stringtranslate.com

Матриксная металлопротеиназа

Матриксные металлопротеиназы ( ММП ), также известные как матриксные металлопептидазы или матриксины , представляют собой металлопротеиназы , которые представляют собой кальций - зависимые цинксодержащие эндопептидазы ; [1] другими членами семейства являются адамализины , серрализины и астацины . ММП принадлежат к более крупному семейству протеаз , известному как суперсемейство метцинцина. [2]

В совокупности эти ферменты способны разрушать все виды белков внеклеточного матрикса , но также могут обрабатывать ряд биологически активных молекул. Известно, что они участвуют в расщеплении рецепторов клеточной поверхности , высвобождении апоптотических лигандов (таких как лиганд FAS ) и инактивации хемокинов / цитокинов . [3] Также считается, что ММП играют важную роль в поведении клеток, таком как пролиферация клеток , миграция ( адгезия /дисперсия), дифференцировка , ангиогенез , апоптоз и защита хозяина .

Впервые они были описаны у позвоночных в 1962 году [4] , включая человека, но с тех пор были обнаружены у беспозвоночных и растений. Они отличаются от других эндопептидаз своей зависимостью от ионов металлов в качестве кофакторов , способностью разрушать внеклеточный матрикс и специфической эволюционной последовательностью ДНК .

История

Первоначально ММП были описаны Джеромом Гроссом и Чарльзом Лапьером в 1962 году, которые наблюдали ферментативную активность ( деградацию тройной спирали коллагена ) во время метаморфоза хвоста головастика (путем помещения хвоста головастика в пластинку коллагенового матрикса). [5] Поэтому фермент был назван интерстициальной коллагеназой ( MMP-1 ).

Позднее он был выделен из кожи человека (1968) [6] и признан синтезированным как зимоген . [7]

«Цистеиновый переключатель» был описан в 1990 году. [8]

Состав

ММП имеют общую доменную структуру . Тремя общими доменами являются пропептидный, каталитический домен и гемопексиноподобный С-концевой домен, который связан с каталитическим доменом гибкой шарнирной областью . [2]

Пропептид

ММП первоначально синтезируются как неактивные зимогены с пропептидным доменом, который необходимо удалить, прежде чем фермент станет активным. Пропептидный домен является частью «цистеинового переключателя». Он содержит консервативный остаток цистеина , который взаимодействует с цинком в активном центре и предотвращает связывание и расщепление субстрата , сохраняя фермент в неактивной форме. В большинстве ММП остаток цистеина находится в консервативной последовательности PRCGxPD. Некоторые ММП имеют сайт расщепления прогормон-конвертазы (фуриноподобный) как часть этого домена, который при расщеплении активирует фермент. MMP-23A и ​​MMP-23B включают трансмембранный сегмент в этом домене. [9]

Каталитический домен

Рентгенокристаллографические структуры нескольких каталитических доменов ММП показали, что этот домен представляет собой сплюснутую сферу размером 35 x 30 x 30 Å (3,5 x 3 x 3 нм ). Активный центр представляет собой бороздку размером 20 Å (2 нм), пересекающую каталитический домен. В части каталитического домена, образующей активный центр, находится каталитически важный ион Zn 2+ , который связан тремя остатками гистидина , обнаруженными в консервативной последовательности HExxHxxGxxH. Следовательно, эта последовательность представляет собой мотив, связывающий цинк.

Желатиназы, такие как MMP-2 , включают модули фибронектина типа II, вставленные непосредственно перед этим в цинк -связывающий мотив каталитического домена. [10]

Шарнирная область

Каталитический домен соединен с С-концевым доменом гибкой шарнирной или линкерной областью. Он имеет длину до 75 аминокислот и не имеет определенной структуры.

Гемопексиноподобный С-концевой домен

Гемопексиноподобный С-концевой домен MMP9 PDB 1itv

С-концевой домен имеет структурное сходство с сывороточным белком гемопексином . Он имеет четырехлопастную конструкцию β-пропеллера. Структуры β-пропеллера обеспечивают большую плоскую поверхность, которая, как полагают, участвует в белок-белковых взаимодействиях . Это определяет специфичность субстрата и является местом взаимодействия с ТИМП ( тканевым ингибитором металлопротеиназ ). Гемопексиноподобный домен отсутствует у ММП-7 , ММП-23, ММП-26, а также у растений и нематод . Мембраносвязанные ММП (МТ-ММП) закрепляются на плазматической мембране через трансмембранный домен или домен, закрепляющий GPI.

Каталитический механизм

Опубликовано три каталитических механизма.

Классификация

Функциональная классификация матриксных металлопротеиназ.

ММП можно разделить по-разному.

