stringtranslate.com

Гаплогруппа J (Y-ДНК)

Гаплогруппа J-M304 , также известная как J , [Филогенетика 1] — гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека . Считается, что она возникла в Западной Азии . [2] Клада распространилась оттуда во время неолита , в основном в Северную Африку , Африканский Рог , архипелаг Сокотра , Кавказ , Европу , Анатолию , Центральную Азию , Южную Азию и Юго-Восточную Азию .

Гаплогруппа J-M304 делится на два основных субклада (ветви), J-M267 и J-M172 .

Происхождение

Считается, что гаплогруппа J-M304 отделилась от гаплогруппы I-M170 примерно 43 000 лет назад в Западной Азии, [1] поскольку обе линии являются субкладами гаплогруппы IJ . Гаплогруппа IJ и гаплогруппа K происходят от гаплогруппы IJK , и только на этом уровне классификации гаплогруппа IJK объединяется с гаплогруппой G-M201 и гаплогруппой H как непосредственные потомки гаплогруппы F-M89 . J-M304 (закавказское происхождение) определяется генетическим маркером M304 или эквивалентным маркером 12f2.1. Основные текущие подгруппы J-M267 (происхождение с Армянского нагорья) и J-M172 (происхождение с гор Загрос), которые в настоящее время включают в себя почти все линии потомков гаплогруппы, как полагают, возникли очень рано, по крайней мере 10 000 лет назад. Тем не менее, сообщалось, что Y-хромосомы F-M89* и IJ-M429* были обнаружены на Иранском плато (Grugni et al. 2012).

С другой стороны, по-видимому, различные эпизоды перемещения населения повлияли на юго-восточную Европу, а также роль Балкан как давнего коридора в Европу с Ближнего Востока показана филогенетическим объединением Hgs I и J базальной мутацией M429. Это доказательство общего происхождения предполагает, что предковые Hgs IJ-M429*, вероятно, проникли в Европу через Балканский след когда-то до LGM . Затем они впоследствии разделились на Hg J и Hg I на Ближнем Востоке и в Европе в типичной дизъюнктивной филогеографической модели. Такой географический зал [ необходимо разъяснение ] склонен сталкиваться с дополнительными последовательными потоками генов, включая поселенцев-садоводов. Более того, объединение гаплогрупп IJK создает эволюционное расстояние от делегатов F–H, а также подтверждает вывод о том, что и IJ-M429, и KT-M9 возникли ближе к Ближнему Востоку, чем к Центральной или Восточной Азии. [ необходима ссылка ]

Гаплогруппа J также была обнаружена среди двух древнеегипетских мумий, раскопанных на археологическом объекте Абусир-эль-Малек в Среднем Египте, которые датируются периодом между поздним Новым царством и римской эпохой . [3]

Распределение

Гаплогруппа J-M267 в наибольшей концентрации встречается на Аравийском полуострове . За пределами этого региона гаплогруппа J-M304 имеет значительное присутствие в других частях Ближнего Востока , а также в Северной Африке , на Африканском Роге и на Кавказе . Она также имеет умеренное распространение в Южной Европе , особенно в центральной и южной Италии, на Мальте, в Греции и Албании. Субклад J-M410 в основном распространен в Малой Азии , Греции и южной Италии. Кроме того, J-M304 наблюдается в Центральной Азии и Южной Азии , особенно в форме своего субклада J-M172. J-12f2 и J-P19 также встречаются среди гереро (8%). [4]

Распределение субкладов

J-M304*

Парагруппа J-M304* [Филогенетика 2] включает все J-M304, за исключением J-M267, J-M172 и их субкладов. J-M304* редко встречается за пределами острова Сокотра, принадлежащего Йемену, где он встречается чрезвычайно часто — 71,4%, а j1-267 — для остальных без j2 [6] Гаплогруппа J-M304* также была обнаружена с меньшей частотой в Омане (Di Giacomo 2004), евреях-ашкенази , [7] Саудовской Аравии (Abu-Amero 2009), Греции (Di Giacomo 2004), Чехии (Di Giacomo 2004 и Luca 2007), уйгурах [8] и нескольких тюркских народах . [9] (Cinnioglu 2004 и Varzari 2006).

