stringtranslate.com

Институт Дж. Крейга Вентера

Институт Дж. Крейга Вентера в Роквилле
Образовательный автобус возле Института Дж. Крейга Вентера в Роквилле

32°52′09″с.ш. 117°14′35″з.д. / 32,869107°с.ш. 117,243037°з.д. / 32,869107; -117,243037Институт Дж. Крейга Вентера ( JCVI ) — некоммерческий исследовательский институт геномики , основанный доктором философии Дж. Крейгом Вентером в октябре 2006 года. Институт был создан в результате объединения четырех организаций: Центра развития геномики, Института геномных исследований (TIGR), Института биологических энергетических альтернатив и Объединенного технологического центра Научного фонда Дж. Крейга Вентера. Он имеет филиалы в Роквилле, штат Мэриленд , и Сан-Диего, штат Калифорния . [ требуется ссылка ]

Институт изучает социальные последствия геномики в дополнение к самой геномике. Исследования института охватывают геномную медицину; экологический геномный анализ; чистую энергию ; синтетическую биологию ; а также этику, право и экономику. В институте работают более 200 человек, включая лауреата Нобелевской премии Гамильтона Смита . Он был продан Калифорнийскому университету в Сан-Диего в 2022 году.

История

В 2004 году Центр развития геномики (TCAG), Институт альтернатив биологической энергии (IBEA) и Объединенный технологический центр Института Дж. Крейга Вентера (JTC) были объединены в Институт Дж. Крейга Вентера (JCVI). [1]

В 1992 году Крейг Вентер был исследователем в Национальном институте здравоохранения (NIH). В то же время он основал Институт геномных исследований (TIGR) и участвовал в определении генома человека . [2] [3] [4] Из-за разногласий по поводу того, как управлялся проект, TIGR был исключен из финансирования NIH в 1998 году. [5] [6] Политические, личные и этические конфликты гонки между государственным и частным секторами были заметны. [2] [3] [4] [7] [8] [9] [10] [11] [12] [ чрезмерное цитирование ]

В 1995 году предшественник Института Дж. Крейга Вентера, TIGR, определил последовательность Haemophilus influenzae , Mycoplasma genitalium и Methanococcus jannaschii . [13] [14] В 1997 году TIGR определил геном Borrelia burgdorferi (вызывающей болезнь Лайма). [15] В 1998 году TIGR секвенировал геном Treponema pallidum (вызывающей сифилис). [16] В 1999 году TIGR опубликовал последовательность радиорезистентного полиэкстремофила Deinococcus radiodurans . [17] TIGR секвенировал и проанализировал более 50 микробных геномов. TIGR разработал генный поисковик GLIMMER и программу выравнивания последовательностей MUMmer . В 2001 году во время атак сибирской язвы TIGR работала с Национальным научным фондом и ФБР над секвенированием штамма Bacillus anthracis, который использовался в биотеррористических атаках. [18]

В июне 2000 года Вентер основал Центр развития геномики (TCAG), аналитический центр по изучению этики генетики человека и исследований стволовых клеток. [19] [20]

Также в 2002 году Вентер основал Институт биологических энергетических альтернатив (IBEA) для исследования использования микроорганизмов для производства альтернативных видов топлива (например, водорода) и для секвестрации углекислого газа . [19] IBEA начал геномное секвенирование популяций микроорганизмов окружающей среды, которые могли бы быть использованы. [21] Для поддержки этих объектов Вентер создал Объединенный технологический центр Института Дж. Крейга Вентера (JTC), который специализировался на высокопроизводительном секвенировании . Для оказания административной и финансовой поддержки TIGR, TCAG, IBEA и JTC Вентер создал некоммерческий Научный фонд Дж. Крейга Вентера (JCVSF) для консолидации деятельности между его дочерними организациями.

В 2007 году институт опубликовал первый диплоидный геном человека, то есть геном одного человека (Дж. Крейг Вентер), в котором были секвенированы оба набора хромосом. [22] В 2010 году институт определил геном Mycoplasma mycoides из 1,08 миллиона пар оснований , который затем был вставлен в клетку для создания первой клетки с полностью синтетическим геномом. [23]

