В биомедицинском контексте биомаркер или биологический маркер является измеримым индикатором некоторого биологического состояния или состояния. Биомаркеры часто измеряются и оцениваются с использованием крови, мочи или мягких тканей [1] для изучения нормальных биологических процессов , патогенных процессов или фармакологических реакций на терапевтическое вмешательство . [2] Биомаркеры используются во многих научных областях .
Биомаркеры, используемые в области медицины, являются частью относительно нового набора клинических инструментов, классифицированных по их клиническому применению. Четырьмя основными классами являются молекулярные, физиологические, гистологические и рентгенографические биомаркеры. [3] Все четыре типа биомаркеров играют клиническую роль в определении или определении решения о лечении и подразделяются на прогностические, прогностические или диагностические.
Прогностические молекулярные, клеточные или визуализирующие биомаркеры, прошедшие валидацию, могут служить методом прогнозирования клинических результатов. Прогнозирующие биомаркеры используются для оптимизации идеального лечения и часто указывают на вероятность получения пользы от конкретной терапии. Например, молекулярные биомаркеры, расположенные на стыке специфичной для патологии архитектуры молекулярных процессов и механизма действия лекарств, обещают улавливать аспекты, позволяющие оценить индивидуальный ответ на лечение. [4] Это предлагает двойной подход: как к наблюдению тенденций в ретроспективных исследованиях, так и к использованию биомаркеров для прогнозирования результатов. Например, при метастатическом колоректальном раке прогностические биомаркеры могут служить способом оценки и улучшения показателей выживаемости пациентов, а в индивидуальном случае они могут служить способом избавить пациентов от ненужной токсичности, возникающей в результате планов лечения рака. [5]
Распространенными примерами прогностических биомаркеров являются такие гены, как ER, PR и HER2/neu при раке молочной железы, слитый белок BCR-ABL при хроническом миелолейкозе, мутации c-KIT в опухолях GIST и мутации EGFR1 при НМРЛ. [6]
Диагностические биомаркеры, отвечающие бремени доказывания, могут сыграть роль в сужении диагноза. Это может привести к постановке диагноза, который значительно более специфичен для отдельных пациентов.
Биомаркер может представлять собой отслеживаемое вещество, которое вводится в организм в качестве средства для изучения функции органа или других аспектов здоровья. [7] Например, хлорид рубидия используется в качестве радиоактивного изотопа для оценки перфузии сердечной мышцы. [ нужна цитата ]
Это также может быть вещество, обнаружение которого указывает на определенное болезненное состояние, например, наличие антитела может указывать на инфекцию . [7] Более конкретно, биомаркер указывает на изменение экспрессии или состояния белка, которое коррелирует с риском или прогрессированием заболевания или с восприимчивостью заболевания к данному лечению. [7]
Одним из примеров часто используемого биомаркера в медицине является простатспецифический антиген (ПСА). Этот маркер можно измерить как показатель размера простаты, при этом быстрые изменения потенциально могут указывать на рак. Самым крайним случаем было бы обнаружение мутантных белков в качестве специфичных для рака биомаркеров с помощью мониторинга выбранных реакций (SRM), поскольку мутантные белки могут происходить только из существующей опухоли, что в конечном итоге обеспечивает наилучшую специфичность для медицинских целей. [8]
Примером может служить биомаркерный тест на черепно-мозговую травму (ЧМТ), основанный на измерении уровней нейрональной убиквитинкарбокси-концевой гидролазы L1 (UCH-L1) и глиального фибриллярного кислого белка (GFAP), чтобы помочь в диагностике наличия черепные поражения у пациентов с ЧМТ средней и легкой степени тяжести, которые в противном случае можно диагностировать только с помощью компьютерной томографии головы. [9]
Другим примером является KRAS, онкоген , который кодирует ГТФазу , участвующую в нескольких путях передачи сигнала . Биомаркеры для прецизионной онкологии обычно используются в молекулярной диагностике хронического миелолейкоза , рака толстой кишки , молочной железы и легких , а также меланомы . [10]