Однако YFull [1] и FTDNA [10] не смогли найти людей J* где-либо в мире, хотя есть 2 человека J2-Y130506 и 1 человек J1 из Сокотры. Но исследование Cerny 2009 обнаружило 9 людей J1 в Сокотре/Сокотре и большинство J* и ни одного J2, что выдвинуло гипотезу об эффекте основателя J1 в Сокотре.

Ниже приводится краткое изложение большинства исследований, в которых специально проверялись J-M267 и J-M172, показывающее их распространение в Европе, Северной Африке, на Ближнем Востоке и в Центральной Азии.

J-M267

Гаплогруппа J-M267 [Phylogenetics 3], определяемая SNP M267, в настоящее время наиболее часто встречается на Аравийском полуострове: Йемен (до 76%), [11] Саудовская Аравия (до 64%) (Alshamali 2009), Катар (58%), [12] и Дагестан (до 56%). [13] J-M267 обычно часто встречается среди арабских бедуинов (62%), [14] евреев-ашкенази (20%) (Semino 2004), Алжир (до 35%) (Semino 2004), Ирак (28%) (Semino 2004), Тунис (до 31%), [15] Сирия (до 30%), Египет (до 20%) (Luis 2004) и Синайский полуостров . В некоторой степени частота гаплогруппы J-M267 падает на границах арабо- / семитскоязычных территорий с преимущественно неарабо-/семитскоязычными территориями, такими как Турция (9%), Иран (5%), суннитские индийские мусульмане (2,3%) и североиндийские шииты (11%) (Eaaswarkhanth 2009). Некоторые цифры выше, как правило, являются большими, полученными в некоторых исследованиях, в то время как меньшие цифры, полученные в других исследованиях, опущены. Она также очень часто встречается среди евреев , особенно линии коханов (46%) (Hammer 2009).

ISOGG утверждает, что J-M267 возник на Ближнем Востоке . Он встречается в некоторых частях Ближнего Востока , Анатолии и Северной Африки , с гораздо более редким распределением в южном средиземноморском фланге Европы и в Эфиопии .

Но не все исследования сходятся во мнении о месте происхождения. Было предложено место происхождения Леванта , но исследование 2010 года пришло к выводу, что гаплогруппа имела более северное происхождение, возможно, Анатолию .

Происхождение субклада J-P58, вероятно, происходит из более северных популяций, а затем распространяется на юг на Аравийский полуостров . Высокая дисперсия Y-STR J-P58 в этнических группах Турции , а также северных регионах Сирии и Ирака , подтверждает вывод о происхождении J-P58 в близлежащей восточной Анатолии . Более того, сетевой анализ гаплотипов J-P58 показывает, что некоторые популяции с низким разнообразием, такие как бедуины из Израиля , Катара , Судана и Объединенных Арабских Эмиратов , тесно сгруппированы вблизи высокочастотных гаплотипов. Это говорит о том, что эффекты основателя с расширением звездного взрыва в Аравийскую пустыню (Chiaroni 2010).

J-M172

Гаплогруппа J-M172 [Филогенетика 4] обнаружена в самых высоких концентрациях на Кавказе и в Плодородном полумесяце / Ираке , а также встречается по всему Средиземноморью (включая Итальянский , Балканский , Анатолийский и Пиренейский полуострова и Северную Африку ) (Di Giacomo 2003).