В апреле 2022 года Вентер продал объект в Ла-Хойе Калифорнийскому университету в Сан-Диего за 25 миллионов долларов. Университет, который уже имеет очень сильную программу по геномике, надеется поглотить большую часть факультета института и его текущие исследовательские гранты. Вентер продолжит возглавлять отдельную некоммерческую исследовательскую группу, также известную как Институт Дж. Крейга Вентера. [24]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ "J. Craig Venter объявляет об объединении трех исследовательских организаций в одну новую некоммерческую организацию — Институт Дж. Крейга Вентера" (пресс-релиз). Институт Дж. Крейга Вентера. 29 сентября 2004 г. Получено 20 марта 2012 г.
  2. ^ Шрив, Джеймс (2004). Геномная война: как Крейг Вентер пытался захватить код жизни и спасти мир. Knopf. ISBN 0375406298.
  3. ^ ab Sulston, John (2002). Общая тема: история науки, политики, этики и генома человека. Joseph Henry Press. ISBN 0309084091.
  4. ^ ab "The Human Genome Project Race". Центр биомолекулярной науки и инженерии, Калифорнийский университет в Санта-Крузе . Получено 20 марта 2012 г.
  5. ^ Прюитт, Ким Д. (1998). «WebWise: Руководство по веб-сайту Института геномных исследований». Genome Research . 8 (10): 1000–1004. doi : 10.1101/gr.8.10.1000 . PMID  9799788 . Получено 20 марта 2012 г. .
  6. ^ Пенниси, Э. (1998). «ПРОЕКТ ГЕНОМ ЧЕЛОВЕКА: запланированное ускорение секвенирования генома, но план находится в состоянии изменения». Science . 281 (5374): 148–149. doi :10.1126/science.281.5374.148. PMID  9687268. S2CID  40799090.
  7. ^ Goozner, Merrill (19 декабря 2001 г.). «Патентование жизни». The American Prospect . Получено 20 марта 2012 г.
  8. ^ МакЭлхени, Виктор К. (2010). Рисование карты жизни: внутри проекта «Геном человека» . Базовые книги. ISBN 978-0465043330.
  9. ^ Вентер, Дж. Крейг (2007). Жизнь расшифрована: Мой геном: Моя жизнь. Viking Adult. ISBN 978-0670063581.
  10. ^ Рабинов, Пол; Дэн-Коэн, Талия (2004). Машина, создающая будущее: биотехнологические хроники . Princeton University Press. ISBN 0691126143.
  11. ^ Шрив, Джеймс (август 2004 г.). «Эпическое путешествие Крейга Вентера с целью переосмысления происхождения видов». Wired . Том 12, № 8. Получено 20 марта 2012 г.
  12. ↑ Уэйд, Николас (27 июня 2000 г.). «Двойные ориентиры для Уотсона: спираль и геном». The New York Times . Получено 20 марта 2012 г.
  13. ^ Fraser, CM ; Gocayne, JD; White, O.; Adams, MD; Clayton, RA; Fleischmann, RD; Bult, CJ; Kerlavage, AR; Sutton, G.; Kelley, JM; Fritchman, JL; Weidman, JF; Small, KV; Sandusky, M.; Fuhrmann, J.; Nguyen, D.; Utterback, TR; Saudek, DM; Phillips, CA; Merrick, JM; Tomb, J. -F.; Dougherty, BA; Bott, KF; Hu, P. -C.; Lucier, TS; Peterson, SN; Smith, HO; Hutchison III, CA; Venter, JC (1995). "Минимальный набор генов Mycoplasma genitalium". Science . 270 (5235): 397–403. Bibcode :1995Sci...270..397F. doi :10.1126/science.270.5235.397. PMID  7569993. S2CID  29825758.
  14. ^ Балт, CJ; Уайт, О.; Олсен, Дж.Дж.; Чжоу, Л.; Флейшманн, РД; Саттон, Дж.Г.; Блейк, Дж.А.; Фицджеральд, LM; Клейтон, РА; Гокейн, доктор медицинских наук; Керлаваж, Арканзас; Догерти, бакалавр; Могила, Ж.-Ф.; Адамс, доктор медицины; Райх, CI; Овербек, Р.; Киркнесс, Э.Ф.; Вайншток, КГ; Меррик, Дж. М.; Глодек, А.; Скотт, Дж.Л.; Геохаген, НСМ; Вентер, Дж. Ф.; Фурманн, Дж.Л.; Нгуен, Д.; Аттербек, ТР; Келли, Дж. М.; Петерсон, доктор медицинских наук; Садоу, П.В.; Ханна, MC (1996). «Полная последовательность генома метаногенного архея Methanococcus jannaschii». Наука . 273 (5278): 1058–1073. Bibcode : 1996Sci...273.1058B. doi : 10.1126/science.273.5278.1058. PMID  8688087. S2CID  41481616.
