем необратимо превращается в ретиноевую кислоту , которая регулирует экспрессию сотен генов. [33] [34] [35]
Алкогольдегидрогеназа также участвует в токсичности других видов алкоголя: например, она окисляет метанол , образуя формальдегид и в конечном итоге муравьиную кислоту . [36] У людей есть по крайней мере шесть немного отличающихся алкогольдегидрогеназ. Каждая из них является димером (т. е. состоит из двух полипептидов ), причем каждый димер содержит два иона цинка Zn 2+ . Один из этих ионов имеет решающее значение для работы фермента: он расположен в каталитическом центре и удерживает гидроксильную группу спирта на месте. [ необходима цитата ]
Активность алкогольдегидрогеназы различается у мужчин и женщин, у молодых и старых, а также среди популяций из разных регионов мира. Например, молодые женщины не способны перерабатывать алкоголь с той же скоростью, что и молодые мужчины, поскольку они не экспрессируют алкогольдегидрогеназу так же сильно, хотя обратное верно для людей среднего возраста. [37] Уровень активности может зависеть не только от уровня экспрессии, но и от аллельного разнообразия среди популяции.
Человеческие гены, кодирующие алкогольдегидрогеназы классов II, III, IV и V, — это ADH4 , ADH5 , ADH7 и ADH6 соответственно.
В отличие от людей, дрожжи и бактерии (за исключением молочнокислых бактерий и кишечной палочки в определенных условиях) не ферментируют глюкозу до лактата. Вместо этого они ферментируют ее до этанола и CO2 . Общую реакцию можно увидеть ниже:
В дрожжах [39] и многих бактериях алкогольдегидрогеназа играет важную роль в ферментации: пируват , образующийся в результате гликолиза, преобразуется в ацетальдегид и углекислый газ , а ацетальдегид затем восстанавливается до этанола алкогольдегидрогеназой, называемой ADH1. Целью этого последнего шага является регенерация NAD + , чтобы мог продолжаться генерирующий энергию гликолиз. Люди используют этот процесс для производства алкогольных напитков, позволяя дрожжам сбраживать различные фрукты или зерна. Дрожжи могут производить и потреблять свой собственный алкоголь.
Основная алкогольдегидрогеназа в дрожжах больше человеческой и состоит из четырех, а не только из двух субъединиц. Она также содержит цинк в своем каталитическом центре. Вместе с цинксодержащими алкогольдегидрогеназами животных и людей эти ферменты из дрожжей и многих бактерий образуют семейство "длинноцепочечных"-алкоголдегидрогеназ. [ необходима цитата ]
У пивных дрожжей также есть другая алкогольдегидрогеназа, ADH2 , которая развилась из дублированной версии хромосомы, содержащей ген ADH1. ADH2 используется дрожжами для преобразования этанола обратно в ацетальдегид, и он экспрессируется только при низкой концентрации сахара. Наличие этих двух ферментов позволяет дрожжам производить спирт, когда сахара много (и этот спирт затем убивает конкурирующие микробы), а затем продолжать окисление спирта, когда сахар и конкуренция исчезают. [40]
В растениях АДГ катализирует ту же реакцию, что и в дрожжах и бактериях, чтобы обеспечить постоянное снабжение НАД + . У кукурузы есть две версии АДГ – АДГ1 и АДГ2, Arabidopsis thaliana содержит только один ген АДГ. Структура АДГ Arabidopsis на 47% консервативна по сравнению с АДГ из печени лошади. Однако структурно и функционально важные остатки, такие как семь остатков, которые обеспечивают лиганды для каталитических и некаталитических атомов цинка, сохраняются, что позволяет предположить, что ферменты имеют схожую структуру. [41] АДГ конститутивно экспрессируется на низких уровнях в корнях молодых растений, выращенных на агаре. Если корням не хватает кислорода, экспрессия АДГ значительно увеличивается. [42] Его экспрессия также увеличивается в ответ на обезвоживание, низкие температуры и абсцизовую кислоту , и он играет важную роль в созревании плодов, развитии сеянцев и развитии пыльцы. [43] Различия в последовательностях ADH у разных видов были использованы для создания филогений, показывающих, насколько тесно связаны разные виды растений. [44] Это идеальный ген для использования из-за его удобного размера (2–3 кб в длину с кодирующей последовательностью ≈1000 нуклеотидов) и низкого числа копий. [43]
Третье семейство алкогольдегидрогеназ, не связанное с двумя предыдущими, содержит железо . Они встречаются в бактериях и грибах. По сравнению с ферментами вышеуказанных семейств, эти ферменты чувствительны к кислороду. [ необходима цитата ] Члены семейства алкогольдегидрогеназ, содержащих железо, включают:
Еще один класс алкогольдегидрогеназ относится к хиноферментам и требует хиноидных кофакторов (например, пирролохинолинхинон, PQQ) в качестве связанных с ферментом акцепторов электронов. Типичным примером этого типа фермента является метанолдегидрогеназа метилотрофных бактерий.