Самая высокая когда-либо зарегистрированная концентрация J-M172 составила 72% в северо-восточной Грузии (Насидзе, 2004). Другие высокие показатели включают ингушей 32% (Насидзе 2004), киприотов 30-37% (Капелли 2005), ливанцев 30% (Уэллс и др. 2001), ассирийцев , мандеев и арабов Ирака 29,7% (Санчес и др. 2005) [ необходима полная цитата ] , сирийцев и сирийцев 22,5%, курдов 24%-28%, пуштунов 20-30%, [16] иранцев 23% (Абурто 2006), евреев-ашкенази 24%, палестинских арабов 16,8%-25%, евреев-сефардов 29% [17] и североиндийских мусульман-шиитов 18%, чеченцев 26%, балкарцев 24%, ягнобцев 32%, армян 21-24% и азербайджанцев 24%-48%.

В Южной Азии J2-M172 оказался значительно выше среди дравидийских каст (19%), чем среди индоевропейских каст (11%). J2-M172 и J-M410 встречаются в 21% среди дравидийских средних каст, за ними следуют высшие касты (18,6%) и низшие касты (14%). (Sengupta 2006) [18] Субклады M172, такие как M67 и M92, не были обнаружены ни в индийских, ни в пакистанских образцах, что также может указывать на частичное общее происхождение. (Sengupta 2006) [18]

Согласно генетическому исследованию, проведенному в Китае Шоу и др., J2-M172 встречается с высокой частотой среди уйгуров (17/50 = 34%) и узбеков (7/23 = 30,4%), умеренной частотой среди памирцев (5/31 = 16,1%), а также обнаружен J-M172 у китайцев хань (10%) [19] и низкой частотой среди югуров (2/32 = 6,3%) и монгоров (1/50 = 2,0%). Авторы также обнаружили J-M304(xJ2-M172) с низкой частотой среди русских (1/19 = 5,3%), узбеков (1/23 = 4,3%), сибе (1/32 = 3,1%), дунсян (1/35 = 2,9%) и казахов (1/41 = 2,4%) на северо-западе Китая . [20] Только у этнических меньшинств крайнего северо-запада в Синьцзяне, Китай, была гаплогруппа J. У узбеков в выборке было 30,4% J2-M172, а также у таджиков из Синьцзяна и уйгуров. [21]

Филогенетика

В филогенетике Y-хромосомы субклады являются ветвями гаплогрупп. Эти субклады также определяются полиморфизмами отдельных нуклеотидов (SNP) или полиморфизмами уникальных событий (UEP).

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем наименования для филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместную статью, в которой было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремящегося прежде всего быть своевременным. Таблица ниже объединяет все эти работы в точке знакового дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему более старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

В создании дерева YCC приняли участие следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями.

Филогенетические деревья

Существует несколько подтвержденных и предложенных филогенетических деревьев для гаплогруппы J-M304. Научно признанное дерево — это дерево Y-Chromosome Consortium (YCC), опубликованное в Karafet 2008 и впоследствии обновленное. Черновик дерева, демонстрирующий зарождающуюся науку, предоставлен Томасом Краном из Genomic Research Center в Хьюстоне, штат Техас . Международное общество генетической генеалогии (ISOGG) также предоставляет любительское дерево.

Проект дерева Центра геномных исследований

Это Томас Кран из Genomic Research Center's Draft tree Proposed Tree для гаплогруппы J-P209 (Krahn & FTDNA 2013). Для краткости показаны только первые три уровня субкладов.

Дерево консорциума Y-хромосомы

Это официальное научное дерево, созданное Консорциумом Y-хромосомы (YCC). Последнее крупное обновление было в 2008 году (Karafet 2008). Последующие обновления были ежеквартальными и двухгодичными. Текущая версия (2022) является обновлением 2019/2020.