Цифровые биомаркеры — это новая развивающаяся область биомаркеров, собираемая в основном с помощью интеллектуальных биосенсоров . [11] До сих пор цифровые биомаркеры были сосредоточены на мониторинге жизненно важных параметров, таких как данные акселерометра и частота сердечных сокращений [12] [13] , а также речи . [14] Все чаще становятся доступными новые неинвазивные молекулярные цифровые биомаркеры, регистрируемые, например, с помощью анализа пота на коже ( судорология с поддержкой Интернета ), которые можно рассматривать как цифровые биомаркеры следующего поколения. [15] Цифровые биомаркеры можно легко передать ответственному врачу, а новые подходы к диагностике можно разработать с использованием искусственного интеллекта. [ нужна цитата ]
Цифровые биомаркеры в настоящее время используются в сочетании с искусственным интеллектом (ИИ) для распознавания симптомов легких когнитивных нарушений (MCI). [16] Одним из основных направлений использования цифровых биомаркеров в настоящее время является отслеживание регулярной активности мозга. Конкретные нейронные показатели могут измеряться с помощью устройств для оценки пациентов на наличие нейропатологий. Собранные данные могут определить вероятность или состояние заболевания пациента. [17] Пока пациенты выполняют повседневные задачи (IADL), компьютеры используют машинное обучение, чтобы наблюдать и выявлять любые отклонения от нормального поведения. Эти маркеры используются как признаки или индикаторы снижения когнитивных функций. [16]
Прогностический биомаркер предоставляет информацию об общем исходе пациента, независимо от какого-либо лечения или терапевтического вмешательства. [6] Одним из примеров прогностических биомаркеров в клинических исследованиях является использование мутированного PIK3CA при изучении метастатического рака молочной железы. Как показано на графике , мутация является прогностической, поскольку ее наличие у пациента приводит к одному и тому же исходу независимо от используемого метода лечения. Женщины, у которых до лечения была мутация PIK3CA, имели самую низкую среднюю выживаемость. Спад в группах, содержащих мутанта, происходил быстрее и гораздо более резким. Независимый характер прогностического фактора позволяет исследователю изучать заболевание или состояние в его естественном состоянии. Это облегчает наблюдение за этими аномальными биологическими процессами и размышления о том, как их исправить. Прогностические факторы часто используются в сочетании с прогностическими переменными в терапевтических исследованиях, чтобы изучить, насколько эффективны различные методы лечения при лечении конкретных заболеваний или рака. В отличие от прогностических биомаркеров, прогностические методы не полагаются на какие-либо объясняющие переменные, что позволяет провести независимое исследование основного заболевания или состояния. [18]
Пищевые биомаркеры (биохимические маркеры потребления) используются для оценки потребления пищи в исследованиях в области питания , в частности в эпидемиологии питания , а также в других дисциплинах, таких как археология, где требуется надежная информация о питании. [19] [20] Пищевой биомаркер может представлять собой любой образец, который отражает потребление пищевых компонентов и является достаточно специфичным. [21] [22] Многие биомаркеры получают из соединений, содержащихся в пищевых продуктах, таких как сахар или фитохимические вещества, или их комбинаций с использованием метаболомики . [19] [23] Другим типом пищевых биомаркеров, особенно распространенным в археологии , являются соотношения стабильных изотопов . [24]
Биомаркеры для точной медицины являются частью относительно нового набора поведенческих и клинических инструментов. Что касается поведенческого инструментария, биомаркеры все чаще используются для мотивации изменения поведения в отношении здоровья, особенно в исследованиях диабета , сердечно-сосудистых заболеваний и ожирения . [25] В большинстве исследований на сегодняшний день используются биомаркеры, которые легко измерить, включая вес, артериальное давление и уровень глюкозы; эти биомаркеры могут отражать влияние диеты, физической активности и сокращения курения. Однако методы, с помощью которых обратная связь от биомаркеров используется в интервенционных исследованиях, разнообразны, и их эффективность остается неясной. [25]
