stringtranslate.com

Ацидофил

Ацидофилы или ацидофильные организмы – это те, которые процветают в очень кислых условиях (обычно при pH 5,0 или ниже [1] ). Эти организмы можно найти в разных ветвях древа жизни , включая архей , бактерий , [2] и эукариев .

Примеры

В список этих организмов входят:

Архея

Бактерии

Эукария

Механизмы адаптации к кислой среде

Большинство ацидофильных организмов развили чрезвычайно эффективные механизмы выкачивания протонов из внутриклеточного пространства , чтобы поддерживать цитоплазму на нейтральном или близком к нему уровне pH. Следовательно, внутриклеточным белкам не требуется приобретать кислотную стабильность в ходе эволюции. Однако другие ацидофилы, такие как Acetobacter aceti , имеют закисленную цитоплазму, которая заставляет почти все белки в геноме приобретать кислотную стабильность. [8] По этой причине Acetobacter aceti стал ценным ресурсом для понимания механизмов, с помощью которых белки могут достигать кислотной стабильности.

Исследования белков, адаптированных к низкому pH, выявили несколько общих механизмов, с помощью которых белки могут достигать кислотной стабильности. В большинстве кислотоустойчивых белков (таких как пепсин и белок soxF из Sulfolobus acidocaldarius ) наблюдается избыток кислотных остатков, что сводит к минимуму дестабилизацию низкого pH, вызванную накоплением положительного заряда. Другие механизмы включают минимизацию доступности кислотных остатков растворителем или связывание металлических кофакторов. Было показано , что в особом случае кислотной стабильности белок NAPase из Nocardiopsis alba переместил чувствительные к кислоте солевые мостики из областей, которые играют важную роль в процессе разворачивания. В этом случае кинетической кислотной стабильности долговечность белка достигается в широком диапазоне pH, как кислого, так и основного.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Цзинь, Цюшэн; Кирк, Мэтью Ф. (01 мая 2018 г.). «РН как основной контроль в микробиологии окружающей среды: 1. Термодинамическая перспектива». Границы в науке об окружающей среде . 6:21 . дои : 10.3389/fenvs.2018.00021 . ISSN  2296-665X.
  2. ^ Беккер, А., Типы бактерий, живущих при кислом pH». Проверено 10 мая 2017 г.
  3. ^ abc Дворкин М, Фальков С (2006). Прокариоты: Справочник по биологии бактерий.
  4. ^ Сингх О.В. (2012). Экстремофилы: устойчивые ресурсы и биотехнологические последствия . Джон Уайли и сыновья . стр. 76–79. ISBN 978-1-118-10300-5.
  5. ^ Квайзер, Ахим; Оксенрайтер, Торстен; Ланц, Криста; Шустер, Стефан К.; Треуш, Александр Х.; Эк, Юрген; Шлепер, Криста (27 августа 2003 г.). «Ацидобактерии образуют целостную, но очень разнообразную группу внутри бактериальной области: данные геномики окружающей среды». Молекулярная микробиология . 50 (2): 563–575. дои : 10.1046/j.1365-2958.2003.03707.x. PMID  14617179. S2CID  25162803.
  6. ^ Петтифер Г.Л.; Осмундсон М.Э.; Мерфи Дж. М. (март 1997 г.). «Методы обнаружения и подсчета Alicyclobacillus acidoterrestris и исследования роста и образования пятен во фруктовых соках и сокосодержащих напитках». Письма по прикладной микробиологии . 24 (3): 185–189. дои : 10.1046/j.1472-765X.1997.00373.x. PMID  9080697. S2CID  6976998.
  7. ^ abc Роулингс, Дуглас; Джонсон, Д. Барри. «Эукариотические ацидофилы». Энциклопедия систем жизнеобеспечения (EOLSS) . Издательство Эолсс. Архивировано из оригинала 13 октября 2014 г. Проверено 3 февраля 2014 г.
  8. ^ Мензель, Ю.; Готшалк, Г. (1985). «Внутренний pH Acetobacterium wieringae и Acetobacter aceti во время роста и производства уксусной кислоты». Арка Микробиол . 143 (1): 47–51. Бибкод : 1985ArMic.143...47M. дои : 10.1007/BF00414767. S2CID  6477488.

дальнейшее чтение