В биотрансформации алкогольдегидрогеназы часто используются для синтеза энантиомерно чистых стереоизомеров хиральных спиртов. Часто может быть достигнута высокая хемо- и энантиоселективность. Одним из примеров является алкогольдегидрогеназа из Lactobacillus brevis ( Lb ADH), которая описывается как универсальный биокатализатор. [52] Высокая хемоспецифичность была подтверждена также в случае субстратов, представляющих два потенциальных окислительно-восстановительных центра. Например, коричный альдегид представляет как алифатическую двойную связь, так и альдегидную функцию. В отличие от обычных катализаторов, алкогольдегидрогеназы способны избирательно действовать только на последний, давая исключительно коричный спирт . [53]
В топливных элементах алкогольдегидрогеназы могут использоваться для катализа расщепления топлива для этанолового топливного элемента . Ученые из Университета Сент-Луиса использовали алкогольдегидрогеназу на углеродной основе с поли( метиленовым зеленым ) в качестве анода, с мембраной нафиона , чтобы достичь около 50 мкА / см2 . [ 54]
В 1949 году Э. Рэкер определил одну единицу активности алкогольдегидрогеназы как количество, вызывающее изменение оптической плотности на 0,001 в минуту при стандартных условиях анализа . [55] В последнее время более распространенным стало международное определение ферментативной единицы (ЕЕ): одна единица алкогольдегидрогеназы преобразует 1,0 мкмоль этанола в ацетальдегид в минуту при pH 8,8 и температуре 25 °C. [56]
Были проведены исследования, показывающие, что вариации в ADH, которые влияют на метаболизм этанола, оказывают влияние на риск алкогольной зависимости. [8] [9] [10] [11] [57] Самый сильный эффект обусловлен вариациями в ADH1B, которые увеличивают скорость, с которой алкоголь превращается в ацетальдегид. Один такой вариант наиболее распространен у людей из Восточной Азии и Ближнего Востока, другой наиболее распространен у людей из Африки. [9] Оба варианта снижают риск алкоголизма, но люди могут стать алкоголиками, несмотря на это. Исследователи предварительно обнаружили несколько других генов, связанных с алкоголизмом , и знают, что должно быть еще много других, которые предстоит найти. [58] Исследования продолжаются с целью идентификации генов и их влияния на алкоголизм. [ необходима цитата ]
Наркотическая зависимость — еще одна проблема, связанная с АДГ, которая, по мнению исследователей, может быть связана с алкоголизмом. Одно конкретное исследование предполагает, что с наркотической зависимостью связано семь генов АДГ, однако необходимы дополнительные исследования. [59] Алкогольная зависимость и зависимость от других наркотиков могут иметь некоторые общие факторы риска, но поскольку алкогольная зависимость часто сочетается с другими наркотическими зависимостями, связь АДГ с другими наркотическими зависимостями может не быть причинной. [ необходима цитата ]
Фомепизол , препарат, который конкурентно ингибирует алкогольдегидрогеназу, может использоваться при остром отравлении метанолом [60] или этиленгликолем [61] . Это предотвращает превращение метанола или этиленгликоля в его токсичные метаболиты (такие как муравьиная кислота , формальдегид или гликолят ). Тот же эффект иногда достигается и с этанолом , опять же за счет конкурентного ингибирования АДГ. [ необходима цитата ]
Препарат гидроксизин распадается на свой активный метаболит цетиризин с помощью алкогольдегидрогеназы. Другие препараты с алкогольными группами могут метаболизироваться аналогичным образом, пока стерические помехи не мешают спирту достичь активного центра. [62]