  15. ^ Фрейзер, CM ; Касженс, S.; Хуан, WM; Саттон, GG; Клейтон, R.; Латхигра, R.; Уайт, O.; Кетчум, KA; Додсон, R.; Хики, EK; Гвинн, M.; Догерти, B.; Томб, JF; Флейшманн, RD; Ричардсон, D.; Петерсон, J.; Керлаваж, AR; Квакенбуш, J.; Зальцберг, S.; Хансон, M.; Ван Вугт, R.; Палмер, N.; Адамс, MD; Гокайн, J.; Вайдман, J.; Аттербек, T.; Уотти, L.; Макдональд, L.; Артиах, P.; Боуман, C. (1997). "Геномная последовательность спирохеты болезни Лайма, Borrelia burgdorferi". Nature . 390 (6660): 580–586. Bibcode : 1997Natur.390..580F. doi : 10.1038/37551 . PMID  9403685. S2CID  4388492.
  16. ^ Фрейзер, CM ; Норрис, SJ; Вайншток, GM; Уайт, O.; Саттон, GG; Додсон, R.; Гвинн, M.; Хики, EK; Клейтон, R.; Кетчум, KA; Содергрен, E.; Хардхэм, JM; Маклеод, MP; Зальцберг, S.; Петерсон, J.; Халак, H.; Ричардсон, D.; Хауэлл, JK; Чидамбарам, M.; Уттербек, T.; Макдональд, L.; Артиах, P.; Боуман, C.; Коттон, MD; Фуджи, C.; Гарланд, S.; Хэтч, B.; Хорст, K.; Робертс, K.; Сандаски, M. (1998). "Полная последовательность генома Treponema pallidum, спирохеты сифилиса". Наука . 281 (5375): 375–388. Bibcode :1998Sci...281..375F. doi :10.1126/science.281.5375.375. PMID  9665876.
  17. ^ Уайт, О.; Эйзен, Дж.; Гейдельберг, Дж.; Хики, Э.; Петерсон, Дж.; Додсон, Р.; Хафт, Д.; Гвинн, М.; Нельсон, В.; Ричардсон, Д.Л.; Моффат, К.С.; Цинь, Х.; Цзян, Л.; Памфил, В.; Кросби, М.; Шен, М.; Ваматеван, Дж.Дж.; Лам, П.; Макдональд, Л.; Уттербек, Т.; Залевски, К.; Макарова, К.С.; Аравинд, Л.; Дейли, М.Дж.; Минтон, К.В.; Флейшманн, РД; Кетчум, КА; Нельсон, К.Е.; Зальцберг, С.; Смит, Х.О. (1999). "Геномная последовательность радиорезистентной бактерии Deinococcus radiodurans R1". Наука . 286 (5444): 1571–1577. doi :10.1126/science.286.5444.1571. PMC 4147723. PMID  10567266 . 
  18. ^ Read, TD; Salzberg, S.; Pop, M.; Shumway, M.; Umayam, L.; Jiang, L.; Holtzapple, E.; Busch, J.; Smith, K.; Schupp, JM; Solomon, D.; Keim, P.; Fraser, CM (2002). «Сравнительное секвенирование генома для обнаружения новых полиморфизмов в Bacillus anthracis». Science . 296 (5575): 2028–2033. Bibcode :2002Sci...296.2028R. doi : 10.1126/science.1071837 . PMID  12004073. S2CID  15470665.
  19. ^ ab "Следующий шаг геномного гиганта". Prisma Techniek . Получено 20 марта 2012 г.
  20. ^ "Genome News Network" . Получено 20 марта 2012 г.
  21. ^ Смит, ХО; Фридман, Р.; Вентер, Дж. Крейг (лето 2003 г.). «Биологические решения для возобновляемой энергии». The Bridge . 33 (2) . Получено 20 марта 2012 г.
  22. ^ Леви, С.; Саттон, Г.; Нг, ПК; Фейк, Л.; Халперн, Алабама; Валенц, БП; Аксельрод, Н.; Хуанг, Дж.; Киркнесс, Э.Ф.; Денисов Г.; Лин, Ю.; Макдональд-младший; Панг, AWC; Шаго, М.; Стоквелл, ТБ; Циамури, А.; Бафна, В.; Бансал, В.; Кравиц, SA; Бусам, Д.А.; Бисон, Кентукки; Макинтош, Калифорния; Ремингтон, Калифорния; Абриль, Дж. Ф.; Гилл, Дж.; Борман, Дж.; Роджерс, Ю.Х.; Фрейзер, Мэн; Шерер, SW; Штраусберг, Р.Л. (2007). «Диплоидная последовательность генома отдельного человека». ПЛОС Биология . 5 (10): е254. doi : 10.1371/journal.pbio.0050254 . PMC 1964779 . PMID  17803354. 
  23. ^ Гибсон, Д.; Гласс, Дж.; Лартиг, К.; Носков В.; Чуанг, Р.; Альжир, М.; Бендерс, Г.; Монтегю, М.; Ма, Л.; Муди, ММ; Мерриман, К.; Ваши, С.; Кришнакумар, Р.; Асад-Гарсия, Н.; Эндрюс-Пфанкох, К.; Денисова Е.А.; Янг, Л.; Ци, З.-Ц.; Сигалл-Шапиро, TH; Калви, Швейцария; Пармар, ПП; Хатчисон, Калифорния, Калифорния; Смит, ХО; Вентер, Дж. К. (2010). «Создание бактериальной клетки, контролируемой химически синтезированным геномом». Наука . 329 (5987): 52–56. Бибкод : 2010Sci...329...52G. doi :10.1126/science.1190719. PMID  20488990.
  24. ↑ Роббинс, Гэри (27 апреля 2022 г.). «Генетик Крейг Вентер продает свой исследовательский центр в Ла-Хойе Калифорнийскому университету в Сан-Диего за 25 миллионов долларов». San Diego Union Tribune . Получено 28 апреля 2022 г.

Внешние ссылки