Видные члены J

Смотрите также

Генетика

Y-ДНК J субклады

Ссылки

  1. ^ abcd "J YTree". Архивировано из оригинала 23 мая 2018 года . Получено 8 апреля 2018 года .
  2. ^ Y-ДНК Гаплогруппа J Архивировано 18 августа 2017 г. в Wayback Machine , ISOGG, 2015 г.
  3. ^ Schuenemann, Verena J.; et al. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримский период». Nature Communications . 8 : 15694. Bibcode :2017NatCo...815694S. doi :10.1038/ncomms15694. PMC 5459999 . PMID  28556824. 
  4. ^ Wood, Elizabeth T.; et al. (2005). «Контрастные паттерны вариации Y-хромосомы и мтДНК в Африке: доказательства демографических процессов с сексуальным перекосом» (PDF) . European Journal of Human Genetics . 13 (7): 867–876. doi : 10.1038/sj.ejhg.5201408 . PMID  15856073. S2CID  20279122. Архивировано (PDF) из оригинала 24 сентября 2016 г. . Получено 24 сентября 2016 г. .
  5. ^ Эль-Сибай 2009 сообщил о результатах нескольких исследований: Ди Джакомо 2003, Аль-Захери 2003, Флорес 2004, Чинниоглу 2004, Капелли 2005, Гонсалвес 2005, Заллуа 2008, Каденас 2008
  6. ^ Černý 2009: J-12f2(xM267, M172)(45/63) Černý, Viktor; et al. (2009). "Out of Arabia—the settlement of island Socotra as reveald by mitochondrial and Ychromosome genetic variation" (PDF) . American Journal of Physical Anthropology . 138 (4): 439–447. doi :10.1002/ajpa.20960. PMID  19012329. Архивировано из оригинала (PDF) 6 октября 2016 г. . Получено 12 июня 2016 г. .
  7. ↑ Шен 2004: Гаплогруппа J-M304 (xM267, M172) у 1/20 евреев-ашкенази.
  8. ^ Чжун и др. (2011), Mol Biol Evol 1 января 2011 г., т. 28, № 1, стр. 717–727. Архивировано 23 августа 2011 г. на Wayback Machine . См. таблицу [ постоянная нерабочая ссылка ] .
  9. ↑ Юнусбаев 2006: Статистика по всем этническим группам Дагестана, подробности см. в статье Дагестан . Даргинцы (91%), аварцы (67%), чамалины (67%), лезгины (58%), табасаранцы (49%), андийцы (37%), ассирийцы (29%), багвалыны (21,4%))
  10. ^ "FamilyTreeDNA - Y-DNA J Haplogroup Project". Архивировано из оригинала 12 февраля 2020 г. Получено 28 сентября 2019 г.
  11. ^
    • Альшамали 2009: 81% (84/104)
    • Каденас 2008: 45/62=72,6% J-M267
  12. ^ Каденас 2008: 42/72 = 58,3% J-M267
  13. ↑ Юнусбаев 2006: Даргинцы (91%), Аварцы (67%), Чамалины (67%), Лезгины (58%), Табасаранцы (49%), Андийцы (37%), Ассирийцы (29%), Багвалыны (21,4%)) статистика объединенных этнических групп Дагестана см. статью Дагестан
  14. ^ Небель 2001: 21/32
  15. ^ 31% основано на объединенных данных.
    • Семино 2004: 30%
    • Арреди 2004: 32%
  16. ^ Хабер, Марк; Платт, Дэниел Э.; Ашрафиан Бонаб, Мазиар; Юханна, Соня К.; Сория-Эрнанц, Дэвид Ф.; Мартинес-Крус, Бегонья; Дуайхи, Бушра; Гассибе-Саббах, Мишелла; Рафатпанах, Хошанг; Ганбари, Мохсен; Уэйл, Джон; Балановский, Олег; Уэллс, Р. Спенсер; Комас, Дэвид; Тайлер-Смит, Крис; Заллуа, Пьер А. (2012). «Этнические группы Афганистана разделяют Y-хромосомное наследие, структурированное историческими событиями». PLOS ONE . 7 (3): e34288. Bibcode : 2012PLoSO...734288H. doi : 10.1371/journal.pone.0034288 . PMC 3314501. PMID  22470552 . 