Что касается набора клинических инструментов, только два прогностических биомаркера применяются клинически в случае метастатического колоректального рака. [5] В этом случае отсутствие данных, помимо ретроспективных исследований и успешных подходов, основанных на биомаркерах, может быть фактором в использовании исследований биомаркеров из-за сокращения числа субъектов в клинических исследованиях . [26]
Область исследований биомаркеров также расширяется и включает в себя комбинаторный подход к идентификации биомаркеров из нескольких источников. Объединение биомаркеров из различных данных позволяет разработать панели, которые оценивают ответ на лечение на основе множества биомаркеров одновременно. Одной из таких областей расширения исследований многофакторных биомаркеров является секвенирование митохондриальной ДНК. Было показано, что мутации в митохондриальной ДНК коррелируют с риском, прогрессированием и ответом на лечение плоскоклеточного рака головы и шеи . [27] В этом примере было показано, что относительно недорогой конвейер секвенирования способен обнаруживать низкочастотные мутации в опухолеассоциированных клетках. Это подчеркивает общую способность биомаркеров на основе митохондриальной ДНК фиксировать гетерогенность среди людей. [27]
Сеть исследований раннего обнаружения (EDNR) составила список из семи критериев, по которым можно оценивать биомаркеры, чтобы упростить клиническую проверку. [28]
Этот шаг, который ранее использовался для определения конкретных характеристик биомаркера, необходим для проверки этих преимуществ in situ . Биологическое обоснование исследования должно быть оценено в небольшом масштабе, прежде чем можно будет проводить какие-либо крупномасштабные исследования. [28] Многие кандидаты должны пройти тестирование, чтобы отобрать наиболее подходящих. [29]
Этот шаг позволяет разработать наиболее адаптированный протокол для повседневного использования биомаркера. Одновременно можно подтвердить актуальность протокола различными методами (гистология, ПЦР, ИФА, ...) и определить страты на основе результатов. [ нужна цитата ]
Одним из наиболее важных шагов является определение конкретных характеристик биомаркера-кандидата перед разработкой рутинного теста. [30] Учитываются несколько параметров, в том числе:
Это оптимизирует проверенный протокол для повседневного использования, включая анализ критических точек путем сканирования всей процедуры для выявления и контроля потенциальных рисков.
В 1997 году Национальный институт здравоохранения предположил необходимость разработки руководящих принципов и законодательства, которые бы регулировали этические аспекты исследований биомаркеров. [28] Подобно тому, как проект «Геном человека» сотрудничал с Управлением по оценке технологий США, исследования чувствительности к биомаркерам должны сотрудничать для создания этических руководящих принципов, которые могут быть внедрены в основу и требования к предложениям исследований. [ нужна цитата ]
Обеспечение того, чтобы всем участникам, включенным в каждый этап проекта (т. е. планирование, реализация и обобщение результатов), была обеспечена защита этических принципов, установленных до начала проекта. Эти этические меры защиты должны защищать не только участников исследования, но и неучастников, исследователей, спонсоров, регулирующие органы и всех других лиц или группы, участвующих в исследовании. [28] Некоторые меры этической защиты могут включать, помимо прочего: [28]
В клеточной биологии биомаркером называют молекулу , позволяющую обнаружить и выделить определенный тип клеток (например, белок Oct-4 используется в качестве биомаркера для идентификации эмбриональных стволовых клеток ). [32]
В генетике биомаркер (идентифицированный как генетический маркер ) представляет собой последовательность ДНК , которая вызывает заболевание или связана с предрасположенностью к заболеванию. Их можно использовать для создания генетических карт любого изучаемого организма.