Эволюционный

Использование биоинформатических методов для сравнения первичных последовательностей ММП позволяет предположить следующие эволюционные группы ММП:

Анализ каталитических доменов по отдельности предполагает, что каталитические домены развивались дальше после дифференциации основных групп, на что также указывают субстратные специфичности ферментов .

Функциональный

Наиболее часто используемые группы (исследователями биологии ММП) основаны частично на исторической оценке субстратной специфичности ММП и частично на клеточной локализации ММП. К этим группам относятся коллагеназы, желатиназы, стромелизины и ММП мембранного типа (МТ-ММП).

Однако становится все более очевидным, что эти разделения являются несколько искусственными, поскольку существует ряд ММП, которые не вписываются ни в одну из традиционных групп.

Гены

Матриксные металлопротеиназы соединяются с металлсвязывающим белком металлотионином; тем самым помогая в механизме металлического связывания.

Функция

ММП играют важную роль в ремоделировании тканей , связанном с различными физиологическими или патологическими процессами, такими как морфогенез , ангиогенез , восстановление тканей , цирроз печени , артрит и метастазирование . Считается, что MMP-2 и MMP-9 играют важную роль в метастазировании. Считается, что MMP-1 играет важную роль при ревматоидном артрите и остеоартрите. Последние данные свидетельствуют об активной роли ММП в патогенезе аневризмы аорты. Избыток ММП разрушает структурные белки стенки аорты. Нарушение баланса между ММП и ТИМП также характерно для острых и хронических сердечно-сосудистых заболеваний. [15]

Активация

взаимная активация ММП

Все ММП синтезируются в латентной форме (зимоген). Они секретируются как проферменты и требуют внеклеточной активации. Они могут быть активированы in vitro с помощью многих механизмов, включая ртутьорганические соединения, хаотропные агенты и другие протеазы.

Ингибиторы

ММП ингибируются специфическим эндогенным тканевым ингибитором металлопротеиназ (ТИМП), который включает семейство из четырех ингибиторов протеаз : ТИМП-1, ТИМП-2, ТИМП-3 и ТИМП-4.

Синтетические ингибиторы обычно содержат хелатную группу , которая прочно связывает каталитический атом цинка в активном центре ММП . Общие хелатные группы включают гидроксаматы , карбоксилаты , тиолы и фосфинилы . Гидроксиматы являются особенно мощными ингибиторами ММП и других цинк-зависимых ферментов из-за их бидентатного хелатирования атома цинка. Другие заместители этих ингибиторов обычно предназначены для взаимодействия с различными карманами связывания на интересующей ММП, что делает ингибитор более или менее специфичным для данных ММП. [2]

Фармакология

Доксициклин в субантимикробных дозах ингибирует активность ММП и использовался с этой целью в различных экспериментальных системах, например, при резистентных рецидивирующих эрозиях роговицы. Он используется в клинической практике для лечения заболеваний пародонта и является единственным ингибитором ММП, широко доступным в клинической практике. Он продается под торговой маркой Periostat компанией CollaGenex. Также было показано, что миноциклин, другой антибиотик тетрациклинового ряда, ингибирует активность ММП.

Ряд рационально разработанных ингибиторов ММП показали некоторую перспективность в лечении патологий, в которых предположительно участвуют ММП (см. выше). Однако большинство из них, такие как маримастат (BB-2516), ингибитор ММП широкого спектра действия, и ципемастат (Ro 32-3555), селективный ингибитор ММП-1 , показали плохие результаты в клинических исследованиях . Провал Маримасата частично стал причиной закрытия компании British Biotech , которая его разработала. Неудача этих препаратов была обусловлена ​​главным образом токсичностью (в частности, скелетно-мышечной токсичностью в случае ингибиторов широкого спектра действия) и неспособностью показать ожидаемые результаты (в случае трокады многообещающие результаты на моделях артрита кроликов не были воспроизведены в клинических исследованиях). испытания на людях). Причины столь неутешительных клинических результатов применения ингибиторов ММП неясны, особенно в свете их активности на животных моделях .