  17. ^ Nebel, Almut; Filon, Dvora; Brinkmann, Bernd; Majumder, Partha P.; Faerman, Marina; Oppenheim, Ariella (ноябрь 2001 г.). «Y-хромосомный пул евреев как часть генетического ландшафта Ближнего Востока». The American Journal of Human Genetics . 69 (5): 1095–1112. doi :10.1086/324070. PMC 1274378. PMID  11573163 . 
  18. ^ ab Сенгупта, С.; Животовский, Л.А.; Кинг, Р.; и др. (февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии выявляют как местные, так и экзогенные расширения и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Am. J. Hum. Genet . 78 (2): 202–21. doi :10.1086/499411. PMC 1380230 . PMID  16400607. 
  19. ^ Сюэ 2006
  20. ^ Shou et al (2010), Распределение Y-хромосомы среди популяций в Северо-Западном Китае выявляет значительный вклад скотоводов Центральной Азии и меньшее влияние западных евразийцев Архивировано 2 апреля 2015 г. в Wayback Machine , Journal of Human Genetics (2010) 55, 314–322; doi:10.1038/jhg.2010.30; опубликовано онлайн 23 апреля 2010 г., Таблица 2. Распределение гаплогрупп и разнообразие Y-хромосомы в 14 северо-западных популяциях Архивировано 14 января 2015 г. в Wayback Machine
  21. ^ Шоу, Вэй-Хуа; Цяо, Вн-Фа; Вэй, Чуань-Ю; Дун, Юн-Ли; Тан, Си-Цзе; Ши, Хун; Тан, Вэнь-Ру; Сяо, Чунь-Цзе (2010). «Распределение Y-хромосомы среди популяций на северо-западе Китая выявляет значительный вклад скотоводов Центральной Азии и меньшее влияние западных евразийцев». J Hum Genet . 55 (5): 314–322. doi : 10.1038/jhg.2010.30 . PMID  20414255. S2CID  23002493.
  22. ^ abcdefgh Maciamo. "Eupedia". Eupedia . Получено 6 августа 2022 г. .
  23. ^ abcd Maciamo. "Eupedia". Eupedia . Получено 6 августа 2022 г. .
  24. ^ Schuenemann, VJ; Peltzer, A.; Welte, B.; Van Pelt, WP; Molak, M.; Wang, CC; Furtwängler, A.; Urban, C.; Reiter, E.; Nieselt, K.; Teßmann, B.; Francken, M.; Harvati, K.; Haak, W.; Schiffels, S.; Krause, J. (2017). «Геномы древних египетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримский период». Nature Communications . 8 : 15694. Bibcode :2017NatCo...815694S. doi :10.1038/ncomms15694. PMC 5459999 . PMID  28556824. 
  25. ^ "Добро пожаловать в FamilyTreeDNA Discover (Beta)". FamilyTreeDNA Discover (Beta) . Получено 6 мая 2023 г. .

Цитируемые работы

Журналы

Диссертация и тезисы

Блоги

Списки рассылки

Веб-сайты

Источники таблиц преобразования

Дальнейшее чтение

Филогенетические заметки

  1. ^ ISOGG Y-ДНК Гаплогруппа J и ее субклады - 2016 Архивировано 18 августа 2017 г. на Wayback Machine (2 февраля 2016 г.).
  2. ^ В этой таблице показаны исторические названия для J-M304 (он же J-P209 и J-12f2.1) в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 является субкладом 23 .
  3. ^ В этой таблице показаны исторические названия J-M267 и его ранее открытого и названного субклада J-M62 в опубликованной рецензируемой литературе.
  4. ^ В этой таблице показаны исторические названия для J-M172 в опубликованной рецензируемой литературе. Обратите внимание, что в Semino 2000 Eu09 является субкладом Eu10, а в Karafet 2001 24 является субкладом 23 .

Внешние ссылки

На Викискладе есть медиафайлы по теме Гаплогруппа J Y-ДНК .

Филогенетическое дерево и карты распространения Y-ДНК гаплогруппы J

Другие