Биомаркером может быть любая молекула , указывающая на существование живых организмов в прошлом или настоящем. В области геологии и астробиологии биомаркеры в отличие от геомаркеров также известны как биосигнатуры . Термин «биомаркер» также используется для описания биологического участия в производстве нефти . Биомаркеры использовались при геохимическом расследовании разлива нефти в заливе Сан-Франциско, штат Калифорния, в 1988 году. [33] 22–23 апреля около 400 000 галлонов сырой нефти были случайно выброшены в долину Сан-Хоакин нефтеперерабатывающим и производственным заводом. комплекс нефтяной компании Shell . Нефть затронула многие прилегающие территории. Пробы сырой нефти были собраны в различных регионах, где она распространилась, и сравнены с пробами, которые не были выброшены, в попытке отличить разлитую нефть от петрогенного фона, присутствующего в районе разлива. [33] Масс-спектры были выполнены для идентификации биомаркеров и циклических алифатических углеводородов в образцах. Обнаружены изменения в концентрации компонентов проб сырой нефти и отложений. [33]
Биомаркеры используются для выявления воздействия загрязнения воды на водные организмы. Бентические макробеспозвоночные обитают в отложениях на дне ручьев, где оседает множество загрязняющих веществ. Эти организмы сильно подвержены загрязнению, что делает их хорошими видами для изучения при обнаружении концентраций загрязняющих веществ и воздействия загрязнения на экосистему. [34] В водном организме существует множество биомаркеров, которые можно измерить в зависимости от загрязняющего вещества или рассматриваемой реакции. В водоемах также присутствуют различные загрязнения. Чтобы проанализировать воздействие загрязнителя на организм, биомаркер должен реагировать на конкретное загрязняющее вещество в течение определенного периода времени или при определенной концентрации. [35] Биомаркеры, используемые для обнаружения загрязнения водных организмов, могут быть ферментативными или неферментативными. [36] [37]
Рэйчел Карсон , автор книги «Безмолвная весна» , подняла вопрос об использовании хлорорганических пестицидов и обсудила возможные негативные последствия, которые указанные пестициды оказывают на живые организмы. [38] В ее книге поднимались этические проблемы против химических корпораций, которые контролировали общее восприятие воздействия пестицидов на окружающую среду, что привело к необходимости экотоксикологических исследований. Экотоксикологические исследования можно считать предшественниками исследований биомаркеров. [39] Биомаркеры используются для обозначения воздействия или воздействия ксенобиотиков , которые присутствуют в окружающей среде и в организмах. Биомаркером может быть само внешнее вещество (например, частицы асбеста или ННК из табака) или вариант внешнего вещества, перерабатываемый организмом ( метаболит ), который обычно можно определить количественно.
Широкое распространение термина «биомаркер» началось еще в 1980 году. [40] Методы мониторинга и изучения окружающей среды в конце 1980-х годов все еще в основном зависели от изучения химических веществ, которые считались опасными. или токсичен при обнаружении в умеренных концентрациях в воде, отложениях и водных организмах. [39] Для идентификации этих химических соединений использовались следующие методы: хроматография, спектрофотометрия, электрохимия и радиохимия. [39] Хотя эти методы оказались успешными в выяснении химического состава и концентраций присутствующих в окружающей среде загрязнителей и рассматриваемых соединений, испытания не предоставили информативных данных о воздействии определенного загрязнителя или химического вещества на живой организм. или экосистема. Было высказано предположение, что характеристика биомаркеров могла бы создать систему предупреждения для проверки благополучия населения или экосистемы до того, как загрязнитель или соединение смогут нанести ущерб системе. Теперь, благодаря развитию исследований биомаркеров, биомаркеры могут использоваться и применяться в области медицины человека и при обнаружении заболеваний. [39]
Термин «биологический маркер» был введен в 1950-е годы. [41] [42]
Де Кок и Крамер разработали концепцию активного биомониторинга в 1994 году. Активный биомониторинг — это сравнение химических/биологических свойств образца, перенесенного в новую среду, условия которой отличаются от исходной среды. [49]
{{cite book}}
: CS1 maint: отсутствует местоположение издателя ( ссылка )