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Верма Р.П., Ханш С. (март 2007 г.). «Матриксные металлопротеиназы (ММП): химико-биологические функции и (Q) SAR» (PDF) . Биоорг. Мед. хим. 15 (6): 2223–68. doi :10.1016/j.bmc.2007.01.011. PMID  17275314. Архивировано из оригинала (PDF) 13 мая 2015 года . Проверено 21 октября 2015 г.
  2. ^ abc Матриксные металлопротеиназы: их значение при сердечно-сосудистых заболеваниях
  3. ^ Ван Линт П., Либерт С. (декабрь 2007 г.). «Обработка хемокинов и цитокинов матриксными металлопротеиназами и ее влияние на миграцию и воспаление лейкоцитов». Дж. Леукок. Биол. 82 (6): 1375–81. дои : 10.1189/jlb.0607338 . ПМИД  17709402.
  4. ^ Гросс, Дж.; Лапьер, CM (июнь 1962 г.). «Коллагенолитическая активность в тканях амфибий: анализ культуры ткани». Труды Национальной академии наук . 48 (6): 1014–22. Бибкод : 1962PNAS...48.1014G. дои : 10.1073/pnas.48.6.1014 . ПМК 220898 . ПМИД  13902219. 
  5. ^ Гросс Дж, Лапьер С (1962). «Коллагенолитическая активность в тканях амфибий: анализ культуры ткани». Proc Natl Acad Sci США . 48 (6): 1014–22. Бибкод : 1962PNAS...48.1014G. дои : 10.1073/pnas.48.6.1014 . ПМК 220898 . ПМИД  13902219. 
  6. ^ Эйзен А., Джеффри Дж., Гросс Дж. (1968). «Коллагеназа кожи человека. Выделение и механизм атаки на молекулу коллагена». Биохим Биофиз Акта . 151 (3): 637–45. дои : 10.1016/0005-2744(68)90010-7. ПМИД  4967132.
  7. ^ Харпер Э., Блох К., Гросс Дж. (1971). «Зимоген коллагеназы головастиков». Биохимия . 10 (16): 3035–41. дои : 10.1021/bi00792a008. ПМИД  4331330.
  8. ^ Ван Варт Х, Биркедал-Хансен Х (1990). «Цистеиновый переключатель: принцип регуляции активности металлопротеиназ с потенциальной применимостью ко всему семейству генов матриксных металлопротеиназ». Proc Natl Acad Sci США . 87 (14): 5578–82. Бибкод : 1990PNAS...87.5578V. дои : 10.1073/pnas.87.14.5578 . ПМК 54368 . ПМИД  2164689. 
  9. ^ Пей Д., Кан Т., Ци Х (2000). «Матричная металлопротеиназа цистеиновой матрицы (CA-MMP) / MMP-23 представляет собой трансмембранную матричную металлопротеиназу типа II, регулируемую одним расщеплением как для секреции, так и для активации». J Биол Хим . 275 (43): 33988–97. дои : 10.1074/jbc.M006493200 . ПМИД  10945999.
  10. ^ Трекслер М., Брикнарова К., Германн М., Ллинас М., Патти Л. (2003). «Пептидные лиганды модулей фибронектина типа II матриксной металлопротеиназы 2 (ММП-2)». J Биол Хим . 278 (14): 12241–6. дои : 10.1074/jbc.M210116200 . ПМИД  12486137.
  11. ^ Браунер М.Ф., Смит В.В., Кастельяно А.Л. (1995). «Комплексы матрилизин-ингибитор: общие темы среди металлопротеаз». Биохимия . 34 (20): 6602–10. дои : 10.1021/bi00020a004. ПМИД  7756291.
  12. ^ Кестер WR, Мэтьюз BW (1977). «Кристаллографическое исследование связывания дипептидных ингибиторов с термолизином: значение для механизма катализа». Биохимия . 16 (11): 2506–16. дои : 10.1021/bi00630a030. ПМИД  861218.
  13. ^ Манцетти С., Маккалок Д.Р., Херингтон AC, ван дер Спол Д. (2003). «Моделирование фермент-субстратных комплексов металлопротеаз ММП-3, ADAM-9 и ADAM-10». J. Comput.-Aided Mol. Дес . 17 (9): 551–65. Бибкод : 2003JCAMD..17..551M. doi :10.1023/B:JCAM.0000005765.13637.38. PMID  14713188. S2CID  17453639.
  14. ^ Лохи Дж., Уилсон CL, Роби Дж.Д., Parks WC (2001). «Эпилизин, новая человеческая матриксная металлопротеиназа (MMP-28), экспрессируемая в семенниках и кератиноцитах и ​​в ответ на травму». J Биол Хим . 276 (13): 10134–10144. дои : 10.1074/jbc.M001599200 . ПМИД  11121398.
  15. ^ Снук-ван Берден ПАМ; Фон ден Хофф JW (2005). «Зимографические методы анализа матриксных металлопротеиназ и их ингибиторов». БиоТехники . 38 (1): 73–83. дои : 10.2144/05381RV01 . hdl : 2066/47379 . ПМИД  15679089.

Синергический эффект полиморфизма промотора стромелизин-1 (матриксная металлопротеиназа-3) (-1171 5A->6A) при подслизистом фиброзе полости рта и поражениях головы и шеи. Чаудхари АК, Сингх М, Бхарти А.С., Сингх М, Шукла С, Сингх АК, Мехротра Р. Рак BMC. 2010, 14 июля; 10: 369.

Внешние ссылки